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基于多组学联用的活鱼暂养及运输应激研究进展

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南方水产科学 2024年第3期20卷 173-180页

作者：岑剑伟陈琛姚世鹏黄卉郝淑贤魏涯杨少玲何静怡王田中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部水产品加工重点实验室广东广州510300 中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心海南三亚572018 上海海洋大学食品学院上海201306 镇巴县农业综合执法大队陕西汉中723600 大连海洋大学水产与生命学院辽宁大连116023

鱼类长途保活运输技术是我国“南鱼北运”实施的主要方法。鱼类在运输过程中受到如低温、盐度变化、碱性胁迫等环境因素影响,结合多组学联合的研究方法对鱼类运输过程中产生的应激进行多维度的分析。识别差异表达基因、蛋白质及代谢物,... 详细信息

鱼类长途保活运输技术是我国“南鱼北运”实施的主要方法。鱼类在运输过程中受到如低温、盐度变化、碱性胁迫等环境因素影响,结合多组学联合的研究方法对鱼类运输过程中产生的应激进行多维度的分析。识别差异表达基因、蛋白质及代谢物,进而解析调控网络及生物标志物对应激反应的影响,有助于理解鱼类运输过程中的健康状况,优化暂养及运输条件,提高活鱼品质与存活率。综述了近年来鱼类在运输中产生各类应激的组学研究进展,为精准调控鱼类保活运输中的各项环境指标及深入研究活鱼运输应激的相关机理提供参考。

关键词：鱼类保活运输转录组蛋白质组代谢组多组学联用

基于细菌气溶胶的地下式污水厂空气质量评价与风险管理

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环境科学学报 2024年

作者：张璐晶邓子祺李威龙陈昕悦郑祥庞洪涛侯锋程荣曹效鑫信开环境投资有限公司中国人民大学化学与生命资源学院贵州筑信水务环境产业有限公司

地下式污水厂因空间较为封闭可能聚集较高浓度的微生物气溶胶，从而对员工身体健康造成威胁.本研究选取某典型地下式污水厂作为研究对象，监测厂内细菌气溶胶的浓度和粒径分布特征，并通过非致癌风险商（HQ）和定量微生物风险评估（QMR... 详细信息

地下式污水厂因空间较为封闭可能聚集较高浓度的微生物气溶胶，从而对员工身体健康造成威胁.本研究选取某典型地下式污水厂作为研究对象，监测厂内细菌气溶胶的浓度和粒径分布特征，并通过非致癌风险商（HQ）和定量微生物风险评估（QMRA）方法对其健康风险进行评价.结果表明：（1）该地下式污水厂各处理单元细菌气溶胶平均浓度范围为86～736 CFU·m-3，低于传统地上污水厂A2O工艺、氧化沟工艺和SBR工艺的浓度水平；（2）在预处理区、污泥脱水区和生化池缺氧区检测到大肠杆菌、沙门氏菌和金黄色葡萄球菌，其浓度范围分别为3～17、3～12、和5～8 CFU·m-3；（3）各处理单元的细菌气溶胶粒径在Anderson六级采样器各级范围分布较平均，其中，可吸入颗粒物（健康风险极大，需要重点监测防控.

关键词：细菌气溶胶地下式污水厂分布特征定量微生物风险评估

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来自两会的声音:好政策出好产业

中国石油和化工产业观察 2024年第2期 18-21页

作者：张天任陆铭马永生莫鼎革刘中民李景虹薛济萍姚锦龙天能控股集团上海交通大学中国发展研究院全国政协中国石化集团公司中石化宁波镇海炼化有限公司中国工程院中国科学院中天科技集团有限公司党委美锦能源

今年3月,参加全国两会的业界人大代表和政协委员围绕如何更好地完善国家能源化工产业政策提出了许多建议。这些建议来自基层,对能源化工产业的健康发展至关重要。在此,本刊摘发部分建议内容。

