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基于多类型变异的炭疽芽孢杆菌群体基因组学研究

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遗传 2025年

作者：张祖铭周豪黄学治张多悦张佳怡林昱方立崴张秀昌崔玉军武雅蓉李艳君河北北方学院军事科学院军事医学研究院解放军总医院第六医学中心

炭疽芽孢杆菌（Bacillus anthracis）是引发烈性传染病炭疽的病原体，也是一种典型生物战剂，主要感染牛、羊等牲畜以及人类，对畜牧业造成严重经济损失，威胁人类社会安全。深入了解该物种遗传多样性和进化推动力，是研究致病机制、开... 详细信息

炭疽芽孢杆菌（Bacillus anthracis）是引发烈性传染病炭疽的病原体，也是一种典型生物战剂，主要感染牛、羊等牲畜以及人类，对畜牧业造成严重经济损失，威胁人类社会安全。深入了解该物种遗传多样性和进化推动力，是研究致病机制、开展炭疽疫情监测与防控的必要基础。但是，目前该领域研究不足，尤其缺乏基于多种类型变异的群体基因组水平研究。本文对公开发表的1628株炭疽芽孢杆菌基因组序列进行收集和质控，在1347株高质量序列中鉴定了SNP、Indel、大片段获得缺失、拷贝数变异以及基因组重排等多类型变异，共发现26,635个SNP位点、9997个Indel位点、21个大片段获得缺失事件、25个拷贝数变异以及5个倒位。系统发育重建表明，该物种可分为6个主要种群及17个亚群。综合种群多样性和地理分布特征发现，美国菌株遗传多样性最高，而非洲菌株则呈现明显的地理聚集性特征。此外，通过选择压力信号分析，发现了4个与耐药和芽孢形成相关的基因（rpoB、fusA、spo0F、GBAA＿RS11385）存在强选择压力。本研究重建了全球炭疽芽孢杆菌的种群结构，并揭示了该物种进化过程中关键的变异位点，为炭疽芽孢杆菌识别、溯源和致病机制研究提供了靶标，同时可为炭疽疫情的预防和控制提供科学支撑。

关键词：炭疽芽孢杆菌全基因组测序遗传变异种群结构选择压力进化动力学

含笑内酯对骨髓增殖性肿瘤细胞系UKE-1和SET-2中细胞因子表达的作用及机制研究

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北京中医药大学学报 2025年

作者：陈猛刘晋琴张莹史哲新肖志坚天津中医药大学第一附属医院国家中医针灸临床医学研究中心中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所)

目的探讨含笑内酯通过信号传导和转录激活因子3(STAT3)/核转录因子-κB (NF-κB)信号通路，对骨髓增殖性肿瘤细胞系中细胞因子表达的影响。方法选取UKE-1和SET-2作为研究对象，采用CCK-8法筛选含笑内酯的实验浓度，将UKE-1和SET-2分... 详细信息

