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2011-2022年内蒙古自治区肺结核发病变化趋势分析

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疾病监测 2024年第1期39卷 53-58页

作者：吴塔娜荣岩曹文杰张鑫徐丽娟内蒙古自治区综合疾病预防控制中心内蒙古呼和浩特010080

目的分析内蒙古自治区(内蒙古)不同时期肺结核发病率的变化趋势,探讨近年来结核病预防控制的效果,为制定防控措施提供依据。方法利用“中国疾病预防控制信息系统”子系统“传染病报告信息管理系统”、“基本信息系统”和《内蒙古统计年... 详细信息

目的分析内蒙古自治区(内蒙古)不同时期肺结核发病率的变化趋势,探讨近年来结核病预防控制的效果,为制定防控措施提供依据。方法利用“中国疾病预防控制信息系统”子系统“传染病报告信息管理系统”、“基本信息系统”和《内蒙古统计年鉴》获取内蒙古2011—2022年肺结核报告发病情况和人口数据,采用Joinpoint回归模型进行肺结核报告发病率(发病率)的趋势性分析。结果2011—2022年内蒙古共计报告肺结核患者14.86万例,发病率从2011年的66.55/10万下降至2022年的28.56/10万,平均发病率49.74/10万,平均变化百分比(AAPC)为-7.32%(Z=-2.405,P=0.016),年递降率为7.40%;男性的发病率(2011年85.66/10万,2022年36.92/10万)高于女性(2011年45.90/10万,2022年19.83/10万),男性、女性AAPC分别为-7.21%、-7.36%;老年人(≥65岁)的平均发病率139.35/10万最高,AAPC为-8.64%,2019年后出现快速下降;中老年(45~54岁)于2011—2018年发病率平稳,2018年后出现下降,年度变化百分比(APC)为-16.56%(t=-4.314,P=0.013);儿童(0~14岁)最低(2.15/10万),AAPC为-6.90%,且儿童女性的平均发病率(2.37/10万)高于男性(1.94/10万)。结论2011-2022年内蒙古肺结核报告发病率总体呈下降趋势,下降了57.09%,对于男性、老年人以及儿童等重点人群,应加强主动筛查,并在综合管理的基础上针对重点人群加强结核病防控工作。

关键词：结核肺流行特征 Joinpoint回归模型

1株鼠疫耶尔森菌噬菌体的分离鉴定及基因组学分析

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疾病监测 2024年第9期 1185-1190页

作者：申小娜贺金荣刘芳王艺婷王宇萌彭遥李存香钟佑宏靳海晓郭瑾李伟中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室内蒙古自治区综合疾病预防控制中心青海省地方病预防控制所云南省地方病预防控制所

目的分离鉴定一株喜马拉雅旱獭携带鼠疫噬菌体，并对其基本生物学特性及基因组学特征进行分析。方法采集鼠疫自然疫源地宿主动物喜马拉雅旱獭盲肠标本，采用双层琼脂平板法，以鼠疫菌疫苗株EV76为宿主菌，分离纯化噬菌体,利用透射电... 详细信息

目的分离鉴定一株喜马拉雅旱獭携带鼠疫噬菌体，并对其基本生物学特性及基因组学特征进行分析。方法采集鼠疫自然疫源地宿主动物喜马拉雅旱獭盲肠标本，采用双层琼脂平板法，以鼠疫菌疫苗株EV76为宿主菌，分离纯化噬菌体,利用透射电子显微镜观察其形态，研究生物学特性，提取该噬菌体的DNA进行二代测序，并利用生物信息学软件分析其基因组的特征与功能。结果在喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地宿主动物喜马拉雅旱獭盲肠中分离获得一株鼠疫噬菌体，命名为vB＿YpM＿QH041，电镜观察其具有正二十面体头部和收缩性的尾部，为肌尾噬菌体。噬菌体生物学特性研究显示，最佳感染复数为0.1，潜伏期为40 min，暴发期为40 min，暴发量为10蚀斑形成单位（PFU）/cell。该噬菌体对来自10个自然疫源地的33株鼠疫菌均裂解，对耶尔森菌属内1株假结核耶尔森菌裂解；对肠杆菌科内1株非致病大肠埃希菌（MG1655）具有裂解性，对其他大肠埃希菌、沙门菌、痢疾杆菌没有明显的裂解性。该噬菌体基因组长度为31 940 bp,GC含量为51.52%，有42个开放阅读框，开放阅读框总长度28.99 kb，其中有35个为已知编码序列，不含毒力基因和抗生素耐药基因。噬菌体全基因组系统发育树同源性分析结果显示，该噬菌体与鼠疫噬菌体vB＿YpM＿22和VB-YpM-18亲缘关系较近，为P2类噬菌体，但宿主谱存在不同。结论该噬菌体对鼠疫菌裂解性好，同时能裂解其他肠道菌，有助于了解鼠疫菌在自然疫源地中的保存问题，具有一定的潜在应用价值。

