检索结果-南通市图书馆

从“器官对话”的现代生物学研究探讨中医脏腑理论的科学内涵

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中国中药杂志 2024年

作者：王文雅廖星中国中医科学院中医临床基础医学研究所循证医学基础研究室

生命是一个动态变化的系统性整体，器官之间相互影响。传统中医以脏腑论述人体组织器官间的互动，现代生物医学通过“器官对话”（organ crosstalk）阐明其在生理病理上的关联。该文从“器官对话”论述了肺与大肠、心与小肠、脾与胃、... 详细信息

生命是一个动态变化的系统性整体，器官之间相互影响。传统中医以脏腑论述人体组织器官间的互动，现代生物医学通过“器官对话”（organ crosstalk）阐明其在生理病理上的关联。该文从“器官对话”论述了肺与大肠、心与小肠、脾与胃、肝与胆、肾与膀胱5种中医经典的脏腑关系及其延伸，简要概述了“器官对话”视角下脏腑与体窍器官的联系、脏腑别通论以及脏间、腑间关系。系统检索了当前中医药研究领域相关的脏腑器官轴/对话，以及与之相关的治疗药物。分析比较传统中医脏腑关系与现代生物医学“器官对话”的特点，中医论述脏腑关系主要通过经络循行传导，以及气、血、精、津液运行关联，现代生物医学“器官对话”机制主要为神经传导、免疫反应、分泌因子和微生物及其代谢产物等参与调控，二者均利用中介渠道与中间媒介物质协助脏腑器官相互沟通。借助“器官对话”可使脏腑关系机制更加明晰，脏腑关系则可为“器官对话”提供潜在联系以完善其系统性，并促进理论实施应用。

关键词： “器官对话” 脏腑关系器官轴间接调控中间媒介物质

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副本交换分子动力学

化学进展 2022年第2期34卷 384-396页

作者：彭诚吴乐云徐志建朱维良中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心上海201203 中国科学院大学北京100049

副本交换分子动力学(REMD)是一种广泛应用于蛋白质功能性构象变化模拟及相应自由能计算的增强型采样算法。由于REMD理论严格且采样效率高,近年来备受关注,尤其是针对传统REMD方法的发展和优化,显著提高了REMD的采样效率,拓展了其应用范... 详细信息

副本交换分子动力学(REMD)是一种广泛应用于蛋白质功能性构象变化模拟及相应自由能计算的增强型采样算法。由于REMD理论严格且采样效率高,近年来备受关注,尤其是针对传统REMD方法的发展和优化,显著提高了REMD的采样效率,拓展了其应用范围。但是各种REMD新型方法的最佳适用范围也存在较大区别,使得如何选用合适的REMD方法成为实际应用的难题和挑战。因此,有必要对各种REMD方法及其应用进行阐述,深入比较各方法的优缺点及其实际应用体系。本综述从REMD的原理出发,回顾了近年来各类REMD方法的变形策略,以助于对REMD方法的理解、应用和继续改进。

关键词：副本交换分子动力学变形采样效率副本数目构象变化

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2023年度中国新药盘点

中国新药与临床杂志 2024年第1期43卷 4-11页

作者：李秋戈乾玮邵黎明复旦大学药学院上海201203 上海市药物研发协同创新中心上海201203

为了解我国新药创新现状,本文盘点了2023年度国家药品监督管理局(NMPA)批准的新药上市申请信息,通过对药品类型、治疗领域、靶点分布和优先审评审批等内容的梳理,为生物医药创新相关领域的研究者提供参考。截至2023年12月31日,NMPA共批... 详细信息

为了解我国新药创新现状,本文盘点了2023年度国家药品监督管理局(NMPA)批准的新药上市申请信息,通过对药品类型、治疗领域、靶点分布和优先审评审批等内容的梳理,为生物医药创新相关领域的研究者提供参考。截至2023年12月31日,NMPA共批准190个新药上市申请,化学药品、治疗用生物制品和中药分别为117、64和9个。1类新药37个,改良型新药117个。抗肿瘤药物仍占主导(34.2%)。儿童用药和罕见疾病用药批准数量大幅提升。

关键词：药物批准 1类新药改良型新药生物制品治疗应用靶点

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重要甾体化合物的化学酶法合成研究进展

合成生物学 2024年

作者：郑梦梦刘犇犇林芝瞿旭东上海交通大学张江高等研究院合成科学创新研究中心上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室教育部代谢与发育科学国际合作联合实验室

