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基于16S rRNA高通量测序技术分析中国西门塔尔牛瘤胃微生物多样性和功能预测的研究

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中国畜牧兽医 2019年第5期46卷 1370-1378页

作者：吴琼王思珍张适胡宗福杨浩牛化欣内蒙古民族大学动物科学技术学院通辽028000

为系统探讨中国西门塔尔牛瘤胃内的微生物多样性及其功能,本试验利用16S rRNA基因高通量测序技术检测分析西门塔尔牛(20月龄,平均体重约为550 kg)瘤胃液样本菌群结构并进行PICRUSt功能预测。结果显示,两组样本通过Illumina Miseq测序平... 详细信息

为系统探讨中国西门塔尔牛瘤胃内的微生物多样性及其功能,本试验利用16S rRNA基因高通量测序技术检测分析西门塔尔牛(20月龄,平均体重约为550 kg)瘤胃液样本菌群结构并进行PICRUSt功能预测。结果显示,两组样本通过Illumina Miseq测序平台共获得66 712条优质序列,聚类分析得到1 797个操作分类单元(OTU),经分类学鉴定分属13个门20个纲22个目33个科及59个属;厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)为优势菌群,所占比例分别为62.46%和22.45%;基于属的组成,依次为粪杆菌真核菌群([Eubacterium]_coprostanoligenes_group,9.16%)、瘤胃球菌属_2 (Ruminococcus_2,7.90%)、未知属f型拟杆菌目RF16菌群(norank_f__Bacteroidales_RF16_group,6.23%)、未知属f型瘤胃菌科(norank_f__Ruminococcaceae,4.79%)、理研菌科_RC9菌群(Rikenellaceae_RC9_gut_group,4.72%)、未知属f型拟杆菌目BS11菌群(norank_f_Bacteroidales_BS11_gut_group,4.49%)、瘤胃球菌属_1(Ruminococcus_1,4.43%)等;16S rRNA基因组的PICRUSt功能预测发现,瘤胃菌群功能主要集中在碳水化合物转运及代谢上,可能含有大量的纤维素和木质素降解酶基因。综上,基于16S rRNA基因的高通量测序技术全面揭示了西门塔尔牛瘤胃菌群的多样性,并预测其含有丰富的蛋白质分解、木质纤维素降解酶系,为探索西门塔尔牛瘤胃微生物奠定基础,也为进一步挖掘与某些重要营养生理功能密切相关的瘤胃微生物功能基因提供参考。

关键词：西门塔尔牛瘤胃 16S rRNA 微生物

二噁英引起斑马鱼下颌短小及其与Sonic hedgehog基因的关联

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湖泊科学 2005年第2期17卷 162-168页

作者：董武杨景峰曹颖霞王思珍 Hiroki Teraoka Takeo Hiraga 内蒙古民族大学动物科学技术学院通辽028042 Rakuno Gakuen University

环境污染物二噁英中毒性最强的2,3,7,8-四氯二苯并对二噁英(2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin,以下简称TCDD)经由芳烃基受体(arylhydrocarbonreceptor,Ahr)引起啮齿类口唇开裂,斑马鱼下颌短小等典型特征.本试验研究了TCDD引起的下颌短小与形态发育基因.Sonichedgehog(shh)的关系.用0—1.0μg/L的TCDD给受精后24h(24hpf)的斑马鱼胚染毒直至观察并进行形态学观察及原位杂交.结果观察到TCDD引起斑马鱼的下颌短小与其浓度相依存,同时观察到TCDD染毒群的Shh基因表达以及类似基因tiggy-winkleheagehog(twhh)的低下.观察Shh缺失的斑马鱼变异体Syu,或给正常斑马鱼染毒,添加Shh阻断药CycopamanCyclopamine,可以同样观察到斑马鱼的下颌短小.本试验表明TC-DD引起的下颌短小与shh和twhh表达是相关联的.同时也说明斑马鱼有可能作为二噁英类污染物的生物学毒性评价生物.

