检索结果-南通市图书馆

基于CRISPR/Cas9系统构建Lep基因敲除小鼠模型

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国比较医学杂志 2024年

作者：曹愿杨远松谷文达赵皓阳翟世杰孙晓炜范昌发中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所国家啮齿类实验动物资源库

目的本研究旨在利用CRISPR/Cas9系统构建Lep基因敲除小鼠(C57BL/6N-Lepem1/Nifdc，简称ob小鼠)，作为肥胖症、糖尿病等临床疾病体内药物评价的动物模型。方法根据CRISPR/Cas9靶点设计原则，设计能够靶向小鼠Lep基因的sgRNA，经体外转... 详细信息

目的本研究旨在利用CRISPR/Cas9系统构建Lep基因敲除小鼠(C57BL/6N-Lepem1/Nifdc，简称ob小鼠)，作为肥胖症、糖尿病等临床疾病体内药物评价的动物模型。方法根据CRISPR/Cas9靶点设计原则，设计能够靶向小鼠Lep基因的sgRNA，经体外转录，与Cas9mRNA一并注射入小鼠受精卵。随后提取出生小鼠的鼠尾DNA，采用PCR检测及测序技术，得到阳性小鼠。将其与野生型小鼠进行交配传代，最终获得纯合ob小鼠，并对纯合ob小鼠进行血清生化指标检测及肝病理检测。结果经PCR鉴定，共得到8只阳性小鼠，经筛选传代，得到能够稳定遗传的阳性小鼠。纯合ob小鼠的血清生化指标甘油三酯（triglycerides，TG）、总胆固醇（totalcholesterol，CHO）、谷丙转氨酶（alaninneaminotransferase，ALT）含量均显著高于野生型小鼠。肝病理检测结果表明，纯合ob小鼠的肝中存在明显的炎症浸润及脂肪空泡样病变。结论成功建立Lep基因敲除小鼠，丰富了国家啮齿类实验动物资源库，为药物临床前评价提供了动物模型支持。

关键词：基因敲除 ob小鼠 CRISPR/Cas9技术 Lep基因

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

木材分子考古研究进展

林业科学 2024年第2期60卷 118-127页

作者：焦立超陆杨郭雨殷亚方中国林业科学研究院木材工业研究所、中国林业科学研究院木材标本馆、国家林业和草原局木材标本资源库CITES全球野生动植物鉴定实验室北京100091

木材考古学研究是推动木质文物自然和历史信息挖掘、保护和修复的重要基础。近年来,随着古DNA捕获和测序技术的快速发展,从木质遗存中可获取古DNA信息,在木材解剖学基础上,创新开展以古DNA为核心的木材分子考古研究已成为木材考古学的... 详细信息

木材考古学研究是推动木质文物自然和历史信息挖掘、保护和修复的重要基础。近年来,随着古DNA捕获和测序技术的快速发展,从木质遗存中可获取古DNA信息,在木材解剖学基础上,创新开展以古DNA为核心的木材分子考古研究已成为木材考古学的前沿热点。本文首先对木材分子考古研究进行概述,从古DNA的保存和降解、获取以及数据处理和序列分析3方面归纳木材古DNA的研究进展,并指出古DNA因高度降解、含量极低和化学损伤特征导致其难于提取和信息解译的难题。然后总结木材分子考古在解读先民认知与利用森林资源方式、复原历史时期地域性森林植被类型和物种多样性以及重建古代树木应对气候和生境变化的微进化反应等方面的主要应用。最后提出该研究领域未来应优先开展的工作:1)建立考古木材标本库及其DNA信息数据库;2)研究不同时空维度下木材古DNA损伤及变化规律;3)构建稳定高效的木材古DNA提取及序列信息解译技术体系。通过进一步加强木材分子考古等多学科交叉研究,推动新理论、新方法、新技术在木材学和考古学领域的应用,为木质文物的用材树种识别、保护利用以及重建历史时期森林植被、环境气候与人类活动的耦合关系提供重要科学依据。

关键词：木质遗存古DNA 树种 DNA提取 DNA损伤分子考古

基于知识图谱多跳推理的中文矿物知识问答方法与系统

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

地学前缘 2024年第4期31卷 37-46页

作者：季晓慧董雨航杨中基杨眉何明跃王玉柱中国地质大学(北京)信息工程学院北京100083 中国地质大学(北京)国家岩矿化石标本资源库北京100083

已有相关矿物数据库用于存储和查询相关矿物知识,常用的搜索引擎也可以对矿物知识进行查询,但无法回答用自然语言进行提问的矿物问题,查询返回的答案需要进一步筛选。亦有基于知识图谱进行矿物知识问答的相关研究,但只能回答涉及知识图... 详细信息

