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实时直接分析串联质谱快速筛查苯二氮卓类药片

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分析试验室 2024年

作者：刘富邦周沛龙王继芬张瑛中国医学科学院北京协和医学院药物研究所中国人民公安大学侦查学院北京市公安司法鉴定中心法庭毒物分析公安部重点实验室

建立了实时直接分析串联质谱快速筛查苯二氮卓类安眠镇静药物药片的方法，优化了实验条件。采用氮气作为载气吹扫药片表面，载气加热器的最佳温度为300℃，使用多反应监测模式，可以监测34种苯二氮卓类药物信号。将药片粉末溶于甲醇后稀... 详细信息

建立了实时直接分析串联质谱快速筛查苯二氮卓类安眠镇静药物药片的方法，优化了实验条件。采用氮气作为载气吹扫药片表面，载气加热器的最佳温度为300℃，使用多反应监测模式，可以监测34种苯二氮卓类药物信号。将药片粉末溶于甲醇后稀释100倍，以氦气为载气，400 ℃为载气加热温度，可以实现药片成分的快速筛查且无残留效应。本文建立的分析方案各有优势，可根据不同的案件情况进行选择，适应司法检验工作中筛查可疑药物药片的需要。

关键词：实时直接分析药片苯二氮卓类物质快速筛查

免疫应激介导的朝藿定B协同补骨脂甲素导致特异质肝损伤的拟靶向代谢组学研究

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中国中药杂志 2024年第2期49卷 443-452页

作者：林蒙蒙李蓥滢曹波徐静肖小河李国辉李春雨国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院北京100021 解放军总医院第五医学中心北京100039

补骨脂和淫羊藿是临床常用药对,既往研究显示两药可能引起特异质肝损伤,然而其物质基础以及发生机制尚不清楚。该研究基于肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)介导的免疫应激小鼠模型,以补骨脂及淫羊藿中2个主要化学成分... 详细信息

补骨脂和淫羊藿是临床常用药对,既往研究显示两药可能引起特异质肝损伤,然而其物质基础以及发生机制尚不清楚。该研究基于肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)介导的免疫应激小鼠模型,以补骨脂及淫羊藿中2个主要化学成分补骨脂甲素和朝藿定B为研究对象,通过检测细胞上清液中乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)释放量和小鼠血浆中丙氨酸氨基转氨酶(alanine aminotransferase,ALT)、天冬氨酸氨基转氨酶(aspartate transaminase,AST)含量,苏木精-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色观察肝脏病理学变化情况,分别在细胞及动物水平评估补骨脂甲素联合朝藿定B引起肝损伤的程度。借助拟靶向代谢组学技术和多元统计分析方法,考察给药前后小鼠血浆中内源性代谢物的影响,筛选差异代谢标志物,并进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集通路分析。结果表明,在细胞水平,使用TNF-α刺激2 h后,相较于正常组及单独给药组,补骨脂甲素可以使HepG2细胞中LDH释放量显著增加;补骨脂甲素联合朝藿定B后,LDH释放量在原来基础上进一步显著增加。在动物水平,对于正常小鼠,单独或联合补骨脂甲素均不引起肝损伤;对于免疫应激模型小鼠,单独给药补骨脂甲素或者朝藿定B均可引起肝损伤,补骨脂甲素或者朝霍定B联合给药时肝损伤进一步增强,表现为小鼠血浆中ALT、AST含量显著升高,并伴随肝脏组织大量炎性免疫细胞浸润。基于拟靶向代谢组学技术,筛选得到7个共有差异代谢物,根据受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析结果,其中曲线下面积(area under curve,AUC)大于0.9的包括D-氨基葡萄糖6-磷酸、N1-甲基-2-吡咯-5-甲酰胺、17β-硝基-5a-雄甾烷、葛花苷元-7-O-葡萄糖醛酸苷、N-(1-脱氧-1-果糖基)缬氨酸。因此,这5个差异代谢物可能是潜在的生物标志物。此外,烟酸盐和烟酰胺代谢及亚油酸代谢通路可能是补骨脂甲素联合朝藿定B诱导特异质肝损伤的关键代谢通路。综上,在TNF-α介导免疫应激的条件下,朝藿定B联合补骨脂甲素导致机体代谢扰动可能是二者协同导致特异质性药物性肝损伤(idiosyncratic drug-induced liver injury,IDILI)的重要机制。

关键词：中成药补骨脂甲素朝藿定B 特异质肝损伤肿瘤坏死因子-α 拟靶向代谢组学

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蛇葡萄属药用植物亲缘学研究

中国现代中药 2024年第6期26卷 978-988页

作者：曾铁鑫许利嘉宋颜君马培陈之端肖培根中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 教育部中草药物质基础与资源利用重点实验室北京100193 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室北京100193

