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2017-2019年我国炭疽流行特征及炭疽芽胞杆菌分子分型分析

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中华预防医学杂志 2022年第4期56卷 422-426页

作者：张恩民张慧娟贺金荣李伟魏建春中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的探讨2017—2019年我国炭疽流行特征及发病规律,对部分省份(自治区)的炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。方法收集中国疾病预防控制传染病监测信息系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统中2017—2019年报告的炭疽发病资料,采用描述性... 详细信息

目的探讨2017—2019年我国炭疽流行特征及发病规律,对部分省份(自治区)的炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。方法收集中国疾病预防控制传染病监测信息系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统中2017—2019年报告的炭疽发病资料,采用描述性流行病学方法分析流行特征和时间、地区及人群分布情况;以2017—2019年分离的47株炭疽芽胞杆菌作为研究对象,应用经典单核苷酸多态性分析(canSNP)和15个位点的可变数量串联重复序列分析(MLVA15)方法对炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。结果2017—2019年共报告的炭疽病例数为951例,其中938例是皮肤炭疽,达到总报告数的98.63%,分布地区主要在我国西部和东北地区,累计病例数前三位的省份是甘肃(215例)、四川(202例)和青海(191例);全年均有病例报告,夏秋季发病较多,8月份达到发病高峰,2017—2019年的6至10月份发病数分别占全年发病数的66.35%(211/318)、72.32%(243/336)和68.01%(202/297);年龄范围分布主要在20~59岁,约占总病例数的80%以上;男性病例明显多于女性,男女性别比约为3∶1。职业以牧民和农民为主,牧民病例占当年全部报告发病数的49.70%~58.18%,农民病例占当年全部报告发病数的31.45%~36.70%。每年均有突发公共卫生事件报告,2017—2019年共报告29起突发公共卫生事件。canSNP分析显示,47株菌中有37株属于A.Br.001/002亚群,10株属于A.Br.Ames亚群。MLVA15分析显示,测试菌株可以分成17个基因型,其中有10个基因型只包括1株菌。结论我国2017—2019年炭疽主要以皮肤炭疽为主,有明显地区性、季节性和人群分布特征;canSNP和MLVA15等分子分型方法可以在传染病溯源工作中发挥作用,为炭疽的预防控制提供技术支持。

关键词：炭疽流行病学分子分型

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实验室监测在传染病预警中的应用及思考

中华预防医学杂志 2022年第4期56卷 401-404页

作者：周海健崔志刚阚飙中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

新型冠状病毒肺炎疫情的暴发流行,使全社会重新认识了传染病发生、流行及防控所面临的巨大挑战,即便是当前对传染病防范的认知、应对技术和社会经济条件已有历史上最好的基础。在传染病的监测预警中,研究和利用各类传染病发生与传播相... 详细信息

新型冠状病毒肺炎疫情的暴发流行,使全社会重新认识了传染病发生、流行及防控所面临的巨大挑战,即便是当前对传染病防范的认知、应对技术和社会经济条件已有历史上最好的基础。在传染病的监测预警中,研究和利用各类传染病发生与传播相关因素的数据,以期在传染病发生的早期甚至发生前识别疫情信号,成为传染病防控研究的重要命题。病原体是传染病发生的原因,所以以病原学为核心的实验室监测是传染病预警体系的重要组成部分。我国目前已经初步建成了基于国家致病菌识别网的细菌性传染病实验室监测预警系统,其核心是识别病原、识别暴发、识别来源,在鼠疫、霍乱、流脑等细菌性传染病的早期发现、溯源和精准防控中起到重要作用。本期重点号围绕实验室监测在细菌性传染病预警和防控中的作用,从流行和暴发菌株特征分析、与流行病学调查的联合应用、与常规病例监测体系的融合等方面开展研究,体现了实验室监测在传染病风险评估和疫情调查中的作用,同时对实验室监测预警技术及应用场景进行了综述和展望,以期为推动我国传染病监测预警体系的跨越发展提供新思维。

关键词：传染病病原学实验室监测预警

1950-2021年中国斑疹伤寒流行特征分析

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中华流行病学杂志 2023年第3期44卷 430-437页

