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HLA新等位基因A*24:191序列及其MHC编码蛋白分子三维结构模拟预测分析

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中华医学遗传学杂志 2022年第5期39卷 505-509页

作者：聂向民朱传福朱海峰刘艳邵静茹乔文本山东省血液中心HLA研究室/中国造血干细胞捐献者资料库山东省分型实验室济南250014

目的鉴定分析人类白细胞抗原(human leukocyte antigens,HLA)新等位基因A*24:191序列,并对其MHC蛋白分子三维结构及其氨基酸残基改变在空间结构中的可能影响进行模拟预测分析。方法应用Luminex及PCR-SBT进行序列鉴定。应用Phyre2及RCSB ... 详细信息

目的鉴定分析人类白细胞抗原(human leukocyte antigens,HLA)新等位基因A*24:191序列,并对其MHC蛋白分子三维结构及其氨基酸残基改变在空间结构中的可能影响进行模拟预测分析。方法应用Luminex及PCR-SBT进行序列鉴定。应用Phyre2及RCSB PDB分析软件,对其MHC蛋白分子三维结构进行模拟预测分析。Histocheck对比分析与A*24常见等位基因间差异。结果相较A*24:02序列,新等位基因A*24:191在256、265、270位发生G>C、G>C、A>T改变。MHC分子三维结构预测分析显示,相较HLA-A*24:02,A*24:191第62位氨基酸残基由A*24:02的酸性谷氨酸(Glu)改变为中性谷氨酰胺(Gln),(Risler’s score,R=2),其残基侧链伸展方向都为自α螺旋向外指向groove凹槽;65位由向α螺旋内伸展小分子中性甘氨酸(Gly)改变为向螺旋上外伸展的长链碱性精氨酸(Arg)(R=52);66位由长链碱性赖氨酸(Lys)改变为中性天冬酰胺(Asn)(R=31),伸展方向都为自α螺旋指向groove凹槽。以上残基均位于构成抗原肽结合凹槽侧壁α螺旋上。其总相异性值DSS Score=3.85。从蛋白分子表面结构模拟图像上,可以清楚看到氨基酸残基改变致α螺旋表面结构形状发生明显改变。结论分析预测以上氨基酸残基性质、大小及构型的改变,将可能改变其多肽结合功能,并影响其与TCR及抗体的结合特性。

关键词：人类白细胞抗原 PCR-SBT 新等位基因结构预测

夯实管理基础健康快速发展——中华骨髓库的管理和建设状况综述

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中国输血杂志 2012年第10期25卷 928-929页

作者：洪俊岭中国造血干细胞捐献者资料库管理中心北京100010

中国造血干细胞捐献者资料库管理中心（以下简称中华骨髓库）始建于1992年3月，由于资金、技术和组织机构不到位，到2001年时入库总数据只有3万份血清学结果，基本处于停顿状态。直到2001年中国红十字总会重新启动了中华骨髓库的建设，... 详细信息

中国造血干细胞捐献者资料库管理中心（以下简称中华骨髓库）始建于1992年3月，由于资金、技术和组织机构不到位，到2001年时入库总数据只有3万份血清学结果，基本处于停顿状态。直到2001年中国红十字总会重新启动了中华骨髓库的建设，中华骨髓库的管理和建设才迎来了转机。

关键词：造血干细胞捐献者资料中华骨髓库 HLA检测质量控制管理建设

人类白细胞抗原新等位基因DRB1＊1219的确认及其序列分析

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中华医学遗传学杂志 2011年第1期28卷 99-102页

作者：聂向民张毅房云海宋永红庄云龙刘艳朱传福山东省血液中心中国造血干细胞捐献者资料库山东省分型实验室济南250014

目的鉴定分析1个白血病患者家庭HLA～DRB1位点1个新等位基因。方法应用PCR-序列特异性引物及LuminexDNA杂交流式分型技术进行HLA分型，发现1个与HLA-DRB1＊120201相关的未知基因。应用DNA测序技术进行鉴定分析并与已知序列比对分析。结... 详细信息

目的鉴定分析1个白血病患者家庭HLA～DRB1位点1个新等位基因。方法应用PCR-序列特异性引物及LuminexDNA杂交流式分型技术进行HLA分型，发现1个与HLA-DRB1＊120201相关的未知基因。应用DNA测序技术进行鉴定分析并与已知序列比对分析。结果先证者DRB1位点有1个等位基因的核苷酸序列与所有已知基因序列均不相同，与同源性最高的DRB1＊120201相比，第2外显子第341位核苷酸碱基发生了C→T，结果导致相应85位密码子编码的丙氨酸变为缬氨酸。结论测序表明被测样本含有1个HLA-DRB1新等位基因，被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB1＊1219（序列号EJ374889）。

