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‘凤丹’牡丹栽培及产业发展综述

北方园艺 2024年第7期 126-132页

作者：李子健朱洁薇于水燕胡永红青岛农业大学园林与林学院青岛山东266109 上海辰山植物园上海市资源植物功能基因组学重点实验室上海201602 中国科学院大学中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海200032

该研究总结了影响‘凤丹’生长发育、产量的各项因素并结合阐述现阶段‘凤丹’综合开发利用的现状,揭示了‘凤丹’产业精细化发展所面临的主要挑战,以期对‘凤丹’以及整个牡丹产业的可持续发展提供参考依据。

关键词： ‘凤丹’ 新资源植物牡丹籽油植物养分补充牡丹产业升级

1.27 μm O_(2)(a^(1)Δ g)气辉临边观测辐射传输特性

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光谱学与光谱分析 2024年第4期44卷 1088-1097页

作者：王道琦王后茂何微微胡向瑞李娟李发泉武魁军烟台大学物理与电子信息学院山东烟台264005 中国科学院国家空间科学中心北京100190 中国科学院西安光学精密机械研究所陕西西安710119 中国科学院精密测量科学与技术创新研究院湖北武汉430071

1.27μm波段的O_(2)(a^(1)Δg)气辉辐射具有辐射信号强、空间跨度大、自吸收效应弱等诸多内禀优势,是临近空间大气遥感的重要目标源,对于中高层大气的动力学及热学特性研究,全球温室气体探测,以及臭氧浓度三维层析等卫星遥感具有重要的... 详细信息

1.27μm波段的O_(2)(a^(1)Δg)气辉辐射具有辐射信号强、空间跨度大、自吸收效应弱等诸多内禀优势,是临近空间大气遥感的重要目标源,对于中高层大气的动力学及热学特性研究,全球温室气体探测,以及臭氧浓度三维层析等卫星遥感具有重要的科学意义和应用价值。首先基于O_(2)(a^(1)Δg)光化学反应模型,研究了O_(2)(a^(1)Δg)气辉的产生机制及湮灭机理,在此基础上,计算得到了O_(2)(a^(1)Δg)气辉体辐射率廓线,并基于HITRAN数据库给出的谱线强度及爱因斯坦系数,提出了两种计算O_(2)(a^(1)Δg)气辉光谱分布的方法。采用最新的分子光谱参数、光化学反应速率常数及F10.7太阳紫外通量等参数,结合光化学反应模型计算得到的O_(2)(a^(1)Δg)气辉体辐射率廓线信息,借助逐线积分算法,建立了1.27μm O_(2)(a^(1)Δg)气辉临边观测辐射传输理论模型,并分析了自吸收效应对不同临边观测高度处气辉辐射光谱强度的影响。然后,利用剥洋葱算法,对大气图像扫描成像吸收光谱仪(SCIAMACHY)在临边观测模式下测得的O_(2)分子近红外大气带的气辉辐射信号进行处理得到了目标层O_(2)(a^(1)Δg)气辉辐射光谱,并通过谱积分算法反演得到了O_(2)(a^(1)Δg)气辉的体辐射率廓线信息。最后通过对比气辉临边观测辐射传输理论模型计算得到的以及SCIAMACHY仪器测量反演得到的1.27μm O_(2)(a^(1)Δg)辐射光谱及体辐射率廓线信息,验证1.27μm O_(2)(a^(1)Δg)气辉临边观测辐射传输理论模型的可靠性与合理性。基于比对结果,对O_(2)(a^(1)Δg)气辉临边辐射强度和体辐射率的影响因素进行了分析。分析结果表明,在50 km以上的高空区域,理论计算结果与卫星实测结果吻合性较好,而随着海拔高度的降低,两者的偏差逐渐增大,这是因为在临边观测模式下,中低空区域的卫星遥感信号受自吸收效应及大气散射效应影响严重。此外,与HITRAN数据库给出的谱线强度参数相比,基于爱因斯坦系数建立的O_(2)(a^(1)Δg)气辉临边辐射模型与卫星实测结果更加吻合。1.27μm O_(2)(a^(1)Δg)气辉临边观测辐射传输理论模型的建立,对于临近空间大气遥感,奠定了理论基础。

