检索结果-南通市图书馆

从基于结构定义的序列模体识别蛋白质的超家族

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科学通报 2002年第8期47卷 591-595页

作者：黄京飞刘次全中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室昆明650223

以进化上相距较远的蛋白质酪氨酸磷酸酶Ⅰ和Ⅱ为例,通过结构比较和基于结构的序列比对及共同保守区域残基替换模式的分析,定义了基于结构的序列模体.利用这种新的模体对SWISS-PROT和TrEMBL蛋白质序列库进行搜索,可特异性地同时识别磷酸... 详细信息

以进化上相距较远的蛋白质酪氨酸磷酸酶Ⅰ和Ⅱ为例,通过结构比较和基于结构的序列比对及共同保守区域残基替换模式的分析,定义了基于结构的序列模体.利用这种新的模体对SWISS-PROT和TrEMBL蛋白质序列库进行搜索,可特异性地同时识别磷酸酶Ⅰ和Ⅱ,其识别正确率可达98.4％.而在此之前,尚未见可同时识别磷酸酶Ⅰ和Ⅱ序列模体的报道.

关键词：基于结构定义蛋白质酪氨酸磷酸酶序列模体超家族序列识别假定蛋白质分子进化

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畜禽肉化学成分近红外光谱检测技术研究进展

光谱学与光谱分析 2013年第11期33卷 3002-3009页

作者：陶琳丽杨秀娟邓君明张曦云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 云南省动物营养与饲料重点实验室云南昆明650201

和传统的肉品化学成分检测方法相比,近红外光谱分析是一种能够快速、简单、安全和可同时测定多种化学成分的肉品检测方法。论述了近年来猪、鸡、牛、羊四种动物肉中粗蛋白质、肌间脂肪、脂肪酸、水分、灰分、肌红蛋白和胶原蛋白七种化... 详细信息

和传统的肉品化学成分检测方法相比,近红外光谱分析是一种能够快速、简单、安全和可同时测定多种化学成分的肉品检测方法。论述了近年来猪、鸡、牛、羊四种动物肉中粗蛋白质、肌间脂肪、脂肪酸、水分、灰分、肌红蛋白和胶原蛋白七种化学成分的近红外光谱分析检测研究进展,并探讨了目前研究中存在的问题及其原因。从已发表的研究结果可以看出,近红外光谱分析具有替代耗时成本高的现有肉品化学检测方法的巨大潜力,特别是用于商业上同步检测多种化学成分。研究大多采用主成分分析法进行特征光谱筛选,偏最小二乘和修正偏最小二乘法建立校正模型,交互验证进行预测结果评价。目前研究热点集中在肉中脂肪酸含量预测模型和应用近红外高光谱图像和多元回归预测肉中化学成分。近红外光谱预测结果差异性较大,这与样品集选择、光谱预处理和建模方法都有很密切的关系。样品选择对近红外预测精度具有重要的意义,非均质肉样影响了近红外化学成分预测精度。总的来说,肌间脂肪、脂肪酸与水分指标预测效果较好,粗蛋白质和肌红蛋白指标预测效果次之,灰分和胶原蛋白指标预测结果较差。

关键词：近红外光谱检测技术肉化学成分综述

TRIM5α分子结构和限制HIV-1复制机制的研究进展

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病毒学报 2009年第2期25卷 148-153页

作者：汤霞况轶群郑永唐中国科学院昆明动物研究所动物模型和人类疾病机理重点实验室分子免疫药理学实验室云南昆明650223 中国科学院研究生院北京100039

TRIM(Tripartite motif protein)家族蛋白,又称为三重基序蛋白,它们均含有RING、B-box和Coiled-Ciol三个结构域。TRIM家族蛋白广泛分布于各种哺乳动物细胞中,具有众多功能,与细胞的分裂、生长、分化和成熟都有密切关系。TRIM家族成员之... 详细信息

