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M2巨噬细胞特征基因风险评分能准确预测HBV相关肝细胞癌患者的预后

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南方医科大学学报 2024年第5期44卷 827-840页

作者：刘鹏程娄丽娟刘霞王建姜颖军事科学院//军事医学研究院北京102206

目的探讨在乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌(HCC)中M2巨噬细胞特征基因(MRG)对患者预后的评估价值及潜在的分子机制。方法从TCGA数据库获取73例HBV相关肝HCC患者的转录组数据,通过WGCNA识别M2巨噬细胞相关基因模块,利用LASSO鉴定出关键MR... 详细信息

目的探讨在乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌(HCC)中M2巨噬细胞特征基因(MRG)对患者预后的评估价值及潜在的分子机制。方法从TCGA数据库获取73例HBV相关肝HCC患者的转录组数据,通过WGCNA识别M2巨噬细胞相关基因模块,利用LASSO鉴定出关键MRG并构建风险评分,并在外部数据集中验证风险评分的预测性能。应用CIBERSORT和R.pRRophetic分析风险评分与免疫细胞浸润、药物敏感性的关系。通过GSVA和GSEA对高风险组和低风险组的差异基因进行通路富集分析。R.Seurat验证在HCC中表达MRG的细胞类型,并通过R.Cellchat分析细胞互作强度,找到与HCC进展相关的重要细胞类型。流式细胞术检测肝癌条件培养基诱导THP-1向M2样极化,RT-qPCR验证MRG在HBV阳性的肝癌细胞系和M2巨噬细胞中表达。结果M2巨噬细胞高浸润状态与患者不良预后显著相关(P=0.025)。高风险组的总生存期(OS)均显著低于低风险组(训练集P=0.021,测试集P=0.046)。高风险组中M2巨噬细胞显著富集(P=0.03),低风险组中幼稚B细胞显著富集(P=0.049)。药物BI.2536对高风险组更有效(P=0.025),AG.014699(P=0.044)、AKT.inhibitor.VIII(P=0.041)、AZD.0530(P=0.0033)、AZD7762(P=0.0051)和BMS.708163(P=0.015)对低风险组更有效。通路富集分析结果表明,增殖相关通路和代谢相关通路在高风险组中富集。单核细胞在高风险组HCC进展的细胞互作中最为活跃。VTN在PLC/PRF/5中的表达显著上调(P<0.0001),GCLC、PARVB、TRIM27和GMPR在M2样THP-1中的表达显著上调(P=0.0037、P=0.0015、P=0.0071、P=0.0004)。结论MRG风险评分能准确预测HBV相关HCC患者的预后,揭示其肿瘤微环境的差异,为HCC患者的精准治疗提供了指导。

关键词： M2巨噬细胞肝细胞癌预后模型乙型肝炎病毒

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装液战斗部液体分散的数值仿真与试验研究

兵器装备工程学报 2024年第6期45卷 134-141页

作者：王振雄宋平郝焕明余留芳陆晓霞陈鹏军事科学院防化研究院北京102205

通过建立典型战斗部结构在不同驱动压力、不同动力黏度液体工况下的液体分散流体动力学仿真模型,对战斗部壳体的受力情况进行计算分析,仿真计算结果与试验测试数据对比可知,计算模型可为该装液战斗部壳体的受力规律分析提供支撑。建立... 详细信息

通过建立典型战斗部结构在不同驱动压力、不同动力黏度液体工况下的液体分散流体动力学仿真模型,对战斗部壳体的受力情况进行计算分析,仿真计算结果与试验测试数据对比可知,计算模型可为该装液战斗部壳体的受力规律分析提供支撑。建立了战斗部壳体内部压力测试系统,获得壳体内部轴向的不同部位的压力时程曲线和压力峰值,得出战斗部壳体内部由于压力波的叠加导致战斗部内部壳壁的峰值均高于驱动压力值,位于喷射孔近区的战斗部壳体承受压力值最大,随着与喷射孔距离的增加,压力峰值随之下降;火药产生的驱动压力和液体动力黏度与战斗部壳体的压力值均正相关。

关键词：战斗部设计黏弹性液体液体分散数值仿真试验研究

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包覆式复合侵彻体的数值模拟研究

兵器装备工程学报 2024年第4期45卷 211-217页

作者：王皓方远航虞欣赵新张开创李红欣军事科学院防化研究院北京102205

为增强聚能装药对目标的后效毁伤效应,设计了一种包覆式复合侵彻体装药结构,在爆轰波的驱动下,紫铜药型罩后翻包覆活性材料,穿透目标后,活性材料释能对目标内部实施纵火后效毁伤。运用LS-DYNA有限元软件对包覆式复合侵彻体的成型及侵彻... 详细信息

