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生物的演化与适应:基因组时代的多维度探索

遗传 2025年第1期47卷 1-4页

作者：张勇施鹏付巧妹于黎中国科学院动物研究所动物进化与系统学院重点实验室北京100101 中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室昆明650223 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所北京100044 云南大学省部共建云南生物资源保护与利用国家重点实验室生命科学学院昆明650500

自1859年达尔文《物种起源》发表以来,自然选择通过作用于可遗传的适应性突变推动生物的演化乃至新物种形成成为演化生物学的核心理论框架。进入21世纪,基因组学的迅猛发展使演化生物学迈入了新的发展阶段。通过高通量测序和多组学整合... 详细信息

自1859年达尔文《物种起源》发表以来,自然选择通过作用于可遗传的适应性突变推动生物的演化乃至新物种形成成为演化生物学的核心理论框架。进入21世纪,基因组学的迅猛发展使演化生物学迈入了新的发展阶段。通过高通量测序和多组学整合,研究者能够追踪包括人类在内的各种物种的演化历史,解析细胞乃至个体水平适应性演化的分子基础。

关键词：《物种起源》物种形成基因组学个体水平自然选择适应性演化演化历史高通量测序

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线粒体RNA结合蛋白AMG-1/SLRP-1复合体开拓生殖发育研究新视野

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科学通报 2025年

作者：常占鑫王鹏苗龙北京师范大学生命科学学院细胞增殖与调控生物学教育部重点实验室中国科学院生物物理研究所中国科学院生物大分子卓越研究中心RNA生物学重点实验室中国科学院大学

在哺乳动物中,线粒体是细胞的能量工厂,通过氧化磷酸化（oxidative phosphorylation, OXPHOS）产生ATP,为精子运动和顶体反应提供必需的能量.精子的鞭毛运动依赖于大量的ATP,线粒体在精子中集中分布于中段,为鞭毛的摆动提供能量支持. Se...

在哺乳动物中,线粒体是细胞的能量工厂,通过氧化磷酸化（oxidative phosphorylation, OXPHOS）产生ATP,为精子运动和顶体反应提供必需的能量.精子的鞭毛运动依赖于大量的ATP,线粒体在精子中集中分布于中段,为鞭毛的摆动提供能量支持. Setiawan等人[1]的研究表明,在线粒体中,氧化磷酸化是生成ATP的主要途径,尤其是在需要大量能量的情况下,如精子激活过程中氧化磷酸化生成的ATP支持鞭毛的运动,这是精子游动所必需的.

关键词：

基于形态学和DNA条形码的青藏高原东缘鼢鼠物种鉴定

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兽类学报 2025年

作者：蔡振媛孔虹颖何振邦宋鹏飞郭凡李斌梁程博胡天石徐波林中原张同作中国科学院西北高原生物研究所高原生物适应与进化重点实验室青海省动物生态基因组学重点实验室青海大学海东市平安区林业和草原局中国科学院大学

物种分类和鉴定是生物学研究的基石，综合分子生物学和经典分类学方法进行物种鉴定可提高结果可靠性。本研究采用传统形态学和线粒体细胞色素b基因 (Cyt b) 序列对青藏高原东缘青海省海东市平安区采集的74个鼢鼠样本进行物种鉴定。头骨... 详细信息

物种分类和鉴定是生物学研究的基石，综合分子生物学和经典分类学方法进行物种鉴定可提高结果可靠性。本研究采用传统形态学和线粒体细胞色素b基因 (Cyt b) 序列对青藏高原东缘青海省海东市平安区采集的74个鼢鼠样本进行物种鉴定。头骨形态鉴定结果显示，尾巴被稀疏短白毛的鼢鼠个体 (Pac) 为甘肃鼢鼠 (Eospalax cansus)，而尾巴被密毛的个体 (Pab) 为高原鼢鼠 (Eospalax baileyi)。74只鼢鼠样本的Cyt b序列共定义了25个单倍型，结合GenBank中8种鼢鼠的Cyt b序列进行分析，在构建的系统发育树中，已知8种鼢鼠序列各自聚为1个单系群，平安区Pab的16个单倍型与已知高原鼢鼠聚为一支，Pac的8个单倍型与已知的甘肃鼢鼠聚为一支。遗传距离结果显示，Pac与已知甘肃鼢鼠遗传距离小于与其他物种的遗传距离 (P 研究加深了对平安区鼢鼠物种组成和分布特征的了解，并为解决鼢鼠物种形态鉴定难的问题提供了DNA条形码解决方案。