甾体化合物因其多功能生物活性和理化特性备受生物医药行业的高度重视，被誉为自然界的“生命之钥”。随着植物甾醇代谢途径的不断解析，国内逐渐形成了“植物甾醇原料-甾体药物中间体-甾体药物”的工业合成路线。日益发展的甾药行业需... 详细信息

甾体化合物因其多功能生物活性和理化特性备受生物医药行业的高度重视，被誉为自然界的“生命之钥”。随着植物甾醇代谢途径的不断解析，国内逐渐形成了“植物甾醇原料-甾体药物中间体-甾体药物”的工业合成路线。日益发展的甾药行业需要不断开发新的合成技术推进甾体药物自上而下高效合成。基于生物信息学、合成生物学、代谢工程以及酶工程的快速发展，甾体化合物的合成技术也取得了重大突破。本文对重要甾体化合物的最新合成进展，包括甾体药物中间体的多样化合成，复杂甾体的化学酶法合成和酵母从头合成植物甾醇原料等方面进行了综述，特别强调了近年来P450羟化酶、3-甾酮-Δ1-脱氢酶、还原酶以及酶级联参与的化学酶法在高效简易合成复杂甾体药物中的代表性工作；在此基础上，也从新一代甾药中间体的开发、新型甾体生物催化剂的挖掘、以分支杆菌为底盘的甾体合成途径的构建等方面对甾体化合物未来的研究机会和挑战进行了展望。

关键词：甾体化合物底盘菌株化学酶法区域-立体选择性酶级联

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马袅湾网箱养殖对沉积物营养盐的影响

海洋湖沼通报 2024年第3期 129-140页

作者：黄宏刘怡琳俞锦辰兰艳赵旭王钻一李迎东储鸣上海海洋大学海洋生态与环境学院上海海洋大学海洋牧场工程技术研究中心中国水产科学研究院东海水产研究所

近年来网箱养殖业飞速发展，但养殖活动对区域环境的影响，尤其影响范围的研究还鲜见报道。海南省澄迈县马袅湾海域有较大规模的网箱养殖鱼类生产，本文选取马袅湾网箱养殖区为研究区域，分别于2019年3月(春季)、7月(夏季)、10月(秋季)... 详细信息

近年来网箱养殖业飞速发展，但养殖活动对区域环境的影响，尤其影响范围的研究还鲜见报道。海南省澄迈县马袅湾海域有较大规模的网箱养殖鱼类生产，本文选取马袅湾网箱养殖区为研究区域，分别于2019年3月(春季)、7月(夏季)、10月(秋季)、12月(冬季)进行现场调查与采样，检测并分析了沉积物中总氮(TN)、总磷(TP)和总有机碳(TOC)等指标的含量与时空变化，并建立TN、TP和TOC分别与距网箱养殖区距离的拟合方程，初步估算了网箱养殖活动对表层沉积物的辐射影响范围。结果显示，马袅湾海域表层沉积物TN、TP平均含量分别在113.48～1 265.10 mg/kg与287.90～760.05 mg/kg之间，TOC含量为0.03%～1.14%,四个季节表层沉积物环境整体优良。TN受季节变化影响较显著，夏季较低，秋、冬季节有增加趋势，TN在春、秋、冬季都存在不同程度的富集现象；TP含量随季节上下波动，秋季呈现一定程度的富集；TOC含量也随季节上下变动，但没有出现富集现象。空间分布上，马袅湾表层沉积物TN、TP和TOC含量在养殖区(S区)和养殖邻近区(A区)含量高，对照区(B、C)含量低；从地理位置看，整体呈北部湾口含量高，南部湾底含量低，可能受东北和西南向往复水流影响，将养殖残饵或者代谢废物带出了马袅湾。马袅湾表层沉积物TN、TP、TOC含量随养殖区距离变化拟合结果较为类似，在距养殖区(A区)0～1 km的范围内TN、TP、TOC含量增加；而在距离网箱养殖区1～3 km的空间范围内开始降低。由此，马袅湾网箱养殖对表层沉积物TN、TP、TOC影响范围约为1 km。

