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基于船位数据的南极磷虾中层拖网船作业状态特征提取

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海洋渔业 2024年

作者：苏冰何瑞麟赵国庆蒋沛雯李阳商宸韩海斌沈烈张衡大连海洋大学航海与船舶工程学院青岛海洋科技中心崂山实验室中国水产科学研究院东海水产研究所农业农村部远洋与极地渔业创新重点实验室河南科技职业大学农业农村部渔业遥感重点实验室安徽师范大学上海海洋大学

为研究基于船位数据提取南极磷虾中层拖网船的作业状态特征，选取2021年福荣海、龙腾和龙发等3艘中国南极磷虾中层拖网船的VMS船位数据，采用航速、航向的阈值综合判别方法初步判断渔船作业状态（分为捕捞、航行和漂流），并与渔捞日志... 详细信息

为研究基于船位数据提取南极磷虾中层拖网船的作业状态特征，选取2021年福荣海、龙腾和龙发等3艘中国南极磷虾中层拖网船的VMS船位数据，采用航速、航向的阈值综合判别方法初步判断渔船作业状态（分为捕捞、航行和漂流），并与渔捞日志数据进行对比验证，确定渔船实际作业状态。依据船位数据中的航速、航向、时间区间、经纬度等特征，构建了基于深度学习网络的船位状态识别算法，并将数据集按照8:2的比例分为训练集和验证集代入训练，提取渔船的作业天数、作业日期以及对应的作业位置信息，并与实际填写的渔捞日志数据进行对比验证。结果表明：提取的结果和实际记录的结果误差较小，其中作业天数每月差值在0～2d，平均准确率为93.88%；作业位置距离差值较小，总体在20km以内，占总天数的94%；与k近邻、逻辑回归、贝叶斯和决策树等传统机器学习算法相比，基于深度学习模型的南极磷虾拖网船作业状态特征提取正确率最高，达87.04%。研究结果对识别南极磷虾拖网渔船作业状态、捕捞行为和渔业管理具有一定的参考价值。

关键词：南极磷虾船位数据作业状态深度学习

基于TMT技术对高温胁迫条件下大菱鲆幼鱼心脏的差异蛋白筛选分析

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渔业科学进展 2024年第5期45卷 30-41页

作者：赵一诺徐荣静黄智慧蒋宇航曹郡文王新安刘诗颖闫鹏飞马爱军中国水产科学研究院黄海水产研究所、海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室、山东省海洋渔业生物技术与遗传育种重点实验室、青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所、海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室、山东省海洋渔业生物技术与遗传育种重点实验室、青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室山东青岛266071 中国农业科学院研究生院北京100081 青岛海洋科技中心海洋生物学与生物技术功能实验室山东青岛266071 烟台开发区天源水产有限公司山东烟台264006

水温是影响鱼类生存生长的重要因素,而心脏对于维持脊椎动物机体稳态有关键作用。因此,为探究与大菱鲆(Scophthalmus maximus)耐高温性状相关的关键蛋白或代谢通路,本研究利用TMT联合LC-MS/MS技术开展高温胁迫下大菱鲆心脏差异表达蛋白... 详细信息

水温是影响鱼类生存生长的重要因素,而心脏对于维持脊椎动物机体稳态有关键作用。因此,为探究与大菱鲆(Scophthalmus maximus)耐高温性状相关的关键蛋白或代谢通路,本研究利用TMT联合LC-MS/MS技术开展高温胁迫下大菱鲆心脏差异表达蛋白谱分析。将大菱鲆幼鱼分为3组进行实验:control组(14.0±0.5)℃(适宜温度),HT1组(20.0±0.5)℃(高温),HT2组(28.0±0.5)℃(极高温)。定量分析鉴定到的肽段数量为35434个,其中特有肽段数量为31704个;鉴定到的蛋白质总数4765个。3个实验组间两两比较形成3个比较组,并进行差异蛋白筛选,结果显示,HT1/control共筛选到87个差异表达蛋白(DEPs),HT2/control共筛选到171个DEPs,HT2/HT1共筛选到188个DEPs。KEGG富集结果显示,HT2组与control组和HT2组与HT1组的差异蛋白均主要富集在与脂肪酸代谢、炎症以及免疫防御相关的通路;热休克蛋白家族中多个蛋白(HSP90B、HSP70等)在HT2组相较于control组均显著上调。蛋白互作网络结果显示,关联度最高的是HSP90B。首次发现,高温胁迫下心脏组织纤维蛋白原相关蛋白(FGA、FGB和FGG)表达水平呈上升趋势,其在热响应中的作用仍需进一步研究。结果表明,极高温可能引起大菱鲆的脂肪酸代谢紊乱,引发炎症反应,而热休克蛋白家族蛋白的上调可能对缓解热胁迫下的应激症状有积极作用。本研究为进一步阐明大菱鲆热应激的分子机制提供了理论依据,并为大菱鲆的耐高温选育提供候选蛋白标记。

