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香叶基香叶基焦磷酸合成酶在肺鳞状细胞癌中的表达及临床意义

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第3期44卷 312-324页

作者：王鑫王晓霞李彦庆郑永鑫乌杰任猛贾向东许天祥内蒙古科技大学包头医学院研究生院包头014060 内蒙古自治区人民医院腹部肿瘤外科呼和浩特010017 内蒙古自治区人民医院重症医学科呼和浩特010017 内蒙古医科大学研究生院呼和浩特010000

目的·利用生物信息学和免疫组织化学法探究在肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)组织中香叶基香叶基焦磷酸合成酶(geranylgeranyl diphosphate synthase 1,GGPS1)的表达及其临床意义。方法·首先从UCSC Xena平台下载LUS... 详细信息

目的·利用生物信息学和免疫组织化学法探究在肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)组织中香叶基香叶基焦磷酸合成酶(geranylgeranyl diphosphate synthase 1,GGPS1)的表达及其临床意义。方法·首先从UCSC Xena平台下载LUSC组织与配对正常组织的转录组数据,使用R语言进行数据标准化和差异表达分析,并利用UALCAN数据库进行验证;采用UALCAN和LinkedOmics数据库分析LUSC患者中GGPS1表达与临床病理特征关系;利用Kaplan-Meier Plotter数据库探究LUSC患者GGPS1表达对预后的影响。应用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归分析筛选基因相关系数及风险评分。通过列线图和校正曲线评价GGPS1对LUSC的诊断价值。采用STRING、GeneMANIA数据库构建GGPS1蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。运用R语言挑选与GGPS1相关差异基因,并进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。采用免疫组织化学法检测LUSC患者GGPS1表达情况,并分析其与临床病理特征和预后的相关性。结果·通过TIMER2.0数据库检索到GGPS1在多数肿瘤中表达均升高,且在LUSC中呈高表达。UCSC Xena、UALCAN数据库中GGPS1在LUSC的表达高于癌旁组织(均P<0.05)。UALCAN和LinkedOmics数据库发现GGPS1在指标分期较晚患者中的表达水平更高,且Kaplan-Meier Plotter数据库显示LUSC患者GGPS1高表达总生存期(overall survival,OS)较短(P<0.05)。基于LASSO回归评估LUSC患者有较好的风险预测效能。构建LUSC患者的个体化预测模型具有最佳预测准确度。GO、KEGG结果显示,GGPS1相关基因主要与蛋白质代谢、调节脂质和胆固醇代谢过程、尼古丁成瘾、磷脂酰肌醇3激酶(phosphatidylinositol3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferatoractivated receptors,PPAR)信号通路等有关。GGPS1的代谢功能可能促进肿瘤发生。免疫组化结果提示GGPS1主要定位于细胞质中,且LUSC组织中表达高于癌旁组织(P<0.05),GGPS1高表达与LUSC患者肿瘤大小、淋巴结转移和TNM分期有关(均P<0.05),且GGPS1表达高的患者OS明显短于低表达者(P=0.000)。多因素Cox回归分析提示GGPS1可作为LUSC的独立预后因素。结论·相较于正常肺组织,GGPS1在LUSC中表达显著升高,尤其在肿瘤体积较大、淋巴结转移阳性及晚期的患者中表达升高更明显;且GGPS1过表达是LUSC患者预后差的独立预测因子。GGPS1有望成为新的LUSC诊治和预防的分子靶点。

关键词：香叶基香叶基焦磷酸合成酶肺鳞状细胞癌生物信息学免疫组织化学临床意义

改进知识蒸馏Transformer的新冠肺炎医学影像分类

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激光杂志 2024年第2期45卷 152-160页

作者：白浩田谷宇杨立东张宝华李建军吕晓琪唐思源张祥松贾成一贺群内蒙古科技大学信息工程学院内蒙古自治区模式识别与智能图像处理重点实验室内蒙古包头014010China 内蒙古工业大学信息工程学院呼和浩特010051China 内蒙古科技大学包头医学院计算机科学与技术学院内蒙古包头014010China 京东方科技集团股份有限公司北京100176China 中国二冶集团有限公司内蒙古包头014010China

