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放线菌酮抑制转化生长因子-β1诱导的小鼠肝细胞的凋亡(英文)

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Acta Pharmacologica Sinica 2001年第2期22卷 84-90页

作者：廖劲晖周兵红柴敏强宋建国中国科学院上海生物化学研究所分子生物学重点实验室中国科学院上海生物化学研究所分子生物学重点实验室上海中国 200031

目的:研究TGF-β1诱导细胞凋亡的机制。方法:采用DNA片段化和荧光染色方法对TGF-β1诱导的细胞凋亡进行定性观察,结晶紫染色方法定量检测TGFβ1的细胞存活率,免疫印迹方法检测Tak1、p53和Bax的蛋白水平,用荧光素酶报告基因的方法测定TGF... 详细信息

目的:研究TGF-β1诱导细胞凋亡的机制。方法:采用DNA片段化和荧光染色方法对TGF-β1诱导的细胞凋亡进行定性观察,结晶紫染色方法定量检测TGFβ1的细胞存活率,免疫印迹方法检测Tak1、p53和Bax的蛋白水平,用荧光素酶报告基因的方法测定TGF-β1诱导的基因表达,采用薄层层析方法检测脂类信号分子神经酰胺的水平。结果:IGF-β1诱导AML12小鼠肝细胞出现典型的细胞凋亡变化,包括DNA片段化,细胞核的固缩、碎裂。放线菌酮下调了Tak1的水平以及TGF-β1诱导的PAI-1表达。TGF-β1能够诱导p53表达,但不诱导Bax表达。TGF-β1诱导的细胞凋亡过程中未见神经酰胶水平的升高。结论:TGF-β1诱导的细胞凋亡需要TGF-β1诱导的基因表达。

关键词：转化生长因子β 细胞凋亡放线菌酮神经酰胺类

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毛发的梯度成熟实验对化石毛发的埋藏学启示

中国科学:地球科学 2025年第1期 62-74页

作者：李鑫周一擘赵涛何行健泮燕红南京大学内生金属矿床成矿机制研究国家重点实验室关键地球物质循环前沿科学中心生物演化与环境科教融合中心地球科学与工程学院云南大学古生物研究院云南省地球系统科学重点实验室云南省古生物学重点实验室

哺乳动物毛发作为与内温性、物理保护和伪装相关的关键特征,其地质历史记录可追溯至中生代.然而,关于毛发化石埋藏学的认识有限,阻碍了对其深时演化意义的理解.为此,我们对黑色毛发样品开展了梯度成熟实验来模拟化石毛发的埋藏过程.通... 详细信息

哺乳动物毛发作为与内温性、物理保护和伪装相关的关键特征,其地质历史记录可追溯至中生代.然而,关于毛发化石埋藏学的认识有限,阻碍了对其深时演化意义的理解.为此,我们对黑色毛发样品开展了梯度成熟实验来模拟化石毛发的埋藏过程.通过扫描电子显微镜、傅里叶变换红外光谱(FTIR)和拉曼光谱技术记录了模拟过程中毛发的形态结构、微观特征和化学成分的变化.结果表明,毛发的形态在温度达到150～175℃时就出现了损伤,在更高温度(200℃)下,毛发的形态完全丢失转变为流体状物质.但是毛发中黑素体的形态结构则具有更高的保存潜力,其微观结构也更稳定.拉曼光谱和FTIR光谱显示,随着温度升高,黑色素和角蛋白的特征峰发生了变化.尽管化学信号并未完全丧失,但FTIR光谱中酰胺特征峰的变化表明,角蛋白在高温(>200℃)下严重降解,而拉曼光谱中的黑色素特征峰则在高温下仍可被识别.这些结果通过主成分分析(PCA)和主成分分析-线性判别分析(PCA-LDA)得到了进一步的验证.此外,所有毛发样品在模拟实验中的拉曼信号均可与常见的地质碳质材料(腐殖酸)信号相区分,这表明拉曼光谱可用于检测化石中的黑色素.