关键词：鼠疫菌噬菌体鼠疫疫源地分离鉴定基因组分析

群体感应调控子AphA对河弧菌Ⅵ型分泌系统VflT6SS2的调控研究

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中华流行病学杂志 2024年第4期45卷 566-573页

作者：程倩韩雨黄元铭冀赛森李杰刁保卫梁未丽传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的研究河弧菌群体感应调控子AphA对Ⅵ型分泌系统VflT6SS2功能活性的调控机制。方法采用Western Blot检测河弧菌野生株、aphA缺失株(ΔaphA)和aphA回补株中VflT6SS2标志性组件溶血素共调节蛋白(Hcp)的表达和分泌。采用实时荧光定量PCR... 详细信息

目的研究河弧菌群体感应调控子AphA对Ⅵ型分泌系统VflT6SS2功能活性的调控机制。方法采用Western Blot检测河弧菌野生株、aphA缺失株(ΔaphA)和aphA回补株中VflT6SS2标志性组件溶血素共调节蛋白(Hcp)的表达和分泌。采用实时荧光定量PCR和启动子-lux融合冷光系统检测野生株和ΔaphA中VflT6SS2核心基因簇和附属基因簇代表基因tssB2、hcp(tssD2)和vgrG(tssI2)以及群体感应调控子HapR的mRNA相对表达量和启动子活性。采用定点突变实验结合启动子活性测定确定AphA在tssD2b启动子区的调控结合位点;采用电泳迁移率位移测定(EMSA)确定AphA与hapR启动子的结合。结果ΔaphA中tssB2、hcp(tssD2)、vgrG(tssI2)和hapR的mRNA相对表达量及Hcp蛋白的表达分泌明显高于野生株。VflT6SS2核心基因簇、tssD2a、tssI2a和hapR的启动子活性在ΔaphA中均高于野生株,而tssD2b启动子活性则低于野生株。tssD2a和tssD2b的启动子序列分析显示-335 bp~-229 bp区差异较大,在tssD2b中该区域存在2个潜在AphA结合位点,将其中的保守位点ATG替换为CGA,tssD2b启动子活性明显降低。EMSA结果显示,AphA与hapR启动子直接结合。结论AphA在转录水平直接抑制hapR的表达,间接参与对VflT6SS2核心基因簇和附属基因簇的调控。AphA对tssD2a和tssD2b呈现相反的调控模式,AphA可直接与tssD2b启动子区(-335 bp~-229 bp)结合正向调控tssD2b的表达。

关键词：河弧菌群体感应调控子 Ⅵ型分泌系统转录调控

新冠疫情大流行期间广州市H3N2流感病毒分子流行特征分析

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中华预防医学杂志 2024年第3期58卷 351-357页

作者：曹蓝周腾飞陈艺韵马蒙蒙夏丹刘艳慧李魁彪狄飚秦鹏哲张周斌广州市疾病预防控制中心病毒免疫部广州510440 广州市疾病预防控制中心传染病预防控制部广州510440 广州市疾病预防控制中心主任室广州510440