针对在筛查新型冠状病毒感染肺炎患者时核酸检测假阴性率较高的问题,提出了一种DRPL-ViT计算机辅助诊断网络。在Vision Transformer的基础上首先引入知识蒸馏机制,使Transformer结构在小数据集上训练取得更好的拟合效果;然后,在patches... 详细信息

针对在筛查新型冠状病毒感染肺炎患者时核酸检测假阴性率较高的问题,提出了一种DRPL-ViT计算机辅助诊断网络。在Vision Transformer的基础上首先引入知识蒸馏机制,使Transformer结构在小数据集上训练取得更好的拟合效果;然后,在patches的位置信息编码上,通过更适合视觉任务的相对位置编码方式,使tokens之间的依赖关系能够被更好地捕捉;为了关注到更多的局部特征,在Transformer Encoder模块中引入了传统的卷积模块提取局部特征。实验在四分类测试集上平均分类准确率达到92.11%,对新冠肺炎分类准确率达到97.85%。实验结果表明,所提出的网络对新冠肺炎及其他肺部病变分类准确率较高,有一定的临床应用价值。

关键词：医学图像分类 Vision Transformer架构深度学习计算机X线摄影新冠肺炎

适配体传感器在磺胺类抗生素检测中的应用研究进展

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辽宁化工 2024年第1期53卷 106-108页

作者：郭红嘉肖淑艳董忠平内蒙古科技大学材料与冶金学院内蒙古包头014010 内蒙古科技大学内蒙古自治区先进陶瓷材料与器件重点实验室内蒙古包头014010

适配体生物传感器是检测环境中抗生素含量的有效手段。介绍了磺胺类抗生素检测中常用的3种适配体生物传感器的工作原理、特点、研究现状,包括适配体电化学传感器、适配体荧光传感器和适配体比色传感器。

关键词：适配体生物传感器磺胺类抗生素研究现状

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不同无人机飞行高度下玉米叶片叶绿素相对含量的无人机遥感反演及其指示叶位的识别

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江苏农业学报 2024年第7期40卷 1234-1244页

作者：李瑞鑫张宝林潘丽杰牛潘婷斯琴高娃何美玲内蒙古师范大学化学与环境科学学院内蒙古呼和浩特010020 内蒙古自治区环境化学重点实验室内蒙古呼和浩特010020 内蒙古节水农业工程研究中心内蒙古呼和浩特010020

玉米叶片叶绿素含量的空间异质性对其监测精度有影响。本研究旨在基于无人机遥感技术探究玉米叶片叶绿素相对含量(SPAD值)与植被指数间的关系,从而明确指示叶位、无人机的最佳飞行高度。采用随机森林法构建基于植被指数的叶绿素相对含... 详细信息

玉米叶片叶绿素含量的空间异质性对其监测精度有影响。本研究旨在基于无人机遥感技术探究玉米叶片叶绿素相对含量(SPAD值)与植被指数间的关系,从而明确指示叶位、无人机的最佳飞行高度。采用随机森林法构建基于植被指数的叶绿素相对含量遥感估算模型,并进行模型的评价。结果表明,玉米灌浆期叶片的叶绿素相对含量高于乳熟期叶片的叶绿素相对含量,植株中部叶片的叶绿素相对含量高于上部、下部叶片的叶绿素相对含量。在玉米灌浆期与乳熟期,玉米叶片SPAD值的指示叶位为第5叶,当无人机飞行高度为20 m时,模型的精度最高[决定系数(R 2)=0.94]。研究结果可为提高叶绿素相对含量遥感监测的精度提供技术支撑,并为农作物的田间智能化管理提供理论依据。

关键词：玉米叶绿素无人机遥感指示叶位智能

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白云鄂博矿床烧绿石族矿物的化学成分变化特征

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中国稀土学报 2024年

作者：罗晓锋曹钊王振江王其伟王艳艳胡庆成内蒙古科技大学矿业与煤炭学院内蒙古自治区矿业工程重点实验室内蒙古自治区煤炭安全开采与利用工程技术研究中心内蒙古煤炭绿色开采与绿色利用协同创新中心包头稀土研究院白云鄂博稀土资源研究与综合利用国家重点实验室内蒙古科技大学工程训练中心

