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新冠肺炎疫情背景下案例教学和PBL相融合的畜牧微生物学课程思政教学设计

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畜牧兽医杂志 2024年第2期43卷 94-98页

作者：张雪莲廖洁丹陆英杰邵建伟佛山科学技术学院生命科学与工程学院广东佛山528225

在畜牧微生物学课程融入思政元素有助于建立动物科学专业学生正确的思想道德体系和坚定的理想信念。问题导向式学习(Problem-Based Learning,PBL)的教学方法是畜牧微生物学课程思政教学设计的重要手段,以鲜活的人物事迹和历史事件为案例... 详细信息

在畜牧微生物学课程融入思政元素有助于建立动物科学专业学生正确的思想道德体系和坚定的理想信念。问题导向式学习(Problem-Based Learning,PBL)的教学方法是畜牧微生物学课程思政教学设计的重要手段,以鲜活的人物事迹和历史事件为案例,通过提出问题,启发学生理解其中的思政内涵,进一步提高其思想道德品质。在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情背景下,如何将其中蕴含的思政元素与课程教学有效的融合,应纳入畜牧微生物学课程思政教学的任务中,本文就此进行了深入探讨。基于新冠疫情中涌现出的人物、事迹和相关事件,经启发式发问引导学生进行思考讨论,有效提高学生的课堂参与度,结合专业知识的学习和讲解,使学生认识到“新冠疫情”案例中的思想道德意义,进而内化成自身的理想信念,让学生努力探索科学真谛的同时,培养自身的家国情怀以及对所学专业的高度认同感的目的。

关键词：畜牧微生物学课程思政问题导向式学习教学法

利用项目式教学提升硕士研究生生物信息学教育质量:方法、案例与反思

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科教导刊（电子版） 2024年第9期 48-50页

作者：邓飞龙柴建民李英佛山科学技术学院生命科学与工程学院广东佛山 528225

在生物信息学教育中,项目式教学法因其能够显著提升学生的实践能力和创新思维而受到广泛关注.该研究旨在探讨利用项目式教学提升硕士研究生生物信息学教育质量的有效方法.通过设计与实施针对性的项目任务,该研究分析了项目式教学在促进... 详细信息

在生物信息学教育中,项目式教学法因其能够显著提升学生的实践能力和创新思维而受到广泛关注.该研究旨在探讨利用项目式教学提升硕士研究生生物信息学教育质量的有效方法.通过设计与实施针对性的项目任务,该研究分析了项目式教学在促进学生深度学习、增强实践技能及创新能力方面的作用,并通过具体案例,评估了教学效果并进行了反思.结果表明,项目式教学能够有效提高学生对生物信息学核心概念的理解,增强他们的数据分析能力,并激发对科研的兴趣.该研究为生物信息学教育模式的创新提供了有价值的见解.

关键词：生物信息学项目式教学教育质量提升案例分析教育创新

来源：博看期刊评论

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电化学酰胺化反应中间体的原位质谱分析

质谱学报 2024年第1期45卷 131-140,I0004页

作者：羊雪惠人杰胡军江南大学生命科学与健康工程学院江苏无锡214200

酰胺键是一种广泛存在的重要化学键,既是构建蛋白质和多肽的核心,也是多种药物分子的活性中心。近年来,基于电化学的酰胺化反应以高选择性、环境友好等优势受到广泛关注,然而,受限于反应过程的复杂性以及缺乏适当的分析技术,其原位监测... 详细信息

酰胺键是一种广泛存在的重要化学键,既是构建蛋白质和多肽的核心,也是多种药物分子的活性中心。近年来,基于电化学的酰胺化反应以高选择性、环境友好等优势受到广泛关注,然而,受限于反应过程的复杂性以及缺乏适当的分析技术,其原位监测和机理研究却鲜有报道。本研究通过在纳升电喷雾喷针尖端集成金属工作电极的方式构建了一种新型耦合接口,实现了电化学与质谱的在线联用。基于该技术原位监测了以三苯基膦为缩合剂的芳伯胺酰胺化反应过程,并实现了其中多种关键中间体,特别是一些短寿命自由基中间体的鉴定。该电化学-质谱耦合接口具有延迟低、样品耗量小、制备简单等优点,有望成为电有机合成反应快速筛选和机理研究的重要工具。

关键词：酰胺化反应自由基中间体原位质谱三苯基膦

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基于北方苍鹰优化核极限学习机的玉米品种鉴别研究

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光谱学与光谱分析 2024年第6期44卷 1584-1590页

作者：倪金索丽敏刘海龙赵蕊黑龙江八一农垦大学信息与电气工程学院黑龙江大庆163319 黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院黑龙江大庆163319

