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云南省2006-2015年狂犬病病毒核蛋白基因进化特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2017年第5期31卷 424-428页

作者：冯云章域震杨卫红潘虹张云智袁庆虹韩茜周济华张海林云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室大理671000

目的阐明云南省2006-2015年t18株狂犬病病毒（Rabies virus,RABV）核蛋白（Nucleoprotein,N）基因进化特征及流行病学特点.方法在云南省狂犬病流行区采集狂犬、可疑犬和病牛脑组织以及狂犬病病例脑组织、唾液和脑脊液标本,用直接免疫... 详细信息

目的阐明云南省2006-2015年t18株狂犬病病毒（Rabies virus,RABV）核蛋白（Nucleoprotein,N）基因进化特征及流行病学特点.方法在云南省狂犬病流行区采集狂犬、可疑犬和病牛脑组织以及狂犬病病例脑组织、唾液和脑脊液标本,用直接免疫荧光法进行病毒抗原检测,阳性标本提取病毒核酸,通过RT-PCR扩增RABV的N基因序列并进行序列测定,用MEGA5.0软件邻接法（Neighbor-Joining）进行系统进化分析.结果经RT-PCR和序列测定获得2012-2015年云南省91株RABV的N基因序列,并与2006-2011年获得的云南27株RABV及邻省和东南亚地区的29株RABV的N基因序列进行系统进化分析.结果表明,云南RABV进化群可分为YN-A（105株）、YN-B（6株）和YN-C（7株）,并分别属于中国进化群中的China-Ⅰ、China-Ⅵ和China-Ⅱ.YN-A流行株在2006-2015年间每年均有分布,其中,2006-2011年14株,2012-2015年91株,并分布于13个州（市）;YN-B和YN-C分别仅分布于2006-2010年和2008-2011年,地区分布也较为局限.YN-A和YN-C与相邻四川、贵州、广西和湖南省的China-Ⅰ或China-Ⅱ进化群流行株亲缘关系较近,YN-B与缅甸、泰国、越南和柬埔寨流行株亲缘关系较近.结论云南省RABV存在不同传播来源的3个进化群.YN-A为优势进化群,在2006-2015年间广泛分布于云南省狂犬病流行区,并具有较强的传播速率.2012年以来云南省未再发现YN-B和YN-C进化群的流行.

关键词：狂犬病病毒核蛋白基因系统进化分析

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云南鼠疫疫源地分布与演变

中华地方病学杂志 2013年第6期32卷 591-592页

作者：宋志忠云南省地方病防治所云南省鼠疫防控技术研究重点实验室大理671000

鼠疫是一种发病急、传播快、病死率高、传染性强的自然疫源性人兽共患病。鼠疫自然疫源地是在具备适宜的地理景观条件下，由宿主动物、传播媒介、鼠疫菌在长期的共同进化中相互适应而形成的特殊生态系统。

关键词：鼠疫疫源地分布演变

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全基因测序技术在鼠疫分子溯源中的应用

中国病原生物学杂志 2023年第4期18卷 489-494页

作者：杨荣王鹏钟佑宏石丽媛云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室云南大理671000 昆明医科大学公共卫生学院

高通量测序技术的发展使得测序成本大幅降低,全基因测序(whole genome sequencing,WGS)技术已成为追溯传染性疾病病原菌和研究细菌遗传进化的主要技术手段。鼠疫菌基因组序列的测定在鼠疫疫情溯源及探索病原菌遗传进化中发挥至关重要的... 详细信息

高通量测序技术的发展使得测序成本大幅降低,全基因测序(whole genome sequencing,WGS)技术已成为追溯传染性疾病病原菌和研究细菌遗传进化的主要技术手段。鼠疫菌基因组序列的测定在鼠疫疫情溯源及探索病原菌遗传进化中发挥至关重要的作用。细菌表型分析虽能体现一定的遗传关系,但不能直接评估所测定表型的遗传基础,不宜用于鼠疫菌的溯源,WGS技术因其具有获取遗传信息全面、精确、高通量及高分辨率等优势,现已在鼠疫的分子溯源工作中被广泛应用。本文简要综述了WGS技术及其在鼠疫分子溯源中的应用进展。

关键词：鼠疫菌全基因测序基因组分子溯源综述

云南省四种家鼠下颌骨形态差异——基于传统测量与几何形态分析

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动物学杂志 2024年第6期59卷 919-930页

作者：周宏伟谢梦茹邵宗体尹鹏吾郭宪国宋文宇大理大学病原与媒介生物研究所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室大理671000 云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室大理671000

