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基于鱼类早期资源调查和eDNA技术揭示长江南京段鱼类资源多样性

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生态学杂志 2025年

作者：李天佑吴思燃赵华丽唐阅刘宝兴方弟安上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心南京农业大学无锡渔业学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室

在“长江大保护”的生态背景下，传统的渔业资源捕捞监测受到诸多限制。环境DNA技术因无损性和高灵敏度等优势已被广泛应用于渔业资源监测。鱼类早期资源调查既能反映鱼类资源现状，又能揭示其多样性特征。为了解禁渔后长江南京江段鱼... 详细信息

在“长江大保护”的生态背景下，传统的渔业资源捕捞监测受到诸多限制。环境DNA技术因无损性和高灵敏度等优势已被广泛应用于渔业资源监测。鱼类早期资源调查既能反映鱼类资源现状，又能揭示其多样性特征。为了解禁渔后长江南京江段鱼类资源现状，本研究利用鱼类早期资源调查结合环境DNA技术于2023年6—8月对其鱼类物种组成和多样性进行了分析。结果表明：在长江南京段共检测出39种鱼类，属于6目11科39种，其中基于鱼类早期资源调查检出的鱼类有6目9科30种，eDNA方法检出的鱼类有5目9科30种，两种方法共同检测出鱼类21种；基于两种方法的共同优势种为刀鲚（Coilia nasus）、贝氏■（Hemiculter bleekeri）和银飘鱼（Pseudolaubuca sinensis）；基于早期资源调查和环境DNA方法计算得出的Shannon多样性指数和Pielou均匀度指数平均值为分别为1.89±0.22和1.86±0.15；0.63±0.08和0.56±0.04；长江南京江段鱼类多样性处于较丰富的水平，鱼类多样性呈现逐渐恢复趋势。本研究揭示了鱼类早期资源调查和环境DNA技术进行渔业资源监测的可行性和应用前景，为长江南京江段鱼类资源的保护与恢复提供了基础资料和科学依据。

关键词：长江环境DNA 鱼类早期资源鱼类多样性

环鄱阳湖地区池塘水体细菌群落结构特征及构建机制

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江西农业大学学报 2025年第1期47卷 178-192页

作者：侯明勇张燕萍余建芳阙祥尧吴子君徐先栋宋超章海鑫江西省水产科学研究所江西南昌330039 江西省渔业资源生态环境监测中心江西南昌330039 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏无锡214125

【目的】为了解环鄱阳湖地区池塘水体细菌群落结构特征及其构建机制,以期为养殖池塘生态健康评价及养殖管理提供理论依据。【方法】于2022年6月(夏季)和12月(冬季)分别采集环鄱阳湖(九江市、南昌市、上饶市、抚州市、吉安市、宜春市)6... 详细信息

【目的】为了解环鄱阳湖地区池塘水体细菌群落结构特征及其构建机制,以期为养殖池塘生态健康评价及养殖管理提供理论依据。【方法】于2022年6月(夏季)和12月(冬季)分别采集环鄱阳湖(九江市、南昌市、上饶市、抚州市、吉安市、宜春市)6个地区共45个池塘水体样本,通过高通量测序技术分析池塘水体细菌群落结构特征,并利用中性模型和零模型探究其构建机制。【结果】(1)6月各采样地区池塘水体的平均水温(T)高于12月,平均氨氮(NH3-N)、总磷(TP)、总氮(TN)浓度均低于12月;池塘水体细菌群落的优势菌门均为放线菌门(Actinobacteriota)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidota)、蓝细菌门(Cyanobacteria),优势菌属为hgcI_clade、CL500-29_marine_group、Mycobacterium、Cyanobium_PCC-6307。(2)6月各地区池塘水体细菌群落α多样性指数无显著差异(P>0.05),12月九江市池塘水体细菌群落Ace、Chao指数与抚州市、上饶市均存在显著差异(P0.05)。(3)除6月九江市池塘水体细菌群落与溶氧(DO)、南昌市池塘水体细菌群落与TN,以及12月九江市池塘水体细菌群落与T外,其他地区池塘水体细菌群落与环境因子T、pH、DO、NH3-N、TN、TP、总悬浮物(TSS)、高锰酸盐指数(CODMn)均呈正相关关系;6月对池塘水体细菌群落结构有显著影响的环境因子按影响程度大小排序为TP、T、NH3-N、CODMn、TN、pH,12月为TSS、TP、pH、TN、T。(4)6月池塘水体细菌群落构建主要由以扩散限制和漂变为主导的随机性过程(贡献率=62.68%)所决定,12月主要由以同质选择为主导的确定性过程(贡献率=65.04%)所决定。【结论】环鄱阳湖地区中九江市池塘水体细菌群落Ace、Chao指数存在季节性显著差异,且12月九江市与抚州市、上饶市存在地区性显著差异,其余各地区池塘水体细菌群落无地区性、季节性显著差异。有机物积累对池塘水体细菌群落结构稳定性和丰富度的贡献高于温度,6月池塘水体细菌群落构建机制主要是以扩散限制、漂变为主导的随机性过程,12月池塘水体细菌群落构建机制主要是以同质选择为主导的确定性过程。