已有相关矿物数据库用于存储和查询相关矿物知识,常用的搜索引擎也可以对矿物知识进行查询,但无法回答用自然语言进行提问的矿物问题,查询返回的答案需要进一步筛选。亦有基于知识图谱进行矿物知识问答的相关研究,但只能回答涉及知识图谱中一个三元组的简单问题,无法回答涉及多个三元组的多跳复杂问题。为此,本文提出基于知识图谱多跳推理的矿物复杂知识问答方法,采用ComplEx模型将矿物实体、关系和问句表示为复数向量,以更好地获取相互之间的语义及推理关系。输入矿物问句后,通过Bert-LSTM-CRF获取其中心词,采用基于编辑距离及分词的方法获得中心词的候选实体集合,然后采用全连接网络确定最相关的实体作为推理起点,与矿物问句拼接后通过全连接网络获得当前跳的最相关关系。根据当前跳的起始实体及最相关关系,在矿物知识图谱中获得另一实体作为下一跳的推理起点,并将下一跳的问句更新为原问句,与当前跳最相关关系拼接,以将当前跳的推理信息带入到下一跳推理中,直到获得的最相关推理关系为预定义的结束标识符,推理结束,返回最后一跳的实体为答案,并给出推理路径。采用Python语言,在Tensorflow框架下实现了本文提出的矿物复杂知识问答并与相关模型进行对比,证明了本文方法的有效性。采用前后端分离架构,使用RESTful API、React、Ajax、echarts和Flask等框架和技术,开发了基于知识图谱多跳推理的矿物复杂知识问答系统,为矿物知识获取及相关地质研究提供了平台和工具。

关键词：矿物问答系统知识图谱多跳推理

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

鲸类消化道微生物研究进展与展望

野生动物学报 2024年第1期45卷 182-192页

作者：万晓玲郑劲松郝玉江王丁武汉轻工大学动物科学与营养工程学院武汉430023 中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072 国家水生生物种质资源库武汉430072

作为宿主的“第二套基因组”,消化道微生物与宿主的营养吸收和免疫抵御等功能紧密相关。与陆生哺乳动物相比,海洋哺乳动物鲸类的消化道微生物是目前国内外关注较少的研究领域。已有研究表明,鲸类消化道微生物极易受到食物和栖息地环境... 详细信息

作为宿主的“第二套基因组”,消化道微生物与宿主的营养吸收和免疫抵御等功能紧密相关。与陆生哺乳动物相比,海洋哺乳动物鲸类的消化道微生物是目前国内外关注较少的研究领域。已有研究表明,鲸类消化道微生物极易受到食物和栖息地环境等因素的影响,然而现阶段研究手段以基于粪便样品进行高通量测序为主。本文对鲸类消化道微生物的研究手段、群落结构、功能特征和调控策略等方面的进展进行总结和分析,并对未来发展方向提出展望和建议。

关键词：鲸类消化道微生物微生物群系保护生物学

维普期刊数据库博看期刊

鸡传染性贫血病毒对SPF鸡的致病特性及其排毒规律研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

畜牧兽医学报 2024年

作者：冯笑艳胡明雪林雨萌高宏雷于海波刘长军祁小乐张伟张艳萍高玉龙中国农业科学院哈尔滨兽医研究所动物疫病防控全国重点实验室中国农业科学院哈尔滨兽医研究所国家禽类实验动物资源库

旨在了解鸡传染性贫血病毒（CAV）对SPF鸡的致病性、排毒规律及水平传播能力。本研究将CAV JL17/1204株经腹腔接种和同居接触感染1日龄及28日龄SPF鸡，在感染后3 d（dpi）、5 dpi、7 dpi、9 dpi、11 dpi、14 dpi、21 dpi、28 dpi、42 dp... 详细信息