关键词：马袅湾网箱养殖营养盐有机碳扩散范围

Shwachman-Diamond综合征7例患儿临床特点和基因变异分析

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临床儿科杂志 2024年第3期42卷 230-237页

作者：王瑞芳梁黎黎张开创杨奕孙宇宁孙曼青肖冰韩连书张惠文顾学范余永国邱文娟上海交通大学医学院附属新华医院、上海市儿科医学研究所儿内分泌遗传代谢科上海200092

目的探讨Shwachman-Diamond综合征(SDS)患儿的临床表型和基因变异特点。方法选取2018年1月至2023年9月于儿内分泌遗传科长期随访的7例SDS患儿,收集其临床资料,采集外周血样进行外显子组测序(ES)分析,并通过Sanger测序对变异位点进行... 详细信息

目的探讨Shwachman-Diamond综合征(SDS)患儿的临床表型和基因变异特点。方法选取2018年1月至2023年9月于儿内分泌遗传科长期随访的7例SDS患儿,收集其临床资料,采集外周血样进行外显子组测序(ES)分析,并通过Sanger测序对变异位点进行家系验证。结果 7例SDS患儿中男3例、女4例,初诊中位年龄为3.0(0.9~4.0)岁,6例为SBDS基因缺陷,1例为EFL1基因缺陷。6例SBDS缺陷的患儿中,5例携带复合杂合突变,2例为c.258+2T>C/c. 183_184 delinsCT,1例为c. 258+2 T>C/c. 40 A>G,1例为c. 258+2 T>C/c. 184 A>T,1例为c. 258+2 T>C/第3外显子杂合缺失;余1例携带c.258+2T>C纯合突变。SBDS缺陷患儿以矮小(6/6,100%)伴慢性腹泻(3/6,50%)和反复呼吸道感染(1/6,16.7%)就诊,经检查发现6例(100%)均存在中性粒细胞减少和肝酶升高,4例有骨骼发育异常表现,3例有胰腺外分泌功能不全表现。1例EFL 1缺陷患儿携带复合杂合突变(c. 2260 C>T/c. 316 G>A),表现为矮小和骨骼发育异常,但无胰腺和血液系统受累。结论 SBDS缺陷患儿具有异质性的临床表型,以上发现丰富了中国SDS的表型谱和变异谱,并首次在中国人群中报道了1例EFL1变异患儿的临床特征。对矮小合并中性粒细胞减少、胰腺外分泌功能障碍、骨骼畸形等症状的患儿,应完善基因检测以免漏诊SDS。

关键词： Shwachman-Diamond综合征 SBDS基因 EFL1基因基因变异

日本血吸虫感染小鼠慢性致病阶段肝脏中差异表达长非编码RNA筛选及功能分析

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第2期36卷 137-147页

作者：李银龙李琴林伟娜冯婷秦志强曹淳力李石柱许静传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)、国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室、WHO热带病合作中心、科技部国家级热带病国际联合研究中心上海200025 上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院上海200025

目的筛选日本血吸虫感染小鼠慢性致病阶段肝脏中差异表达长非编码RNA(long non-coding RNA, lnc RNA)并进行功能分析,为探索lnc RNA在日本血吸虫感染所致肝脏病变中的作用提供参考。方法 20只6周龄C57BL/6小鼠随机分为2组,每组10只。... 详细信息

目的筛选日本血吸虫感染小鼠慢性致病阶段肝脏中差异表达长非编码RNA(long non-coding RNA, lnc RNA)并进行功能分析,为探索lnc RNA在日本血吸虫感染所致肝脏病变中的作用提供参考。方法 20只6周龄C57BL/6小鼠随机分为2组,每组10只。实验组每只小鼠采用腹部贴片法感染(15±2)条日本血吸虫尾蚴建立日本血吸虫慢性感染小鼠模型,以蒸馏水作为对照组。两组小鼠均于感染70 d后剖杀,获取小鼠肝脏组织样本,进行RNA抽提及文库构建。通过Illumina Nova Seq 6000测序平台对文库进行测序,采用fastp软件进行数据清洗,使用HISAT2软件进行参考基因组比对及基因表达量(FPKM)计算。采用CNIC、CPC、Pfam、PLEK软件对潜在lnc RNA序列进行编码潜能预测,筛选出潜在lnc RNA。采用DESeq2软件进行基因差异表达分析,筛选出差异表达lnc RNA。通过基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,挖掘差异表达lnc RNA靶基因参与的生物学过程和代谢途径。结果共筛选出333个潜在lnc RNA,67个鉴定为差异表达lnc RNA,其中49个表达上调、18个表达下调。差异表达lnc RNA预测靶基因共53个,GO富集分析显示这些靶基因主要富集在生物学过程和分子功能;其中Sema7a、Arrb1、Ccl21b等基因可能是细胞外调节蛋白激酶1(extracellular regulated protein kinase,ERK1)和ERK2级联正调控生物学过程的关键靶基因,可能参与调控胶原蛋白表达。KEGG富集分析显示,差异表达lnc RNA靶基因主要参与细胞因子-细胞因子受体相互作用、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用、趋化因子信号通路和核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)通路等信号通路。结论本研究鉴定了日本血吸虫感染小鼠慢性致病阶段肝脏中差异表达lnc RNA及其靶基因的功能富集,其中上调表达的lnc RNA可能通过调控Sema7a、Arrb1、Ccl21b等靶基因影响ERK1/2级联等生物学过程以及趋化因子信号通路等,影响胶原蛋白表达及炎症相关信号通路,从而影响肝脏病变发展。

