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LAMA3 DNA甲基化对卵巢上皮性癌铂耐药及预后影响的生物信息学和临床分析

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中华妇产科杂志 2024年第6期59卷 454-464页

作者：陈昌贤张伊黎黄勇志李力广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科暨区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室南宁

目的探讨层粘连蛋白α3(LAMA3)DNA甲基化对卵巢上皮性癌(卵巢癌)铂耐药及预后的影响及可能的机制。方法 (1)通过数据库中生物信息学数据分析LAMA3 DNA甲基化水平与卵巢癌铂耐药的关系。(2)选取2000年1月至2012年12月在广西医科大学附属... 详细信息

目的探讨层粘连蛋白α3(LAMA3)DNA甲基化对卵巢上皮性癌(卵巢癌)铂耐药及预后的影响及可能的机制。方法 (1)通过数据库中生物信息学数据分析LAMA3 DNA甲基化水平与卵巢癌铂耐药的关系。(2)选取2000年1月至2012年12月在广西医科大学附属肿瘤医院诊治的卵巢癌患者共67例(包括铂耐药组35例和铂敏感组32例), 采用焦磷酸测序技术检测两组卵巢癌组织中LAMA3 DNA甲基化水平, 探讨其对卵巢癌患者铂耐药及预后的诊断效能, 并进一步分析其对卵巢癌铂耐药患者化疗效果及预后的影响。结果 (1)从基因互作检索平台(STRING)数据库中筛选出与LAMA3高度互作的10个蛋白, 包括层粘连蛋白β(LAMB)3、层粘连蛋白γ(LAMC)3、整合素α(ITGA)6、整联蛋白β4(ITGB4)、ITGA3、LAMC1、LAMB2、肌营养不良蛋白关联糖蛋白1(DAG1)、LAMB1、17型胶原蛋白α1链(COL17A1)蛋白;京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析显示, LAMA3及其相关互作蛋白通过细胞凋亡、细胞周期、DNA损伤反应、上皮间质转化(EMT)、雄激素受体(AR)、雌激素受体(ER)、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)、大鼠肉瘤癌基因(RAS)/有丝分裂原活化蛋白激酶(MAPK)、受体酪氨酸激酶(RTK)、结节性硬化症蛋白复合体(TSC)/雷帕霉素靶蛋白(mTOR)等信号通路, 参与恶性肿瘤发生、发展过程的调控, 其表达水平与卵巢癌顺铂等化疗药物的敏感性相关。(2)本院临床数据分析发现, 铂耐药组、铂敏感组卵巢癌组织中LAMA3 DNA甲基化水平分别为71%(25/35)、69%(22/32), 两组比较, 差异无统计学意义(χ2=0.057, P=0.811);LAMA3 DNA甲基化水平判断卵巢癌铂耐药的曲线下面积(AUC)为0.601, 预测患者预后的AUC值为0.686。LAMA3 DNA高甲基化铂耐药卵巢癌患者(24例)的化疗效果较低甲基化铂敏感患者(15例)更差[有效率分别为50%(12/24)和15/15;χ2=10.833, P=0.001], 且LAMA3 DNA甲基化水平对卵巢癌患者的无进展生存时间和总生存时间均有显著影响(P均<0.05)。结论 LAMA3 DNA甲基化水平对卵巢癌患者的铂耐药及预后具有一定的诊断和预测价值, 可能与卵巢癌的调控机制、铂耐药及预后存在密切联系。

关键词：卵巢上皮癌顺铂抗药性, 肿瘤层粘连蛋白 DNA甲基化预后计算生物学

乡村旅游从业者的声景体验对其健康的影响研究

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地理研究 2024年

作者：寇力容邹佳珊李梓杨徐红罡中山大学旅游学院旅游可持续智能评测技术文旅部重点实验室

乡村旅游是人们逃离拥挤嘈杂的城市空间、回归质朴安静的乡村空间的重要方式。尽管声音对健康影响已被多个学科领域证明，但较少研究关注乡村空间中多源声音对人们健康的影响。乡村旅游发展带来了噪音问题，但乡村声景也是重要健康资源... 详细信息

