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2017-2019年我国炭疽流行特征及炭疽芽胞杆菌分子分型分析

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中华预防医学杂志 2022年第4期56卷 422-426页

作者：张恩民张慧娟贺金荣李伟魏建春中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的探讨2017—2019年我国炭疽流行特征及发病规律,对部分省份(自治区)的炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。方法收集中国疾病预防控制传染病监测信息系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统中2017—2019年报告的炭疽发病资料,采用描述性... 详细信息

目的探讨2017—2019年我国炭疽流行特征及发病规律,对部分省份(自治区)的炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。方法收集中国疾病预防控制传染病监测信息系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统中2017—2019年报告的炭疽发病资料,采用描述性流行病学方法分析流行特征和时间、地区及人群分布情况;以2017—2019年分离的47株炭疽芽胞杆菌作为研究对象,应用经典单核苷酸多态性分析(canSNP)和15个位点的可变数量串联重复序列分析(MLVA15)方法对炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。结果2017—2019年共报告的炭疽病例数为951例,其中938例是皮肤炭疽,达到总报告数的98.63%,分布地区主要在我国西部和东北地区,累计病例数前三位的省份是甘肃(215例)、四川(202例)和青海(191例);全年均有病例报告,夏秋季发病较多,8月份达到发病高峰,2017—2019年的6至10月份发病数分别占全年发病数的66.35%(211/318)、72.32%(243/336)和68.01%(202/297);年龄范围分布主要在20~59岁,约占总病例数的80%以上;男性病例明显多于女性,男女性别比约为3∶1。职业以牧民和农民为主,牧民病例占当年全部报告发病数的49.70%~58.18%,农民病例占当年全部报告发病数的31.45%~36.70%。每年均有突发公共卫生事件报告,2017—2019年共报告29起突发公共卫生事件。canSNP分析显示,47株菌中有37株属于A.Br.001/002亚群,10株属于A.Br.Ames亚群。MLVA15分析显示,测试菌株可以分成17个基因型,其中有10个基因型只包括1株菌。结论我国2017—2019年炭疽主要以皮肤炭疽为主,有明显地区性、季节性和人群分布特征;canSNP和MLVA15等分子分型方法可以在传染病溯源工作中发挥作用,为炭疽的预防控制提供技术支持。

关键词：炭疽流行病学分子分型

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实验室监测在传染病预警中的应用及思考

中华预防医学杂志 2022年第4期56卷 401-404页

作者：周海健崔志刚阚飙中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

新型冠状病毒肺炎疫情的暴发流行,使全社会重新认识了传染病发生、流行及防控所面临的巨大挑战,即便是当前对传染病防范的认知、应对技术和社会经济条件已有历史上最好的基础。在传染病的监测预警中,研究和利用各类传染病发生与传播相... 详细信息

新型冠状病毒肺炎疫情的暴发流行,使全社会重新认识了传染病发生、流行及防控所面临的巨大挑战,即便是当前对传染病防范的认知、应对技术和社会经济条件已有历史上最好的基础。在传染病的监测预警中,研究和利用各类传染病发生与传播相关因素的数据,以期在传染病发生的早期甚至发生前识别疫情信号,成为传染病防控研究的重要命题。病原体是传染病发生的原因,所以以病原学为核心的实验室监测是传染病预警体系的重要组成部分。我国目前已经初步建成了基于国家致病菌识别网的细菌性传染病实验室监测预警系统,其核心是识别病原、识别暴发、识别来源,在鼠疫、霍乱、流脑等细菌性传染病的早期发现、溯源和精准防控中起到重要作用。本期重点号围绕实验室监测在细菌性传染病预警和防控中的作用,从流行和暴发菌株特征分析、与流行病学调查的联合应用、与常规病例监测体系的融合等方面开展研究,体现了实验室监测在传染病风险评估和疫情调查中的作用,同时对实验室监测预警技术及应用场景进行了综述和展望,以期为推动我国传染病监测预警体系的跨越发展提供新思维。

关键词：传染病病原学实验室监测预警

1950-2021年中国斑疹伤寒流行特征分析

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中华流行病学杂志 2023年第3期44卷 430-437页

作者：韩玲张云飞滕中秋阚飙秦天中国疾病预防控制中心传染病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的分析斑疹伤寒在我国的流行病学特征,探讨我国斑疹伤寒防控工作面临的问题及挑战和策略。方法资料来源于中国公共卫生科学数据中心传染病历史数据库和中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统1950-2021年斑疹伤寒报告数据,... 详细信息

