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马铃薯Stpatatin 05基因转录调控因子筛选及互作验证

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生物技术通报 2025年

作者：俞婷黄丹丹朱炎辉杨梅宏高冬丽云南师范大学云南省马铃薯生物学重点实验室中国农业科学院深圳农业基因组研究所

【目的】筛选对patatin启动子有调控作用的转录因子，为patatin蛋白积累提供新的基因资源。【方法】选取Stpatatin 05作为候选基因，克隆其启动子序列，构建pAbAi-Stpatatin 05pro诱饵载体，将其转化至酵母细胞中，获得诱饵酵母菌株。... 详细信息

【目的】筛选对patatin启动子有调控作用的转录因子，为patatin蛋白积累提供新的基因资源。【方法】选取Stpatatin 05作为候选基因，克隆其启动子序列，构建pAbAi-Stpatatin 05pro诱饵载体，将其转化至酵母细胞中，获得诱饵酵母菌株。利用马铃薯幼嫩块茎组织的c DNA文库进行酵母单杂交筛库实验，对候选蛋白进行互作验证和互作位点分析，并利用双荧光素酶报告实验分析其对下游靶标基因表达的影响。【结果】经酵母单杂交筛选获得一个候选蛋白StMYB86-like。StMYB86-like属于MYB类转录因子家族，该蛋白编码320个氨基酸，定位在细胞核。克隆StMYB86-like基因全长序列，进行酵母单杂交验证，结果显示在30 mmol/L 3-氨基-1,2,4-三氮唑的条件下，对照组酵母不能正常生长，而实验组酵母能正常生长，表明转录因子与基因启动子存在互作。酵母单杂交结果表明StMYB86-like转录因子能够结合启动子中的CAACTG结构域，双荧光素酶报告实验证明StMYB86-like负调控下游靶标基因的表达。【结论】StMYB86-like与Stpatatin 05启动子互作，可能对马铃薯块茎中patatin蛋白的积累发挥作用。

关键词：马铃薯 patatin蛋白酵母单杂交 Stpatatin 05 StMYB86-like 转录调控

橘小实蝇离子型受体基因家族的全基因组注释及分析

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昆虫学报 2025年

作者：杨明寰王齐严善春刘伟王桂荣东北林业大学林学院森林生态系统可持续经营教育部重点实验室中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业农村部合成生物重点实验室

[目的]离子型受体(ionotropic receptors,IRs)在昆虫的嗅觉、味觉、温度和湿度感受等方面起到重要的作用。本研究结合转录组数据在全基因组水平上对橘小实蝇Bactrocera dorsalis离子型受体基因家族进行鉴定,为进一步研究橘小实蝇离子型... 详细信息

[目的]离子型受体(ionotropic receptors,IRs)在昆虫的嗅觉、味觉、温度和湿度感受等方面起到重要的作用。本研究结合转录组数据在全基因组水平上对橘小实蝇Bactrocera dorsalis离子型受体基因家族进行鉴定,为进一步研究橘小实蝇离子型受体基因功能提供理论基础。[方法]利用隐马尔可夫模型、多重比对、基因结构域和系统发育分析在橘小实蝇全基因组中鉴定IR基因。利用TBtools对IR基因家族进行染色体定位、基因全长结构、蛋白保守基序和共线性分析,并通过EasyCodeML计算进化压。利用Hisat2及Stringtie软件计算分析橘小实蝇IR基因在外周神经组织(触角、口器、前足、中足、后足和产卵器)中的表达模式,并利用qPCR进行验证。[结果]在橘小实蝇全基因组中共鉴定获得39个候选IR基因,全部位于常染色体上,其中26个IR基因获得了转录组支持的CDS全长结构;全长IR基因共享2～8个相同的蛋白保守基序,说明其结构的保守性;28个候选IR基因与果实蝇属Bactrocera其他实蝇的IR基因存在共线性关系,其中1个IR基因受到强烈的负选择;17个候选IR共线性基因在橘小实蝇外周神经组织中表达,其中10个仅表达于触角,2个仅表达于口器,1个仅表达于产卵器。另外,1个IR基因仅在触角和雄性生殖器中表达,1个IR基因除产卵器不表达其余组织都表达,2个IR基因在所有外周神经组织中都表达,另有6个IR基因存在雌雄表达差异,其他11个候选IR基因在外周神经组织中无表达。[结论]本研究利用基因组和转录组数据对橘小实蝇离子型受体基因家族进行了系统鉴定,并对该基因家族成员的结构特征、进化关系和表达模式进行了分析,为进一步研究橘小实蝇离子型受体基因的功能提供了理论基础。

