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基于比较基因组学解析植物乳植杆菌ST的功能基因组

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食品科学 2023年第14期44卷 86-93页

作者：杨淑娟周金萍李海燕曹振辉孙志宏林秋叶内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业农村部奶制品加工重点实验室内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室乳酸菌与发酵乳制品省部共建协同创新中心内蒙古呼和浩特010018 云南农业大学食品科学技术学院云南昆明650201 云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201

解析植物乳植杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)ST的功能基因组特征,为其开发利用奠定基础。对*** ST与1株模式菌株ATCC 14197T基因组序列及NCBI中已公开的152株***全基因组序列进行比较基因组学分析。基于154株***的1262个核心基因... 详细信息

解析植物乳植杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)ST的功能基因组特征,为其开发利用奠定基础。对*** ST与1株模式菌株ATCC 14197T基因组序列及NCBI中已公开的152株***全基因组序列进行比较基因组学分析。基于154株***的1262个核心基因构建了系统发育树,发现ST与肠道分离株BCC9546遗传距离最近。乳、肉制品分离株分别集中在第II分支的上半部分和下半部分,因来源不同而存在差异,且存在一定的聚集性。同时果蝇分离株具有明显聚集趋势。功能注释分析发现,ST基因组中包含磷酸转移酶系统糖类转运系统相关基因,还注释到了免疫调控通路相关基因,同时有较多水解或重排糖苷键的基因。ST不存在毒力因子和耐药基因。与其他***相比,ST携带特有的与能量转运功能有关的功能基因ecfT。此外,ST具有与群体感应信号分子AI-2、黏附分子和谷胱甘肽合成相关的功能基因。API 50 CHL碳水化合物代谢结果显示,*** ST能利用丰富的碳源,可代谢包括单糖类、糖苷和二糖类及多糖类等中29种碳源。本研究从基因组层面分析*** ST功能基因组特征,同时结合糖发酵表型实验结果,认为*** ST是1株安全且具有潜在益生特性的益生菌,为其开发利用提供遗传学基础。

关键词：植物乳植杆菌ST 比较基因组学功能基因

饲喂方式对德州驴生长性能、营养物质消化率和盲肠微生物多样性的影响

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动物营养学报 2020年第2期32卷 706-714页

作者：刘桂芹格尔乐其木格张心壮邢敬亚曲洪磊王涛苏少锋刘明丽赵一萍芒来内蒙古农业大学动物科学学院马属动物研究中心内蒙古自治区马属动物遗传育种与繁殖重点实验室农业农村部马属动物遗传育种与繁殖科学观测实验站呼和浩特010018 聊城大学农学院山东省黑毛驴高效繁育与生态饲养工程技术研究中心山东省驴产业科技协同创新中心聊城252059 国家胶类中药工程技术研究中心东阿阿胶股份有限公司东阿252201

本试验旨在研究饲喂方式对德州驴生长性能、营养物质消化率和盲肠微生物多样性的影响。选择体重[(215±10)kg]相近、2周岁左右的健康德州公驴15头,随机分为C1组(饲喂方式为先粗后精)、C2组(饲喂方式为先精后粗)、C3组[饲喂方式为全混合... 详细信息

本试验旨在研究饲喂方式对德州驴生长性能、营养物质消化率和盲肠微生物多样性的影响。选择体重[(215±10)kg]相近、2周岁左右的健康德州公驴15头,随机分为C1组(饲喂方式为先粗后精)、C2组(饲喂方式为先精后粗)、C3组[饲喂方式为全混合日粮(TMR)],每组5头,预试期7 d,正试期75 d。结果显示:1)C2组平均日增重极显著高于C1和C3组(P≤0.01),C1组干物质和酸性洗涤纤维消化率以C1组最高,C3组次之,C2组最低,C1组与C2组间存在显著差异(P≤0.05)。2)饲喂方式对德州驴盲肠微生物组成有一定影响。在门水平上,各组盲肠微生物均以厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)为主(二者占比>75%),其次为螺旋体菌门(Spirochaetes)、变形菌门(Proteobacteria)和纤维杆菌门(Fibrobacteres),且C2组厚壁菌门相对丰度高于C1组和C3组;在属水平上,将401个属中相对丰度低于1%的属聚为其他(占比>75%)后,各组均以其他为优势菌属;随后,C1组以螺旋体科未定义属(unidenti⁃fied⁃Spirochaetaceae)和厌氧孤菌属(Anaerovirbrio)为主,C2组以厌氧孤菌属、链球菌属(Strepto⁃coccus)和螺旋体科未定义属为主,C3组则以乳酸杆菌属(Lactobacillus)和螺旋体科未定义属为主。3)通过UPGMAA聚类树、主成分分析和物种差异性分析发现,3组德州驴盲肠微生物组成不同,且C2组与其他2组差别较大,C1组和C3组可聚为一类。综上可知,饲喂方式可极显著影响德州驴的平均日增重,显著影响干物质和酸性洗涤纤维消化率,并可改变盲肠微生物组成。

