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基于GBS测序技术分析云上黑山羊主配公羊亲缘关系及近交系数

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中国畜牧兽医 2024年第8期51卷 3447-3460页

作者：李子健江炎庭兰蓉朱兰叶朗惠龚翔欧阳依娜云南省畜牧兽医科学院昆明650224 云南省种羊繁育推广中心寻甸655204

[目的]探究云上黑山羊主配公羊的亲缘关系及近交系数,构建肉羊高效联合育种体系,提升云上黑山羊生产性能和可持续发展力。[方法]采用简化基因组测序(genotyping-by-sequencing,GBS)技术对云上黑山羊5个核心育种场(XD、ZY、ML、SB、TJ)的... 详细信息

[目的]探究云上黑山羊主配公羊的亲缘关系及近交系数,构建肉羊高效联合育种体系,提升云上黑山羊生产性能和可持续发展力。[方法]采用简化基因组测序(genotyping-by-sequencing,GBS)技术对云上黑山羊5个核心育种场(XD、ZY、ML、SB、TJ)的100只主配公羊进行测序,并使用BWA、SAMTOOLS、PLINK v 1.90、Gmatrix v 2、Mega X等软件进行质控后高质量单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点鉴定、主成分分析(PCA)、状态同源距离矩阵(identical by state,IBS)和G矩阵构建、群体进化树分析、亲缘系数计算及近交系数估计。[结果]GBS质控后共获得215926个高质量SNPs位点;共检测到8692条连续性纯合片段(runs of homozygosity,ROH),长度在10.59~591.23 Mb之间,平均长度245.74 Mb。云上黑山羊主配公羊群体平均IBS遗传距离为0.118±0.011,亲缘关系G矩阵结果与IBS距离矩阵结果一致。结合群体进化树和亲缘关系分析,100只云上黑山羊被分为三大支和28个家系,其中家系2、11、13、14、16、17、18、20、23、24、25仅有1只公羊,XD、ZY、ML、SB、TJ核心育种场分别有18、10、8、5和8个家系;基于ROH的群体平均基因组近交系数为0.099641,29只公羊的近交系数0.125,存在较大的近交累积。[结论]100只云上黑山羊主配公羊被分为28个家系,其中11个家系仅有1只公羊,应加强繁育防止其血统的流失,配种方案制定中应关注近交系数>0.125的个体,防止近交衰退,同时根据不同的育种目标合理进行种公羊的交换。

关键词：云上黑山羊主配公羊简化基因组测序(GBS) 亲缘关系近交系数

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猪札幌病毒荧光定量RT⁃PCR检测方法建立及遗传进化分析

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病毒学报 2024年第4期40卷 811-822页

作者：杜松舒相华姚俊袁红张雪宋春莲云南农业大学昆明650201 云南省畜牧兽医科学院昆明650224

猪札幌病毒(Porcine sapovirus,PoSaV)是一种引起猪急性胃肠炎的肠道病毒,对于生猪养殖业造成严重威胁。PoSaV感染猪只表现出的症状与其他腹泻病毒引起的症状相似,难以区分。为了检测该病毒并了解其在猪场中的流行情况,我们建立了一种Po... 详细信息