关键词：二噁英斑马鱼下颌长度生物学毒性评价 TCDD Shh基因

BP神经网络算法结合超高效液相色谱-质谱联用技术研究红花治疗慢性酒精性肝损伤的作用机制

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质谱学报 2024年第6期45卷 897-906,I0006页

作者：王曦烨韩晓静姜明洋白梅荣许良内蒙古民族大学化学与材料学院天然产物化学与功能分子合成自治区重点实验室内蒙古通辽028000 内蒙古民族大学蒙医药学院蒙医药研发工程教育部重点实验室内蒙古通辽028000 内蒙古民族大学计算机科学与技术学院内蒙古通辽028000

临床上,红花对慢性酒精性肝损伤(chronic alcoholic liver injury,CALI)有很好的疗效,但治疗机制不甚明确。因此,阐明红花治疗CALI的分子作用机制对药物的进一步开发及应用具有重要意义。以雄性Wistar大鼠为研究对象,模型组大鼠以8 mL/k... 详细信息

临床上,红花对慢性酒精性肝损伤(chronic alcoholic liver injury,CALI)有很好的疗效,但治疗机制不甚明确。因此,阐明红花治疗CALI的分子作用机制对药物的进一步开发及应用具有重要意义。以雄性Wistar大鼠为研究对象,模型组大鼠以8 mL/kg酒精连续灌胃28天,建立CALI模型;给药组大鼠分别以高(4.290 3 g/kg)、中(1.430 1 g/kg)、低(0.476 7 g/kg)剂量灌胃红花提取物。采用大鼠血清代谢组学分析方法结合超高效液相色谱-质谱技术鉴定与CALI相关的潜在生物标志物,并研究红花对这些生物标志物的调控机制。利用MATLAB软件建立BP神经网络模型处理组学数据的分类问题。从苏木精和伊红(H&E)染色实验发现,高剂量红花提取物减轻了肝细胞的损伤程度;与模型组相比,高剂量红花组中的丙氨酸氨基转移酶(ALT)和天冬氨酸氨基转移酶(AST)的表达水平降低,表明高剂量红花提取物具有肝保护作用。BP神经网络模型的分类准确率为95.8%,分类效果良好。通过火山图分析共鉴定出20种与CALI相关的生物标志物,红花可以对这些生物标志物产生回调效果。研究表明,红花可能通过对甘油三酯、脂肪酸、磷脂、胆汁酸、氨基酸、维生素E代谢的调控作用而对CALI产生治疗效果。本研究可为红花的推广和临床应用提供了理论基础。

关键词：红花慢性酒精性肝损伤代谢组学超高效液相色谱-质谱(UHPLC-MS) BP神经网络算法

人兽共患带科绦虫丝氨酸蛋白酶抑制剂研究进展

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中国血吸虫病防治杂志 2021年第6期33卷 650-654页

作者：宋伟宜王昕蕊于铭川崔亚轩齐昱孙树民内蒙古民族大学动物科技学院内蒙古通辽028000

丝氨酸蛋白酶抑制剂是一类能抑制丝氨酸蛋白酶活性的蛋白超家族,通过抑制宿主蛋白酶活性协助寄生虫感染宿主。本文从丝氨酸蛋白酶抑制剂空间结构与分类、丝氨酸蛋白酶抑制剂与宿主机体免疫应答间的作用机制及当前人兽共患带科绦虫丝氨... 详细信息

丝氨酸蛋白酶抑制剂是一类能抑制丝氨酸蛋白酶活性的蛋白超家族,通过抑制宿主蛋白酶活性协助寄生虫感染宿主。本文从丝氨酸蛋白酶抑制剂空间结构与分类、丝氨酸蛋白酶抑制剂与宿主机体免疫应答间的作用机制及当前人兽共患带科绦虫丝氨酸蛋白酶抑制剂相关研究进展等方面进行阐述,为人兽共患带科绦虫及其中绦期幼虫感染引发疾病诊断、药物治疗靶点和疫苗候选分子筛选等提供参考。

关键词：人兽共患病带科绦虫丝氨酸蛋白酶抑制剂免疫逃避

SIRT1功能及其对卵泡发育和卵母细胞成熟的调控作用

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中国生物工程杂志 2020年第10期40卷 51-56页

作者：贾振伟内蒙古民族大学动物科技学院通辽028043

沉默信息调节因子1(silent information regulator1,SIRT1)是NAD+依赖的去乙酰化酶,通过使底物发生去乙酰化而参与细胞众多生理功能的调节,在糖脂代谢、衰老、细胞凋亡、氧化应激等过程中发挥了重要作用。另外,众多研究表明,SIRT1是调... 详细信息

