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基于转录组数据的红三叶密码子使用偏好性分析

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草地学报 2024年第6期32卷 1752-1759页

作者：花梅吕丽娟穆赢通张晓明郝宁王俊杰刘媛内蒙古农业大学草原与资源环境学院内蒙古自治区中蒙药材良种育繁工程技术研究中心内蒙古呼和浩特010019 呼和浩特市林业和草原局内蒙古呼和浩特010019

研究红三叶(Trifolium pratense L.)叶片的密码子使用偏好性,可为优化密码子组成奠定基础。研究通过CodonW,R,CUSP等软件对红三叶叶片转录组中5 513条编码序列进行密码子使用模式和偏好性分析。研究发现,GC3与GC12相关性较弱,表明选择... 详细信息

研究红三叶(Trifolium pratense L.)叶片的密码子使用偏好性,可为优化密码子组成奠定基础。研究通过CodonW,R,CUSP等软件对红三叶叶片转录组中5 513条编码序列进行密码子使用模式和偏好性分析。研究发现,GC3与GC12相关性较弱,表明选择压力对其密码子偏好性的选择有一定的作用;ENC-plot分析中,大多数密码子偏好性相对较弱,表明选择压力是偏好性的主要来源,少数的基因在期望曲线两侧均衡散布,表明部分基因受突变压力的作用;密码子适应度值(Codon adaptation index, CAI)分析可知,基因表达水平对密码子偏好性产生过程具有一定影响作用,CAI为0.201,表明密码子偏好性比较弱。偏倚性分析进一步证实红三叶叶片密码子偏好性重点受突变压力的影响。最优密码子分析表明,红三叶叶片转录组序列的最优密码子更偏好以G或C结尾。结果有利于红三叶基因工程研究中密码子优化,对红三叶的系统进化研究具有重要意义。

关键词：红三叶叶片密码子偏好性转录组编码序列

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暗沟排盐对西辽河平原苏打盐碱荒地改良效果的研究

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节水灌溉 2024年第2期 112-116页

作者：胡玲玲张万锋王伟刘红霞郭富强张晶丁奋谦妥德宝内蒙古恒源水利工程有限公司呼和浩特010010 内蒙古师范大学呼和浩特010028 内蒙古农牧业生态与资源保护中心呼和浩特015199 内蒙古农业大学呼和浩特010010

为探究暗沟排盐技术对西辽河平原苏打盐碱荒地改良效果的影响,在科左中旗胜利乡盐碱荒地,通过设置暗沟并应用不同的改良措施,暗沟间距分别设置5 m(L1)、10 m(L2)和15 m(L3),以及无暗沟(CK)处理,在此基础上施入脱硫石膏30 t/hm^(2),腐殖... 详细信息

为探究暗沟排盐技术对西辽河平原苏打盐碱荒地改良效果的影响,在科左中旗胜利乡盐碱荒地,通过设置暗沟并应用不同的改良措施,暗沟间距分别设置5 m(L1)、10 m(L2)和15 m(L3),以及无暗沟(CK)处理,在此基础上施入脱硫石膏30 t/hm^(2),腐殖酸4.5 t/hm^(2)(F1)和9 t/hm^(2)(F2),共8个处理,对暗沟排盐工程结合化学改良措施对苏打盐碱荒地土壤的脱盐效果进行研究。研究结果表明,暗沟排盐技术对降低苏打盐碱荒地的土壤盐分有显著效果,0~40 cm深度土壤全盐量平均降低1.74 g/kg,暗沟间距越小,脱盐效果越显著。此外,施入腐殖酸对降低土壤盐碱度也有显著影响,平均降低了5.7%,其中间距5 m,施用量4.5 t/hm^(2)处理的降低幅度最大,达到了8.2%。从试验结果来看,暗沟间距10 m和施用4.5 t/hm^(2)腐殖酸的组合是最佳的改良效果。研究结果可为西辽河平原盐碱荒地的合理开发利用提供了理论依据。