关键词：橘小实蝇离子型受体全基因组鉴定基因特征系统发育进化

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动态浊度法测定饲料中细菌内毒素含量的研究

中国饲料 2025年

作者：陈家舒熊雄段锦梅韩和悦熊诗阳朱红惠广东省科学院微生物研究所广东省微生物分析检测中心华南应用微生物国家重点实验室农业农村部农业微生物组学与精准应用重点实验室农业农村部农业微生物组学重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室

本实验基于动态浊度法的基础,旨在利用动态试管仪建立饲料中细菌内毒素的测定方法。将供试品配成10%溶液,涡旋混合后,采用10000 r/min离心10 min后取上清液,应用动态浊度法进行细菌内毒素测定。结果显示:该方法的相关系数(r)为0.9977,... 详细信息

本实验基于动态浊度法的基础,旨在利用动态试管仪建立饲料中细菌内毒素的测定方法。将供试品配成10%溶液,涡旋混合后,采用10000 r/min离心10 min后取上清液,应用动态浊度法进行细菌内毒素测定。结果显示:该方法的相关系数(r)为0.9977,加标回收率为97.1%～156.4%,相对标准偏差(RSD)(n=6)为2.0%～7.9%,28种不同类型的饲料样品中细菌内毒素含量在0～349.220 EU/mg。研究表明,实验所用方法操作简便、准确度高、重复性好、应用范围广,适用于饲料中细菌内毒素含量的测定。

关键词：饲料细菌内毒素动态浊度法动态试管仪

内蒙古地区自然发酵乳中乳酸菌的分离鉴定及优良菌株筛选

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食品与发酵工业 2025年第1期51卷 11-17页

作者：雷雪艳赵丽霞李瑜刘文俊内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业农村部奶制品加工重点实验室内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室内蒙古呼和浩特010018

鲜乳及其发酵乳是牧民日常饮食中主要的营养物来源之一,其中含有丰富的乳酸菌资源。为了从纯培养角度了解不同乳源中乳酸菌的菌群结构并获取其中宝贵的乳酸菌菌种,该研究采用纯培养技术从内蒙古牧区21份样品中分离得到411株乳酸菌,包括1... 详细信息

鲜乳及其发酵乳是牧民日常饮食中主要的营养物来源之一,其中含有丰富的乳酸菌资源。为了从纯培养角度了解不同乳源中乳酸菌的菌群结构并获取其中宝贵的乳酸菌菌种,该研究采用纯培养技术从内蒙古牧区21份样品中分离得到411株乳酸菌,包括10个属,21个种。其中乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)分离株的数量最多,其次为瑞士乳杆菌(Lactobacillus helveticus)和马乳酒样乳杆菌(Lactobacillus kefiranofaciens)。优势菌群分析发现不同乳源的菌群结构差异较大,酸马乳的菌群多样性最丰富,马乳酒样乳杆菌是其优势菌种之一。根据酸马乳低pH值、低酒精含量的特点,从93株马乳酒样乳杆菌中筛选出4株在低pH值(pH 3.0)和6%(体积分数)乙醇环境下耐受性较好的菌株,然后进一步研究其人工胃肠液耐受性、乙醇耐受性和对3种食品中常见致病菌的抑菌能力。最终筛选出2株马乳酒样乳杆菌分别为:IMAU12331与IMAU12208,具有较好的耐受性和抑菌特性,可作为潜在益生菌开发利用,具有较高的潜在应用价值。

关键词：乳酸菌分离鉴定菌株筛选耐受性抑菌特性

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秸秆和稻糠对稻田土壤硅素转化及水稻硅吸收的影响

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华中农业大学学报 2025年

作者：杨丽雯陈剑珠宁川川蔡昆争华南农业大学资源环境学院/农业农村部华南热带农业环境重点实验室/广东省生态循环农业重点实验室

为促进有机物料循环利用、提高稻田土壤硅有效性，设计2季水稻盆栽试验，试验设7个处理：对照（CK）、0.5%秸秆（JG1）、1%秸秆（JG2）、1.5%秸秆（JG3）、0.5%稻糠（DK1）、1%稻糠（DK2）、1.5%稻糠（DK3），研究2种有机物料稻秆和稻... 详细信息