乡村旅游是人们逃离拥挤嘈杂的城市空间、回归质朴安静的乡村空间的重要方式。尽管声音对健康影响已被多个学科领域证明，但较少研究关注乡村空间中多源声音对人们健康的影响。乡村旅游发展带来了噪音问题，但乡村声景也是重要健康资源，却尚未被重视和利用。基于此，本文以宏村为例，关注处于嘈杂工作环境下的乡村旅游从业者，采用深度访谈与GIS相结合的混合研究方法，基于流动性视角和赋能资源框架，探究不同时空场景下乡村声景对旅游从业者健康的影响机制。结果表明：(1)乡村声景具有时空动态性，在乡村空间的夜晚和白天声音来源和分贝水平存在差异。(2)乡村旅游从业者的经营动机影响其在乡村空间中工作、居住、休闲和社交的时空安排，进而影响其乡村声景体验，从而差异化影响其健康。(3)乡村旅游从业者对乡村声音作为资源的认知和时空流动能力，影响其在乡村空间下开展多元活动的时空流动特点，并动态影响其所体验的乡村声景与健康之间关系。对乡村空间中声景体验与健康的深入分析，旨在从听觉视角丰富乡村资源开发方式、提升乡村健康人居环境，为乡村旅游地的可持续发展提供参考。

关键词：乡村旅游旅游小企业声音声环境时空流动健康

慢性低氧胁迫下虹鳟和硬头鳟生长、生化指标和基因表达的比较研究

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水生生物学报 2024年

作者：陈晓群周演根贾坤同刘荣欣杨小刚高勤峰董云伟董双林中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室中山大学香港科技大学

为比较低氧胁迫对虹鳟、硬头鳟生长、血清生化指标、肝脏抗氧化酶活性和基因表达的影响,研究设置4个处理组:虹鳟常氧组(R-CT)、虹鳟低氧组(R-HY)、硬头鳟常氧组(S-CT)和硬头鳟低氧组(S-HY),养殖周期为30d。结果显示:低氧胁迫显著降低了... 详细信息

为比较低氧胁迫对虹鳟、硬头鳟生长、血清生化指标、肝脏抗氧化酶活性和基因表达的影响,研究设置4个处理组:虹鳟常氧组(R-CT)、虹鳟低氧组(R-HY)、硬头鳟常氧组(S-CT)和硬头鳟低氧组(S-HY),养殖周期为30d。结果显示:低氧胁迫显著降低了虹鳟和硬头鳟的增重率、摄食量、特定增长率和热生长系数,且两种鱼间不存在显著差异。在低氧环境下,虹鳟血糖(GLU)水平减少、血清乳酸脱氢酶(LDH)水平增加;而硬头鳟GLU水平增加、血清LDH水平减少,表明低氧胁迫激活虹鳟肝脏糖酵解以应对自身能量供应短缺,而硬头鳟糖酵解被抑制。低氧胁迫分别显著降低了虹鳟血清谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、碱性磷酸酶(ALP)和硬头鳟血清ALP水平,表明虹鳟和硬头鳟代谢反应受到显著影响。低氧胁迫分别激活虹鳟肝脏过氧化氢酶(CAT)和硬头鳟肝脏超氧化物歧化酶(SOD)及CAT活性,暗示硬头鳟活性氧(ROS)清除能力优于虹鳟。综合生物标志物响应(IBR)指数结果显示:R-HY组(6.61)>S-HY组(5.94)>S-CT组(0.43)>R-CT组(0.37),表明低氧胁迫下虹鳟存活能力低于硬头鳟。低氧胁迫分别激活虹鳟肝脏血管生长因子(VEGF)和硬头鳟肝脏VEGF、葡萄糖转运蛋白1 (GLUT1) mRNA表达,表明两者HIF-1信号通路低氧响应有所不同。综上,在慢性低氧条件下(4.08±0.45 mg/L),硬头鳟的耐低氧能力优于虹鳟,且两种不同生活型鲑的生理响应存在差异。

关键词：低氧胁迫生化指标基因表达虹鳟硬头鳟

离散Boltzmann方程的求解:基于有限体积法

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物理学报 2024年第11期73卷 70-79页

作者：孙佳坤林传栋苏咸利谭志城陈亚楼明平剑中山大学中法核工程与技术学院珠海519082 清华大学能源与动力工程系热科学与动力工程教育部重点实验室北京100084 新加坡国立大学机械工程系新加坡119260

近十年来,离散Boltzmann方法在复杂非平衡流体系统领域的应用取得了显著的进展,这种方法已逐步成为描述和预测流体系统行为的重要手段.该方法的控制方程是一套简单统一的离散Boltzmann方程,其离散格式的选取对于数值模拟的计算精度和稳... 详细信息