关键词：西辽河平原苏打盐碱荒地碱化度全盐量土壤改良

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高加索三叶草与白三叶杂种F_(1)代表型遗传变异研究

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中国草地学报 2024年第8期46卷 37-44页

作者：刘嘉伟郝新艳杜雨芊提忠慧王明玖内蒙古农业大学草原与资源环境学院内蒙古呼和浩特010011 内蒙古自治区农牧业科学院内蒙古呼和浩特010031 土默特左旗现代农业示范区工作服务中心内蒙古呼和浩特010100

对高加索三叶草(♀)、白三叶(♂)及其远缘杂交育成的8个F_(1)代株系的13个数量性状和7个质量性状进行调查,研究杂交F_(1)代表型的相对遗传力与杂种优势。结果表明:13个数量性状表型遗传多样性丰富,11个性状的变异系数超过10%;7个质量性... 详细信息

对高加索三叶草(♀)、白三叶(♂)及其远缘杂交育成的8个F_(1)代株系的13个数量性状和7个质量性状进行调查,研究杂交F_(1)代表型的相对遗传力与杂种优势。结果表明:13个数量性状表型遗传多样性丰富,11个性状的变异系数超过10%;7个质量性状遗传多样性指数较低;F_(1)代表型遗传多为正向显性,相对遗传力a1最高可达1.92,母本对F_(1)代的相对遗传力较父本高;F_(1)代杂种优势最明显的是小花数与结实小花数,杂种优势率达65.03%和80.96%;聚类分析表明,8个F_(1)代与高加索三叶草距离较近,与白三叶距离较远。

关键词：高加索三叶草白三叶 F_(1)代表型性状遗传变异相对遗传力

2022-2023年内蒙古自治区羊种布鲁氏菌多位点序列分型与体外抗生素敏感性试验

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疾病监测 2024年第6期39卷 761-765页

作者：左柯铭塔娜高静关娜刘晓婷李鹏白雪晶温永俊内蒙古农业大学内蒙古呼和浩特010010 内蒙古自治区综合疾病预防控制中心内蒙古呼和浩特010031 包头医学院内蒙古包头014040

目的通过生化鉴定与分子生物型分型鉴定临床分离得到的布鲁氏菌,并测定羊种布鲁氏菌分离株对常见抗生素的体外敏感性。方法对29株2022—2023年内蒙古自治区(内蒙古)收集到的羊种布鲁氏菌进行生化鉴定、牛种羊种猪种犬种(AMOS)多重荧光... 详细信息

目的通过生化鉴定与分子生物型分型鉴定临床分离得到的布鲁氏菌,并测定羊种布鲁氏菌分离株对常见抗生素的体外敏感性。方法对29株2022—2023年内蒙古自治区(内蒙古)收集到的羊种布鲁氏菌进行生化鉴定、牛种羊种猪种犬种(AMOS)多重荧光定量聚合酶链式反应(PCR)、多位点序列分型(MLST),并选择了阿奇霉素、多西环素、利福平、环丙沙星、左氧氟沙星、链霉素、庆大霉素、头孢曲松共8种抗生素使用E-test药敏试纸条测定各菌株对抗生素的最小抑菌浓度(MIC)。结果AMOS多重荧光定量PCR与生化鉴定结果得到羊种1型9株、羊种2型6株、羊种3型14株,ST分型结果为MLST 8型28株、ST 12型1株。全部菌株对多西环素、链霉素、环丙沙星、左氧氟沙星、庆大霉素均敏感;20.68%的菌株对头孢曲松耐药;6.89%的菌株对利福平耐药;100.00%的菌株对阿奇霉素耐药,且MIC范围较其他地区显著增加,这种耐药性可能与地理分布或时间因素有关。结论利福平作为治疗布病的一线药物,耐药菌株的出现提示,应加强对利福平耐药性的监测工作,链霉素、环丙沙星、左氧氟沙星、庆大霉素均可能作为利福平耐药布病患者治疗的候选药物。