玉米作为我国种植最为广泛的农作物,其产量对于我国粮食安全具有重大意义,由于不同品种具有不同的特性,根据种植条件科学选种能够很大限度上提高产量并且降低生产成本,但不同玉米种子外观极其相似,导致科学选种工作产生了一定难度。该... 详细信息

玉米作为我国种植最为广泛的农作物,其产量对于我国粮食安全具有重大意义,由于不同品种具有不同的特性,根据种植条件科学选种能够很大限度上提高产量并且降低生产成本,但不同玉米种子外观极其相似,导致科学选种工作产生了一定难度。该研究基于近红外光谱技术结合核极限学习机(KELM)针对玉米品种分类问题构建鉴别模型,利用甜糯黄玉米、甜妃、昌甜、金色超人、香甜5号五种玉米种子,每种取(13±0.5)g作为一份样品,共计126个样品作为研究对象,对采集的近红外光谱数据进行标准正态变量变换(SNV)处理后采用竞争性自适应重加权采样法(CARS)对数据集进行降维。按照5∶1的比例将样本随机分为训练集和测试集,探讨北方苍鹰优化算法(NGO)对KELM模型性能的影响。分别使用NGO算法、粒子群算法(PSO)和灰狼算法(GWO)对KELM模型的两个重要参正则化参数C和高斯核函数γ进行寻优,选择五折交叉验证识别准确率最高时对应的C和γ作为建模参数,建立KELM分类模型。将各算法寻优后建立的KELM模型性能进行对比。实验发现,通过NGO算法寻优后建立的KELM模型性能高于其他两种算法优化的KELM模型,测试集识别准确率可达100%。在CARS降维的基础上分别建立CARS-NGO-KELM、CARS-PSO-KELM和CARS-GWO-KELM模型,结果表明,在面对降维后的数据时NGO算法仍能表现较好的性能,其测试集准确率和F 1值均达到了100%。为了验证样本数量对模型的影响,使用各品种样品数量同步后的共计90个样品重新训练KELM模型。结果表明,在同步各类样品数量后,各个模型在训练集和测试集上的表现均有提升。该研究在近红外光谱的基础上引入多种优化算法构建核极限学习机模型并将识别准确率提升至100%,实现了对玉米种子快速、无损、准确的品种鉴别,研究结果为玉米品种快速鉴别提供了一种新方法,同时也对监管部门具有一定的指导意义。

关键词：近红外光谱玉米北方苍鹰竞争性自适应加权采样核极限学习机

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拟南芥细胞膜质子泵对硝酸盐吸收利用的影响

植物营养与肥料学报 2024年第4期30卷 666-676页

作者：潘婷张雅琳周博阳成元喻敏张茂星朱毅勇国际膜生物学与环境研究中心/佛山科学技术学院食品科学与工程学院广东佛山528200 南京农业大学资源与环境科学院江苏南京210095

[目的]硝态氮(NO_(3)^(-)-N)是多数植物吸收利用的主要氮素形态之一,NO_(3)^(-)-N的跨膜运输需要耦合质子共转运,质子运转需要细胞膜上的质子泵提供质子驱动力。本研究通过分析拟南芥细胞膜质子泵AHA1和AHA2对硝态氮吸收的信号网络,以... 详细信息

