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野生型天然rhlC基因缺失菌株铜绿假单胞A39-1的鼠李糖脂产物结构与合成路径解析

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上海海洋大学学报 2025年第1期34卷 111-122页

作者：罗惠芳戚建华童文涛王瑞吕天翊宋增福上海海洋大学水产与生命学院上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 中国-东盟海水养殖技术“一带一路”联合实验室上海201306

为了探究铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)A39-1菌株以不同碳源发酵所得鼠李糖脂抑菌活性及结构组成,解析铜绿假单胞菌A39-1鼠李糖脂生物合成路径。利用牛津杯法检测鼠李糖脂对常见病原菌的抑菌活性,采用液相色谱-质谱联用技术(LC-... 详细信息

为了探究铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)A39-1菌株以不同碳源发酵所得鼠李糖脂抑菌活性及结构组成,解析铜绿假单胞菌A39-1鼠李糖脂生物合成路径。利用牛津杯法检测鼠李糖脂对常见病原菌的抑菌活性,采用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)检测与分析鼠李糖脂样品的同系物组成,通过第二代测序技术(Illumina Hiseq)和第三代单分子测序技术(Pac Bio)测定和组装铜绿假单胞菌A39-1的全基因组序列,注释分析鼠李糖脂合成相关基因。结果显示,菌株A39-1以甘油、葡萄糖、葵花籽油、菜籽油和调和油作为唯一碳源发酵生产的鼠李糖脂具有抑菌活性;LC-MS检测为4种单糖单脂(Rha-C_(8∶2)、Rha-C_(9∶2)、Rha-C_(11∶2)和Rha-C_(10))和4种单糖双脂(Rha-C_(6∶1)-C_(6∶1)、Rha-C_(12∶1)-C_(12∶1)、Rha-C_(12)-C_(14)和Rha-C_(14∶2)-C_(14∶2)),Rha-C_(11:2)为主要结构;基因组预测到alg C、rml A、rml B、rml C、rml D、rhl A、rhl B相关鼠李糖脂合成基因,缺失编码合成双鼠李糖脂的鼠李糖基转移酶Ⅱ基因rhl C。研究表明,铜绿假单胞菌A39-1为野生型天然rhl C基因缺失株,以不同碳源发酵均能专一性产生单鼠李糖脂,且该单鼠李糖脂具有抑菌活性。本研究探索单鼠李糖脂抑菌活性,解析其组成结构及生物合成路径,为开发水生动物疾病新型绿色防控药物提供新思路。

关键词：铜绿假单胞菌A39-1 鼠李糖脂抑菌活性液相色谱-质谱联用技术全基因测序分析

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防腐剂对牡蛎中耐药菌群结构的影响

食品安全质量检测学报 2025年第3期16卷 195-202页

作者：宫钰洁吴书香王鹏姚琳曲梦李风铃王联珠江艳华中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部水产品质量安全检测与评价重点实验室青岛266071 中国海洋大学食品科学与工程学院青岛266404

目的探究常用食品防腐剂对牡蛎中耐药共生菌的影响作用。方法以4℃冷藏为对照组,以分别经山梨酸钾、壳聚糖、乳酸链球菌素、ɛ-聚赖氨酸浸泡处理后进行4℃冷藏为实验组,通过耐药平板计数法分析不同食品防腐剂处理后牡蛎中耐药菌含量的变... 详细信息

目的探究常用食品防腐剂对牡蛎中耐药共生菌的影响作用。方法以4℃冷藏为对照组,以分别经山梨酸钾、壳聚糖、乳酸链球菌素、ɛ-聚赖氨酸浸泡处理后进行4℃冷藏为实验组,通过耐药平板计数法分析不同食品防腐剂处理后牡蛎中耐药菌含量的变化情况,并通过16S rRNA扩增子高通量测序分析耐药菌群结构的变化。结果山梨酸钾与壳聚糖能显著降低单种与多重抗菌药的耐药菌数;乳酸链球菌素能显著降低复方新诺明耐药菌数、氯霉素耐药菌数、庆大霉素耐药菌数和同时耐受2、3、4种药物的耐药菌数;ε-聚赖氨酸能显著降低环丙沙星耐药菌数、复方新诺明耐药菌数、氯霉素耐药菌数、庆大霉素耐药菌数和同时耐受3、4种药物的耐药菌数。山梨酸钾与壳聚糖对四环素与环丙沙星耐药菌群的组成影响较大,乳酸链球菌素与ε-聚赖氨酸对复方新诺明耐药菌群的组成影响较大。结论本研究表明通过应用合适的食品防腐剂可以控制牡蛎中耐药菌的含量,食品防腐剂可以影响牡蛎中可培养耐药菌群的组成且不同防腐剂能抑制特定的抗菌药耐药菌,为建立牡蛎中耐药菌的控制措施提供了新思路。