作者：韩玲张云飞滕中秋阚飙秦天中国疾病预防控制中心传染病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的分析斑疹伤寒在我国的流行病学特征,探讨我国斑疹伤寒防控工作面临的问题及挑战和策略。方法资料来源于中国公共卫生科学数据中心传染病历史数据库和中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统1950-2021年斑疹伤寒报告数据,... 详细信息

目的分析斑疹伤寒在我国的流行病学特征,探讨我国斑疹伤寒防控工作面临的问题及挑战和策略。方法资料来源于中国公共卫生科学数据中心传染病历史数据库和中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统1950-2021年斑疹伤寒报告数据,采用描述性统计方法、Mann-Kendall检验和圆形分布法对斑疹伤寒的发病情况、死亡情况、病死率进行分析,研究我国斑疹伤寒流行的时间、空间、人群分布和诊断现状。结果1950-2021年,我国共报告斑疹伤寒发病数452965例,死亡数7339例,分别在20世纪50年代、60年代和80年代的14年中报告发病数均过万。20世纪90年代以来,斑疹伤寒发病数和发病率大幅降低,流行强度以散发为主,但安徽省、湖北省和湖南省报告发病数呈上升趋势。斑疹伤寒在全年均可发病,但可呈现一定的季节聚集性,我国斑疹伤寒的发病率高峰集中在夏、秋季,不同省份斑疹伤寒的月发病高峰从北方至南方逐渐向前推移。斑疹伤寒发病的男女性别比为1.01∶1(18529∶18366),近年来女性发病数逐渐超过男性;≤9岁人群发病数占比最大(18.9%),≥50岁人群发病数呈增加趋势;发病人群职业以农民为主,并呈逐年增加趋势,学生和散居儿童发病数占比也较大。斑疹伤寒病例从发病日期至诊断日期间隔时间的中位数为6 d,实验室确诊病例占比较低,检测方法为外斐反应为主。结论尽管我国斑疹伤寒流行态势整体好转,仍需警惕局部暴发的风险,其防控工作仍面临很多挑战,需加强斑疹伤寒病原体检测和监测能力建设。

关键词：斑疹伤寒立克次体流行病学特征

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我国布鲁氏菌病防控现状、进展及建议

中华流行病学杂志 2020年第9期41卷 1424-1427页

作者：姜海阚飙中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室感染性疾病协同诊治协同创新中心北京102206

布鲁氏菌病(布病)是一种易被忽视的人畜共患病。不仅严重危害人民身体健康,而且也严重影响畜牧业、旅游业、国际贸易的发展,还会带来食品安全隐患。在过去的20年里,人类和动物布病的防控已经取得了较大进展。与此同时,特别是在发展中国... 详细信息

布鲁氏菌病(布病)是一种易被忽视的人畜共患病。不仅严重危害人民身体健康,而且也严重影响畜牧业、旅游业、国际贸易的发展,还会带来食品安全隐患。在过去的20年里,人类和动物布病的防控已经取得了较大进展。与此同时,特别是在发展中国家,控制和根除布病仍然面临巨大的挑战。近年来,随着我国家畜饲养量不断增加,动物及其产品流通频繁,人畜接触机会增加,布病流行范围也不断扩大。全国布病疫情相对集中在内蒙古及其毗邻省份,其原因比较复杂,与畜牧经济发展、历史疫区活跃、传染源的流动及对布病重视程度等诸多因素都有很大关系。本文将重点介绍布病在中国的防控工作历程、监测情况和防治现状,并提出防控建议。

关键词：布鲁氏菌病防控

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益生菌干预艰难梭菌感染的研究进展

中华微生物学和免疫学杂志 2022年第8期42卷 652-658页

作者：白璐璐王媛媛郑浩然钟佳鑫卢金星吴媛中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

艰难梭菌感染(Clostridioides difficile infection,CDI)是以发热、腹痛、腹泻为主要临床表现的一种感染性疾病,目前治疗措施主要包括抗生素疗法、粪菌移植疗法等,但复发性、难治性CDI仍不断增加,寻求一种更有效的替代疗法迫在眉睫,目... 详细信息