猪札幌病毒(Porcine sapovirus,PoSaV)是一种引起猪急性胃肠炎的肠道病毒,对于生猪养殖业造成严重威胁。PoSaV感染猪只表现出的症状与其他腹泻病毒引起的症状相似,难以区分。为了检测该病毒并了解其在猪场中的流行情况,我们建立了一种PoSaV检测方法。本研究根据GenBank中GIII基因型,设计引物,优化反应条件,通过特异性评价,灵敏度和重复性检测,建立荧光定量RT‐PCR方法。本试验从贵州省获取20份腹泻母猪肛拭子样品,通过RT‐PCR进行检测,并进行VP1全基因扩增测序,使用MEGA7.0进行系统进化树构建和同源性分析。结果显示,建立的荧光定量RT‐PCR检测方法具有较强特异性和高灵敏度,在拷贝值为1×101·μL‐1时可以达到普通RT‐PCR方法100倍以上的检出限。此外,该方法具有良好的重复性和稳定性,批内变异系数与批间变异系数均小于1%;在检测猪腹泻临床样本中发现阳性率为85%(17/20)。将获得的17条VP1全基因序列与国内外14条参考毒株进行比对,结果显示:所有测序毒株与参考序列核苷酸同源性介于81.0%‐99.2%,氨基酸同源性介于80.8%‐97.6%,并且均与美国经典Cowden毒株亲缘性较远。所有测序毒株与YNAN、YNAN2020亲缘性较近,其中5株(GZ‐VP1‐3、GZ‐VP1‐5、GZ‐VP1‐6、GZ‐VP1‐9、GZ‐VP1‐11)与云南省分离株YNAN核苷酸及氨基酸同源性为99.2%、96.9%‐97.6%,亲缘性最为亲近,表明可能由一个原始毒株进化而来。测序毒株均在同一分支上亲缘性较近,但核苷酸及氨基酸同源性在91.8%‐100%,显示VPl基因存在一定程度变异。本研究成功建立一种PoSaV检测方法,深入分析了当前毒株的遗传变异情况,对PoSaV防控有着一定的启示作用。

关键词：猪札幌病毒荧光定量PCR VP1基因遗传进化分析

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绿色畜牧养殖技术有效推广的研究

农业灾害研究 2024年第1期14卷 55-57,72页

作者：尹凤山东省济南市平阴县畜牧兽医局孔村畜牧兽医站山东济南250403

通过文献综述和实证研究发现,绿色畜牧养殖技术可以减少环境污染、提高动物福利和生产效率。然而,推广面临着诸多挑战,包括技术适应性、经济可行性和农民的意愿等。因此,提出了针对这些挑战的解决方案,如加强技术培训、提供资金支持和... 详细信息

通过文献综述和实证研究发现,绿色畜牧养殖技术可以减少环境污染、提高动物福利和生产效率。然而,推广面临着诸多挑战,包括技术适应性、经济可行性和农民的意愿等。因此,提出了针对这些挑战的解决方案,如加强技术培训、提供资金支持和建立政策激励机制。有效推广绿色畜牧养殖技术需要政府、农业部门和畜牧业者共同努力,以促进可持续发展和环境保护。

关键词：绿色畜牧养殖技术挑战推广畜牧业

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畜禽养殖粪污综合利用与处理技术模式研究

吉林畜牧兽医 2024年第4期45卷 154-156页

作者：蓝志斌史耀峰李小娜甘肃省定西市安定区畜牧兽医局巉口畜牧兽医站甘肃定西743022 甘肃省定西市安定区畜牧兽医局鲁家沟畜牧兽医站甘肃定西743000 甘肃省定西市畜牧兽医局甘肃定西743000

在现如今的社会生产和建设过程中,养殖产业实现了自身的飞速发展,满足了消费者基本需求、提高养殖人员经济收益的同时,也造成了极大的环境污染问题。畜禽养殖污染已然成为了现阶段主要的污染源之一,严重影响了相关地区的生态环境,使得... 详细信息

在现如今的社会生产和建设过程中,养殖产业实现了自身的飞速发展,满足了消费者基本需求、提高养殖人员经济收益的同时,也造成了极大的环境污染问题。畜禽养殖污染已然成为了现阶段主要的污染源之一,严重影响了相关地区的生态环境,使得生态环境建设和治理工作面临较大的难题。

关键词：生态环境养殖人员养殖产业畜禽养殖污染经济收益环境污染问题污染源综合利用

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不同计算方法的云南省永胜县下院滑坡堰塞湖沉积物粒度特征及沉积历史重建

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中国地质 2024年第5期51卷 1761-1775页

作者：张宇徐宗恒查玲珑陈云英陶真鹏云南师范大学地理学部云南昆明650500 云南省高原地理过程与环境变化重点实验室云南昆明650500 云南省玉龙纳西族自治县气象局云南丽江674100

