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野生新麦草种质醇溶蛋白遗传变异及地理分化研究

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野生新麦草种质醇溶蛋白遗传变异及地理分化研究

中国草学会2013学术年会

作者：陈仕勇周青平张新全马啸陈有军西南民族大学生命科学与技术学院四川农业大学草业科学系西南民族大学青藏高原研究院

采用酸性聚丙烯凝胶电泳技术(A—PAGE)对来自中国新疆、俄罗斯西伯利亚及蒙古等地的35份野生新麦草Psathyrostachys juncea种质进行醇溶蛋白的遗传变异分析,获得下述结果:(1)电泳共检测到37条醇溶蛋白条带,多态性条带37条,多态性条带比... 详细信息

采用酸性聚丙烯凝胶电泳技术(A—PAGE)对来自中国新疆、俄罗斯西伯利亚及蒙古等地的35份野生新麦草Psathyrostachys juncea种质进行醇溶蛋白的遗传变异分析,获得下述结果:(1)电泳共检测到37条醇溶蛋白条带,多态性条带37条,多态性条带比率高达100%;(2)种质间遗传相似系数变幅为0—0.8276,平均值为0.4509。这些表明了供试材料具有丰富的醇溶蛋白遗传多样性;(3)聚类分析将供试材料分成5类,相同或者相似生态地理来源的材料能够聚在一起,表明了醇溶蛋白带谱与其地理分布具有一定的相关性;(4)种质间的Shannon多样性指数H=0.5796,类群平均多样性指数H=0.4835,其中类群内和类群间的遗传变异分别为83.42%和16.58%,这可能与新麦草异花授粉的繁育方式有关。本研究结果将为新麦草种质资源的保护和利用提供理论依据。

关键词：新麦草种质醇溶蛋白遗传变异资源保护

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基于红外相机的中国兽类多样性监测现状分析

四川林业科技 2022年第3期43卷 60-66页

作者：郭桢杉黄金燕张群艳吴沛桦张晋东西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室四川南充637009 中国大熊猫保护研究中心大熊猫国家公园珍稀动物保护生物学国家林业和草原局重点实验室四川都江堰611830

为在全国整体宏观尺度下,总结我国各省(自治区、直辖市)基于红外相机技术对兽类物种多样性与地理分布的研究现状,明确研究空白或较少区域,从而为制定相对的保护监测与管理计划提供依据。采用文献检索法,系统收集各国学者在中国境内基于... 详细信息

为在全国整体宏观尺度下,总结我国各省(自治区、直辖市)基于红外相机技术对兽类物种多样性与地理分布的研究现状,明确研究空白或较少区域,从而为制定相对的保护监测与管理计划提供依据。采用文献检索法,系统收集各国学者在中国境内基于红外相机的野生动物多样性调查研究的相关文献,并分类整理。结果显示:全国红外相机共记录到至少208个野生兽类物种,隶属于11目37科,占全国兽类物种总数的30.06%。目前我国兽类红外相机监测研究基本已经覆盖全国,全国34个省(自治区、直辖市)中已有32个省(自治区、直辖市)有基于红外相机的兽类物种调查记录,但多集中于西南地区和东北地区。综合我国各省(自治区、直辖市)研究点数量、文献数量和红外相机已记录兽类物种占该省总物种数的比例等方面来看,重庆、辽宁、江苏、福建、内蒙古、台湾、上海含有潜在的调查价值。我国基于红外相机技术的兽类多样性监测还有一定的完善空间,需要开展更系统、更深入的监测研究。

关键词：生物多样性红外相机陷阱法兽类编目监测网络文献检索法

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基于全基因组数据的新旧大陆狼遗传分化研究

基于全基因组数据的新旧大陆狼遗传分化研究

第三届中国西部动物学学术研讨会

作者：范振鑫 Oscar Ramirez 杜联明张文平张修月张志和 Tomas Marques-Bonet Robert Wayne 岳碧松四川大学生命科学学院 Institut de Biologia Evolutiva (CSIC-Univ Pompeu Fabra) Barcelona Spain 成都大熊猫繁育研究基地 Department of Ecology and Evolutionary Biology University of California Los Angeles Los Angeles California United States of America