关键词：饲喂方式德州驴生长性能营养物质消化率盲肠微生物多样性

黄花蒿乙醇提取物对脂多糖诱导损伤奶牛乳腺细胞中乳蛋白合成的影响

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动物营养学报 2021年第9期33卷 5236-5245页

作者：胡耀宋洁王丽芳敖长金内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区高校动物营养与饲料科学重点实验室呼和浩特010018 农业农村部农产品质量安全风险评估实验室(呼和浩特) 内蒙古自治区农牧业科学院呼和浩特010031

本试验旨在通过奶牛乳腺上皮细胞(BMECs)体外培养技术,研究黄花蒿乙醇提取物(AAE)对脂多糖(LPS)诱导损伤BMECs活力以及乳蛋白合成相关基因表达的影响。试验分为5组,对照组:BMECs用基础培养基常规培养15 h;模型组:BMECs用基础培养基常规... 详细信息

本试验旨在通过奶牛乳腺上皮细胞(BMECs)体外培养技术,研究黄花蒿乙醇提取物(AAE)对脂多糖(LPS)诱导损伤BMECs活力以及乳蛋白合成相关基因表达的影响。试验分为5组,对照组:BMECs用基础培养基常规培养15 h;模型组:BMECs用基础培养基常规培养3 h+10μg/mL LPS处理12 h;AAE+LPS组:BMECs分别用含3、6、12μg/mL AAE的基础培养基培养3 h+10μg/mL LPS处理12 h。结果表明:1)与对照组相比,模型组的BMECs活力显著降低(P动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、信号转导和转录激活因子5(STAT5)、真核细胞翻译启动因子4E结合蛋白1(EIF4EBP1)、核糖体S6蛋白激酶1(S6K1)、Janus激酶2(JAK2)基因表达量显著增加(P<0.05),6、12μg/mL AAE组真核起始因子4E(EIF4E)基因表达量显著增加(P<0.05)。由此可见,12μg/mL AAE对LPS诱导损伤BMECs活性和乳蛋白合成有较好的预保护效果。

关键词：黄花蒿乙醇提取物乳蛋白基因表达脂多糖

植物精油和胆盐复合制剂对山羊肠道屏障功能的影响

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动物营养学报 2023年第5期35卷 3174-3182页

作者：高瑞玲李胜利金鹿张春华张崇志章嘉诚孙海洲内蒙古自治区农牧业科学院动物营养与饲料研究所内蒙古自治区草食动物营养科学重点实验室呼和浩特010031

本试验旨在研究饲粮中添加植物精油和胆盐复合制剂对山羊肠道屏障功能的影响。选择24只5月龄的体重为(21.46±2.07)kg的阿拉善白绒山羊公羊,随机分为4组,每组6个重复,每个重复1只。对照组饲喂基础饲粮,试验组均在基础饲粮中额外添加5 g... 详细信息