【研究目的】滑坡堰塞湖灾害链危害大,其形成和溃决过程中受外部环境影响大。堰塞湖沉积物作为记录堰塞湖全生命周期的载体,具有良好的古环境和古气候的指示作用,采用最佳解析方法对其进行解读有利于还原沉积物沉积过程及古环境变化。... 详细信息

【研究目的】滑坡堰塞湖灾害链危害大,其形成和溃决过程中受外部环境影响大。堰塞湖沉积物作为记录堰塞湖全生命周期的载体,具有良好的古环境和古气候的指示作用,采用最佳解析方法对其进行解读有利于还原沉积物沉积过程及古环境变化。【研究方法】通过野外调查采样和室内测试分析相结合的方法,采用图解法和矩值法计算下堰塞湖沉积物统计特征的适用性问题,使用粒度结合有机质含量重建了堰塞湖沉积环境,对堰塞湖的发育过程进行还原。【研究结果】(1)堰塞湖沉积物分层沉积层序明显,为单一水动力湖相沉积,物质来源稳定,非多物源沉积;综合有机质变化和沉积物粒度特征表明该堰塞湖经历了4次干湿周期,在气候和地质活动的共同作用下至少存在3次堵塞−泄流沉积过程,估算沉积旋回周期约为1750 a,该沉积历史应该是断裂带长期复杂的活动和气候−河流共同作用的结果。(2)通过对图解法和矩值法进行统计分析结果表明,两种方法对平均粒径和分选系数评价一致性较好,可直接进行替换;矩值法对偏态峰态整体计算结果比图解法大,在使用中需进行线性代换。由于描述参照值的缘故,偏态、峰态在统计表述中有所偏差。【结论】堰塞湖沉积物粒径分布简单,采用图解法计算更加便捷,与其他沉积物对比方便,推荐图解法对堰塞湖沉积进行计算。研究结果表明粒度特征对堰塞湖的沉积和溃决过程以及滑坡灾害对气候变化的响应研究具有一定的指导意义,可为还原该堰塞湖沉积期的古环境和古气候提供理论依据。

关键词：滑坡堰塞湖沉积粒度特征图解法矩值法沉积历史环境地质调查工程永胜县云南省

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高楼生猪养殖优势及模式分析

农家科技 2024年第30期 91-93页

作者：莫伦粤广东省肇庆市怀集县畜牧兽医局

随着城市化进程加快,传统生猪养殖模式已经不能满足当前的养殖需求,在此背景下,高楼生猪养殖模式应运而生。高楼生猪养殖模式可通过充分利用垂直空间,不仅在土地利用和生物安全性方面展现出显著优势,还通过现代化设施应用,大大提高生产... 详细信息

随着城市化进程加快,传统生猪养殖模式已经不能满足当前的养殖需求,在此背景下,高楼生猪养殖模式应运而生。高楼生猪养殖模式可通过充分利用垂直空间,不仅在土地利用和生物安全性方面展现出显著优势,还通过现代化设施应用,大大提高生产效率,降低环境污染。本文从多方面分析高楼生猪养殖的优势及其在实际应用中的关键要点,为推动这一新兴养殖模式的发展提供支持。

关键词：高楼生猪养殖优势养殖模式

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高寒草地土壤真菌群落结构对春季休牧的响应

生态学杂志 2024年第6期43卷 1703-1711页

作者：郑文贤李世雄赵文刘晶晶尹亚丽青海大学畜牧兽医科学院西宁810016 青海省畜牧兽医科学院西宁810016

为明确春季休牧对中度退化高寒草甸植被特征、土壤理化性质和土壤真菌群落特征的影响,本研究在祁连山区高寒草地设置春季休牧和自由放牧两个处理,休牧结束后于牧草生长旺季,调查草地植物群落特征并采集土壤样本。结果表明,春季休牧后高... 详细信息