目的分析斑疹伤寒在我国的流行病学特征,探讨我国斑疹伤寒防控工作面临的问题及挑战和策略。方法资料来源于中国公共卫生科学数据中心传染病历史数据库和中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统1950-2021年斑疹伤寒报告数据,采用描述性统计方法、Mann-Kendall检验和圆形分布法对斑疹伤寒的发病情况、死亡情况、病死率进行分析,研究我国斑疹伤寒流行的时间、空间、人群分布和诊断现状。结果1950-2021年,我国共报告斑疹伤寒发病数452965例,死亡数7339例,分别在20世纪50年代、60年代和80年代的14年中报告发病数均过万。20世纪90年代以来,斑疹伤寒发病数和发病率大幅降低,流行强度以散发为主,但安徽省、湖北省和湖南省报告发病数呈上升趋势。斑疹伤寒在全年均可发病,但可呈现一定的季节聚集性,我国斑疹伤寒的发病率高峰集中在夏、秋季,不同省份斑疹伤寒的月发病高峰从北方至南方逐渐向前推移。斑疹伤寒发病的男女性别比为1.01∶1(18529∶18366),近年来女性发病数逐渐超过男性;≤9岁人群发病数占比最大(18.9%),≥50岁人群发病数呈增加趋势;发病人群职业以农民为主,并呈逐年增加趋势,学生和散居儿童发病数占比也较大。斑疹伤寒病例从发病日期至诊断日期间隔时间的中位数为6 d,实验室确诊病例占比较低,检测方法为外斐反应为主。结论尽管我国斑疹伤寒流行态势整体好转,仍需警惕局部暴发的风险,其防控工作仍面临很多挑战,需加强斑疹伤寒病原体检测和监测能力建设。

关键词：斑疹伤寒立克次体流行病学特征

CVB3诱导Th17/Treg失衡导致小鼠病毒性胰腺炎

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中华实验和临床病毒学杂志 2023年第2期37卷 128-134页

作者：王瑞芳宗可鑫宋芹芹夏冬杜海军刘宓夏志强韩俊宋娟中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的构建CVB3诱导的小鼠胰腺炎模型,观察胰腺组织病理学损伤和浸润Th17/Treg细胞的占比变化。方法BALB/c小鼠腹腔注射CVB3构建急性病毒性胰腺炎模型,通过HE染色观察胰腺病理学改变;q-PCR检测胰腺组织病毒核酸载量和细胞因子(IFN-γ、IL-... 详细信息

目的构建CVB3诱导的小鼠胰腺炎模型,观察胰腺组织病理学损伤和浸润Th17/Treg细胞的占比变化。方法BALB/c小鼠腹腔注射CVB3构建急性病毒性胰腺炎模型,通过HE染色观察胰腺病理学改变;q-PCR检测胰腺组织病毒核酸载量和细胞因子(IFN-γ、IL-6和IL-17)mRNA的相对表达量;流式细胞术检测胰腺组织浸润细胞CD45+CD3+T细胞、CD4+和CD8+T细胞、Th17和Treg细胞占比。结果CVB3感染第3天胰腺组织病毒核酸载量为0.96±0.18,且随感染时间点推移而逐渐降低;与3dpi组相比,7dpi组胰腺组织病毒核酸载量有降低趋势(0.96±0.18 vs.0.62±0.14),但无统计学差异。胰腺组织炎症细胞浸润在7dpi后明显增加,损伤评分>2;浸润的Th17细胞(1.05±0.21 vs.22.13±5.79)和Treg细胞(3.11±0.78 vs.8.25±1.30)在CD4+T细胞中占比在感染后7天同时升高(P病毒性胰腺炎,胰腺组织浸润Th17/Treg及其相关细胞因子IL-6和IL-17上调,促进疾病进展。

关键词： CVB3 病毒性胰腺炎炎性浸润 Th17 Treg 细胞因子

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单染色体霍乱弧菌基因组学与生物学特征分析

中国预防医学杂志 2023年第6期24卷 587-593页

作者：蒋羽赵文轩宋敬东赵硕逄波阚飙中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

目的研究1株罕见的两条染色体融合为单染色体的霍乱弧菌菌株的基因组及其生物学特征,并与典型的具有两个染色体的霍乱弧菌进行比较。方法通过短读长和长读长测序相结合的方法测定及分析单染色体菌株VC6047的基因组特征,分析融合方式... 详细信息