本试验旨在研究饲粮中添加植物精油和胆盐复合制剂对山羊肠道屏障功能的影响。选择24只5月龄的体重为(21.46±2.07)kg的阿拉善白绒山羊公羊,随机分为4组,每组6个重复,每个重复1只。对照组饲喂基础饲粮,试验组均在基础饲粮中额外添加5 g/kg以麦饭石为载体的复合制剂;其中试验1组(T1组)复合制剂中含500 mg植物精油(60%沙蒿油、40%香芹酚+肉桂醛+牛至油),试验2组(T2组)复合制剂中含500 mg植物精油(60%沙蒿油、40%香芹酚+肉桂醛+牛至油)和500 mg胆盐,试验3组(T3组)复合制剂中含500 mg胆盐。预试期10 d,正试期60 d。结果表明:1)与对照组相比,T1组T2组的平均日采食量显著提高(P<0.05);T1组的料重比降低了28%,T2组的料重比降低了10%。2)与对照组相比,T1、T2组的空肠绒毛高度、绒毛高度/隐窝深度显著升高(P<0.05),T1组的空肠隐窝深度显著降低(P<0.05);T1组的回肠绒毛高度和绒毛高度/隐窝深度显著升高(P<0.05),T1、T2组的回肠隐窝深度显著降低(P<0.05)。3)与对照组相比,T1组的盲肠黏膜闭锁小带蛋白-1(ZO-1)的mRNA相对表达量显著提高(P<0.05);T2和T3组的瘤胃闭锁蛋白(Occludin)的mRNA相对表达量显著提高(P<0.05),T1和T2组的回肠黏膜Occludin的mRNA相对表达量显著提高(P<0.05);T1和T3组的盲肠黏膜封闭蛋白-1(Claudin-1)的mRNA相对表达量显著提高(P<0.05);T1、T2和T3组的肝脏法尼醇X受体(FXR)的mRNA相对表达量显著提高(P<0.05)。由此可见,饲粮中添加复合植物精油对山羊平均日采食量、料重比以及肠道组织形态发育效果最佳,对肠道紧密连接蛋白的mRNA表达有促进作用;饲粮中添加植物精油和胆盐复合制剂在一定程度上也能提高山羊平均日采食量、降低料重比,且在肠道健康发育过程中也有积极影响。

关键词：幼龄绒山羊植物精油胆盐肠道屏障

蒿属植物活性成分对哺乳动物乳房炎的影响及作用机制

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动物营养学报 2021年第4期33卷 1936-1943页

作者：胡耀宋洁王丽芳敖长金内蒙古自治区农牧业科学院农业农村部农产品质量安全风险评估实验室(呼和浩特)呼和浩特010031 内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区高校动物营养与饲料科学重点实验室呼和浩特010018

长期以来,动物乳房炎对全世界畜牧业造成了巨量的经济损失,随着抗生素在全世界范围内逐渐被禁用,人们开始致力于寻找低毒副作用、高性价比的天然植物源替代物防治动物乳房炎。蒿属植物在我国有着悠久的药用历史,来源广泛,在诸多替代物... 详细信息

长期以来,动物乳房炎对全世界畜牧业造成了巨量的经济损失,随着抗生素在全世界范围内逐渐被禁用,人们开始致力于寻找低毒副作用、高性价比的天然植物源替代物防治动物乳房炎。蒿属植物在我国有着悠久的药用历史,来源广泛,在诸多替代物中备受青睐。本文综述了近年来国内外关于蒿属植物活性成分对哺乳动物乳房炎的影响及其作用机制的研究成果,旨在为蒿属植物在畜牧业的应用及其进一步开发提供参考。

关键词：乳房炎蒿属植物抗炎抗氧化抗菌

壳聚糖对蛋种鸡血清中脂类物质及脂肪细胞因子含量的影响

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动物营养学报 2018年第6期30卷 2310-2317页

作者：刘志友李胤豪闫素梅史彬林赵启龙张鹏飞内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区动物营养与饲料科学重点实验室呼和浩特010018 赤峰市农牧科学研究院赤峰024031

本试验旨在研究饲粮中添加不同水平壳聚糖对蛋种鸡血清中脂类物质及脂肪细胞因子含量的影响。试验选择26周龄健康海兰褐蛋种鸡450只,随机分为5组,每组6个重复,每个重复15只鸡。对照组饲喂不添加壳聚糖的基础饲粮,4个试验组分别饲喂在基... 详细信息

