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基于中断时间序列分析评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响

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郑州大学学报（医学版） 2024年第4期59卷 459-463页

作者：李言言李鑫潇张冰洁薛晨路王永斌新乡医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室新乡453003

目的:使用中断时间序列分析方法评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响。方法:从河南省卫生健康委员会法定报告传染病系统中收集2013年1月至2022年9月手足口病发病数据。用河南省2013年1月至2019年6月手足口病发病数... 详细信息

目的:使用中断时间序列分析方法评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响。方法:从河南省卫生健康委员会法定报告传染病系统中收集2013年1月至2022年9月手足口病发病数据。用河南省2013年1月至2019年6月手足口病发病数据构建ARIMA预测模型,用2019年7月至2019年12月数据验证模型的预测效果。以该模型预测的2020年1月至2022年9月(疫情防控期间)手足口病发病数据为预测值,同期报告数据为真实值,采用阶跃变化、脉冲变化两种评价方法,分析疫情防控对手足口病发病的影响。结果:ARIMA(0,1,1)(0,1,1)12模型的MA1=0.43(t=3.14,P病发病数阶跃变化为-3471(95%CI为-11794~4852)例,估计的脉冲变化为每月9210(95%CI为3153~15268)例。结论:新冠病毒感染疫情防控降低了河南省手足口病发病水平。

关键词：中断时间序列分析自回归综合移动平均模型新冠病毒感染疫情手足口病河南省

NLRP3炎症小体在感染性疾病中的作用研究进展

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中国病原生物学杂志 2024年第11期19卷 1371-1376页

作者：高雪涵卫麟娜董品志陈晋柯源张浪浪王海燕覃明罗军敏遵义医科大学基础医学院免疫学教研室贵州遵义563000 遵义医科大学流行病学与卫生统计学教研室

核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(Nucleotide-bindingoligomerization domain-like receptor protein 3,NLRP3)是一类存在于胞浆中的大分子蛋白复合物,作为炎症反应的核心,能够感知外源性病原体和内源性危险信号,在多种感染性疾病的... 详细信息

核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(Nucleotide-bindingoligomerization domain-like receptor protein 3,NLRP3)是一类存在于胞浆中的大分子蛋白复合物,作为炎症反应的核心,能够感知外源性病原体和内源性危险信号,在多种感染性疾病的发生发展中发挥重要作用。因此,本文对NLRP3炎症小体的激活机制以及NLRP3炎症小体在感染性疾病中的研究进展予以综述,旨在为感染性疾病的治疗提供新的靶点。

关键词：固有免疫模式识别受体 NLRP3炎症小体感染性疾病综述

肺腺癌ceRNA调控网络构建及AFAP1-AS1功能验证

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中国胸心血管外科临床杂志 2024年第4期31卷 576-584页

作者：王会新李倩侯晓雯史新竹冯旭沈阳医学院公共卫生学院统计教研室沈阳110034 沈阳医学院公共卫生学院流行病学教研室沈阳110034

目的基于生物信息学方法构建肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)特异性长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,并分析肌动蛋白纤维相关蛋白1-反义RNA1(actinfilament-associated protein 1-antisense RNA1,AFAP1-AS1)在LUAD中的功能机制,以期为LUAD治疗靶点研究提供新的方向。方法从基因表达综合性基因库(GEO)中下载LUAD的基因芯片,并使用GEO2R在线软件筛选LUAD与正常组织之间具有差异表达的lncRNA和mRNA,并通过在线数据库预测其靶基因,构建ceRNA网络,并进行富集分析。在细胞实验中,对AFAP1-AS1进行基因敲除并构建siRNA,通过细胞转染法转染LUAD细胞A549。用CCK8、Transwell、划痕实验和流式细胞术实验检测细胞增殖、侵袭、迁移和凋亡的能力。结果在LUAD的芯片中共鉴定出6个差异表达lncRNA和494个差异表达的mRNA。ceRNA网络共涉及6个lncRNA、22个miRNA和55个mRNA。富集分析发现mRNA与癌症相关通路有关。在细胞实验中,敲除AFAP1-AS1可抑制细胞增殖、侵袭和迁移,且AFAP1-AS1促进细胞凋亡。结论本研究构建了一个lncRNA介导的ceRNA网络,这可能有助于进一步研究LUAD的作用机制。此外,通过细胞实验,本研究发现AFAP1-AS1有潜力作为LUAD的治疗靶点。

