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植物乳杆菌胞外多糖的生物合成及生物学功能

中国食品学报 2024年第7期24卷 351-363页

作者：李凤娇夏永军熊智强艾连中王光强上海理工大学健康科学与工程学院、上海食品微生物工程技术研究中心上海200093

胞外多糖(EPS)作为植物乳杆菌重要的生物活性分子,其合成受基因簇的调控。不同的植物乳杆菌菌株具有不同的EPS合成基因簇,产生不同组成和结构的胞外多糖,这些胞外多糖以菌株特异性的方式影响微生物与宿主相互作用,从而产生抗氧化、抗肿... 详细信息

胞外多糖(EPS)作为植物乳杆菌重要的生物活性分子,其合成受基因簇的调控。不同的植物乳杆菌菌株具有不同的EPS合成基因簇,产生不同组成和结构的胞外多糖,这些胞外多糖以菌株特异性的方式影响微生物与宿主相互作用,从而产生抗氧化、抗肿瘤和免疫调节等不同的生物学功能。本文总结植物乳杆菌的胞外多糖的基本特征,概述其生物合成和生物学功能,以期解析植物乳杆菌胞外多糖生物合成遗传信息-物理化学特征-生理功能的关联,为阐明其发挥益生作用的模式提供理论依据。

关键词：植物乳杆菌胞外多糖生物学功能

Gasdermin膜打孔蛋白——细胞焦亡的执行者

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生物化学与生物物理进展 2024年第10期 2311-2327页

作者：侯彦婕丁璟珒中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室中国科学院生物大分子卓越创新中心

细胞焦亡是一种由膜打孔蛋白gasdermin（GSDM）家族介导的膜裂解性细胞程序性坏死，在机体抵御病原感染、清除变异或有害细胞等生物学过程中发挥关键作用。哺乳动物具有双结构域自抑制特征的GSDM蛋白通过上游蛋白酶切割释放N端的效应结... 详细信息

细胞焦亡是一种由膜打孔蛋白gasdermin（GSDM）家族介导的膜裂解性细胞程序性坏死，在机体抵御病原感染、清除变异或有害细胞等生物学过程中发挥关键作用。哺乳动物具有双结构域自抑制特征的GSDM蛋白通过上游蛋白酶切割释放N端的效应结构域，在细胞膜上发生剧烈的构象变化并寡聚打孔，介导裂解性的细胞焦亡。GSDM蛋白进化保守，在包括细菌在内的多种生物体中普遍存在，蛋白酶切割释放膜打孔活性是GSDM蛋白激活的通用机制。最近在一些低等真核生物中发现缺少C端自抑制结构域的非经典GSDM蛋白，它们采用非酶切依赖的全新机制激活膜打孔活性，介导细胞死亡。由于细胞焦亡高度促炎的免疫学特征，机体通过基因转录和蛋白质翻译后修饰等多种方式精确地调控GSDM蛋白的活性，从而控制细胞焦亡的程度和产生的炎症效应；病原菌在和宿主免疫系统的博弈中，也进化出专门的机制直接拮抗宿主的细胞焦亡免疫防御。本文围绕近年来GSDM蛋白介导细胞焦亡领域的研究进展，系统地总结了GSDM蛋白的基本生物学特征、及其丰富多样的活化和调控机制，并展望了细胞焦亡研究的生物学意义和未来方向。

关键词：细胞焦亡打孔蛋白激活机制调控机制病原菌

外泌体来源microRNA在微生物感染中的作用研究进展

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中国病原生物学杂志 2024年第6期19卷 729-732页

作者：杜文雅马枫茜代禹美陈瑞枫王国富吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

外泌体包含母细胞来源的蛋白质、脂质和核酸等多种成分,其中核酸中的miRNA起到越来越重要的作用,miRNA通过靶向mRNA 3′端非翻译区结合导致mRNA降解或翻译抑制。许多疾病的发生都伴随着miRNA表达失调,这对宿主基因调控和某些分子机制产... 详细信息