关键词：防腐剂牡蛎耐药菌耐药菌丰度菌群结构

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罗氏沼虾胚胎发育过程中的转录组

水产学报 2025年第2期 77-85页

作者：黄光华彭敏杨春玲冯鹏霏曾地刚陈秀荔刘青云李强勇张永德朱威霖郁二蒙赵永贞广西壮族自治区水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室广西壮族自治区水产科学研究院农业农村部中国(广西)-东盟水产种质资源综合开发与利用重点实验室(部省共建) 广西壮族自治区水产科学研究院广西虾类繁育工程技术研究中心中国水产科学研究院珠江水产研究所

【目的】为了探索罗氏沼虾胚胎发育的分子调控机制。【方法】本研究对罗氏沼虾胚胎的卵裂期Ⅰ、卵裂期Ⅱ、囊胚期、原肠胚期、前无节幼体、无节幼体、前蚤状幼体、蚤状幼体8个发育阶段进行转录组测序。【结果】本研究共得到156.37 Gb cl... 详细信息

【目的】为了探索罗氏沼虾胚胎发育的分子调控机制。【方法】本研究对罗氏沼虾胚胎的卵裂期Ⅰ、卵裂期Ⅱ、囊胚期、原肠胚期、前无节幼体、无节幼体、前蚤状幼体、蚤状幼体8个发育阶段进行转录组测序。【结果】本研究共得到156.37 Gb clean data，预测得到22 964个unigenes。对罗氏沼虾8个不同发育阶段的胚胎样品的unigenes进行两两比较分析，获得各个时期之间的差异表达基因数量为587～8 620。对差异表达基因进行GO富集分析，上调表达基因主要富集在与细胞发育、生长、运动相关的GO功能类别，下调表达基因主要富集在与细胞的翻译调控、趋化、抗氧化、排毒活性相关的GO功能类别。KEEG富集分析发现，差异表达基因的pathway主要富集在与细胞的生长发育以及正常的生理生化过程相关的代谢途径。【结论】本研究获得了罗氏沼虾胚胎的大量转录本信息，发现了与胚胎发育相关的差异表达基因及其主要富集功能和途径，为罗氏沼虾胚胎研究提供了有用的转录组信息资源。

关键词：罗氏沼虾胚胎发育转录组基因表达

碱度对尼罗罗非鱼肝脏免疫、肠道菌群结构和代谢物的影响

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淡水渔业 2025年第1期55卷 49-59页

作者：蒋利进衣萌萌可小丽曹建萌刘志刚王章谭泽加卢迈新王淼上海海洋大学水产与生命学院上海201306 中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室/广东省水产动物免疫与绿色养殖重点实验室广州510380 广州利洋水产科技股份有限公司广州510080

为探索尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)适宜的养殖水体碱度,分析了不同初始碱度(3.90、21.57和48.88 mmol/L)养殖的尼罗罗非鱼的肝脏免疫指标、肠道微生物和肠道代谢物差异。结果显示,21.57 mmol/L碱度组尼罗罗非鱼的肝脏碱性磷酸酶(... 详细信息

为探索尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)适宜的养殖水体碱度,分析了不同初始碱度(3.90、21.57和48.88 mmol/L)养殖的尼罗罗非鱼的肝脏免疫指标、肠道微生物和肠道代谢物差异。结果显示,21.57 mmol/L碱度组尼罗罗非鱼的肝脏碱性磷酸酶(AKP)活性最高,肝脏免疫球蛋白M(IgM)和补体C3含量最高,肝脏肿瘤坏死因子α(TNFα)含量最低。48.88 mmol/L碱度组尼罗罗非鱼肝脏AKP活性、肝脏IgM和补体C3含量最低,肝脏TNFα含量最高。二元回归分析发现,养殖水体初始碱度为16.32~24.51 mmol/L时,尼罗罗非鱼的免疫性能最高。21.57 mmol/L碱度组尼罗罗非鱼肠道微生物丰富度和多样性最高。与对照组相比,21.57 mmol/L碱度组尼罗罗非鱼丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成等途径显著上调,48.88 mmol/L碱度组罗非鱼辅因子生物合成、核酸代谢、苯丙氨酸代谢等途径显著下调。本研究表明尼罗罗非鱼最适初始碱度范围为16.32~24.51 mmol/L,高碱度(48.88 mmol/L)对尼罗罗非鱼的肝脏免疫、肠道菌群结构和代谢产生负面影响。