关键词：哺乳动物毛发黑色素角蛋白化石化模拟埋藏

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单胺氧化酶

生物化学与生物物理进展 2000年第5期27卷 504-508页

作者：陈剑峰王恩多中国科学院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验上海200031

单胺氧化酶 (monoamineoxidase,MAO)是生物体内一种十分重要的酶 ,它在大脑和周围神经组织中催化一些生物体产生的胺 ,氧化脱氨产生过氧化氢 (H2 O2 ) .单胺氧化酶A和B基因的克隆清楚地证明了这些酶是由不同的多肽组成的 .单胺氧化酶A和... 详细信息

单胺氧化酶 (monoamineoxidase,MAO)是生物体内一种十分重要的酶 ,它在大脑和周围神经组织中催化一些生物体产生的胺 ,氧化脱氨产生过氧化氢 (H2 O2 ) .单胺氧化酶A和B基因的克隆清楚地证明了这些酶是由不同的多肽组成的 .单胺氧化酶A和B的基因定位于X染色体 (Xp11 2 3) ,都由 15个外显子组成 ,而且它们的内含子外显子组织是完全一致的 .这些事实表明单胺氧化酶A和B的基因很可能从同一个祖先进化而来 .单胺氧化酶A和B具有不同的底物和抑制剂专一性 ,在生物神经递质代谢和行为方面具有不同的作用 .

关键词：单胺氧化酶神经递质行为疾病分布基因

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胆碱脱氢酶的变性及其构象研究

Acta Biochimica et Biophysica Sinica 1997年第1期29卷 82-87页

作者：傅晓红蔡澎林其谁中国科学院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室中国科学院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室 200031

增溶胆碱脱氢酶（CDH）在较低的pH条件下易于失活,底物胆碱的存在有助于提高其pH稳定性。热变性酶蛋白分子中β结构所占比例上升,α螺旋结构比例下降,其中β结构的变化主要来自于β回折和310螺旋的贡献,底物对CDH的热变性具有一定的保... 详细信息

增溶胆碱脱氢酶（CDH）在较低的pH条件下易于失活,底物胆碱的存在有助于提高其pH稳定性。热变性酶蛋白分子中β结构所占比例上升,α螺旋结构比例下降,其中β结构的变化主要来自于β回折和310螺旋的贡献,底物对CDH的热变性具有一定的保护作用。在完全SDS变性和有底物保护的蛋白质分子中310螺旋的比例分别为33%和31.2%,β回折比例分别为29%和10.6%,此外在α螺旋、无规卷曲等所占的比例方面,在底物保护下经变性处理的CDH蛋白的构象都与天然胆碱脱氢酶相近。

关键词：胆碱脱氢酶胆碱变性构象

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脱脂蛋白A-Ⅰ模型多肽与脂质体的相互作用

Acta Biochimica et Biophysica Sinica 1997年第1期29卷 8-16页

作者：王庆达崔大敷林其谁中国科学院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室中国科学院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室 200031

根据脱脂蛋白的脂结合区序列合成了2个两亲性多肽Ampl和Amp2,Amp2以缬氨酸残基取代了Ampl第4位的赖氨酸残基。内源荧光光谱、包埋钙氯黄素的脂质体的渗漏、碘化物和丙烯酰胺对多肽色氨酸残基的淬灭、圆二色谱以及用自旋标记的磷脂测定... 详细信息

根据脱脂蛋白的脂结合区序列合成了2个两亲性多肽Ampl和Amp2,Amp2以缬氨酸残基取代了Ampl第4位的赖氨酸残基。内源荧光光谱、包埋钙氯黄素的脂质体的渗漏、碘化物和丙烯酰胺对多肽色氨酸残基的淬灭、圆二色谱以及用自旋标记的磷脂测定多肽色氨酸残基的插膜深度等研究均表明,Ampl与脂双层的作用强于Amp2,推测A类两亲性α螺旋以长轴平行于膜平面的方式埋膜,而且两亲性多肽亲水/疏水界面上的带正电残基与脂双层中带负电的磷脂头的静电作用对多肽与磷脂的亲和力有重要意义。

