检索结果-南通市图书馆

基于Transformer和门控循环单元的肽序列理论串联质谱图预测方法

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计算机应用 2024年

作者：何长久杨婧涵周丕宇边昕烨吕明明董迪付岩王海鹏中国科学院数学与系统科学研究院山东理工大学计算机科学与技术学院

针对现有理论串联质谱图预测仅限预测b、y主干碎片离子，单一模型难以捕捉肽序列复杂关系的问题，提出了一种基于Transformer和门控循环单元（GRU）的肽序列理论串联质谱图预测方法，名为DeepCollider。首先，使用Transformer和GRU相结... 详细信息

针对现有理论串联质谱图预测仅限预测b、y主干碎片离子，单一模型难以捕捉肽序列复杂关系的问题，提出了一种基于Transformer和门控循环单元（GRU）的肽序列理论串联质谱图预测方法，名为DeepCollider。首先，使用Transformer和GRU相结合的深度学习架构，通过自注意力机制和长距离依赖关系，增强对肽序列与碎片离子强度关系的建模能力。其次，与现有方法编码肽序列预测所有b、y主干离子不同，使用碎裂标志位来标记肽序列的碎裂位点，可针对特定碎裂位点编码并预测相应的碎片离子。最后，为了计算预测谱图与实验谱图之间的相似度，使用皮尔逊相关系数（PCC）和平均绝对误差（MAE）作为评测指标。实验表明，与现有的仅限预测b、y主干碎片离子的方法（如名为pDeep和Prosit的方法）相比，DeepCollider在PCC和MAE指标上均有优势，PCC值提升约0.15,MAE值降低0.005左右。DeepCollider不仅可以预测b、y、a主干离子及其相应的失水失氨中性丢失离子，还可进一步提高理论谱图预测的谱峰覆盖度和相似性。

关键词：理论质谱图预测肽序列碎片离子强度蛋白质组学深度学习

Ru/SiC催化乙酰丙酸水相加氢制备γ-戊内酯

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精细化工 2024年

作者：王静茹董宪姝樊玉萍王英勇太原理工大学矿业工程学院中国科学院山西煤炭化学研究所煤转化国家重点实验室

为提高水相体系中催化乙酰丙酸（LA）加氢合成γ-戊内酯（GVL）催化剂的水热稳定性和耐酸稳定性，采用浸渍还原法制备了Ru负载量（以SiC的质量计，下同）为3%的Ru/SiC催化剂(Ru3/SiC)，采用TEM、XRD、XPS、H2-TPR和H2-TPD对其进行了表... 详细信息

为提高水相体系中催化乙酰丙酸（LA）加氢合成γ-戊内酯（GVL）催化剂的水热稳定性和耐酸稳定性，采用浸渍还原法制备了Ru负载量（以SiC的质量计，下同）为3%的Ru/SiC催化剂(Ru3/SiC)，采用TEM、XRD、XPS、H2-TPR和H2-TPD对其进行了表征。将Ru3/SiC用于催化LA加氢反应，对比了不同载体负载的Ru基催化剂(Ru3/石墨烯、Ru3/TiO2、Ru3/ZrO2、Ru3/SiO2和Ru3/Al2O3)的性能，考察了反应温度、时间、氢气压力、溶剂对Ru3/SiC催化LA加氢反应的影响和循环稳定性。结果表明，Ru3/SiC中的Ru纳米粒子（0.22 nm）主要以Ru0的形式均匀分散在SiC表面上。Ru3/SiC表现出更高的催化LA加氢反应活性，在LA（4 mmol）为反应物、水（10 mL）为溶剂、50 mg Ru3/SiC为催化剂、H2压力0.2 MPa、反应温度50 ℃、反应时间2 h的反应条件下，LA转化率和GVL选择性均接近100%。Ru3/SiC循环5次后，催化活性无明显下降，其高的催化活性归因于Ru与SiC之间的Mott-Schottky接触促进了载体与金属之间的电子转移，富电子的Ru纳米颗粒有利于H2的解离。