目的探讨含笑内酯通过信号传导和转录激活因子3(STAT3)/核转录因子-κB (NF-κB)信号通路，对骨髓增殖性肿瘤细胞系中细胞因子表达的影响。方法选取UKE-1和SET-2作为研究对象，采用CCK-8法筛选含笑内酯的实验浓度，将UKE-1和SET-2分为对照组和2.5、5、10μmol/L含笑内酯组，各给药组分别加入终浓度为2.5、5、10μmol/L含笑内酯溶液1mL，对照组仅加入等体积的培养基。采用实时荧光PCR法检测各组细胞白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和趋化因子2(CCL2)mRNA表达抑制率，采用蛋白印迹法检测各组细胞STAT3、磷酸化STAT3(p-STAT3)的蛋白表达水平。以UKE-1为研究对象，进行还原性谷胱甘肽和双硫苏糖醇的逆转实验，将UKE-1分为对照组、含笑内酯组、含笑内酯+还原性谷胱甘肽组、含笑内酯+双硫苏糖醇组、还原性谷胱甘肽和双硫苏糖醇组，采用蛋白印迹法检测各组细胞STAT3、磷酸化STAT3(p-STAT3)的蛋白表达水平。采用TNF-α（5000ng/L）刺激UKE-1，以复制细胞因子过度分泌的病理模型，将UKE-1分为对照组、模型组及2.5、5、10μmol/L含笑内酯组，采用实时荧光PCR法检测上述指标，酶联免疫吸附测定（ELISA）法检测各组细胞培养基中CCL2含量，蛋白质印迹法检测STAT3、p-STAT3及NF-κb信号通路相关蛋白的蛋白表达水平。结果实时荧光PCR法结果显示，与对照组比较，2.5、5、10和20μmol/L含笑内酯组UKE-1在24、48、72h的增殖抑制率均升高，5、10和20μmol/L含笑内酯组SET-2在48、72h的增殖抑制率均升高（均P研究选用2.5、5和10μmol/L。与对照组比较，2.5、5和10μmol/L含笑内酯组UKE-1及SET-2的TNF-αmRNA表达抑制率均升高，5、10μmol/L含笑内酯组UKE-1及SET-2的IL-1βmRNA表达抑制率亦升高，10μmol/L含笑内酯组UKE-1及SET-2中CCL2mRNA表达抑制率升高（均P<0.05）。使用TNF-α刺激后，与模型组比较，2.5、5、10μmol/L含笑内酯组UKE-1中TNF-α、IL-1β、CCL2mRNA表达抑制率均升高（均P＜0.05）。ELISA法结果显示，与对照组比较，模型组UKE-1中CCL2含量升高；与模型组比较，2.5、5、10μmol/L含笑内酯组UKE-1中CCL2含量降低（均P＜0.05）。蛋白质印迹法结果显示，与对照组比较，5、10μmol/L含笑内酯组UKE-1和SET-2中p-STAT3蛋白表达水平下调，SET-2中STAT3蛋白表达水平下调（均P<0.05）；还原性谷胱甘肽和双硫苏糖醇逆转实验中，与对照组比较，含笑内酯组UKE-1中p-STAT3表达水平降低，与含笑内酯组比较，含笑内酯+双硫苏糖醇组和含笑内酯+还原型谷胱甘肽组UKE-1中p-STAT3蛋白表达水平升高（均P< 0.05）；使用TNF-α刺激后，与对照组比较，模型组p-STAT3、p-IκKα/β、p-IκBα、p-NF-κBp65蛋白表达升高，IκBα蛋白表达降低，与模型组比较，2.5、5、10μmol/L含笑内酯组p-IκKα/β、p-IκBα、p-STAT3、p-NF-κBp65蛋白表达降低，5、10μmol/L含笑内酯组IκBα蛋白表达升高(均P< 0.05)。结论含笑内酯能够抑制JAK2V617F突变的UKE-1和SET-2中IL-1β、TNF-α和CCL2 mRNA表达，以及UKE-1细胞对CCL2的分泌，这种抑制作用可能与其抑制STAT3的磷酸化激活及NF-κB信号通路的激活相关。

关键词：含笑内酯骨髓增殖性肿瘤细胞因子信号传导和转录激活因子3 核转录因子-κB

C1q样蛋白4对乳腺癌侵袭及转移影响的体内研究

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华中科技大学学报(医学版) 2025年

作者：李潇赵博郭研徐壮语徐繁河北省2024年度医学科学研究课题No.20240363河北省承德医学院附属医院肿瘤科

目的通过体内实验验证C1q样蛋白4（C1ql4）对NOD/SCID鼠乳腺癌转移瘤组织的EMT和干性特征影响。方法构建免疫荧光素标记的稳转低表达和过表达C1ql4的细胞系（MDA-MB-231、MCF-7），尾静脉注射到4周龄雌性NOD/SCID鼠体内，IVIS活体成... 详细信息

