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引起2017年兰州市一起疱疹性咽峡炎暴发疫情的CV-A2的基因特征分析

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病毒学报 2024年第3期40卷 574-579页

作者：陈建华于德山武海卓赵哲赵晓虹张勇张晓曙甘肃省疾病预防控制中心甘肃省传染病病原学重点实验室兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206

为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)暴发疫情的致病病原体及其病原学特征,对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养,然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列,根据分子定型的方法... 详细信息

为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)暴发疫情的致病病原体及其病原学特征,对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养,然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列,根据分子定型的方法进行肠道病毒型别鉴定。根据VP1区核苷酸差异选择3个毒株进行二代测序,获取全基因组序列。使用MEGA软件(版本号11.0)进行病毒的核苷酸,氨基酸相似性分析,VP1区的氨基酸突变位点分析,并构建系统发育树,使用Simplot(版本号3.5.1)软件进行病毒重组分析。本次疫情中分离到的毒株鉴定为柯萨奇病毒A2型(Coxsackievirus A 2, CV-A2),分子分型显示属于D基因型,且VP1区第102位氨基酸发生了丙氨酸到甘氨酸(A102G)的突变,与省内2014-2015年分离到的两株CV-A2毒株在该位置的突变不同。重组分析发现,病毒在P2区和P3区发生了以CV-A4为主的重组事件。本次疫情的致病病原体CV-A2存在着VP1区氨基酸A102G的特征性变异及P2区和P3区的重组,需要加强对肠道病毒的变异和重组的监测和研究,以提升预警能力。

关键词：疱疹性咽峡炎柯萨奇病毒A2型基因组特征性突变重组变异分子流行病学

基于棘球蚴病病灶分型的棘球蚴感染风险指数构建及应用

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第3期36卷 259-271页

作者：薛垂召郑灿军蒉嫣师悦王旭刘白雪伍卫平韩帅中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)、传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室、世界卫生组织热带病合作中心、科技部国家级热带病国际研究中心上海200025 中国疾病预防控制中心、传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206

目的分析基于棘球蚴病病灶分型构建棘球蚴感染风险指数的可行性,从而为棘球蚴病防控提供参考。方法收集2012—2016年我国棘球蚴病流行病学调查中棘球蚴病病例病灶影像学资料及2017—2022年我国棘球蚴病防治工作年报中各流行省(自治区)... 详细信息

目的分析基于棘球蚴病病灶分型构建棘球蚴感染风险指数的可行性,从而为棘球蚴病防控提供参考。方法收集2012—2016年我国棘球蚴病流行病学调查中棘球蚴病病例病灶影像学资料及2017—2022年我国棘球蚴病防治工作年报中各流行省(自治区)及新疆生产建设兵团棘球蚴病新发现病例检出率数据。对棘球蚴病病灶进行分型后,参考离散分布边际概率原理和多分组分类数据检验方法构建棘球蚴感染风险指数。对该指数与2017—2022年各流行省(自治区)和新疆生产建设兵团棘球蚴病新发现病例检出率数据进行相关性分析,建立单因素线性回归模型分析近期与中期、中期与远期棘球蚴感染风险指数间关系。结果本研究累计纳入2012—2016年我国棘球蚴病病例4 014例。我国各棘球蚴病流行省(自治区)、新疆生产建设兵团间细粒棘球蚴近期、中期和远期感染风险指数均不相同(χ^(2)=4.12~708.65,P均病例检出率相关性均无统计学意义(t=-0.518~2.265,P均> 0.05);多房棘球蚴各期感染风险指数与2018、2020、2021、2022、2017—2020、2017—2021、2017—2022年泡型(含混合型)棘球蚴病新发现病例检出率均呈强相关(r均> 0.7,t=2.521~3.692,P均病新发现病例检出率建立线性回归模型,均有统计学意义(b=0.214~2.168,t=2.458~3.692,F=6.044~13.629,P均病病灶分型的棘球蚴感染风险指数,可望为棘球蚴病防控、预测、诊疗和分类管理提供参考。

关键词：棘球蚴病病灶分型风险指数相关分析回归分析

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《预防接种工作规范(2023年版)》解读

中国疫苗和免疫 2024年第3期30卷 343-348页

作者：余文周刘怡叶家楷曹雷张国民曹玲生徐慧李克莉李力宋祎凡张肇南尹遵栋传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心北京102206 中国疾病预防控制中心免疫规划中心北京100050

为落实《中华人民共和国疫苗管理法》要求,进一步强化预防接种规范化管理,提升预防接种服务质量,国家疾病预防控制局会同国家卫生健康委员会,组织中国疾病预防控制中心、部分省份和地市疾病预防控制中心对《预防接种工作规范(2016年版)... 详细信息

为落实《中华人民共和国疫苗管理法》要求,进一步强化预防接种规范化管理,提升预防接种服务质量,国家疾病预防控制局会同国家卫生健康委员会,组织中国疾病预防控制中心、部分省份和地市疾病预防控制中心对《预防接种工作规范(2016年版)》进行修订,形成《预防接种工作规范(2023年版)》,并于2023年11月30日印发。本文对该版文件的主要内容和修订情况进行了解读。

