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以EV71 3C^(pro)为靶标的抗病毒药物筛选模型的建立及抗3C^(pro)化合物筛选

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生物化学与生物物理进展 2017年第9期44卷 776-782页

作者：曾施暖李倩雯潘婷孟小斌黄清苑郭学敏中山大学中山医学院人类病毒学研究所广州510080 梅州市人民医院梅州514031

建立一种以EV71 3C蛋白酶为靶标的抗肠病毒药物筛选模型,并应用于小分子化合物库筛选具有抗EV71活性的化合物.从临床手足口病例标本中分离肠道病毒进行PCR鉴定及基因组测序.通过插入突变在黄色荧光YFP编码框合适位点处引入EV71 3C酶切位... 详细信息

建立一种以EV71 3C蛋白酶为靶标的抗肠病毒药物筛选模型,并应用于小分子化合物库筛选具有抗EV71活性的化合物.从临床手足口病例标本中分离肠道病毒进行PCR鉴定及基因组测序.通过插入突变在黄色荧光YFP编码框合适位点处引入EV71 3C酶切位点,构建对3C蛋白酶敏感的报告质粒pc DNA3-m YFP,然后将其与表达3C的质粒共转293A细胞,在3C抑制剂Rupintrivir存在与否的情况下通过荧光显微镜和酶标仪检测Ex(500nm)/Em(535nm)荧光信号的变化,判断建模是否成功;利用建好的筛选模型在高通量药物筛选平台对小分子化合物库进行初筛和复筛;再利用空斑分析检测筛选出的活性化合物是否对临床分离的EV71毒株具有抑制作用.m YFP在293A细胞中表达良好,3C的表达使荧光信号下降80%,Rupintrivir的存在则几乎不影响荧光表达,说明以3C为靶位的筛选模型构建成功.经过高通量初筛和复筛从26 000多种小分子化合物中获得26种能够显著回复m YFP表达的活性化合物;空斑分析显示其中2种化合物具有较为明显的抑制EV71复制的活性.因此,我们所构建的3C-m YFP共表达系统是一种简便有效的、可用于高通量筛选抗EV71 3C^(pro)药物的筛选模型.

关键词：手足口病肠道病毒71型 3C蛋白酶高通量筛选抗病毒药物

抑制RORγt活性及Th17分化的新型化合物研究

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免疫学杂志 2015年第6期31卷 476-480,490页

作者：丁庆峰赵梅黄朝峰中山大学中山医学院人类病毒学研究所广州510080

目的我们在实验中偶然发现了一种能抑制RORγt活性的新型化合物,拟通过鉴定该化合物对Th17体外分化及其细胞因子分泌的影响对其进行生物学评价,以确定该化合物是否可作为一种新型的自身免疫病候选药物。方法构建能在Jurkat细胞中稳定表... 详细信息

目的我们在实验中偶然发现了一种能抑制RORγt活性的新型化合物,拟通过鉴定该化合物对Th17体外分化及其细胞因子分泌的影响对其进行生物学评价,以确定该化合物是否可作为一种新型的自身免疫病候选药物。方法构建能在Jurkat细胞中稳定表达Gal4-RORγt的荧光素酶报告系统,通过该体系发现了一种对RORγt有显著抑制活性的新型化合物,并在小鼠Th17细胞分化实验中对该化合物的作用效果进行体外验证。在此基础上,对该化合物进行生物功能分析,包括EC50、CC50的测定以及T细胞特异性分析。结果通过体外验证实验,我们确定该化合物(编号为compound 2)能显著的抑制Th17分化及其细胞因子IL-17A、IL-17F的表达和分泌。在后续的生物学评价中,我们还发现该化合物对RORγt有较高的抑制效率,较低的细胞毒性和较强的T细胞特异性。结论本研究中得到的化合物compound 2可作为一种潜在的新型前导化合物应用于治疗自身免疫性疾病和一些炎症性疾病。

关键词：新型化合物 RORγt Th17分化自身免疫病

GDF11在体外扩增CD8^+记忆干性T细胞的作用

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中国病理生理杂志 2016年第4期32卷 762-768页

作者：马星如陈颖诗林颖彤张旭罗海华刘超潘婷中山大学中山医学院人类病毒学研究所广东广州510080

目的:探讨生长分化因子11(GDF11)在体外诱导扩增具有干细胞特性的记忆性T细胞(memory stem T cells,Tscm)中的作用,从而进一步提高免疫过继治疗的疗效。方法:通过密度梯度离心的方法分离健康人的外周血单个核细胞,然后用磁珠分选获得CD8... 详细信息

目的:探讨生长分化因子11(GDF11)在体外诱导扩增具有干细胞特性的记忆性T细胞(memory stem T cells,Tscm)中的作用,从而进一步提高免疫过继治疗的疗效。方法:通过密度梯度离心的方法分离健康人的外周血单个核细胞,然后用磁珠分选获得CD8^+T细胞;随后将所得的细胞分为实验组和对照组,实验组中加入等体积、不同浓度的GDF11,对照组中加入等体积的PBS缓冲液,最后分别在不同时点通过流式细胞术检测2组细胞中Tscm的扩增情况。结果:在CD8^+T细胞的体外扩增实验中,GDF11可以显著扩增CD8^+T细胞;在CD8^+T细胞的体外培养实验中,GDF11可以显著提高Tscm在CD8^+T细胞中的比例。结论:GDF11可以有效地在体外扩增CD8^+Tscm,为提高免疫过继治疗的效率提供了新的方法。