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰... 详细信息

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰(阳性率为52.23%),流行强度和持续时间均高于2019年H3N2流感流行期。2022年流行株HA基因和NA基因均属于3C.2a1b.2a.1a.1分支,与2019年冬季的H3N2流行株进化分支(Group-3 毒株3C.2a1b.1a)不同。2022年流行株抗原位点变异主要发生在C区I48T位,HA蛋白受体结合位点与疫苗株一致。大部分流行株在HA蛋白上带有13个糖基化位点,一起暴发疫情分离株发生24-NST处糖基化位点的缺失。综上,新冠疫情大流行期间,引起广州市2022年H3N2流感流行的病毒株属于新衍生进化分支,进化起源上并非由2019年广州市毒株直接传播进化而来。

关键词： H3N2流感病毒分子变异遗传特征新型冠状病毒监测

2010—2022年我国钩端螺旋体病流行病学特征

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第2期36卷 130-136页

作者：师悦耿梦杰周升陈曦孙军玲田雪莹徐红李昱郑灿军传染病溯源预警与智能决策国家重点实验室、中国疾病预防控制中心北京102206 山东省疾病预防控制中心广西壮族自治区南宁市疾病预防控制中心

目的分析2010—2022年我国钩端螺旋体病流行病学特征,为制订钩端螺旋体病防控策略提供参考依据。方法在中国疾病预防控制信息系统中,收集2010年1月1日至2022年12月31日报告的钩端螺旋体病临床诊断病例和确诊病例信息,采用描述性流行病... 详细信息

目的分析2010—2022年我国钩端螺旋体病流行病学特征,为制订钩端螺旋体病防控策略提供参考依据。方法在中国疾病预防控制信息系统中,收集2010年1月1日至2022年12月31日报告的钩端螺旋体病临床诊断病例和确诊病例信息,采用描述性流行病学方法对病例地区、时间、人群分布及报告和诊断机构进行分析。结果 2010—2022年全国累计报告钩端螺旋体病病例4 559例,年均报告351例;报告病例数从2010年的679例下降至2018年的158例。四川省、云南省、广东省、湖南省、福建省、浙江省、广西壮族自治区、安徽省、江西省和贵州省累计报告钩端螺旋体病病例4 276例,占全国病例总数的93.79%;其中云南省近年病例数大幅下降,浙江省、广东省报告病例数明显增加。2010—2020年河南省无钩端螺旋体病病例报告,但2021、2022年分别报告5例和2例;2010—2017年陕西省仅报告1例病例,但自2018年起连续5年有病例报告。全国全年均有钩端螺旋体病病例报告,以8—10月为发病高峰,各省发病高峰存在差异;男性病例多于女性,男女性别比为2.3∶1;病例中位年龄50岁(四分位间距:23岁),以51~60岁组报告病例数占比最高(23.21%)。2010—2022年我国钩端螺旋体病报告病例中,确诊病例占53.28%,确诊病例占比从2010年的35.05%上升至2022年的61.66%。综合医院、疾病预防控制机构、基层卫生机构和其他卫生机构钩端螺旋体病报告病例数占比分别为67.22%(2 937例)、20.44%(893例)、7.23%(316例)、5.10%(223例)。2010—2022年全国钩端螺旋体病报告病例病死率为1.07%,男性病死率高于女性(1.39%vs.0.36%;χ^(2)=9.52,P=0.002)。结论2010—2022年我国钩端螺旋体病处于低水平流行状态,南方地区为主要流行区,各流行省份病例流行病学特征存在差异。陕西省、河南省等省份近年持续有病例报告,需加强关注。建议各地加强钩端螺旋体病监测,提升病例诊治能力,因地制宜开展防控工作。

关键词：钩端螺旋体病流行病学特征地区分布时间分布人群分布诊断监测中国

2021年内蒙古自治区死因监测点主要慢性非传染性疾病死亡情况及2014-2021年变化趋势分析

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疾病监测 2024年第7期39卷 902-908页

作者：郑婧婧席云峰乔丽颖那布其尚书亢伟伟内蒙古自治区疾病预防控制中心(内蒙古自治区预防医学科学院) 内蒙古呼和浩特010031

目的通过分析2021年内蒙古自治区20个国家级死因监测点主要慢性非传染性疾病(简称“慢性病”)死亡情况及2014—2021年变化趋势,掌握主要慢性病的疾病负担,为慢性病的防控工作提供依据。方法通过人口死亡信息登记管理系统收集2014—2021... 详细信息

