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基于功能性状的土壤动物群落生态学研究进展

应用生态学报 2024年第4期35卷 1150-1158页

作者：孙新谢致敬乔志宏高梅香殷睿常亮吴东辉刘满强朱永官中国科学院城市环境研究所福建厦门361021 中国科学院大学北京100049 东北师范大学环境学院长春130022 中国科学院东北地理与农业生态研究所长春130102 宁波大学土木工程与地理环境学院浙江宁波315211 西北农林科技大学资源环境学院陕西杨凌712100 兰州大学草地微生物研究中心草种创新与草地农业生态系统全国重点实验室兰州730020 中国科学院生态环境研究中心北京100085

功能性状是生物对周围环境响应与适应的直观表现,同时影响一系列的生态系统功能。土壤动物的功能性状可较好地表征和预测环境变化及其所在生态系统的功能变化。综合物种、系统发育及功能性状的多维分析,有助于全面和深入理解土壤动物分... 详细信息

功能性状是生物对周围环境响应与适应的直观表现,同时影响一系列的生态系统功能。土壤动物的功能性状可较好地表征和预测环境变化及其所在生态系统的功能变化。综合物种、系统发育及功能性状的多维分析,有助于全面和深入理解土壤动物分布格局、群落构建机制及生态系统功能。本文在阐述土壤动物功能性状常用表征指标和生态学意义的基础上,系统分析了基于功能性状的土壤动物群落响应环境变化及其群落构建过程的相关研究进展,并提出未来在理论上应重点关注生物互作的生态进化过程对土壤动物功能性状的影响,在方法上应注重具有生态学意义的功能性状数据库的建立,还应重视利用功能性状与生态功能的关系指导生态恢复实践,促进土壤生物多样性保护及资源可持续利用。

关键词：生物多样性功能性状土壤动物功能多样性群落构建

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中国野生动物调查存在的问题与改进建议

动物学杂志 2024年第2期59卷 282-292页

作者：李欣海郜二虎李雪谢文冬楼瑛强宋凯方昀孙悦华中国科学院动物研究所动物生态与保护生物学院重点实验室北京100101 中国科学院大学生命科学学院北京100049 国家林业和草原局调查规划设计院北京100013 北京鼎星科技有限公司北京100070

一百余年前,人类就开始了相对系统的野生动物调查。目前已经建立了成熟的方法体系,并制定了相应的调查规范。最近几十年来,我国科研人员进行了大量的野生动物调查。但是,当前我国的野外调查规范还不够细致,调查者在调查时缺乏必要的约束... 详细信息

一百余年前,人类就开始了相对系统的野生动物调查。目前已经建立了成熟的方法体系,并制定了相应的调查规范。最近几十年来,我国科研人员进行了大量的野生动物调查。但是,当前我国的野外调查规范还不够细致,调查者在调查时缺乏必要的约束,导致调查数据不规范、不可靠,很多重要信息缺失。突出问题有:样线信息不全,只有起点和终点的经纬度,没有自动记录的详细样线信息(如每秒记录一次的连续点位信息,含经纬度和时间);动物位点信息缺乏可信度指标(如距观测者的距离);调查时间不合理;调查地点的空间取样不均衡;记录的标准化不够(如每个观测点的观测时长不确定)等等。对此,我们参考国际通用的调查规范,提出了一些简单易行的调查要点,以便提高野外调查数据的质量。另外,我们提倡野外记录的无纸化,充分利用现有的手机应用软件(APP)和模型工具提高野外记录以及后期数据处理的效率。最后,我们提议建立固定的中国生物多样性监测样线体系,以便消除每年调查时空间取样的不确定性,更好地量化野生动物的时间动态,为野生动物的保护和管理提供依据。

关键词：野生动物数量估计调查监测野外调查规范手机应用软件(APP)

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IRES核心区12-bp非连续插入突变对猪塞内卡病毒复制和细胞嗜性的影响

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中国农业科学 2024年第7期57卷 1407-1416页

作者：张晓战董轩志吕楠楠刘懿雯马新甜王林青夏艳勋蒋增海郭运泽赵攀登宋予震杨德成边传周河南牧业经济学院动物医药学院郑州师范学院/分子生物学郑州市重点实验室中国农业科学院哈尔滨兽医研究所/动物疫病防控全国重点实验室