关键词：两亲性多肽脂质体多肽-磷脂相互作用脱脂蛋白

马里亚纳海沟深渊微生物胞外酶的保压酶活性特征

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中国科学:地球科学 2025年第1期 184-193页

作者：曹军伟王佳华张宏鸽邓俊豪潘彬彬陈家旺张利方家松上海海洋大学海洋科学与生态环境学院浙江大学海洋学院海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室

微生物胞外酶在海洋有机物的转化和矿化过程中起着至关重要的作用.然而,传统上在常压条件下测定的深海微生物胞外酶活性(Microbial ectoenzyme activities, MEAs)并不能准确反映土著微生物群落的代谢活性.为了解决这一局限性,本研究对... 详细信息

微生物胞外酶在海洋有机物的转化和矿化过程中起着至关重要的作用.然而,传统上在常压条件下测定的深海微生物胞外酶活性(Microbial ectoenzyme activities, MEAs)并不能准确反映土著微生物群落的代谢活性.为了解决这一局限性,本研究对比分析了马里亚纳海沟挑战者深渊保压和非保压海水样品中3种微生物胞外酶(氨肽酶、α-葡萄糖苷酶和β-葡萄糖苷酶)在常压和原位压力条件下的酶活性.结果显示,表层海水(50m)中氨肽酶和α-葡萄糖苷酶的保压酶活性(isobaric MEAs)最高,深海(4,000～6,000m)氨肽酶和深渊(10,903m) α-葡萄糖苷酶的保压酶活性次之,然而β-葡萄糖苷酶的保压酶活性最高值出现在深渊(10,903m).此外,深渊海水的保压酶活性通常比相应的释压酶活性(decompressed MEAs)高,这一结果突显了保压采样和保压酶活性测定的重要性.随着深度的增加,半饱和常数(Km)总体呈下降趋势,表明深海微生物可能通过增强其胞外酶对底物的亲和力来适应高压和寡营养环境.另外,与颗粒物附着胞外酶活性相比,非颗粒物附着胞外酶活性对深海总酶活性的贡献更为显著,这表明细胞附着性和溶解性胞外酶在海洋生态系统中起着重要作用.本研究为全面理解海洋微生物胞外酶活性提供了重要研究基础,有利于深入理解微生物驱动的海洋生物地球化学循环过程.

关键词：保压采样微生物胞外酶活性深海微生物高压马里亚纳海沟

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绿色荧光蛋白

生物化学与生物物理进展 2000年第3期27卷 238-243页

作者：刘默芳王恩多中国科学院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室上海200031

来源于水母Aequoreavictoria的绿色荧光蛋白 ( greenfluorescentprotein ,GFP)现已成为在生物化学和细胞生物学中研究和开发应用得最广泛的蛋白质之一 .其内源荧光基团在受到紫外光或蓝光激发时 (λmax=395nm ,小峰在 4 79nm )可高效发... 详细信息

来源于水母Aequoreavictoria的绿色荧光蛋白 ( greenfluorescentprotein ,GFP)现已成为在生物化学和细胞生物学中研究和开发应用得最广泛的蛋白质之一 .其内源荧光基团在受到紫外光或蓝光激发时 (λmax=395nm ,小峰在 4 79nm )可高效发射清晰可见的绿光 .GFP的高分辨率晶体结构为了解和研究蛋白质结构和光谱学功能关系提供了一个极好的机会 .GFP已成为一个监测在完整细胞和组织内基因表达和蛋白质定位的理想标记 .通过突变和蛋白质工程构建的GFP嵌合蛋白在生理指示剂、生物传感器。

关键词：水母绿色荧光蛋白生色团变种报告分子

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基于自研光谱仪的痕量气体光解速率测量研究

光谱学与光谱分析 2025年第1期45卷 15-23页

作者：李浩然曾议朱磊窦科刘志宏常振江宇司福祺中国科学院合肥物质科学研究院安徽光学精密机械研究所环境科学与技术重点实验室安徽合肥230031 中国科学技术大学科学岛分院安徽合肥230026 合肥大学生物食品与环境学院安徽合肥230601