本试验旨在研究饲粮中添加不同水平壳聚糖对蛋种鸡血清中脂类物质及脂肪细胞因子含量的影响。试验选择26周龄健康海兰褐蛋种鸡450只,随机分为5组,每组6个重复,每个重复15只鸡。对照组饲喂不添加壳聚糖的基础饲粮,4个试验组分别饲喂在基础饲粮中添加250、500、1 000和2 000 mg/kg壳聚糖的试验饲粮。试验期为56 d。结果表明:与对照组相比,饲粮添加250、500、1 000和2 000 mg/kg壳聚糖可不同程度地降低试验第28天和第56天蛋种鸡血清中总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、游离脂肪酸(FFA)的含量及肝脏FFA含量。试验第28天时,与对照组相比,饲粮添加250、500和1 000 mg/kg壳聚糖可显著降低蛋种鸡血清中甘油三酯(TG)含量(P≤0.05),添加500 mg/kg壳聚糖可显著降低蛋种鸡血清中极低密度脂蛋白(VLDL)含量(P≤0.05),添加250、500、1 000和2 000 mg/kg壳聚糖可显著降低蛋种鸡血清中瘦素(LEP)含量(P≤0.05),添加250 mg/kg壳聚糖可显著增加蛋种鸡血清中高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)含量(P≤0.05)。试验第28天和第56天时,蛋种鸡血清TC含量随壳聚糖添加水平增加均呈现显著的线性下降(P<0.01);试验第28天时,蛋种鸡血清TG(P<0.01)、HDL-C(P<0.01)、FFA(P=0.04)和VLDL含量(P<0.01)与壳聚糖添加水平呈显著的二次曲线关系,通过回归分析得出壳聚糖添加水平在652.56~967.18 mg/kg时对上述指标有较好的调节效果。由此可见,饲粮添加壳聚糖可改善蛋种鸡体内脂质代谢的健康水平,且其对蛋种鸡血清脂类物质含量及肝脏FFA含量的影响与其添加水平有关。

关键词：壳聚糖蛋种鸡脂质代谢游离脂肪酸极低密度脂蛋白脂肪细胞因子

基于转录组测序对不同岁龄大青山山羊背最长肌中脂肪代谢相关基因的筛选及分析

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农业生物技术学报 2023年第6期31卷 1193-1205页

作者：张保军田建军张燕军李金泉李丽杰贺银凤内蒙古农业大学食品科学与工程学院内蒙古农业大学动物科学学院农业农村部肉羊遗传育种重点实验室

大青山山羊(Capra hircus)是内蒙古当地典型的肉绒兼用型山羊类群之一。养殖时间、方式等与动物肌肉组织中的脂肪蓄积(或代谢)存在一定关联，而肌肉中的脂肪含量对肉品质产生直接影响。为探索不同养殖阶段大青山山羊肉质的转录组差异及... 详细信息

大青山山羊(Capra hircus)是内蒙古当地典型的肉绒兼用型山羊类群之一。养殖时间、方式等与动物肌肉组织中的脂肪蓄积(或代谢)存在一定关联，而肌肉中的脂肪含量对肉品质产生直接影响。为探索不同养殖阶段大青山山羊肉质的转录组差异及相关差异基因的数据信息，本研究以3个不同岁龄(1.5,2.5和3.5岁)大青山山羊为研究对象，对其背最长肌进行肉质性状指标测定和转录组测序分析。结果表明，3个岁龄组在滴水损失、p H方面差异不显著，3.5岁龄的粗脂肪含量和剪切力显著高于其他两个岁龄组(P研究获得的差异表达基因可为大青山山羊肉质特性的深入研究提供基础资料。

关键词：大青山山羊岁龄背最长肌脂肪沉积转录组差异表达基因

山羊氨基酸代谢网络的重构与关键代谢基因的解析

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家畜生态学报 2023年第5期44卷 14-22页

作者：吕琦李望娇刘沛昊彭渝景献金武小璐苏蕊内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区呼和浩特010018 农业农村部肉羊遗传育种重点实验室内蒙古自治区呼和浩特010018 动物遗传育种与繁殖自治区重点实验室内蒙古自治区呼和浩特010018