利用二代测序平台对来自非洲、亚洲、欧洲、中东、美洲等不同地区的狼、狗进行了高覆盖的全基因组测序,产生了36个犬科动物的高质量全基因组数据,结合已经公布的犬科动物基因组,进行了较深入的比较基因组学分析。通过对基因组水平的杂... 详细信息

利用二代测序平台对来自非洲、亚洲、欧洲、中东、美洲等不同地区的狼、狗进行了高覆盖的全基因组测序,产生了36个犬科动物的高质量全基因组数据,结合已经公布的犬科动物基因组,进行了较深入的比较基因组学分析。通过对基因组水平的杂合度分析发现,中国狼中的两只西藏狼表现出很低的杂合度。用5Mb大小的窗口扫描了所有38个染色体,计算所有5Mb窗口内的杂合度,进一步发现两只西藏狼的低杂合度表现在所有染色体。用PSMC模型对个体进行有效种群大小在历史变化分析,两只西藏狼在大约55,000年前出现了严重的瓶颈效率,并一直保持低于其它狼的有效种群大小持续到现在。对基因组纯合区域统计分析的结果表明,两只西藏狼比其它狼有更多的纯合区域,特别是有更多的长度较短的纯合区域,暗示西藏狼在较为古老的时期就开始了近亲繁殖。在ABBA-BABA对可能基因流的检测中,低海拔的中国狼（内蒙古和新疆个体）在大多数的分析中都表现出与不同的狗有显著的基因流;而高海拔的西藏狼在绝大多数的分析中都显示和狗没有基因流;同样为高海拔的青海狼,则在一些分析中显示与澳洲野狗、中国土狗和藏獒有显著的基因交流。印度狼和伊朗狼都表现为分析中所用的"第二只狼"和不同的狗有显著的基因流,其结果和西藏狼的类似;三只俄罗斯狼在所有的分析结果都显示和不同的狗有基因交流。用Tree Mix对杂交事件进行检测时,发现印度狼和中东狼的祖先和金毛豺有基因流,红狼和其余狼的祖先与五大湖狼有基因流,巴仙吉犬和中东狼有基因流,巴仙吉犬和藏獒有基因流,巴仙吉犬和中国土狗有基因流,亚洲狼和印度狼有基因流。用全基因组数据构建的系统发育树中,新旧大陆的狼和狗出现了明显的分化。新大陆狼中的墨西哥狼处于基部位置,表明其有特殊的遗传背景。这一结果符合以前研究假设-墨西哥狼是亚欧大陆狼迁徙到新大陆的最原始狼的遗存。在旧大陆的进化支中,狗和狼分别聚为两个大支。本研究中不同品系的狗聚为一支,而不同地区或国家的旧大陆狼聚为一支,狗和旧大陆狼遗传关系更近。这一结果也符合普遍被接受的观点,狗是由旧大陆的狼驯养后演变而来。在旧大陆狼的分支中,表现出了按地理分布区域的遗传分化。在主成分分析中,也得到了和系统发育树比较一致的结果。西藏狼有极低的杂合度、率先出现种群瓶颈和极低的有效种群以及拥有最多的纯合区域,揭示了西藏狼栖息在青藏高原这样的恶劣环境,其更容易受到冰期的影响,使其有效种群大小下降,并逐渐成为一个被隔离的小种群,造成近亲繁殖。杂交分析的结果表明不同的中国狼种群很可能有不同的进化历史,不同种群与狗间的基因流情况不一致:西藏狼是个隔离的种群,和其他犬科动物无基因交流;俄罗斯狼和不同的狗有频繁的基因流。这是首次基于世界范围内主要分布区的样品,通过全基因组数据,进行新旧大陆狼遗传分化和进化历史的研究。

关键词：新旧大陆亚洲狼全基因组测序遗传分化种群历史动态

基于线粒体Cytb及CO Ⅰ基因的黄河上游大鼻吻鮈(Rhinogobio nasutus)遗传多样性与系统发育关系分析

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基因组学与应用生物学 2024年第Z2期 1826-1835页