旨在了解鸡传染性贫血病毒（CAV）对SPF鸡的致病性、排毒规律及水平传播能力。本研究将CAV JL17/1204株经腹腔接种和同居接触感染1日龄及28日龄SPF鸡，在感染后3 d（dpi）、5 dpi、7 dpi、9 dpi、11 dpi、14 dpi、21 dpi、28 dpi、42 dpi、56 dpi、84 dpi和112 dpi，感染组和同居组分别采集3只鸡的抗凝血并剖检，以检测其贫血、胸腺萎缩情况；每个时间点另采集每组20只鸡的咽拭子和肛拭子通过PCR方法进行排毒检测。临床观察结果显示，1日龄感染组和同居组鸡的死亡率分别为50.0%和10.0%，死亡时间为12～15 dpi；28日龄感染组和同居组鸡感染后无死亡。剖检结果显示，各组发病鸡出现胸腺萎缩和/或贫血症状，1日龄感染组和同居组发病率分别为100.0%和20.0%；28日龄感染组和同居组发病率分别为10.0%和8.0%。排毒检测结果显示，1日龄感染组鸡呼吸道和消化道分别从3 dpi、5 dpi开始排毒，1日龄同居组呼吸道和消化道排毒期分别为同居后5～84 d和7～42 d；28日龄感染组呼吸道和消化道排毒期分别为感染后3～9 dpi和5～14 dpi；28日龄同居组呼吸道和消化道排毒期分别为同居后5～9 d和5～42 d。结果提示CAV对1日龄SPF鸡致病性强，感染后可诱导鸡死亡、胸腺萎缩和/或贫血等致病特征，对28日龄SPF鸡致病性明显减弱；接种和同居感染后均经呼吸道和消化道排毒，可诱导同居接触感染鸡发病甚至死亡，表明CAV具有较强的水平传播能力。本研究结果系统阐明了CAV感染致病特征和排毒规律，为鸡群科学开展CAV的净化提供了理论指导和科学依据。

关键词：鸡传染性贫血病毒 SPF鸡致病特性排毒规律水平传播

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

基于渐进多粒度训练深度学习的矿物图像识别

地学前缘 2024年第4期31卷 112-118页

作者：万成舟季晓慧杨眉何明跃张招崇曾姗王玉柱中国地质大学(北京)信息工程学院北京100083 中国地质大学(北京)国家岩矿化石标本资源库北京100083 中国地质大学(北京)地球科学与资源学院北京100083

近年来,随着深度学习在地学领域中的应用,矿物图像识别变得越来越重要。虽然已经有研究将深度学习应用于矿物图像识别,并取得了一定的成果,但在大规模矿物数据集上的识别准确率仍然有待进一步提高。不同矿物之间可能存在细微的形态、纹... 详细信息

近年来,随着深度学习在地学领域中的应用,矿物图像识别变得越来越重要。虽然已经有研究将深度学习应用于矿物图像识别,并取得了一定的成果,但在大规模矿物数据集上的识别准确率仍然有待进一步提高。不同矿物之间可能存在细微的形态、纹理和颜色差异,符合细粒度识别算法特征,但以往的研究中很少有人采用细粒度方法进行矿物识别。所以本文提出了一种基于Next-ViT模型的细粒度矿物识别方法,通过引入渐进式多粒度训练拼图技术,实现对矿物图像的精确分类。首先采用Next-ViT模型作为特征提取器,该模型结合了Transformer结构和卷积神经网络的优势,能够提取到丰富的图像特征;接下来利用随机拼图生成器创建不同粒度级别的矿物拼图,这些拼图包含从细节到整体的多种信息。训练过程中采用渐进式多粒度训练策略,在训练的早期阶段,模型主要关注细粒度的特征,通过学习拼图中的细节信息来区分不同的矿物,随着训练的深入,模型逐渐将注意力转移到更大粒度级别的特征上,学习更加抽象和全局的信息。通过这种方式,模型能够充分利用不同粒度级别的信息,提高矿物识别的准确性。实验结果表明,该模型在常见的36种矿物数据集上取得了86.5%的准确率,有效地提高了矿物识别的准确率。这表明,细粒度识别方法对于矿物识别是有效的。

关键词：矿物识别深度学习 Next-ViT 细粒度识别渐进式多粒度训练

南海细足磷虾属Hansarsia的分类学研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

热带海洋学报 2024年

作者：周志乾连喜平谭烨辉中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室南海海洋生物标本馆中国科学院大学

细足磷虾属Hansarsia(原Nematoscelis)的物种在海洋浮游生态系统中扮演着关键角色,但常存在混淆和错误鉴定。本研究采用形态学分析方法,对中国科学院南海海洋生物标本馆在南海和东印度洋海域采集到的细足磷虾属标本进行了深入研究,旨在... 详细信息

细足磷虾属Hansarsia(原Nematoscelis)的物种在海洋浮游生态系统中扮演着关键角色,但常存在混淆和错误鉴定。本研究采用形态学分析方法,对中国科学院南海海洋生物标本馆在南海和东印度洋海域采集到的细足磷虾属标本进行了深入研究,旨在明确种间差异并解决分类上的混淆。本研究a)补充和修订了秀细足磷虾、瘦细足磷虾、小细足磷虾和长细足磷虾的特征描述；b)描绘四个种从亚成体到成体的第一和第二胸足的变化；c)指出成体瘦细足磷虾的额角二型现象以及第一胸足掌节刚毛的数量变化；d)明确了在南海和东印度洋海域的小细足磷虾和长细足磷虾的区别。研究结果不仅提高了分类学的准确性,也为磷虾资源的保护和可持续利用提供了科学依据。