[目的]硝态氮(NO_(3)^(-)-N)是多数植物吸收利用的主要氮素形态之一,NO_(3)^(-)-N的跨膜运输需要耦合质子共转运,质子运转需要细胞膜上的质子泵提供质子驱动力。本研究通过分析拟南芥细胞膜质子泵AHA1和AHA2对硝态氮吸收的信号网络,以明确硝态氮吸收过程中的分子调控机制。[方法]以野生型Col-0、质子泵基因突变体aha1-9、aha2-5以及恢复系AHA1/aha1-9、AHA2/aha2-5为试验材料,在不同NO_(3)^(-)-N浓度(1、10和20mmol/L)培养基上培养10天,观察其表型,记录根系生长以及生物量变化,测定根系细胞膜质子泵蛋白及其磷酸化水平变化,检测根系中参与NO_(3)^(-)-N响应与转运相关基因(NRT1.1、NRT2.1、NRT2.2、NRT2.4和NLP7)和生长素响应与转运相关基因(ARF11、IAA6、PIN7和SAUR57)的相对表达量。[结果]20 mmol/L NO_(3)^(-)-N处理下各材料之间的生长无显著差异。在1和10 mmol/L NO_(3)^(-)-N条件下,与野生型相比,aha1-9和aha2-5的主根长度、侧根数量、根部和地上部生物量均显著降低。1 mmol/L NO_(3)^(-)-N时,aha1-9的上述指标与野生型的差异显著大于aha2-5。恢复系AHA1/aha1-9、AHA2/aha2-5在各个NO_(3)^(-)-N供应水平下均与野生型差异不显著。通过分离根系细胞膜发现,在1、10 mmol/L NO_(3)^(-)-N条件下,相比野生型,aha1-9和aha2-5的细胞膜质子泵蛋白水平分别降低了68%、19%和36%、53%,质子泵蛋白磷酸化水平分别降低了83%、43%和16%、42%;在20 mmol/L NO_(3)^(-)-N条件下,aha1-9和aha2-5的质子泵蛋白水平与野生型差异不显著,但磷酸化水平显著降低。通过RT-qPCR测定发现,在1 mmol/L NO_(3)^(-)-N条件下,aha1-9、aha2-5根系中的NRT1.1、NRT2.1、NRT2.2、NLP7表达量相比野生型显著下调,10和20 mmol/L NO_(3)^(-)-N条件下均没有显著差异。此外,在1和10 mmol/L NO_(3)^(-)-N条件下aha1-9、aha2-5中的ARF11、IAA6、PIN7和SAUR57表达量显著上调,然而在20 mmol/L NO_(3)^(-)-N条件下其表达量没有显著差异。[结论]低氮条件下,敲除细胞膜质子泵基因不仅降低其自身蛋白的合成和磷酸化水平,同时也影响硝酸盐转运蛋白基因和生长素相关基因的表达,进而抑制植物的生长。

关键词：拟南芥硝酸盐细胞膜质子泵 AHA1 AHA2

山东某规模化鸡场鸡毒支原体的分离鉴定、基因分型、耐药性和致病性分析

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微生物学通报 2024年

作者：周峰王晨燕侯博郭锦玥福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心佛山科学技术学院生命科学与工程学院

【背景】鸡毒支原体(Mycoplasma galliscepticum， MG)主要引起家禽慢性呼吸道疾病，不同地区MG菌株的耐药性和致病性差异大，给临床防控增加了难度。【目的】明确山东省烟台市某规模化鸡场MG分离株基因分型、耐药情况及致病力，为该地... 详细信息

【背景】鸡毒支原体(Mycoplasma galliscepticum， MG)主要引起家禽慢性呼吸道疾病，不同地区MG菌株的耐药性和致病性差异大，给临床防控增加了难度。【目的】明确山东省烟台市某规模化鸡场MG分离株基因分型、耐药情况及致病力，为该地区MG防控提供科学依据。【方法】本研究从MG阳性鸡群上腭裂拭子分离、纯化获得MG分离株，利用atpG、plsC、mraW、ugpA、DUF3196、lgT和dppC共7个管家基因进行多位点序列分型(multilocus sequence typing，MLST)，并构建系统发育树。测定分离株对金霉素、大观霉素、林可霉素、泰乐菌素、泰万菌素、泰妙菌素、沃尼妙林和多西环素的最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration， MIC)，并对相关耐药基因23S rRNA基因V结构域、L4及L22蛋白基因测序并分析。通过点眼攻毒和气管攻毒两种方式感染28日龄SPF鸡，评价感染10、20和30 d后气囊炎的发病率、气管组织MG载量和病理损伤。【结果】分离纯化9株MG，其中菌株YTX2、YTX5.6、YTX11、YTX12、YTX13、YTX14和YTX15的管家基因plsC和mraW首次发现新的等位基因，ID号分别为33和31，这7株MG分离株属于ST97型，而菌株YTX9和YTX10属于ST16型。所有MG分离株对沃尼妙林和泰妙菌素敏感(MIC≤0.25 μg/mL)，对泰万菌素和多西环素次之(MIC≤4 μg/mL)，对金霉素和林可霉素有一定程度耐药(MIC≥16 μg/mL)；属于ST97的7个MG分离株对泰乐菌素存在中等程度耐药(MIC：4-8 μg/mL)；选取菌株YTX5.6、YTX2和YTX10对耐药性相关的23S rRNA基因V结构域、L4和L22蛋白基因测序分析，菌株YTX5.6和YTX2在23S rRNA基因V结构域发生A2069G突变；菌株YTX5.6和YTX2的L4蛋白基因出现G568T突变，在L22蛋白基因上出现T102C、T129C、T252C、C336T和G404A突变；对泰万菌素、泰乐菌素、泰妙菌素、沃尼妙林和多西环素敏感的YTX10株与对照菌株MG Rlow株序列一致，未发生突变。在感染后10、20和30 d，菌株YTX5.6气管攻毒组气囊炎发病率分别为80%、60%和80%；菌株YTX10气管攻毒组仅在感染后20 d和30 d出现气囊炎，发病率分别为40%和20%，其余组在整个实验过程中均未发现明显气囊炎。气管攻毒组的鸡在整个感染过程中气管黏膜增厚情况均比点眼攻毒组严重(P<0.05)，菌株YTX5.6气管攻毒组在感染后第20天气管黏膜增厚最严重，平均厚度为300.6 μm。菌株YTX5.6和YTX10气管攻毒方式在感染后10、20和30 d，气管中的MG载量均比菌株YTX5.6和YTX10点眼攻毒方式高。【结论】本研究从山东烟台某规模化鸡群共分离9株MG菌株，分别属于ST97和ST16基因型，分离株对目前常用抗生素存在不同程度的耐药性，动物感染试验表明不同基因型菌株存在不同致病力。

