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CRISPR/Cas系统在寄生虫基因编辑与核酸检测中的应用进展

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第3期36卷 314-320页

作者：闫书宁杨硕杨汉银辛怡徐斌胡薇卢艳郑彬中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心) 国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室WHO热带病合作中心科技部国家级热带病国际联合研究中心上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院

成簇规律间隔短回文重复序列（clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR）及其相关蛋白（CRISPR-associated protein,Cas）系统（CRISPR/Cas系统）为具有规律簇状短回文重复序列结构的适应性免疫系统，能干扰外源性核酸，保护原核生物免受外部侵害，是一种有效的基因编辑及核酸检测工具。CRISPR/Cas系统在病毒和细菌领域应用广泛，但在寄生虫病领域研究相对较少。本文分类探讨了CRISPR/Cas系统的作用机制，全面综述了其在寄生虫基因编辑与核酸检测中的应用，旨在为未来寄生虫病相关研究提供参考。

关键词： CRISPR/Cas系统寄生虫病基因编辑核酸检测

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2023年全国血吸虫病防治进展

中国血吸虫病防治杂志 2024年第3期36卷 221-227页

作者：张利娟何君逸杨帆党辉李银龙郭苏影李仕祯曹淳力许静李石柱传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室WHO热带病合作中心科技部国家级热带病国际联合研究中心

为了解全国血吸虫病消除工作进展、总结防治经验及存在的问题，本文对2023年全国血吸虫病疫情和监测结果进行了概括分析。截至2023年底，上海、浙江、福建、广东、广西等5个省（直辖市、自治区）继续维持血吸虫病消除状态，四川、江苏... 详细信息

为了解全国血吸虫病消除工作进展、总结防治经验及存在的问题，本文对2023年全国血吸虫病疫情和监测结果进行了概括分析。截至2023年底，上海、浙江、福建、广东、广西等5个省（直辖市、自治区）继续维持血吸虫病消除状态，四川、江苏省继续维持传播阻断标准，云南、湖北省于2020年达到传播阻断标准，安徽、江西、湖南省于2023年新达到传播阻断标准。2023年，全国共有451个血吸虫病流行县（市、区）、26 250个流行村，流行村总人口7 303.45万人；451个流行县（市、区）中，354个（78.49%）已达到血吸虫病消除标准、97个（21.51%）已达到传播阻断标准。2023年全国共开展居民血吸虫病免疫学检查4 216 643例，阳性47 794例；开展病原学检查184 216例，阳性4例；全国尚存晚期血吸虫病患者27 768例。2023年全国血吸虫病流行村现有存栏牛539 548头，累计开展免疫学检查查病125 440头，阳性124头；病原学检查查病133 508头，未发现阳性。全国累计开展钉螺调查641 339.53 hm2，查出有螺面积184 819.77 hm2，其中新发现有螺面积51.53 hm2、复现有螺面积642.25 hm2。2023年，全国累计治疗血吸虫病患者20 198例，人群病原学扩大治疗598 183例·次，牛病原学扩大治疗283 954头·次；全国累计开展药物灭螺116 347.95 hm2，实际药物灭螺65 690.89 hm2，环境改造灭螺1 334.62 hm2。2023年，全国血吸虫病监测结果显示人、畜血吸虫感染率均为0，未发现感染性钉螺。疫情数据分析显示，2023年全国所有流行省份均达到血吸虫病传播阻断标准、疫情趋于稳定，血吸虫病病例以晚期病例为主；但钉螺面积居高不下，部分地区牛复养现象严重。需继续加强血吸虫病监测预警，做好重点地区钉螺控制工作。

关键词：血吸虫病疫情消除监测中国

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我国血吸虫病防治机构能力建设现状调查

中国血吸虫病防治杂志 2024年第1期36卷 67-73页

作者：何君逸李仕祯邓王平曹淳力李石柱许静中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)、国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室、who热带病合作中心、科技部国家级热带病国际联合研究中心上海200025 上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院

目的了解我国血吸虫病流行省(直辖市、自治区)血吸虫病防治机构能力建设现状。方法2023年5-6月,通过专家研讨及现场访谈、实地走访等方式了解各类血吸虫病防治机构职责任务和建设要求,设计血吸虫病防治能力维持和巩固专题调查问卷。采... 详细信息