关键词：磷虾细足磷虾属形态学分类第一胸足

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

基于数据增强和集成学习的矿物图像识别

地学前缘 2024年第4期31卷 87-94页

作者：王琳季晓慧杨眉何明跃张招崇曾姗王玉柱中国地质大学(北京)信息工程学院北京100083 中国地质大学(北京)国家岩矿化石标本资源库北京100083 中国地质大学(北京)地球科学与资源学院北京100083

矿物识别是地质学研究的一个重要部分,对于资源勘探、岩石分类和地质环境监测都有着重要的意义。然而,传统方法通常依赖人的经验进行主观判断,并且效率低下。近年来,已有许多研究将深度学习的图像分类技术应用于矿物识别,以客观快速地... 详细信息

矿物识别是地质学研究的一个重要部分,对于资源勘探、岩石分类和地质环境监测都有着重要的意义。然而,传统方法通常依赖人的经验进行主观判断,并且效率低下。近年来,已有许多研究将深度学习的图像分类技术应用于矿物识别,以客观快速地识别矿物,这些研究都取得了一定的成果,但可识别矿物种类有限且精度需要进一步提升。为此本文首先解决了矿物数据集图像数据样本分布不平衡问题,对数据集中矿物图像较少的11个矿物类别采用DCGAN生成矿物图像进行数据增强,对比选择效果更好的方案对数据集进行扩充。其次,为了得到更可靠、精确度更高的识别模型,将ImageNet上表现较好的ResNet、RegNet、EfficientNet和Vision Transformer模型迁移到本文使用的矿物数据集上。针对训练好的基模型排列组合得到11个子模型,分别使用平均软投票法和加权软投票法两种方法进行集成,得到22个集成模型并对其训练得到识别结果,对比22个集成模型的结果选择出精度最高的集成模型。实验结果表明:使用DCGAN进行数据增强,在不同的模型上平均提升了3.12%的准确率,充分证明了DCGAN数据增强的有效性;在所有集成模型中,使用加权软投票法的模型表现较好,其中精度最高的是利用4个基分类模型进行加权软投票得到的集成模型,在扩充后的36种常见矿物数据集上达到了87.47%的准确率。

关键词：矿物识别深度卷积生成对抗网络数据增强集成学习

5株H6N3亚型禽流感病毒的分子特征及遗传演化分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国家禽 2024年

作者：陈源崔鹏飞施建忠邓国华陈化兰中国农业科学院哈尔滨兽医研究所动物疫病防控全国重点实验室国家禽类实验动物资源库

为了解H6N3亚型禽流感病毒（AIV）的遗传演化特点，试验对2023年采集自广东、湖北两地的活禽交易市场禽类咽喉拭子及泄殖腔拭子进行病原分离鉴定，并对分离的H6N3亚型AIV进行全基因组序列测定，进一步分析其遗传演化情况和特殊分子标记... 详细信息

为了解H6N3亚型禽流感病毒（AIV）的遗传演化特点，试验对2023年采集自广东、湖北两地的活禽交易市场禽类咽喉拭子及泄殖腔拭子进行病原分离鉴定，并对分离的H6N3亚型AIV进行全基因组序列测定，进一步分析其遗传演化情况和特殊分子标记。结果显示：共分离到5株H6N3亚型AIV，且均为新型重配病毒，可分为2种基因型，其中4株湖北分离株属于基因1型，NA基因进化支相对独立，其余基因片段与分离于我国家禽的H3N2、H3N3、H3N8、H6N6亚型AIV有着较近的亲缘关系；1株广东分离株属于基因2型，与多种不同亚型野鸟源病毒高度同源；5株分离株HA蛋白的裂解位点序列仅有一个碱性氨基酸，符合低致病性禽流感病毒（LPAIV）的特征；4株湖北分离株的NA基因全长仅有1 365 bp，其编码的NA蛋白出现茎部缺失；部分分离株HA蛋白获得A138S突变，一株病毒的PB2蛋白获得I292V突变。综上所述，分离的5株H6N3亚型AIV为新型重配病毒，部分分离株获得哺乳动物适应性突变，应加强对H6亚型AIV的流行病学监测。

关键词： H6N3 禽流感病毒活禽交易市场分子特征基因重配