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海洋特征天然产物——硝基苯酯倍半萜类的研究进展

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药学学报 2024年第1期59卷 35-42页

作者：陈仪佘江链唐斓刘永宏周雪峰中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省海洋药物重点实验室广东广州510301 中国科学院大学北京100049 南方医科大学药学院广东广州510515

倍半萜类化合物在自然界中广泛存在,而硝基苯酯倍半萜类化合物较为罕见。迄今发现的12种天然来源硝基苯酯倍半萜均来自于海洋曲霉属Aspergillus真菌,是一类典型的海洋特征天然产物。该类天然产物显示了较好的抗肿瘤、抗病毒和抑制破骨... 详细信息

倍半萜类化合物在自然界中广泛存在,而硝基苯酯倍半萜类化合物较为罕见。迄今发现的12种天然来源硝基苯酯倍半萜均来自于海洋曲霉属Aspergillus真菌,是一类典型的海洋特征天然产物。该类天然产物显示了较好的抗肿瘤、抗病毒和抑制破骨细胞分化活性,特别是在治疗破骨细胞相关疾病中显示较好的药用开发价值。本文对硝基苯酯倍半萜的天然产物来源和化学结构、化学和生物合成、生物活性和药理机制进行了综述,并对其吸收(absorption)、分布(distribution)、代谢(metabolism)、排泄(excretion)及毒性(toxicity)(ADME/T)和类药性进行预测和讨论,为海洋来源硝基苯酯倍半萜类天然产物及其药用开发潜力提供较为全面的认识。

关键词：硝基苯酯倍半萜海洋天然产物曲霉属抑制破骨细胞分化类药性

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短吻三线舌鳎、褐斑三线舌鳎和紫斑舌鳎种类的有效性厘定

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水产学报 2024年第3期48卷 109-117页

作者：孔晓瑜罗海容 THOMAS A. Munroe 中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室美国史密斯自然博物馆国家系统研究室

舌鳎属有些种类形态特征高度相似，导致了鉴定困难和种类的混乱，例如短吻三线舌鳎(Cynoglossusabbreviatus, Gray, 1834)、褐斑三线舌鳎(C. trigrammus, Günther,1862)和紫斑舌鳎(C. purpureomaculatus,Regan,1905)的种类有效性和种间关系就存在三种观点：仅短吻三线舌鳎为有效种；短吻三线舌鳎和褐斑三线舌鳎均为有效种，而紫斑舌鳎是褐斑三线舌鳎的次同物异名；三个名义种均为有效种。为了解决这一分类混乱，本研究对三种舌鳎的原始描述、自测的模式标本和中国大陆沿海采集标本的28个形态特征和分子条形码进行了比较分析。结果显示，8个可数和16个可量特征的比例值以及2个描述性状在三个种之间为一致、包含、大部分重叠的关系；只有2个描述特征存在差异，一个是在吻长较上眼上缘距背鳍基部的长度特征上，短吻三线舌鳎和紫斑舌鳎为略长、等长或略短于的连续特征值，而褐斑三线舌鳎为明显大于；另一个差异是体表的花色差异，紫斑舌鳎体长一般小于200 mm，且具有明显的斑纹，短吻三线舌鳎体长一般大于200 mm，且随着体长增加，斑点逐渐淡化或者无斑，而不同体长的褐斑三线舌鳎在头后和身体前3/4均具有明显的零星褐色斑纹。COⅠ分子条形码结果显示，短吻三线舌鳎和紫斑舌鳎的遗传距离为0.000～0.002，为种内差异;褐斑三线舌与其他两种舌鳎之间的遗传距离为0.141～0.145，为种间差异。研究表明，短吻三线舌鳎和褐斑三线舌鳎是有效种，紫斑舌鳎是短吻三线舌鳎的次同物异名。本研究结果为鲽形目鱼类的正确分类提供了科学依据。

关键词：鲽形目舌鳎科形态特征有效性 COⅠ条形码

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热带海洋特色生态系统恢复重构与保护思考

热带海洋学报 2024年

作者：黄良民林强谭烨辉黄小平周林滨黄晖中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院大学

热带海洋特色生态系统是指珊瑚礁、红树林、海草床等由独特生境与生物共同构成的生态系统，主要分布于全球热带亚热带海区；其特点是物质循环效率高，生态功能独特，具有丰富的生物多样性和极高生产力，历来是海洋科学研究和资源利用的... 详细信息

