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基于SRAP标记的哈尼梯田红米遗传多样性及群体结构分析

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分子植物育种 2019年第7期17卷 2231-2237页

作者：马孟莉周晓梅郑云张婷婷张晓倩卢丙越红河学院生命科学与技术学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室蒙自661100

著名的哈尼梯田核心区位于云南省元阳县,至今仍以种植水稻地方品种为主,梯田红米是其中的主要类型。本研究利用筛选的20对SRAP标记分析60份哈尼梯田红米品种的遗传多样性和群体结构。20对SRAP标记共扩增出182个条带,其中165个具有多态性... 详细信息

著名的哈尼梯田核心区位于云南省元阳县,至今仍以种植水稻地方品种为主,梯田红米是其中的主要类型。本研究利用筛选的20对SRAP标记分析60份哈尼梯田红米品种的遗传多样性和群体结构。20对SRAP标记共扩增出182个条带,其中165个具有多态性,多态性比率达90.66%,平均每对引物可扩增9.10个条带;观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样度(H)和Shannon信息指数(I)分别为1.907、1.404、0.239和0.366,表明云南哈尼梯田水稻红米品种具有较丰富的遗传多样性。聚类分析和主成分分析均将60份红米品种分为两大类,即57个籼稻品种聚为第一类,3个粳稻品种聚为第二类,表明哈尼梯田红米以籼稻为主,在籼稻亚群中有部分品种存在遗传分化现象,这一结果与STRUCTURE软件分析的群体结构类型一致。本研究为哈尼梯田红米资源的保护和利用提供了科学依据。

关键词：哈尼梯田红米遗传多样性群体结构

高效氟氯氰菊酯及诱蝇酮对南瓜实蝇成虫的不育效应

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北方园艺 2018年第22期 51-56页

作者：何超孔琼袁盛勇沈登荣谢昆王传铭红河学院生命科学与技术学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室云南蒙自661100

以南瓜实蝇为研究对象,采用饲料饲喂法测定了不同浓度高效氟氯氰菊酯、诱蝇酮单独使用及混用对南瓜实蝇成虫的不育性效果,以期为利用化学不育技术控制该虫提供参考依据。结果表明:浓度为0.05～1.00mg·L^(-1)的高效氟氯氰菊酯单剂或2.00... 详细信息

以南瓜实蝇为研究对象,采用饲料饲喂法测定了不同浓度高效氟氯氰菊酯、诱蝇酮单独使用及混用对南瓜实蝇成虫的不育性效果,以期为利用化学不育技术控制该虫提供参考依据。结果表明:浓度为0.05～1.00mg·L^(-1)的高效氟氯氰菊酯单剂或2.00%～5.00%的诱蝇酮单剂对南瓜实蝇成虫均有明显的不育作用,其单雌产卵量和卵孵化率均低于对照,以0.50mg·L^(-1)高效氟氯氰菊酯和4.00%的诱蝇酮处理对成虫的不育效果最好。使用不同浓度高效氟氯氰菊酯和4.00%诱蝇酮混配,0.50mg·L^(-1)高效氟氯氰菊酯处理单雌产卵量和卵孵化率均低于对照及其余处理。高效氟氯氰菊酯和诱蝇酮对南瓜实蝇成虫的不育效果,以同时处理雌雄成虫效果最好,其次为单独处理雌虫;二者混用对南瓜实蝇的不育效果优于高效氟氯氰菊酯单剂。

关键词：南瓜实蝇成虫高效氟氯氰菊酯诱蝇酮不育效应

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巨魾野生群体遗传多样性的RAPD分析

淡水渔业 2015年第1期45卷 15-19,24页

作者：杜民牛宝珍罗彩艳刘艳红红河学院生命科学与技术学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室云南蒙自661199

巨魾(Bagarius yarrelli)为云南特有的经济鱼类,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对元江下游的河口巨野生群体进行了遗传多样性分析,在50条随机引物中筛选出19条多态性较好的引物,通过PCR扩增,19条引物在巨群体中共检测到67个位点,其中... 详细信息

巨魾(Bagarius yarrelli)为云南特有的经济鱼类,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对元江下游的河口巨野生群体进行了遗传多样性分析,在50条随机引物中筛选出19条多态性较好的引物,通过PCR扩增,19条引物在巨群体中共检测到67个位点,其中多态性位点66个,平均多态性位点比率为98.51%,个体间平均遗传相似系数为0.890 9,个体间平均遗传距离为0.117 6;群体Nei's基因多样性指数为0.291 6,Shannon信息指数为0.426 9,结果表明巨野生群体具有较高的遗传多样性。

关键词：巨魾(Bagarius yarrelli) RAPD 引物筛选遗传多样性

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石榴NAC转录因子家族的生物信息学分析

分子植物育种 2021年第1期19卷 88-99页

作者：李圣龙王传铭李晓静红河学院生命科学与技术学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室蒙自661100