关键词：尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus) 碱度高通量测序肠道微生物代谢组

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鱼毒素的结构、功能和作用机理

水生生物学报 2025年第1期49卷 166-177页

作者：任建峰江妍秋汪勇翔李家乐李可上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 安徽省黄山市水产站黄山245099 中国科学院烟台海岸带研究所烟台264003

鱼毒素具有较强的生物学活性及独特的作用机制,能够作用于离子通道、细胞膜和酶等靶点,影响神经、循环、肌肉等系统,利于鱼类进行快速、高效的捕食和防御。文章总结了鱼毒素的来源、分布、成分、作用靶点及毒素检测方法等信息,并阐述了... 详细信息

鱼毒素具有较强的生物学活性及独特的作用机制,能够作用于离子通道、细胞膜和酶等靶点,影响神经、循环、肌肉等系统,利于鱼类进行快速、高效的捕食和防御。文章总结了鱼毒素的来源、分布、成分、作用靶点及毒素检测方法等信息,并阐述了已知鱼毒素在医疗领域的应用。对鱼毒素的综合回顾将加强对鱼毒素自然生态功能的理解,并提高新的毒素衍生药理工具、药物先导物和药物的鉴定率,为鱼毒素的科学研究和医疗应用提供参考。

关键词：鱼毒素生物功能组织分布化学特征作用机制

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基于CPB细胞扩增体系的鳜弹状病毒增殖条件的优化

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水产学报 2018年第9期42卷 1481-1488页

作者：罗霞付小哲李宁求林强黄志斌张悠中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部渔用药物创制重点实验室广东省水产动物免疫技术重点实验室

为获知鳜弹状病毒（Siniperca chuatsi rhabdovirus,SCRV）QY株在体外培养细胞中最适增殖条件,以鳜脑细胞系（Chinese perch brain cell line,CPB）为增殖体系,采用实时荧光定量PCR（quantitative real-time PCR,q RT-PCR）技术所测病毒拷贝数为判断指标,比较同步接毒和异步接毒2种接种方式以及病毒接种量、血清浓度等培养条件对病毒增殖的影响,确定SCRV-QY株在CPB细胞中的最适增殖条件。结果显示,单位体积病毒增殖量方面,异步接毒法优于同步接毒法,以感染复数（multiplicity of infection,MOI）为10将病毒接种长满单层的CPB细胞中,28°C吸附1.5 h,用含2%胎牛血清的L15培养液于28°C培养时,病毒增殖量最高,为5.59×10;拷贝/mL;而从单位成本所获病毒量考虑,同步接毒法筛选出的4种增殖条件单位成本所获的病毒产量优于异步接毒法,其中当MOI=0.03、胎牛血清终浓度为6%时,同步接种对数生长中期的CPB细胞,28°C恒温培养70 h后收获病毒液,单位成本所获病毒量最高,为4.88×10;个拷贝/元。综上所述,本研究以病毒增殖量和培养基成本作为考量,优化SCRV-QY株的增殖条件,可为SCRV疫苗低成本、规模化生产提供理论依据。

关键词：鳜弹状病毒鳜脑细胞接毒方法增殖条件实时荧光定量PCR

鳜传染性脾肾坏死病毒主衣壳蛋白单克隆抗体的制备及鉴定

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水产学报 2016年第3期40卷 363-370页

作者：付小哲李宁求林强刘礼辉吴淑勤中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部渔用药物创制重点实验室中国水产科学研究院珠江水产研究所广东省水产动物免疫技术重点实验室

为了建立鳜传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)疫苗抗原含量的ELISA检测方法,制备了3株抗ISKNV主衣壳蛋白(MCP)的单克隆抗体,鉴定了其生物学特性。将大肠杆菌表达的重组MCP纯化复性后,连续3次免疫BALB/c小鼠,然后将免疫小鼠的脾细胞与SP2/0细胞... 详细信息

为了建立鳜传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)疫苗抗原含量的ELISA检测方法,制备了3株抗ISKNV主衣壳蛋白(MCP)的单克隆抗体,鉴定了其生物学特性。将大肠杆菌表达的重组MCP纯化复性后,连续3次免疫BALB/c小鼠,然后将免疫小鼠的脾细胞与SP2/0细胞融合,经过克隆、筛选,获得3株能稳定分泌抗ISKNV MCP蛋白的单克隆抗体阳性细胞株,分别命名为5F1、3D9和5B4,均为Ig G1亚型。间接ELISA实验表明,3株单抗可特异性识别ISKNV,与鳜弹状病毒、大鲵虹彩病毒等无交叉反应。将5F1株免疫小鼠后制备腹水,以重组MCP和ISKNV细胞培养物上清液为检测抗原,ELISA检测腹水效价分别为1∶51 200和1∶400。间接免疫荧光(IFA)和Western Blotting鉴定结果显示,5F1能够与ISKNV病毒发生特异性反应,并初步确定5F1单抗株制备的腹水用于IFA的使用浓度为1∶200、Western Blotting的使用浓度为1∶1000。结果证实,成功制备了抗ISKNV MCP的单克隆抗体,可特异性识别ISKNV病毒粒子和MCP蛋白,为建立ISKNV疫苗抗原含量检测方法奠定了基础。