TRIM(Tripartite motif protein)家族蛋白,又称为三重基序蛋白,它们均含有RING、B-box和Coiled-Ciol三个结构域。TRIM家族蛋白广泛分布于各种哺乳动物细胞中,具有众多功能,与细胞的分裂、生长、分化和成熟都有密切关系。TRIM家族成员之一TRIM5α是哺乳动物细胞中一种重要的限制因子,它们以一种物种依赖的方式限制包括HIV-1(Human immunodeficiency virustype1)在内的多种逆转录病毒复制。自2004年Stremlau M和Nisole S等分别发现恒河猴TRIM5α和鹰猴TRIMCyp能强烈限制HIV-1复制以来,[第一段]

关键词： TRIM5α CypA HIV-1 灵长类动物

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普洱茶提取物的抗HIV活性(英文)

中国天然药物 2012年第5期10卷 347-352页

作者：黄宁杨柳萌李晓莉郑昌博王睿睿杨永平郑永唐中国科学院昆明动物研究所、中国科学院和云南省动物模型与人类疾病机理重点实验室昆明650223 中国科学院研究生院南京210009 中国科学院昆明植物研究所民族植物学实验室昆明650204 中国药科大学药学院北京100039

目的:研究普洱熟茶(发酵)和普洱绿茶(未发酵)这 2 种常见普洱茶的抗 HIV 作用。方法:采用 MTT 比色法检测普洱茶提取物对 C8166, MT4 和 PBMC 细胞的毒性作用; 细胞病变法检测化合物对 HIV-1 急性感染的抑制活性。采用细胞病变法和 HIV-... 详细信息

目的:研究普洱熟茶(发酵)和普洱绿茶(未发酵)这 2 种常见普洱茶的抗 HIV 作用。方法:采用 MTT 比色法检测普洱茶提取物对 C8166, MT4 和 PBMC 细胞的毒性作用; 细胞病变法检测化合物对 HIV-1 急性感染的抑制活性。采用细胞病变法和 HIV-1 p24 抗原 ELISA 方法检测普洱茶提取物的抗 HIV 活性作用; 结果:所有普洱茶提取物都具有较低的细胞毒性 CC50为 120.63 524.95 μg·mL 1。所有普洱茶提取物均能抑制 HIV 诱导细胞形成合胞体其 EC50为 11.13 67.49 μg·mL 1。普洱茶水提物的抑制作用比醇提物的抑制作用要好, 并且普洱熟茶的抑制作用好于普洱生茶, 尤其是 YYP-31, 其 SI 值为 42.40。YYP-31 对HIV-RF和 HIV-2CBL-20也有很好的抑制作用, 其 EC50分别为 30.82 和 39.79 μg·mL 1。YYP-31 还能很好地抑制 HIV-1IIIB急性感染C8166 细胞和 HIV-1KM018感染PBMC细胞p24抗原的产生, 其EC50分别为14.95和 74.63 μg·mL 1。YYP-31能阻止正常细胞C8166与 HIV-1 慢性感染细胞 H9/HIV-1IIIB之间的融合, EC50为 234.27 μg·mL 1。提取物 YYP-31 与 AZT 联合用药具有显著的协同抗HIV 作用,但是对 HIV 逆转录没有抑制作用。结论:普洱茶提取物具有很好的抗 HIV 的活性作用, 可以作为一种 HIV 辅助治疗的产品或保健品用于 HIV 患者的治疗过程中。

关键词：茶茶树普洱茶抗HIV药物

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关山生物群中奇虾类前附肢的新发现

科学通报 2013年第32期58卷 2940-2945页

作者：王媛媛黄迪颖胡世学中国科学院南京地质古生物研究所现代古生物学与地层学国家重点实验室南京210008 成都地质矿产研究所成都610081

奇虾是寒武纪海洋中一类大型的捕食动物，处于海洋生态金字塔的顶端．完整奇虾化石很少见，通常保存前附肢及口器化石．本文研究了云南省昆明市高楼房剖面寒武系第二统第四阶乌龙箐组的大量奇虾类前附肢化石，建立Anomalocaris属的一新... 详细信息