关键词：布鲁氏菌生化鉴定多位点序列分型最小抑菌浓度

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豆科牧草嫩枝扦插影响因素相关研究进展

中国草地学报 2024年第4期46卷 132-143页

作者：陆婕王俊杰内蒙古农业大学草原与资源环境学院内蒙古呼和浩特010011 内蒙古自治区中蒙药材良种育繁工程技术研究中心内蒙古呼和浩特010011

豆科牧草在畜牧生产中具有极高的经济价值,在我国境内分布范围极广。在豆科牧草的栽培中,扦插繁殖是一种广泛使用的手段,主要包括硬枝扦插和嫩枝扦插两种繁殖方法。但豆科牧草种类繁多,扦插繁殖技术各有不同。目前,豆科牧草嫩枝扦插领... 详细信息

豆科牧草在畜牧生产中具有极高的经济价值,在我国境内分布范围极广。在豆科牧草的栽培中,扦插繁殖是一种广泛使用的手段,主要包括硬枝扦插和嫩枝扦插两种繁殖方法。但豆科牧草种类繁多,扦插繁殖技术各有不同。目前,豆科牧草嫩枝扦插领域的繁殖技术研究仍面临一定的困难和限制。本研究在前人研究成果的基础上,通过对不同规格插条的选择、不同植物生长调节剂的筛选以及植物对生长环境因子的响应分析,总结了目前关于豆科嫩枝扦插繁殖技术的研究进展,为进一步开展相关领域的研究提供参考。

关键词：豆科牧草嫩枝扦插繁殖技术

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假小链双歧杆菌比较基因组学分析

食品与发酵工业 2024年第14期50卷 142-150,I0004,I0005页

作者：路镜达杨瑞钟罡弓艳春周钧鸿张艺馨徐维那钟智内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区农牧业技术推广中心内蒙古呼和浩特010010

该研究对分离自中国、日本和美国的104株假小链双歧杆菌进行比较基因组学分析。结果表明,在基因组特征上,日本分离株的编码序列数量显著高于中国和美国分离株(P<0.01)。基于核心基因构建的系统发育树和平均核苷酸一致性聚类热图发现分... 详细信息

该研究对分离自中国、日本和美国的104株假小链双歧杆菌进行比较基因组学分析。结果表明,在基因组特征上,日本分离株的编码序列数量显著高于中国和美国分离株(P<0.01)。基于核心基因构建的系统发育树和平均核苷酸一致性聚类热图发现分离自相同国家的菌株更相似。功能基因注释结果进一步表明分离地会影响菌株的功能基因分布,碳水化合物活性酶注释结果显示15个碳水化合物活性酶存在地域性差异;经耐药基因和毒力因子数据库注释发现中国分离株携带的耐药基因和黏附型毒力因子的数量显著高于日本分离株;中国和日本分离株携带复制、重组和修复及噬菌体相关可移动遗传元件数量均与美国分离株存在差异。该研究发现分离地会影响假小链双歧杆菌的功能基因,不同分离地假小链双歧杆菌存在差异功能基因。研究结果可为解析假小链双歧杆菌的功能差异提供理论依据。

关键词：假小链双歧杆菌比较基因组学碳水化合物活性酶耐药基因毒力因子

精准变量全幅式物料施撒装置的设计与仿真分析

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农机化研究 2024年第6期46卷 96-102,108页

作者：李明庞永强董帅燕洁华叶汪忠内蒙古农业大学能源与交通工程学院呼和浩特010018

为进一步解决风沙土改良作业机械化率低的问题,提高改土材料机械化铺施效率,提出了一种精准可控变量的固体物料施撒方案,设计了一种精准变量全幅式物料施撒装置。通过对物料施撒过程的受力和运动分析,以物料颗粒为研究对象,建立其在幅... 详细信息