【背景】塞内卡病毒（senecavirus A, SVA）是新近暴发的一种引起猪特发性水疱病及仔猪死亡的小核糖核酸病毒。该病毒基因组5′非编码区（untranslated region, UTR）中的内部核糖体进入位点（IRES）元件在病毒复制过程中发挥重要作用。... 详细信息

【背景】塞内卡病毒（senecavirus A, SVA）是新近暴发的一种引起猪特发性水疱病及仔猪死亡的小核糖核酸病毒。该病毒基因组5′非编码区（untranslated region, UTR）中的内部核糖体进入位点（IRES）元件在病毒复制过程中发挥重要作用。2017年我国出现IRES核心区Domain II 12个碱基非连续插入的自然突变SVA毒株，在病毒复制和致病性方面存在明显改变。【目的】探讨IRES Domain II区域发生的突变对SVA的复制及细胞嗜性的影响，为进一步了解SVA致病机制奠定基础。【方法】以实验室前期构建的含HeN-1/2018株全基因组感染性克隆pHeN-1/2018为基础，通过定点突变的方式，逐步将其IRES Domain II核心区域308—317 nt的9个碱基（ACTCAAGCG）替换为GD04/2017株基因组308—328 nt的21个碱基（CACGCCTGCCGATAGACGATT），构建重组载体pHeN-1/2018-i12并进行了病毒拯救。随后，利用病毒基因组克隆测序、间接免疫荧光试验和Western blot试验对所拯救病毒进行鉴定，同时验证了IRES核心区12个碱基插入突变对SVA病毒体外复制能力和细胞嗜性的影响。【结果】将构建完成的重组载体pHeN-1/2018-i12转染细胞，盲传至P2代，获得致使感染细胞病变明显、病变时间稳定的IRES突变病毒rHeN-1/2018-i12。病毒连续传代后测序结果表明rHeN-1/2018-i12遗传稳定，P5代病毒基因组序列未发生碱基突变，P10代病毒IRES区域没有出现突变现象。用低代次的突变病毒rHeN-1/2018-i12体外感染本体动物猪源细胞系PK-15和IBRS-2，及仓鼠源细胞系BHK-21，进行细胞感染试验，结果表明rHeN-1/2018-i12与亲本毒株rHeN-1/2018在PK-15、IBRS-2和BHK-21中均能导致明显的细胞病变，表现出相似的生长曲线趋势，表明IRES核心区Domain II 12个碱基突变不能够改变对上述细胞的嗜性；但SVA突变病毒和亲本株在不同细胞中的病变时间及病毒滴度上存在较大的差异，rHeN-1/2018-i12株在细胞中生长能力较其亲本株rHeN-1/2018差，诱使细胞病变的时间较晚，在感染24 hpi，两者病毒滴度相差可达10倍。【结论】本研究基于SVA反向遗传操作系统构建并拯救SVA IRES突变毒株，确定了IRES突变对SVA生物学特性的影响，有助于我们更好地了解SVA致病机制，拓宽我们对病毒IV型IRES功能的认识。

关键词：塞内卡病毒内部核糖体进入位点反向遗传操作系统病毒复制细胞嗜性

悬浮物对三亚珊瑚礁区浮游动物群落结构及其摄食的影响

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热带海洋学报 2024年第3期43卷 122-130页

作者：胡思敏周天成张琛刘胜李涛黄晖中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院南海海洋研究所广东广州510301 三亚海洋科学综合(联合)实验室海南省热带海洋生物技术重点实验室三亚海洋生态环境工程研究院海南三亚572000 中国科学院大学北京100049 海南三亚海洋生态系统国家野外科学观测研究站中国科学院海南热带海洋生物实验站海南三亚572000

随着人类活动对珊瑚礁的影响日益加剧,输入到近岸珊瑚礁区的悬浮物日益增多,不仅影响珊瑚的生理,也会对珊瑚礁生态系统基础生物生产过程产生影响。为了解悬浮物对珊瑚礁区浮游动物组成及摄食的影响,于2015年4月在三亚典型岸礁区设置了... 详细信息