目的通过体内实验验证C1q样蛋白4（C1ql4）对NOD/SCID鼠乳腺癌转移瘤组织的EMT和干性特征影响。方法构建免疫荧光素标记的稳转低表达和过表达C1ql4的细胞系（MDA-MB-231、MCF-7），尾静脉注射到4周龄雌性NOD/SCID鼠体内，IVIS活体成像检测转移瘤形成情况。注射8周后安乐死小鼠，取肺组织固定后石蜡包埋，HE染色观察转移灶数量；免疫组织化学染色（IHC）方法检测肺组织标本CD44、SOX2蛋白及ER、Her-2 蛋白的表达水平；提取新鲜肺转移瘤中的总RNA和蛋白，qRT-PCR和Western blot法检测EMT和干细胞特性相关蛋白表达。结果 IVIS活体成像结果显示：与MDA-MB-231-sh组相比，MDA-MB-231组小鼠体内肿瘤的荧光值及荧光密度显著降低（P肿瘤的荧光值及荧光密度显著升高（P<0.05）。小鼠肺内转移瘤组织HE染色及IHC结果显示：与MDA-MB-231组相比，MDA-MB-231-sh组小鼠肺内转移灶数量明显减少，且CD44、SOX2表达下调（均P<0.05），而ER及Her-2表达无明显变化；与MCF-7组相比，MCF-7-OE组小鼠肺内转移灶数量明显增多且CD44、SOX2表达增加（均P<0.05），ER及Her-2表达无明显变化。小鼠肺内转移瘤组织qRT-PCR和Western blot结果显示，MDA-MB-231-sh组干性相关蛋白和间质标志物表达量明显低于MDA-MB-231组（均P<0.05），但上皮标志物表达量则高于MDA-MB-231组（P<0.05）；MCF-7-OE组干性相关蛋白和间质标志物表达量明显高于MCF-7组（均P<0.05），但上皮标志物表达量则低于MCF-7组（P<0.05）。结论 C1ql4通过增强癌细胞干性表达和EMT进程促进小鼠乳腺癌肺转移瘤的形成和进展。

关键词：乳腺癌 C1q样蛋白4 上皮间质转化干细胞特性

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消融与免疫治疗联合用于肝癌研究进展

中国介入影像与治疗学 2025年

作者：王善鹏刘现闯陈奉伟余瑞乔元岗济宁医学院临床医学院(附属医院) 济宁医学院附属医院血管肿瘤介入医学科

治疗肝癌的主要手段包括手术切除、TACE、消融、免疫治疗及肝移植等。消融治疗可促进肝癌细胞死亡而达到抗肿瘤目的；免疫治疗通过相应途径重新激活免疫细胞、产生新的免疫应答，识别并清除肝癌细胞；消融联合免疫治疗用于肝癌可协同增... 详细信息

治疗肝癌的主要手段包括手术切除、TACE、消融、免疫治疗及肝移植等。消融治疗可促进肝癌细胞死亡而达到抗肿瘤目的；免疫治疗通过相应途径重新激活免疫细胞、产生新的免疫应答，识别并清除肝癌细胞；消融联合免疫治疗用于肝癌可协同增强抗肿瘤免疫效应。本文就消融联合免疫治疗用于肝癌研究进展进行综述。

关键词：肝肿瘤消融技术免疫治疗治疗转归

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人工智能辅助肺癌数据库构建

中国胸心血管外科临床杂志 2025年

作者：杨丽冰郭超姜会珍马琏李单青中国医学科学院北京协和医院胸外科中国医学科学院北京协和医院信息中心

目的采用人工智能技术对临床数据进行结构化和标准化，构建基于人工智能的肺癌数据库，支持肺癌诊治中的大数据深度挖掘，为多样化的真实世界研究提供高质量的数据支持。方法依托北京协和医院胸外科丰富的临床数据资源，本研究利用机... 详细信息