关键词：生长分化因子11 CD8+记忆干性T细胞过继免疫治疗

紫外交联合并串联亲和纯化高效鉴定蛋白复合物组分的RNA结合活性

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生物化学与生物物理进展 2014年第6期41卷 617-622页

作者：岳莎周淑如郭学敏中山大学中山医学院人类病毒学研究所热带病防治研究教育部重点实验室广州510080

RNA结合蛋白在RNA的生成与代谢中发挥着重要作用.我们在近年报道的PAR-CLIP(photoactivatableribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation)技术的基础上建立了一套快速、有效鉴定RNA结合蛋白的实验方法:以串联亲和纯化替代一步免疫沉淀获得高纯度蛋白-RNA复合物;将Sypro Ruby蛋白染色与RNA放射自显影相结合判断复合物中哪种或哪些组分为RNA结合蛋白,该方法命名为紫外交联合并的串联亲和纯化(cross-linkingand tandem affinity purification,CLiTAP).运用该方法对布氏锥虫的三种锌指蛋白ZC3H7、ZC3H34和ZC3H5进行分析,发现ZC3H7作为帽结合蛋白复合物的核心组分具有很强的RNA结合能力;ZC3H34结合RNA能力较弱,但其互作蛋白具有强的RNA结合活性;相比之下,ZC3H5及其复合物组分皆无RNA结合活性.这些结果表明,CLiTAP与蛋白质鉴定方法相结合,能够有效鉴定靶蛋白复合物中的RNA结合蛋白种类,也为进一步定位RNA结合位点、研究RNA结合蛋白的结构及作用机制奠定了基础.

关键词：紫外交联串联亲和纯化 RNA结合蛋白布氏锥虫 CCCH型锌指蛋白

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RORγt基因启动子的鉴定和特征分析

免疫学杂志 2013年第1期29卷 28-32页

作者：杨丽霞黄朝峰中山大学中山医学院人类病毒研究所广州510080

目的以RORγt转录起始位点5’上游4.8 kb基因序列为研究对象,初步鉴定分析是否存在RORγt单独的启动子,并且探讨β-Catenin/Tcf1信号途经对RORγt启动子转录活性的影响。方法用带有不同长度的5’上游基因的5个报告质粒,与pSV-40-renilla... 详细信息

目的以RORγt转录起始位点5’上游4.8 kb基因序列为研究对象,初步鉴定分析是否存在RORγt单独的启动子,并且探讨β-Catenin/Tcf1信号途经对RORγt启动子转录活性的影响。方法用带有不同长度的5’上游基因的5个报告质粒,与pSV-40-renilla Luc共转染Jurkat、EL-4、NIH 3T3和293T细胞系,与报告质粒的空载相比较,根据荧光强度的相对值的大小确定启动子存在的可能性和所在的位置;利用野生型β-Catenin、激活突变型β-Catenin和Tcf1表达质粒及RORγt启动子报告载体共转染,观察β-Catenin/Tcf1信号途径对RORγt启动子活性的影响。结果不同长度的启动子报告质粒在Jurkat、EL-4、NIH 3T3和293T细胞中均呈现启动子活性,其中所有报告质粒在Juakat和EL-4等T细胞系中的活性均高于其他2个上皮细胞系,而RORγt上游0.5 kb的报告质粒启动子活性在所有的细胞系中均呈最高活性。野生型β-Catenin、激活突变型β-Catenin和Tcf1对RORγt启动子报告有强激活作用。结论 RORγt转录表达由独立启动子控制,β-Catenin/Tcf1信号途径能够增强该启动子的转录活性。

关键词： RORγt 启动子分析转录调控 β-Catenin Tcf1信号途径

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“精英控制者”开启治疗艾滋病新策略

中国科学基金 2021年第2期35卷 232-233页

作者：张辉周末中山大学人类病毒学研究所中山大学中山医学院

一小部分罕见的群体,在感染艾滋病毒后,能够长期在不使用抗病毒药物的情况下,控制艾滋病毒感染的进展,他们被称为"精英控制者"。2020年,一项针对64名艾滋病毒感染者的研究,揭示了他们的不寻常成功与病毒在其基因组中的定位之间的联系。...

