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稻瘟菌诱导的水稻WRKY基因OsWRKY52的分离和鉴定(英文)

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生物化学与生物物理进展 2005年第10期32卷 937-946页

作者：王海华谢科吴坤陆郭泽建浙江大学农业与生物技术学院中国农业大学植物病理系北京100094 中国农业大学植物病理系

WRKY蛋白参与植物对生物或非生物胁迫反应和一些发育、代谢过程,在植物中组成一个转录因子大家族.从水稻cDNA文库中分离到一个新的WRKY基因——OsWRKY52cDNA,包括一个1719bp的开放读码框,推测编码一个由572个氨基酸组成的蛋白质,与燕麦(... 详细信息

WRKY蛋白参与植物对生物或非生物胁迫反应和一些发育、代谢过程,在植物中组成一个转录因子大家族.从水稻cDNA文库中分离到一个新的WRKY基因——OsWRKY52cDNA,包括一个1719bp的开放读码框,推测编码一个由572个氨基酸组成的蛋白质,与燕麦(Avenasativa)AsWRKY1具有54%的氨基酸一致性.该基因被非亲和性稻瘟菌快速诱导.凝胶阻滞实验结果表明,原核表达的OsWRKY52能与水稻PR1a启动子上的W盒元件特异结合.采用酵母单杂交体系的方法证明了OsWRKY52具有转录激活活性,其丝氨酸岛、苏氨酸岛和C端的富酸性氨基酸区是负责转录激活的区域.这些结果提示OsWRKY52作为一个转录激活子,可能参与植物对稻瘟菌的应答反应.

关键词： DNA结合稻瘟菌(Magnaporthe grisea) 水稻(Oryza sativa) 转录激活转录因子 WRKY

植物病原细菌Pseudomonas syringae ***基因组中的信号肽分析

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遗传 2005年第6期27卷 959-964页

作者：刘雅婷李正跃朱有勇李成云李永忠云南农业大学农学与生物技术学院昆明650201 云南农业大学植物保护学院昆明650201 云南省植物病理重点实验室昆明650201 云南农业大学烟草学院昆明650201

应用SignaIP 3.0对植物病原细菌Pseudomonas syringae *** DC3000菌株基因组中的细菌染色体全部5 615个ORFs进行了分析,确定其中679个ORFs所编码蛋白质的N-端有信号肽序列,其中已经命名并有注释的有107个ORFs.信号肽的长度以19～31个氨... 详细信息

应用SignaIP 3.0对植物病原细菌Pseudomonas syringae *** DC3000菌株基因组中的细菌染色体全部5 615个ORFs进行了分析,确定其中679个ORFs所编码蛋白质的N-端有信号肽序列,其中已经命名并有注释的有107个ORFs.信号肽的长度以19～31个氨基酸居多,其中最多的是23个氨基酸的信号肽.具有信号肽的ORFs编码蛋白的长度大多为101～400个氨基酸之间.同时,对组成信号肽的氨基酸种类作了系统的分析,发现组成信号肽的氨基酸中非极性氨基酸占48.54%,极性氨基酸占18.67%,带负电荷氨基酸占24.54%,带正电荷氨基酸仅占8.00%,出现最多的3种氨基酸依次为亮氨酸、丙氨酸和丝氨酸,最少的氨基酸是异亮氨酸,在切割位点-1端的氨基酸中83.21%均为丙氨酸,在切割位点后3位的氨基酸中最多的氨基酸也是丙氨酸.通过分析确定628个分泌类信号肽,36个信号肽具有RR-motif的保守区段,15个脂蛋白类信号肽,未发现Prepiln-like信号肽和Bacteriocin and Pheromone信号肽.