作者：王彩雯穆爱娟王吉祥王永杰刘彦斌刘凯肖伟刘哲连总强甘肃农业大学动物科学技术学院贺兰县农业农村局喀什大学生命与地理科学学院宁夏回族自治区水产研究所宁夏渔业工程技术研究中心

为研究黄河上游不同群体大鼻吻鮈遗传结构与系统发育关系，保护其野生种质资源，本研究基于线粒体Cytb和COⅠ基因对黄河宁夏段及内蒙古段4个地理群体的大鼻吻鮈进行了遗传多样性及系统发育关系分析。结果表明，Cytb和COⅠ基因序列长度... 详细信息

为研究黄河上游不同群体大鼻吻鮈遗传结构与系统发育关系，保护其野生种质资源，本研究基于线粒体Cytb和COⅠ基因对黄河宁夏段及内蒙古段4个地理群体的大鼻吻鮈进行了遗传多样性及系统发育关系分析。结果表明，Cytb和COⅠ基因序列长度分别为1 145、 749 bp,两个序列串联后的组合序列长度为1 894 bp,碱基组成均呈现明显的AT偏倚性。4个地理种群中，线粒体Cytb和COⅠ序列具有8个组合多态位点及9个组合单倍型，平均单倍型多样性（Hd）0.776,平均核苷酸多样性（π）为0.000 78。分子方差分析（analysis of molecular variance, AMOVA）显示4个地理种群间无显著遗传分化，其中95.81%变异来自群体内部，4.18%变异来自群体间。系统发育树及单倍型网络图表明大鼻吻鮈遗传结构比较单一，错配分布结果表明大鼻吻鮈在历史上出现过群体扩张事件。综上所述，黄河中上游的大鼻吻鮈群体遗传结构单一、遗传多样性较低，有必要将其作为一个保护单元进行就地保护，以期丰富大鼻吻鮈种群的遗传多样性。

关键词：大鼻吻鮈 Cytb CO Ⅰ 遗传多样性

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生物信息资源在家畜育种教学中的实践与探索

生物信息资源在家畜育种教学中的实践与探索

2019全国教育教学创新与发展高端论坛

作者：贾纯琰内蒙古农业大学职业技术学院

生物信息学是一门新兴的交叉学科,生物信息学实验在生物信息学教学中占有重要地位。总结了生物信息学实验教学中的使用和检索方法 ,并将其在生物信息学实验教学中进行了应用,取得了良好的教学效果,为培养创新应用型人才奠定了基础。伴...

生物信息学是一门新兴的交叉学科,生物信息学实验在生物信息学教学中占有重要地位。总结了生物信息学实验教学中的使用和检索方法 ,并将其在生物信息学实验教学中进行了应用,取得了良好的教学效果,为培养创新应用型人才奠定了基础。伴随着生物信息学的发展,生物信息数据库日趋完善。生物信息学数据库具有高度网络化,可以实现个人计算机平台上的自由访问,而且大部分数据免费获得等优点。为了充分利用生物信息数据库资源,提出了生物信息数据库在序列比对与电子克隆、蛋白质结构比对与预测、分子进化和比较基因组学研究、基于结构的药物设计等方面的应用策略,以及为我国学者提供免费的生物信息数据库资源,为生命科学各领域的研究构建信息平台。家畜育种学是动物科学专业的一门重要专业课,家畜育种学是高等农业院校动物科学专业重要的专业基础课,是一门从理论和方法上研究如何逐代改进家畜群体的遗传结构以不断地提高其生产性能的一门学科。家畜育种学与遗传学和畜牧生产有关的其他学科密切相关,是多学科相互渗透和彼此结合的结果 [1]。近年来,国内外的家畜育种学发展迅速,新理论、新研究成果不断涌现,新方法、新技术在生产中发挥了越来越大的作用,因此家畜育种学的内容也在不断丰富。但目前存在这门课程的教学存在诸多问题,目前本校的家畜育种学实验内容相对笔者对这些问题进行了分析并提出了教学改革的措施。