目的了解我国血吸虫病流行省(直辖市、自治区)血吸虫病防治机构能力建设现状。方法2023年5-6月,通过专家研讨及现场访谈、实地走访等方式了解各类血吸虫病防治机构职责任务和建设要求,设计血吸虫病防治能力维持和巩固专题调查问卷。采用问卷星APP对我国承担血吸虫病防治和监测任务的县级、市级及省级卫生机构开展线上问卷调查,分析我国血吸虫病防治机构分布、血吸虫病防治任务承担机构、部门和员工数量及血吸虫病防治科研转化情况;以通过中国合格评定国家认可委员会(China National Accreditation Service for Conformity Assessment,CNAS)认可为实验室有能力开展相应检测工作,分析血吸虫病防治机构检测能力水平。结果累计收到我国12个血吸虫病流行省(直辖市、自治区)的486家血吸虫病防治机构的有效问卷,其中2.5%(12/486)为省级机构、15.8%(77/486)为市级机构、81.7%(397/486)为县级机构;77.4%(376/486)为疾病预防控制中心或公共卫生中心,21.0%(102/486)为血吸虫病、地方病或寄生虫病防治专业机构,1.6%(8/486)为医院、卫生院或其他。486家血吸虫病防治机构共有在职员工37713人,其中血吸虫病防治相关员工5675人。省、市、县级机构血吸虫病防治相关员工数占机构在职总人数的比例分别为5.9%(231/3897)、5.5%(566/10134)和20.6%(4878/23682)。累计有专职血吸虫病防治员工3826名,其中年龄≤40、41~50岁及>50岁员工比例分别为30.5%(1166/3826)、34.6%(1324/3826)和34.9%(1336/3826);血吸虫病防治工作年限>25年专职员工占41.0%(1571/3826);初、中级职称分别占35.5%(1358/3826)和33.7%(1290/3826),18.6%(712/3826)的血吸虫病防治专职员工不具有专业技术职称。血吸虫病防治机构最核心的3项血吸虫病防治工作任务分别为钉螺控制(26.3%,374/1420)、疫情监测与管理(25.4%,361/1420)及健康教育(18.8%,267/1420)。各级血吸虫病防治机构具备的血吸虫病检测技术中,改良加藤厚涂片法、尼龙绢袋集卵孵化法及间接红细胞凝集试验(indirect hemagglutination test,IHA)占比较高。具备酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)、胶体染料试纸条法(dipstick dye immunoassay,DDIA)、金标免疫渗滤试验(dot immunogold filtration assay,DIGFA)、环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)和聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)等检测技术能力或实验条件的实验室比例均虫病防治机构累计承担血吸虫病防治科研项目211项,总经费1859.6万元;累计发表论文619篇;参与制定血吸虫病防治相关标准13项;申请相关专利113项,获批101项;成果转化4项。结论我国血吸虫病防治机构中,独立血吸虫病防治专业机构比例较低、实验室检测能力有待提高、员工年龄结构较老化且职称构成偏低。应加大血吸虫病防治投入和工作力度,加强血吸虫病防治机构能力建设和人才培养,为高质量开展血吸虫病消除工作提供有力支撑。

关键词：血吸虫病消除能力建设现状调查中国

全国2017—2022年输入性恶性疟流行病学特征分析

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中国热带医学 2024年第4期24卷 388-393页

作者：易博禹夏志贵张丽中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心) 国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织热带病合作中心国家级热带病国际联合研究中心上海200025

目的通过分析2017—2022年全国输入性恶性疟病例的流行病学特征,了解我国疟疾消除前后输入性恶性疟疫情变化趋势,为进一步做好境外输入性恶性疟防控工作提供数据支撑。方法收集整理寄生虫病防治信息管理系统中2017—2022年31个省(自治... 详细信息

目的通过分析2017—2022年全国输入性恶性疟病例的流行病学特征,了解我国疟疾消除前后输入性恶性疟疫情变化趋势,为进一步做好境外输入性恶性疟防控工作提供数据支撑。方法收集整理寄生虫病防治信息管理系统中2017—2022年31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团(未包括台湾、香港和澳门地区)的恶性疟个案流行病学调查表,对疫情概况、境外感染地、三间分布等进行统计和分析。结果2017—2022年全国累计报告恶性疟7026例,占疟疾病例总数64.2%(7026/10943),均为境外输入性病例,感染地分布在4个洲60个国家,以非洲国家为主。2017—2022年每月均有恶性疟报告,各月分布不均,在年初出现高峰;输入性恶性疟病例数位居前5位的地区分别为广东省(13.1%,922/7026)、江苏省(9.1%,636/7026)、山东省(8.1%,569/7026)、广西壮族自治区(7.6%,537/7026)和浙江省(7.6%,534/7026);以中国籍病例为主(占94.9%,6668/7026),男女性别比为17.2∶1。在报告的恶性疟病例中,危重症病例239例、死亡病例48例。结论在防止疟疾输入再传播阶段,虽然我国报告疟疾病例均为境外输入性病例,但恶性疟占比较高,考虑其病情复杂且发展较快,容易导致危重症甚至死亡,因此要做到及时发现、准确诊断和规范治疗疟疾病例,减少危重症或死亡。