随着人类活动对珊瑚礁的影响日益加剧,输入到近岸珊瑚礁区的悬浮物日益增多,不仅影响珊瑚的生理,也会对珊瑚礁生态系统基础生物生产过程产生影响。为了解悬浮物对珊瑚礁区浮游动物组成及摄食的影响,于2015年4月在三亚典型岸礁区设置了昼夜连续观测站点(W4为悬浮物浓度高的站位,W5为对照站位),分析了悬浮物波动对浮游动物群落结构的影响,并用分子生物学方法结合室内实验,研究了悬浮物对优势桡足类现场食物组成和摄食选择的影响。结果显示:两个站位叶绿素a浓度偏低,昼夜波动较大;W4站的悬浮物和叶绿素a浓度均高于W5站,但W5站悬浮物中有机颗粒物组分比例(73.69%)高于W4站(46.09%);W5站浮游动物种类多样性和丰度均高于W4站。进一步摄食分析表明,两个站位桡足类均以后生动物来源的有机碎屑为主要食物,在W4站桡足类食物组成中浮游植物的比例也相对较高,而在W5站桡足类还摄食较多的微型浮游动物。在摄食实验中,高浓度的悬浮颗粒物显著提高了红纺锤水蚤(Acartia erythraea)的滤水率和摄食率,但其食物组成却由以浮游植物为主转而以陆生植物碎屑为主,说明浓缩海水中较高的悬浮颗粒物含量限制了桡足类的摄食选择,使其摄食大部分有机碎屑作为补偿营养来源。研究结果表明,高悬浮物浓度会影响浮游动物的摄食选择,但悬浮物中高比例的有机碎屑可为浮游动物提供重要的补充食物来源,支持其维持较高的生物量。

关键词：浮游动物悬浮物群落结构摄食多样性三亚湾

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珊瑚礁生态学研究现状和展望

热带海洋学报 2024年第3期43卷 3-12页

作者：黄晖俞晓磊黄林韬江雷中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院南海海洋研究所广东广州510301 三亚海洋科学综合(联合)实验室海南省热带海洋生物技术重点实验室三亚海洋生态环境与工程研究院海南三亚572000 海南三亚海洋生态系统国家野外科学观测研究站中国科学院海南热带海洋生物实验站海南三亚572000 中国科学院大学北京100049

珊瑚礁生态系统是海洋生态系统的重要组成部分,在维持海洋生态平衡和生物多样性上扮演着重要角色。本文通过文献检索手段,归纳了当前国际和国内珊瑚礁生态学领域的发展现状。国际上关注的主要方面包括全球变化与珊瑚礁生态系统、珊瑚共... 详细信息

珊瑚礁生态系统是海洋生态系统的重要组成部分,在维持海洋生态平衡和生物多样性上扮演着重要角色。本文通过文献检索手段,归纳了当前国际和国内珊瑚礁生态学领域的发展现状。国际上关注的主要方面包括全球变化与珊瑚礁生态系统、珊瑚共生关系的建立与维持、珊瑚礁生物系统发育与进化、珊瑚礁生物多样性及其物种分布格局、珊瑚礁生态系统保护与管理等;国内关注的主要方面包括全球变化与珊瑚礁生态系统、全球变化背景下的珊瑚–虫黄藻共生体、珊瑚共生关系多样性、人类活动与南海珊瑚礁生态系统、珊瑚礁生物多样性及其群落格局等。珊瑚礁生态学研究的未来发展趋势将更加注重全球变化背景下的珊瑚与珊瑚礁生态系统、珊瑚共生机制、边缘珊瑚礁以及珊瑚礁保护与修复。未来我国珊瑚礁生态学研究需提升全球视野,加强国内与国际合作,深入机制挖掘,完善系统研究,增强珊瑚礁保护与修复研究。