蛇葡萄属(Ampelopsis Michaux)植物为多年生木本藤蔓植物,全世界有30余种,中国有17种,大部分为中国特有,多具有传统药用价值,可作茶饮。基于系统进化关系和形态学相似性,近期蛇葡萄属中具羽状复叶的种从该属中分出,成立牛果藤属(Nekemia... 详细信息

蛇葡萄属(Ampelopsis Michaux)植物为多年生木本藤蔓植物,全世界有30余种,中国有17种,大部分为中国特有,多具有传统药用价值,可作茶饮。基于系统进化关系和形态学相似性,近期蛇葡萄属中具羽状复叶的种从该属中分出,成立牛果藤属(Nekemias Raf),但这需要更多证据,特别是植物化学方面的证据支持。对蛇葡萄属植物亲缘关系、化学成分和药理活性进行归纳总结,并对其药用亲缘学进行探讨。蛇葡萄属中含有丰富的黄酮类化合物,但其主要种类存在差异,具羽状复叶的蛇葡萄种富含二氢杨梅素、杨梅素等类黄酮物质,而其余蛇葡萄属植物则检测到了白藜芦醇、儿茶素等酚酸类物质。这些化合物具有抗肿瘤、保肝、抗菌等活性,可与传统功效相关联。对蛇葡萄属植物的药用亲缘关系进行初步探讨,可为该属植物的资源保护和进一步开发提供参考。

关键词：蛇葡萄属化学成分传统功效药理活性药用植物亲缘学

口服草药来源的小RNA(XKC-sRNA-h3)可治疗血管紧张素Ⅱ诱导的小鼠高血压

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中国科学：生命科学 2024年第5期54卷 925-935页

作者：汤克功王小娜赵煜李晓北姜振宇梅颂陈明锐马一鸣杜芯仪乔翔宇孙娜刘佳齐蒋澄宇中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室北京100005

高血压是心血管疾病发病和死亡的重要危险因素之一,也是全球公共卫生关注的焦点.目前,寡核苷酸药物已被证明可用于多种疾病治疗,是未来极有前景的药物研发方向.本研究展示了一条草药来源的小RNA(small RNA, sRNA)——XKC-sRNA-h3(B55710... 详细信息

高血压是心血管疾病发病和死亡的重要危险因素之一,也是全球公共卫生关注的焦点.目前,寡核苷酸药物已被证明可用于多种疾病治疗,是未来极有前景的药物研发方向.本研究展示了一条草药来源的小RNA(small RNA, sRNA)——XKC-sRNA-h3(B55710460, F221.I000082.B11),通过靶向血管紧张素转换酶(angiotensin-converting enzyme, ACE)基因而在高血压小鼠模型中有显著的降压效果.相比降压药卡托普利,口服鞘氨醇(d18:1)-XKCsRNA-h3本草体可以更有效地缓解血管紧张素Ⅱ(angiotensin Ⅱ, Ang Ⅱ)诱导的小鼠高血压性心脏损伤和肾脏损伤.这些结果表明, XKC-sRNA-h3有望成为一种新型可口服治疗高血压的ACEI类寡核苷酸药物.

关键词：高血压寡核苷酸药物口服给药

头孢唑林及其杂质诱导的斑马鱼胃肠道毒性反应比较分析

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中国抗生素杂志 2024年第3期49卷 317-324页

作者：张苗青张靖溥胡昌勤中国医学科学院医药生物技术研究所北京协和医学院国家卫生健康委员会抗生素生物工程重点实验室抗感染药物研究北京市重点实验室北京100050 中国食品药品检定研究院北京102629

目的本研究利用药源性斑马鱼胃肠道毒性反应模型,比较分析头孢唑林及其杂质F和杂质A诱导的胃肠道毒性反应及其机制。方法荧光显微镜下活体观测头孢唑林、杂质F和杂质A对斑马鱼幼鱼胃肠道排空过程的影响,评价其毒性反应,比较分析3种化合... 详细信息