关键词：养殖池塘细菌群落结构构建机制中性模型零模型

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分布于雅砻江中游厚唇裸重唇鱼的饵料生物组成与摄食特性

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水产学报 2025年第03期 158-177页

作者：李筱芹曾如奎倪达富冯钢万卓坤王洁吴彤飞鲁桃秀邓华堂姚维志付梅吕红健西南大学水产学院农业农村部长江上游水生生物多样性保护研究中心西南大学渔业资源环境研究中心雅砻江流域水电开发有限公司雅安市雨城区农业农村局中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站

【目的】研究雅砻江中游现有厚唇裸重唇鱼的饵料生物组成与摄食特性。【方法】通过分析于2020年10月至12月、2021年3月和2022年5月在四川省甘孜藏族自治州内新龙县至雅江县江段采集的207尾厚唇裸重唇鱼样本的摄食强度，并分别选取30与5... 详细信息

【目的】研究雅砻江中游现有厚唇裸重唇鱼的饵料生物组成与摄食特性。【方法】通过分析于2020年10月至12月、2021年3月和2022年5月在四川省甘孜藏族自治州内新龙县至雅江县江段采集的207尾厚唇裸重唇鱼样本的摄食强度，并分别选取30与53尾样本测量肠道长度、分析肠道内容物。【结果】雅砻江中游厚唇裸重唇鱼的总体摄食强度较低，且在繁殖期的摄食强度最低。厚唇裸重唇鱼所摄食饵料生物的总种类数为38种，主要饵料生物为大型无脊椎动物中的纹石蛾幼虫，并兼食等片、舟形藻、桥弯藻、异极藻等着生藻类。厚唇裸重唇鱼肠道系数(IC)平均值为1.61±0.06，处于已有研究裂腹鱼类的中下游水平；其饵料生物Shannon-Wiener多样性指数(H')和Pielou均匀度指数(J)分别为2.10和0.58，处于已有研究裂腹鱼类的上游水平。此外，Amundsen图示法和Schoener重叠指数结果均表明，雅砻江中游厚唇裸重唇鱼不同体长组及不同性别之间的饵料生物重叠程度较高，而不同季节采集样本之间的饵料生物重叠程度较低。【结论】雅砻江中游厚唇裸重唇鱼属广食性鱼类，也属偏食底栖无脊椎动物的杂食性鱼类，且相较于体型与性别而言，季节更替对其饵料生物组成的影响更为明显。研究结果丰富了厚唇裸重唇鱼的基础生物学资料，同时为其野生资源保护、人工驯养、饲料研发等提供了基础数据。

关键词：裂腹鱼亚科厚唇裸重唇鱼饵料生物组成摄食特性雅砻江中游

乙醇梭菌蛋白替代鱼粉对日本沼虾生长及代谢的影响

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水生生物学报 2025年

作者：高国栋杨昶 Momodou Saidyleigh 刘波潘良坤夏冬孙存鑫郑肖川周群兰南京农业大学无锡渔业学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心水科院水产养殖动物营养与健康重点实验室

为评估新型蛋白源乙醇梭菌蛋白(CAP)在水产饲料中应用的可行性,文章以日本沼虾(Macrobrachium nipponense)为研究对象,探讨了CAP替代鱼粉后对其生长、代谢等影响。试验设计6组等氮等脂饲料包括D1(对照组、含25%鱼粉)、D2 (CAP替代10%鱼... 详细信息