外泌体包含母细胞来源的蛋白质、脂质和核酸等多种成分,其中核酸中的miRNA起到越来越重要的作用,miRNA通过靶向mRNA 3′端非翻译区结合导致mRNA降解或翻译抑制。许多疾病的发生都伴随着miRNA表达失调,这对宿主基因调控和某些分子机制产生影响。越来越多研究证明miRNA可以作为疾病的潜在生物标志物、治疗靶点,参与炎症反应的过程等。本文就外泌体中的miRNA在病毒,细菌等微生物导致的感染性疾病,如流感病毒、肝炎病毒、HIV、结核分枝杆菌、梅毒螺旋体和支原体中的作用进行综述。

关键词：外泌体 miRNA 微生物感染性疾病综述

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江苏省23例猴痘病例病毒基因组特征分析

新发传染病电子杂志 2024年第4期9卷 12-17页

作者：赵康辰朱小娟乔乔陈银吴涛崔舟崔仑标葛以跃江苏省疾病预防控制中心(江苏省预防医学院)病原微生物研究所国家卫健委肠道病原微生物重点实验室江苏省新发突发重大传染病病原微生物重点实验室江苏南京210009

目的分析2023年6月至9月江苏省23例猴痘病例病毒全基因组序列并研究其分子进化特征。方法收集猴痘病例口咽拭子、痘疱液、痘疱渗出物拭子等样本,以实时定量PCR进行病毒核酸检测,利用扩增子测序技术捕获猴痘样本中病毒全基因组,通过Mini... 详细信息

目的分析2023年6月至9月江苏省23例猴痘病例病毒全基因组序列并研究其分子进化特征。方法收集猴痘病例口咽拭子、痘疱液、痘疱渗出物拭子等样本,以实时定量PCR进行病毒核酸检测,利用扩增子测序技术捕获猴痘样本中病毒全基因组,通过MiniSeq高通量测序仪进行二代测序,对序列进行病毒进化和变异分析。结果23份样本的平均测序深度907.30×~11578.58×,基因组覆盖度(测序深度≥10×)95.50%~99.94%。系统发育分析显示,病毒均属于MPXVⅡb C.1(2023)谱系,与来自同时期日本、韩国、葡萄牙和中国的序列同属一个分支,并分布于3个聚类簇中。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)分析共发现60个SNPs,包含59处碱基替换和1处碱基缺失,其中非同义突变26个,分别影响宿主免疫调控、膜蛋白和病毒转录调控功能。26个非同义突变中有25个SNPs为载脂蛋白B mRNA编辑催化多肽样(APOBEC3-like)突变,且23份样本中的6个共享突变均为APOBEC3-like突变。样本23010与23011只有C177833T一个突变位点的区别,且C76450T和G80405A位点均只在这两个样本中出现。结论江苏省2023年6月至9月23例猴痘病毒均为Ⅱb进化分支C.1(2023)谱系,病毒来源为多个源头输入,应持续开展猴痘病毒全基因组监测和研究,密切关注病毒来源和在本地传播后的变异进化方式。

关键词：猴痘病毒高通量测序基因组特征单核苷酸多态性

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贝氏柯克斯体耐受渗透脱水研究模型的建立

中国人兽共患病学报 2024年第5期40卷 415-420页

作者：王涛孙静尹白露于永慧何卫平段学章解放军总医院第五医学中心肿瘤医学部放射治疗科北京100039 解放军总医院第五医学中心感染病医学部国家感染临床医学研究中心北京100039 军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的基于无生命培养体系,探索建立贝氏柯克斯体耐受脱水的实验室研究模型。方法梯度调整贝氏柯克斯体无生命培养体系中的渗透压条件,利用qPCR定量测定不同渗透压下贝氏柯克斯体在培养周期内基因组拷贝数变化并描记生长曲线,进一步利用... 详细信息