热带海洋特色生态系统是指珊瑚礁、红树林、海草床等由独特生境与生物共同构成的生态系统，主要分布于全球热带亚热带海区；其特点是物质循环效率高，生态功能独特，具有丰富的生物多样性和极高生产力，历来是海洋科学研究和资源利用的重点区域。然而，由于受人类活动和全球气候变化多重压力影响，其退化趋势日益凸显。如何恢复这些特色生态系统的功能，维护它们的可持续发展，造福人类，引起了学界和国际社会的高度关注。本文阐述了世界热带海洋特色生态系统的分布格局、退化趋势及其影响因素，分析了我国珊瑚礁、红树林、海草床生态系统的分布现状和生物多样性特点；以珊瑚礁生态系统为重点，探讨了热带海洋特色生态系统退化的原因，以及目前我国开展修复和保护的有关行动措施。根据全球生物多样性保护行动计划，结合我国的实际情况，提出热带海洋特色生态系统恢复重构与保护的对策建议和思考：1)建议国家组建南海特色生态系统研究中心、智能监测监控系统和专项数据库、专家智库；2)设立热带海洋特色生态系统恢复与保护示范区，组织多学科领域专家联合开展研究-试验-示范-评估-推广-监控；3)健全政策法规，加强执法管理，重视科普教育，提高公众环保意识，形成社会自觉行动。为加强热带海洋特色生态系统与生物多样性保护及管理，维护其可持续发展和落实国际30×30目标提供参考依据。

关键词：特色生态系统分布格局退化原因恢复与保护珊瑚礁红树林海草床

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南海小叶海蛞蝓线粒体基因组特征与系统进化

热带海洋学报 2024年

作者：刘慧张辉贤刘馨蔓林强沈萍萍烟台大学海洋学院中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室(LMB)广东省应用海洋生物重点实验室中国科学院南海海洋研究所珠海科技学院

南海小叶海蛞蝓发现于南海海域，其形态特征与叶海牛科物种极为相似，呈修长的卵圆形，背部呈深灰色且具不规则乳白色瘤状突起，其中央两排较大橙色突起并行分布。本文利用线粒体全基因组测序对其进行鉴定，并根据蛋白编码基因（protein... 详细信息

南海小叶海蛞蝓发现于南海海域，其形态特征与叶海牛科物种极为相似，呈修长的卵圆形，背部呈深灰色且具不规则乳白色瘤状突起，其中央两排较大橙色突起并行分布。本文利用线粒体全基因组测序对其进行鉴定，并根据蛋白编码基因（protein-coding genes,PCGs）序列分析其系统进化关系。结果表明，该物种线粒体基因组全长为14677 bp，包含37个基因，分别为13个PCGs、2个rRNA和22个t RNA。线粒体基因组的碱基组成为：A占30.4%、T占37.3%、C占15.0%、G占17.3%,A+T含量为67.7%。在13个PCGs中，除了ND5和ND6使用TTG作为起始密码子外，其他11个PCGs的起始密码子均符合ATN的形式。最大似然法进化树分析结果表明，该物种与突丘小叶海蛞蝓（Phyllidiella pustulosa）亲缘关系极为密切，并与媚眼叶海牛（Phyllidia ocellata）聚为一支。Blast分析发现，该物种与P. pustulosa线粒体全基因组序列相似度为94.6%,COX1基因序列相似度为98.8%。结合形态特征与分子鉴定结果表明，该物种为Phyllidiella属新种，将之命名为南海小叶海蛞蝓（Phyllidiella nanhaiense sp. nov.(Zhang,Liu&Shen, 2018)）。南海小叶海蛞蝓的发现及其线粒体基因组数据为Phyllidiella属的深入研究提供参考，对海蛞蝓的物种多样性和系统发育研究具有重要意义。

关键词：南海小叶海蛞蝓线粒体基因组进化分析物种鉴定

中国南沙群岛新腹足目(软体动物门,腹足纲)二新记录种

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热带海洋学报 2024年

作者：何晨陈志云谭烨辉中国科学院大学中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室南海海洋生物标本馆