关键词： O_(2)(a^(1)Δg)气辉体辐射率临边观测辐射传输理论模型

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不同倍性甘薯及近缘材料的SNP鉴定流程

分子植物育种 2024年第20期 6747-6756页

作者：王心怡李明颜梦晓王红霞杨俊上海辰山植物园上海市资源植物功能基因组学重点实验室四川省农业科学院生物技术核技术研究所中国科学院分子植物科学卓越创新中心植物分子遗传国家重点实验室

基因组上的SNP变异具有丰富的数量和多态性的特点，SNP鉴定在作物遗传多样性、群体结构关系、育种等方面有重要作用。然而多倍体作物由于倍性高、杂合性高等问题，使得SNP的开发、验证和检测较为困难。甘薯及不同倍性近缘野生种均属于... 详细信息

基因组上的SNP变异具有丰富的数量和多态性的特点，SNP鉴定在作物遗传多样性、群体结构关系、育种等方面有重要作用。然而多倍体作物由于倍性高、杂合性高等问题，使得SNP的开发、验证和检测较为困难。甘薯及不同倍性近缘野生种均属于番薯属，由于甘薯近缘物种倍性变化较大，本研究选取二倍体、四倍体、六倍体的Ipomoea trifida以及五倍体和六倍体的甘薯为材料，采用简化基因组测序技术——RAD-seq进行测序，以栽培甘薯‘泰中6号’基因组序列为参考，通过与参考基因组的比对、排序、PCR标记去重复以及变异检测，建立了一套基于甘薯参考基因组进行不同倍性材料SNP鉴定的分析流程。通过IQ-TREE对SNP标记进行系统发育树构建，结果验证了本流程具有较高的可靠性。本研究开发的数据处理流程，不仅可用于不同倍性野生材料遗传关系的鉴定，还可为甘薯品种的遗传多样性分析和育种的亲本选择以及其他多倍体植物SNP标记开发鉴定提供借鉴和参考。

关键词：甘薯 Ipomoea trifida 多倍体 SNP 简化基因组测序

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虎耳草表型特征多样性分析

植物研究 2024年第4期44卷 540-553页

作者：唐世梅黄安琪陈之林罗佳琳李昕晋宇轩田代科中国科学院分子植物科学卓越创新中心辰山科研中心/上海辰山植物园上海201602 湖南农业大学园艺学院长沙410128 湖南省中亚热带优质花木繁育与利用工程技术研究中心长沙410128 贵州省农业科学院园艺研究所贵阳550006 上海市资源植物功能基因组学重点实验室上海201602

为了全面理解虎耳草(Saxifraga stolonifera)的种内多样性,探讨种下分类的可能性,为资源保护及创新利用提供参考,对全国43个虎耳草居群的33个性状进行观察记录,通过数量性状变异和质量性状多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分... 详细信息

为了全面理解虎耳草(Saxifraga stolonifera)的种内多样性,探讨种下分类的可能性,为资源保护及创新利用提供参考,对全国43个虎耳草居群的33个性状进行观察记录,通过数量性状变异和质量性状多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析等方法探讨该种的表型性状多样性。结果表明:(1)数量性状变异系数为0.05~0.67,质量性状多样性指数为0.19~1.39,居群间斑纹分布式样和叶色多样性水平高,匍匐茎分枝数和叶长宽比分别为最不稳定和最稳定的性状。(2)数量性状和导出性状变异系数普遍较大、质量性状的多样性指数普遍较高及各主成分的贡献率较分散,因此不宜仅仅依靠形态特征对该种进行种下分类。(3)虎耳草居群间各性状相关性存在差异,叶长和叶宽、下长花瓣长和下短花瓣长、下长花瓣宽和下短花瓣宽等性状相关性显著。(4)基于形态聚类结果可将国产虎耳草分为3个分支,并表现出一定的地域性,其中分支Ⅰ由8个西南居群、2个华东居群和3个西北居群组成;分支Ⅱ由4个华东居群、4个华中居群、4个西南居群和1个西北居群组成,这一类表型的虎耳草分布广泛;分支Ⅲ由10个华中居群、6个西南居群和1个华东居群组成。