为探讨黄胸鼠(Rattus tanezumi)、大足鼠(***)、褐家鼠(***)及黑缘齿鼠(***)的下颌骨种间形态差异,为上述物种提供新的鉴定依据,提高形态分类的准确性,本研究对4种共40号标本的下颌骨进行了传统线性测量分析和几何形态测量分析。使用单... 详细信息

为探讨黄胸鼠(Rattus tanezumi)、大足鼠(***)、褐家鼠(***)及黑缘齿鼠(***)的下颌骨种间形态差异,为上述物种提供新的鉴定依据,提高形态分类的准确性,本研究对4种共40号标本的下颌骨进行了传统线性测量分析和几何形态测量分析。使用单因素方差分析比较了传统形态测量值的种间差异。通过主成分分析、典型变量分析和系统发育信号检验分析了4种家鼠下颌骨的几何形态差异。通过Bayes判别分析和函数判别法分别检验了不同方法对物种鉴定的准确性。传统形态测量的单因素方差分析表明,4种家鼠下颌骨长、下臼齿列长、下颌高和下颌齿隙传统测量值存在显著差异,且黄胸鼠与黑缘齿鼠差异最大,大足鼠与褐家鼠差异最小;几何形态测量分析表明,黄胸鼠与黑缘齿鼠下颌骨形态较为相近,黄胸鼠与大足鼠下颌骨形态差异最大,4种家鼠下颌骨形态差异主要集中在冠状突、角突和踝状突;传统测量值的Bayes交叉验证判别分析对4个物种标本的正确分类为72.5%,几何形态判别函数分析结果表明,除褐家鼠-黑缘齿鼠(60%)外,另几个物种的两两交叉验证结果都达到70%及以上,表明两种分析方法具有一定的可靠性。下颌骨形态可以作为4种家鼠的鉴别依据,几何形态测量方法可以提高4种家鼠的分类准确性。在今后的研究中可以运用该方法在更多类群中展开验证,获得更全面的形态差异信息,进而为基层疾控单位工作人员开展鼠源性疾病控制和预防工作时的物种鉴定提供参考依据。

关键词：小型兽类几何形态测量物种分类典型变量分析系统发育信号

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噬菌体受体种类及噬菌体与宿主结合方式研究进展

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中国病原生物学杂志 2022年第6期17卷 739-743页

作者：王紫鉴王鹏大理大学公共卫生学院云南大理671000 云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室

近年来随着抗生素的使用,抗生素耐药菌的广泛出现严重威胁了全球人类健康及发展。噬菌体作为一种可以杀死细菌的病毒,被认为是解决细菌耐药的一种有效方法。噬菌体感染细菌是通过与宿主细菌表面的特异性受体吸附、结合,将基因组注入细... 详细信息

近年来随着抗生素的使用,抗生素耐药菌的广泛出现严重威胁了全球人类健康及发展。噬菌体作为一种可以杀死细菌的病毒,被认为是解决细菌耐药的一种有效方法。噬菌体感染细菌是通过与宿主细菌表面的特异性受体吸附、结合,将基因组注入细菌。深入了解其作用机制对于研究噬菌体和宿主细菌的相互作用非常重要。本文就噬菌体配体与受体种类及结合方式进行综述,为噬菌体相关研究提供理论参考。

关键词：噬菌体受体宿主结合方式综述

鼠疫染疫动物对鼠疫耶尔森菌的敏感性、抗性及其机制研究进展

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中华地方病学杂志 2023年第7期42卷 593-597页

作者：陈敏石丽媛大理大学公共卫生学院大理671000 云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室大理671000

宿主动物对鼠疫耶尔森菌(简称鼠疫菌)的敏感性、抗性存在着种间和地域间的差异,其中指示动物对鼠疫菌存在天然抗性。本文就鼠疫染疫动物对鼠疫菌的敏感性、抗性及其机制研究进展进行综述,旨在为完善鼠疫的生态学研究和鼠疫防控工作提供... 详细信息

宿主动物对鼠疫耶尔森菌(简称鼠疫菌)的敏感性、抗性存在着种间和地域间的差异,其中指示动物对鼠疫菌存在天然抗性。本文就鼠疫染疫动物对鼠疫菌的敏感性、抗性及其机制研究进展进行综述,旨在为完善鼠疫的生态学研究和鼠疫防控工作提供帮助。