关键词：政协委员能源化工产业全国两会人大代表政策

盐胁迫对紫花苜蓿生长发育及营养品质影响的研究进展

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草原与草业 2024年第1期36卷 1-7页

作者：史金红卢强张桂杰王世丛侯美玲刘丽英撒多文宁夏大学林业与草业学院银川750021 宁夏大学科学技术研究院银川750021 白城师范学院生命科学学院白城137000 内蒙古自治区林业科学研究院呼和浩特010010 中国农业科学院草原研究所呼和浩特010010

我国耕地资源紧张和优质饲草料严重短缺,利用盐碱地发展饲草产业既符合国家草牧业发展战略又能改变优质饲草料缺乏的局面。盐胁迫是重要的非生物胁迫之一,严重影响了植物的健康生长发育。了解盐胁迫对紫花苜蓿生长发育、产量及营养物质... 详细信息

我国耕地资源紧张和优质饲草料严重短缺,利用盐碱地发展饲草产业既符合国家草牧业发展战略又能改变优质饲草料缺乏的局面。盐胁迫是重要的非生物胁迫之一,严重影响了植物的健康生长发育。了解盐胁迫对紫花苜蓿生长发育、产量及营养物质的影响有利于实现盐碱地资源的开发与利用,减轻日益增加的粮食压力。文中总结了盐胁迫对紫花苜蓿种子萌发、气孔导度及发芽状态等生理变化,探讨了盐胁迫对紫花苜蓿产量、碳水化合物、蛋白质含量的调控作用,并对今后的研究进行了展望。

关键词：盐胁迫紫花苜蓿生长发育产量营养品质

全基因组重测序探究晋南牛优势性状的分子基础

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中国畜牧兽医 2024年第1期51卷 1-10页

作者：贾雪纯戎艳花朱芷葳李鹏飞山西农业大学生命科学学院太谷030801

【目的】探究晋南牛优势性状所基于的遗传基础,为后续晋南牛种质资源利用以及分子育种提供参考。【方法】采集12头健康的纯种晋南牛耳缘组织,提取基因组DNA进行全基因组重测序,将测序数据以及NCBI数据库12头红安格斯牛基因组数据比对到... 详细信息

【目的】探究晋南牛优势性状所基于的遗传基础,为后续晋南牛种质资源利用以及分子育种提供参考。【方法】采集12头健康的纯种晋南牛耳缘组织,提取基因组DNA进行全基因组重测序,将测序数据以及NCBI数据库12头红安格斯牛基因组数据比对到牛参考基因组(ARS-UCD1.2),检测群体SNPs位点,采用ANNOVAR软件对变异位点进行注释;对晋南牛与红安格斯牛变异基因进行韦恩分析,筛选晋南牛特异性变异基因并进行GO功能和KEGG通路富集分析,采用Cytoscape软件将显著富集的变异基因进行功能互作分析。【结果】晋南牛基因组DNA测序共获取clean reads 2 621 153 222条,Q30平均值达93.5%,碱基分布均匀且无明显偏向性,平均测序深度11.19×,覆盖率(≥4×)平均值为92.64%;检测到SNPs位点117 773 201个,注释外显子区域获得nonsynonymous、stopgain/stoploss SNPs共405 506个,覆盖于16 690个基因,筛选出晋南牛特异性变异基因5 289个。GO功能和KEGG通路分析表明,基因广泛富集于线粒体、核糖体、细胞器膜相关生物过程以及氧化磷酸化、细胞色素P450(CYP)代谢通路中;线粒体呼吸链蛋白(NDU)、细胞色素C氧化酶(COX)、葡萄糖醛酸基转移酶(UGT)广泛富集于氧化磷酸化途径;CYP1A1、CYP2E1、UGT1A6、UGT1A1基因富集于细胞色素P450相关的多条代谢通路;GSTM2、GSTT1、GSTT2、GSTK1基因富集于谷胱甘肽(GST)代谢途径与细胞色素P450相关路径;线粒体核糖体蛋白(MRP)、核糖体蛋白(RP)基因家族子网络富集于核糖体蛋白形成过程。【结论】晋南牛特异性变异基因与细胞能量代谢显著相关,推断其对晋南牛饲料高效转化率具有潜在遗传效应。本研究结果为筛选显著影响育肥性状的SNPs标记,繁育高饲料转化率的晋南牛提供方向。