目的基于无生命培养体系,探索建立贝氏柯克斯体耐受脱水的实验室研究模型。方法梯度调整贝氏柯克斯体无生命培养体系中的渗透压条件,利用qPCR定量测定不同渗透压下贝氏柯克斯体在培养周期内基因组拷贝数变化并描记生长曲线,进一步利用相差显微镜、透射电子显微镜对真核细胞以及无细胞培养方法所得贝氏柯克斯体进行形态学分析,并感染BGMK细胞测定不同渗透压培养所得贝氏柯克斯体的感染性VFU。结果贝氏柯克斯体可在高渗透压条件的无生命培养基中适应性生存7 d以上,经高渗透压培养后的菌体脱水收缩且大小类似于小贝氏体,同时感染后24 h的VFU较对照组降低。结论成功建立了贝氏柯克斯体耐受高渗压脱水的研究模型,为下一步用蛋白质组学等方法研究贝氏柯克斯体在自然环境中耐受干燥脱水的遗传学机制奠定了基础。

关键词：贝氏柯克斯体 Q热渗透压脱水无生命培养

微滴式数字PCR技术快速精准检测苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌

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菌物学报 2024年第9期43卷 67-79页

作者：李辉姜锋杨春光姜丽赵鹏李鑫大连海关技术中心辽宁大连116000 东港海关综合技术服务中心辽宁丹东118300 长春工业大学人文信息学院吉林长春130122 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101

为了建立苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌Neofabraea perennans微滴式数字PCR (ddPCR)检测方法,实现苹果检疫性病原菌的高效率、高精度的检疫鉴定和疫情监控,为口岸外来有害生物防控和保护我国生态安全提供技术服务和支持。本研究以***为... 详细信息

为了建立苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌Neofabraea perennans微滴式数字PCR (ddPCR)检测方法,实现苹果检疫性病原菌的高效率、高精度的检疫鉴定和疫情监控,为口岸外来有害生物防控和保护我国生态安全提供技术服务和支持。本研究以***为研究对象,通过生物信息学分析确定β-微管蛋白基因(TUB2)作为靶标进行特异性引物与探针设计,通过引物和探针浓度以及退火温度的优化,构建***的ddPCR特异性检测体系。研究结果表明,***的ddPCR检测体系的绝对定量检测低限为0.16 copies/μL,最低基因组DNA检测浓度为10.0 pg/μL,与qPCR方法一致,在定量检测范围内的线性相关系数R2大于0.999,RSD小于25%,说明该检测体系的重复性较好,能够用于进口水果样品中苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌***的快速精准检测。

关键词：微滴式数字PCR 苹果牛眼果腐病多年明孢盘菌快速检测

刺五加的活性成分、生物学功能及在动物生产中的应用

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中国饲料 2024年第15期 70-76页

作者：宋婕季彬彭轶楠叶泽王治业甘肃省科学院生物研究所甘肃兰州730000 甘肃省微生物资源开发利用重点实验室甘肃兰州730000

刺五加富含苷类、黄酮、多糖、木脂素、香豆素等生物活性成分,具有促进生长性能、提高免疫力、抗氧化、抗炎、抗应激等生物学功能。本文对刺五加的营养价值、活性成分、生物学功能及在动物生产中的应用进行综述,旨在为刺五加饲料添加剂... 详细信息

刺五加富含苷类、黄酮、多糖、木脂素、香豆素等生物活性成分,具有促进生长性能、提高免疫力、抗氧化、抗炎、抗应激等生物学功能。本文对刺五加的营养价值、活性成分、生物学功能及在动物生产中的应用进行综述,旨在为刺五加饲料添加剂的研发和应用推广提供参考。

关键词：刺五加营养成分生物学功能动物生产应用

长牡蛎(Crassostrea gigas)环GMP-AMP合酶(cyclic GMP-AMP synthase,cGAS)的基因克隆与功能研究

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热带海洋学报 2024年

作者：白晶毛帆刘客林宋菁晨喻子牛张扬中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室中国科学院南海海洋研究所暨南大学