光解速率及其测量技术最早由德国科学家提出,21世纪初Metcon公司开发了光解速率测量仪,该技术在国内得到关注,部分高校和公司对光解速率测量系统开展了研究和开发。国外产品一般体积较大,价格昂贵。国内产品中光谱仪、接收器等核心器件... 详细信息

光解速率及其测量技术最早由德国科学家提出,21世纪初Metcon公司开发了光解速率测量仪,该技术在国内得到关注,部分高校和公司对光解速率测量系统开展了研究和开发。国外产品一般体积较大,价格昂贵。国内产品中光谱仪、接收器等核心器件仍依赖于国外进口,易受国外技术封锁影响。在我国“十四五”国家重点研发计划中“大气与土壤、地下水污染综合治理”重点专项对化学气候综合站检测技术与装备需求引导下,研制了测量大气物质光解速率的光谱仪系统,并满足其核心部件国产化的要求。系统采用自主设计的小型光谱仪作为核心部件,配合各向均匀响应的光学接收器,经实验室光学定标后测得各种物质的光解速率。该系统工作波段为285~430 nm,时间分辨率可达0.1 s,可测物质包括NO_(2)、HONO、HCHO、H_(2)O_(2)等,与国外进口测量仪器对比,各气体物质光解速率的测量误差小于5%,相关性均超过0.93。采用该系统在合肥市董铺岛对大气中气体光解速率开展了长时间的连续监测。对NO_(2)光解速率变化趋势以及NO_(2)光解速率与浓度间的相关性进行分析,发现光解反应与驱动光化反应的能量密切相关,晴天的光解速率数值明显高于阴天与雨天。发现NO_(2)光解速率与浓度的积分曲线间存在一种经验公式,相关性大于0.9,可通过测量NO_(2)光解速率对NO_(2)浓度的累积量进行估计。该系统实现了核心部件的国产化,整体结构简单、便携,方便外场试验安装的同时,降低成本,提高经济性。研究为大气污染综合监测治理提供数据支撑,对各地区的环境监测及污染预防具有参考意义。

关键词：光解速率光谱仪辐亮度光学接收器

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应用定点突变与分子模建方法研究蛋白酶抑制剂eglin C突变体对蛋白酶furin和kexin的抑制活力(英文)

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生物化学与生物物理学报 2001年第6期33卷 591-599页

作者：费浩罗明娟叶玉珍丁达夫戚正武中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所分子生物学国家重点实验室中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所分?

蛋白质前体加工酶参与许多重要蛋白质前体的加工成熟过程 ,哺乳动物来源的furin和酵母中的kexin是该家族的重要成员。首先人工合成了编码枯草杆菌蛋白酶抑制剂eglinC的基因片段 ,组装后在大肠杆菌中得到表达。以定点突变方法在野生型egl... 详细信息

蛋白质前体加工酶参与许多重要蛋白质前体的加工成熟过程 ,哺乳动物来源的furin和酵母中的kexin是该家族的重要成员。首先人工合成了编码枯草杆菌蛋白酶抑制剂eglinC的基因片段 ,组装后在大肠杆菌中得到表达。以定点突变方法在野生型eglinC抑制活性中心的P1、P2 和P4 位引入碱性氨基酸残基可以将其改造为很强的furin抑制剂 (Ki约 10 -9mol/L) ,和kexin抑制剂 (Ki 约 10 -11mol/L)。同时根据枯草杆菌蛋白酶和eglinC复合物的晶体结构 ,计算机同源模建了前体加工酶与eglinC突变体结构之间的相互作用 ,并结合实验数据得到以下结果 :(1)P1位引入的碱性残基是该抑制剂活力的前提 ;(2 )P4 位碱性残基的引入可以极大地提高抑制剂活力约两个数量级 ;(3)P2 位的碱性残基将有效提高抑制剂的活力 ,然而同时可以破坏抑制剂本身的稳定性 ;(4 )野生型P3 位的疏水性残基参与抑制剂活性环附近疏水核心的构成。

关键词：蛋白质前体加工酶蛋白酶抑制剂定点突变分子模建