关键词：输入性恶性疟流行病学特征中国

《加快实现消除血吸虫病目标行动方案(2023—2030年)》解读

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第1期36卷 7-12页

作者：周晓农朱泽林涂宏刘德喜曹淳力许静李石柱传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)、国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室、who热带病合作中心、科技部国家级热带病国际联合研究中心上海200025 国家疾病预防控制局卫生与免疫规划司

2023年6月16日,国家疾病预防控制局联合多部门制定并印发了《加快实现消除血吸虫病目标行动方案(2023—2030年)》。该方案的实施为实现“健康中国2030”规划目标、落实乡村振兴战略奠定了重要基础。本文就该方案的出台背景、原则制定、... 详细信息

2023年6月16日,国家疾病预防控制局联合多部门制定并印发了《加快实现消除血吸虫病目标行动方案(2023—2030年)》。该方案的实施为实现“健康中国2030”规划目标、落实乡村振兴战略奠定了重要基础。本文就该方案的出台背景、原则制定、目标设定、防治策略、保障措施、效果评估等进行解读,旨在指导基层科学规范开展消除血吸虫病目标行动、高质量推动我国消除血吸虫病进程。

关键词：血吸虫病消除行动方案中国

基于文献计量学分析构建全球卫生人才培训评价指标体系

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第2期36卷 191-197页

作者：陶晓晴马雪娇费思伟段磊吕山武佳妮中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)、国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室、who热带病合作中心、国家级热带病国际联合研究中心上海200025 上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院上海交通大学-爱丁堡大学全健康研究中心

目的了解当前全球卫生培训研究热点,构建全球卫生人才培训评价指标体系。方法在中国期刊全文数据库、万方数据库、Web of Science核心合集数据库中,检索2003—2022年公开发表的有关全球卫生培训评价的文献。采用Cite Space软件对检索... 详细信息

目的了解当前全球卫生培训研究热点,构建全球卫生人才培训评价指标体系。方法在中国期刊全文数据库、万方数据库、Web of Science核心合集数据库中,检索2003—2022年公开发表的有关全球卫生培训评价的文献。采用Cite Space软件对检索到的文献进行关键词共现和聚类分析。基于关键词聚类分析结果,以决策导向(context,input,process,product,CIPP)评价模型作为理论框架,构建全球卫生人才培训指标体系。结果共纳入692篇中文文献、1 264篇英文文献进行分析。经关键词共现和聚类分析,获得中、英文关键词聚类各10个,中文关键词聚类依次为层次分析法、卫生外交、人员结构、跨学科、教育考核、全球健康学科发展、培训需求、课程设置、质量评价、后勤保障,英文关键词聚类依次为循证实践、能力建设、全球卫生、生活质量、机器学习、领导力、撒哈拉沙漠以南非洲、健康平等、公共卫生安全、全球卫生外交。基于上述关键词聚类,以CIPP作为理论框架,构建了包括4个一级指标、15个二级指标、59个三级指标的全球卫生人才培训评价指标体系,其中一级指标包括背景评价、投入评价、过程评价、结果评价4个维度。结论成功构建了全球卫生人才培训评价指标体系,该体系可为未来全球卫生人才培训提供有效的评估工具和量化依据。

关键词：全球卫生人才培训评价指标文献计量学决策导向评价模式

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我国重点寄生虫病疫情形势及防控工作重点

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2024年第1期42卷 1-7页

作者：王强许静夏志贵韩帅张仪钱门宝李石柱周晓农中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心) 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织热带病合作中心科技部国家级热带病国际研究中心上海200025

经过70余年有效防治,我国重点寄生虫病防治工作成效显著,正向控制和消除目标迈进。本文分析了近年来我国血吸虫病、疟疾、棘球蚴病、内脏利什曼病、华支睾吸虫病和土源性线虫病等重点寄生虫病的疫情形势和面临的挑战,提出了下一步工作... 详细信息

经过70余年有效防治,我国重点寄生虫病防治工作成效显著,正向控制和消除目标迈进。本文分析了近年来我国血吸虫病、疟疾、棘球蚴病、内脏利什曼病、华支睾吸虫病和土源性线虫病等重点寄生虫病的疫情形势和面临的挑战,提出了下一步工作方向和重点任务,为加快推进全国重点寄生虫病控制和消除进程提供参考。