近十年来,离散Boltzmann方法在复杂非平衡流体系统领域的应用取得了显著的进展,这种方法已逐步成为描述和预测流体系统行为的重要手段.该方法的控制方程是一套简单统一的离散Boltzmann方程,其离散格式的选取对于数值模拟的计算精度和稳定性有着直接影响.为了提高数值模拟的可靠性,本文引入有限体积法用于求解离散Boltzmann方程.有限体积法是一种常用的数值计算方法,具有守恒性强、精度高等特点,可用于有效处理高速可压缩流体的数值计算问题.本文采用MUSCL格式进行重构,并引入了通量限制器以提高数值计算的稳定性.最后,对基于有限体积的离散Boltzmann方法进行了验证,数值算例包括冲击波、Lax激波管以及声波.结果表明,该方法能够准确刻画冲击波、稀疏波、声波,以及物质界面的演化,同时确保系统的质量、动量和能量守恒,还可以准确测量流体系统的流体力学和热力学非平衡效应.

关键词：离散Boltzmann方法有限体积法非平衡效应可压缩流

大黄素干预胰岛素生长因子受体诱导胃癌细胞凋亡的作用机制

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中药药理与临床 2024年

作者：王燕如王超刘秀珠郭晴阳李佳蔚靳晓杰刘永琦甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室医学院山西大同大学敦煌医学与转化教育部重点实验室

目的：探究大黄素干预胰岛素生长因子受体（IGF1R）治疗胃癌（gastric cancer）的作用机制。方法：基于数据库预测大黄素和胃癌的潜在靶点。采用蛋白互作分析（PPI）得到大黄素治疗胃癌的核心靶点，并分析其与IGF1R的联系。DAVID、Cytos... 详细信息

目的：探究大黄素干预胰岛素生长因子受体（IGF1R）治疗胃癌（gastric cancer）的作用机制。方法：基于数据库预测大黄素和胃癌的潜在靶点。采用蛋白互作分析（PPI）得到大黄素治疗胃癌的核心靶点，并分析其与IGF1R的联系。DAVID、Cytoscape数据库进行基因本体（GO）和通路富集分析；Schr?dinger进行分子对接和结合自由能计算；采用CCK8法检测大黄素对细胞活力的影响；采用HE、4’，6二脒基-2-苯基吲哚（DAPI）染色及流式细胞术检测凋亡；免疫荧光检测、ELISA法和蛋白免疫印迹（WB）检测大黄素对IGF1R及调控的通路蛋白的影响。结果：网络药理学结果显示IGF1R可能是大黄素作用的关键靶点，大黄素调控的主要生物过程（BP）是细胞增殖、凋亡过程的负调控等；主要细胞组成（CC）是核质、细胞核等；主要分子功能（MF）是类固醇结合、雌激素受体的活动等；主要调控的通路是P53信号通路、癌症的蛋白聚糖信号通路和PI3K-AKT信号通路等，其中IGF1R/磷酸肌醇依赖性蛋白激酶-1（PDK1）是癌症的蛋白聚糖信号通路中关键的一环，与细胞增殖和凋亡的调控有关。分子对接和结合自由能计算验证大黄素与IGF1R有较好的结合力。体外细胞实验验证显示，大黄素可呈剂量和时间依赖性抑制MKN-45细胞活力；大黄素可诱导MKN-45细胞凋亡，并显著降低p-IGF1R及其下游PDK1、p-PDK1蛋白的表达（P <0.05或P <0.01）。结论：IGF1R是大黄素治疗胃癌的关键作用靶点，大黄素可诱导胃癌细胞的凋亡、抑制增殖，其作用机制可能与抑制IGF1R/PDK1信号通路有关。

关键词：大黄素胃癌胰岛素生长因子受体凋亡增殖

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抗氧化剂硫辛酸抑制煤自燃效果及机理研究

中国矿业大学学报 2024年第3期53卷 534-545页

作者：高飞蒲锌格贾喆辽宁工程技术大学安全科学与工程学院辽宁工程技术大学矿山热动力灾害与防治教育部重点实验室

为了研究抗氧化剂硫辛酸（LA）对煤氧化自燃的阻化作用，采用程序升温试验探究LA对煤自燃倾向的影响并对比LA与氯盐阻化剂的阻化效果；通过电子自旋共振能谱（ESR）和傅里叶红外光谱（FTIR）等方法分析加入LA前后煤中的自由基类型、浓... 详细信息