关键词：

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鹅喉羚

生物学通报 2015年第4期50卷 14-14页

作者：李晓军西北师范大学生命科学学院甘肃兰州730070

鹅喉羚（Gazella subgutturosa）生活于亚欧大陆荒漠、半荒漠地区，栖息于海拔1000～2500m的平原、丘陵等高原开阔草原地带。国内分布于新疆、青海、内蒙古西部和甘肃北部等地。为我国Ⅱ级重点保护野生动物。

关键词：鹅喉羚半荒漠地区内蒙古西部亚欧大陆野生动物海拔栖息

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体外培养蒙古羊成纤维细胞染色体组型分析

体外培养蒙古羊成纤维细胞染色体组型分析

全国畜禽遗传资源保护与利用学术研讨会

作者：马月辉关伟军梁海青于太永张海艳杨公社岳文斌中国农业科学院畜牧研究所山西农业大学动物科技学院西北农林科技大学动物科技学院洛阳师范学院生命科学系

以体外培养的蒙古羊成纤维细胞为研究材料,通过染色体核型的制备与分析得出如下研究结果:蒙古羊染色体数目为2n=54,其中二倍体染色体占86%以上,第一对为亚中央着丝粒染色体,第二、三对为中央着丝粒染色体,其它为端着丝粒染色体,性染色体... 详细信息

以体外培养的蒙古羊成纤维细胞为研究材料,通过染色体核型的制备与分析得出如下研究结果:蒙古羊染色体数目为2n=54,其中二倍体染色体占86%以上,第一对为亚中央着丝粒染色体,第二、三对为中央着丝粒染色体,其它为端着丝粒染色体,性染色体X为最大的端着丝粒染色体,Y为最小的亚中央着丝粒染色体。本试验对于探讨蒙古羊的起源与进化,基因定位、染色体的遗传多态性和纤维细胞库的鉴定具有重要意义。

关键词：蒙古羊体外培养成纤维细胞染色体分析

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老芒麦种质资源遗传多样性的SRAP分析

草业学报 2014年第1期23卷 205-216页

作者：顾晓燕郭志慧张新全周永红白史且张昌兵蒋忠荣刘新周朝杰马啸四川农业大学动物科技学院草业科学系四川雅安625014 四川农业大学小麦研究所四川成都611130 四川省草原科学研究院四川成都611731 四川省甘孜藏族自治州畜牧科学研究所四川康定626000

利用SRAP标记,对来自亚洲的84份老芒麦种质的遗传多样性和遗传关系进行了分析.23个引物组合共产生337条扩增带,其中203条为多态性带,多态性比率为60.24％.各种质间遗传相似系数的变幅为0.783～0.965,平均值为0.865.来自于青藏高原和蒙... 详细信息

利用SRAP标记,对来自亚洲的84份老芒麦种质的遗传多样性和遗传关系进行了分析.23个引物组合共产生337条扩增带,其中203条为多态性带,多态性比率为60.24％.各种质间遗传相似系数的变幅为0.783～0.965,平均值为0.865.来自于青藏高原和蒙古的种质间的平均遗传相似性（GS）值最小（0.830）,而来自于俄罗斯和蒙古的种质问的平均GS值最大（0.897）.对84份种质的聚类分析表明,供试种质可以划分成2大类,而且聚类结果与原始相似性矩阵间具有很高的吻合度（r=0.88）.同时,主向量分析（PCoA）也得到了与聚类分析类似的结果.方差分析（AMOVA）表明在总的遗传变异中有79.62％发生在地理类群内,有20.38％发生在类群间（ΦST=0.204）,类群间和类群内的变异均为极显著（P＜0.0001）.基于各地理类群间ΦsT值进行的聚类分析也表明青藏高原类群明显区别于其他地理类群.这种聚类模式可能依赖于种质地理来源赋予其的特殊生态地理适应性.本研究结果对于今后老芒麦种质的利用和品种选育提供了有益信息.

关键词：老芒麦种质资源遗传多样性 SRAP

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