环GMP-AMP合酶(cyclic GMP-AMP synthase, cGAS)是一种关键的细胞内传感器,能够识别细胞质内异常存在的DNA并触发免疫反应。为了揭示cGAS在软体动物先天性免疫调控中的重要作用,本研究成功克隆了长牡蛎中的cGAS基因(CgcGAS),其开放阅读... 详细信息

环GMP-AMP合酶(cyclic GMP-AMP synthase, cGAS)是一种关键的细胞内传感器,能够识别细胞质内异常存在的DNA并触发免疫反应。为了揭示cGAS在软体动物先天性免疫调控中的重要作用,本研究成功克隆了长牡蛎中的cGAS基因(CgcGAS),其开放阅读框(open reading frame, ORF)全长1623bp,编码540个氨基酸,理论相对分子质量为62.3kDa,并具有保守的Mab21结构域。系统进化分析表明了CgcGAS为软体动物cGAS家族中的一员。定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)结果显示Cgc GAS广泛表达于各组织,并在消化腺的相对表达量最高。亚细胞定位实验观察到CgcGAS蛋白在细胞核和细胞质中都有分布,主要定位于细胞核,提示其可能在细胞核内的DNA感应以及细胞质内的DNA结合和信号传递中发挥作用。另外,双荧光素酶报告基因系统和RNA干扰实验结果显示, CgcGAS能够显著激活NF-κB和ISRE信号通路,及其下游的炎症相关因子干扰素诱导病毒抑制蛋白(virus inhibitory proteinendoplasmicreticulum-associatedinterferon-inducible,viperin)、肿瘤坏死因子(tumornecrosisfactor, TNF)、白细胞介素-17(interleukin-17, IL-17)及转录因子干扰素调节因子2/8 (interferon regulatory factor 2/8, IRF2/8)的表达。综上所述, CgcGAS在长牡蛎的先天性免疫反应中的信号传递过程中发挥了关键作用。

关键词：长牡蛎先天性免疫环GMP-AMP合酶基因克隆功能

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溶瘤病毒递送策略的研究进展

中国病原生物学杂志 2024年第11期19卷 1385-1389页

作者：陈浩楠王焱米赟奇田甜郭娇西安市病原微生物与肿瘤免疫重点实验室陕西西安710000 西安医学院基础医学部吉林大学白求恩第二临床医学院

溶瘤病毒(Oncolytic virus,OV)能够特异性地在肿瘤细胞内复制并造成肿瘤细胞裂解,而对正常细胞无影响,因此被视为对免疫检查点抑制剂治疗后无反应或未能实现持久反应的癌症患者的一种治疗选择。目前多款溶瘤病毒疗法陆续获批上市。局部... 详细信息

溶瘤病毒(Oncolytic virus,OV)能够特异性地在肿瘤细胞内复制并造成肿瘤细胞裂解,而对正常细胞无影响,因此被视为对免疫检查点抑制剂治疗后无反应或未能实现持久反应的癌症患者的一种治疗选择。目前多款溶瘤病毒疗法陆续获批上市。局部瘤内注射溶瘤病毒是目前主流疗法,然而该疗法对转移性癌症患者疗效有限。近年来,全身静脉递送溶瘤病毒疗法逐渐兴起。这种疗法的递送方式包括细胞运输、基因和纳米修饰、聚合物涂层、非生物载体、与免疫抑制剂联合等,可以协助溶瘤病毒逃避机体免疫或引发机体抗肿瘤免疫,以提高溶瘤病毒的递送和治疗效率。本综述对溶瘤病毒用药方式、给药与效应屏障、溶瘤病毒递送策略进行总结。

关键词：溶瘤病毒瘤内递送静脉递送免疫逃避免疫治疗综述