关键词：虎耳草属数量分类学形态聚类分析主成分分析

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基于文献计量分析的土壤微生物残体研究态势

土壤通报 2024年第1期55卷 242-253页

作者：陈炀赵泓凯李通王芳宋秀芳崔骁勇中国科学院大学生命科学学院北京100049 中国科学院大学资源与环境学院北京100049 格里菲斯大学地球健康和粮食安全中心布里斯班4111 中国科学院文献情报中心北京100190 中国科学院大学经济与管理学院图书信息与档案管理系北京100190 北京燕山地球关键带国家野外科学观测研究站北京100049 中国科学院青藏高原地球科学卓越创新中心北京100101

土壤微生物残体是当前的热点研究领域,本研究在系统描述1991~2022年期间土壤微生物残体领域的研究现状及研究热点的基础上,分析了该领域尚存的一些有待解决的问题,有助于相关学者加深对该研究领域的理解,对进一步聚焦土壤微生物残体领... 详细信息

土壤微生物残体是当前的热点研究领域,本研究在系统描述1991~2022年期间土壤微生物残体领域的研究现状及研究热点的基础上,分析了该领域尚存的一些有待解决的问题,有助于相关学者加深对该研究领域的理解,对进一步聚焦土壤微生物残体领域的研究方向具有重要参考价值。采用文献计量方法,对1991~2022年期间WOS(Web of Science)核心合集数据库收录的该研究领域论文的数量、被引频次、作者、国家(地区)、研究机构、期刊以及关键词进行统计。基于VOSviewer可视化软件分析贡献居前的作者、国家(地区)、研究机构、期刊以及重要关键词。①在1991~2022年间,中国学者在本研究领域共发表论文179篇,排名世界第一,占该领域全部文章总数的54.41%。②根据年度发文量,该领域的研究历程大体可分为三个阶段,分别为萌芽期(1991~2003年)、波动发展期(2004~2015年)和指数增长期(2016~2022年)。③何红波、梁超、张旭东以及丁雪丽是本研究领域的核心作者。④中国科学院是核心研究机构。⑤Soil Biology&Biochemistry为WOS数据库文献的主要来源期刊。⑥本领域关键词共现图表明当前研究多集中于土壤微生物残体对土壤有机质的贡献及其对气候变化的响应。土壤微生物残体领域研究正处于指数增长阶段,国内学者为该领域的发展做出了不可或缺的巨大贡献。微生物残体标识物的扩展、微生物残体与植物木质素在不同生态系统中的积累机制、微生物残体在氮、磷等养分循环中可能起到的重要作用,以及微生物残体含量在不同土壤深度以及更加广泛的地理格局中所展现出的差异等方面可能是今后土壤微生物残体领域的研究热点。

关键词：微生物残体细菌真菌碳循环 VOSviewer

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虎耳草表型特征的多样性分析

植物研究 2024年

作者：唐世梅黄安琪陈之林罗佳琳李昕晋宇轩田代科中国科学院分子植物科学卓越创新中心辰山科研中心/上海辰山植物园湖南农业大学园艺学院上海市资源植物功能基因组学重点实验室湖南省中亚热带优质花木繁育与利用工程技术研究中心贵州省农业科学院园艺研究所

为了全面理解虎耳草的种内多样性，探讨其种下分类的可能性，为其资源保护及创新利用提供参考。对全国43个虎耳草居群的33个性状进行观察记录，通过数量性状变异和质量性状多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析等方法探讨该种... 详细信息