为增强聚能装药对目标的后效毁伤效应,设计了一种包覆式复合侵彻体装药结构,在爆轰波的驱动下,紫铜药型罩后翻包覆活性材料,穿透目标后,活性材料释能对目标内部实施纵火后效毁伤。运用LS-DYNA有限元软件对包覆式复合侵彻体的成型及侵彻靶板过程进行模拟,分析了活性罩直径、外曲率半径和罩顶厚度比对包覆式复合侵彻体成型的影响。结果表明:将活性材料嵌入紫铜药型罩内侧,在炸药驱动下可以实现对活性材料的包覆;当活性罩直径取值为0.86 D(D为装药直径)时,外曲率半径取值为1.15D,壁厚比取值为2/3时,复合侵彻体包覆效果较好;包覆式复合侵彻体能穿透30 mm厚45#钢靶,并能对后效靶造成毁伤。

关键词：聚能装药复合侵彻体活性材料包覆式向后翻转

长线缆高空核电磁脉冲效应的数值求解及仿真分析

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核电子学与探测技术 2024年

作者：常芸芬庞新良殷昊黄灵钟军事科学院防化研究院

本文研究了高空核电磁脉冲的作用下线缆的耦合效应，采用了Agrawal模型传输线分析方法，对高空核电磁脉冲耦合效应下的感应电流和电压进行了解析求解，讨论了入射波电场位于入射波平面左侧和右侧这两种情况时负载端感应电流数值解析式... 详细信息

本文研究了高空核电磁脉冲的作用下线缆的耦合效应，采用了Agrawal模型传输线分析方法，对高空核电磁脉冲耦合效应下的感应电流和电压进行了解析求解，讨论了入射波电场位于入射波平面左侧和右侧这两种情况时负载端感应电流数值解析式的差异。并通过MATLAB软件仿真，分别分析了这两种情况下不同线缆负载、线缆长度、线缆高度对终端感应电流的影响。

关键词：高空核电磁脉冲 Agrawal模型解析求解感应电流仿真分析

考虑晶体取向的Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金动态力学性能研究

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爆炸与冲击 2024年第3期44卷 2-26页

作者：陈嘉琳李述涛陈叶青军事科学院国防工程研究院北京100036

鉴于高熵合金材料(high-entropy alloy,HEA)在高应变率动态响应下呈现不同的破坏模式及力学性能,其潜在机理从宏观角度已不能够完全解释,需从微观角度研究其动态响应过程中的原子结构变化、位错分布变化、演变机理及变形机制,为优化HEA... 详细信息

鉴于高熵合金材料(high-entropy alloy,HEA)在高应变率动态响应下呈现不同的破坏模式及力学性能,其潜在机理从宏观角度已不能够完全解释,需从微观角度研究其动态响应过程中的原子结构变化、位错分布变化、演变机理及变形机制,为优化HEA防护材料的加工工艺、制备方法等提供参考。利用分子动力学模拟的方法,设计了[100]、[110]和[111]等3种取向结构的Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金在不同应变率下的压缩、拉伸及冲击试验,分析了动态响应过程中原子结构变化、位错分布变化、演变机理及变形机制。压缩试验中:[110]取向结构的Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金的屈服强度最高,[111]的次之,[100]的最低;[100]取向结构的Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金主要的变形机制为孪晶变形,[110]的为滑移变形,[111]的为位错变形。拉伸试验中:[111]取向结构的Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金的屈服强度最高,[100]的次之,[110]的最低;[100]取向结构Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金拉伸过程中孪晶结构较多,[110]取向结构的Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金产生较规则的密排六方结构滑移面,[111]取向结构的Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金不会产生任何滑移面。随着应变率的升高,3种取向结构的Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金压缩和拉伸屈服强度均大幅度提高,对应伸长量增大。较低应变率(1×109 s^(−1))下的塑性变形机制主要为滑移变形,但滑移系较少;中应变率(1×10^(10)s^(−1))下的塑性变形机制是以滑移为主的变形机制,但滑移系较多;高应变率(1×10^(11)s^(−1))下的塑性变形机制是由原子排列无序化的非晶原子诱导的变形。[110]取向结构的Al_(0.3)CoCrFeNi高熵合金的抗冲击性能最好,与其具有最高的屈服强度,并且在屈服结束阶段也能保持最高的应力有关。

关键词：晶体取向高熵合金变形机制微观演变分子动力学

华盛顿大学蛋白质设计研究所创新之道及其对生命科学新型研发机构建设的启示

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中国科学院院刊 2024年第7期 1235-1244页

作者：赵润州倪铭法云智伯晓晨焦剑军事科学院军事医学研究院

蛋白质设计研究所是美国华盛顿大学发起，州政府、联邦政府等支持的非营利性科研机构。自2012年成立起，该研究所抢抓人工智能驱动科学研究（AI for Science）、开放科学发展机遇，提升原始创新、技术供给和产品生成能力，现已成为全球... 详细信息

蛋白质设计研究所是美国华盛顿大学发起，州政府、联邦政府等支持的非营利性科研机构。自2012年成立起，该研究所抢抓人工智能驱动科学研究（AI for Science）、开放科学发展机遇，提升原始创新、技术供给和产品生成能力，现已成为全球生命科学前沿创新的关键力量。研究表明，其成功得益于深耕基础前沿先做强再做大、人工智能赋能干湿结合领跑新范式、推动创新链与产业链融合发展、发挥战略科学家定向引航作用、构建开放共享融合创新生态。借鉴其经验，中国可发挥新型举国体制优势，从聚焦顶层设计加强制度保障、立足以精立业抢占变革先机、突出市场导向集聚创新要素、坚持以人为本营造宽松环境等方面，更好地推动生命科学新型研发机构高质量发展，支撑生命科学高水平自立自强。