为明确春季休牧对中度退化高寒草甸植被特征、土壤理化性质和土壤真菌群落特征的影响,本研究在祁连山区高寒草地设置春季休牧和自由放牧两个处理,休牧结束后于牧草生长旺季,调查草地植物群落特征并采集土壤样本。结果表明,春季休牧后高寒草地植物群落多样性指数、均匀度指数和丰富度指数显著升高(P局;休牧后土壤有机碳和全钾含量显著增加(P<0.05),增幅分别为10.64%和1.10%;而土壤容重和pH显著降低(P<0.05),降幅分别为17.83%和4.60%。春季休牧处理下土壤子囊菌门的相对丰度增加,而被孢霉菌门的丰度下降;土壤真菌群落多样性指数在两处理间差异不显著;PCoA分析结果显示,主坐标1(PCo1)、主坐标2(PCo2)和主坐标3(PCo3)对真菌群落结构差异的解释率分别为17.58%、12.07%和11.51%,累计解释率为41.16%;真菌共现网络模块化分析发现,春季休牧处理下土壤真菌网络复杂性更高,土壤真菌群落更稳定。植被和土壤因子的方差分析结果显示,土壤含水量和植被地下生物量是影响真菌群落重构的两个主要调控因子。

关键词：春季休牧高寒草甸植物群落土壤理化性质土壤真菌群落

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肉羊阶段性饲养管理技术要点

吉林畜牧兽医 2024年第2期45卷 94-96页

作者：史耀峰蓝志斌甘肃省定西市安定区畜牧兽医局鲁家沟畜牧兽医站甘肃定西743000 甘肃省定西市安定区畜牧兽医局巉口畜牧兽医站甘肃定西743022

相较于其他的羊种,肉羊生长优势比较明显,其生长速度较快,同时具备较强地繁殖能力,通过高质量开展饲养管理工作,能够为广大养殖户创造较高的养殖效益。就现阶段的养殖实际来看,肉羊养殖规模进一步扩大,养殖数量增多,但养殖质量和效果还... 详细信息

相较于其他的羊种,肉羊生长优势比较明显,其生长速度较快,同时具备较强地繁殖能力,通过高质量开展饲养管理工作,能够为广大养殖户创造较高的养殖效益。就现阶段的养殖实际来看,肉羊养殖规模进一步扩大,养殖数量增多,但养殖质量和效果还有较大地提升空间,这对广大养殖户的积极性造成了较大打击。

关键词：养殖数量生长优势肉羊养殖效益繁殖能力养殖户生长速度管理技术要点

2021—2023年云南省麻栗坡县口蹄疫血清学监测及分析

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中国动物检疫 2024年第5期41卷 14-19页

作者：周曦元正菊李玉凤苗海生谢家卫张科方信爱国麻栗坡县动物疫病预防控制中心云南麻栗坡663600 云南省畜牧兽医科学院云南昆明650224

为了解云南省中越边境麻栗坡县家畜口蹄疫(FMD)免疫情况,2021—2023年采集麻栗坡县猪、牛、羊血清样品4846份,分别采用口蹄疫病毒(FMDV)O型/A型ELISA抗体检测试剂盒及非结构蛋白3ABC阻断ELISA抗体检测试剂盒进行抗体检测。结果显示:麻... 详细信息

为了解云南省中越边境麻栗坡县家畜口蹄疫(FMD)免疫情况,2021—2023年采集麻栗坡县猪、牛、羊血清样品4846份,分别采用口蹄疫病毒(FMDV)O型/A型ELISA抗体检测试剂盒及非结构蛋白3ABC阻断ELISA抗体检测试剂盒进行抗体检测。结果显示:麻栗坡县猪、牛和羊O型FMD免疫合格率为74.08%,牛和羊A型FMD免疫合格率为73.95%;不同畜种间O型FMD免疫合格率差异有统计学意义(P0.05);不同年份间,O型/A型FMD免疫合格率差异均有统计学意义(P县猪、牛、羊FMD整体免疫合格,但存在不同程度的FMDV感染。建议持续加强FMD疫苗免疫和免疫效果评估,强化血清学和病原学监测,及时掌握FMDV畜间感染情况,防控边境地区FMD流行,降低向内地散播风险。

关键词：口蹄疫免疫抗体非结构蛋白抗体血清学监测云南省