艰难梭菌感染(Clostridioides difficile infection,CDI)是以发热、腹痛、腹泻为主要临床表现的一种感染性疾病,目前治疗措施主要包括抗生素疗法、粪菌移植疗法等,但复发性、难治性CDI仍不断增加,寻求一种更有效的替代疗法迫在眉睫,目前已有大量益生菌防治CDI的研究,但其研究尚处于初期阶段,本文通过对益生菌干预CDI的种类、机制及技术手段方面的研究加以综述,以期推动益生菌防治CDI的研究进程。

关键词：益生菌艰难梭菌感染干预多组学分析

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F磁珠对血液样本中EB病毒的富集方法

中华实验和临床病毒学杂志 2023年第5期37卷 537-542页

作者：郑皓卢金星陈小萍中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的设计表达一种全新的重组蛋白(重组Ficolin-2蛋白,F蛋白)并包被磁珠,实现多种抗凝血中EB病毒的富集效果。方法通过体外基因合成重组F蛋白基因片段,该片段包括人IL-2信号肽、his标签、人IgG1 Fc、人Ficolin-2颈区及纤维蛋白原样区域(f... 详细信息

目的设计表达一种全新的重组蛋白(重组Ficolin-2蛋白,F蛋白)并包被磁珠,实现多种抗凝血中EB病毒的富集效果。方法通过体外基因合成重组F蛋白基因片段,该片段包括人IL-2信号肽、his标签、人IgG1 Fc、人Ficolin-2颈区及纤维蛋白原样区域(fibrinogen-like domain,FGD);并整合进表达质粒pCDNA^(TM)3.1(+)载体中,通过转染HEK293F细胞,实现上清中的分泌表达;通过镍柱纯化蛋白后包被到蛋白A磁珠上构建F磁珠;最后,收集三种不同抗凝剂(分别为ETDA、肝素、柠檬酸钠)抗凝的临床EB病毒血样本,并且比较了F磁珠和课题组前期开发的重组甘露聚糖结合凝集素磁珠(M磁珠)对三种抗凝剂抗凝血液中EB病毒富集的效果。结果M磁珠对肝素和柠檬酸钠抗凝血液中EB病毒富集效果均较好(P<0.01),但是对EDTA抗凝血EB病毒没有富集作用;而F磁珠对三种抗凝血中EB病毒的富集效果均较好(P<0.01)。结论F磁珠可以实现多种抗凝血中EB病毒的富集作用。

关键词： F磁珠 EB病毒检测 M磁珠

结核分枝杆菌多组分蛋白候选疫苗EPDPA015f和EPDPA015m的免疫作用初步评价

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中华微生物学和免疫学杂志 2023年第4期43卷 294-303页

作者：王瑞欢范雪亭钱程宇曹滨于晋杰李马超李桂莲赵秀芹栾秀丽刘海灿万康林中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的初步评价新型结核融合型多组分蛋白候选疫苗EPDPA015f和混合型多组分蛋白候选疫苗EPDPA015m的免疫原性和有效性, 为研制结核疫苗提供新的抗原组合。方法将构建和表达的EPDPA015f和EPDPA015m蛋白与铝佐剂混合, 采用皮下多点的方式对... 详细信息

目的初步评价新型结核融合型多组分蛋白候选疫苗EPDPA015f和混合型多组分蛋白候选疫苗EPDPA015m的免疫原性和有效性, 为研制结核疫苗提供新的抗原组合。方法将构建和表达的EPDPA015f和EPDPA015m蛋白与铝佐剂混合, 采用皮下多点的方式对6周龄BALB/c小鼠进行3次免疫, 间隔为10 d, 每次50 μg/只。末次免疫10 d后采集血液和脾脏样本。采用酶联免疫吸附试验、多重微球技术、酶联免疫斑点法检测血清抗体滴度、细胞因子分泌水平;采用体外结核分枝杆菌生长抑制试验检测小鼠脾细胞体外抑制结核分枝杆菌生长的能力。多组间比较采用单因素方差分析, 两组间比较采用t检验。结果 EPDPA015f和EPDPA015m均可诱导产生多种高水平的细胞因子和较高滴度的IgG抗体。与佐剂组相比, EPDPA015f组诱导产生Th1(IL-2、TNF-α、IFN-γ)、Th2(IL-4、IL-6、IL-10)、Th17(IL-17)型细胞因子及其他促炎细胞因子(GM-CSF、IL-12)的差异有统计学意义(P均预防型疫苗或加强型疫苗的潜力。