为了全面理解虎耳草的种内多样性，探讨其种下分类的可能性，为其资源保护及创新利用提供参考。对全国43个虎耳草居群的33个性状进行观察记录，通过数量性状变异和质量性状多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析等方法探讨该种的表型性状多样性。结果表明：（1）数量性状变异系数为0.05～0.67，质量性状多样性指数为0.19～1.39，居群间斑纹分布式样和叶色多样性水平高，匍匐茎分枝数和叶长宽比分别为最不稳定和最稳定的性状；（2）数量性状和导出性状变异系数普遍较大、质量性状的多样性指数普遍较高及各主成分的贡献率较分散，因此不宜仅仅依靠形态特征对该种进行种下分类；（3）虎耳草居群间各个性状间相关性存在差异，叶长和叶宽、下长花瓣长和下短花瓣长、下长花瓣宽和下短花瓣宽等性状相关性显著；（4）基于形态聚类结果可将国产虎耳草分为3个分支，并表现出一定的地域性，其中分支I由8个西南居群、2个华东居群和3个西北居群组成；分支Ⅱ由4个华东居群、4个华中居群、4个西南居群和1个西北居群组成，这一类表型的虎耳草分布广泛；分支Ⅲ由10个华中居群、6个西南居群和1个华东居群组成。

关键词：虎耳草属数量分类学形态聚类分析主成分分析

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虎耳草属的资源分类及育种进展

广西植物 2024年第1期44卷 193-206页

作者：唐世梅张霞陈倩如蔡文淇李炎林田代科中国科学院分子植物科学卓越创新中心辰山科研中心/上海辰山植物园上海201602 湖南农业大学园艺学院长沙410128 上海市资源植物功能基因组学重点实验室上海201602 湖南省中亚热带优质花木繁育与利用工程技术研究中心长沙410128

虎耳草属(Saxifraga Tourn. ex L.)资源丰富且分布广泛,全球有440~500个种,其分类一直受到植物学家的关注。该属具有重要的观赏和药用价值,欧洲多国非常重视其观赏资源的开发利用。虎耳草属的品种培育距今已有150多年的历史,到2022年国... 详细信息

虎耳草属(Saxifraga Tourn. ex L.)资源丰富且分布广泛,全球有440~500个种,其分类一直受到植物学家的关注。该属具有重要的观赏和药用价值,欧洲多国非常重视其观赏资源的开发利用。虎耳草属的品种培育距今已有150多年的历史,到2022年国际虎耳草协会(The Saxifrage Society)网站收录了1 692个品种,但只有1个品种来自中国。可见,我国虽然是虎耳草属的多样性中心之一,但对其观赏资源的开发利用远远落后于欧美甚至日本。该文从虎耳草属的种质资源、分类概况、育种进展等方面进行综述,并简要介绍该属资源的利用现状,为今后我国虎耳草属的分类、育种及应用提供借鉴。结果表明:(1)虎耳草种质资源丰富,但属下系统演化关系仍存在诸多问题,有待整合形态和系统发育学手段开展系统而深入的研究。(2)该属品种主要通过杂交育种和变异筛选的方式育成,英国、捷克共和国、德国、荷兰为培育品种最多的国家。(3)我国对该属的品种选育工作起步晚,育成品种少且育种方式单一。

关键词：虎耳草属栽培品种种质资源育种研究进展

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全球科研人员城市间的流动格局及演化特征——基于Scopus百年论文数据的研究

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科学学与科学技术管理 2024年第6期45卷 89-107页

作者：赵彬彬刘玄陈光张超中国科学院科技战略咨询研究院北京100190 中国科学院大学公共政策与管理学院北京100049 苏州大学政治与公共管理学院江苏苏州215123 中国科学院学部工作局北京100049