关键词：大菱鲆蛋白组学高温胁迫心脏

基于eDNA技术的密云水库鱼类群落结构及生态位变化分析

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大连海洋大学学报 2024年第2期39卷 298-307页

作者：曲疆奇郝桐锋李永刚刘录民郝东生贾成霞张清靖北京市农林科学院水产科学研究所渔业生物技术北京重点实验室北京100068 天津农学院水产学院天津300392 北京市密云区农业服务中心北京101500

为探究南水北调中线工程蓄水后新水域环境对鱼类群落的影响,采用eDNA宏条形码技术(environmental DNA metabarcoding)首次对密云水库鱼类群落结构及多样性的时空变化特征进行了分析,并结合生态位宽度Shannon-Winner(B_(i))和重叠Pianka... 详细信息

为探究南水北调中线工程蓄水后新水域环境对鱼类群落的影响,采用eDNA宏条形码技术(environmental DNA metabarcoding)首次对密云水库鱼类群落结构及多样性的时空变化特征进行了分析,并结合生态位宽度Shannon-Winner(B_(i))和重叠Pianka指数(Q_(ik))研究了鱼类种群间的相互作用、共生共存及生态位分化的响应过程。结果表明:本次调查密云水库共检出86个鱼类物种eDNA信息,隶属14目21科68属,有3个鱼类eDNA信息仅注释到科、属级分类水平;鱼类主要栖息于水库底层(61.63%),以肉食性(43.02%)和杂食性(26.74%)摄食类型为主;PCoA分析显示,密云水库各采样点鱼类群落结构无显著性差异(P>0.05),Alpha多样性各项指数也无显著性差异(P>0.05);主要鱼类生态位宽度为1.15~9.25,均为中生态和广生态位种,其中,生态位重叠指数Q_(ik)>0.6的种对有517对,约占总种对数的14.15%;与历史资料相比,鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鳙(Aristichthys nobilis)、鲫(Carassius auratus)、鲂(Megalobrama terminalis)和鲤(Cyprinus carpio)等增殖放流鱼类仍为水库主要经济鱼类。研究表明,蓄水后营底栖、以肉食性和草食性为主要生活策略的水库鱼类对环境的适应能力较弱,且彼此之间竞争明显。

关键词：密云水库鱼类群落结构多样性生态位变化南水北调

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排浦中心渔港换水通道布置对水交换的影响

水运工程 2024年第5期 82-88页

作者：李醒丁磊曾起召熊玉章王刚中国水产科学研究院渔业工程研究所北京100141 天津科技大学海洋与环境学院天津300457 中海(广州)工程勘察设计有限公司广东广州510000

以排浦中心渔港建设项目为例,利用平面二维水动力和水交换数学模型,通过2种基本换水通道的不同组合,探究换水通道平面布置形式对水交换的影响。结果表明,仅布置通道1有利于加快1 000 t渔船泊位前的水交换,但会迟滞其左侧泊位前沿特别是... 详细信息

以排浦中心渔港建设项目为例,利用平面二维水动力和水交换数学模型,通过2种基本换水通道的不同组合,探究换水通道平面布置形式对水交换的影响。结果表明,仅布置通道1有利于加快1 000 t渔船泊位前的水交换,但会迟滞其左侧泊位前沿特别是防波堤堤根附近水体的半交换周期;仅布置通道2有利于提高防波堤堤根附近的水交换效率;2种换水通道同时布置有利于增强中型渔船停泊区及各泊位前沿整体的水交换能力,同时提高防波堤堤根附近水交换效率。

关键词：换水通道水交换半交换周期数值模拟排浦中心渔港

2个鲤群体(Cyprinus carpio L.)表型生长性状的AI测量与手工测量的相关性分析

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中国农学通报 2024年第14期40卷 157-164页

作者：马子尧潘红王开阔陈颖杰曹逸铭孙晓晴张研上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 农业农村部水生动物基因组学重点实验室/中国水产科学研究院生物技术研究中心/北京市渔业生物技术重点实验室北京100141 北京市野生动物救护中心北京101300