关键词：预防接种工作规范解读

免疫球蛋白使用者疫苗接种研究和实践现状综述

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中国疫苗和免疫 2024年第2期30卷 258-263页

作者：程祖瑶郭旭宋渝丹王亚敏李军宏贾亚超尹遵栋马超传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心北京102206 中国疾病预防控制中心免疫规划中心北京100050

免疫球蛋白制剂通常用于被动免疫治疗,与疫苗的同时使用可能会影响疫苗的免疫应答,合理确定免疫球蛋白使用与疫苗接种之间的时间间隔是良好免疫实践的重要考虑。本文对有关免疫球蛋白影响疫苗免疫应答的文献、世界卫生组织和主要国家发... 详细信息

免疫球蛋白制剂通常用于被动免疫治疗,与疫苗的同时使用可能会影响疫苗的免疫应答,合理确定免疫球蛋白使用与疫苗接种之间的时间间隔是良好免疫实践的重要考虑。本文对有关免疫球蛋白影响疫苗免疫应答的文献、世界卫生组织和主要国家发布的相关指南、疫苗产品说明书等进行了综述,为完善中国疫苗免疫实践提供参考。

关键词：免疫球蛋白疫苗接种时间间隔

2021—2022年我国风疹流行病学及其病毒基因特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2024年第1期38卷 49-57页

作者：钱程刘莹蔡建林崔爱利李立群范丽霞刘李周淑洁陈瑛崔晓娴毛乃颖张燕朱贞传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室、WHO西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 云南省疾病预防控制中心昆明650022 青海省疾病预防控制中心西宁810007 四川省疾病预防控制中心成都610041 安徽省疾病预防控制中心合肥230061 甘肃省疾病预防控制中心兰州730030 上海市疾病预防控制中心上海200336

目的了解2021—2022年间风疹流行病学及其病毒基因特征, 为我国风疹防控提供基础科学数据。方法自中国疾病预防控制信息系统中的传染病监测模块和监测报告管理模块获取2021—2022年间全国风疹发病数据;从全国麻疹/风疹实验室网络获得阳... 详细信息

目的了解2021—2022年间风疹流行病学及其病毒基因特征, 为我国风疹防控提供基础科学数据。方法自中国疾病预防控制信息系统中的传染病监测模块和监测报告管理模块获取2021—2022年间全国风疹发病数据;从全国麻疹/风疹实验室网络获得阳性风疹病毒(rubella virus, RuV)分离株, 通过逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction, RT-PCR)扩增并测定位于E1基因的两个核苷酸(nucleotide, nt)片段[F1-480(8 633~9 112 nt)和F2-633(8 945~9 577 nt)], 整理拼接后获得靶基因序列(E1-739), 将其与已报道的基因型/亚型参考株构建系统发育树以鉴定基因型别, 同时从GenBank数据库中下载我国2018—2020年间流行的RuV病毒株序列开展系统发育分析。结果 2021—2022年我国风疹发病率均为0.06/10万(2021年:840例;2022年:784例), 病例主要集中于西部和南部省份。病例年龄分布分析显示, 2021—2022年风疹发病主要以病例免疫史发现, 8~23月龄的病例中, 仅接种了1剂次含风疹成分的疫苗(rubella containing vaccine, RCV)幼儿的发病比例较高;2~14岁年龄组病例主要分布在接种了2剂次或以上RCV的儿童中;然而, >15岁病例主要集中在未接种RCV或免疫史不详的人群中。全国病毒学监测数据显示, 2021—2022年间从我国6个省市共获得22株RuV病毒分离株, 分属于1E-L2(11株)和2B-L2c(11株)基因亚型, 并与2018—2020年间流行的RuV病毒株具有很高的同源性。结论 2021—2022年间我国风疹发病维持在较低水平, 流行的RuV为1E-L2和2B-L2c基因亚型。

关键词：风疹流行病学基因特征

柯萨奇病毒A组6型对利巴韦林耐药性的初步研究

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病毒学报 2023年第2期39卷 384-392页

作者：王蕊王聪聪李晓亮宋洋刘莹李冀琛肖金波路环环刘志军孙强张勇潍坊医学院潍坊261053 国家脊髓灰质炎实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 山东第一医科大学济南250117

柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)已成为近年来国内导致手足口病的主要病原体。本研究挑选16株中国流行的不同基因亚型的CVA6,通过在RD细胞上的细胞活性实验和观察致细胞病变效应来检测利巴韦林对不同CVA6毒株的抑制率。结果... 详细信息

柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)已成为近年来国内导致手足口病的主要病原体。本研究挑选16株中国流行的不同基因亚型的CVA6,通过在RD细胞上的细胞活性实验和观察致细胞病变效应来检测利巴韦林对不同CVA6毒株的抑制率。结果表明药物浓度在0.8mmol/L和0.4mmol/L作用下对部分CVA6有明显的抑制作用(P病毒致病力之间的关系,在利巴韦林敏感组与利巴韦林耐药组分别随机挑选两株CVA6进行ICR乳鼠感染实验。通过观察乳鼠生存率、临床评分和体重变化,结果显示利巴韦林耐药组CVA6致病力均比利巴韦林敏感组弱,表明利巴韦林耐药与致病力之间存在一定联系。最后使用MEGA软件对利巴韦林敏感组和耐药组CVA6进行3D区氨基酸序列比对分析,发现两组CVA6在3D区75位、308位、342位、346位氨基酸完全不同,提示利巴韦林耐药与3D区的基因多态性存在一定联系。本研究提示对利巴韦林耐药的CVA6广泛存在,属于目前优势流行D3a基因亚型,不仅为手足口病患者个体化治疗提供了重要依据,而且对CVA6感染相关疾病的防控具有重要意义。

关键词：柯萨奇病毒A组6型利巴韦林差异位点分析耐药性

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新冠病毒感染后机体病毒载量变化及相关影响研究进展

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中华实验和临床病毒学杂志 2024年第1期38卷 99-104页

作者：包恬淼冯晔囡范华陈操山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院济南250117 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430071

新型冠状病毒病(coronavirus disease 2019, COVID-19)是由新型冠状病毒(新冠病毒, 2019-nCoV)感染引起的传染性疾病。截至2023年9月24日, COVID-19疫情已波及220多个国家和地区, 累计确诊和死亡病例分别超过7.7亿例和660万例, 对全球... 详细信息

新型冠状病毒病(coronavirus disease 2019, COVID-19)是由新型冠状病毒(新冠病毒, 2019-nCoV)感染引起的传染性疾病。截至2023年9月24日, COVID-19疫情已波及220多个国家和地区, 累计确诊和死亡病例分别超过7.7亿例和660万例, 对全球经济政治生活造成严重冲击和影响。目前, 2019-nCoV仍在不断变异, 具有传播优势的变异株已导致全球出现多次流行高峰。2019-nCoV感染人体后在体内复制, 病毒载量不断变化。通过了解排毒规律, 可辅助疫情防控和疾病诊治。本文从病毒复制和机体免疫清除的角度对感染后2019-nCoV核酸载量变化和相关影响因素的研究进展进行综述。

关键词：新型冠状病毒病新型冠状病毒病毒载量病毒复制免疫清除

干扰素α2b和λ1体外抗呼吸道合胞病毒活性研究

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中华实验和临床病毒学杂志 2024年第2期38卷 117-124页

作者：管恩蕊张骞陈爱珺王超黄益曼麻粉莲郑丽舒中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、传染病溯源预警和智能决策全国重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京100052

目的分析干扰素(interferon,IFN)α2b和λ1在Hep2细胞和人呼吸道上皮细胞(human airway epithelium,HAE)中抗呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)病毒活性。方法在Hep2细胞中,RSV(MOI=0.01)感染后,加入IFN-α2b或IFN-λ1,48 h后观察细胞病变(cytopathic effect,CPE)、RT-qPCR方法测定病毒载量、免疫荧光法检测RSV F蛋白及结晶紫法检测细胞存活率。在HAE细胞中,用IFN-α2b和IFN-λ1预处理24 h后,RSV(MOI=0.01)感染HAE,RT-qPCR方法测定第1~7天培养上清中的病毒载量,免疫荧光法检测RSV F蛋白及空斑法测定第7天培养上清中的病毒滴度。结果在Hep2细胞中,IFN-α2b和IFN-λ1处理组的CPE较病毒对照组均有所缓解,且均是高浓度组干扰素的CPE轻于低浓度组。不同浓度的IFN-α2b和IFN-λ1均可以显著降低RSV病毒载量(P病毒载量明显低于低浓度组(P病毒复制,降低病毒滴度(P病毒活性,为干扰素抗呼吸道病毒研究提供了数据参考。

关键词：呼吸道合胞病毒 IFN-α2b IFN-λ1 人呼吸道上皮细胞

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轮状病毒疫苗免疫效果影响因素研究进展

中华实验和临床病毒学杂志 2024年第2期38卷 224-230页

作者：车如意李丹地中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

轮状病毒(Rotavirus,RV)是导致全球5岁以下儿童重度胃肠炎最常见的病原之一,接种RV疫苗是控制婴幼儿轮状病毒腹泻最有效的措施。RV疫苗在不同收入水平国家的免疫效果存在差异,本研究对影响RV疫苗免疫效果的因素进行系统阐述,为RV疫苗的... 详细信息

轮状病毒(Rotavirus,RV)是导致全球5岁以下儿童重度胃肠炎最常见的病原之一,接种RV疫苗是控制婴幼儿轮状病毒腹泻最有效的措施。RV疫苗在不同收入水平国家的免疫效果存在差异,本研究对影响RV疫苗免疫效果的因素进行系统阐述,为RV疫苗的研究及免疫策略的制定提供参考。

关键词：轮状病毒疫苗腹泻