关键词：鸡毒支原体耐药性多位点序列分型 MIC测定致病性

gga-miR-17-5p在鸡骨骼肌和脂肪沉积相关组织及细胞中的表达差异及其关键靶基因的筛选

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中国农业大学学报 2024年第7期29卷 23-33页

作者：杨苗苗向海李瑞瑞赵振华王钱保黄正洋李春苗梁忠吴兆林黄华云江苏省家禽科学研究所江苏扬州225125 佛山科学技术学院生命科学与工程学院/广东省动物分子设计与精准育种重点实验室广东佛山528225

为探究gga-miR-17-5p在鸡脂肪沉积和肌肉发育中的作用,本研究以矮小品系S3(DW)和隐性白羽鸡(RR)为试验素材,分析gga-miR-17-5p在不同时期腿肌、肝脏、腹脂组织及细胞中的表达差异,并通过KEGG及蛋白互作分析筛选关键靶基因。结果表明:1)g... 详细信息

为探究gga-miR-17-5p在鸡脂肪沉积和肌肉发育中的作用,本研究以矮小品系S3(DW)和隐性白羽鸡(RR)为试验素材,分析gga-miR-17-5p在不同时期腿肌、肝脏、腹脂组织及细胞中的表达差异,并通过KEGG及蛋白互作分析筛选关键靶基因。结果表明:1)gga-miR-17-5p在腹脂、肝脏和腿肌组织中均可表达。在腹脂中,gga-miR-17-5p在0周表达有品种差异(P<0.05),且2个品种在0周时显著高于其他周龄(P<0.05);在肝脏中,gga-miR-17-5p在16周有品种差异(P<0.05),S3系在16周显著高于其他周龄(P<0.05),隐性白羽肉鸡在16周显著高于0周和8周(P<0.05);在腿肌中,gga-miR-17-5p在0周有品种差异(P<0.05),S3系在0周和2周显著于其它周龄(P<0.05),隐性白羽肉鸡在0周显著高于其他周龄(P<0.05)。2)在脂肪细胞中,gga-miR-17-5p在肌内脂肪细胞诱导分化6 d后的表达显著高于增殖期和分化1 d(P<0.05);腹脂细胞分化1 d的表达最低,显著低于增殖期、分化4 d和分化6 d(P<0.05)。3)在成肌细胞中,gga-miR-17-5p的表达量随分化时间的延长而升高,且分化6 d的表达显著高于增殖期(P<0.05)。4)KEGG及蛋白互作分析表明,PTEN、MAPK3、PIK3R1、BECN1和PLCB4是gga-miR-17-5p重要的靶基因。RT-qPCR结果表明,PTEN和PIK3R1在成肌细胞增殖期的表达显著高于分化期(P<0.05)。综上,gga-miR-17-5p的表达存在显著的品种和组织差异性,miR-17-5p很可能通过PTEN、MAPK3、PIK3R1、BECN1和PLCB4来影响肌肉发育和脂肪沉积,其中PTEN和PIK3R1尤为关键。本研究为深入研究gga-miR-17-5p的功能和机制提供了坚实的理论基础和数据支撑。

关键词：鸡 gga-miR-17-5p 脂肪沉积肌肉发育

基于杜洛克猪全基因组重测序的InDel分析及重要经济性状基因定位

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基因组学与应用生物学 2024年第6期43卷 1010-1027页

作者：何健郑伟杰孙艳梅张瑞琪王素青马亮亮袁仁强赵云翔郭金彪佛山科学技术学院生命科学与工程学院佛山528225 广西大学动物科学技术学院南宁530004 广西扬翔股份有限公司贵港537000 中国农业大学动物科学技术学院北京100083 辽宁省农业发展服务中心沈阳110000