白云鄂博REE-Nb-Fe矿床中铌资源储量丰富，烧绿石族矿物是该矿床主要的铌矿物。本文针对东部接触带的霓石-萤石-少量白云石-铁矿物组成的条带状矿石中的烧绿石族矿物，利用场发射扫描电镜（FE-SEM）和电子探针（EPMA）对其结构特征和化... 详细信息

白云鄂博REE-Nb-Fe矿床中铌资源储量丰富，烧绿石族矿物是该矿床主要的铌矿物。本文针对东部接触带的霓石-萤石-少量白云石-铁矿物组成的条带状矿石中的烧绿石族矿物，利用场发射扫描电镜（FE-SEM）和电子探针（EPMA）对其结构特征和化学成分进行了研究。背散射（BSE）电子图像显示其具有弱条带结构。EPMA分析表明，相对于其理想化学式的理论值和世界其它产地的烧绿石，白云鄂博的烧绿石Nb2O5含量较高，其质量分数为61.32%～65.10%，平均63.84%。按新定义，该烧绿石应为氟钙烧绿石，化学式为(Ca1.20Na0.78RE0.07Fe2+0.01)2.06(Nb1.78Ti0.22)2.00O6.32F0.68，Ca过剩Na亏损。矿物成分中部分阳离子之间存在选择性类质同象置换，Ca选择Nd、La，Th选择Pr。Nb与矿物成分中各元素具有不同的相关性，与Ti呈很好的负相关关系。其稀土配分模式呈“倒U式”，最大值为Pr或Nd。球粒陨石标准化（La/Nd）N的变化范围为0.49～0.58，表明白云鄂博烧绿石为相对La衰减和Nd富集矿物。δEu=0.96～0.99，Eu弱负异常，δCe=1.07～1.22，Ce弱正异常。烧绿石族矿物的化学成分变化主要受晶体结构控制和流体成分变化影响。

关键词：烧绿石族矿物化学成分白云鄂博电子探针

13-18岁青少年颈椎关节突关节发育特征的数字化三维形态分析

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中国组织工程研究 2024年

作者：李贵花和雨洁史君李琨张少杰刘路李志军王星内蒙古医科大学基础医学院解剖学教研室内蒙古医科大学基础医学院数字医学中心内蒙古医科大学基础医学院生理学教研室内蒙古自治区监狱管理局第一医院

背景：颈椎关节突关节作为颈椎后柱的重要解剖结构，在颈部活动、应力传导以及维持颈椎稳定性中发挥重要的作用。近年来通过解剖学和生物力学研究表明，颈椎关节突关节不对称可引起关节突关节的退变，颈椎关节突关节的退变可能是引起青... 详细信息

背景：颈椎关节突关节作为颈椎后柱的重要解剖结构，在颈部活动、应力传导以及维持颈椎稳定性中发挥重要的作用。近年来通过解剖学和生物力学研究表明，颈椎关节突关节不对称可引起关节突关节的退变，颈椎关节突关节的退变可能是引起青年人颈椎退变的主要原因。现有研究多集中在成人，国内对于学龄前儿童、学龄期儿童也有报道，而对于青少年颈椎小关节形态相关参数鲜有报道。目的：通过三维重建青少年颈椎关节突关节，测量其相关形态参数，并与儿童和成年人进行比较分析，探讨颈椎小关节形态发育的增龄变化规律，为临床颈椎小关节源性颈椎病的诊治和预防提供理论依据。方法：选择13-18岁青少年62例，行颈椎螺旋CT扫描后三维重建，要求无骨质破坏、肿瘤、畸形、骨折等，椎骨形态结构未发生改变，既往无脊柱相关手术，监护人对试验方案知情同意。按年龄分组，A组年龄为13-14岁，B组年龄为15-16岁，C组年龄为17-18岁。对各组青少年进行C2-C7关节突关节相关形态测量及统计分析。结果与结论：(1)3组关节突关节面高和关节面宽在随椎序的变化中，分别呈递减和递增趋势，下关节突关节面的高和宽均大于上关节面的相应指标；(2)关节突关节内高在3组年龄中，最小值均位于C5，且与年龄呈正相关变化；(3)关节突关节面间隙在3组中，A组C4-5、B组C3-4和C组C4-5明显大于各组其余间隙；A、B组除C4-5外，其余无显著性差异；C组除C2-3其余椎序间关节面间隙均明显大于A、B组；(4)提示颈椎关节突关节面的形态随椎序的增加，逐渐由圆形过渡到椭圆形；在组间比较中，关节面高较关节面宽受年龄影响明显；各节段下关节面的面积均大于上关节面的面积，仅在C4-5和C5-6形态和面积有显著性差异；加之关节突关节内高最小值均位于C5，关节突关节面间隙明显增宽处也主要位于C3-4和C4-5，因此颈椎失稳多发生于中位节段。

