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苯丙氨酰-tRNA合成酶的进化与结构域丢失(英文)

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生物化学与生物物理学报 2003年第12期35卷 1061-1065页

作者：林军黄京飞中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室昆明650223 中国科学院研究生院北京100039 云南省畜禽分子生物学重点实验室

基因的复制、融合以及基因的水平转移是许多蛋白质包括氨酰 tRNA合成酶 (aminoacyl tRNAsynthetase ,AARS)进化过程中的常见事件。然而作者研究的结果显示 ,苯丙氨酰 tRNA合成酶 (phenylalanyl tRNAsynthetase,PheRS)的进化主要表现为... 详细信息

基因的复制、融合以及基因的水平转移是许多蛋白质包括氨酰 tRNA合成酶 (aminoacyl tRNAsynthetase ,AARS)进化过程中的常见事件。然而作者研究的结果显示 ,苯丙氨酰 tRNA合成酶 (phenylalanyl tRNAsynthetase,PheRS)的进化主要表现为一些结构域的丢失 ;并且这种结构域的丢失不影响PheRS的功能或活性。通常在生物从细菌到真核生物的进化过程中 ,其基因组的大小和基因的数目都有所增加 ,然而有趣的是 ,真核生物中PheRS的结构域类型和数目都明显少于细菌的PheRS。PheRS通过结构域的丢失而进化的现象 ,似乎与某些AARS功能由多重专一性向单一专一性的演化有着“异曲同工”之妙。

关键词：苯丙氨酰-tRNA合成酶结构域丢失分子进化

Mitochondrial DNA D-loop Variation and Genetic Background of Brahman Cattle

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Zoological Research 2006年第6期27卷 615-620页

作者：亐开兴吴桂生廖祥龙金显栋赵刚杨国荣袁希平黄必志文际坤张亚平云南省肉牛和牧草研究中心云南昆明650212 中国科学院昆明动物研究所云南省畜禽分子生物学重点实验室分子进化与基因组多样性实验室

The complete mitochondrial DNA D-loop sequences from 10 stud Brahman cattle were sequenced and analyzed. The results showed that the genetic diversity of Brahman cattle was rich ; the rate of nucleotide variation, haplotype diversity and nucleotide diversity were 6.25%, 0.978± 0.054 and 0.014 30± 0.008 68, respectively. Nine haplotypes were defined and fell into two distinct lineages, suggesting that Brahman cattle have both Bos indicus （Zebu） and B. taurus genetic background. The taurine haplotypes were predominant at 90% and only Brah-6 belonged to the Asian zebu mthaplotype. This indicates that Brahman cattle was one of the zebu breeds and inherited the excellent characteristics of both the Asian zebu and European beef cattle, such as easy calf delivery, high quality beef, heat tolerance and resistance to various parasites. Breeders introduced Brahman cattle to improve the productivity and adaptability of native cattle. The Zebu has evidently frequently introgressed into the modem taurine breeds. As for modem zebu breeds, B. taurus also highly contributed to their formation, except for the Asian zebu. Furthermore our results also confirm the hypothesis that B. indicus has undergone a separate domestication event and originated from the Indian subcontinent.

关键词： Brahman cattle mtDNA D-loop polymorphism genetic background

用6个微卫星座位研究BMY牛和婆罗门牛的遗传多样性和群体遗传结构

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遗传 2006年第3期28卷 285-290页

作者：亐开兴朱芳贤吴桂生聂龙金显栋杨国荣袁希平文际坤张亚平云南省肉牛和牧草研究中心昆明650212 中国科学院昆明动物研究所云南省畜禽分子生物学重点实验室细胞与分子进化重点实验室昆明650223

对6个牛微卫星座位的遗传变异及多态性分析，以期了解BMY牛和婆罗门牛的群体遗传结构与育成情况。6个微卫星座位的多态信息含量为在0．524～0．752间，BMY牛、婆罗门牛两个群体的平均期望杂合度和观察杂合度值接近，分别为0．7376和0．7... 详细信息

对6个牛微卫星座位的遗传变异及多态性分析，以期了解BMY牛和婆罗门牛的群体遗传结构与育成情况。6个微卫星座位的多态信息含量为在0．524～0．752间，BMY牛、婆罗门牛两个群体的平均期望杂合度和观察杂合度值接近，分别为0．7376和0．7396，0．6412和0．6537，进入横交固定第二世代的BMY牛期望杂合度值较高，这与我们的育种进展相符。红安格斯的期望杂合度较低（0．4609）接近日本和牛0．471，暗示红安格斯牛的同质性较高。