关键词：鼠疫宿主动物指示动物敏感性与抗性

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沙粒病毒及所致人类疾病的研究进展

中国人兽共患病学报 2019年第1期35卷 70-75页

作者：蒋梦颖张云智大理大学公共卫生学院大理671000 云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室大理671000

沙粒病毒(Arenaviruses)属于沙粒病毒科(Arenaviridae),现分为爬行动物沙粒病毒属(Reptarenavirus,RARV)、哈特曼病毒属(Hartmanivirus,HARV)和哺乳动物沙粒病毒属(Mammarenavirus,MARV)3个属,分别以爬行动物和啮齿动物为宿主。沙粒病毒,特别是MARV可引起人类病毒性出血热,主要分布于非洲和美州,近几年来,亚洲也有病例报道,特别是我国鼠类中也证实存在一类新型沙粒病毒的感染,引起人们的关注。本文就沙粒病毒的结构、分类、疫苗、治疗及所致人类疾病的研究进展进行了综述。

关键词：沙粒病毒结构分类人类疾病

第三次鼠疫大流行的传播及生态环境与其流行关系的研究进展

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中华地方病学杂志 2024年第9期43卷 769-774页

作者：杨丰义宋志忠石丽媛云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室大理大理大学公共卫生学院大理云南省疾病预防控制中心昆明

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的烈性传染病, 世界史上曾经发生过三次鼠疫大流行, 其中第三次鼠疫大流行始于1772年的中国云南, 于1894年成为全球性大流行性疾病, 波及亚洲、欧洲、美洲、大洋洲和非洲的多个国家。有研究报道, 第三次鼠疫大... 详细信息

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的烈性传染病, 世界史上曾经发生过三次鼠疫大流行, 其中第三次鼠疫大流行始于1772年的中国云南, 于1894年成为全球性大流行性疾病, 波及亚洲、欧洲、美洲、大洋洲和非洲的多个国家。有研究报道, 第三次鼠疫大流行是由鼠疫耶尔森菌***支系引起的。本文对***支系的起源、传播路线、分布地区及生态环境与第三次鼠疫大流行的关系等进行总结, 对进一步认识和研究鼠疫的流行规律、制定适宜的监测计划和防控措施具有指导意义。

关键词：第三次鼠疫大流行 1.ORI支系生态环境

2019-2021年云南省人间布鲁氏菌病流行特征分析

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中华地方病学杂志 2024年第2期43卷 118-122页

作者：杨秋菊杨向东于彬彬邵宗体大理大学公共卫生学院大理671000 云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室大理671000

目的了解云南省人间布鲁氏菌病的流行特征,为制定布鲁氏菌病精准防控策略提供可靠的科学依据。方法收集中国疾病预防控制中心信息系统中2019年1月至2021年12月云南省人间布鲁氏菌病疫情资料和云南省各州(市)上报的布鲁氏菌病年度监测数... 详细信息

目的了解云南省人间布鲁氏菌病的流行特征,为制定布鲁氏菌病精准防控策略提供可靠的科学依据。方法收集中国疾病预防控制中心信息系统中2019年1月至2021年12月云南省人间布鲁氏菌病疫情资料和云南省各州(市)上报的布鲁氏菌病年度监测数据,采用描述性流行病学方法,对布鲁氏菌病的流行概况,三间分布(时间、地区、人群)特征及血清学、病原学监测结果进行分析。结果2019-2021年云南省累计报告布鲁氏菌病病例1408例,年均发病率为1.00/10万;发病数从2019年的321例增加至2021年的701例,发病率从2019年的0.68/10万增加至2021年的1.50/10万。发病时间主要集中在4-9月(857例)。报告发病数居前3位的地区依次为昆明市(483例)、曲靖市(379例)、红河哈尼族彝族自治州(281例),共占总病例数的81.18%(1143/1408)。发病年龄主要集中在20~云南省共监测布鲁氏菌病重点人群血清26280份,血清学检测阳性572份,阳性率为2.18%(572/26280)。共从全省医院病例血液标本中分离出布鲁氏菌169株,其中羊种3型155株、羊种1型14株。结论2019-2021年云南省人间布鲁氏菌病发病呈上升趋势,以夏秋季高发,发病人群主要为青中年男性农民,应加强高发季节重点人群的疾病监测与健康教育。

关键词：布鲁氏菌病流行特征血清学试验病原学试验