关键词： SiC Ru 乙酰丙酸催化加氢 γ-戊内酯

勇担使命铸魂育人——新疆维吾尔医学专科学校马克思主义学院建设纪实

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大学（思政教研） 2024年第5期 1-2页

作者：龚真杰新疆维吾尔医学专科学校党委新疆维吾尔医学专科学校宣传部

加强马克思主义学院建设,是深化马克思主义理论研究和建设的重要举措,是培养担当民族复兴大任时代新人的内在要求,对于彰显中国大学社会主义底色,培养一代又一代社会主义建设者和接班人,具有重要意义。党的十八大以来,新疆维吾尔医学专... 详细信息

加强马克思主义学院建设,是深化马克思主义理论研究和建设的重要举措,是培养担当民族复兴大任时代新人的内在要求,对于彰显中国大学社会主义底色,培养一代又一代社会主义建设者和接班人,具有重要意义。党的十八大以来,新疆维吾尔医学专科学校贯彻落实党中央要求,推动马克思主义学院建设取得了长足进展。

关键词：时代新人党的十八大以来马克思主义理论研究建设者和接班人铸魂育人民族复兴中国大学

H10N3禽流感病毒安徽分离株遗传多样性研究

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病毒学报 2024年第5期 1022-1032页

作者：李珊董卉姚雪张春鸽邢薇佳李娟史卫峰山东第一医科大学(山东省医学科学院)山东省高等学校新发传染病重点实验室山东第一医科大学(山东省医学科学院)临床与基础医学院(基础医学研究所)病原生物学系山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院中国科学院流感研究与预警中心中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室

2021年4月我国江苏确诊全球第一例人感染H10N3禽流感病例，研究我国活禽市场H10N3亚型禽流感病毒（Avian influenza virus, AIV）的遗传多样性和分子特征，将为理解人感染H10N3病毒的进化来源、评估其溢出风险提供理论依据。为此，2021... 详细信息

2021年4月我国江苏确诊全球第一例人感染H10N3禽流感病例，研究我国活禽市场H10N3亚型禽流感病毒（Avian influenza virus, AIV）的遗传多样性和分子特征，将为理解人感染H10N3病毒的进化来源、评估其溢出风险提供理论依据。为此，2021年6-12月我们对安徽地区活禽市场销售家禽及环境中H10N3 AIV进行实时荧光定量RT-PCR检测，共分离鉴定到6株H10N3病毒（AH01-AH06），其中1株为11月份环境样本分离株，其余5株为6月、11月和12月鸡咽拭子分离株。高通量测序和生物信息学分析表明，同一活禽市场分离到的毒株表现出一定的遗传多样性和重配模式差异：4株H10N3分离株（AH01-AH04）间核苷酸同源性均高于99.00%，而A/chicken/Anhui/11-30-YHZGS024-O/2021(AH05)株的MP基因片段和A/chicken/Anhui/06-26-YHZGS006-O/2021(AH06)株的PA、MP基因片段与其他分离株的核苷酸同源性较低，均低于97.04%。系统发育分析显示，本研究6株H10N3分离株与人源H10N3病毒的HA和NA基因均位于欧亚进化分支，它们的内部基因都来自H9N2亚型AIV。特别是分离株AH06与人感染H10N3病毒八个基因均位于同一进化分支，而分离株AH01-AH05的PA基因与人感染H3N8和H9N2毒株、MP基因与人感染H9N2毒株的亲缘关系较近。分子遗传特征分析显示，6株H10N3 AIV的血凝素蛋白均携带G228S等哺乳动物适应性突变，提高了对人源受体的结合能力。综上，本研究证实了禽源H10N3病毒在安徽省活禽市场的持续流行，揭示了禽源H10N3病毒的遗传多样性以及新型感染人的H10N3在我国家禽中传播，强调其携带多个哺乳动物适应性突变，为评估H10N3 AIV潜在公共卫生风险提供了理论依据。