沉默信息调节因子1(silent information regulator1,SIRT1)是NAD+依赖的去乙酰化酶,通过使底物发生去乙酰化而参与细胞众多生理功能的调节,在糖脂代谢、衰老、细胞凋亡、氧化应激等过程中发挥了重要作用。另外,众多研究表明,SIRT1是调控动物卵巢老化、卵泡发育和卵母细胞成熟的重要因子,SIRT1表达下降或活性改变将导致卵母细胞老化,降低动物的繁殖力。为了充分理解SIRT1功能,并通过调控SIRT1活性而延缓卵巢和卵母细胞老化,从而提高动物繁殖力,简述了SIRT1的激活及其参与细胞内调控的生物过程,并从能量代谢、抗氧化胁迫、染色质重塑的角度讨论了SIRT1的主要功能,重点阐述了SIRT1对动物卵泡发育和卵母细胞成熟的调控作用。

关键词： SIRT1 能量代谢卵泡发育卵母细胞成熟

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线粒体与多潜能干细胞功能

遗传 2016年第7期38卷 603-611页

作者：贾振伟内蒙古民族大学动物科技学院通辽028043

线粒体是细胞内重要的细胞器,主要功能是通过氧化磷酸化为细胞生命活动提供能量。近年来,研究表明,在多潜能干细胞(Pluripotent stem cells,PSCs)中线粒体表现出独有的特征,即在多能性状态下,PSCs主要依靠糖酵解提供能量,其分化期间线... 详细信息

线粒体是细胞内重要的细胞器,主要功能是通过氧化磷酸化为细胞生命活动提供能量。近年来,研究表明,在多潜能干细胞(Pluripotent stem cells,PSCs)中线粒体表现出独有的特征,即在多能性状态下,PSCs主要依靠糖酵解提供能量,其分化期间线粒体氧化磷酸化代谢能力逐渐增强。相反,体细胞重编程为多潜能干细胞期间,线粒体氧化磷酸化向糖酵解途径的转变是其成功重编程必需的代谢过程。另外,线粒体通过生物合成和形态结构的动态重塑维持了PSCs多能性、诱导分化及诱导多能干细胞(Induced pluripotent stem cells,i PSCs)的重编程。因此,本文综述了PSCs线粒体形态结构及其在调控PSCs多能性、合成代谢、氧化还原状态的平衡、分化及重新编程中的作用,为深入了解线粒体调控PSCs功能的作用提供理论基础。

关键词：线粒体多潜能干细胞多能性分化重编程

内蒙古高原紫花苜蓿土壤氮素丰缺指标和推荐施氮量

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草地学报 2021年第12期29卷 2785-2791页

作者：米春娇孙洪仁王显国高凯张玉霞刘庭玉中国农业大学草业科学与技术学院北京100193 内蒙古民族大学农学院内蒙古通辽028000

为了给内蒙古高原紫花苜蓿(Medicago sativa L.)测土施氮奠定科学基础,本研究采用“零散实验数据整合法”和“养分平衡-地力差减法”新应用公式,开展了该自然区域紫花苜蓿土壤氮素丰缺指标和推荐施氮量研究。结果表明:内蒙古高原生长第... 详细信息

为了给内蒙古高原紫花苜蓿(Medicago sativa L.)测土施氮奠定科学基础,本研究采用“零散实验数据整合法”和“养分平衡-地力差减法”新应用公式,开展了该自然区域紫花苜蓿土壤氮素丰缺指标和推荐施氮量研究。结果表明:内蒙古高原生长第1年紫花苜蓿土壤碱解氮第1~6级丰缺指标为≥48,20~48,8~20,4~8,2~4和内蒙古高原紫花苜蓿第1~6级土壤推荐施氮量分别为0,68~135,135~270,203~405,270~540和338~675 kg·hm^(-2)。

关键词：紫花苜蓿测土施肥碱解氮全氮有机质丰缺指标施肥量

钾肥种类及用量对低温胁迫下苜蓿根颈含氮保护物质含量及抗寒性的影响

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中国草地学报 2023年第3期45卷 78-86页

作者：孙明雪张玉霞夏全超王显国张庆昕刘庭玉张永亮内蒙古民族大学农学院内蒙古通辽028041 中国农业大学草业科学与技术学院北京100193

为探讨钾肥种类及用量对低温胁迫下苜蓿(Medicago sativa L.)越冬器官抗寒性的影响及含氮保护物质变化的生理机理,对苜蓿施用氯化钾、硫酸钾和磷酸二氢钾3种钾肥,设置0、100、200和300 kg/hm^(2) K_(2)O 4个用量处理,于越冬前取苜蓿越... 详细信息