关键词：珊瑚礁生态学研究现状发展趋势和对策

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三亚凤凰岛造礁石珊瑚迁移效果研究

热带海洋学报 2024年第3期43卷 177-186页

作者：张浴阳刘骋跃俞晓磊罗勇周天成练健生黄晖中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院南海海洋研究所广东广州510301 三亚海洋科学综合(联合)实验室海南省热带海洋生物技术重点实验室三亚海洋生态环境与工程研究院海南三亚572000 海南三亚海洋生态系统国家野外科学观测研究站中国科学院海南热带海洋生物实验站海南三亚572000 中国科学院大学北京100049

造礁石珊瑚既是构成珊瑚礁生态系统中的关键功能生物,也是国家二级保护野生动物,其数量的快速衰退已引起了广泛关注,因此近年来我国对造礁石珊瑚以及珊瑚礁生态系统的保护正在逐步加强。海岸工程易对周边的珊瑚礁造成严重影响,实施保护... 详细信息

造礁石珊瑚既是构成珊瑚礁生态系统中的关键功能生物,也是国家二级保护野生动物,其数量的快速衰退已引起了广泛关注,因此近年来我国对造礁石珊瑚以及珊瑚礁生态系统的保护正在逐步加强。海岸工程易对周边的珊瑚礁造成严重影响,实施保护性迁移是降低工程对造礁石珊瑚影响的重要手段。为研究海南热带海域造礁石珊瑚迁移方法以及迁移保护的效果,我们对三亚凤凰岛二期项目拆除工程影响海域内的造礁石珊瑚实施了保护性迁移及监测。迁移造礁石珊瑚个体共计16634株,包括鹿角珊瑚属、牡丹珊瑚属、滨珊瑚属等18属造礁石珊瑚种类。迁移个体分别迁移至鹿回头海域6210株与西岛海域10424株。迁移珊瑚采用了三种移植方法,分别为铆钉移植、小型移植礁体移植与直接摆放。在迁移至鹿回头和西岛两地8个月后,迁移珊瑚平均存活率均在80%以上,两地迁移珊瑚的总存活率为86.24%。调查的结果显示,铆钉移植的方法存活率最高,小型移植礁体和直接摆放的两种移植方法存活率稍低。迁移至西岛的珊瑚8个月平均生长了3.03cm,的增长率为23.31%,而鹿回头迁入的珊瑚平均生长了6.15cm,增长率为58.74%,高于迁移至西岛的珊瑚。迁移采用的三种移植方法的8个月的存活率均高于75%,并且珊瑚的生长速率较好,说明珊瑚适应迁入区环境。由以上结果来看,此次保护性迁移珊瑚数量多,涉及的珊瑚种类广,在迁移后经受过两次台风的影响,迁移结果具有一定的代表性。本研究中,珊瑚迁移的效果达到了保护受拆除工程影响的造礁石珊瑚的目的,可为未来的珊瑚迁移性保护提供重要经验。

关键词：造礁石珊瑚珊瑚礁保护珊瑚迁移三亚珊瑚礁凤凰岛

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中国海洋生物地理学研究进展和热点:物种分布模型及其应用

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生物多样性 2024年第5期32卷 138-168页

作者：董云伟鲍梦幻程娇陈义永杜建国高养春胡利莎李心诚刘春龙秦耿孙进王信杨光张崇良张雄张宇洋张志新战爱斌贺强孙军陈彬沙忠利林强中国海洋大学水产学院教育部海水养殖重点实验室山东青岛266003 中国科学院海洋研究所山东青岛266071 中国科学院生态环境研究中心北京100085 自然资源部第三海洋研究所福建厦门361005 广东省科学院动物研究所广州510260 复旦大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200438 中国科学院南海海洋研究所广州510301 中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所山东青岛266003 中山大学生态学院广东深圳518000 中国地质大学(武汉)广州南沙地大滨海研究院广州511462 中国地质大学(武汉)生物地质与环境地质国家重点实验室武汉430074

海洋生物地理学是研究海洋生物地理分布时空格局、形成过程及其影响因素的学科,对于生物多样性保护、生态系统结构稳定以及海洋资源可持续利用具有重要支撑作用。物种分布模型是研究物种地理分布变化的重要手段,其发展对于海洋生物地理... 详细信息