为促进有机物料循环利用、提高稻田土壤硅有效性，设计2季水稻盆栽试验，试验设7个处理：对照（CK）、0.5%秸秆（JG1）、1%秸秆（JG2）、1.5%秸秆（JG3）、0.5%稻糠（DK1）、1%稻糠（DK2）、1.5%稻糠（DK3），研究2种有机物料稻秆和稻糠不同用量对土壤硅形态、水稻植株硅吸收和地上部干物质积累量、土壤肥力的影响。结果显示，2种富硅有机物料显著提高土壤水溶性硅、有效硅、有机结合态硅、无定形硅含量，总体上与用量成正比，以稻糠处理的提高幅度较高。与CK相比，1%、1.5%稻糠施用分别使土壤水溶性硅含量提高18.85%～46.58%，有效硅含量提高11.51%%～118.82%，有机结合态硅含量提高21.88%～51.95%，铁锰氧化物结合态硅含量提高3.38%～19.17%，无定形硅含量提高6.41%～22.14%。2种有机物料提高水稻茎叶硅含量和积累量，稻糠施用效果更显著；与CK相比，秸秆和稻糠施用分别使水稻茎叶硅积累量显著提高0.60～2.51倍、1.33～4.08倍。2种有机物料提高水稻地上部干物质积累量，在不同程度上增加土壤有机质和速效氮、磷、钾养分含量。综上，2种有机物料都能增加土壤肥力，提高土壤硅有效性，促进水稻对硅的吸收，其中稻糠的提高幅度更大，但从实践应用的角度来看，秸秆更具有一定的应用前景。

关键词：水稻秸秆稻糠土壤硅形态硅有效性硅吸收

日粮中添加枯草芽孢杆菌对高氧气调包装猪肉蛋白质和脂质氧化的影响

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食品科学 2025年第1期46卷 142-148页

作者：张悦于江刘飞张玉玉张一敏毛衍伟山东农业大学食品科学与工程学院山东泰安271018 山东省农业科学院畜牧兽医研究所农业农村部畜禽生物组学重点实验室山东济南250100

为探究日粮添加枯草芽孢杆菌对猪肉抗氧化能力以及高氧气调包装贮藏期间猪肉肉色、蛋白质氧化、脂质氧化和感官品质的影响,选取对照组(只饲喂基础日粮)和处理组(基础日粮添加枯草芽孢杆菌)的三元杂交(杜洛克×长白×大约克)猪各6只,屠... 详细信息

为探究日粮添加枯草芽孢杆菌对猪肉抗氧化能力以及高氧气调包装贮藏期间猪肉肉色、蛋白质氧化、脂质氧化和感官品质的影响,选取对照组(只饲喂基础日粮)和处理组(基础日粮添加枯草芽孢杆菌)的三元杂交(杜洛克×长白×大约克)猪各6只,屠宰后取背最长肌测定抗氧化酶活性,其余背最长肌样品进行高氧气调包装,4℃冷库贮藏,分别在0、5、10、15、20?d测定肉色、丙二醛(malondialdehyde,MDA)、羰基和巯基含量,并进行感官评价。结果表明:与对照组相比,处理组能够显著提高超氧化物歧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶和过氧化氢酶活性(P组能够显著降低MDA含量(P<0.05),抑制高氧气调包装猪肉的脂肪氧化;日粮中添加枯草芽孢杆菌能够显著抑制高氧气调包装猪肉的蛋白质氧化、羰基的生成和巯基损失(P<0.05),同时显著提高猪肉打开包装前的颜色和打开包装后的总体喜爱度评分(P<0.05)。综上,在日粮中添加枯草芽孢杆菌可提高猪肉的抗氧化能力、改善猪肉在高氧气调包装中的肉色、抑制蛋白质和脂质氧化,提高猪肉的食用品质。

关键词：枯草芽孢杆菌猪肉抗氧化能力脂质氧化蛋白质氧化

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MicroRNA对肌肉再生功能调控研究进展

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遗传 2025年

作者：周泰增陈秋阳杨祎挺甘麦邻朱砺沈林園四川农业大学猪禽种业全国重点实验室四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室四川农业大学动物科技学院农业农村部畜禽生物组学重点实验室

MicroRNA（miRNA）是一类大小在22 nt左右的单链非编码短RNA分子，已被证明参与了几乎所有细胞事件中基因表达的转录后调节，包括细胞增殖、迁移、分化和凋亡。因此，miRNA受到最为广泛的研究和关注。miRNA通过靶向骨骼肌再生不同阶段... 详细信息