目的采用人工智能技术对临床数据进行结构化和标准化，构建基于人工智能的肺癌数据库，支持肺癌诊治中的大数据深度挖掘，为多样化的真实世界研究提供高质量的数据支持。方法依托北京协和医院胸外科丰富的临床数据资源，本研究利用机器学习技术，特别是自然语言处理技术，对电子病历、检查报告、病理报告等非结构化数据进行自动化处理，转化为结构化信息。同时，采用数据治理和自动化清洗技术，确保数据的完整性和一致性。结果截至2024年9月，数据库共收录了18 811例患者的数据，涵盖住院和门诊病历、检验检查报告、病理报告、医嘱信息以及随访信息，形成了结构完整、变量丰富的多维数据系统。数据库的实时查询和多层次筛选功能使研究人员能够快速获取符合特定条件的研究数据，大幅提升了数据处理效率和研究进程。在非小细胞肺癌预后探究的真实世界应用举例中，通过数据库实现了对预后影响因素的快速分析。研究表明，肿瘤分期、合并症情况等因素显著影响患者生存率。这一应用实例展示了数据库临床大数据挖掘应用中的价值。结论基于人工智能的肺癌数据库显著提升了数据管理和分析的整体效率，为临床大规模研究、回顾性分析以及疾病管理提供了坚实的数据支持。随着大语言模型和多模态方法进一步应用于临床，该数据库的精确性和分析深度将持续增强，为肺癌大数据挖掘及真实世界研究提供更强有力的支撑。

关键词：肺癌数据库人工智能自然语言处理真实世界研究

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靶向肿瘤相关中性粒细胞治疗肿瘤的研究进展

中国肿瘤生物治疗杂志 2025年

作者：赵果简爱文王书航李宁国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院药物临床试验研究中心

肿瘤相关中性粒细胞（TANs）是肿瘤微环境（TME）的重要组成部分，在调节肿瘤的生长和转移方面发挥重要作用。TANs具有促肿瘤和抑制肿瘤两种表型：分为抗肿瘤的N1型和促肿瘤的N2型。一方面，TANs通过释放多种促炎、免疫调节和血管生成... 详细信息

肿瘤相关中性粒细胞（TANs）是肿瘤微环境（TME）的重要组成部分，在调节肿瘤的生长和转移方面发挥重要作用。TANs具有促肿瘤和抑制肿瘤两种表型：分为抗肿瘤的N1型和促肿瘤的N2型。一方面，TANs通过释放多种促炎、免疫调节和血管生成因子等，直接或间接地作用于肿瘤细胞来促进或抑制肿瘤的发生、进展和转移。此外，TME内的多种细胞因子和趋化因子以及其他细胞的旁分泌信号又会负调控TANs的极化。这种双向调控的产生与其本身的异质性和可塑性有关。因此，通过调控TANs的促瘤作用，放大抑癌作用杀伤肿瘤，是一种极具希望的肿瘤治疗策略。本综述讨论了TANs在TME中的复杂双向调控作用，并重点介绍了中性粒细胞靶向治疗在癌症治疗中的策略。

关键词：肿瘤相关中性粒细胞肿瘤微环境中性粒细胞靶向肿瘤治疗

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免疫检查点及抑制剂抗肿瘤作用的研究进展

实用医学杂志 2025年

作者：付强卢钟琦常颖金铁峰张美花延边大学附属医院超声医学科延边大学肿瘤研究中心陕西省人民医院超声医学科

近年来，肿瘤免疫治疗备受瞩目，随着研究的深入而迅速发展，产生了多种重要的治疗策略。免疫检查点抑制剂已成为该领域中的核心方法之一，其研究成果受到广泛关注。本文拟对当前已知的几种抗肿瘤免疫检查点及其相关治疗进展进行系统综... 详细信息

近年来，肿瘤免疫治疗备受瞩目，随着研究的深入而迅速发展，产生了多种重要的治疗策略。免疫检查点抑制剂已成为该领域中的核心方法之一，其研究成果受到广泛关注。本文拟对当前已知的几种抗肿瘤免疫检查点及其相关治疗进展进行系统综述，包括PD-1/PD-L1、CTLA-4、LAG-3、TIM-3、TIGIT和VISTA等关键检查点。通过详细探讨这些检查点的作用机制、现有的临床应用情况以及未来的研究方向，旨在为优化肿瘤免疫治疗策略提供有力参考与指导。