关键词：生物信息学肺腺癌竞争性内源RNA 长链非编码RNA 肌动蛋白纤维相关蛋白1-反义RNA1

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临床研究中混杂偏倚控制的原则和方法

中华内科杂志 2024年第8期63卷 734-738页

作者：徐博雅高银燕宋金璐吴心音中南大学湘雅公共卫生学院流行病与卫生统计学系长沙410015 湖南省临床流行病学重点实验室长沙410015

混杂偏倚是影响临床研究结果真实性的重要原因之一,需进行科学合理地控制。混杂偏倚的控制应贯穿临床研究设计和资料分析的全过程,针对已测量、未测量和无法测量混杂,存在不同的混杂控制方法。为进一步促进混杂控制在临床研究中的规范性... 详细信息

混杂偏倚是影响临床研究结果真实性的重要原因之一,需进行科学合理地控制。混杂偏倚的控制应贯穿临床研究设计和资料分析的全过程,针对已测量、未测量和无法测量混杂,存在不同的混杂控制方法。为进一步促进混杂控制在临床研究中的规范性,提高临床研究的方法学质量,满足临床实践和医学决策的需要,本文从混杂偏倚的定义和识别入手,梳理和归纳了临床研究中混杂偏倚控制的原则和方法。

关键词：混杂偏倚临床研究偏倚控制

基于两样本孟德尔随机化的失眠与2型糖尿病关联研究

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北京大学学报（医学版） 2024年第1期56卷 174-178页

作者：马雨佳卢燃藜周泽宸李晓怡闫泽玉武轶群陈大方北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系北京大学重大疾病流行病学教育部重点实验室北京100191

目的:为克服观察性研究中的混杂因素和反向因果关系的影响,通过两样本孟德尔随机化法探讨失眠与2型糖尿病之间的关联关系。方法:在欧洲裔人群最新的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)中选择与失眠密切相关的遗传位... 详细信息

目的:为克服观察性研究中的混杂因素和反向因果关系的影响,通过两样本孟德尔随机化法探讨失眠与2型糖尿病之间的关联关系。方法:在欧洲裔人群最新的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)中选择与失眠密切相关的遗传位点作为工具变量。剔除与吸烟、体育活动、饮酒、教育程度、肥胖或2型糖尿病显著相关的位点后,使用逆方差加权评估失眠对2型糖尿病的效应,并采用加权中位数法和MR-Egger回归分析来检验结果的稳健性。通过计算F统计量来检验工具变量的适用性,F统计量大于10认为存在弱工具变量偏倚可能性较小。采用MR-Egger回归进行多效性检验。此外,采用留一法(leave-one-out)进行敏感性分析,以进一步验证结果的稳定性和可靠性。结果:在全基因组水平上选择了248个与失眠独立相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)作为候选工具变量集合,基于千人基因组计划对候选工具变量集合进行修剪并剔除潜在的多效SNPs后,共纳入与失眠相关的167个SNPs作为最终的工具变量。本研究中F统计量为39.74,符合孟德尔随机化的相关性假设。逆方差加权法发现失眠与2型糖尿病的发生风险较高,在失眠的人群中发生2型糖尿病的风险是无失眠人群的1.14倍(95%CI:1.09~1.21,P病存在正向关联。多效性检验表明结果受多效性影响的可能性较小,敏感性分析支持研究结果的可靠性与稳定性。结论:失眠是2型糖尿病的危险因素,失眠与2型糖尿病发病存在正向关联,本研究为糖尿病高危人群保持健康的生活方式提供了进一步的理论依据。

关键词：入睡和睡眠障碍糖尿病,2型孟德尔随机化分析

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不同亚型妊娠期糖尿病与胰岛素水平对新生儿出生体质量的交互作用

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疾病监测 2024年

作者：沈海红黄满仙蒲柳艳顾雷君迪丽亚尔·艾尼宛邱逸文黄烨吴金华浙江大学公共卫生学院流行病学与卫生统计室舟山市妇女儿童医院

目的阐明不同亚型妊娠期糖尿病(GDM)与胰岛素水平对新生儿出生体质量的共同作用，为GDM孕妇的孕期管理提供循证依据。方法采用前瞻性队列研究设计，以2022年1月—2023年5月在浙江省舟山市妇女儿童医院建册并符合标准的孕妇为研究对象... 详细信息