鱼类形态是人工育种、功能基因定位以及水产养殖和生态学研究的重要种群资源。鲤(Cyprinus carpio L.)是中国重要的养殖淡水鱼类之一,鲤的自然和人工选择导致不同品种间的表型极具多样性。近年来,随着成像技术、计算能力和硬件设备的飞... 详细信息

鱼类形态是人工育种、功能基因定位以及水产养殖和生态学研究的重要种群资源。鲤(Cyprinus carpio L.)是中国重要的养殖淡水鱼类之一,鲤的自然和人工选择导致不同品种间的表型极具多样性。近年来,随着成像技术、计算能力和硬件设备的飞速发展,基于机器视觉的无损测量方法逐渐成为一种高效、可重复批量检测鱼体的方法。本研究旨在检验AI测量对鱼类表型性状测量的准确性。本文选择了表型指数差异显著的元江鲤(Cyprinus carpio yuankiang)和金背鲤(Cyprinus carpio ***)2个群体,共计204尾鱼进行研究。针对全长、体长、体高、体厚、头长、尾柄长、尾柄高、吻长、眼径和眼间距共10种线性、圆形和空间性状进行手工测量和AI测量,并进行了比较分析。其结果显示:(1)元江鲤和金背鲤2个群体中,针对10种表型性状的测量,相较于手工测量,AI测量结果整体偏大;在表型指数中,体宽指数(体厚/体长),头长指数(头长/体长)和尾鳍指数(尾柄长/体长)2种测量方法均无显著差异,而2种方法在体深指数(体高/体长)结果中,呈现显著差异。(2)元江鲤和金背鲤群体中,对2种测量方法进行相关性和一致性分析,发现针对全长、体长、体高、体厚、头长和眼间距共6种性状,2种方法呈现高度一致性(r>0.85);(3)2种测量方法重复性测量的一致性分析中,发现手工测量和AI测量均呈现较好的一致性(r>0.85),但手工测量的一致性要略高于AI测量。综上所述,AI测量准确度的提升能够加快全长等线性表型性状测量的工作效率和选择育种速度,但对于圆形和空间等表型性状测量的准确度,还需进一步提升。

关键词：手工测量 AI测量元江鲤金背鲤

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肠球菌素及其在食品中的应用研究进展

现代农业科技 2024年第18期 147-150,163页

作者：王忠祥张海涛迟海中国农村技术开发中心北京100045 江苏海洋大学海洋食品与生物工程学院江苏连云港222005 中国水产科学研究院东海水产研究所上海200090

肠球菌广泛存在于自然环境中,是一种人体和动物肠道正常菌群中常见的乳酸菌,其代谢过程中产生的功能物质也常被认为绿色、安全。肠球菌可以产生一种由核糖体合成的抗菌多肽,即肠球菌素。现对肠球菌素的分类、合成和抑菌机理的研究进展... 详细信息

肠球菌广泛存在于自然环境中,是一种人体和动物肠道正常菌群中常见的乳酸菌,其代谢过程中产生的功能物质也常被认为绿色、安全。肠球菌可以产生一种由核糖体合成的抗菌多肽,即肠球菌素。现对肠球菌素的分类、合成和抑菌机理的研究进展进行综述,并详细介绍肠球菌素在乳制品、肉制品等食品中的应用,旨在为肠球菌素的发展和应用提供基础理论信息。

关键词：肠球菌素分类合成抑菌机理研究进展应用

2023年冬季宁德核电冷源海域棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)资源声学评估

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渔业信息与战略 2024年第1期39卷 39-48页

作者：鲁超熊敏思邢晓峰张正楼张献娟宋云鹏吴祖立伍玉梅自然资源部宁德海洋中心福建宁德352100 中国水产科学研究院东海水产研究所上海200090 上海核工程研究设计院上海200233 上海海洋大学海洋科学学院上海201306

滨海核电厂冷却水源的取水安全正受到海洋生物暴发引起的堵塞威胁,鱼类堵塞核电冷源的事件时有发生。声学技术在海洋生物探测方面具有高效、实时的优势,因此,被广泛应用于海洋生态系统研究。为了解冬季宁德核电厂冷却水源取水海域棘头... 详细信息