关键词：结核分枝杆菌多组分蛋白 T细胞表位疫苗免疫学评价

城市对海口市南渡江的微生物群落及其毒力因子与抗生素耐药基因组的影响

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中华流行病学杂志 2023年第6期44卷 974-981页

作者：范宇峰李臻鹏遇晓杰李哲周海健张亚淋甘晓婷华德卢昕阚飙中国疾病预防控制中心传染病预防控制所腹泻病室北京102206 海南省疾病预防控制中心检验检测所海口570203 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的探讨河流流经海口市前后河水中细菌菌群结构、抗生素耐药基因组和病原菌毒力基因组的变化,及其传播扩散模式。方法从流经海口市前的南渡江上游至南渡江入海口划分前、中、后段3个研究区域,每个区域选择3个采样点,每个采样点平行采集... 详细信息

目的探讨河流流经海口市前后河水中细菌菌群结构、抗生素耐药基因组和病原菌毒力基因组的变化,及其传播扩散模式。方法从流经海口市前的南渡江上游至南渡江入海口划分前、中、后段3个研究区域,每个区域选择3个采样点,每个采样点平行采集6份样本并混合为1份,每份3 L。通过宏基因组测序和16S rRNA基因全长测序获得相关生物信息数据,分析前、中、后3段水体中微生物群落结构以及耐药基因、毒力因子和可移动遗传元件信息。运用主坐标分析、普氏分析和曼特尔检测等方法分析样本间菌群分布差异以及传播模式相关性。结果随着河水流经海口市,微生物的α多样性呈现逐渐降低趋势。其中变形菌门在前、中、后段的细菌群落中均占据主导地位,中、后段变形菌门相对丰度高于前段。抗生素耐药基因、毒力因子及可移动遗传元件的多样性和丰度在前段均处于较低水平,流经海口市后,均明显升高。同时,可移动遗传元件介导的水平传播在抗生素耐药基因和毒力因子扩散中发挥较大作用。结论城市化对河流中的微生物及其携带的耐药基因、毒力因子和可移动遗传元件产生显著影响。在海口市南渡江,河流流经城市受纳了人群排出的抗生素耐药菌和病原相关细菌,同时抗生素耐药基因和毒力因子在细菌中的富集,显示了城市人群排出的抗生素耐药菌和病原菌对环境健康和公共卫生的威胁。流经城市前后微生物组和抗生素耐药基因组的比较,也可成为有价值的抗生素耐药扩散监测预警指标。

关键词：菌群结构耐药基因毒力因子城市化

一种新的定量16S rRNA基因扩增子测序方法

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生物工程学报 2020年第12期36卷 2548-2555页

作者：韩娜彭贤慧张婷婷强裕俊李秀文张雯中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室传染病预防控制国家重点实验室北京102206 感染性疾病诊治协同创新中心浙江杭州310003

近年来,16S扩增子测序技术被广泛应用于肠道微生物菌群结构和多样性研究,同时也常被用于临床样本中未知病原菌的检测。然而其对样本中物种组成的分辨率只能到属水平的相对丰度,且实验过程中多种因素皆可对结果产生一定影响,如样本起始... 详细信息

近年来,16S扩增子测序技术被广泛应用于肠道微生物菌群结构和多样性研究,同时也常被用于临床样本中未知病原菌的检测。然而其对样本中物种组成的分辨率只能到属水平的相对丰度,且实验过程中多种因素皆可对结果产生一定影响,如样本起始浓度、PCR循环数、扩增引物等。为解决以上问题,本研究采用随机标签和内参法相结合的方法,开发了一套定量16S扩增子测序方法,将常规的16S rRNA编码基因测序结果中的相对丰度转化为绝对定量的拷贝数,有效提高了肠道菌群结构检测的精准性,降低了实验操作对结果的影响,也提高了测序与其他分子生物学方法间的可比性,有利于未来技术的进一步研发和改进。

关键词： 16S rRNA 扩增子定量随机标签内参