氨基酸是参与生物体生命活动的基本物质之一,其代谢对山羊的诸多经济性状(如羊肉品质、山羊绒)有重要影响。随着生物信息学的快速发展,系统生物学方法被广泛用来研究生物体内代谢机制。为了阐明山羊体内氨基酸的代谢机制,本文通过构建... 详细信息

氨基酸是参与生物体生命活动的基本物质之一,其代谢对山羊的诸多经济性状(如羊肉品质、山羊绒)有重要影响。随着生物信息学的快速发展,系统生物学方法被广泛用来研究生物体内代谢机制。为了阐明山羊体内氨基酸的代谢机制,本文通过构建代谢网络解析山羊氨基酸代谢机制,并通过网络分析发现关键代谢基因。研究首先使用山羊氨基酸代谢基因重新构建山羊氨基酸代谢网络,其次采用Cytoscape软件对该网络进行可视化,并利用R语言中的igraph程序包对氨基酸代谢网络的聚类系数、接近中心度、网络直径及密度等网络参数进行计算和分析。结果发现,山羊氨基酸代谢网络直径为13,密度为0.03,说明该代谢网络的拓扑结构表现出直径较大、密度较小、整个氨基酸代谢网络较复杂等特征。在该代谢网络中,发现10个相互没有联系的子网络模块,根据子网络的基因个数由多到少及其各自的主要功能将它们分别定义为谷胱甘肽转移酶模块、甲基转移酶模块、硒复合代谢模块、赖氨酸降解模块等。山羊氨基酸代谢网络的结构特点与氨基酸的生理功能是相辅相成的,这是山羊长期进化适应环境的结果。此外,本文从网络拓扑结构的角度确定13个对维持整个山羊氨基酸代谢网络具有重要意义的关键代谢基因,例如ABAT,AGXT2,ALDH3B1等。上述结果发现的代谢网络模块及关键代谢基因有助于从遗传层面进一步完善山羊氨基酸代谢的分子机制,可以为全面深入解析山羊与氨基酸代谢相关的经济性状的形成机制奠定了基础,同时也可以为改良相关的重要经济性状、品种培育提供了新的理论参考。

关键词：山羊氨基酸代谢网络关键基因

带诱芯的蓝板放置位置和方式对番茄潜叶蛾的诱捕效果

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中国蔬菜 2024年第2期 88-91页

作者：李灏盛承发李艳辉武建华黄志强赵利王慧敏盛世蒙王少丽内蒙古自治区巴彦淖尔市现代农牧业事业发展中心内蒙古巴彦淖尔015000 中国科学院动物研究所北京100083 辽宁省沈阳市乡村振兴发展中心(沈阳市农业技术推广培训中心沈阳市农业检验监测中心沈阳市植物保护中心)辽宁沈阳110036 中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜生物育种全国重点实验室北京100081

番茄潜叶蛾是一种重大外来入侵性有害生物,给番茄产业带来严重威胁。为明确蓝板放置方式对其诱蛾量的影响,开展了带有性诱芯的蓝板不同放置角度和不同高度对番茄潜叶蛾的诱杀效果试验。结果表明,蓝板不同放置角度和放置高度对诱蛾量影... 详细信息

番茄潜叶蛾是一种重大外来入侵性有害生物,给番茄产业带来严重威胁。为明确蓝板放置方式对其诱蛾量的影响,开展了带有性诱芯的蓝板不同放置角度和不同高度对番茄潜叶蛾的诱杀效果试验。结果表明,蓝板不同放置角度和放置高度对诱蛾量影响较大。蓝板平放处理的平均诱蛾量分别是与地面角度为45°斜放和90°竖放(蓝板垂直于地面)处理的1.438倍和8.590倍,其中平放和斜放均与竖放差异达极显著水平;蓝板放置高度为0 cm处理的平均诱蛾量分别是高度30~35 cm和高度60~65cm处理的1.491倍和2.485倍,且与后者之间差异达显著水平。因此,田间采用蓝板对番茄潜叶蛾进行诱杀时,将蓝板平放在地面上的诱蛾效果最好。

关键词：番茄潜叶蛾蓝板放置方法诱捕效果

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