关键词：青少年颈椎关节突关节数字化形态三维重建

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下颈椎椎弓根的显微形态学特征

中国组织工程研究 2024年第12期28卷 1890-1894页

作者：李琨张少杰史君王建刘亚楠朵岚杨洋郝韵腾李志军王星内蒙古医科大学基础医学院解剖学教研室内蒙古自治区呼和浩特市010110 内蒙古医科大学基础医学院数字医学中心内蒙古自治区呼和浩特市010110 内蒙古医科大学基础医学院生理学教研室内蒙古自治区呼和浩特市010110 内蒙古医科大学基础医学院研究生学院内蒙古自治区呼和浩特市010110

背景:下颈椎椎弓根是脊柱后柱的主要应力部位,对人体重心稳定的维持及减轻振荡有重要意义,目前对其内部骨小梁特征、椎弓根与关节突及椎体的连接部位的特征研究鲜有报道,迫切需要了解椎弓根的精细解剖结构及其各部分关系和功能。目的:通... 详细信息

背景:下颈椎椎弓根是脊柱后柱的主要应力部位,对人体重心稳定的维持及减轻振荡有重要意义,目前对其内部骨小梁特征、椎弓根与关节突及椎体的连接部位的特征研究鲜有报道,迫切需要了解椎弓根的精细解剖结构及其各部分关系和功能。目的:通过Micro-CT扫描下颈椎椎骨标本以观测椎弓根显微解剖学形态,测量和分析正常下颈椎椎弓根内骨小梁的微结构和形态计量学参数以评估颈椎的安全性能。方法:选取31套干燥成人下颈椎骨骼标本C3-C7进行Micro-CT扫描,通过对椎弓根内骨小梁感兴趣区的勾选与重建,观察下颈椎椎弓根内骨小梁的形态特征及走形方向,检测骨微细结构参数,并分析比较C3-C7椎弓根骨微细结构的差异性。结果与结论:①Micro-CT图像显示下颈椎椎弓根的蜂窝样骨小梁呈复杂的网状微结构,靠近皮质骨的骨小梁呈板层状,结构相对致密,并向前方椎体部和向后方关节突椎板部延伸;板状骨小梁向髓腔伸展转化为网状结构,再转化为杆状骨小梁,髓腔内杆状骨小梁分布稀疏;②骨小梁各形态参数统计结果显示,C4、C5椎弓根的骨小梁骨体积分数高于C7(P<0.05),C7椎弓根的骨表面积/骨体积高于C3、C4、C6(P<0.05),C7椎弓根的骨小梁骨表面密度高于C3、C4、C5、C6(P<0.05),C7椎弓根的骨小梁厚度高于C3、C4、C5(P<0.05),左侧椎弓根骨小梁的骨表面积/骨体积、骨表面密度比较大于右侧(P<0.05);③该文总结了C3-C7微结构变化规律,其中C7椎弓根的负荷能力及应力较差,该区发生损伤的风险较高。

关键词：脊柱下颈椎椎弓根 Micro-CT 显微形态骨小梁

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颈椎钩突相关夹角增龄变化的特征与意义

中国组织工程研究 2024年第36期28卷 5766-5772页

作者：张德洲王超群史君李琨张少杰马渊侯二飞赵丹阳郝韵腾王思敏李筱贺王海燕李志军王星内蒙古医科大学研究生院内蒙古自治区呼和浩特市010110 内蒙古医科大学附属医院影像科内蒙古自治区呼和浩特市010050 内蒙古医科大学基础医学院生理学教研室内蒙古自治区呼和浩特市010110 内蒙古医科大学基础医学院解剖学教研室内蒙古自治区呼和浩特市010110 内蒙古医科大学基础医学院数字医学中心内蒙古自治区呼和浩特市010059