关键词：人类白细胞抗原测序新等位基因 DRB1*1219等位基因

2006-2014年中华骨髓库HLA基因分型抽检质量评价结果分析

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中国输血杂志 2016年第12期29卷 1368-1372页

作者：周晓阳黑爱莲肖尧戴大鹏姜平杜丹韩颖蔡剑平北京医院国家老年医学中心北京100730 中国造血干细胞捐献者资料库管理中心质量控制实验室中国造血干细胞捐献者资料库管理中心技术服务部

目的总结分析2006-2014年中华骨髓库志愿者HLA基因分型抽检质量评价结果,为提高中华骨髓库入库数据的HLA基因分型质量提供参考依据。方法针对2%的随机抽检标本进行HLA基因分型复核,与入库时分型数据进行比对,统计分析各实验室HLA基因分... 详细信息

目的总结分析2006-2014年中华骨髓库志愿者HLA基因分型抽检质量评价结果,为提高中华骨髓库入库数据的HLA基因分型质量提供参考依据。方法针对2%的随机抽检标本进行HLA基因分型复核,与入库时分型数据进行比对,统计分析各实验室HLA基因分型的错误率。结果 1)2006年1月-2014年11月,实际抽检来自全国31家HLA基因分型实验室的32 154份检测标本(2.0%);2)2009-2014年抽检标本的中、高分辨基因分型数据比例逐年增加,从2012年,起高分辨基因分型数据占每年抽检标本总数的90%以上;3)2010-2014年抽检标本中5位点HLA基因分型数据入库比例逐年增加,2014年度HLA 5位点基因分型数据占全年抽检标本总数的50%以上;4)2006-2014年全部抽检标本基因分型总错误率评价结果显示,在2006年和2010年出现2次错误率高峰,2006-2009年低分辨分型数据的错误率由1.14%降至0.19%;2010-2014年中、高分辨基因分型数据的错误率由0.51%降至0.17%;5)2006-2014年,各HLA基因分型实验室的抽检标本基因分型平均错误率评价结果显示,有2家实验室连续错误率超标(>2%)。结论 HLA基因分型抽检数据质量评价项目对中华骨髓库志愿者HLA基因分型数据错误率的降低发挥了积极作用。

关键词：人类白细胞抗原造血干细胞移植月LA基因分型抽样检测质量控制

HLA新等位基因DRB1＊03：80的鉴定及其序列分析

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中国实验血液学杂志 2014年第2期22卷 509-512页

作者：聂向民张毅庄云龙宋永红乔文本刘艳朱传福山东省血液中心中国造血干细胞捐献者资料库山东省分型实验室山东济南250014

本研究旨在分析鉴定中国人群HLA-DR位点1个新等位基因。应用Luminex PCR-SSO流式分型技术发现1例罕见等位基因组合样本,应用PCR-测序分型(sequence-based typing,SBT)及单等位基因特异性测序分型技术进行鉴定分析。结果表明,该样本DR位... 详细信息

本研究旨在分析鉴定中国人群HLA-DR位点1个新等位基因。应用Luminex PCR-SSO流式分型技术发现1例罕见等位基因组合样本,应用PCR-测序分型(sequence-based typing,SBT)及单等位基因特异性测序分型技术进行鉴定分析。结果表明,该样本DR位点1个等位基因序列与同源性最高的DRB1*03:06等位基因相比,其第2外显子第239位核苷酸碱基由C→G,结果导致相应51位密码子编码的苏氨酸变为精氨酸。结论:确定了该样本含有1个HLA-DRB1新等位基因。该等位基因被WHO HLA因子命名委员会正式命名为DRB1*03:80。

关键词：人类白细胞抗原 HIA新等位基因 DRB1*03 80等位基因

HLA高分辨等位基因及单体型多态性与北方汉族髓系白血病的关联性研究

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中国实验血液学杂志 2018年第1期26卷 32-41页

作者：齐珺王天菊陈利萍王满妮武君华杜丹陕西省血液中心、中华骨髓库HLA高分辨分型确认实验室陕西西安710061 中国造血干细胞捐献者资料库管理中心北京100013

目的:探讨HLA-A,-B,-DRB1高分辨等位基因及单体型多态性与北方汉族急性髓系白血病(AML)和慢性髓系白血病(CML)的相关性。方法:以1241例健康非亲缘造血干细胞捐献者为对照,采用PCR-SBT、-SSO和-SSP方法对259例髓系白血病患者进行HLA-A,B,... 详细信息