关键词：寄生虫病疫情形势控制消除

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2022年全国棘球蚴病防治工作进展

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2024年第1期42卷 8-16页

作者：蒉嫣薛垂召王旭刘白雪王莹王立英杨诗杰韩帅许学年中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心) 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织热带病合作中心科技部国家级热带病国际研究中心上海200025

为掌握全国棘球蚴病防治进展,总结防治经验,发现存在的问题,对2022年全国棘球蚴病防治工作数据进行描述性分析。截至2022年底,全国共有370个棘球蚴病流行县(市、区、旗)29926个流行村。2022年全国流行县(市、区、旗)现有棘球蚴病患者25... 详细信息

为掌握全国棘球蚴病防治进展,总结防治经验,发现存在的问题,对2022年全国棘球蚴病防治工作数据进行描述性分析。截至2022年底,全国共有370个棘球蚴病流行县(市、区、旗)29926个流行村。2022年全国流行县(市、区、旗)现有棘球蚴病患者25227例,平均患病率为58.35/10万(25227/43232609)。细粒棘球蚴病15554例,多房棘球蚴病8169例,混合感染255例,未分型1249例。新发现棘球蚴病患者1270例,其中细粒棘球蚴病991例,多房棘球蚴病89例,混合感染5例,未分型185例;学检测超声筛查疑似人员17404人次。2022年370个监测点控制,但防治工作还存在诸多困难和挑战,需要继续加强棘球蚴病防治工作力度,提高群众的防病意识;完善疾病监测体系,发挥区域联防联控机制作用,全面落实各项综合防治措施。

关键词：棘球蚴病细粒棘球蚴病多房棘球蚴病流行病学中国

我国主要传疟按蚊及其杀虫剂抗性基因高通量双端标签序列检测方法的建立

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中国热带医学 2024年第3期24卷 287-294页

作者：曹自有戴雨琪尹建海夏志贵中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心) 世界卫生组织热带病合作中心科技部国家级热带病国际联合研究中心国家卫生健康委寄生虫病原与媒介生物学重点实验室上海200025

目的建立一种可同时、快速、准确检测我国主要传疟按蚊蚊种及其抗性基因的高通量方法,为疟疾消除后我国主要传疟媒介监测提供高通量监测工具。方法2022年8月—2023年7月在云南腾冲市、海南省文昌市、辽宁省东港市不同采样点采集中华按... 详细信息

目的建立一种可同时、快速、准确检测我国主要传疟按蚊蚊种及其抗性基因的高通量方法,为疟疾消除后我国主要传疟媒介监测提供高通量监测工具。方法2022年8月—2023年7月在云南腾冲市、海南省文昌市、辽宁省东港市不同采样点采集中华按蚊、微小按蚊、大劣按蚊和嗜人按蚊成蚊。采用聚合酶链式反应(polymerase chain re‐action,PCR)技术和Sanger测序分别检测按蚊ITS2、kdr(L1014)、rdl(A296)及ace-1(G119)基因;使用优化的多重PCR反应体系、定制设计双端标签序列(barcode)引物和下一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)检测混合样本的上述基因。采用Kappa一致性检验和多个率比较的卡方检验评价方法的一致性,采用四格表计算方法的灵敏度、特异度以及约登指数,对每种方法正常操作流程下各个环节涉及的费用进行统计汇总,并综合确定最适混合检测样本量。结果常规PCR扩增300只蚊虫基因组DNA,扩增产物Sanger测序结果分别为144只中华按蚊、53只大劣按蚊、62只嗜人按蚊和41只微小按蚊,抗性基因kdr(L1014)、rdl(A296)和ace-1(G119)突变数量分别为73只、27只和41只。应用新建立的基于定制双端barcode的多重PCR反应体系和NGS测序技术,检测不同样本量下Sanger测序对应的样本,2种方法检测结果的一致性高(全部Kappa>0.900),多重比较显示样本量N(40、80、160)、N(120、200、240、280)和N(300)三者之间2种方法检测一致率差异有统计学意义(χ^(2)=26.547,P0.994(120)>0.990(280)>0.988(200)>0.987(240)>0.985(300)。从检测40到300个样本量,新建方法单个测序位点费用从20.0元降低至8.3元,常规方法单个测序位点费用从16.7元降低至15.4元。新建方法的最佳检测混合样本量为280。结论新建立的多重PCR、双端barcode和NGS相结合检测方法可同时检测我国4种传疟按蚊蚊种和ace-1、kdr、rdl抗性基因突变位点情况,该方法稳定性好,灵敏度、特异度高,一次可检测较大样本量,相对于其他类型的检测方法成本经济性好。

关键词：疟疾按蚊抗性基因多重PCR技术双端标签序列标记高通量检测