关键词： DNA条形码技术鼢鼠 Cyt b 形态系统发育遗传距离

长牡蛎(Crassostrea gigas)环GMP-AMP合酶(cyclic GMP-AMP synthase,cGAS)的基因克隆与功能研究

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热带海洋学报 2025年第1期44卷 24-34页

作者：白晶毛帆刘客林宋菁晨喻子牛张扬暨南大学广东广州510632 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室中国科学院南海海洋研究所广东广州510301

环GMP-AMP合酶(cyclic GMP-AMP synthase,cGAS)是一种关键的细胞内传感器,能够识别细胞质内异常存在的DNA并触发免疫反应。为了揭示cGAS在软体动物先天性免疫调控中的重要作用,本研究成功克隆了长牡蛎中的cGAS基因(CgcGAS),其开放阅读框... 详细信息

环GMP-AMP合酶(cyclic GMP-AMP synthase,cGAS)是一种关键的细胞内传感器,能够识别细胞质内异常存在的DNA并触发免疫反应。为了揭示cGAS在软体动物先天性免疫调控中的重要作用,本研究成功克隆了长牡蛎中的cGAS基因(CgcGAS),其开放阅读框(open reading frame,ORF)全长1623bp,编码540个氨基酸,理论相对分子质量为62.3kDa,并具有保守的Mab21结构域。系统进化分析表明了CgcGAS为软体动物cGAS家族中的一员。定量逆转录聚合酶链式反应(qRTPCR)结果显示CgcGAS广泛表达于各组织,并在消化腺的相对表达量最高。亚细胞定位实验观察到CgcGAS蛋白在细胞核和细胞质中都有分布,主要定位于细胞核,提示其可能在细胞核内的DNA感应以及细胞质内的DNA结合和信号传递中发挥作用。另外,双荧光素酶报告基因系统和RNA干扰实验结果显示,CgcGAS能够显著激活核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)和干扰素刺激性反应元件(interferon-sensitive response element,ISRE)信号通路,及其下游的炎症相关因子干扰素诱导病毒抑制蛋白(virus inhibitory protein endoplasmic reticulum-associated interferon-inducible,viperin)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)及转录因子干扰素调节因子2/8(interferon regulatory factor 2/8,IRF2/8)的表达。综上所述,CgcGAS在长牡蛎的先天性免疫反应中的信号传递过程中发挥了关键作用。

关键词：长牡蛎先天性免疫环GMP-AMP合酶基因克隆功能

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硒和硒蛋白对动物肝脏健康的调节机制研究进展

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中国科学:生命科学 2025年第03期 450-462页

作者：周辉何羿文印遇龙李铁军何流琴湖南师范大学生命科学学院动物肠道功能湖南省重点实验室湖南省动物肠道生态与健康国际联合实验室中国科学院亚热带农业生态研究所亚热带农业生态过程重点实验室动物营养生理与代谢过程湖南省重点实验室

硒是一种必需的微量元素,主要以硒蛋白的形式存在,具有免疫调节和营养活性的功能.硒和硒蛋白通过调节细胞增殖分化、氧化应激、免疫反应和脂质代谢等生理过程来保护肝脏健康,进而起到预防或治疗肝脏疾病的作用.本文综述了硒在体内的吸... 详细信息

硒是一种必需的微量元素,主要以硒蛋白的形式存在,具有免疫调节和营养活性的功能.硒和硒蛋白通过调节细胞增殖分化、氧化应激、免疫反应和脂质代谢等生理过程来保护肝脏健康,进而起到预防或治疗肝脏疾病的作用.本文综述了硒在体内的吸收代谢以及硒蛋白的生理功能,重点解析了硒和硒蛋白调节肝脏氧化应激、免疫反应和脂质代谢的分子机制及其在肝脏疾病中的潜在作用,以期为硒用于预防和治疗肝脏疾病提供新的思路和依据.