关键词： Pseudomonas syringae pv.tomato ORF 信号肽 RR-motif 脂蛋白

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云南三七病毒病的发生及病毒种类检测

植物病理学报 2019年第4期49卷 456-464页

作者：杨馨孟鈺李梅蓉李晓静包改丽朱静刘琴利兰平秀李凡云南农业大学植物保护学院昆明650201 云南农业大学动物科学技术学院昆明650201

对云南省文山市、昆明市、红河州、曲靖市的三七主要种植区进行病毒病调查及相关病毒检测,发现病毒病在上述地区均有发生,年平均发病率均在5%以上,且种植年限越长发病率越高,已成为三七上仅次于根腐病的主要病害。三七病毒病症状类型复... 详细信息

对云南省文山市、昆明市、红河州、曲靖市的三七主要种植区进行病毒病调查及相关病毒检测,发现病毒病在上述地区均有发生,年平均发病率均在5%以上,且种植年限越长发病率越高,已成为三七上仅次于根腐病的主要病害。三七病毒病症状类型复杂多样,主要有白化、黄化、褪绿、斑驳、皱缩、卷叶和坏死等。利用PCR/RT-PCR对2011年~2015年,以及2017年采集的466份疑似病毒病样品进行检测,发现侵染三七的病毒主要有三七Y病毒(Panax virus Y,PnVY)、中国番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl China virus,TYLCCNV)及其卫星(tomato yellow leaf curl China betasatellite,TYLCCNB)、三七A病毒(Panax notoginseng virus A,PnVA)和烟草扭脉病毒(tobacco vein distorting virus,TVDV),基中PnVY为当前为害云南三七的优势病毒,TVDV在三七上侵染为害系黄症病毒科成员侵染人参属植物的首次报道。PnVY、TYLCCNV、PnVA和TVDV的平均检出率分别为51.5%、31.9%、10.7%和7.0%,存在PnVY+TYLCCNV、PnVY+PnVA以及PnVA+TVDV复合侵染的现象,复合侵染的检出率分别为20.6%、3.4%和0.3%。未检测到番茄斑萎病毒(tomato spotted w ilt tospovirus,TSWV)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CM V)、烟草花叶病毒属(Tobamovirus)病毒、毛形病毒属(Crinivirus)病毒,以及菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)中除TYLCCNV以外的其他病毒。

关键词：三七病毒病病害调查种类鉴定烟草扭脉病毒

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转基因烟草植株对南方根结线由的抗性测定

云南农业大学学报 1996年第2期11卷 127-129页

作者：胡先奇喻盛甫唐嘉义云南农业大学农业科学技术学院植物病理系

转基因烟草植株对南方根结线由的抗性测定ＲｅｓｉｓｔａｎｃｅＴｅｓｔｏｆＴｒａｎｓｇｅｎｉｃＰｌａｎｔｏｆＴｏｂａｃｃｏｔｏＭｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅｉｎｃｏｇｎｉｔａ胡先奇，喻盛甫，唐嘉义（云南农业大学农业科学技术学院植... 详细信息

转基因烟草植株对南方根结线由的抗性测定ＲｅｓｉｓｔａｎｃｅＴｅｓｔｏｆＴｒａｎｓｇｅｎｉｃＰｌａｎｔｏｆＴｏｂａｃｃｏｔｏＭｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅｉｎｃｏｇｎｉｔａ胡先奇，喻盛甫，唐嘉义（云南农业大学农业科学技术学院植物病理系，昆明６５０２０１）烟草根...

关键词：烟草转基因南方根结线虫抗虫性

云南省马铃薯晚疫病菌的交配型、抗药性及生理小种分布的研究(英文)

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植物病理学报 2003年第2期33卷 126-131页

作者： K.Y.RYU 罗文富杨艳丽国立耘郭华春王毅陈海如韩国江原道高岭地国家农业实验站云南农业大学植物病理系昆明650201 中国农业大学植物病理系北京100094 云南农业大学农业与生物技术学院昆明650201 国际马铃薯中心北京办事处北京100081

从云南省陆良县、建水县和南涧县采集2000年秋播的马铃薯晚疫病标本,分离获得124个致病疫霉菌株,连同1999～2000年分离自昆明、曲靖等地的春播马铃薯晚疫病的10个菌株共134个,采用常规技术对这些菌株进行了交配型、抗药性及生理小种的... 详细信息