为进一步解决风沙土改良作业机械化率低的问题,提高改土材料机械化铺施效率,提出了一种精准可控变量的固体物料施撒方案,设计了一种精准变量全幅式物料施撒装置。通过对物料施撒过程的受力和运动分析,以物料颗粒为研究对象,建立其在幅板上运动的动力学模型。基于离散元法对物料施撒过程进行仿真试验研究,建立试验因素与试验指标之间的二次回归模型,并进行单因素影响分析、方差分析及目标参数优化。结果表明:各因素对分布变异系数影响大小的先后顺序分别为调量板、排肥轮轴转速、幅板个数;经过中心组合响应曲面试验设计进行参数优化可知:当幅板个数为7、调量板位置为0mm、排肥轮轴转速为40r/min时,分布变异系数最小为7.36%,铺料最均匀,厚度最大,满足施撒作业的要求。研究结果可为风沙土改良机械及农业固体施肥机械设计提供参考。

关键词：物料施撒装置均匀性精准变量离散元法施撒性能

播量对缩行带状滴灌燕麦抗倒伏能力和产量的影响

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作物学报 2024年

作者：杨志雪刘景辉米俊珍孙婧赵宝平任长忠田露郑成忠内蒙古农业大学农学院内蒙古高校燕麦工程研究中心/内蒙古自治区燕麦工程实验室/内蒙古农业大学杂粮产业协同创新中心白城市农业科学院内蒙古自治区农牧业科学院乌兰察布市农林科学研究所

为明确缩行带状滴灌下播量对燕麦抗倒伏能力和产量的影响，于2022—2023年以抗倒伏品种“坝莜1号”和易倒伏品种“燕科2号”为试验材料，分别设90 kg hm-2（S1）、120 kg hm-2（S2）、150 kg hm-2（S3）、180 kg hm-2（S4）和210 kg hm-... 详细信息

为明确缩行带状滴灌下播量对燕麦抗倒伏能力和产量的影响，于2022—2023年以抗倒伏品种“坝莜1号”和易倒伏品种“燕科2号”为试验材料，分别设90 kg hm-2（S1）、120 kg hm-2（S2）、150 kg hm-2（S3）、180 kg hm-2（S4）和210 kg hm-2（S5） 5个播量，研究其对燕麦茎秆基部理化特性、抗倒伏能力、产量及构成因素的影响。结果表明，燕麦株高和重心高度随播量增加呈先升高后降低趋势，“坝莜1号”在S3处理下最高，较其他处理株分别增加了2.63%～13.36%和1.49%～12.30%；“燕科2号”在S2处理下最高，较其他处理分别增加了2.52%～15.20%、4.67%～21.21%。两燕麦茎秆基部第二节间长随播量增加而增加，S1较其他处理降低了10.86%～96.39%，第二节间粗、干重、充实度及抗折力随播量增加而减小，S1较其他处理分别增加了1.76%～32.81%、9.08%～125.89%、26.88%～292.64%、6.48%～129.70%。随着播量的增加，燕麦茎秆基部纤维素、可溶性糖、C/N、钾、硅含量逐渐降低，氮含量相反。与其他处理相比较，S1处理各化学组分含量分别增加了5.81%～74.10%、1.62%～24.34%、4.78%～55.41%、1.90%～107.78%、2.00%～17.37%，氮含量降低了2.95%～22.66%。倒伏率和倒伏级别在不同年份和品种间表现不同：2022年坝莜1号和燕科2号分别在S4～S5和S3～S5播量下发生倒伏，2023年两燕麦均发生倒伏，且倒伏率和倒伏分级随播量增加而增加。穗粒数和千粒重随播量增加而降低，但籽粒产量呈先升高后降低趋势，“坝莜1号”和“燕科2号”分别在150 kg hm-2和120 kg hm-2下籽粒产量最高。相关性分析表明，燕麦茎秆基部节间形态特征和化学组分含量显著影响茎秆基部抗折力，从而影响田间倒伏率和级别，可作为评价燕麦抗倒伏能力的关键指标。综合考虑抗倒伏能力与籽粒产量，坝莜1号最佳播量为150 kg hm-2，燕科2号最佳播量为120 kg hm-2。

关键词：茎秆基部形态茎秆基部化学组分含量抗折力倒伏率产量

不同品种马铃薯幼苗对NaHCO_(3)胁迫的响应及耐碱能力指标筛选

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植物营养与肥料学报 2024年第4期30卷 745-756页

