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靶向HER-2 mRNA模拟二级结构中局部保守序列的反义药物优化设计及QSAR分析(英文)

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Acta Pharmacologica Sinica 2003年第9期24卷 59-64+112页

作者：杨栓平宋三泰汤仲明宋海峰军事医学科学院放射医学研究所药理室军事医学科学院放射医学研究所药理室北京 100850 中国军事医学科学院附属医院

目的:验证mRNA二级结构保守性在反义药物设计中的作用,获得靶向HER-2 mRNA的优于已报道阳性药物的序列。方法:RNAstructure用于模拟HER-2 mRNA二级结构,设计21个反义硫代寡脱氧核苷酸(S-ODN)。用SK-BR-3乳腺癌细胞评价S-ODN体外活性,SPS... 详细信息

目的:验证mRNA二级结构保守性在反义药物设计中的作用,获得靶向HER-2 mRNA的优于已报道阳性药物的序列。方法:RNAstructure用于模拟HER-2 mRNA二级结构,设计21个反义硫代寡脱氧核苷酸(S-ODN)。用SK-BR-3乳腺癌细胞评价S-ODN体外活性,SPSS进行定量构效关系(QSAR)分析,RT-PCR检测S-ODN对HER-2表达的影响。结果:11个靶向模拟二级结构完全保守局域(LM)的S-ODN中,有9个获得低于或相似于HA4的IC50值,且其IC50值显著低于靶向部分保守与非保守LM的AS-ODN(P基数,靶结构自由能在QSAR方程中有统计意义,多元回归R=0.967,P=0.005)。结论:针对模拟靶mRNA二级结构中高度保守LM部位进行反义药物设计可提高阳性率,并获得优于阳性对照的S-ODN。

关键词： erbB-2基因反义寡脱氧核苷酸类构效关系二级结构

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EPR波谱拟合-傅里叶去卷积距离计算方法

波谱学杂志 2010年第1期27卷 113-120页

作者：郭林超王长振丛建波先宏吴可军事医学科学院放射与辐射医学研究所国家生物医学分析中心自由基与顺磁共振实验室北京100850

在蛋白质结构与功能研究中经常需要测量和计算蛋白质分子功能基团间的距离.电子顺磁共振(Electron Paramagnetic Resonance,EPR)结合定点自旋标记(Site Directed Spin Labeling,SDSL)技术已成为测量蛋白质特殊位点间距离的重要方法.目... 详细信息

在蛋白质结构与功能研究中经常需要测量和计算蛋白质分子功能基团间的距离.电子顺磁共振(Electron Paramagnetic Resonance,EPR)结合定点自旋标记(Site Directed Spin Labeling,SDSL)技术已成为测量蛋白质特殊位点间距离的重要方法.目前在计算距离中广泛使用的傅里叶去卷积距离计算方法(Fourier Deconvolution Distance Measurement,FDDM)在某些特殊实验条件下会产生计算误差较大或需要人为设置一些关键参数,从而影响计算结果的客观性等问题.本文在其基础上提出波谱拟合-傅里叶去卷积距离计算方法(Spectrum Simulation-Fourier Deconvolution Distance Measurement,SS-FDDM),比较了SS-FDDM与FDDM方法计算距离的实用性、抗噪能力和磁场偏移修正能力等.结果表明,SS-FDDM方法能一定程度地克服原方法存在的不足,减少由谱偏移和高噪声带来的误差,使计算结果更加准确客观.利用SS-FDDM方法,对不同浓度的自由基冰冻溶液模型样品进行了实际距离计算,验证了该方法是实际可行的.

关键词：电子顺磁共振(EPR) 距离测量定点自旋标记蛋白质傅里叶去卷积

用电子顺磁共振波谱拟合方法估算牙釉质辐射剂量

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中华放射医学与防护杂志 2011年第6期31卷 -页

作者：董国福丛建波郭林超宁静先宏王长振吴可军事医学科学院放射与辐射医学研究所国家生物医学分析中心自由基与顺磁共振实验室北京100850

目的探讨运用电子顺磁共振(electron paramagnetic resonance,EPR)波谱拟合技术估算牙釉质EPR辐射剂量的准确性.方法编制多成分叠加型EPR粉末波谱拟合软件,分别拟合牙齿本底信号( background signal,BS)和辐照诱发信号(radiation-indu... 详细信息

目的探讨运用电子顺磁共振(electron paramagnetic resonance,EPR)波谱拟合技术估算牙釉质EPR辐射剂量的准确性.方法编制多成分叠加型EPR粉末波谱拟合软件,分别拟合牙齿本底信号( background signal,BS)和辐照诱发信号(radiation-induced signal,RS)的EPR波谱模型,用波谱模型叠加计算方法拟合出实际辐照后牙釉质的EPR波谱,从复合谱中提取出RS成分并计算其相对强度,建立剂量响应曲线,估算样品剂量,并将剂量估算结果与传统的波谱强度测量方法进行比较.结果拟合获得的BS信号为单峰高斯线形粉末谱,g=2.0035,线宽Hpp=0.650 -1.100 mT; RS信号为轴对称多晶粉末谱线形,其g(1)=2.0018,g(11)=1.9965,线宽Hpp=0.335 -0.400 mT；分离BS与RS后得到的RS相对强度与辐照剂量呈线性相关,剂量响应方程为:y=240.74x+ 76 724( R2=0.9947),剂量估算结果相对误差期望值为0.13.结论 EPR波谱拟合方法在一定程度上提高了牙釉质辐射剂量估计的准确性和可信度.