一小部分罕见的群体,在感染艾滋病毒后,能够长期在不使用抗病毒药物的情况下,控制艾滋病毒感染的进展,他们被称为"精英控制者"。2020年,一项针对64名艾滋病毒感染者的研究,揭示了他们的不寻常成功与病毒在其基因组中的定位之间的联系。这些"特殊患者"多年来未曾使用抗逆转录病毒药物,并一直保持健康状态。这些新的理解虽然暂时无法达到治愈艾滋病的目标,但开辟了一种新的策略,使感染者能在不服用药物的情况下生存数十年。

关键词：

珠江三角洲城市群留鸟多样性格局及其驱动机制

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中山大学学报（自然科学版）（中英文） 2025年第1期64卷 218-227页

作者：叶俊宏刘珍环杨帆魏莱周义广东省粤北岩溶区碳水耦合野外科学观测研究站/中山大学地理科学与规划学院广东广州510006

鸟类是反映城市生境和生物多样性变化的重要指标,城市鸟类多样性分布格局模拟与预测是当前城市生物多样性保护研究中重点关注的难题。珠江三角洲城市群经历了快速的城市化过程,景观变化显著,给城市生境和生物多样性保护带来了巨大挑战... 详细信息

鸟类是反映城市生境和生物多样性变化的重要指标,城市鸟类多样性分布格局模拟与预测是当前城市生物多样性保护研究中重点关注的难题。珠江三角洲城市群经历了快速的城市化过程,景观变化显著,给城市生境和生物多样性保护带来了巨大挑战。为解析城市鸟类多样性与城市生境之间的空间关联机制,构建“单物种分布预测-物种多样性聚类-多样性的影响归因”的空间综合途径,开展珠江三角洲城市群留鸟空间格局与形成机制研究。结果表明:1)珠江三角洲城市群的87种留鸟构成的多样性与适宜性具有高度的城-乡梯度分布模式;将留鸟的空间适宜性聚类可分为8类,总体上留鸟的中高适宜区占比小于30%。2)结构方程模型的解析可以发现,人类活动显著地正向影响了鸟类多样性的空间分布格局,影响系数介于0.28~1.94;而植被、气候、地形的正向或负向效应差异明显。研究可为城市生物多样性保护,调控鸟类多样性的生境影响因素,开展城市生态建设与管理提供科学依据。

关键词：城市生物多样性鸟类 MaxEnt模型结构方程模型

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橡胶林内人类活动对海南山蛭种群数量的影响

中山大学学报（自然科学版） 2003年第1期42卷 27-30页

作者：谭恩光中山大学中山医学院广东广州510089

研究了海南岛橡胶林内人类的经济活动对海南山蛭Haemadipsahainana种群数量的影响。结果表明 ,橡胶园内牛群放牧使海南山蛭种群数量 1年内增加 3 43倍。化学除环山行杂草、化学全面积除杂草使山蛭种群数量在 1年内分别减少 2 9 82 %和 5... 详细信息

研究了海南岛橡胶林内人类的经济活动对海南山蛭Haemadipsahainana种群数量的影响。结果表明 ,橡胶园内牛群放牧使海南山蛭种群数量 1年内增加 3 43倍。化学除环山行杂草、化学全面积除杂草使山蛭种群数量在 1年内分别减少 2 9 82 %和 5 0 2 1%。除草剂混入杀蛭农药 ,使山蛭种群数量 1年内减少 73 0 2 %。科学的林段管理与控制山蛭数量相结合的措施 ,能更好控制山蛭数量。

关键词：海南山蛭 HaemadipsaHainana 种群数量海南岛

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多感官视角下城市居民滨江空间景观感知偏好

中山大学学报（自然科学版）（中英文） 2025年第1期64卷 182-194页

作者：朱战强李欢中山大学地理科学与规划学院广东广州510006 广东省公共安全与灾害工程技术研究中心广东广州510006

中国城镇化迈入人口城镇化的“下半场”,多感官下的居民景观感知与规划设计是近年空间感知分析与规划设计的热点。然而,现有研究多集中于视觉、听觉单一感官分析或双重感官分析,存在着对嗅觉、触觉等感官缺乏关注,以及对多感官结合分析... 详细信息

中国城镇化迈入人口城镇化的“下半场”,多感官下的居民景观感知与规划设计是近年空间感知分析与规划设计的热点。然而,现有研究多集中于视觉、听觉单一感官分析或双重感官分析,存在着对嗅觉、触觉等感官缺乏关注,以及对多感官结合分析关注很少的理论不足。本文以多感官感知为视角,以广州市滨江公共空间景观作为研究对象,将其分为“自然、人类/人类活动、人造/机械”3种景观要素及33个景观因素,通过构建感知增长率指数,对视觉、听觉、嗅觉和触觉4种感官下的不同类型滨江空间的居民景观感知特征进行评价。结果表明:不同景观要素下4种感官的感知相对敏感度不同,自然景观中嗅觉敏感,人类活动景观中听觉敏感,人造景观中触觉敏感。相对视觉和触觉而言,听觉和嗅觉下居民景观感知需求更容易被忽视。居民对自然声音和自然气味的景观要素感知期待仍需加强,而人类活动声和机械气味则不受欢迎。多感官下的景观要素感知特征在不同类型的公共空间下存在差异,广场和桥下/码头是重点改造空间,需特别关注避免电子设备声和交通噪声的干扰。最后形成了各滨江空间相应的感知设计指引。本文提出,集成多感官的居民景观感知分析可为城市滨江空间规划和设计提供实质性的参考。

关键词：多感官感知滨江空间景观要素偏好广州市

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