目的本研究利用药源性斑马鱼胃肠道毒性反应模型,比较分析头孢唑林及其杂质F和杂质A诱导的胃肠道毒性反应及其机制。方法荧光显微镜下活体观测头孢唑林、杂质F和杂质A对斑马鱼幼鱼胃肠道排空过程的影响,评价其毒性反应,比较分析3种化合物结构与毒性关系;利用RNA-seq技术分析3种化合物胃肠道毒性反应机制的差异;利用分子对接模拟分析3种化合物与胆汁盐外排蛋白(BSEP)蛋白结合亲和力。结果杂质F胃肠排空能力明显大于头孢唑林,杂质A的胃肠排空能力明显小于头孢唑林,MMTD结构是头孢唑林导致胃肠道毒性反应的主要毒性功能基团;RNA-seq分析发现杂质F处理组分别与头孢唑林和杂质A处理组相比较具有45个共同呈显著差异的基因,主要显著富集在矿物质吸收通路和胆汁分泌通路中,其中abcb11b基因的表达与胃肠道毒性反应呈明显相关;分子对接结果显示杂质F与斑马鱼BSEP的亲和力高于头孢唑林,头孢唑林的结合亲和力高于杂质A。结论临床中头孢唑林钠的胃肠毒性反应可能与产品中杂质F有关,通过药物和杂质与BSEP蛋白结合的亲和力可以评估头孢唑林杂质引起的胃肠道毒性反应的差异,可为头孢唑林钠的生产工艺评估和质量控制提供理论依据。

关键词：头孢唑林杂质斑马鱼胃肠道毒性

靶向TLR4的口服寡核苷酸药物BZL-sRNA-20可有效缓解小鼠急性肺损伤

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中国科学:生命科学 2024年第7期54卷 1279-1291页

作者：赵丹丹秦宇豪刘佳齐汤克功鲁帅尧刘子睿林烨暄张聪黄凤鸣常佳慧李昌田明尧马一鸣李晓芸周丛照李霄彭小忠金宁一蒋澄宇中国医学科学院基础医学研究所&北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室中国医学科学院医学生物学研究所中国农业科学院长春兽医研究所中国科学技术大学合肥微尺度物质科学国家研究中心

2019年12月底,新型冠状病毒病(coronavirus disease 2019, COVID-19)开始流行.急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)和急性肺损伤(acute lung injury, ALI)是由细菌脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)、禽流感病毒和新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)等引发的高致死疾病. Toll样受体4(Toll-like receptor 4, TLR4)是ARDS和ALI病理通路中的关键靶点.草药小RNA(small RNA,sRNA)已被报道是草药药效的重要成分之一.本研究发现,半枝莲来源的小核酸BZL-sRNA-20(检索号:B59471456; ID:F2201.Q001979.B11)是TLR4及促炎细胞因子的有效抑制剂,可下调细菌脂磷壁酸(lipoteichoic acid, LTA)和聚肌苷酸-聚胞苷酸(Poly(I:C))引发上升的促炎细胞因子水平,并能挽救禽流感病毒H5N1, SARSCoV-2及其多种变异株感染所致的细胞死亡.此外,口服本草体(bencaosome):(鞘氨醇(d22:0)+BZL-sRNA-20)可缓解LPS与SARS-CoV-2诱导的小鼠急性肺损伤.本研究结果表明,半枝莲来源的BZL-sRNA-20可能是一种广谱治疗ARDS/ALI的寡核苷酸药物.

关键词：寡核苷酸药物中草药 ARDS/ALI SARS-CoV-2

氨基酸取代的苯基醚类截短侧耳素衍生物的合成与抗菌活性研究

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中国抗生素杂志 2024年第1期49卷 46-56页

作者：向进罗新宇张文轩潘卫东吴松贵州医科大学药学院/省部共建药用植物功效与利用国家重点实验室贵阳550025 贵州省中国科学院天然产物研究中心贵阳550014 中国医学科学院&北京协和医学院药物研究所天然产物活性物质与功能国家重点实验室北京100050

目的设计合成截短侧耳素衍生物,寻找广谱、高效、安全的新化合物。方法以天然产物截短侧耳素为起始原料,合成3个氨基苯醚类截短侧耳素衍生物和8个氨基酸取代的苯基醚类截短侧耳素衍生物,并进行活性测试、初步成药性评价以及分子对接研... 详细信息

目的设计合成截短侧耳素衍生物,寻找广谱、高效、安全的新化合物。方法以天然产物截短侧耳素为起始原料,合成3个氨基苯醚类截短侧耳素衍生物和8个氨基酸取代的苯基醚类截短侧耳素衍生物,并进行活性测试、初步成药性评价以及分子对接研究。结果设计合成了11个未见文献报道的新型截短侧耳素衍生物,其结构经核磁、ESI-MS和HRMS确证。大多数化合物对标准金黄色葡萄球菌和标准大肠埃希菌的抗菌活性均优于lefamulin,并且其细胞毒活性低(IC50>10μmol/L),理化性质预测良好。分子对接结果表明,化合物侧链连接的氨基苯醚与氨基酸能够与结合空腔的核苷酸形成更多的氢键相互作用。结论氨基苯酚以及氨基酸的修饰有助于提高截短侧耳素类抗生素的抗菌活性和理化性质。