关键词：电子顺磁共振波谱拟合牙釉质辐射剂量估算

基于系统发育与模拟mRNA结构设计的靶向蛋白激酶C-α的反义药物(英文)

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Acta Pharmacologica Sinica 2003年第3期24卷 79-86页

作者：宋海峰汤仲明袁守军朱宝珍刘秀文军事医学科学院放射医学研究所药理毒理研究室军事医学科学院放射医学研究所药理毒理研究室北京 100850 中国

目的:系统发育比较分析与二级结构模拟结合用于反义药物优化设计。方法:靶向自由能低的完全保守区域设计反义脱氧寡核苷酸(ODN)。体外评价ODN对人A549细胞和鼠B16-BL6细胞的增殖抑制效应。细胞原位杂交与RT-PCR方法检测靶mRNA表达。用... 详细信息

目的:系统发育比较分析与二级结构模拟结合用于反义药物优化设计。方法:靶向自由能低的完全保守区域设计反义脱氧寡核苷酸(ODN)。体外评价ODN对人A549细胞和鼠B16-BL6细胞的增殖抑制效应。细胞原位杂交与RT-PCR方法检测靶mRNA表达。用裸鼠荷A549肿瘤和小鼠荷B16肿瘤模型评价ODN的体内活性。结果:3个ODN体外对A549细胞的IC50值显著低于阳性对照ISIS3521。效果最佳的ODN AP1261可剂量依赖地抑制PKC-α mRNA的表达。AP1261在0.005-0.5mg·kg-1·d-1的剂量范围内可抑制A549和B16肿瘤的体内生长。相同剂量下AP1261对A549肿瘤体内生长的抑制率显著高于ISIS3521,而ISIS3521对鼠B16肿瘤的体内外生长无影响。结论:AP1261可能成为有效的抗癌药物或佐剂,系统发育比较分析与二级结构模拟相结合有助于反义药物设计。

关键词：药物设计反义寡脱氧核苷酸类蛋白激酶C 系统发育

衰老过程中雄性大鼠脏器自由基浓度和过氧化脂质的变化

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中华老年医学杂志 1991年第3期10卷 166-169页

作者：詹皓孙存普军事医学科学院毒物药物研究所（现工作单位：航空医学研究所北京，100036）军事医学科学院自由基生物学专业实验室军事医学科学院毒物药物研究所

采用电子自旋共振技术测定了3、13和24月龄雄性大鼠（每组5只）肝、睾丸组织77K温度下的电子自旋共振（electron spin resonance，ESR）波谱，这些组织均带有g=2.0035的ESR信号和g=2.031～2.032的含氧自由基信号。24月龄大鼠肝、睾丸自... 详细信息

采用电子自旋共振技术测定了3、13和24月龄雄性大鼠（每组5只）肝、睾丸组织77K温度下的电子自旋共振（electron spin resonance，ESR）波谱，这些组织均带有g=2.0035的ESR信号和g=2.031～2.032的含氧自由基信号。24月龄大鼠肝、睾丸自由基浓度分别较13、3月龄大鼠明显降低（P<0.05）。下丘脑、肾上腺、胸腺与脾匀浆的过氧化脂质无明显增龄变化，但随大鼠月龄增长，大脑皮层匀浆和线粒体、肝匀浆和微粒体、睾丸匀浆和线粒体的过氧化脂质逐渐升高。

关键词：衰老自由基过氧化脂质

DMTU对激光视网膜损伤治疗作用的实验研究

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激光技术 2003年第4期27卷 285-287页

作者：陈鹏单清张杰马萍张翠萍姜严明钱焕文军事医学科学院放射医学研究所北京100850 军事医学科学院卫生学环境医学研究所天津300050

二甲基硫脲 (DMTU)是一种特异的自由基清除剂 ,实验中 ,建立了动物视网膜激光损伤模型 ,观察了治疗组与对照组不同时间点视网膜的组织病理改变以及生化和分子生物学指标的变化。结果表明 ,DMTU可以有效地抑制感光细胞的脂质过氧化 ,能... 详细信息