目的通过分析2021年内蒙古自治区20个国家级死因监测点主要慢性非传染性疾病(简称“慢性病”)死亡情况及2014—2021年变化趋势,掌握主要慢性病的疾病负担,为慢性病的防控工作提供依据。方法通过人口死亡信息登记管理系统收集2014—2021年内蒙古自治区国家级死因监测点的数据,并使用《国际疾病分类》第10版对居民的根本死因进行分类和编码。使用SAS 9.4软件对原始数据进行清洗;使用Excel 2007和SPSS 23.0软件整理并计算粗死亡率、标化死亡率以及早死概率等数据,使用2010年第六次全国人口普查数据进行标化;使用Joinpoint软件计算平均年度变化百分比(AAPC),对数据进行趋势分析;率的比较采用χ^(2)检验。结果2021年内蒙古自治区国家级死因监测点4种主要慢性病的粗死亡率为570.14/10万,其中女性为469.82/10万,男性为662.43/10万,差异有统计学意义(χ^(2)=798.702,P内蒙古自治区国家级死因监测点居民粗死亡率为590.28/10万~663.04/10万,呈上升趋势(AAPC=1.35%,t=5.548,P内蒙古自治区国家级死因监测点4种主要慢性病粗死亡率为499.61/10万~570.14/10万,呈上升趋势(AAPC=1.55%,t=4.822,P内蒙古自治区国家级死因监测点4种主要慢性病早死概率为20.76%~14.59%,呈下降趋势(AAPC=−4.69%,t=−6.600,P内蒙古自治区国家级死因监测点居民粗死亡率呈上升趋势,心脑血管疾病、恶性肿瘤、慢性呼吸系统疾病等慢性病是导致内蒙古自治区居民死亡的主要原因。要加大4种主要慢性病的防治力度,尤其要将男性群体作为重点人群来开展工作,同时重点关注老年群体。

关键词：慢性病死亡情况平均年度变化百分比内蒙古自治区

一种基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法的建立

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中华预防医学杂志 2024年第4期58卷 489-496页

作者：苏文哲李岩陆维智谢华萍李魁彪狄飚聂凯王环宇张周斌许松涛广州市疾病预防控制中心病毒免疫部广州510440 山东省疾病预防控制中心传染病防制所济南250000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 广州市疾病预防控制中心主任室广州510440

目的:建立基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法。方法:通过NCBI网站检索和下载CHIKV的各基因型序列,经序列比对筛选出备选参考序列,使用Primalscheme和Geneious Prime等软件进行引物方案的设计、筛选和人工优化,并使用7份C... 详细信息

目的:建立基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法。方法:通过NCBI网站检索和下载CHIKV的各基因型序列,经序列比对筛选出备选参考序列,使用Primalscheme和Geneious Prime等软件进行引物方案的设计、筛选和人工优化,并使用7份CHIKV阳性样品对实验流程进行评估。结果:本研究所设计的引物方案可对各阳性样品进行成功扩增;在样品Ct值小于33时,可获得完整编码区序列;样品Ct值达到35时,可获得99.38%的编码区序列;使用多次迭代,逐步校正的拼接策略可将拼接成功率提高5.70%~25.43%。结论:建立的基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法操作简单,对多个浓度的基孔肯雅病毒阳性临床样品均表现良好。

关键词：基孔肯雅病毒全基因组测序多重PCR 高通量测序

2020年上海市一起洗浴中心庞蒂亚克热暴发调查

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中国公共卫生 2024年第1期40卷 82-86页

作者：俞晓崔鹏陈敏陈明亮韩若冰孔德川邱琪刘清潘浩上海市疾病预防控制中心传染病防治所急性传染病防治科上海200336 上海市奉贤区疾病预防控制中心传染病防制科上海201499 上海市疾病预防控制中心病原生物检定所上海200336

目的报告2020年上海市发生的一起洗浴中心庞蒂亚克热暴发疫情的流行病学调查结果,以期为后续同类疫情的监测和调查处置提供参考。方法对上海市奉贤区发热门诊2020年12月18—21日具有某洗浴中心暴露史的139例发热病例进行流行病学调查。... 详细信息

