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基于磁性氧化石墨烯核酸适配体分离材料构建17β-雌二醇传感器

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色谱 2025年第1期43卷 87-95页

作者：金心宇陈乐源刘艳娜谢文菁彭汉勇中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理学国家重点实验室北京100085 中国科学院大学北京100049 中国科学院大学杭州高等研究院环境学院浙江杭州310024

17β-雌二醇(E2)是天然的甾体雌激素,在生物体的各项生理活动中发挥着至关重要的作用。然而,外源性E2也被归类为内分泌干扰物(EDC),即使在ng/L水平上也会干扰内分泌系统功能,且在医疗、畜牧业废水中均能检测到E2污染。目前,E2的检测方... 详细信息

17β-雌二醇(E2)是天然的甾体雌激素,在生物体的各项生理活动中发挥着至关重要的作用。然而,外源性E2也被归类为内分泌干扰物(EDC),即使在ng/L水平上也会干扰内分泌系统功能,且在医疗、畜牧业废水中均能检测到E2污染。目前,E2的检测方法主要以色谱-质谱联用方法为主,但受仪器等限制,难以应用于现场检测或大量样品检测。为了解决该难题,本工作用油包水微乳液法(W/O microemulsion)合成了一种基于磁性氧化石墨烯(MGO)的核酸分离材料,并进行了系统的表征,以开发高灵敏度、快速检测、高通量的荧光恢复(“turn-on”)型生物传感器,用于检测环境样品中的E2。传感器基于荧光共振能量转移原理(FRET),即MGO通过吸附荧光基团标记的E2核酸适配体发生FRET效应猝灭荧光信号,而在E2存在时,核酸适配体与E2结合,从MGO上脱附,实现荧光信号恢复,且信号响应与一定范围的E2质量浓度呈线性关系。本工作引入了磁性固相分离方法,降低了背景信号值,从而提高了方法的灵敏度。本方法中相对荧光恢复强度与E2质量浓度呈良好的线性关系,检出限低至1 ng/mL,对多种干扰离子有较好的抵抗性,且在同族雌激素类似物中有良好的选择性。与色谱-质谱检测方法相比,该方法检测时间短,成本低,操作简便,可应用于环境水样中E2的快速检测。

关键词： 17β-雌二醇磁固相分离荧光生物传感器磁性氧化石墨烯

高效液相色谱-串联质谱法分析游离RNA修饰核苷的研究进展

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色谱 2025年第1期43卷 3-12页

作者：张绿叶张维冰汪海林中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理学国家重点实验室北京100085 华东理工大学化学与分子工程学院上海市功能性材料化学重点实验室上海200237 中国科学院大学北京100049

核糖核苷酸(RNA)的转录后修饰在基因表达调控中发挥重要作用,而RNA在降解与再合成过程中产生大量游离核苷,包含未修饰的基础核苷和多种类型的修饰核苷。修饰核苷无法被进一步分解,在胞内积累,或在转运蛋白作用下运输到胞外环境,直到被... 详细信息

核糖核苷酸(RNA)的转录后修饰在基因表达调控中发挥重要作用,而RNA在降解与再合成过程中产生大量游离核苷,包含未修饰的基础核苷和多种类型的修饰核苷。修饰核苷无法被进一步分解,在胞内积累,或在转运蛋白作用下运输到胞外环境,直到被机体代谢,并在过程中发挥信号分子的作用。对生物样本中各级代谢物中修饰核苷的准确鉴定与定量能够为RNA降解和游离修饰核苷排泄调控提供重要信息,协助研究其生物学功能和发现潜在的临床应用。例如,小分子修饰核苷在应激反应和疾病状态下作为信号分子调控机体的应答;病理状态下体液和组织中发生特异性变化的修饰核苷可作为生物标志物,为疾病的诊断和治疗提供信息。高效液相色谱-串联质谱(HPLC-MS/MS)技术作为一种高灵敏度、高选择性、快速高效的分析工具,已在游离修饰核苷分析中展现出重要的应用价值。但HPLC-MS/MS准确分析游离修饰核苷仍面临一些挑战,如生物样品成分的复杂性,多种类目标物的化学性质差异,多种目标物的含量呈数量级的差异,以及众多的修饰核苷中同分异构体的干扰等。这些因素使得开发同时定量多种核苷的HPLC-MS/MS方法难度增加。本综述介绍了内源性游离RNA修饰核苷的来源及检测方法,概述了HPLC-MS/MS技术在内源性核苷分析中的样品前处理、色谱分离、质谱检测模式和定量方法开发等方面的研究进展,并综述了游离RNA修饰核苷的生物学功能、调控机制研究和作为疾病潜在分子标志物等的应用。