关键词： BMY牛婆罗门牛遗传多样性微卫星

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基于文献计量法的杜鹃花研究现状及热点分析

西华师范大学学报（自然科学版） 2025年第1期46卷 22-29页

作者：王一霞黄旭东曾文汐马文宝余海清王飞甘小洪董廷发西华师范大学生命科学学院四川南充637009 四川省林业科学研究院成都610081 四川省甘孜藏族自治州林业科学研究所四川甘孜626001 中国科学院植物研究所华西亚高山植物园成都611830 云南大学生态与环境学院生物多样性研究院入侵生物学研究中心西南跨境生态安全教育部重点实验室云南省植物繁殖适应与进化生态学重点实验室昆明650500

杜鹃花(Rhododendron)是世界著名的观赏花卉,因其重要的观赏价值、经济价值而备受关注。基于Web of Science核心合集和CNKI数据库,利用CiteSpace软件对近二十年国内外杜鹃花的研究现状进行分析,总结了杜鹃花研究领域的前沿热点及发展趋... 详细信息

杜鹃花(Rhododendron)是世界著名的观赏花卉,因其重要的观赏价值、经济价值而备受关注。基于Web of Science核心合集和CNKI数据库,利用CiteSpace软件对近二十年国内外杜鹃花的研究现状进行分析,总结了杜鹃花研究领域的前沿热点及发展趋势。研究发现:(1)近二十年关于杜鹃花的研究型论文以英文为主,且英文文献数量呈现快速增加的趋势,而中文论文在前十年快速增加,近十年呈波动趋势;(2)美国是英文文献中贡献最多的国家,中国科学院(Chinese Academy of Sciences)是中英文发文量最高的机构,陈训和Peter ***分别是发表中文和英文文献最多的学者;(3)中、英文文献早期在杜鹃花研究领域的关注点有所不同,中文文献主要集中在杜鹃花品种培育、扦插栽培和抗性研究,英文文献则更加关注杜鹃花品种培育从分子层面上的实施,以及杜鹃花野外资源的保护。近年来,气候变化下杜鹃花的响应及品种培育已成为研究热点,建议在今后的工作中加强对全球变化下杜鹃花的响应以及抗性育种的研究。

关键词：杜鹃花研究热点知识图谱可视化分析 CiteSpace

Genetic differentiations between randomly and selectively bred pig populations in Yunnan,China

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Zoological Research 2011年第3期32卷 255-261页

作者：亐开兴吴桂生苟潇严达伟连林生 Mumtaz Baig 张亚平中国科学院昆明动物研究所云南省畜禽分子生物学重点实验室分子进化与基因组多样性实验室云南大学生物资源保护与利用重点实验室云南省草地动物科学研究院中国科学院植物研究所云南农业大学动物科技学院 Department of Zoology Govt Vidarbha Institute of Science and HumanitiesAmravati 444604India

To assess the genetic diversity between randomly and selectively bred populations,we sequenced 438 bp of the mitochondrial DNA control region from 102 *** samples represented four native pig breeds,one nucleus and one conservation herd from Yunnan,*** haplotypes with sixteen polymorphic sites were *** number of haplotypes in the nucleus herd of Saba pig and the conservation herd of Banna miniature pig were restricted to three and one,respectively,while the randomly bred pig populations exhibited over six ***,haplotype diversity in randomly bred populations was significantly greater than the selectively bred populations（h=0.732 vs.0.425 and 0,exact test,P≤0.0036）.These findings demonstrate that selective breeding generated low genetic diversity compared to randomly bred pig breeds.A timely intervention and well programmed breeding approach would stop further genetic diversity reduction in the nucleus and conservation herds of native pig ***,selective breeding would dramatically reduce genetic diversity in only several years,indicating that sharp contradictions exist between breeding,conservation and genetic *** relationships are discussed based on net genetic distances among pig populations.

关键词： Yunnan pig breeds Genetic diversity Randomly bred population Selectively bred population

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DNA拓扑异构酶Ⅱ与ⅠA的进化分析

Zoological Research 2006年第6期27卷 595-600页

作者：任永明唐素妮黄京飞中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室中国科学院研究生院北京100049 中国科学院昆明动物研究所云南省畜禽分子生物学重点实验室云南昆明650223

DNA拓扑异构酶与断开DNA链和改变其拓扑结构有关。先前的研究认为,拓扑异构酶TypeⅡB是由TypeⅡA通过基因的复制、重组和缺失所造成。然而,本研究结果则显示,TypeⅠA与TypeⅡB的进化关系较近,而TypeⅡA与TypeⅡB的关系较远。因此,TypeⅡ... 详细信息

DNA拓扑异构酶与断开DNA链和改变其拓扑结构有关。先前的研究认为,拓扑异构酶TypeⅡB是由TypeⅡA通过基因的复制、重组和缺失所造成。然而,本研究结果则显示,TypeⅠA与TypeⅡB的进化关系较近,而TypeⅡA与TypeⅡB的关系较远。因此,TypeⅡB可能是由TypeⅠA演化而来,或者说,TypeⅡB是TypeⅠA在古细菌中的特化形式;TypeⅡB可能是由TypeⅡA通过形成TypeⅠA后演化而成的,而不是由TypeⅡA直接通过基因的复制、重组和缺失所造成。在由TypeⅡA演化成为TypeⅠA,最后演化为TypeⅡB的过程中,DNA拓扑异构酶的催化机制也发生了变化从需要金属离子的协助,演化到了不需要镁离子的存在协助其催化。