关键词：蛋白质设计新型研发机构生命科学科技创新

适用于降解样本的201个遗传标记检测体系的构建和验证

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遗传 2024年第4期46卷 306-318页

作者：韩伟张庆珍杨静周喆军事科学院军事医学研究院生物信息中心北京100850

近年来,法医实践中复杂案件数量逐渐增多,需要联合使用短串联重复序列(short tandem repeat,STR)、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)、插入缺失多态性(insertion/deletion polymorphism,InDel)、微单倍型(microhaplotype,MH)等不同类型的遗传标记,为案件提供更多的参考信息。本研究筛选了24个常染色体STR(autosomes STR,A-STR)、24个Y染色体STR(Y-STR)、110个A-SNP、24个Y-SNP、9个A-InDel、1个Y-InDel、8个MH和Amelogenin共201个遗传标记,建立二代测序检测体系HID_AM Panel v1.0。根据DNA分析方法科学工作组(Scientific Working Group on DNA Analysis Methods,SWGDAM)的验证指南,对该体系的重复性、准确性、灵敏度、对降解样本的适用性、物种特异性、抗抑制性等指标进行评估。本体系分型结果与基于毛细管电泳方法检测的48个STR和Amelogenin结果完全一致,与ForenSeq™ DNA Signature Prep Kit重合的79个SNP分型结果完全一致;当DNA加入量不低于200 pg时可获得全部等位基因分型结果;当检测降解指数大于15.87的模拟降解样本时,检出成功率明显高于GlobalFilerTM PCR扩增试剂盒;当体系内血红素浓度不高于40μmol/L、靛蓝浓度不高于2 mmol/L、或腐殖酸浓度不高于15 ng/μL时,扩增无明显抑制;鸭、鼠、牛、兔、鸡的DNA特异性扩增较少;常规样本中STR检出率达99.74%,SNP、InDel、MH全部检出。综上所述,本研究建立的检测体系具有较高的准确性、灵敏度、物种特异性和抗抑制性,适用于降解样本的个体识别。

关键词：二代测序多类型遗传标记降解样本

面向战略运筹分析的事件本体及数据集构建方法

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系统仿真学报 2024年

作者：陈泉林贾珺军事科学院战争研究院

针对目前战略运筹分析领域缺少信息抽取技术研究的专业数据集的问题，本文提出了一种面向战略运筹分析的事件本体及数据集构建方法。该方法根据战略运筹分析中情况判断方面的需求，提出面向战略运筹分析事件本体模型，并使用“少量人工... 详细信息

针对目前战略运筹分析领域缺少信息抽取技术研究的专业数据集的问题，本文提出了一种面向战略运筹分析的事件本体及数据集构建方法。该方法根据战略运筹分析中情况判断方面的需求，提出面向战略运筹分析事件本体模型，并使用“少量人工标注+微调大语言模型标注”的方法构建面向战略运筹分析的事件数据集EfSOA。该数据集包含887条篇章级新闻文本，其中事件文本有3140条，事件关系文本有445条，负样本307条。本文提出的构建数据集方法以及所构建的数据集EfSOA，突出了战略运筹分析领域知识，能有效支持信息抽取方法在该领域的研究，为未来构建面向战略运筹分析的事件抽取与关系挖掘模型奠定了基础。

关键词：战略运筹分析大语言模型事件本体数据集信息抽取

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高通量测序文库质量控制技术研究进展

遗传 2024年第2期46卷 140-148页

作者：崔梦楠郭彦武雅蓉裴广倩崔玉军军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所北京100071

作为生命科学和医学领域中的关键性支撑技术,高通量测序已得到快速发展并日趋成熟。该技术工作流程可分为核酸提取、文库构建、上机测序、数据分析等,其中文库构建是承上启下的关键步骤,文库构建的效果受制于上游样品质量,同时会对测序... 详细信息

作为生命科学和医学领域中的关键性支撑技术,高通量测序已得到快速发展并日趋成熟。该技术工作流程可分为核酸提取、文库构建、上机测序、数据分析等,其中文库构建是承上启下的关键步骤,文库构建的效果受制于上游样品质量,同时会对测序数据产出后的数据分析造成影响。对文库构建质量控制技术的选择和实施是提高结果可靠性、降低测序数据误差的重要保证。本文对文库构建质量控制技术进行深入综述,总结评价其原理、优缺点、适用范围,并对实际应用场景中相关技术的选择进行了论述,以期为科研人员、疾病预防控制人员等在选择文库质量控制技术时提供理论依据与参考,从而促进高通量测序工作的质量和效率。

关键词：高通量测序文库文库浓度文库大小分布质量控制技术评价