关键词： RNA修饰代谢物分析高效液相色谱-串联质谱修饰核苷

机器学习结合分子SMILES特征预测油品碳正离子生成焓性质

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燃料化学学报(中英文) 2025年

作者：詹志文杨涛刘旭红周余伟周利平北京信息科技大学计算机学院北京材料基因工程高精尖创新中心(北京信息科技大学) 中国科学院山西煤炭化学研究所中科合成油技术股份有限公司

碳正离子是油品加工等多种化学反应中的关键中间体，其热力学生成焓性质在计算反应焓变、反应能垒、反应速率常数和理解反应机理等方面至关重要。实验上制备和获取碳正离子非常困难，几乎无法直接测量其生成焓性质。目前主流的做法是通... 详细信息

碳正离子是油品加工等多种化学反应中的关键中间体，其热力学生成焓性质在计算反应焓变、反应能垒、反应速率常数和理解反应机理等方面至关重要。实验上制备和获取碳正离子非常困难，几乎无法直接测量其生成焓性质。目前主流的做法是通过基团加和法估算，或者通过高精度量子化学方法计算。前者是经验性估算方法，计算快速但误差较大，后者通常基于第一性原理方法，计算精准但计算量巨大。本研究提出一种利用机器学习结合分子SMILES特征进行碳正离子生成焓预测的新方法，实现了以较低计算成本快速准确地预测油品碳正离子的生成焓性质。我们构建了156个油品烃类碳正离子数据集，利用SMILES特征提取体系信息，考察并利用多个机器学习方法进行模型的训练和构建，最后获得一个基于支持向量机回归的预测模型，其在训练集和测试集上的决定系数R2达到了0.957和0.966，同时预测的绝对平均误差MAE为2.21 kcal/mol。机器学习结合SMILES特征不仅为油品碳正离子的生成焓预测提供了一种高效实用的策略，还为相关反应过程的热力学和动力学研究开辟了新途径。

关键词：碳正离子生成焓机器学习 SMILES特征

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激光解吸电离质谱新型液相基质研究

高等学校化学学报 2002年第10期23卷 1868-1872页

作者：熊少祥陈文章蒲丹辛斌王光辉中国科学院化学研究所分子科学中心北京质谱中心北京100080

选用包括纳米粒子在内的多种基质化合物 ,构成了多种不同组成的液相基质 .以多肽、蛋白、大环寡糖和有机小分子等数种类型化合物为样品 ,系统地考察了不同液相基质在基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF)分析中的应用情况 ,探... 详细信息

选用包括纳米粒子在内的多种基质化合物 ,构成了多种不同组成的液相基质 .以多肽、蛋白、大环寡糖和有机小分子等数种类型化合物为样品 ,系统地考察了不同液相基质在基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF)分析中的应用情况 ,探讨了与固体制样方法的异同点 .实验结果表明 ,有些液相基质对多类化合物具有较好的通用性。

关键词：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱液相基质样品制备纳米粒子

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱研究(Ⅰ)──杯芳烃化合物

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高等学校化学学报 2000年第4期21卷 522-526页

作者：熊少祥辛斌王光辉刘国诠中国科学院化学研究所分子科学中心北京质谱中心北京100080

采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 ( MALDI-TOF-MS)对杯芳烃化合物进行了分析 .探讨了样品的制备条件、仪器操作参数等因素对测定结果的影响 .2 5种样品的质谱数据表明 ,利用 MALDI-TOF-MS可非常方便地得到灵敏度、分辨率、准确度... 详细信息

采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 ( MALDI-TOF-MS)对杯芳烃化合物进行了分析 .探讨了样品的制备条件、仪器操作参数等因素对测定结果的影响 .2 5种样品的质谱数据表明 ,利用 MALDI-TOF-MS可非常方便地得到灵敏度、分辨率、准确度均较高 ,且易于识别和解析的质谱图 .

关键词：杯芳烃结构表征 MALDZ-TOF 质谱分析

液相基质辅助激光解吸电离-傅里叶变换离子回旋共振质谱研究

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分析化学 2004年第1期32卷 14-18页

作者：熊少祥赵镇文蒲丹辛斌王光辉中国科学院化学研究所分子科学中心北京质谱中心中国科学院化学研究所分子科学中心北京质谱中心北京100080

选用液相基质制样 ,考察了激光强度、回旋池开门时间等因数对基质辅助激光解吸电离傅里叶变换离子回旋共振质谱 (MALDI FT ICR MS)检测结果的影响 ,优化了实验条件。使用液相制样方法对 5类实际样品进行了MALDI FT ICR MS检测 ,结果表... 详细信息

选用液相基质制样 ,考察了激光强度、回旋池开门时间等因数对基质辅助激光解吸电离傅里叶变换离子回旋共振质谱 (MALDI FT ICR MS)检测结果的影响 ,优化了实验条件。使用液相制样方法对 5类实际样品进行了MALDI FT ICR MS检测 ,结果表明 :液相基质具有很好的通用性 ,质谱信号稳定、持久。利用FT ICR MS特有的超高分辨率与准确度 ,能够很准确地测定化合物组成