NAC (NAM-ATAF1/2-CUC2)是植物特有的转录因子大家族之一,其参与植物叶片的衰老、花的形成、种子的发育、根的发育、次生细胞壁的合成、激素的信号转导、果实的成熟及着色等生长发育过程。本研究基于石榴基因组数据库,从中鉴定了73个NA... 详细信息

NAC (NAM-ATAF1/2-CUC2)是植物特有的转录因子大家族之一,其参与植物叶片的衰老、花的形成、种子的发育、根的发育、次生细胞壁的合成、激素的信号转导、果实的成熟及着色等生长发育过程。本研究基于石榴基因组数据库,从中鉴定了73个NAC基因;运用生物信息学方法分析NAC基因家族的蛋白理化性质、基因结构、保守结构域、进化和基因表达。结果表明,NAC基因可分为9个亚族。基于不同组织器官的转录组数据,分析了Pg NAC基因的表达模式,发现Pg NAC30有可能在石榴根系的发育中起重要作用;Pg NAC3和Pg NAC13有可能参与调控石榴种子大小,Pg NAC32有可能调控石榴果实成熟发育,Pg NAC49参与调控石榴种子木质素的生物合成。该研究结果为石榴NAC家族基因功能研究,探索NAC调控石榴果实发育及品质形成提供参考,为石榴的分子育种提供科学依据。

关键词：石榴(Punica granatum L.) NAC基因家族系统进化基因结构表达分析

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重金属Pb^(2+)对牛蛙生理活性的影响

西南农业学报 2015年第4期28卷 1834-1839页

作者：高波李河鲜思萍全舒舟张德刚红河学院生命科学与技术学院云南蒙自661100 云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室云南蒙自661100

本研究以牛蛙(Rana catesbiana)为材料,用氯化铅配制不同浓度的Pb2+溶液(10、20和40 mg/kg)。持续染毒7 d后,培养1 d,然后对牛蛙呼吸频率、心率、肌肉和神经组织兴奋阈值、总蛋白质含量、丙二醛(Malondialdehyde,MDA)含量、过氧化氢酶(C... 详细信息

本研究以牛蛙(Rana catesbiana)为材料,用氯化铅配制不同浓度的Pb2+溶液(10、20和40 mg/kg)。持续染毒7 d后,培养1 d,然后对牛蛙呼吸频率、心率、肌肉和神经组织兴奋阈值、总蛋白质含量、丙二醛(Malondialdehyde,MDA)含量、过氧化氢酶(Catalase,CAT)活性以及重金属Pb2+的残留量进行测定。结果表明,处理前牛蛙呼吸频率无显著差异,处理后呼吸频率有显著差异,心率随浓度的增大而降低。牛蛙肌肉和神经组织兴奋阈值随重金属Pb2+离子浓度的增大而增大,总蛋白质含量、MDA含量随Pb2+浓度的增大而升高,CAT活性随Pb2+浓度的增大而降低。在腹肌、后腿肌肉和肝脏中重金属Pb2+的残留量最多的是肝脏,其次是腹肌,最少的是后腿肌肉。

关键词：牛蛙 Pb2+ 组织兴奋阈值总蛋白质丙二醛过氧化氢酶

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南湖和响水河鲫群体的RAPD分析

淡水渔业 2014年第3期44卷 24-28,94页

作者：杜民牛宝珍刘艳红李云崧红河学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室云南蒙自661199

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对云南南湖和响水河两个鲫(Carassius auratus)群体进行了遗传多样性分析,在50条随机引物中筛选出10条多态性较好的引物,通过PCR扩增,10条引物在南湖鲫群体中共检测到82个位点,其中多态性位点69个,平均... 详细信息

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对云南南湖和响水河两个鲫(Carassius auratus)群体进行了遗传多样性分析,在50条随机引物中筛选出10条多态性较好的引物,通过PCR扩增,10条引物在南湖鲫群体中共检测到82个位点,其中多态性位点69个,平均多态性位点比率为83.56%,平均杂合度为0.289 6,Shannon表型多样性指数为0.432 0,群体内遗传相似率为0.643 7;响水河鲫群体共检测到70个位点,其中多态性位点58个,平均多态位点比率为82.17%,平均杂合度为0.316 7,Shannon表型多样性指数为0.479 4,群体内遗传相似率为0.731 8;两群体间的遗传相似率为0.900 9,遗传距离为0.104 3。结果表明南湖和响水河鲫群体都具有较高的遗传多样性,但南湖鲫群体稍高于响水河群体,而两群体间的遗传分化并不是很大。

关键词：鲫(Carassius auratus) RAPD分析南湖响水河遗传多样性

犬γ-干扰素基因的克隆、序列分析及蛋白质结构预测

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江苏农业学报 2016年第1期32卷 170-175页

作者：谢昆蒋成砚唐秀华周文树王海荣汪镜红河学院生命科学与技术学院云南蒙自661199 云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室云南蒙自661199