奇虾是寒武纪海洋中一类大型的捕食动物，处于海洋生态金字塔的顶端．完整奇虾化石很少见，通常保存前附肢及口器化石．本文研究了云南省昆明市高楼房剖面寒武系第二统第四阶乌龙箐组的大量奇虾类前附肢化石，建立Anomalocaris属的一新种***．，以及1个新类型***．，***．其中***．可能具有15个肢节，第3节具有强壮的基腹刺，基腹刺具有不对称的6个腹侧刺，在基腹刺节之前可能存在2节，第1节骨化较弱、弯曲，第2节下方具有较小的刺突，4～14节腹刺具成对的腹侧刺，12～14节具背刺，末节具有一大一小2个端刺．***．，***．可见22节，向前明显渐细，大部分腹刺具有约5对小型腹侧刺，近末端的10个肢节具有背刺，末节具有2个很小的端刺．新化石材料的发现增加了我们对寒武纪奇虾类多样性的了解．通过对奇虾类前附肢形态特征的分析有助于揭示这类寒武纪大型食肉动物的捕食策略及它们在早期生态系统中的作用和地位．

关键词：云南寒武纪奇虾前附肢关山生物群

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中缅树鼩自然感染六种病毒的血清流行病学

Zoological Research 2011年第1期32卷 11-16页

作者：韩建保张高红段勇马建平张喜鹤罗荣华吕龙宝郑永唐中国科学院和云南省动物模型与人类疾病机理重点实验室中国科学院昆明动物研究所云南昆明650223 昆明医学院第一附属医院检验科云南昆明650032 中国科学院研究生院北京100049 中国科学院昆明灵长类研究中心中国科学院昆明动物研究所云南昆明650223

中缅树鼩作为一种新型实验动物,在医学生物学上,尤其是病毒学方面的应用受到越来越多的重视。实验动物自身病毒感染会影响动物健康和干扰实验结果,甚至危害实验人员生命安全。所以,实验动物病毒检测一直是动物质量控制的重要部分。中缅... 详细信息

中缅树鼩作为一种新型实验动物,在医学生物学上,尤其是病毒学方面的应用受到越来越多的重视。实验动物自身病毒感染会影响动物健康和干扰实验结果,甚至危害实验人员生命安全。所以,实验动物病毒检测一直是动物质量控制的重要部分。中缅树鼩研究迄今缺乏清晰的病毒自然感染资料。为调查中缅树鼩的病毒感染状况,采集野生俘获和人工繁殖的中缅树鼩血清样本272份,全部血清样本通过ELISA方法对乙型肝炎病毒(HBV)表面抗原,丙型肝炎病毒(HCV)总抗体,以及戊型肝炎病毒(HEV)、腺病毒(ADV)、单纯疱疹病毒1型(HSV-1)和2型(HSV-2)的IgG抗体进行了检测。结果表明,ELISA初筛HBV表面抗原有3份阳性样本,但通过乙型肝炎两对半定量检测进一步确认为阴性;抗HCV抗体和抗HEV、ADV、HSV-1IgG抗体检测均为阴性;抗HSV-2IgG检测有1份阳性样本。提示仅抗原或抗体血清学指标检测树鼩肝炎结果并不能反应个体携带病毒的状态,应该再进行病毒学指标确认。同时建议中缅树鼩繁殖群应进行HSV-2的筛选,以便杜绝和控制该病毒的感染。

关键词：中缅树鼩树鼩自然感染病毒血清流行病学

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宏基因组研究的生物信息学平台现状

Zoological Research 2012年第6期33卷 574-585页

作者：叶丹丹樊萌萌关琼陈红菊马占山中国科学院昆明动物研究所遗传资源国家重点实验室计算生物学与医学生态学研究组云南昆明650223 红河学院数学学院云南蒙自661100

由Handelsman et al(1998)提出的宏基因组(metagenome)泛指特定环境样品(例如:人类和动物的肠道、母乳、土壤、湖泊、冰川和海洋等环境)中微生物群落所有物种的基因组。宏基因组技术起源于环境微生物学研究,而新一代高通量测序技术使其... 详细信息