目的:探讨HLA-A,-B,-DRB1高分辨等位基因及单体型多态性与北方汉族急性髓系白血病(AML)和慢性髓系白血病(CML)的相关性。方法:以1241例健康非亲缘造血干细胞捐献者为对照,采用PCR-SBT、-SSO和-SSP方法对259例髓系白血病患者进行HLA-A,B,DRB1高分辨分型,运用Arleguin 3.5.2软件计算基因频率及单体型频率,病例对照研究计算疾病比值比(ocld ratio,OR);用Swiss-Model对差异HLA分子进行同源建模,Swiss-Pdb Viewer v4.1软件对分子间三维结构进行差异比对。结果:经χ~2检验、连续校正显示,AML组(n=189)的A*02:07(8.47%vs 5.28%,P=0.013)、A*29:01(1.85%vs 0.68%,P=0.044)、B*07:02(5.29%vs 3.10%,P=0.029)、B*07:05:01G(1.85%vs 0.68%,P=0.044)、B*35:02(1.06%vs 0.20%,P=0.023)的基因频率高于对照组,而AML组的A*02:03频率则低于对照组(0.79%vs 3.10%,P=0.011)。CML组(n=70)的B*46:01频率低于对照组(2.86%vs 7.82%,P=0.031),但上述等位基因经Bonferroni校正后,均显示无统计学差异。经Fisher精确概率检验和Bonferroni校正,DRB1*11:28及其单体型A*24:02-B*15:01-DRB1*11:28频率在陕西籍CML患者中显著升高(1.43%vs 0.00%,Pc'=0.015;1.43%vs 0.00%,P=0.003)。Swiss-Pdb Viewer v 4.1软件计算DRB1*11:28和DRB1*11:01分子肽结合区主链间均方根偏差(RMSD)为0.09 nm。经Bonferroni校正单体型A*03:01-B*50:01-DRB1*07:01和A*11:01-B*40:06-DRB1*09:01分别在AML和CML患者中频率显著升高(1.06%vs 0.00%,Pc=0.000;2.86%vs 0.07%,Pc=0.000),与白血病呈正相关(OR=59.66,95%CI=3.21-1110.39;OR=42.91,95%CI=7.07-260.32)。结论:北方汉族AML和CML患者携带有特定的易感单体型,DRB1*11:28与CML发病呈正相关,可能不能有效结合并提呈bcr-abl肽段给CD4^+T细胞,是北方汉族尤其陕西籍发生CML的易感基因(OR=89.62,95%CI=4.28-1875.87),并与其特定单体型关联。

关键词：髓系白血病人类白细胞抗原北方汉族单体型基因频率比值比 HLA分子三维结构模拟

非亲缘造血干细胞捐献者的心理焦虑原因分析与应对

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中国输血杂志 2015年第9期28卷 1165-1167页

作者：郭翔惠飞张博李涛深圳市职业病防治院广东深圳518001 中国造血干细胞捐献者资料库北京管理中心

外周血造血干细胞(peripheral blood stem cell,PBSC)移植在治疗白血病等恶性血液病中获得了广泛的应用。随着非亲缘造血干细胞捐献志愿者日益增多,捐献过程中的心理焦虑问题也逐渐突显,心理焦虑已经成为PBSC捐献者普遍出现的不良反应... 详细信息

外周血造血干细胞(peripheral blood stem cell,PBSC)移植在治疗白血病等恶性血液病中获得了广泛的应用。随着非亲缘造血干细胞捐献志愿者日益增多,捐献过程中的心理焦虑问题也逐渐突显,心理焦虑已经成为PBSC捐献者普遍出现的不良反应之一。目前认为,引起PBSC捐献者心理焦虑的原因主要包括:对安全性的担忧、采集过程中的不良反应、外界环境、负面干预、受到过度关注以及对患者移植预后的担忧等。针对这些原因可采取包括:加强宣传、减轻不良反应、提供舒适的捐献环境、加强心理辅导、改进志愿服务以及充分沟通等在内的针对性措施,减轻或消除捐献者在PBSC采集过程中的心理焦虑。

关键词：心理焦虑造血干细胞志愿者捐献者

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在中华骨髓库找到HLA匹配无关供者的概率

中国输血杂志 2013年第6期26卷 506-510页

作者：赵桐茂洪俊岭刘静湖高东英刘琪杜丹韩颖鲁静徐刚中华骨髓库专家委员会北京100007 中国造血干细胞捐献者资料库管理中心紫光软件系统有限公司

目的计算在中华骨髓库(CMDP)找到HLA匹配无关供者的概率,探讨骨髓库最佳库容量。方法根据HLA表型频率计算找到HLA匹配供者概率。结果在中华骨髓库248 978名HLA等位基因分型供者中,找到至少1例HLA-A,-B,-DRB1等位基因6/6匹配、HLA-A,-B,-... 详细信息