二甲基硫脲 (DMTU)是一种特异的自由基清除剂 ,实验中 ,建立了动物视网膜激光损伤模型 ,观察了治疗组与对照组不同时间点视网膜的组织病理改变以及生化和分子生物学指标的变化。结果表明 ,DMTU可以有效地抑制感光细胞的脂质过氧化 ,能明显减少损伤区域视网膜神经元的凋亡数目 ,保护视网膜组织的结构和形态。

关键词：视网膜损伤激光损伤治疗二甲基硫脲细胞凋亡 DMTU 自由基清除剂

氧化修饰低密度脂蛋白对巨噬细胞一氧化氮合酶基因表达的影响

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生物化学与生物物理进展 1997年第2期24卷 140-143页

作者：刘尚喜陈瑗周玫孙曼霁第一军医大学自由基医学研究室广州510515 军事医学科学院毒物药物研究所北京100850

氧化修饰LDL (OX LDL)可抑制脂多糖 (LPS)诱导的巨噬细胞NO释放 ,而正常 (N LDL)和乙酰化LDL (AC LDL)则没有抑制作用 .OX LDL对NO释放的抑制作用随LDL修饰程度的升高而增强 ,且具有浓度和时间效应 .狭缝杂交结果显示OX LDL处理可使LPS... 详细信息

氧化修饰LDL (OX LDL)可抑制脂多糖 (LPS)诱导的巨噬细胞NO释放 ,而正常 (N LDL)和乙酰化LDL (AC LDL)则没有抑制作用 .OX LDL对NO释放的抑制作用随LDL修饰程度的升高而增强 ,且具有浓度和时间效应 .狭缝杂交结果显示OX LDL处理可使LPS诱导的巨噬细胞NOSmRNA含量下降 ,提示OX

关键词：低密度脂蛋白氧化修饰巨噬细胞一氧化氮合酶

Mn-SOD对CHO细胞电离辐射敏感性的影响

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生物化学与生物物理进展 1997年第1期24卷 48-52页

作者：孙娟陈瑗周玫葛忠良黎明涛第一军医大学自由基医学研究室广州510515 军事医学科学院放射医学研究所北京100850 中山医科大学药理教研室广州510089

近年来的研究发现 ,IL 1和TNF是重要的辐射防护因子 ,因IL 1和TNF都能选择性诱导Mn SOD的高度表达 ,因此认为Mn SOD可能有辐射防护作用 .通过转染有义和反义Mn SODcDNA于CHO细胞 ,进一步说明了Mn SOD在抗电离辐射损伤中的作用 .研究表... 详细信息

近年来的研究发现 ,IL 1和TNF是重要的辐射防护因子 ,因IL 1和TNF都能选择性诱导Mn SOD的高度表达 ,因此认为Mn SOD可能有辐射防护作用 .通过转染有义和反义Mn SODcDNA于CHO细胞 ,进一步说明了Mn SOD在抗电离辐射损伤中的作用 .研究表明 ,转染有义Mn SODcDNA可降低细胞对电离辐射的敏感性 ,而转染反义Mn

关键词：超氧化物歧化酶锰电离辐射细胞生物氧化

N-乙酰-L-半胱氨酸对失血性休克大鼠再灌注损伤的保护作用

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中国药理学与毒理学杂志 2003年第6期17卷 420-425页

作者：管利东王广义王字玲军事医学科学院输血研究所北京100850

目的　为临床应用抗氧化剂N 乙酰 L 半胱氨酸 (NAC)防治失血性休克提供实验基础。方法大鼠放血致休克 (失血量 4 9% ,血压 4～ 5 .3kPa) ,30min后 ,回输全血并再灌注 3h。回输全血的同时 ,分别给予NAC (15 0mg·kg- 1)和银杏叶提取物(E... 详细信息

目的　为临床应用抗氧化剂N 乙酰 L 半胱氨酸 (NAC)防治失血性休克提供实验基础。方法大鼠放血致休克 (失血量 4 9% ,血压 4～ 5 .3kPa) ,30min后 ,回输全血并再灌注 3h。回输全血的同时 ,分别给予NAC (15 0mg·kg- 1)和银杏叶提取物(Egb ,5 0mg·kg- 1) ,3h后检测血浆乳酸脱氢酶(LDH)、谷草转氨酶 (GOT)活性和组织匀浆丙二醛(MDA)含量、髓过氧化物酶 (MPO)活性 ,并观察肾和肝组织病理变化。结果　给予NAC可明显降低缺血再灌注所致的血浆LDH、GOT活性及心、肝、肺和肾组织MPO活性和MDA含量增高 ,病理观察也显示组织损伤改善。Egb也有一定的改善作用 ,但不如NAC作用显著。结论　再灌早期给予NAC可抑制自由基的产生和脂质过氧化反应。

关键词： N-乙酰-L-半胱氨酸休克失血性再灌注损伤银杏叶提取物