从云南省陆良县、建水县和南涧县采集2000年秋播的马铃薯晚疫病标本,分离获得124个致病疫霉菌株,连同1999～2000年分离自昆明、曲靖等地的春播马铃薯晚疫病的10个菌株共134个,采用常规技术对这些菌株进行了交配型、抗药性及生理小种的研究。交配型测定结果为:陆良县的18个菌株中有3个为A_2交配型,其余15个菌株为A_1交配型,建水县和南涧县的106个菌株及昆明、曲靖1999～2000年的10个菌株都是A_1交配型。测定了83个菌株对瑞毒霉(metalaxyl)和烯酰吗啉(dimethomorph)的抗药性,结果有12.0％的菌株对瑞毒霉表现抗性,16.9％表现中抗,71.1％表现敏感,其中陆良、昆明和曲靖的抗瑞毒霉菌株的比例大于建水和南涧的抗药性菌株的比例;所测定的83个菌株都对烯酰吗啉表现敏感。生理小种鉴定结果表明,云南晚疫病菌为3.4、0、3和4生理小种,分别占鉴定菌株总数的48.0％、32.5％、15.6％和3.9％。但南涧仅发现3.4和0小种,而昆明有0、3、3.4和4小种,陆良有0、3和3.4小种,可见昆明和陆良地区的晚疫病菌生理小种比南涧地区的生理小种的组成更趋多样。

关键词：云南马铃薯晚疫病菌交配型抗药性生理小种

天然产物通过调节自噬功能改善动脉粥样硬化的研究进展

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天然产物研究与开发 2023年第11期35卷 1991-2002页

作者：杨晋勃蒙温露儿胡丹丹黄业伟云南农业大学普洱茶学教育部重点实验室云南农业大学食品科学技术学院云南农业大学理学院昆明650201

动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的发病机理复杂,是诸多心血管疾病的病理基础。自噬是一种细胞自身的分解代谢机制,细胞自噬功能障碍与许多疾病的发生和发展密切相关。天然产物是自然界中动植物所含化学成分的统称,越来越多的研究揭... 详细信息

动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的发病机理复杂,是诸多心血管疾病的病理基础。自噬是一种细胞自身的分解代谢机制,细胞自噬功能障碍与许多疾病的发生和发展密切相关。天然产物是自然界中动植物所含化学成分的统称,越来越多的研究揭示了天然产物在治疗人类疾病中的巨大潜力,本文就近年来天然产物基于细胞自噬改善AS的研究进行综述。

关键词：动脉粥样硬化自噬天然产物

泛肽交联酶(E2)通过苯丙氨酸解氨酶基因启动子参与水稻对紫外光的防护(英文)

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Journal of Integrative Plant Biology 2003年第11期45卷 1351-1358页

作者：彭日荷姚泉洪熊爱生范惠琴李贤彭友良上海201106 上海市农业科学院生物技术研究中心农业遗传育种重点实验室中国农业大学植物病理系上海201106 中国农业大学植物病理系北京100094

迄今为止,诱导苯丙类化合物和黄酮类化合物合成并造成类黄酮的积累被认为是植物抵御紫外光的惟一主要的途径。苯丙氨酸解氨酶(PAL)是苯丙类化合物合成的关键酶。通过体内足印试验表明,在pal-1基因启动子中有一段序列CTCCAACAACCCCTTC可... 详细信息

迄今为止,诱导苯丙类化合物和黄酮类化合物合成并造成类黄酮的积累被认为是植物抵御紫外光的惟一主要的途径。苯丙氨酸解氨酶(PAL)是苯丙类化合物合成的关键酶。通过体内足印试验表明,在pal-1基因启动子中有一段序列CTCCAACAACCCCTTC可以作为顺式元件参与紫外信号的传递。为了克隆与其相对应的反式因子,我们使用了酵母单杂交体系进行筛选。在鱼饵质粒中,我们将3个拷贝的顺式元件序列串联并与酵母异细胞血红素C(CYC)基本启动子连接。将鱼饵质粒和水稻cDNA表达质粒库共同转化到同一酵母中,通过筛选鉴定,克降到一些编码泛肽交联酶(E2)基因。氦基酸同源性分析表明,该酶E2(RE2)与其他物种的泛肽交联酶具有很高的同源性。水稻泛肽交联酶受紫外光诱导加速合成。当RE2与水稻核蛋白进行交联反应后能与pal-1基因中顺式元件CTCCAACAACCCCTTC专一结合。从这些结果可以推测水稻泛肽交联酶RE2可能通过苯丙类化合物的合成代谢参与对紫外光的防护。