关键词：硒氧化应激免疫脂质代谢肝脏疾病

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云南伊洛瓦底江流域4种鱼类新记录

动物学杂志 2025年第01期 12-31页

作者：曾宇旸吕健冰林峰付贵权李波刘淑伟罗国启陈小勇中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室和云南省高黎贡山生物多样性与生态安全重点实验室云南省东南亚生物多样性保护国际联合实验室中国科学院东南亚生物多样性研究中心中国科学院大学云南省渔业科学研究院龙陵小黑山省级自然保护区管护局

伊洛瓦底江作为中南半岛的大河之一，是缅甸境内最大的河流。其中，中国境内的支流龙川江-瑞丽江、大盈江、独龙江、勐乃河等河流具有丰富的鱼类多样性及多样的河流生境，共记录鱼类86种。由于以往调查深度不足，流域内仍存在未被发现... 详细信息

伊洛瓦底江作为中南半岛的大河之一，是缅甸境内最大的河流。其中，中国境内的支流龙川江-瑞丽江、大盈江、独龙江、勐乃河等河流具有丰富的鱼类多样性及多样的河流生境，共记录鱼类86种。由于以往调查深度不足，流域内仍存在未被发现、描述或记录的物种。2021年至2024年，对云南省保山市和德宏傣族景颇族自治州境内的伊洛瓦底江流域进行的多次高黎贡山鱼类多样性考察中，发现了4种未曾记录的淡水鱼类。通过对所采集到鱼类标本的重要性状进行测量、与国内外相关文献的原始描述进行形态特征比较及对部分标本进行分子系统比较，分别鉴定为怒江高原鳅（Triplophysa nujiangensa）、多鳞荷马条鳅（Homatula pycnolepis）、奥氏裸吻鱼（Psilorhynchus olliei）和长须纹胸■（Glyptothorax longinema）。其中怒江高原鳅和多鳞荷马条鳅分别为伊洛瓦底江水系内高原鳅属与荷马条鳅属的首次记录；奥氏裸吻鱼为裸吻鱼科在中国境内除西藏雅鲁藏布江水系外的首次记录；长须纹胸■分布于怒江和澜沧江，是伊洛瓦底江水系的首次记录。本文对中国境内伊洛瓦底江水系的物种鉴定提供了基础资料，对高黎贡山地区的鱼类资源调查和保护提供了基础依据。

关键词：云南伊洛瓦底江怒江高原鳅多鳞荷马条鳅奥氏裸吻鱼长须纹胸■ 新记录

外膜蛋白CsgG影响禽致病性大肠杆菌生物被膜形成

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微生物学通报 2025年第2期 811-821页

作者：彭浩恒林子竹胡剑刚张贝贝郭伟奇王欣宇王芷洋祁晶晶田明星鲍衍清李海花王少辉天津农学院动物科学与动物医学学院天津市农业动物繁育与健康养殖重点实验室中国农业科学院上海兽医研究所

【背景】禽致病性大肠杆菌(avian pathogenic Escherichia coli, APEC)能够引起禽类气囊炎、心包炎等症状，严重制约养禽业的健康发展。同时，APEC与人类肠道外致病性大肠杆菌(extraintestinal pathogenic Escherichia coli, ExPEC)具... 详细信息