目的阐明不同亚型妊娠期糖尿病(GDM)与胰岛素水平对新生儿出生体质量的共同作用，为GDM孕妇的孕期管理提供循证依据。方法采用前瞻性队列研究设计，以2022年1月—2023年5月在浙江省舟山市妇女儿童医院建册并符合标准的孕妇为研究对象，收集孕妇社会人口学、婚育史和饮食营养等信息，在孕中期进行口服葡萄糖耐量试验并检测空腹胰岛素水平，随访新生儿生长发育信息。采用线性回归模型分析胰岛素指标与出生体质量的关联；采用多分类Logistic回归模型分析胰岛素指标与低出生体质量、巨大儿的关联，并根据是否患有GDM对孕妇进行分组，分析组内胰岛素指标与出生体质量的关联；采用叉生分析探索GDM亚型和胰岛素抵抗对出生体质量的交互作用。结果调整孕妇年龄、分娩孕周、孕次和产次后，孕妇胰岛素水平和胰岛素抵抗指数均与新生儿出生体质量呈正相关(胰岛素水平：β=3.015±1.210，P=0.013；胰岛素抵抗指数：β=14.986±5.237，P=0.004)。在调整孕前体质量指数和孕期增重后，孕妇胰岛素分泌指数与出生体质量呈负相关(β=-0.061±0.031，P=0.046)；根据是否患有GDM分组，仅非GDM孕妇中存在与上述相似关联。高胰岛素水平(≥75.00%)和胰岛素抵抗(≥75.00%)分别与巨大儿发生率呈正相关[高胰岛素水平：比值比(OR)=2.030，95%置信区间(CI)：1.080～3.830，P=0.028；胰岛素抵抗：OR=3.690，95%CI：1.910～5.950，P=0.002]。未发现GDM亚型和胰岛素抵抗对出生体质量存在交互作用(P交互>0.05)。结论孕妇胰岛素抵抗、胰岛素分泌和整体胰岛素水平对新生儿出生体质量均有重要影响，应注重监测GDM孕妇以胰岛素抵抗指数为代表的各项胰岛素指标，制定基于亚型的孕期管理指南与不良围产期结局防治措施。

关键词：妊娠期糖尿病胰岛素水平胰岛素抵抗出生体质量低出生体质量巨大儿

数据融合技术及其在疾病“防诊治康”领域中的应用

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中国公共卫生 2024年第1期40卷 91-97页

作者：李紫琳张媛武睿婕张同超陈佳齐王泽吕明山东大学齐鲁医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系济南250012 山东大学齐鲁医院临床流行病学研究室济南250012 山东大学临床研究中心济南250012

数据融合技术是将多类同构或异构传感器的冗余或互补信息融合起来,更加精确的评估被观测对象的情况,以便对事物做出正确的判决。随着医学技术的不断进步,不同模态的医学数据迅速增多,相较于单一模态,利用数据融合技术处理多模态医学数据... 详细信息

数据融合技术是将多类同构或异构传感器的冗余或互补信息融合起来,更加精确的评估被观测对象的情况,以便对事物做出正确的判决。随着医学技术的不断进步,不同模态的医学数据迅速增多,相较于单一模态,利用数据融合技术处理多模态医学数据,可获得更加丰富全面的信息,避免信息孤岛,为开展医学研究提供强有力的信息支持。本文概述了数据融合的概念及原理,以及数据融合中不同层级和常用算法的工作原理及优缺点,并详细阐述了数据融合技术在疾病预防、诊断、治疗和康复领域中的应用,以期为充分应用医学数据,实现精准医疗和提高人民健康水平提供新的思路和信息支持。

关键词：数据融合算法医学

基于基因组学数据的缺血性脑卒中免疫分子标志物的鉴定

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中华疾病控制杂志 2024年第6期28卷 664-671页

作者：张文婧徐雅琪黄一铭王凤琳王爱民王清华石福艳潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室潍坊261053

目的基于基因组学数据,探索缺血性脑卒中免疫相关分子标志物,为缺血性脑卒中的预防和临床治疗提供理论依据。方法选取基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中GSE16561和GSE58294两个数据,对缺血性脑卒中相关免疫分子标志物... 详细信息