通过整理中国科学院南海海洋生物标本馆馆藏的采自南沙群岛的海洋贝类标本,鉴定出分别隶属于腹足纲Gastropoda新腹足目Neogastropoda核螺科Columbellidae和肋脊笔螺科Costellariidae的新记录种2种,分别为:舌状绘核螺Graphicomassa ligul... 详细信息

通过整理中国科学院南海海洋生物标本馆馆藏的采自南沙群岛的海洋贝类标本,鉴定出分别隶属于腹足纲Gastropoda新腹足目Neogastropoda核螺科Columbellidae和肋脊笔螺科Costellariidae的新记录种2种,分别为:舌状绘核螺Graphicomassa ligula (Duclos, 1840)和肋条菖蒲螺Vexillum costatum (Gmelin, 1791)。

关键词：南沙群岛腹足纲核螺科肋脊笔螺科新记录种

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珊瑚礁生态系统研究的发展、挑战与希望

热带海洋学报 2024年第3期43卷 1-2页

作者：刘胜中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院南海海洋研究所广东广州510301 三亚海洋科学综合(联合)实验室海南省热带海洋生物技术重点实验室三亚海洋生态环境工程研究院海南三亚572000

珊瑚礁生态系统是以造礁石珊瑚等造礁类生物为框架生物,兼具极高生物多样性和初级生产力的海洋生态系统。珊瑚礁分布面积占全球海域面积不足0.25%,却养育了全球超过1/4的海洋生物,被誉为“海洋中的热带雨林”。我国珊瑚礁面积约3.8万km2... 详细信息

珊瑚礁生态系统是以造礁石珊瑚等造礁类生物为框架生物,兼具极高生物多样性和初级生产力的海洋生态系统。珊瑚礁分布面积占全球海域面积不足0.25%,却养育了全球超过1/4的海洋生物,被誉为“海洋中的热带雨林”。我国珊瑚礁面积约3.8万km2,主要分布于南海,是全球珊瑚礁的重要组成部分。珊瑚礁生态系统在保护海岸线、提供渔业和旅游资源产出、维持生物多样性等方面为我国社会发展提供了重要的经济价值和生态服务功能。同时,几乎所有的南海岛礁都为珊瑚礁,因此南海珊瑚礁生态系统更是我国保卫蓝色国土的天然生态防线,具有无法替代的国家战略意义。

关键词：生物多样性造礁石珊瑚南海岛礁生态服务功能蓝色国土热带雨林海洋生态系统珊瑚礁

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CRISPR/Cas基因编辑及其新兴技术在丝状真菌研究中的系统应用

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合成生物学 2024年第3期5卷 672-693页

作者：陈盈盈刘扬史俊杰马俊英鞠建华中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省海洋药物重点实验室广东广州510301 山东大学药学院天然产物化学生物学教育部重点实验室山东省基础科学研究中心(药学)山东省高等学校药物化学生物学重点实验室山东济南250012

丝状真菌(filamentous fungi)具有独特的形态和细胞构造,与人类健康和工农业生产息息相关,对这类生物资源的开发和利用高度依赖高效的基因编辑平台。然而,由于丝状真菌复杂多样的遗传背景,使用传统的基因编辑技术较难实现大范围的基因编... 详细信息

丝状真菌(filamentous fungi)具有独特的形态和细胞构造,与人类健康和工农业生产息息相关,对这类生物资源的开发和利用高度依赖高效的基因编辑平台。然而,由于丝状真菌复杂多样的遗传背景,使用传统的基因编辑技术较难实现大范围的基因编辑,极大地妨碍了丝状真菌的遗传学研究。CRISPR/Cas(clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein)技术的出现,打破了这一困境,促进了不同种属和不同来源的丝状真菌的基因编辑,为丝状真菌的基础和应用研究带来了革命性的突破。本文简述了CRISPR/Cas系统的作用机理、分类及基于CRISPR的各种新型技术,归纳总结了丝状真菌中现有的CRISPR/Cas9系统功能组分、多种新兴CRISPR/Cas技术在丝状真菌中的应用现状以及海洋真菌中的CRISPR/Cas技术的应用情况。最后,对CRISPR/Cas系统在丝状真菌中应用进展缓慢、编辑效率低和脱靶效应等问题以及针对这些问题的潜在解决方法进行总结和展望,以期为不同类型的丝状真菌基因编辑平台的构建提供参考。