关键词：鳜传染性脾肾坏死病毒主衣壳蛋白单克隆抗体

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鱼源溶藻弧菌生物学特性和病理组织学观察

微生物学报 2014年第11期54卷 1378-1384页

作者：赖迎迢陶家发孙承文石存斌吴淑勤中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部渔用药物创制重点实验室广东省水产动物免疫技术重点实验室广东广州510380

【目的】溃烂病是我国海水养殖及南方养殖斜带石斑鱼的常见严重病害之一。通过对患病的斜带石斑鱼病原菌的分离与鉴定,为检测其耐药性和控制石斑鱼在海水养殖中溃烂病的爆发和流行奠定基础。本文目的是研究斜带石斑鱼相关的病原菌的特... 详细信息

【目的】溃烂病是我国海水养殖及南方养殖斜带石斑鱼的常见严重病害之一。通过对患病的斜带石斑鱼病原菌的分离与鉴定,为检测其耐药性和控制石斑鱼在海水养殖中溃烂病的爆发和流行奠定基础。本文目的是研究斜带石斑鱼相关的病原菌的特性。【方法】从患病斜带石斑鱼肾脏、肝脏病灶组织,分离纯化得到病原菌,进行纯化培养、人工感染和回归感染、ATB细菌自动鉴定及药敏试验,并进行菌体常规形态特征、培养特性和生理生化反应指标测定。【结果】确定为溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)。两株典型菌株经人工感染和回归感染均显示自然发病症状。药敏试验表明,该菌具有较强的耐药性,在所检测的抗菌药物中,对青霉素等3类抗菌药物高度耐药,而对氯霉素等5类抗菌药物敏感。器官主要组织病理学变化为:肝细胞、肾小管细胞等变性、坏死,病变组织有炎性细胞浸润且呈变质性炎症。溶藻弧菌对机体的主要器官造成严重病理损伤。【结论】生理生化等结果均证实分离菌株是溶藻弧菌,而且产生多重耐药情况较为普遍,未来应加强对养殖海水中病原耐药性和斜带石斑鱼病原感染的监测。

关键词：斜带石斑鱼溶藻弧菌弧菌鉴定

鳢流行性溃疡综合征病原分离鉴定与病理形态学观察

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中国水产科学 2019年第6期26卷 1213-1220页

作者：常藕琴石存斌王亚军刘春陈绮梨霍礼侠中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部渔用药物创制重点实验室广东省水产动物免疫技术重点实验室

为寻找冬春季鳢(Channa maculata)烂身病的病原,应用组织压片、组织切片、扫描电镜技术、HE 常规染色法和 Grocott 六胺银染色法、霉菌分离纯化及 ITS 的序列分析等对冬春季患疑似溃疡综合征的烂身病鳢进行了病原学与病理学研究。病变... 详细信息

为寻找冬春季鳢(Channa maculata)烂身病的病原,应用组织压片、组织切片、扫描电镜技术、HE 常规染色法和 Grocott 六胺银染色法、霉菌分离纯化及 ITS 的序列分析等对冬春季患疑似溃疡综合征的烂身病鳢进行了病原学与病理学研究。病变组织压片观察到大量直径 10~20 μm,分枝较少、纤细菌丝。扫描电镜观察到肌肉组织中延伸出大量的纤细的丝状真菌。患病鳢皮肤和肌肉表现为变性、坏死与炎性细胞浸润,溃疡灶肌肉内可见大量的慢性肉芽肿结节和炎性细胞浸润。结节基本结构由类上皮细胞和多核巨细胞、炎性细胞、霉菌菌丝(横断面呈圆形,斜断或纵断呈丝状)组成,霉菌位于结节中央。Grocott 六胺银染色观察到结节中有大量棕色菌体。无菌分离培养可观察到典型丝状霉菌;霉菌在灭菌池塘水 20℃过夜, 12 h 后可观察原代孢子群形成,真菌 ITS 序列分析表明其与侵袭丝囊菌(Aphanomyces invadans)同源性为 100%。侵袭丝囊霉菌(A. invadans)是杂交鳢溃疡综合症病的主要病原,为鱼类流行病学调查和疾病防治的深入研究奠定基础。

关键词：鳢流行性溃疡综合征丝囊霉菌病理形态学