目的报告2020年上海市发生的一起洗浴中心庞蒂亚克热暴发疫情的流行病学调查结果,以期为后续同类疫情的监测和调查处置提供参考。方法对上海市奉贤区发热门诊2020年12月18—21日具有某洗浴中心暴露史的139例发热病例进行流行病学调查。以在该洗浴中心有明确轨迹和饮食信息的74例患者为病例组,以有该洗浴中心暴露史但未发热的44名健康人群作为对照组进行流行病学病因调查,采用logistic回归分析暴露危险因素,并使用RT-PCR方法对病例组15例发热患者深咳痰液样本进行病原核酸检测,利用BCYE平板进行军团菌培养。使用余氯检测仪现场检测该洗浴中心水中游离性余氯。结果除发热外,139例病例出现频率最高的症状依次为乏力(71例,51.08%)、头痛(58例,41.73%)和肌痛(58例,41.73%),疫情潜伏期为12~68 h,M为36 h。病例对照研究中,单因素分析结果显示在该洗浴中心泡汤是发热的危险因素(OR=9.036,95%CI=3.521~23.189);多因素logistic回归结果分析显示曾在美肌汤池泡汤者的危险度是未泡者的5.456倍(95%CI=1.746~17.042)。4例发热病例深咳痰液样本检出军团菌核酸阳性,4份环境样品培养出军团菌菌株,2个汤池余氯低于标准值(分别为0.2、0.09 mg/L)。结论结合流行病学、临床表现和实验室检测结果,综合判断此次疫情为一起由军团菌引起的庞蒂亚克热暴发。

关键词：不明原因发热庞蒂亚克热军团菌暴发洗浴中心上海

2016—2023年内蒙古自治区TB/HIV双重感染流行特征及治疗情况分析

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中国防痨杂志 2024年第S1期46卷 50-55页

作者：张鑫郎胜利徐丽娟高雨龙内蒙古自治区疾病预防控制中心结核病预防控制所结核病防治科呼和浩特010031 内蒙古自治区疾病预防控制中心结核病预防控制所呼和浩特010031 内蒙古自治区综合疾病预防控制中心结核病预防控制所呼和浩特010031

目的:通过对内蒙古自治区2016—2023年TB/HIV双重感染流行特点进行数据分析,为全区TB/HIV防控提供科学依据。方法:采用描述流行病学方法,运用“登记率”、“检查率”和“治疗成功率”等指标分析内蒙古自治区TB/HIV双重感染患者的流行病... 详细信息

目的:通过对内蒙古自治区2016—2023年TB/HIV双重感染流行特点进行数据分析,为全区TB/HIV防控提供科学依据。方法:采用描述流行病学方法,运用“登记率”、“检查率”和“治疗成功率”等指标分析内蒙古自治区TB/HIV双重感染患者的流行病学特点;运用趋势卡方检验及Fisher确切概率法分析内蒙古TB/HIV双重感染患者在2016-2023年间的三间分布、治疗情况。结果:2016—2023年全区登记HIV/AIDS患者43703例,接受胸片或痰涂片检查41049例,检出结核病患者158例,检查率为93.93%,检查率呈逐年上升态势(χ^(2)_(趋势)=272.970,P区结核病患者HIV抗体阳性筛查比例为23.69%,呈明显升高态势(χ^(2)_(趋势)=5764.882,P内蒙古TB/HIV双重感染患者的登记率2016-2018年逐年上升(χ^(2)_(趋势)=4.685,P=0.03),2019-2023年基本不变(χ^(2)_(趋势)=1.084,P趋势=0.179);不同盟(市)双感患者平均登记率存在差异(χ^(2)=41.565,P内蒙古2016-2023年TB/HIV双筛率逐年提高。每年的TB/HIV双重感染病例约为20例,登记率水平有所波动。今后要继续做好对重点地区、重点人群的监测管理工作,及时登记并提供优质的治疗管理服务。

关键词： TB/HIV双重感染流行病学治疗内蒙古[自治区]