关键词：丝状真菌海洋真菌 CRISPR/Cas 基因编辑

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基于CiteSpace的广东省典型蓝碳生态系统碳汇研究进展的可视化分析

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热带海洋学报 2024年

作者：张彤凌娟岳维忠王友绍程皓孙红岩黄小芳梁童茵周卫国董俊德中国科学院大学中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室三亚海洋生态环境工程研究院海南省热带海洋生物技术重点实验室华南农业大学海洋学院中国科学院海南热带海洋生物实验站中国科学院南海海洋研究所粤东上升流区海洋生态系统综合观测研究站

发挥红树林、海草床等典型蓝碳生态系统的碳汇功能是缓解全球气候变化自然的解决方案之一。广东省蓝碳资源丰富,厘清典型蓝碳生态系统碳汇研究进展对生态系统的保护修复与政策制定具有重要的科学意义。本文以中国知网(Chinese National ... 详细信息

发挥红树林、海草床等典型蓝碳生态系统的碳汇功能是缓解全球气候变化自然的解决方案之一。广东省蓝碳资源丰富,厘清典型蓝碳生态系统碳汇研究进展对生态系统的保护修复与政策制定具有重要的科学意义。本文以中国知网(Chinese National Knowledge Infrastructure, CNKI)总库的文献为主要数据来源,应用CiteSpace文献计量学方法对近20年发表的94篇关于广东省蓝碳生态系统碳汇相关的中英文文献从研究现状、发展趋势等方面进行分析,探讨该领域的研究热点及未来研究方向。基于对文章作者、研究机构、关键词等可视化分析的结果,显示广东省蓝碳生态系统碳汇的研究大致可以分为三个阶段:起步阶段(2003—2011年)、缓慢发展阶段(2012—2016年)和快速发展阶段(2017—2023年)。关键词共现图谱和聚类图谱分析结果表明,已有研究主要集中在碳储量、红树林、海洋碳汇、海草床、生物量等方面,未来的研究热点将仍然以碳中和碳达峰为目标导向,建议未来要加强广东省红树林、海草床等典型蓝碳生态系统碳汇的监测和核算方法研究及典型蓝碳生态系统增汇技术的研发,构建典型蓝碳生态系统的负碳技术体系,实现蓝碳生态系统的保护修复与固碳增汇协同增效,推动实现碳中和碳达峰目标。

关键词：蓝碳广东省文献计量分析碳储量

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鱼类抗菌肽-壳聚糖抑菌保鲜剂的制备

海洋科学 2024年

作者：王雪芹李帅欣王兴仁李开强李鹏程刘松中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室崂山实验室海洋药物与生物制品功能实验室青岛科技大学海洋科学与生物工程学院中国科学院大学

为研发安全高效的抑菌保鲜剂，本研究以安康鱼为原料，采用定向酶解技术制备鱼类抗菌肽，与海洋天然产物壳聚糖复配制备新型抑菌保鲜剂。结果如下：通过单因素实验确定鱼类抗菌肽和壳聚糖对大肠杆菌的最佳抑菌浓度，响应面优化实验确定... 详细信息

为研发安全高效的抑菌保鲜剂，本研究以安康鱼为原料，采用定向酶解技术制备鱼类抗菌肽，与海洋天然产物壳聚糖复配制备新型抑菌保鲜剂。结果如下：通过单因素实验确定鱼类抗菌肽和壳聚糖对大肠杆菌的最佳抑菌浓度，响应面优化实验确定鱼类抗菌肽-壳聚糖抑菌保鲜剂的最佳添加量为：鱼类抗菌肽7.796 mg/mL，壳聚糖1号0.716 mg/mL，壳聚糖2号0.389 mg/mL，复配得到的抑菌保鲜剂对大肠杆菌的抑菌圈直径为9.77 mm，接近回归模型预测值10.19 mm。此外，将鱼类抗菌肽-壳聚糖抑菌保鲜剂应用于新鲜鱼糜，结果表明，该抑菌保鲜剂能够延长新鲜鱼糜发生质变的时间，具有明显的抑菌保鲜作用，后续可应用于即食鱼糜制品抑菌保鲜剂的开发。

关键词：鱼类抗菌肽壳聚糖抑菌保鲜剂响应面分析