为了研究抗氧化剂硫辛酸（LA）对煤氧化自燃的阻化作用，采用程序升温试验探究LA对煤自燃倾向的影响并对比LA与氯盐阻化剂的阻化效果；通过电子自旋共振能谱（ESR）和傅里叶红外光谱（FTIR）等方法分析加入LA前后煤中的自由基类型、浓度及表面官能团的变化.试验结果表明：不同质量分数的LA（1%,2%,3%和4%）均可以抑制煤的自燃进程，经过质量分数为3%的LA处理后煤样的CO释放浓度和耗氧量均最小且阻化效果要明显优于相同质量分数下的物理阻化剂CaCl2和MgCl2;煤样经LA和MgCl2处理后，煤氧化过程中自由基类型、反应活性及相对浓度均低于原煤，2种阻化剂均可抑制煤氧化过程中-CH3和-CH2-的反应，减少-C=O和-OH的生成.但无论从阻化的效果，还是阻化的温度范围来说，LA的抑制效果始终强于MgCl2,并且2种阻化剂的作用机理不同.MgCl2是在80℃之前通过隔氧保湿作用阻化煤氧化反应的，LA是通过降低反应中自由基的类型及相对浓度，从根本上抑制自由基链式反应的引发及进行.根据试验结果推断：氧化型ALA和还原型DHLA均可作为氢供体，不断消耗煤氧化过程中的羟基自由基和过氧自由基，中和游离的碳自由基和碳氧自由基，从而降低整个链式反应过程中自由基的浓度和反应活性，阻断煤氧复合反应的发生.

关键词：煤自燃硫辛酸电子自旋共振能谱傅里叶红外光谱

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人-地系统动力学耦合模型研究的评述与展望

科学通报 2024年

作者：董文杰延晓冬丑洁明北京师范大学环境演变与自然灾害教育部重点实验室中山大学大气科学学院

人-地系统动力学耦合模型研究是当前全球变化与地球系统科学领域的前沿科学问题,为可持续发展提供重要理论基础和研究工具.本文回顾总结了目前国内外“人-地系统耦合模型”的研究状况,分析认为:目前已有的人-地系统动力学耦合模型只是... 详细信息

人-地系统动力学耦合模型研究是当前全球变化与地球系统科学领域的前沿科学问题,为可持续发展提供重要理论基础和研究工具.本文回顾总结了目前国内外“人-地系统耦合模型”的研究状况,分析认为:目前已有的人-地系统动力学耦合模型只是将人类社会经济系统模型和地球系统模式在计算机载体上的模拟耦合;这类耦合模型工作在全球变暖、未来CO2排放趋势、土地利用变化、经济反馈方面取得了重要进展,但仍存在系统间反馈过程复杂性刻画不明确、时空尺度不匹配、极端事件的模拟能力差等难题;攻克以上难题,需要发展多样化反馈过程、采用中等复杂程度的地球系统建模思想、应用反映真实供求关系形成的狭义均衡化人类系统模型和极端事件响应化的人地系统耦合模型、构建统一数据集进行集合模拟试验.人-地系统动力学耦合模型的研究将为科学制定气候变化适应政策提供科学依据,有利于推动我国跻身地球系统科学的国际前沿.

关键词：气候变化人-地系统反馈过程复杂性耦合模型适应

一株中华稻蝗内生真菌Fusarium lateritium ZMT01的代谢产物

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中山大学学报（自然科学版）（中英文） 2024年第1期63卷 71-77页

作者：房豪东黄子辉李苏柠黎杨倩佘志刚熊亚红李春远华南农业大学材料与能源学院/生物基材料与能源教育部重点实验室广东广州510642 中山大学化学学院广东广州510275

研究一株中华稻蝗内生真菌Fusarium lateritium ZMT01的代谢产物,采用大米培养基发酵真菌,色谱技术分离纯化单体,波谱分析鉴定结构,共从发酵物中分离鉴定了10个化合物:fusopoltide A(1)、fusopoltide B(2)、fusopoltide D(3)、solaniol... 详细信息