由Handelsman et al(1998)提出的宏基因组(metagenome)泛指特定环境样品(例如:人类和动物的肠道、母乳、土壤、湖泊、冰川和海洋等环境)中微生物群落所有物种的基因组。宏基因组技术起源于环境微生物学研究,而新一代高通量测序技术使其广泛应用成为可能。与基因组学研究相类似,目前宏基因组学发展的瓶颈在于如何高效分析高通量测序产生的海量数据,因此,相关的生物信息学分析方法和平台是宏基因组学研究的关键。该文介绍了目前宏基因组研究领域中主要的生物信息学软件及工具;鉴于目前宏基因组研究所采用的"全基因组测序"(whole genome sequencing)和"扩增子测序"(amplicon sequencing)两大测序方法所获得的数据和相应分析方法有较大差异,文中分别对相应软件平台进行了介绍。

关键词：宏基因组学扩增子测序全基因组测序生物信息学平台高通量测序技术

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中缅树鼩精子形态特征及冷冻损伤

Zoological Research 2012年第1期33卷 29-36页

作者：张远旭平述煌杨世华昆明理工大学生命科学与技术学院衰老与肿瘤分子遗传学实验室云南昆明650500 中国科学院和云南省动物模型与人类疾病机理重点实验室中国科学院昆明动物研究所云南昆明650223

树鼩作为一种新型的、接近灵长类的实验动物,在医学生物学上的应用受到越来越多的重视。精子的结构特性研究及冷冻后结构的完整性分析是精子生物学的主要内容,也有助于树鼩的实验室快速繁殖。该研究采用人工饲养的中缅树鼩(Tupaia belan... 详细信息

树鼩作为一种新型的、接近灵长类的实验动物,在医学生物学上的应用受到越来越多的重视。精子的结构特性研究及冷冻后结构的完整性分析是精子生物学的主要内容,也有助于树鼩的实验室快速繁殖。该研究采用人工饲养的中缅树鼩(Tupaia belangeri chinensis),结果显示其睾丸占总体重的(1.05±0.07)%,总体积为(1.12±0.10)mL。附睾尾及输精管精子总量估计在2.2×107～8.8×107,其运动度和顶体完整率分别为(68.8±3.9)%和(90.0±2.1)%。利用扫描电子显微镜和透射电子显微镜对树鼩附睾精子的超微结构进行的观察和分析显示精子头部呈圆形或卵圆形;头部长度、宽度平均分别为6.65和5.82μm;精子尾部中段、主段、尾段和精子总长度平均分别为13.39、52.35、65.74和73.05μm;尾部中段的线粒体螺旋数量为48个,其轴丝结构为典型的"9+9+2"结构。冷冻解冻后的精子主要表现在顶体与质膜不完整、精子断裂、尾部扭曲和膨大。上述结果提示树鼩精子与其他哺乳动物精子的结构特征相似,但是精子大小和线粒体螺旋数目有明显的差别,且超微结构改变仍是冷冻精子运动和受精能力下降的主要原因。

关键词：树鼩睾丸精子形态结构冷冻损伤

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云南僰人源流的父系和母系遗传研究

Zoological Research 2006年第5期27卷 449-455页

作者：石宏李易罗虹吉学平宿兵中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室云南省文物考古研究所云南昆明650118

对云南人32份男性DNA样本进行Y染色体单倍型以及mitochondrialDNA(mtDNA)单倍型分析,结果发现云南人的父系和母系遗传组分都表现出典型的南方人群的遗传特征。由人的数据结合已经发表的东亚人群的Y染色体和mtDNA单倍型(haplotype... 详细信息

对云南人32份男性DNA样本进行Y染色体单倍型以及mitochondrialDNA(mtDNA)单倍型分析,结果发现云南人的父系和母系遗传组分都表现出典型的南方人群的遗传特征。由人的数据结合已经发表的东亚人群的Y染色体和mtDNA单倍型(haplotype)数据进行MultidimensionalScaling(MDS)分析,结果表明,在MDS分布图中人群体的Y染色体单倍型和mtDNA单倍型都与南方人群聚在一起。这一结果支持人的遗传族源为东亚南方人群后裔,与考古学的推论相一致。结合历史和考古学证据来探讨人的起源和史前迁移,为揭开“人悬棺”这种独特的考古文化的起源和史前传播提供遗传学的研究证据。

关键词：僰人悬棺葬遗传族源 Y染色体 mtDNA