关键词： DNA拓扑异构酶 CAP-like结构域 Toprim结构域分子进化,催化机制

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昆明种犀牛小鼠及其分子遗传基础

科学通报 2004年第1期49卷 74-80页

作者：田明熊郁良王婉瑜张亚平中国科学院昆明动物研究所云南省畜禽分子生物学重点实验室中国科学院昆明动物研究所昆明650223

无毛型(hr)和犀牛型(hrrh)小鼠是无毛基因(hr)突变时的两种不同表型,但犀牛小鼠与丘疹性秃头症患者有着更相似的病理特征,因而是重要的实验动物模型.报道了中国科学院昆明动物研究所饲养的昆明小鼠封闭群中发现的犀牛型无毛小鼠,并将其... 详细信息

无毛型(hr)和犀牛型(hrrh)小鼠是无毛基因(hr)突变时的两种不同表型,但犀牛小鼠与丘疹性秃头症患者有着更相似的病理特征,因而是重要的实验动物模型.报道了中国科学院昆明动物研究所饲养的昆明小鼠封闭群中发现的犀牛型无毛小鼠,并将其命名为犀牛小鼠KIZ.从形态学、皮肤组织病理学、基因序列分析、家系分析和基因功能分析等方面进行了系统的研究,证明无毛基因(hr)第2817位的无义突变(C→T)是导致犀牛小鼠KIZ的原因.在昆明小鼠中发现的犀牛型无毛突变小鼠,由于其遗传机制清楚,将是一个很有前景的实验动物模型.

关键词：无毛基因丘疹性秃头症犀牛小鼠分子遗传学形态学

云南保山猪线粒体DNA D-loop区序列初步分析

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遗传 2003年第5期25卷 526-528页

作者： 开兴连林生聂龙史宪伟张亚平云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 中国科学院昆明动物研究所云南省畜禽分子生物学重点实验室细胞与分子进化重点实验室昆明650223

为了解云南保山猪(Baoshanpig)的遗传多样性及其遗传背景,我们测定了19个个体线粒体DNAD loop高变区I15363～15801片段序列438bp。检测到10种单倍型,包括8个多态位点,其中5次T/C转换、1次G/A转换、1次G/C颠换和1次A/T颠换,其A、T、G、C... 详细信息

为了解云南保山猪(Baoshanpig)的遗传多样性及其遗传背景,我们测定了19个个体线粒体DNAD loop高变区I15363～15801片段序列438bp。检测到10种单倍型,包括8个多态位点,其中5次T/C转换、1次G/A转换、1次G/C颠换和1次A/T颠换,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为35.4%、26.9%、13.2%和24.5%,A+T含量(62.3%)明显高于G+C含量(37.7%)。对于保山猪的保种及其持续利用有着重要的理论指导意义。

关键词：保山猪线粒体DNA D-loop 高变区I 遗传多样性序列分析

云南18个民族Y染色体双等位基因单倍型频率的主成分分析

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Acta Genetica Sinica 2004年第10期31卷 1030-1036页

作者：董永利杨智丽石宏高路鲁靖程宝文李开源昝瑞光肖春杰云南大学人类遗传学研究中心昆明650091 中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室比较基因组学研究组昆明650223

世居云南的少数民族中 ,壮、傣、水、布依、布朗、德昂、佤、彝、白、怒、哈尼、傈僳、拉祜、纳西、景颇、阿昌、基诺和独龙 18个民族是由“羌”、“濮”、“越”3大部落群体演化而来 ,是云南的土著居民。利用PCR RFLP方法对这18个土著... 详细信息

世居云南的少数民族中 ,壮、傣、水、布依、布朗、德昂、佤、彝、白、怒、哈尼、傈僳、拉祜、纳西、景颇、阿昌、基诺和独龙 18个民族是由“羌”、“濮”、“越”3大部落群体演化而来 ,是云南的土著居民。利用PCR RFLP方法对这18个土著民族进行Y染色体上 13个双等位基因位点进行基因分型。结果显示 ,不同历史族源的民族群体在Y染色体双等位基因单倍型分布上具有一定的差异 :在百越后裔民族群体中以单倍型H11、H12为主要分布 ;在氐羌后裔民族中以单倍型H5、H6和H8为主要分布 ;在百濮后裔民族群体中主要单倍型分布为H6、H8和H11。进一步主成分分析表明 ,百越后裔民族群体和氐羌后裔民族在主成分图上聚为两组 ,提示父系基因库有不同的来源。

关键词： Y染色体双等位基因单倍型云南民族