研究一株中华稻蝗内生真菌Fusarium lateritium ZMT01的代谢产物,采用大米培养基发酵真菌,色谱技术分离纯化单体,波谱分析鉴定结构,共从发酵物中分离鉴定了10个化合物:fusopoltide A(1)、fusopoltide B(2)、fusopoltide D(3)、solaniol(4)、javanicin(5)、(1S,4S,10S)-3,4-dihydro-6,9-dihydroxy-8-methoxy-10(-2-oxopropyl)-1,4-methano-2-benzoxepin-5(1H)-one(6)、2,2′‐methylenebis(4‐methyl‐6‐tert‐butylphenol)(7)、2-hydroxymethyl-5-isopropoxy-4-methoxynaphthalen(8)、β-sitosterol(9)和walterolactone A(10)。其中化合物8、10为首次从Fusarium属中得到,除化合物9外,其他化合物为首次从Fusarium lateritium中分离到。采用二倍稀释法测试抗菌活性,结果显示化合物4和5对O6血清型大肠杆菌Escherichia coli有强抑制活性,MIC为6.25μg/mL,化合物4对尖孢镰孢菌Fusarium oxysporum显示中等抑菌活性,MIC为200μg/mL。

关键词：内生真菌砖红镰刀菌代谢产物抗菌活性

甘草黄酮A对低氧条件下胃癌细胞增殖和糖酵解的影响

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中国实验方剂学杂志 2024年第13期30卷 120-127页

作者：董焕成苏韫龚红霞曹旺杰袁敏捷刘永琦黄勇甘肃中医药大学基础医学院甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究省级重点实验室敦煌医学与转化教育部重点实验室兰州730000

目的:探讨低氧条件下甘草黄酮A对胃癌细胞增殖和糖酵解的影响。方法:筛选人胃癌AGS细胞予以5%O2低氧环境培养48 h,分为5组:常氧组、低氧组、甘草黄酮A高、中、低浓度组(100、50、25μmol·L^(-1))。细胞增殖与活性检测(CCK-8)法和克隆... 详细信息

目的:探讨低氧条件下甘草黄酮A对胃癌细胞增殖和糖酵解的影响。方法:筛选人胃癌AGS细胞予以5%O2低氧环境培养48 h,分为5组:常氧组、低氧组、甘草黄酮A高、中、低浓度组(100、50、25μmol·L^(-1))。细胞增殖与活性检测(CCK-8)法和克隆形成实验检测甘草黄酮A对低氧条件下AGS细胞增殖的影响;划痕实验检测细胞迁移情况,蛋白免疫印迹法(Western blot)和实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测AGS细胞中低氧诱导因子-1α(HIF-1α)、葡萄糖转运蛋白1(GLUT1)、乳酸脱氢酶A(LDHA)、丙酮酸激酶M2(PKM2)、己糖激酶Ⅱ(HK2)的蛋白及mRNA表达水平。试剂盒检测葡萄糖摄取和HK的活性的表达情况。结果:CCK-8法实验结果表明,与低氧组比较,24 h时,甘草黄酮A高、中浓度组AGS细胞的增殖率显著降低(P实验结果表明,与常氧组比较,低氧组AGS细胞克隆形成数显著升高(P实验表明,与常氧组比较,低氧组的AGS细胞迁移的能力升高(P<0.01);与低氧组比较,甘草黄酮A高、中、低浓度组的AGS细胞各个时间段迁移细胞的能力显著降低(P<0.01)。Real-time PCR表明,与常氧组比较,低氧组GLUT1、LDHA、PKM2和HK2 mRNA明显升高(P<0.05,P<0.01);与低氧组比较,甘草黄酮A高浓度组GLUT1、LDHA、PKM2、HK2 mRNA,甘草黄酮A中浓度组GLUT1、LDHA、HK2 mRNA、甘草黄酮A低浓度组HK2 mRNA明显降低(P<0.05,P<0.01)。Western blot表明,与常氧组比较,低氧组HIF-1α、GLUT1、LDHA、PKM2和HK2蛋白的表达明显升高(P<0.05,P<0.01);与低氧组比较,甘草黄酮A高浓度组的HIF-1α、GLUT1、LDHA、PKM2和HK2蛋白的表达明显降低(P<0.05,P<0.01),甘草黄酮A中、低浓度的HK2蛋白的表达明显降低(P<0.05,P<0.01)。试剂盒检测葡萄糖摄取及HK活性结果表明,与常氧组比较,低氧组葡萄糖的摄取和HK的含量表达升高(P<0.01),与低氧组比较,甘草黄酮A高浓度组葡萄糖的摄取和HK的含量表达及甘草黄酮A中浓度组HK的含量表达降低(P<0.01)。结论:甘草黄酮A可以抑制低氧条件下AGS细胞的增殖,其作用机制可能与抑制胃癌的糖酵解有关。

关键词：甘草黄酮A 胃癌低氧糖酵解增殖