滨海核电厂冷却水源的取水安全正受到海洋生物暴发引起的堵塞威胁,鱼类堵塞核电冷源的事件时有发生。声学技术在海洋生物探测方面具有高效、实时的优势,因此,被广泛应用于海洋生态系统研究。为了解冬季宁德核电厂冷却水源取水海域棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)的密度和运动规律,利用声学技术对相关海域冷却水源生物量进行了测量和评估。研究结果显示,棘头梅童鱼为研究海域的优势种,拖网调查显示平均尾数密度为1964尾·km^(-2),平均质量密度为0.483 kg·km^(-2)。棘头梅童鱼丰度在研究海域向核电厂方向减少,质量密度以核电厂温排水区域站点最高。通过对鱼类回波特征和个体轨迹的追踪统计,分析了该海域冬季内单体目标强度检测及其空间结构分布、资源现存量和资源丰度密度的时空分布变化。声学走航海域鱼类平均密度为2.78×10^(5)尾·n mile^(-2),生物量密度均值为1.41×10^(4) kg·n mile^(-2),棘头梅童鱼资源总量为7.47×10^(5) kg。研究表明,声学技术在宁德核电厂取水海域冬季冷却水源生物量测量中具有明显优势。通过不断改进和优化方法,声学技术将能更好地支持核电厂取水海域的生态环境监测与资源管理,为冷却水源取水安全提供科学依据。

关键词：声学评估棘头梅童鱼核电厂冷源堵塞

基于线粒体Cyt b基因和D-loop区序列的雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡遗传多样性分析

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生物资源 2024年第4期46卷 340-347页

作者：孙超周建设王万良王壮壮何昊明户国普布西藏大学生态环境学院西藏拉萨850000 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所西藏拉萨850032 西藏土著鱼类繁育与利用技术工程研究中心西藏拉萨850032 西藏自治区渔业与种质资源利用重点实验室西藏拉萨850032 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所黑龙江哈尔滨150070

对西藏雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡(Glyptosternum maculatum)种群遗传多样性的解析可为黑斑原鮡的保护和人工选育提供理论依据,以雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡种群为研究对象,通过对其线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)和控制区(D-loop区... 详细信息

对西藏雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡(Glyptosternum maculatum)种群遗传多样性的解析可为黑斑原鮡的保护和人工选育提供理论依据,以雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡种群为研究对象,通过对其线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)和控制区(D-loop区)基因序列进行扩增和测序,分析了黑斑原鮡的线粒体序列特征与其种群遗传多样性的关联。结果显示:黑斑原鮡Cyt b基因序列长度为1 138 bp,(A+T)含量(59.5%)高于(C+G)含量(40.5%);检测到突变位点32个,其中单突变位点26个,简约信息位点6个;共检测到21个单倍型,其中单倍型Hap 1个体数最多,占总检测个体数的69.44%;种群单倍型多样性(Hd)为(0.509±0.050),核苷酸多样性(Pi)为(0.000 71±0.000 11),Tajima’s D中性检验值为-2.532 91,中性检验结果显示(P信息位点14个;检测到23个单倍型,Hd为(0.701±0.028),Pi为(0.001 67±0.000 28),单倍型Hap 1和Hap 3的个体数较多,分别占45.14%和30.56%;D-loop基因Tajima’s D中性检验值为-2.366 38,中性检验结果显示(P<0.01)极显著负值,表明该群体经历过种群扩张。黑斑原鮡种群的Cyt b和D-loop区基因适合进行黑斑原鮡的种内遗传分析,且D-loop区基因更具有进化优势,其种群的遗传多样性较低,对黑斑原鮡遗传育种与保护具有一定的参考价值。

关键词：雅鲁藏布江黑斑原鮡遗传多样性细胞色素b基因 D-loop区

2004～2005年《中国水产科学》引证分析报告

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中国水产科学 2007年第3期14卷 513-520页

作者：张晓琴吴均陈欣然中国水产科学研究院渔业信息中心中国水产科学研究院渔业信息中心北京100039

根据中国科学技术信息研究所2006年提供的引证数据,对2004-2005年《中国水产科学》被引证情况进行分析,同时根据2005-2006年版《中国科技期刊引证报告》进行计量学指标分析。结果显示,2年中国内引用《中国水产科学》的期刊种类总数为162... 详细信息

根据中国科学技术信息研究所2006年提供的引证数据,对2004-2005年《中国水产科学》被引证情况进行分析,同时根据2005-2006年版《中国科技期刊引证报告》进行计量学指标分析。结果显示,2年中国内引用《中国水产科学》的期刊种类总数为162种,总计被引频次为1 142次,著者论文被引用篇次最多的为33次,单篇被引次数最高为16次,主要研究领域集中于渔业环境生态、分子遗传育种和鱼类生理生化研究方面。从2004年到2005年,引用期刊种类数量从105种上升为121种,说明《中国水产科学》的影响在稳步提高,但在文章的遴选过程中,应关注当前的研究热点和文章整体科技创新水平。

关键词：计量学指标中国水产科学引证分析