海洋生物地理学是研究海洋生物地理分布时空格局、形成过程及其影响因素的学科,对于生物多样性保护、生态系统结构稳定以及海洋资源可持续利用具有重要支撑作用。物种分布模型是研究物种地理分布变化的重要手段,其发展对于海洋生物地理学的发展具有重要的推动作用。本文综述了中国海洋生物地理学的发展历程和现状;提供了物种分布模型的定义、类型、发展历程及相关重要数据库;整理分析了中国海洋生物地理学研究中的部分热点问题,主要涉及全球变化下海洋生物分布区变化、海洋生物谱系地理结构、海洋生物入侵、种群连通性、海洋保护规划、海洋生态修复、海洋生物对极端环境适应、海洋渔业资源管理和海水养殖规划等。本文同时对海洋生物地理学研究的未来发展进行了展望,强调了改进物种分布模型的重要性,提出要强化环境和生物数据库建设,加强海洋生物地理学与其他学科的交叉融合等。本综述对于今后我国海洋生物地理学的研究,尤其是物种分布模型在相关领域中的应用具有参考价值。

关键词：海洋生物分布生物地理区划相关模型机理模型全球变化生物地理学

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龙蜥属Diploderma研究简况与展望

动物学杂志 2024年第1期59卷 129-131页

作者：王剀高伟吴亚勇车静遗传资源与进化国家重点实验室云南省高黎贡山生物多样性与生态安全重点实验室中国科学院昆明动物研究所昆明650201 中国科学院东南亚生物多样性研究中心缅甸内比都05282 宜宾学院农林与食品工程学部宜宾644000

龙蜥属(Mountain Dragons,学名Diploderma)隶属于爬行纲(Reptilia)鬣蜥科(Agamidae)飞蜥亚科(Draconinae),由美国两栖爬行动物学家Edward Hallowell于1861年依据琉球龙蜥(***)描述,早期被认为是攀蜥属(Japalura)的同物异名,2019年经系统分类学厘定后恢复其有效性(Wang et al.2019a)。厘定后,攀蜥属物种主体分布在喜马拉雅山地区,而龙蜥属则分布于东亚和中南半岛北部。

关键词：两栖爬行动物系统分类学同物异名龙蜥爬行纲攀蜥属鬣蜥科

CO_(2)升高对风信子鹿角珊瑚(Acropora hyacinthus)钙化速率和基因表达的影响

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热带海洋学报 2024年第3期43卷 40-48页

作者：袁翔城梁宇娴宋严俞晓磊黄晖周伟华中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室广东广州510301 三亚海洋生态环境工程研究院三亚海洋科学综合(联合)实验室海南省热带海洋生物技术重点实验室海南三亚572000 中国科学院海南热带海洋生物实验站海南三亚海洋生态系统国家野外科学观测研究站海南三亚572000 中国科学院南海生态环境工程创新研究院广东广州510301 南方海洋科学与工程广东省实验室(广州) 广东广州511458 中国科学院大学北京100049

本文以风信子鹿角珊瑚(Acropora hyacinthus)为研究对象,以三亚珊瑚礁海域自然海水培养的珊瑚样本为对照组,模拟本世纪末海水酸化状况,并开展珊瑚模拟培养试验。以此探究海水酸化对***钙化和基因表达的影响。在酸化胁迫下,***净钙化速... 详细信息

本文以风信子鹿角珊瑚(Acropora hyacinthus)为研究对象,以三亚珊瑚礁海域自然海水培养的珊瑚样本为对照组,模拟本世纪末海水酸化状况,并开展珊瑚模拟培养试验。以此探究海水酸化对***钙化和基因表达的影响。在酸化胁迫下,***净钙化速率显著下降,基因表达受到显著影响,其中有机物运输、阴离子运输、化学应激等通路上调,动物器官发育、脂质转运、细胞生物合成、细胞表面受体信号等通路下调。与钙化相关的基因中,碳酸酐酶和溶质运载蛋白下调,但是Ca^(2+)-ATP酶和钙离子运输相关的基因上调。结果表明,高CO_(2)影响了***的钙化和多个生物过程的基因表达,海水酸化可能通过抑制珊瑚碳酸酐酶等基因表达,减少HCO–3运输,最终降低钙化速率。

关键词：海水酸化风信子鹿角珊瑚基因表达钙化

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