关键词：日本血吸虫长非编码RNA 肝纤维化细胞外调节蛋白激酶小鼠

中药治疗盆腔炎性疾病后遗症作用机制研究进展

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世界科学技术-中医药现代化 2024年

作者：程力唐潇冉何成瑶袁琴赵超胡成凤贵州中医药大学第二临床医学院贵州师范大学天然药物质量控制研究中心

目的研究单味中药及复方治疗盆腔炎性疾病后遗症的作用机制。方法对Pubmed、Web of Science、中国知网和万方等数据库进行检索，寻找建库至2023年3月以来关于中药治疗SPID及作用机制的相关文献，并对文献进行归纳整理。结果共纳入文... 详细信息

目的研究单味中药及复方治疗盆腔炎性疾病后遗症的作用机制。方法对Pubmed、Web of Science、中国知网和万方等数据库进行检索，寻找建库至2023年3月以来关于中药治疗SPID及作用机制的相关文献，并对文献进行归纳整理。结果共纳入文献428篇，从纳入文献中筛选出从调节细胞因子和炎症介质分泌水平、促进炎症细胞凋亡、抑制脂质过氧化、抑制组织纤维化、改善血液循环、调节代谢途径和细胞信号转导、调节免疫能力等方面报道单味中药及复方治疗盆腔炎性疾病的作用机制。结论为中药治疗盆腔炎性疾病后遗症作用机制进行深入研究，并对其新药研发提供参考。

关键词：盆腔炎性疾病后遗症中药作用机制

基于HPLC-Q-TOF-MS/MS和网络药理学的补肺丸入血成分、肺病治疗潜能及新型冠状病毒感染恢复期的应用机制研究

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中国中药杂志 2024年

作者：杨丽李孟莹胡文青翁小刚练晓梅张美玉闫寒彭娟孙健中国中医科学院医学实验中心沈阳药科大学中国中医科学院中药研究所黑龙江中医药大学

该研究基于血清化学、药物体内分布、网络药理学等方法探讨补肺丸在肺系疾病的应用功能，并挖掘潜在的药理学功能。大鼠灌胃给药补肺丸后，通过HPLC-Q-TOF-MS/MS研究补肺丸体内成分，比较复方提取物、给药后含药血清、组织样本及空白样... 详细信息

该研究基于血清化学、药物体内分布、网络药理学等方法探讨补肺丸在肺系疾病的应用功能，并挖掘潜在的药理学功能。大鼠灌胃给药补肺丸后，通过HPLC-Q-TOF-MS/MS研究补肺丸体内成分，比较复方提取物、给药后含药血清、组织样本及空白样本，从大鼠血清中发现入血成分共56个，其中首次发现neocyclomorusin、asterinin A、neoisostegane、goimisin R、frehmaglutoside H等成分可以经口服吸收入血，相关成分还可分布于心、肝、脾、肺、肾、脑脊液、胰腺不同脏器。经网络药理学分析，发现ALB、IL6、AKT1、TNF、EGFR、ESR1、JUN、HSP90AA1等81个核心靶点，参与PI3K-Akt、MAPK、VEGFA、AGE-RAGE等信号通路。补肺丸可能通过介导靶点通路的参与抑制炎症反应、氧化应激、影响代谢、调节免疫功能等机制，干预DO富集的慢性阻塞性肺病、肺纤维化、肺炎等主要的肺部疾病，以及慢性阻塞性肺病并发症，如糖尿病、肾病、抑郁等，及新型冠状病毒感染恢复期气短乏力、身体疼痛等表型，相关活性具有开发价值，有待进一步研究。

关键词：补肺丸体内成分 HPLC-Q-TOF-MS/MS 网络药理学肺病治疗潜能新型冠状病毒感染恢复期