目的基于基因组学数据,探索缺血性脑卒中免疫相关分子标志物,为缺血性脑卒中的预防和临床治疗提供理论依据。方法选取基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中GSE16561和GSE58294两个数据,对缺血性脑卒中相关免疫分子标志物进行分析和探索。基于免疫学数据库和分析网站(the immunology database and analysis portal,ImmPort)数据库,获取免疫相关的基因,分析其在缺血性脑卒中组和正常对照组中的差异表达,鉴定差异表达免疫基因(differentially expressed immune genes,DEIGs),并利用蛋白质互作网络(protein-protein interaction,PPI)鉴定免疫相关的关键基因。基于DEIGs进行通路富集分析,发现缺血性脑卒中可能富集的分子信号通路。最后,基于CIBERSORT算法评估22种免疫细胞的浸润丰度,并计算其在缺血性脑卒中组和正常对照组中的差异,以此推断缺血性脑卒中相关的免疫细胞。结果差异分析结果表明37个DEIGs在两组间差异均有统计学意义(均P<0.05),包含缺血性脑卒中样本上调基因31个,下调基因6个。通路分析结果表明鉴定的DEIGs主要富集于免疫相关分子通路上。PPI的分析结果显示,TLR4、TLR2、MMP-9、CCR7、STAT3、TNFSF13B、S100A12、CD19、CAMP和SLC11A1是缺血性脑卒中密切相关的关键免疫基因。CIBERSORT结果表明,与正常对照样本相比较,缺血性脑卒中样本免疫回应细胞的富集水平较低(均P<0.05),而免疫抑制细胞的水平较高(均P<0.05)。结论研究基于转录组表达数据鉴定了缺血性脑卒中相关的免疫基因、免疫信号通路和免疫细胞,从3个分子水平上揭示了与缺血性脑卒中相关的免疫分子标志物,对缺血性脑卒中的有效防控和治疗策略的制定具有重要意义。

关键词：缺血性脑卒中免疫基因信号通路免疫细胞分子标志物组学数据

MTB Hsp60重组蛋白对巨噬细胞趋化功能的影响

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中国病原生物学杂志 2024年第2期19卷 157-161,171页

作者：卫麟娜高雪涵董品志吴荧浓王海燕罗军敏覃明遵义医科大学基础医学院免疫学教研室贵州遵义563000 遵义医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室

目的研究结核分枝杆菌H37Rv重组热休克蛋白60(Heat shock protein 60 of Mycobacterium tuberculosis,MTB Hsp60)对巨噬细胞(RAW264.7)趋化功能的影响。方法MTB Hsp60重组蛋白(100 ng/mL)刺激巨噬细胞24 h后,采用实时荧光定量PCR检测下列趋化因子如单核细胞趋化蛋白1(Monocyte chemotactic protein-1,MCP-1,CCL2)、巨噬细胞炎症蛋白1α(Macrophage inflammatory protein-1α,MIP-1α,CCL3)、巨噬细胞炎症蛋白1β(Macrophage inflammatory protein-1β,MIP-1β,CCL4)、调节活化正常T细胞表达与分泌的趋化因子(Regulation of Activation,Expression and Secretion by Normal T Cells,RANTES,CCL5)和单核细胞趋化蛋白5(Monocyte chemotactic protein-5,MCP-5,CCL12)的mRNA表达;ELISA法检测细胞培养上清液中趋化因子CCL2、CCL3、CCL4、CCL5和CCL12的分泌水平;Western bolt检测巨噬细胞表面趋化因子受体CC基序趋化因子受体1(C-C motif chemokine receptor 1,CCR1)、CCR2和CCR5的蛋白表达;流式细胞术检测表达趋化因子受体CCR1、CCR2、CCR5的巨噬细胞;Transwell实验检测巨噬细胞的趋化功能。结果100 ng/mL MTB Hsp60重组蛋白刺激巨噬细胞24 h后,其趋化因子CCL2、CCL3、CCL4及CCL12的mRNA表达水平无明显差异,但CCL5的mRNA水平显著上调(P<0.05);巨噬细胞表面主要的趋化因子受体CCR1、CCR2蛋白表达水平显著增高(P<0.05),而其表面CCR5蛋白的变化不明显;流式细胞术检测结果显示,与未处理组相比,处理组中CCR1^(+)、CCR2^(+)巨噬细胞数量明显增加(P<0.05),而CCR5^(+)巨噬细胞数量无明显差异;Transwell实验表明,经过MTB Hsp60重组蛋白处理后的巨噬细胞有更明显的被募集的趋势(P<0.05);而上清液中趋化因子CCL2、CCL3、CCL4、CCL5及CCL12的释放水平无明显变化。结论MTB Hsp60重组蛋白能上调巨噬细胞中趋化因子CCL5的mRNA表达水平,能增加巨噬细胞表面趋化因子受体CCR1和CCR2的表达,并且能增强巨噬细胞的趋化功能。

关键词： MTB Hsp60重组蛋白巨噬细胞趋化因子趋化因子受体