本研究利用选择信号分析方法在美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪中筛选与重要经济性状相关的候选基因。选取健康状态良好、饲养管理水平一致的成年美系杜洛克公猪33头、丹系杜洛克公猪11头,提取DNA并重测序,利用F_(st)&P_(i)的联合分析,保留... 详细信息

本研究利用选择信号分析方法在美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪中筛选与重要经济性状相关的候选基因。选取健康状态良好、饲养管理水平一致的成年美系杜洛克公猪33头、丹系杜洛克公猪11头,提取DNA并重测序,利用F_(st)&P_(i)的联合分析,保留候选区域,对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,进一步筛选与重要经济性状相关的相关候选基因。美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪的全基因组重测序平均测序深度在13×以上,测序数据平均效率为99.82%,Q30平均值分别为91.91%、91.93%,G+C含量分别在42.90%~43.83%和42.48%~43.55%,均表明本次测序数据质量较高。以5%为筛选阈值,关联F_(st)&P_(i)提取相关候选区域,采用选择性消除方法检测到相应的选择信号区域,美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪之间的F_(st)值为0.268,θ_(π)比值分别为0.495和-1.415,P_(i)值分别为4.206和3.506。在美系杜洛克猪的选择性消除分析中有557个受选择区域,注释到1323个基因;丹系杜洛克猪的选择性消除分析中有207个受选择区域,注释到338个基因。GO分析和KEGG通路富集分析发现,在美系和丹系杜洛克群体中初步筛选到ERLIN2、TMCO2、PITX2、SORCS3和SUFU等5个与精子发生、脂肪形成、生殖功能等性状相关的候选基因。在美系杜洛克猪中筛选到ATP1B1、LAMA4、EP300、ELOVL3、ECHS1、THEME5、PIP5K1A、PPT1、UBQLN1、IL2、CNTFR、ITGA10、SEC24D、MAP3K5和HSP90B1等15个与肉质、脂肪合成与代谢、精子发生、生长发育、骨发生和饲料效率等性状相关的候选基因。在丹系杜洛克猪中筛选到PDIA3、CBLIN2、CYCS和CDH7等4个候选基因,分别与产奶量、肉质性状、骨骼肌、饲料效率相关;BMI1、LHX8、ELL3、CATSPER2和CSMD1等5个与繁殖性状相关的候选基因。本研究发现美系杜洛克猪群体和丹系杜洛克猪群体间存在较大的遗传分化,为进一步研究杜洛克公猪的遗传特性提供了基因组数据支撑。

关键词：选择信号分析方法杜洛克猪全基因组重测序重要经济性状候选基因

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凝固型脱皮亚麻籽仁发酵乳的研制及贮藏稳定性研究

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食品与发酵工业 2024年第14期50卷 111-119,I0001,I0002页

作者：梅琴琴董思远范文静黄剑波黄桂东钟先锋佛山科学技术学院食品科学与工程学院广东佛山528000 广东产品质量监督检验研究院广东佛山528000

该研究以脱皮亚麻籽仁原浆和全脂牛奶为主要原料,通过单因素试验和响应面法对脱皮亚麻籽仁发酵乳的发酵工艺进行优化,并对其贮藏稳定性进行研究。结果表明,凝固型脱皮亚麻籽仁发酵乳最佳制备工艺条件为:脱皮亚麻籽仁原浆与全脂牛奶的体... 详细信息

该研究以脱皮亚麻籽仁原浆和全脂牛奶为主要原料,通过单因素试验和响应面法对脱皮亚麻籽仁发酵乳的发酵工艺进行优化,并对其贮藏稳定性进行研究。结果表明,凝固型脱皮亚麻籽仁发酵乳最佳制备工艺条件为:脱皮亚麻籽仁原浆与全脂牛奶的体积比3∶7、蔗糖添加量74 g/L、发酵剂添加量2.3 g/L、β-环糊精添加量2.0 g/L、发酵温度42℃、发酵时间8 h。另外在此优化条件下,贮藏21 d后发酵乳的可滴定酸度为84°T、pH 4.3、持水力为84.03%、活菌数为2.44×10^(8)CFU/g,硬度为1.07 N、弹性为0.63 mm、咀嚼性为0.45 N、黏性为0.71 N、内聚性为0.66。其凝固型发酵乳色泽乳白、质地均匀一致、无乳清析出,具有亚麻籽的香气且稳定性良好,所得结果为植物基发酵乳的发酵工艺及贮藏特性评价提供研究思路和数据参考。

关键词：脱皮亚麻籽仁牛奶发酵乳质构特性贮藏稳定性