关键词：晋南牛重测序 SNP 线粒体细胞能量代谢饲料转化率

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糖尿病领域研发态势分析

遗传 2022年第10期44卷 824-839页

作者：张丽雯阮梅花刘加兰贺彩红于建荣中国科学院上海生命科学信息中心中国科学院上海营养与健康研究所上海200031 中国科学院昆明动物研究所昆明650201 中国科学院大学北京100049

糖尿病(diabetes mellitus)是由胰岛素分泌缺乏和/或胰岛素抵抗引起的以高血糖为特征的一类代谢性疾病,已成为威胁全球人类健康的重大疾病之一。本文从论文、专利、药物、产业发展等方面分析了糖尿病领域国内外研发态势,旨在为我国糖尿... 详细信息

糖尿病(diabetes mellitus)是由胰岛素分泌缺乏和/或胰岛素抵抗引起的以高血糖为特征的一类代谢性疾病,已成为威胁全球人类健康的重大疾病之一。本文从论文、专利、药物、产业发展等方面分析了糖尿病领域国内外研发态势,旨在为我国糖尿病领域研究及相关产业发展提供决策参考。结果表明,论文发表方面,糖尿病领域研究的论文数量稳步增长,研究热点主要包括并发症及流行病学研究;技术开发方面,比利时杨森制药、美国礼来制药、德国勃林格殷格翰公司等大型制药企业在糖尿病诊断、治疗、管理等方面积极探索;药物研发方面,截至2022年3月23日,已有207个药物上市,还有大量药物处于临床前及临床阶段;产业发展方面,国内外市场潜力巨大,糖尿病数字化管理快速发展。我国在糖尿病研究和技术开发方面拥有一定的实力,未来需要采取措施加强研究成果转化与产品开发,以满足我国庞大的糖尿病诊疗与管理需求。

关键词：糖尿病研究现状药物研发产业发展

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西瓜枯萎病对根际细菌多样性的影响

中国土壤与肥料 2024年第2期 97-104页

作者：侯嘉玮马荣谷医林王星张晓霞马毅楠中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室北京100081 山西大学生命科学学院山西太原030006

通过系统分析北京地区西瓜根际微生物组,显示了细菌群落结构分布的显著区域性,磷元素和钾元素是影响西瓜根际菌群组成最主要的因子;扩增子测序分析表明,健康植株比发病植株根际土壤群落结构更为稳定,节点微生物更多;网络分析发现了来自... 详细信息

通过系统分析北京地区西瓜根际微生物组,显示了细菌群落结构分布的显著区域性,磷元素和钾元素是影响西瓜根际菌群组成最主要的因子;扩增子测序分析表明,健康植株比发病植株根际土壤群落结构更为稳定,节点微生物更多;网络分析发现了来自5个菌门的19个菌属与镰刀菌属直接相关,其中芽孢菌属与假单胞菌属与镰刀菌属丰度呈正相关。通过对比西瓜健康植株与镰刀菌侵染植株根际细菌组成差异,并构建相关性网络发现了潜在的枯萎病防治菌群,为北京西瓜枯萎病预警和防控奠定了基础。

关键词：扩增子测序微生物组西瓜枯萎病根际微生物土壤理化性质

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花鲈igf3基因SNP位点的鉴定及其与生长性状的关联分析

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基因组学与应用生物学 2024年第1期43卷 109-116页