目的研究1株罕见的两条染色体融合为单染色体的霍乱弧菌菌株的基因组及其生物学特征,并与典型的具有两个染色体的霍乱弧菌进行比较。方法通过短读长和长读长测序相结合的方法测定及分析单染色体菌株VC6047的基因组特征,分析融合方式。通过透射电镜观察菌体形态,观察不同培养温度、pH值、盐浓度和M9以及LB培养基下菌株的生长状况,分析生物膜形成能力以及进入活的非可培养状态(viable but non-culturable, VBNC)的生物学特征。结果菌株VC6047呈现典型的弧菌特征,染色体的融合位置对应于霍乱弧菌大、小染色体的att B位点(染色体附着位点),也是霍乱弧菌丝状溶源性噬菌体CTXΦ整合的位置。该菌株与第七次大流行菌株处于不同进化分支。培养18 h后,25℃LB培养基条件下以及在37℃,4.0%和5.0%盐浓度LB培养基中菌株VC6047生长高于对比菌株。菌株VC6047仍然具有生物膜形成能力,但相比较于其基因组高度同源的,仍为两个染色体的菌株,菌株VC6047进入VBNC的速率加快,冷适应能力有所降低。结论大小染色体融合菌株仍基本保持应对优劣环境压力的能力,但发生了一些环境压力适应变化,为菌株染色体融合可能的促成压力研究和微环境适应提供了基础认识。

关键词：霍乱弧菌染色体融合生长 attB位点

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医学病毒形态识别中的假象

电子显微学报 2023年第3期42卷 386-399页

作者：宋敬东中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京100052

基于透射电子显微镜负染技术和超薄切片技术的病毒形态识别是病毒鉴定的重要手段,病毒的形态识别在病毒相关的科研工作及重大疫情、生物恐怖事件的病原体鉴定中均发挥重要的作用。但是,无论负染样本中还是超薄切片上有时存在类似病毒结... 详细信息

基于透射电子显微镜负染技术和超薄切片技术的病毒形态识别是病毒鉴定的重要手段,病毒的形态识别在病毒相关的科研工作及重大疫情、生物恐怖事件的病原体鉴定中均发挥重要的作用。但是,无论负染样本中还是超薄切片上有时存在类似病毒结构的假象,往往导致误判。本文对负染样本、超薄切片样本中常见的医学病毒类似结构的假象结构进行列举,包括噬菌体、球形杂质颗粒、线粒体成分、支原体、网格蛋白及非网格蛋白包被囊泡、多泡体、高尔基体运输囊泡、糖原颗粒、微管、染色质周围颗粒、核孔、微绒毛、分泌泡和胶原原纤维等结构,期望为医学病毒形态判定提供一定的思路。

关键词：透射电子显微镜技术医学病毒形态假象鉴别

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F磁珠对血液样本中EB病毒的富集方法

中华实验和临床病毒学杂志 2023年第5期37卷 537-542页

作者：郑皓卢金星陈小萍中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的设计表达一种全新的重组蛋白(重组Ficolin-2蛋白,F蛋白)并包被磁珠,实现多种抗凝血中EB病毒的富集效果。方法通过体外基因合成重组F蛋白基因片段,该片段包括人IL-2信号肽、his标签、人IgG1 Fc、人Ficolin-2颈区及纤维蛋白原样区域(f... 详细信息

目的设计表达一种全新的重组蛋白(重组Ficolin-2蛋白,F蛋白)并包被磁珠,实现多种抗凝血中EB病毒的富集效果。方法通过体外基因合成重组F蛋白基因片段,该片段包括人IL-2信号肽、his标签、人IgG1 Fc、人Ficolin-2颈区及纤维蛋白原样区域(fibrinogen-like domain,FGD);并整合进表达质粒pCDNA^(TM)3.1(+)载体中,通过转染HEK293F细胞,实现上清中的分泌表达;通过镍柱纯化蛋白后包被到蛋白A磁珠上构建F磁珠;最后,收集三种不同抗凝剂(分别为ETDA、肝素、柠檬酸钠)抗凝的临床EB病毒血样本,并且比较了F磁珠和课题组前期开发的重组甘露聚糖结合凝集素磁珠(M磁珠)对三种抗凝剂抗凝血液中EB病毒富集的效果。结果M磁珠对肝素和柠檬酸钠抗凝血液中EB病毒富集效果均较好(P病毒没有富集作用;而F磁珠对三种抗凝血中EB病毒的富集效果均较好(P病毒的富集作用。