目的计算在中华骨髓库(CMDP)找到HLA匹配无关供者的概率,探讨骨髓库最佳库容量。方法根据HLA表型频率计算找到HLA匹配供者概率。结果在中华骨髓库248 978名HLA等位基因分型供者中,找到至少1例HLA-A,-B,-DRB1等位基因6/6匹配、HLA-A,-B,-C,-DRB1等位基因8/8匹配、HLA-A,-B,-C,-DRB1,-DQB1等位基因10/10匹配供者的概率,分别为0.358 1、0.274 9、和0.234 7。根据籍贯将供者分为北方和南方2大群体,在114 767名北方供者群体和114 767名南方供者群体中,找到至少1例6/6、8/8、10/10匹配供者的概率分别为0.240 5和0.338 3,0.180 7和0.262 8,0.155 0和0.222 5。结论 CMDP供者南北群体之间存在遗传学差异,北方供者HLA多态性高于南方供者。选择性增加特定籍贯供者,可提高该籍贯患者找到HLA匹配供者的概率。

关键词：中华骨髓库造血干细胞供者 HLA匹配概率南北群体差异最佳库容量

供受者HLA高分辨基因分型不合对非血缘造血干细胞移植患者预后的影响

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中华血液学杂志 2012年第5期33卷 353-357页

作者：何军徐超吴小津鲍晓晶邱桥成袁晓妮李杨沈宏杰吴德沛洪峻岭刘静湖杜海英张雷杜丹鲁静柳静苏州大学附属第一医院、江苏省血液研究所美国ASHI认证实验室中华骨髓库HLA高分辨分型确认实验室215006 中国造血干细胞捐献者资料库管理中心

目的研究供受者HLA高分辨基因分型错配对非亲缘造血干细胞移植（HSCT）患者预后的影响。方法对来源于中华骨髓库随访登记的835对供受者资料进行回顾性分析，其中急性髓系白血病（AML）288例，急性淋巴细胞白血病（ALL）227例，慢性髓性... 详细信息

目的研究供受者HLA高分辨基因分型错配对非亲缘造血干细胞移植（HSCT）患者预后的影响。方法对来源于中华骨髓库随访登记的835对供受者资料进行回顾性分析，其中急性髓系白血病（AML）288例，急性淋巴细胞白血病（ALL）227例，慢性髓性白血病（CML）187例，骨髓增生异常综合征（MDS）52例，非霍奇金淋巴瘤（NHL）25例，再生障碍性贫血（AA）42例，地中海贫血14例。HLA．A、B、C、DRB1、DQB1高分辨基因分型采用DNA序列测定、序列特异性寡核苷酸探针和高分辨序列特异性引物分型方法。在835对供受者中HLA不相合473对，其中HLA1个等位基因错配159对，1个抗原错配125对，1个等位基因加1个抗原错配95对，2个等位基因错配29对，2个抗原错配20对，多个等位基因加抗原错配45对。随访截止到2011年3月。结果供受者HLA全相合总体生存（OS）率高于HLA不相合者（分别为79．83％和73．15％），差异无统计学意义（P〉0．05），但HLA的1个等位基因加1个抗原错配是影响HSCT患者OS、无病生存和移植相关死亡率的重要危险因素。不同疾病类型患者的OS率从高到低为地中海贫血、AA、CML、MDS、AML、NHL和ALL。HLA位点错配的受者OS率分别为DRB194．4％、DQB183．3％、B75．0％、A74．4％和C71．4％。1个等位基因错配的受者Os率从高到低为DRB1、C、A、B和DQB1。A、B、C位点错配的受者0s率和Ⅱ-Ⅳ度急性移植物抗宿主病（aGVHD）发生率与全相合受者比较差异均有统计学意义（P值均〈0．05）。优先考虑供受者HLA错配类型为B^＊15：01／B^＊15：05、DRB1^＊12：01／DRB1^＊12：02、C^＊04：01／C^＊03：04和DQB1^＊03：02／DQB1^＊03：03。供受者为B^＊39：01／B^＊39：05、C^＊15：02／C^＊14：02、C^＊08：01／C^＊03：04和C^＊07：02／C^＊15：02错配是影响移植患者OS率和aGVHD发生的危险因素。结论HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨基因分型对筛选供受者HLA不允许错配类型，进而选择最合适无关供者进行HSCT有重要意义，并可改善移植患者的存活率。

关键词： HLA抗原高分辨分型碱基错配供者选择造血干细胞移植