【背景】禽致病性大肠杆菌(avian pathogenic Escherichia coli, APEC)能够引起禽类气囊炎、心包炎等症状，严重制约养禽业的健康发展。同时，APEC与人类肠道外致病性大肠杆菌(extraintestinal pathogenic Escherichia coli, ExPEC)具有相似的毒力因子，严重威胁公共卫生。APEC形成生物被膜可抵抗抗生素杀伤及逃避宿主免疫。因此，探究APEC生物被膜形成的关键基因和调控机制，对于防控APEC具有重要的理论和实践意义。【目的】探讨外膜蛋白CsgG在APEC生物被膜形成中的作用，揭示APEC生物被膜形成的分子机制，为禽大肠杆菌病的防治提供理论基础。【方法】利用Red同源重组技术构建的csgG基因缺失株ΔcsgG及其互补株CΔcsgG，分析了csgG对APEC生长、运动能力、膜通透性、胞外多糖(extracellular polysaccharides, EPS)产量及生物被膜形成能力的影响。【结果】csgG的缺失并不影响APEC的生长和细胞膜的通透性，但增强了APEC的运动性。csgG的缺失显著降低了APEC生物被膜形成能力，扫描电子显微镜观察发现缺失株生物被膜细菌组成由多层变为单层，细菌间黏附减少。激光扫描共聚焦显微镜观察发现csgG的缺失导致生物被膜结构松散，黏附的细菌数量减少，同时发现csgG缺失显著降低APEC的EPS产量。实时荧光定量PCR分析显示，csgG的缺失导致与生物被膜形成相关基因的转录水平显著降低。【结论】CsgG在APEC生物被膜形成过程中起着关键作用，严重影响生物被膜结构的完整性。

关键词：禽致病性大肠杆菌 CsgG 生物被膜胞外多糖

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黄鳝自然性逆转的遗传基础与优良种质创制研究进展

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水生生物学报 2025年第1期49卷 121-129页

作者：宋焱龙罗红瑞陶彬彬陈戟罗大极陈贶新周文宗胡炜中国科学院水生生物研究所水产品种创制与高效养殖全国重点实验室湖北洪山实验室武汉430072 上海市农业科学院农业农村部稻鱼综合种养生态重点实验室上海市农业科学院生态环境保护研究所上海201403

黄鳝(Monopterus albus)是第一个被发现的具有雌雄同体自然性逆转特性的脊椎动物。先雌后雄性别转变过程中性腺内细胞的重构及分子调控机制研究对于阐明鱼类生殖发育的机理具有重要科学价值。黄鳝是我国重要淡水名特优养殖鱼类,年养殖... 详细信息

黄鳝(Monopterus albus)是第一个被发现的具有雌雄同体自然性逆转特性的脊椎动物。先雌后雄性别转变过程中性腺内细胞的重构及分子调控机制研究对于阐明鱼类生殖发育的机理具有重要科学价值。黄鳝是我国重要淡水名特优养殖鱼类,年养殖产量超30万吨,苗种繁育困难、缺少优良养殖品种一直是制约产业发展的瓶颈。文章综述了国内外学者在黄鳝性逆转过程和调控机理基础研究的现状,以及近年在黄鳝优良种质创制技术和品种培育取得的突破性进展,以期为揭示黄鳝性逆转遗传基础这一经典而又极富挑战性的科学问题提供有益启示,促进黄鳝养殖产业高质量发展。

关键词：雌雄同体性逆转分子调控品种培育黄鳝

肠道共生生物对肠道干细胞的调节机制研究进展

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畜牧兽医学报 2025年

作者：丁莹莹张嘉芸唐龙轩张少华郭小腊蒲丽霞牟文杰王帅中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室

肠道干细胞（intestinal stem cells， ISCs）在维持肠道稳态中起重要作用。已有研究表明，肠道共生生物如微生物和寄生虫及其代谢产物对宿主的干细胞调节至关重要，可通过直接或间接作用影响肠道干细胞的更新分化。本文重点阐述了肠道... 详细信息

肠道干细胞（intestinal stem cells， ISCs）在维持肠道稳态中起重要作用。已有研究表明，肠道共生生物如微生物和寄生虫及其代谢产物对宿主的干细胞调节至关重要，可通过直接或间接作用影响肠道干细胞的更新分化。本文重点阐述了肠道菌群和蠕虫及其代谢产物对ISCs的影响，并侧重总结了相关的细菌、代谢产物等对ISCs增殖分化的研究进展。旨在为未来肠道损伤治疗提供新的思路。

关键词：肠道菌群肠道蠕虫肠道干细胞