关键词：肿瘤免疫治疗免疫检查点抑制剂

基于SwinTransCAD的高效多尺度注意解码的甲状腺结节分割方法

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激光与光电子学进展 2025年

作者：王韵澎姚劲草徐栋郝翔浙江大学光电工程学院浙江省肿瘤医院超声医学科中国科学院杭州医学研究所

随着深度学习技术在医学图像处理中的广泛应用，精确的甲状腺分割对于疾病诊断和治疗具有重要意义。本研究提出了一种融合Swin Transformer和多尺度注意解码机制的SwinTransCAD模型，充分挖掘甲状腺的细节，实现甲状腺精确分割。本文首... 详细信息

随着深度学习技术在医学图像处理中的广泛应用，精确的甲状腺分割对于疾病诊断和治疗具有重要意义。本研究提出了一种融合Swin Transformer和多尺度注意解码机制的SwinTransCAD模型，充分挖掘甲状腺的细节，实现甲状腺精确分割。本文首先简述甲状腺疾病的临床需求和传统分割方法的局限，之后分析Swin Transformer的技术特征及其在医学图像处理中的应用前景，进而详细介绍SwinTransCAD模型结构和多尺度注意解码策略。通过对比实验，验证模型在不同数据集上的泛化能力及其在各项评估指标上的优势。实验结果显示，该研究所提出的方法相较现有技术具有显著的性能提升，为甲状腺疾病的预诊断和辅助治疗提供了有力的技术支持。

关键词：甲状腺结节分割多尺度注意解码深度学习医学图像处理

抗肿瘤药物临床试验受试者筛选失败原因及方案纳排指标分析

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医药导报 2025年

作者：贾硕鹏马海兰黄慧瑶朱敬肖于安琪侯怡如唐玉房虹李宁国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院药物临床试验研究中心中国药科大学基础医学与临床药学学院

目的分析抗肿瘤药物临床试验受试者筛选失败的原因以及纳排标准对受试者进入临床试验的影响，探讨提高受试者成功筛选入组的策略，为研究机构和申办方制定纳排标准提供参考依据。方法选取2016年1月1日-2022年6月30日中国医学科学院肿... 详细信息

目的分析抗肿瘤药物临床试验受试者筛选失败的原因以及纳排标准对受试者进入临床试验的影响，探讨提高受试者成功筛选入组的策略，为研究机构和申办方制定纳排标准提供参考依据。方法选取2016年1月1日-2022年6月30日中国医学科学院肿瘤医院药物临床试验研究中心开展的40项药物临床试验资料，通过频数、百分构成比对收集到的受试者筛选失败数据和方案中的纳排指标进行统计描述。结果在涵盖8个瘤种的40个抗肿瘤药物临床试验项目中，筛选失败受试者425名，＜65岁受试者居多（333例，78.4%），筛选失败的主要原因包括受试者自愿退出（71例，16.7%）、肿瘤转移（52例，12.8%）、其他疾病治疗未恢复（38例，8.9%）、骨髓功能未达标（19例，4.7%）、肝功能不符合要求（15例，3.7%）。在纳排指标中，对受试者年龄（100%）、美国东部肿瘤协作组（ECOG）评分（97.5%）、骨髓功能（中性粒细胞绝对计数（ANC）：95.0%、血小板计数（PLT）：97.5%、血红蛋白（HB）：97.5%）、肝功能（总胆红素（TBIL）：95.0%、谷氨酸氨基转移酶（ALT）：87.5%、天冬氨酸转移酶（AST）：95.0%）、肾功能（肌酸酐（CR）：80.0%）以及病毒筛查（人体免疫缺陷病毒（HIV）：80.0%、乙型肝炎病毒（HBV）：70.0%、丙型肝炎病毒（HCV）：62.5%）的要求相对严格。结论该院抗肿瘤药物临床试验中受试者筛选失败的主要原因是受试者自愿退出、肿瘤脑转移以及生化检测指标不合格，这与临床试验纳排标准的设定密切相关。深入了解受试者特征，精准设定合适纳排标准，持续改进试验设计，加强与受试者沟通，提供更多相关信息，有助于提高抗肿瘤药物临床试验筛选成功率。

关键词：临床试验方案抗肿瘤药物纳排标准筛选失败原因受试者