关键词：禽流感病毒活禽市场 H10N3 遗传多样性

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基于HMGB1/TLR4/NF-κB信号通路研究藁本内酯衍生物抑制IL-1β诱导的大鼠软骨细胞凋亡和炎症反应的作用机制

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中国中药杂志 2024年第4期49卷 1007-1016页

作者：齐鑫陈欣安文博许志明王多贤罗鹏飞陈一新马姣姣胡紫阳齐伟刘建军柳军玺甘肃中医药大学甘肃兰州730000 甘肃中医药大学附属医院甘肃兰州730000 中国科学院兰州化学物理研究所甘肃兰州730000

软骨细胞是关节软骨中的独特驻留细胞类型,当其发生一系列病理改变时能够导致骨关节炎(osteoarthritis,OA)的发生。藁本内酯衍生物(ligusticum cycloprolactam,LIGc)是中药当归药效标志物藁本内酯(Z-ligustilide,LIG)的衍生物,具有抗炎... 详细信息

软骨细胞是关节软骨中的独特驻留细胞类型,当其发生一系列病理改变时能够导致骨关节炎(osteoarthritis,OA)的发生。藁本内酯衍生物(ligusticum cycloprolactam,LIGc)是中药当归药效标志物藁本内酯(Z-ligustilide,LIG)的衍生物,具有抗炎、抑制细胞凋亡等多种生物学功能。然而,其对OA软骨细胞的保护作用以及潜在的作用机制尚不清楚。该研究拟进行体外实验探索LIGc抗OA保护软骨细胞作用的分子机制。采用白细胞介素-1β(IL-1β)诱导建立大鼠OA软骨细胞炎症模型,并单独使用LIGc和联合高迁移率族蛋白B1/Toll样受体4/核因子-κB(HMGB1/TLR4/NF-κB)信号通路阻断剂甘草酸(glycyrrhizic acid,GA)进行干预,以系统评估其治疗效果。通过cell counting kit-8(CCK-8)试剂盒检测不同浓度下LIGc对软骨细胞活力的影响,并筛选出最佳作用浓度;Annexin V-FITC/PI凋亡染色检测各组软骨细胞凋亡情况;酶联免疫吸附法(ELISA)测定各组软骨细胞上清中环氧合酶-2(COX-2)、前列腺素-2(PGE2)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)的表达;蛋白质印迹法(Western blot)检测各组软骨细胞B细胞淋巴瘤-2(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(caspase-3)、HMGB1、TLR4、NF-κB p65的蛋白表达水平;实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测各组软骨细胞HMGB1、TLR4、NF-κB p65、髓样分化因子88(MyD88)的基因表达变化。通过CCK-8确定了LIGc对软骨细胞的大致安全浓度范围,并进一步明确了LIGc作用的最佳浓度。在IL-1β的干预下,成功构建大鼠OA软骨细胞模型,且在该细胞模型中,软骨细胞凋亡率明显增加。与此同时,ELISA检测该组软骨细胞上清中COX-2、PGE2、TNF-α的表达均显著上升;Western blot检测发现模型组软骨细胞Bax、caspase-3、HMGB1、TLR4、NF-κB p65的蛋白表达显著上调,Bcl-2的蛋白表达受到明显抑制;RT-qPCR测定显示软骨细胞内HMGB1、TLR4、NF-κB p65、MyD88的基因表达经IL-1β干预后均有所提高。然而,随着LIGc的加入逆转了IL-1β诱导下上述一系列因子的表达变化。此外,LIGc联合GA共同作用下较单独添加LIGc对实验结果的逆转趋势更为明显。这些研究结果表明,从中药当归中提取并衍生的LIGc能够起到抑制软骨细胞炎症反应及减少软骨细胞凋亡的作用,且该作用的发挥可能与HMGB1/TLR4/NF-κB信号通路具有较强的相关性。LIGc保护软骨细胞的药理作用,对于延缓OA病情及改善患者临床症状具有潜在价值,值得进一步深入研究。