关键词： F磁珠 EB病毒检测 M磁珠

2020年中国克–雅病监测网络病例特征分析

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疾病监测 2022年第2期37卷 159-166页

作者：高利萍肖康周伟王园董小平石琦中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的了解2020年中国克–雅病(CJD)的发病情况、流行病学及临床特征。方法对2020年我国CJD监测网络获得的可疑CJD病例的临床及流行病学资料进行分析,并收集患者的血液及脑脊液,提取全血基因组DNA并利用聚合酶链式反应及测序方法对朊蛋... 详细信息

目的了解2020年中国克–雅病(CJD)的发病情况、流行病学及临床特征。方法对2020年我国CJD监测网络获得的可疑CJD病例的临床及流行病学资料进行分析,并收集患者的血液及脑脊液,提取全血基因组DNA并利用聚合酶链式反应及测序方法对朊蛋白基因(PRNP)129位及219位氨基酸多态性进行分析,Western Blot检测脑脊液中14-3-3蛋白。结果 2020年共监测病例458例,其中散发型CJD临床诊断病例179例(39.08%),疑似诊断病例12例(2.62%),遗传型CJD病例18例(3.93%),吉斯特曼–施特劳斯综合征(GSS)1例(0.22%)。病例报告无季节聚集性,长久居住地呈散在分布,职业分布无聚集性。临床诊断病例年龄中位数为63.14(43,87)岁,男女性别比为0.97∶1;疑似诊断病例年龄中位数为68.08(54,77)岁,男女性别比为1∶1。快速进行性痴呆为最常见的首发症状。脑脊液14-3-3蛋白、脑电图以及头颅磁共振成像3项检测结果中,出现阳性结果越多的病例典型症状也较多。对439份血液样品进行PRNP检测,其中129位氨基酸为M/M纯合子的434例,M/V杂合子的3例,V/V纯合子的2例;219位氨基酸为E/E纯合子的435例,E/K纯合子的4例。结论 2020年我国监测到的CJD病例的报告时间、长久居住地分布、职业、性别比例以及年龄分布均符合CJD的发病特点。

关键词：克–雅病监测 14-3-3蛋白朊蛋白基因

2019年中国克–雅病监测网络病例特征分析

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疾病监测 2022年第2期37卷 185-190页

作者：肖康周伟王园董小平石琦中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的了解2019年中国克–雅病(CJD)监测网络中12个省(自治区、直辖市)的发病情况、流行病学和临床特征。方法对我国CJD监测网络获得的可疑CJD病例的临床及流行病学资料进行分析,收集患者脑脊液及血液样品,采用Western blot检测脑脊液中... 详细信息

目的了解2019年中国克–雅病(CJD)监测网络中12个省(自治区、直辖市)的发病情况、流行病学和临床特征。方法对我国CJD监测网络获得的可疑CJD病例的临床及流行病学资料进行分析,收集患者脑脊液及血液样品,采用Western blot检测脑脊液中14-3-3蛋白,提取全血基因组DNA并利用聚合酶链式反应(PCR)及测序方法对朊蛋白基因(PRNP)进行129位和219位氨基酸多态性及基因突变的分析。结果 2019年共监测CJD病例520例,其中临床诊断病例190例(36.54%),疑似诊断病例8例(1.54%),遗传型病例25例(4.81%),致死性家族型失眠症5例(0.96%),格斯特曼综合征(GSS)1例(0.19%)。病例报告无季节聚集性,长久居住地呈散在分布,职业分布广泛。确诊诊断和临床诊断病例年龄中位数为63(40, 84)岁,男女性别比为0.96∶1;疑似诊断病例年龄中位数为64.5(45, 76)岁,男女性别比例为1∶1。快速进行性痴呆为最常见的首发症状。508份血液样品PRNP的检测结果显示,其中491份129位氨基酸为M/M纯合子,497份219位氨基酸为E/E纯合子。结论 2019年我国监测到的CJD病例的报告时间、长久居住地、职业、性别比例以及年龄分布均符合散发型克–雅病的发病特点。

关键词：克–雅病监测 14-3-3蛋白朊蛋白基因头颅磁共振成像