为探讨钾肥种类及用量对低温胁迫下苜蓿(Medicago sativa L.)越冬器官抗寒性的影响及含氮保护物质变化的生理机理,对苜蓿施用氯化钾、硫酸钾和磷酸二氢钾3种钾肥,设置0、100、200和300 kg/hm^(2) K_(2)O 4个用量处理,于越冬前取苜蓿越冬器官带回室内模拟4℃、-10℃、-20℃和-30℃低温胁迫处理,测定相对电导率、可溶性蛋白、脯氨酸和游离氨基酸含量,并进行相关性分析。结果表明:苜蓿根颈相对电导率随着温度的降低持续增长,游离氨基酸含量的变化趋势与之相反,其他指标则随着温度的降低表现为先升高后降低的趋势。3种钾肥处理的相对电导率随着施肥量的增加先降低后增长,其他指标均表现为先升高后降低的趋势;且在不同的低温胁迫处理下,以硫酸钾处理的苜蓿根颈相对电导率最低,其他指标含量最高,且在施用量为200 kg/hm^(2)K_(2)O时,苜蓿根颈相对电导率最低,较CK减少了23.37%~38.02%,可溶性蛋白、脯氨酸和游离氨基酸含量最高且均显著高于CK(P<0.05),分别增长了32.48%~50.39%、43.95%~264.29%和56.50%~249.50%,说明施用硫酸钾种类钾肥200 kg/hm^(2) K_(2)O更有利于减缓苜蓿细胞液外渗程度,调节细胞渗透势,保护生物膜,提高苜蓿抗寒性。

关键词：苜蓿抗寒含氮保护物质钾肥

早期补饲对舍饲肉用犊牛生长性能和肠道健康的影响

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动物营养学报 2024年第7期36卷 4413-4427页

作者：李琦徐均钊马建飞包俊杰牛化欣内蒙古民族大学动物科技学院通辽028000

本试验旨在研究早期补饲对舍饲肉用犊牛生长性能、腹泻率和肠道菌群及功能的影响。选用同一批次头胎肉用母牛所产健康新生犊牛30头(母犊牛16头、公犊牛14头),初生重(42.38±0.89)kg,随机分为2组(对照组与早期补饲组),每组15头(母犊牛8... 详细信息

本试验旨在研究早期补饲对舍饲肉用犊牛生长性能、腹泻率和肠道菌群及功能的影响。选用同一批次头胎肉用母牛所产健康新生犊牛30头(母犊牛16头、公犊牛14头),初生重(42.38±0.89)kg,随机分为2组(对照组与早期补饲组),每组15头(母犊牛8头、公犊牛7头),肉用母牛-犊牛(母子一体)单栏饲喂。对照组:犊牛随母哺乳,断奶前不补饲任何饲料;早期补饲组:犊牛随母哺乳,随日龄增加适时适量补饲颗粒开食料与优质燕麦干草。试验共持续42 d。结果显示:1)早期补饲组犊牛42日龄时体重极显著高于对照组(P0.05);早期补饲组犊牛各日龄阶段的平均日增重均极显著高于对照组(P0.05)。3)早期补饲组犊牛的腹泻率显著低于对照组(P0.05)。4)与对照组相比,早期补饲组犊牛肠道菌群的Simpson指数显著增加(P<0.05),Chao1指数显著降低(P<0.05);早期补饲组犊牛肠道菌群中粪杆菌属(Faecalibacterium)的相对丰度显著高于对照组(P<0.05),艾克曼菌属(Akkermansia)的相对丰度极显著高于对照组(P<0.01),并出现少量普雷沃氏菌属(Prevotella)与丁酸弧菌属(Butyrivibrio)。5)肠道菌群功能预测显示,早期补饲组犊牛肠道菌群功能中嘧啶核苷残基超途径、鸟苷核糖核苷酸从头生物合成、尿嘧啶核苷酸生物合成的丰度极显著高于对照组(P<0.01)。由此得出,早期补饲可促进舍饲肉用犊牛的生长发育,改善肠道菌群结构,促进氨基酸、能量代谢,降低腹泻率,便于实施早期断奶。

关键词：肉用犊牛早期补饲生长性能腹泻率肠道微生物