关键词：藁本内酯衍生物(LIGc) 骨关节炎软骨细胞 HMGB1/TLR4/NF-κB信号通路炎症反应细胞凋亡

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界面吸附对高分子液体膜去润湿动力学的影响

高等学校化学学报 2024年第5期45卷 149-154页

作者：张苡宁卫来石彤非徐林伊犁师范大学物理科学与技术学院新疆凝聚态相变与微结构重点实验室伊宁835000 广东工业大学轻工化工学院广州510006 中国科学院深圳先进技术研究院珠海中科先进技术研究院有限公司生物材料中心珠海519000

以线形聚苯乙烯(LPS)薄膜三臂星形聚苯乙烯(3SPS)薄膜作为研究对象,探讨了受限体系中高分子链界面吸附对高分子溶液膜界面稳定性的影响.实验结果表明,吸附在基底上的高分子链对薄膜去润湿的驱动力形成拖拽力,增大了薄膜去润湿的阻力.随... 详细信息

以线形聚苯乙烯(LPS)薄膜三臂星形聚苯乙烯(3SPS)薄膜作为研究对象,探讨了受限体系中高分子链界面吸附对高分子溶液膜界面稳定性的影响.实验结果表明,吸附在基底上的高分子链对薄膜去润湿的驱动力形成拖拽力,增大了薄膜去润湿的阻力.随着退火时间的延长,线形链和三臂星形链在基底上的吸附量逐渐增加,LPS和3SPS薄膜在丙酮蒸汽中由发生去润湿到稳定存在,孔边在薄膜去润湿过程中由不稳定转变为稳定,去润湿速度逐渐降低,平衡接触角逐渐减小.当退火时间相同时,3SPS薄膜在丙酮蒸汽中的去润湿速度比LPS薄膜更低;去润湿后3SPS薄膜在基底上的平衡接触角比LPS薄膜更小,3SPS薄膜的毛细驱动力小于LPS薄膜.

关键词：高分子薄膜去润湿界面吸附

RAG-PHI:检索增强生成驱动的平行人与平行智能

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智能科学与技术学报 2024年第1期6卷 41-51页

作者：田永林王兴霞王雨桐王建功郭超范丽丽沈甜雨武万森张红梅朱正秋王飞跃中国科学院自动化研究所多模态人工智能系统全国重点实验室北京100190 中国科学院自动化研究所复杂系统管理与控制国家重点实验室北京100190 中国科学院大学人工智能学院北京100049 中国航空系统工程研究所北京100029 北京理工大学信息与电子学院北京100081 北京化工大学信息科学与技术学院北京100029 国防科技大学系统工程学院湖南长沙410073 北方自动控制技术研究所山西太原030006 澳门科技大学创新工程学院中国澳门999078

大模型技术的发展为融合生物人、数字人和机器人的平行人系统构建提供了崭新思路和智能基础。但是,在面临复杂系统的管控任务时,仍然存在着知识更新受限、专用能力不足以及信息隐私泄露等问题。为此,提出了检索增强生成驱动的平行人与... 详细信息

大模型技术的发展为融合生物人、数字人和机器人的平行人系统构建提供了崭新思路和智能基础。但是,在面临复杂系统的管控任务时,仍然存在着知识更新受限、专用能力不足以及信息隐私泄露等问题。为此,提出了检索增强生成驱动的平行人与平行智能框架——RAG-PHI,打造了开放式数据平台,为平行人系统接入实时知识、行业知识及私有知识;构建动态路由检索,进行上下文抓取和平行人能力重组;引入上下文提示学习增强思维与行为能力。进一步,面向平行人的组织管理、培训评估和运营生产模式,提出了基于RAGPHI架构的平行人社区、平行人学校和平行人工厂架构,形成了检索增强生成和基础大模型协同驱动下的平行人生态,促进智业时代的生产力提升。