作者：逯春杏刘玉龙吴娟苑志强胡戎朔张胜王晓娇曹春梅张必周逯海林内蒙古农业大学内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区农牧业科学院内蒙古呼和浩特010030 扎赉特旗农牧和科技局内蒙古兴安盟扎赉特旗137600 呼伦贝尔市农牧技术推广中心内蒙古呼伦贝尔021008 商都县科学技术事业发展中心内蒙古乌兰察布商都县013450

[目的]探究不同马铃薯品种对NaHCO_(3)胁迫的响应机制,为选育耐碱性较强的马铃薯品种提供理论依据。[方法]以V_(7)、后旗红、克新1号、兴佳2号、荷兰15号、康尼贝克6个品种马铃薯为研究对象,以1/2霍格兰(Hoagland)营养液为母液进行了水... 详细信息

[目的]探究不同马铃薯品种对NaHCO_(3)胁迫的响应机制,为选育耐碱性较强的马铃薯品种提供理论依据。[方法]以V_(7)、后旗红、克新1号、兴佳2号、荷兰15号、康尼贝克6个品种马铃薯为研究对象,以1/2霍格兰(Hoagland)营养液为母液进行了水培试验。营养液设置6个NaHCO_(3)浓度,分别为0、10、20、30、40、50 mmol/L,选择出苗后7天的马铃薯幼苗,缓苗3天后进行碱胁迫处理。胁迫处理7天后,调查马铃薯幼苗株高、茎粗、主根长,分析叶片含氮量和叶绿素相对含量,分析根系脯氨酸含量、过氧化物酶(POD)活性、过氧化物歧化酶(SOD)活性以及过氧化氢酶(CAT)活性等11项生理指标。[结果]随着碱胁迫浓度的增加,各品种马铃薯幼苗生长受到不同程度的影响,在碱浓度30、40、50 mmol/L胁迫处理下,V_(7)根长较0 mmol/L处理分别增加了54.37%、46.04%、25.58%,其余5个品种根长均显著低于0 mmol/L。50 mmol/L胁迫处理下,各品种株高、茎粗均显著低于碱浓度0 mmol/L处理。各品种叶片含氮量、叶绿素相对含量随胁迫浓度增加呈现不同的变化趋势,V_(7)、后旗红、克新1号叶片含氮量均在40 mmol/L处理下达到峰值,兴佳2号叶绿素相对含量在50mmol/L处理下达到峰值,而荷兰15号、康尼贝克叶片含氮量、叶绿素相对含量均在50mmol/L处理达到最小值。各品种幼苗根系活力呈先增后降的趋势,碱浓度40 mmol/L胁迫处理下,V_(7)、后旗红根系活力显著高于0mmol/L,而荷兰15号的降幅达80%以上。各品种幼苗根系中丙二醛含量随胁迫程度加剧而增加,但V_(7)的丙二醛含量始终低于其他品种。各品种幼苗根系CAT活性、SOD活性均呈先升后降变化趋势,其中V_(7)、后旗红、克新1号、兴佳2号的CAT活性、SOD活性高于康尼贝克和荷兰15号。利用主成分分析计算得到5个特征值>1的归一化指标,其对碱胁迫抗性的累积贡献率达80.07%,符合主成分分析要求,因此将11个指标转化为7项生理指标,包括:株高、茎粗、叶片含氮量、叶绿素相对含量、脯氨酸含量、POD活性、CAT活性。[结论]株高、茎粗、叶片含氮量、叶绿素相对含量、脯氨酸含量、POD活性、CAT活性这7项生理指标可作为马铃薯耐碱性能力强弱的评价指标。综合各项指标筛选出耐碱能力较强的品种为V_(7),后旗红、克新1号、兴佳2号耐碱能力中等,康尼贝克与荷兰15号耐碱性较弱。

关键词：马铃薯 NaHCO_(3)胁迫耐碱性耐碱能力指标