背景:钩椎关节作为颈椎所特有的结构,其发生、发展和发育直接影响着颈椎的稳定性和活动度,也与颈椎病的发病密切相关,深入了解钩椎关节的发育特点对颈椎病的发病类型、诊断与治疗有着重要意义。目的:利用影像学和三维重建技术对不同年... 详细信息

背景:钩椎关节作为颈椎所特有的结构,其发生、发展和发育直接影响着颈椎的稳定性和活动度,也与颈椎病的发病密切相关,深入了解钩椎关节的发育特点对颈椎病的发病类型、诊断与治疗有着重要意义。目的:利用影像学和三维重建技术对不同年龄段的颈椎钩突相关夹角进行大样本测量和观察,旨在揭示其随年龄和椎骨增长变化的特点,以及与颈椎稳定性之间的关系。方法:采用回顾性设计,将收集到的符合研究要求的1447例完整颈椎节段CT影像学资料的原始数据以DICOM格式导入Mimics 21.0软件进行后处理,并进行钩突夹角、钩突矢状位角测量,按照性别、年龄、侧别分组。结果与结论:①钩突夹角随椎序的增加呈V字形增长,其最低峰值位于C5处;总体随年龄的增长呈尖峰状,其峰值多介于30-39岁年龄范围内;②钩突矢状位角随椎序的增加呈鱼钩样增长、总体随年龄的递增也呈尖峰状,其峰值多介于20-29岁年龄范围内;钩突夹角与钩突矢状位角在侧别和性别间仅部分存在显著性差异(P<0.05);③提示钩突夹角随椎序递增呈V字形增长;钩突矢状位角随椎序递增鱼钩样增长,而2个夹角随年龄的增长总体呈尖峰状,钩突夹角在131°左右,可能与颈椎的稳定性密切相关;而钩突矢状位角在14°左右,可能对限制颈椎过度旋转有一定作用。

关键词：钩突钩突夹角钩突矢状位角增龄变化颈椎稳定性

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内蒙古部分地区全沟硬蜱的遗传多样性研究

中国人兽共患病学报 2024年第4期40卷 295-301页

作者：崔梦宇苏思邢丽丽木兰高瑞娟郭棋棋任洪祁冬冬于晶峰内蒙古医科大学公共卫生学院呼和浩特010100 内蒙古医科大学基础医学院呼和浩特010100 内蒙古医科大学第二附属医院呼和浩特010090 内蒙古医科大学第一临床医学院呼和浩特010100 呼伦贝尔市第三人民医院精神疾病基础与临床实验室呼伦贝尔022150

目的了解内蒙古自治区部分地区全沟硬蜱的遗传多样性和种群历史动态,为制定有效的媒介控制方案和揭示全沟硬蜱的传播机制提供科学数据。方法于2021年4月—2023年7月对内蒙古自治区的10个地区采用人工采集法或拖旗法进行采样,基于全沟硬... 详细信息

目的了解内蒙古自治区部分地区全沟硬蜱的遗传多样性和种群历史动态,为制定有效的媒介控制方案和揭示全沟硬蜱的传播机制提供科学数据。方法于2021年4月—2023年7月对内蒙古自治区的10个地区采用人工采集法或拖旗法进行采样,基于全沟硬蜱的16S rRNA和COI基因合成特异引物,对呼伦贝尔市阿龙山镇和兴安盟阿尔山市野外采获的游离全沟硬蜱进行PCR扩增,分析其遗传多样性。结果COI基因阳性率为90.00%,16S rRNA阳性率为98.33%;COI基因鉴定出18个单倍型,16S rRNA序列鉴定出15个单倍型;两个基因的单倍型多样性大于0.762,核苷酸多样性小于0.005;中性检验的Tajima’s值与Fu’s Fs值均为负值且达到了显著性水平(P<0.05),且核苷酸错配图显示为单峰。种群的遗传分化指数F ST显示群体的遗传分化程度较小,同时分子方差分析(AMOVA)表明,群体内的变异大于群体间的变异。系统发育树与单倍型网络图显示单倍型之间混杂分布。结论兴安盟地区与呼伦贝尔地区的全沟硬蜱拥有丰富的遗传多样性,能适应环境变化,遗传分化主要集中在群体内部且并未出现地理隔离。

关键词：全沟硬蜱 16S rRNA COI基因遗传多样性