MicroRNA（miRNA）是一类大小在22 nt左右的单链非编码短RNA分子，已被证明参与了几乎所有细胞事件中基因表达的转录后调节，包括细胞增殖、迁移、分化和凋亡。因此，miRNA受到最为广泛的研究和关注。miRNA通过靶向骨骼肌再生不同阶段的关键因素，在肌肉再生过程中发挥着重要作用。本文探讨了miRNA在肌肉再生过程中通过影响卫星细胞静止、成肌细胞增殖、分化从而调控肌肉再生能力，并且更新了miRNA在肌肉再生过程中与PI3K/AKT、TGF-β/Smad信号通路互作的研究进展，有助于研究者更多地了解miRNA在肌肉再生生物学中的知识，为非编码RNA参与肌肉再生提供了更深入的理解。

关键词： microRNA 肌肉再生肌肉卫星细胞成肌细胞信号通路

施氮量对测墒补灌小麦光合特性、籽粒灌浆及产量的影响

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麦类作物学报 2025年

作者：董亚博尤薇石玉张永丽张振山东农业大学农学院/小麦育种全国重点实验室/农业农村部作物生理生态与耕作重点实验室

为探究黄淮海地区小麦高产的适宜施氮量,以小麦品种烟农1212为供试材料,通过大田试验,设置0kg·hm-2（N0）、150kg·hm-2（N150）、210kg·hm-2（N210）、270kg·hm-2（N270）共4个施氮水平,分析了施氮量对测墒补灌小麦旗叶光合特性和... 详细信息

为探究黄淮海地区小麦高产的适宜施氮量,以小麦品种烟农1212为供试材料,通过大田试验,设置0kg·hm-2（N0）、150kg·hm-2（N150）、210kg·hm-2（N210）、270kg·hm-2（N270）共4个施氮水平,分析了施氮量对测墒补灌小麦旗叶光合特性和籽粒灌浆的影响。结果表明,N210处理下小麦花后14～28d旗叶SPAD值显著高于N0和N150处理,与N270处理差异不显著。N210处理下小麦花后14～28d旗叶光合参数及光合酶活性均显著高于N0和N150处理,但施氮量增至N270时,旗叶光合参数及光合酶活性无显著变化。N210处理下籽粒平均灌浆速率和最大灌浆速率均显著高于其他处理,有利于粒重的提高。N210处理下千粒重和籽粒产量最高,其中产量较N0、N150和N270处理分别增加了43.93%、12.35%和4.36%。综上所述,施氮量210kg·hm-2是本试验条件下高产的最佳施氮量。

关键词：施氮量小麦光合特性籽粒灌浆产量

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两个甘薯野生近缘种的比较基因组分析

植物遗传资源学报 2025年

作者：肖世卓许攀王珧戴习彬周志林曹清河江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业农村部甘薯生物学与遗传育种重点实验室兰州大学草地农业科技学院/草种创新与草地农业生态系统全国重点实验室/农业农村部草牧业创新重点实验室

甘薯是重要的农作物，其野生近缘种数量庞大，蕴含着丰富的基因变异。本研究利用公开发表的、基因组组装质量较高的两个甘薯野生种进行了比较基因组分析。发掘了覆盖全基因组的1798184个SNP，同时还发掘了2076个易位和84个倒位，倒位中... 详细信息

甘薯是重要的农作物，其野生近缘种数量庞大，蕴含着丰富的基因变异。本研究利用公开发表的、基因组组装质量较高的两个甘薯野生种进行了比较基因组分析。发掘了覆盖全基因组的1798184个SNP，同时还发掘了2076个易位和84个倒位，倒位中包含2106个基因，富集分析显示这些基因主要富集于次级代谢产物的生物合成等通路。其中34段倒位的断点位于基因内部，可能影响到基因的结构。两个基因组之间存在10226个插入型和11411个缺失型的结构变异（SV），对这些SV进行了注释，并对可能影响基因功能或表达的SV进行了基因富集分析，结果发现这些可能受影响的基因主要富集于次级代谢产物的通路，DNA修复和复制等相关功能的基因也出现了富集。通过对两个野生种和其它近缘种共线性基因对的同义替换率（Ks）和四倍简并位点颠换率（4DTv）的统计，说明番薯属植物的共同祖先在发生了全基因组三倍化事件之后才分化成不同的种。以上研究将为甘薯野生近缘种优异变异的发掘和物种分化提供有力支撑。

关键词：甘薯野生近缘种比较基因组学