关键词：水稻泛肽交联酶紫外防护顺式元件酵母单杂交体系

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PCR技术在植物病原细菌研究中的应用

微生物学通报 2002年第4期29卷 77-81页

作者：姬广海张世光魏兰芳云南农业大学云南省植物病理重点实验室昆明650201 云南农业大学资源与环境学院昆明650201

利用rep-PCR、AFLP和RAPD等多种基因组指纹分析方法,指纹图谱结合计算机辅助分析,用于研究植物病原细菌群体遗传多样性;遗传多样性图谱有助于理解病原细菌的分类、群体结构,还有利于设计特异、灵敏、快速检测策略用于植物病原检测和病... 详细信息

利用rep-PCR、AFLP和RAPD等多种基因组指纹分析方法,指纹图谱结合计算机辅助分析,用于研究植物病原细菌群体遗传多样性;遗传多样性图谱有助于理解病原细菌的分类、群体结构,还有利于设计特异、灵敏、快速检测策略用于植物病原检测和病害诊断。已有许多以PCR为基础的检测技术如rDNA-PCR、ITS-PCR、ARDRA等,有很多特异性引物及检测程序,已在植物病原检测和病害诊断中广泛应用。PCR技术的应用和计算机的辅助分析,为植物病原细菌群体动态和生态学知识提供了基本框架,使植物病理学进入一个新时代。

关键词： PCR技术植物病原细菌研究应用病害诊断

基于NP基因序列的云南烟草番茄环纹斑点病毒群体遗传多样性分析

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植物病理学报 2024年第3期54卷 512-521页

作者：赵正婷盖晓彤张俊蕾夏振远马俊红刘雅婷姜宁云南省烟草农业科学研究院昆明650021 云南农业大学农学与生物技术学院昆明650201 云南农业大学植物保护学院昆明650201 云南农业大学烟草学院昆明650201

为探明云南烟草上番茄环纹斑点病毒(tomato zonate spot virus,TZSV)的发病情况及群体遗传多样性特征,本研究使用核壳体蛋白(nucleocapsid protein,NP)基因的特异性引物对采自云南各烟区的560份烟草斑萎病样品进行检测,对部分阳性样本... 详细信息

为探明云南烟草上番茄环纹斑点病毒(tomato zonate spot virus,TZSV)的发病情况及群体遗传多样性特征,本研究使用核壳体蛋白(nucleocapsid protein,NP)基因的特异性引物对采自云南各烟区的560份烟草斑萎病样品进行检测,对部分阳性样本的NP基因进行克隆测序,并对获得的序列进行系统发育、遗传变异、群体多样性等分析。RT-PCR结果显示,560份样品中共有262个检出TZSV,平均阳性检出率为46.8%;重组分析在DX_LJHP_65分离物基因序列中检测到显著的重组信号;系统发育分析显示129个TZSV分离物在进化上可以分为6个组,相同地区来源的分离物倾向于相聚成簇,表明该病毒在进化上具有较强的地理特异性;错配分布分析结果,云南TZSV群体呈多峰分布,表明该群体近期未经历群体扩张事件;种群间遗传分化分析结果表明,滇西和滇东北与其他群体之间基因交流频率很低,其余种群间存在频繁的基因交流。本研究是对云南各烟区TZSV分离物群体遗传变异情况的首次报道,研究结果可为防控TZSV提供重要参考。

关键词：烟草番茄环纹斑点病毒 NP基因遗传变异遗传多样性