作者：陶欣邱丽华张博王鹏飞闫路路赵超林云想林锋大连海洋大学水产与生命学院大连116000 中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室广州510300 中国水产科学研究院农业农村部水生动物基因组学重点实验室北京100141 饶平县西海岸生物科技有限公司潮州515725

花鲈(Lateolabrax maculatus)是我国最重要的海水经济鱼类之一,近年来其年产量已突破19万吨,是构成我国“菜篮子”工程的重要组成部分。但是,由于缺乏有效的遗传标记导致花鲈良种选育技术不成熟,这成为限制我国花鲈产业健康发展的主要... 详细信息

花鲈(Lateolabrax maculatus)是我国最重要的海水经济鱼类之一,近年来其年产量已突破19万吨,是构成我国“菜篮子”工程的重要组成部分。但是,由于缺乏有效的遗传标记导致花鲈良种选育技术不成熟,这成为限制我国花鲈产业健康发展的主要瓶颈之一。为筛选花鲈胰岛素样生长因子3(insulin-like growth factor 3,igf3)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点以及了解其与生长性状的关联性,本研究对同批次9月龄花鲈群体开展igf3基因SNP位点筛选及其与生长性状的关联性分析。实验结果显示,花鲈igf3基因上存在4个SNP位点,分别位于起始密码子下游C+2990T、G+3037A、C+3303G、G+3602A处,其中前3个位点位于内含子区,第4个位点位于外显子区。尽管单个SNP位点与花鲈生长性状之间并无显著关联性(P>0.05),但双倍型与花鲈生长性状之间却表现出明显的关联性(P研究为筛选具备生长优势的花鲈提供了候选基因,有利于花鲈育种工作的开展。

关键词：花鲈 igf3 单核苷酸多态性(SNP) 生长性状

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屎肠球菌FDT2的分离鉴定及抑菌特性研究

中国畜牧兽医 2024年第7期51卷 3020-3029页

作者：张晓勇蓝伟王雅劳健龙李志贾丹孔祥颖胡凯茵温咏森吕舒婷陈曼殷宏李有全兰州理工大学生命科学与工程学院兰州730050 广东海洋大学滨海农业学院湛江524088 青海大学青海省畜牧兽医科学院西宁810016 中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室兰州730046 海北州农牧综合服务中心海北810299

【目的】从牦牛粪便中分离和鉴定屎肠球菌并进行体外抑菌特性研究,以期筛选出具有优良抑菌特性的益生菌。【方法】用MRS培养基从青海省健康牦牛粪便中分离肠球菌,结合形态学和分子生物学鉴定后进行抑菌性研究。通过发酵过滤分离菌株上清... 详细信息

【目的】从牦牛粪便中分离和鉴定屎肠球菌并进行体外抑菌特性研究,以期筛选出具有优良抑菌特性的益生菌。【方法】用MRS培养基从青海省健康牦牛粪便中分离肠球菌,结合形态学和分子生物学鉴定后进行抑菌性研究。通过发酵过滤分离菌株上清液,采用打孔法观察其对应的抑菌效果,通过改变pH及加入过氧化氢酶、胃蛋白酶和胰蛋白酶等方法来分析其抑菌物质,并探究温度和pH对菌株发酵上清液的影响。【结果】结合形态学及系统进化树分析表明,分离的2株菌(FDT2和D2)均为屎肠球菌。抑菌试验结果表明,屎肠球菌FDT2对5株致病菌均有抑制作用,其中对产肠毒素性大肠杆菌K88和大肠杆菌ATCC 43888的抑菌性最强,而屎肠球菌D2对5株致病菌均无明显抑菌作用。通过排酸试验证明,屎肠球菌FDT2发酵上清液中起抑菌作用的不是酸性物质;通过加入过氧化氢酶试验证明了抑菌物质中有过氧化氢存在,且发挥部分的抑菌作用;加入胃蛋白酶和胰蛋白酶后其抑菌圈直径极显著低于对照组(P研究。

关键词：屎肠球菌鉴定形态学抑菌性