关键词：截短侧耳素天然产物结构修饰抗菌活性分子对接细胞毒活性

基于人工智能驱动分子工厂技术的Menin抑制剂优化

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中国药科大学学报 2024年第3期55卷 326-334页

作者：曾浩吴国振邹武新王哲宋剑飞施慧汪小涧侯廷军邓亚峰杭州碳硅智慧科技发展有限公司杭州310018 浙江大学药学院杭州310058 中国医学科学院、北京协和医学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室活性物质发现与适药化研究北京市重点实验室北京100050 清华大学自动化系北京100084

以深度学习为代表的新一代人工智能技术已经成为推动新药研发的重要驱动力。本文创造性地提出了一种基于人工智能技术的创新药物分子设计和优化工作流程“分子工厂”,该流程融合了自主研发的智能分子生成模型、高性能分子对接算法以及... 详细信息

以深度学习为代表的新一代人工智能技术已经成为推动新药研发的重要驱动力。本文创造性地提出了一种基于人工智能技术的创新药物分子设计和优化工作流程“分子工厂”,该流程融合了自主研发的智能分子生成模型、高性能分子对接算法以及高精度亲和力预测方法,已作为核心模块被整合进一站式药物设计软件平台DrugFlow,为先导化合物发现和优化提供了一整套成熟的解决方案。利用“分子工厂”模块,针对Menin蛋白开展了抗耐药第2代抑制剂的研发。通过计算和实验的结合,快速获得多个潜力化合物,其中化合物RG-10对Menin野生型、M327I突变体和T349M突变体的IC50分别为9.681 nmol/L、233.2 nmol/L和40.09 nmol/L;与已进入Ⅱ期临床的阳性参照分子SNDX-5613相比,其对M327I和T349M突变体的抑制活性显著提升。上述研究充分展现了“分子工厂”技术在新药研发项目中的独特优势,能快速高效地针对特定蛋白结构产生高质量的活性分子,对推动新药研发具有重大价值和深远意义。

关键词：分子工厂人工智能分子生成分子对接 Menin抑制剂

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基于数据挖掘和网络药理学的三七保健品组方规律及增强免疫力保健功能研究

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中草药 2024年第1期55卷 205-216页

作者：刘树森王敏刘永铭肖海燕叶景学曹丽李文兰孙桂波哈尔滨商业大学药学院黑龙江哈尔滨150076 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所中药(天然药物)创新药物研发北京市重点实验室北京100193 上海中医药大学附属曙光医院石氏伤科医学中心上海201203

目的通过数据挖掘、网络药理学及分子对接技术分析含三七的保健食品的组方规律并对其潜在的机制进行研究。方法通过检索国家市场监督管理总局及药智网含三七的保健食品,采用频数统计和关联规则等方法分析基本信息及组方规律。通过检索TC... 详细信息

目的通过数据挖掘、网络药理学及分子对接技术分析含三七的保健食品的组方规律并对其潜在的机制进行研究。方法通过检索国家市场监督管理总局及药智网含三七的保健食品,采用频数统计和关联规则等方法分析基本信息及组方规律。通过检索TCMSP等数据库、整理相关文献获得三七相关化学成分及潜在靶点;根据保健功能频次分析结果,从GeneCards等数据库中筛选相关的潜在靶点信息;借助R语言相关软件包、String数据库、Cytoscape软件等筛选出关键成分和关键靶点。随后进行蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,根据度(degree)值筛选出核心靶点,并进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。最后,利用分子对接技术验证核心靶点和关键成分的作用亲和力。结果共收集含三七保健食品345个,保健功能频次出现最多的是有助于增强免疫力。获得三七相关化学成分684个,其中有效成分339个及靶基因2078个,获得免疫力相关的潜在靶点2076个;通过三七和免疫力相关靶基因取交集,得到关键靶点434个,三七增强免疫力的核心靶点10个;三七通过细胞因子产生的正向调节等过程及磷脂酰肌醇-3-羟激酶(phosphatidylinositol-3-hydroxykinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)等信号通路起到提高免疫力的作用。分子对接结果也提示三七的关键成分与核心靶点能自发稳定地结合。结论通过数据挖掘、网络药理学和分子对接研究,分析了含三七的保健食品相关信息,初步揭示三七增强免疫力的潜在靶点与机制通路,为三七后续产品的研发提供了理论依据。

关键词：三七保健食品数据挖掘网络药理学增强免疫力人参皂苷Rg1 人参皂苷Rb1 三七皂苷R1 三七素槲皮素