关键词：检索增强生成平行人平行智能大模型

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丹麦中小学生心理健康教育指导和服务研究

基础教育参考 2024年第2期 9-19页

作者：李晓乐张兴利王永丽中国科学院行为科学重点实验室中国科学院大学心理学系北京100049 教育部教育管理信息中心研究处北京100816

丹麦中小学生随着社交媒体的发展,出现了日益严重的心理健康问题,引起了丹麦政府及社会各界的广泛关注和重视。文章探究了丹麦中小学生心理健康问题的主要类型及表现,详述了丹麦在加强中小学生心理健康教育方面的预防措施及政策管理,聚... 详细信息

丹麦中小学生随着社交媒体的发展,出现了日益严重的心理健康问题,引起了丹麦政府及社会各界的广泛关注和重视。文章探究了丹麦中小学生心理健康问题的主要类型及表现,详述了丹麦在加强中小学生心理健康教育方面的预防措施及政策管理,聚焦疫情时期的应对措施和信息化手段的运用及效果。此外,还描述了丹麦天才儿童的心理健康情况和特别针对性的心理健康服务措施。总体上,丹麦政府、社会、学校以及家庭层面都致力于提供多样化的心理健康服务,共同促进学生的心理健康和幸福感。

关键词：丹麦中小学生心理健康心理健康服务天才儿童信息化

G-四链体二聚体/核酸外切酶Ⅰ辅助信号放大纸芯片检测黄曲霉毒素B1

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分析化学 2024年第8期52卷 1094-1107页

作者：贺璇齐骥余子辉陈燕付秀丽烟台大学化学化工学院中国科学院烟台海岸带研究所海岸带环境工程技术研究与发展中心中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室烟台大学物理与电子信息学院山东农业工程学院资源与环境工程学院

本研究利用DNA四面体（TDN）精准调控识别配体的取向和密度，结合核酸外切酶Ⅰ（ExoⅠ）对单链DNA的特异性切割活性，借助G-四链体（G4）二聚体对硫黄素T(ThT)的荧光增强作用，构建了旋转型纸芯片，用于快速高灵敏检测黄曲霉毒素B1(AFB1... 详细信息

本研究利用DNA四面体（TDN）精准调控识别配体的取向和密度，结合核酸外切酶Ⅰ（ExoⅠ）对单链DNA的特异性切割活性，借助G-四链体（G4）二聚体对硫黄素T(ThT)的荧光增强作用，构建了旋转型纸芯片，用于快速高灵敏检测黄曲霉毒素B1(AFB1)。以含有G4二聚体与AFB1识别序列的单链DNA(G4二聚体探针)为识别探针，其中AFB1识别序列与TDN的延伸手臂链通过碱基互补配对形式结合。当AFB1不存在时，G4二聚体探针上的G4二聚体与ThT结合，体系呈现出较强的荧光信号；当AFB1存在时，AFB1与G4二聚体探针结合，使其脱离TDN。此时，ExoⅠ切割脱离的G4二聚体探针，释放出AFB1, AFB1能够再次与TDN上的G4二聚体探针结合，如此循环，使得TDN上的G4二聚体探针减少，导致体系剩余的G4二聚体减少，荧光强度降低。此旋转型纸芯片在AFB1浓度为0.0001～500 ng/mL范围内具有良好的线性关系，检出限为0.1 pg/mL。将本方法用于花生和红酒样品中AFB1的检测，回收率为85.2%～118.2%。本研究开发的的TDN/G4二聚体/ExoⅠ检测策略显著增强了体系的特异性和灵敏度。

关键词：旋转型纸芯片核酸外切酶Ⅰ G-四链体二聚体 DNA四面体黄曲霉毒素B1