根据Gen Bank上犬γ-干扰素基因(IFN-γ)序列(序列号WO318193),利用Primer 5.0软件设计特异性引物,应用RT-PCR技术从100μg/ml Con A刺激24 h后的犬外周血淋巴细胞总RNA中扩增出γ-干扰素基因,测序后应用DNAStar软件对克隆的犬γ-干扰... 详细信息

根据Gen Bank上犬γ-干扰素基因(IFN-γ)序列(序列号WO318193),利用Primer 5.0软件设计特异性引物,应用RT-PCR技术从100μg/ml Con A刺激24 h后的犬外周血淋巴细胞总RNA中扩增出γ-干扰素基因,测序后应用DNAStar软件对克隆的犬γ-干扰素基因进行序列分析,并与Gen Bank上发表的犬、牛、大熊猫、鸡、牦牛、人、猪、野猪、斑马鱼、土拨鼠等的IFN-γ基因序列进行同源性比较。结果显示,克隆的犬IFN-γ基因大小501 bp,编码166个氨基酸,与犬、牛、大熊猫、鸡、牦牛、人、猪、野猪、斑马鱼、土拨鼠IFN-γ基因的核苷酸序列同源性分别为98.4%、81.6%、26.1%、26.1%、22.7%、22.7%、80.8%、81.0%、28.5%和25.0%;氨基酸序列同源性分别为95.8%、72.5%、5.4%、5.4%、6.6%、6.6%、68.9%、69.5%、5.4%和5.4%。运用DNAstar软件对犬γ-干扰素进行蛋白结构预测的结果显示,犬γ-干扰素蛋白含有10个α-螺旋、9个β-折叠、11个β-转角和5个无规则卷曲。

关键词：犬 γ-干扰素基因克隆序列分析蛋白质结构预测

铁皮石斛黑斑病菌小分子毒素提取及产毒条件优化

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西南农业学报 2017年第1期30卷 118-121页

作者：孔琼袁盛勇薛春丽汪正红李祥卢丽蓉明应忠红河学院生命科学与技术学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室云南蒙自661199

铁皮石斛是一种重要的中草药,随着人工种植面积的扩大和年限延长,铁皮石斛上的各种病害随之而来,其中由链格孢引起的石斛黑斑病日趋严重。本研究选取铁皮石斛黑斑病病原—细极链格孢为供试菌株,采用不同溶剂提取病原小分子毒素,同时对... 详细信息

铁皮石斛是一种重要的中草药,随着人工种植面积的扩大和年限延长,铁皮石斛上的各种病害随之而来,其中由链格孢引起的石斛黑斑病日趋严重。本研究选取铁皮石斛黑斑病病原—细极链格孢为供试菌株,采用不同溶剂提取病原小分子毒素,同时对病原小分子毒素的产毒条件进行优化。结果表明,乙酸乙酯的萃取效果最好,且小分子毒素的活性成分主要存在于水相中;当培养基为PSK培养液,温度为25℃,转速为120 r/min,L∶D=12∶12的培养方式全振荡培养7 d时,该病原的小分子毒素活性最强。

关键词：铁皮石斛黑斑病小分子毒素

水杨酸对黄瓜种子萌发及干旱胁迫下幼苗生长的影响

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北方园艺 2018年第6期 23-29页

作者：杨若鹏毕红才李杰红河学院生命科学与技术学院云南蒙自661100 云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室云南蒙自661100

以黄瓜种子为试材,采用浓度为1.0、2.0、3.0、4.0mmol·L^(1)的水杨酸浸种处理黄瓜种子,研究了不同浓度水杨酸对黄瓜种子萌发的影响及干旱胁迫下黄瓜幼苗抗干旱的能力。结果表明:1.0~2.0mmol·L^(1)水杨酸浸种处理可以促进黄瓜种子的萌... 详细信息

以黄瓜种子为试材,采用浓度为1.0、2.0、3.0、4.0mmol·L^(1)的水杨酸浸种处理黄瓜种子,研究了不同浓度水杨酸对黄瓜种子萌发的影响及干旱胁迫下黄瓜幼苗抗干旱的能力。结果表明:1.0~2.0mmol·L^(1)水杨酸浸种处理可以促进黄瓜种子的萌发能力和幼苗生长,而3.0~4.0mmol·L^(1)水杨酸抑制黄瓜种子萌发,且以1.0mmol·L^(1)水杨酸处理黄瓜发芽特性效果最佳。1.0mmol·L^(1)水杨酸引发可以提高干旱胁迫下黄瓜幼苗过氧化氢酶(CAT)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)活性,且可溶性糖、可溶性蛋白质、游离脯氨酸含量显著增强,而丙二醛(MDA)含量显著下降。说明1.0mmol·L^(1)水杨酸在缓解干旱胁迫对黄瓜生长阻碍的效果最好。

关键词：水杨酸干旱胁迫保护酶渗透调节物质