关键词：基质辅助激光解吸电离傅里叶变换离子回旋共振质谱液相基质样品制备

邻近标记技术在蛋白质-蛋白质相互作用研究中的应用和进展

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遗传 2025年

作者：许昕薷仇本华鄢秀敏上海交通大学医学院附属新华医院环境与儿童健康重点实验室中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)细胞生物学国家重点实验室中国科学院大学

蛋白质-蛋白质相互作用在细胞内的几乎所有生物过程中都扮演着至关重要的角色。近年来，邻近标记技术作为一种前沿实验方法，被广泛应用于细胞内蛋白质相互作用和亚细胞区室空间蛋白质组等方面的研究。这项技术通过在目标蛋白质周围引... 详细信息

蛋白质-蛋白质相互作用在细胞内的几乎所有生物过程中都扮演着至关重要的角色。近年来，邻近标记技术作为一种前沿实验方法，被广泛应用于细胞内蛋白质相互作用和亚细胞区室空间蛋白质组等方面的研究。这项技术通过在目标蛋白质周围引入化学标记物，实现对邻近蛋白质的标记和捕捉。结合质谱鉴定与分析，邻近标记技术能够以高时空分辨率捕捉蛋白质间的相互作用及细胞区室的蛋白质组信息。与传统方法相比，邻近标记技术凭借其高时空分辨率和高灵敏度，成为研究细胞内蛋白质功能、相互作用及蛋白质空间组学的重要工具。本文系统介绍了蛋白质邻近标记技术的原理、分类及其应用，以期为研究人员提供全面的技术视角，促进蛋白质邻近标记技术在细胞生物学、蛋白质组学以及疾病机制研究中的更广泛应用。

关键词：邻近标记技术蛋白质相互作用空间蛋白质组

上海白玉兰花香和鲜花精油挥发性成分的GC-MS分析研究

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化学试剂 2025年第1期47卷 80-85页

作者：黄积武郭思妤王慧敏周博文王昊阳郭寅龙刘文中国科学院上海有机化学研究所生命过程小分子调控全国重点实验室上海200032 中国科学院上海有机化学研究所分析测试中心上海200032 上海社会科学院应用经济研究所上海200020

为了比较上海白玉兰花香和白玉兰鲜花精油的成分差异,采用顶空气质联用技术(HS-GC-MS)或气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)进行挥发性成分的分析。结果表明,从白玉兰花香和白玉兰鲜花精油中共鉴定出44种成分,相同成分10种;白玉兰花香中共检... 详细信息

为了比较上海白玉兰花香和白玉兰鲜花精油的成分差异,采用顶空气质联用技术(HS-GC-MS)或气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)进行挥发性成分的分析。结果表明,从白玉兰花香和白玉兰鲜花精油中共鉴定出44种成分,相同成分10种;白玉兰花香中共检测出26种成分,相对含量占其总量的96.29%,其主要成分为桉叶油醇(26.73%)、桧烯(23.29%)、β-蒎烯(18.77%)、β-月桂烯(12.22%)和α-蒎烯(6.83%);白玉兰鲜花精油中共检测出28种化学成分,相对含量占其总量的79.46%,主要成分包括苯乙醇(35.48%)、桉叶油醇(10.09%)、α-松油醇(9.12%)、柳杉二醇(5.69%)和4-松油醇(5.52%)。白玉兰花香和白玉兰鲜花精油成分在类别及相对含量上均有所差异,这为白玉兰资源的合理开发利用提供了理论依据。

关键词：白玉兰花香精油挥发性成分 GC-MS

傅里叶变换离子回旋共振质谱测定复杂表面活性剂组分

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分析化学 2003年第4期31卷 429-432页

作者：熊少祥蒲丹辛斌王光辉中国科学院化学研究所分子科学中心中国科学院化学研究所分子科学中心北京质谱中心北京100080

利用傅里叶变换离子回旋共振质谱 (FT ICR MS) ,分析了两类复杂的离子型表面活性剂样品。实验结果表明 :高分辨FT ICR MS ,可以简单、快速、准确地获得两类化合物的结构信息 ,利用其高准确度的质量测定数据 ,计算出复杂样品中各组分的... 详细信息

利用傅里叶变换离子回旋共振质谱 (FT ICR MS) ,分析了两类复杂的离子型表面活性剂样品。实验结果表明 :高分辨FT ICR MS ,可以简单、快速、准确地获得两类化合物的结构信息 ,利用其高准确度的质量测定数据 ,计算出复杂样品中各组分的元素组成 ,鉴定出具体化合物 ,显示了FT ICR MS在分子结构分析和未知物鉴定中的强大能力

关键词：傅里叶变换离子回旋共振质谱精确质量测量二次离子质谱