伴随着全球城市间科技交流活动日益频繁,科研人员跨国流动已经成为促进知识国际扩散和区域创新发展的重要途径。基于Scopus数据库1920年—2020年间的80749758篇论文数据对近4100万名科研人员跨国流动行为进行识别,采用社会网络分析方法... 详细信息

伴随着全球城市间科技交流活动日益频繁,科研人员跨国流动已经成为促进知识国际扩散和区域创新发展的重要途径。基于Scopus数据库1920年—2020年间的80749758篇论文数据对近4100万名科研人员跨国流动行为进行识别,采用社会网络分析方法构建全球科研人员在36个重要城市间的跨国流动网络,并从宏观趋势、流动格局和科学中心三方面探讨了全球科研人员在城市间的跨国流动特征。结果发现:(1)从宏观趋势看,1920年—2020年间全球科研人员的跨国流动规模总体上呈现加速增长趋势,流动模式由迁徙型主导向回流和弱流动转变,学科分布主要集中在医学、生物化学、遗传学和分子生物学、化学工程领域。(2)从流动格局看,全球经历了20世纪“欧洲—北美”两极间跨国流动格局向21世纪“欧洲、北美和亚太”三极间跨国流动格局的转变。跨国流动的科研人员在地理分布上表现出明显的城市集聚特征,主要分布在伦敦、纽约、东京、巴黎、北京、新加坡等综合影响力较高的城市,同时以北上广深为代表的中国城市自21世纪以来对全球科研人员的吸引力稳步增强。(3)从科学中心的演化看,科研人员跨国流动有助于促进城市层面科学中心的形成与发展。其中,以纽约和伦敦为代表的欧美城市在科学中心的形成和发展过程中更多地体现了自身在科学发展方面的优势累积效应,而以北京和东京为代表的亚洲城市科学实力的提升则更多地体现了向欧美国家赶超过程中的后发学习优势。

关键词：科研人员跨国流动流动格局演化特征

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丹参萜类合酶基因家族的鉴定和表达模式分析

中国实验方剂学杂志 2024年第3期30卷 142-151页

作者：高颖姜金铸高营营杨洪涛刘先菊刘安中国中医科学院中药研究所北京100700 中国科学院植物研究所北京100093 中国化学品安全协会北京100013

目的:利用生物信息学方法从基因组层面对丹参萜类合酶(SmTPS)基因家族成员进行全面鉴定和功能预测。方法:从国家基因组科学数据中心(NGDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、拟南芥信息资源中心(TAIR)和番茄功能基因组学数据库(TFGD)... 详细信息

目的:利用生物信息学方法从基因组层面对丹参萜类合酶(SmTPS)基因家族成员进行全面鉴定和功能预测。方法:从国家基因组科学数据中心(NGDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、拟南芥信息资源中心(TAIR)和番茄功能基因组学数据库(TFGD)分别获取丹参、拟南芥和番茄基因组与转录组数据。借助Perl语言、TBtools等工具对SmTPS进行全基因组鉴定与生物信息学分析。结果:共鉴定出52个TPS成员分布在丹参的8条染色体上;编码氨基酸数目在207~822 aa;等电点在4.76~9.16,分子质量为24.11~94.81 kDa,所有成员均为亲水蛋白。基因结构分析表明不同亚族成员之间内含子数差异明显,72.6%TPS-a、TPS-b、TPS-g亚族成员为6,88.9%TPS-c、TPS-e/f亚族成员>10;蛋白motif相对保守。顺式作用元件分析表明,SmTPSs启动子区均含有大量光响应元件,大多数SmTPSs启动子区含有激素响应元件。基因表达模式分析显示SmTPS家族成员存在组织表达特异性,24个基因响应外源茉莉酸甲酯。结论:基于已发表丹参基因组,鉴定得到52个SmTPS家族成员,结合系统进化与表达模式对其功能进行了预测。该文为丹参中萜类化合物生物合成及调控机制全面解析提供了参考信息。

关键词：丹参萜类合酶(TPS) 生物信息学功能分析基因家族

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