为评估新型蛋白源乙醇梭菌蛋白(CAP)在水产饲料中应用的可行性,文章以日本沼虾(Macrobrachium nipponense)为研究对象,探讨了CAP替代鱼粉后对其生长、代谢等影响。试验设计6组等氮等脂饲料包括D1(对照组、含25%鱼粉)、D2 (CAP替代10%鱼粉)、D3 (CAP替代20%鱼粉)、D4 (CAP替代30%鱼粉)、D5(CAP替代40%鱼粉)和D6 (CAP替代50%鱼粉), 1200尾初始体重约0.1g的日本沼虾幼虾随机分配到24个圆形塑料养殖桶,设6个处理组,每组4个平行,饲养8周。结果显示, CAP不影响日本沼虾存活率(P>0.05)。与对照组相比,在CAP替代20%鱼粉时,日本沼虾增重率(WGR)、特定生长率(SGR)、饲料系数(FCR)和蛋白质效率(PER)等生长指标均差异不显著(P>0.05);但当鱼粉替代水平超过30%以后,日本沼虾WGR、SGR和PER显著降低, FCR显著升高(P0.05)。在CAP替代鱼粉后,显著提高了日本沼虾肌肉中非必需氨基酸和总氨基酸含量,特别是甘氨酸的含量(P0.05),肝胰腺脂肪酶活性显著高于对照组(P0.05)。总之,在日本沼虾饲料中利用CAP替代20%鱼粉对其生长、蛋白质和脂质代谢无显著影响, CAP可以作为一种新型蛋白源应用于日本沼虾配合饲料中,为菌体蛋白在水产养殖中的应用提供数据支撑。

关键词：乙醇梭菌蛋白鱼粉替代生长营养代谢肝胰腺基因表达日本沼虾

基于COI基因的黄河河南-山东段鲤群体遗传结构分析

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淡水渔业 2025年第02期 43-52页

作者：薛向平孙朝徽刘霞惠筠李学军李秀启司飞河北省渤海鱼类种质资源保护与利用重点实验室中国水产科学研究院北戴河中心实验站中国水产科学研究院渤海渔业研究中心河南省水产科学研究院河南师范大学山东省淡水渔业研究院

为了解黄河河南-山东段黄河鲤（Cyprinus carpio haematopterus）野生和养殖群体的种质资源现状，本研究基于线粒体COI基因序列，对黄河河南-山东段的6个野生和2个养殖群体，共计204尾黄河鲤样本进行了遗传多样性分析。研究结果表明，20... 详细信息

为了解黄河河南-山东段黄河鲤（Cyprinus carpio haematopterus）野生和养殖群体的种质资源现状，本研究基于线粒体COI基因序列，对黄河河南-山东段的6个野生和2个养殖群体，共计204尾黄河鲤样本进行了遗传多样性分析。研究结果表明，204条长度为628 bp的COI基因序列中，碱基A、T、C和G的平均含量分别为26.74%、27.41%、28.01%和17.84%,A+T的含量（54.15%）高于C+G的含量（45.85%）,表现出明显的AT偏倚性。8个黄河鲤群体共检测到18个多态位点，定义了17个单倍型，Hap2、Hap4和Hap5出现频次最高，其中Hap4和Hap5为8个黄河鲤群体共有单倍型，分布于133个样本中，占总样本数的65.20%。核苷酸多样性（Pi）为0.000 97～0.002 54,单倍型多样性（Hd）为0.451～0.837,遗传多样性水平总体偏低，表现出高Hd低Pi。山东东阿（DE）群体的遗传多样性最高，其次为河南三门峡（SMX）群体、河南恼里（NL）群体，最低为河南养殖群体（HNYZ）群体。群体间Fst及遗传距离结果显示，黄河口（HHK）群体与其他群体间存在一定程度遗传分化，但不显著，HHK和DE群体的遗传距离最大，河南段柳园口（LYK）群体和河南养殖（HNYZ）群体的遗传距离最小；8个群体的分子方差分析（AMOVA）显示，变异主要来源于群体内，占总变异86.04%;中性检验和碱基错配分布结果分析表明，黄河鲤群体历史上可能经历过扩张或持续增长，当在环境、捕捞等外部压力减小的情况下种群可能实现快速补充，这为当前种群资源量匮乏形势下黄河鲤的种群资源恢复提供了良好信号。

关键词：黄河鲤(Cyprinus carpio haematopterus) 线粒体COI基因遗传多样性群体遗传进化

基于MaxEnt模型的厚唇裸重唇鱼当下潜在适宜分布

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水生生物学报 2025年第3期49卷 1-12页

作者：吴开阳赵春娴吕红健李筱芹鲁桃秀吴彤飞田辉伍邓华堂姚维志付梅西南大学水产学院农业农村部长江上游水生生物多样性保护研究中心西南大学渔业资源环境研究中心重庆400716 中国水产科学研究院长江水产研究所国家农业科学重庆观测实验站武汉430223

研究以厚唇裸重唇鱼(Gymnodiptychuspachycheilus)为研究对象,基于其53个野外分布位点,并结合筛选后的3组环境因子(包括第1组:气候因子与地形因素;第2组:淡水环境因子;第3组:气候因子、地形因素与淡水环境因子)分别构建MaxEnt模型Ⅰ、... 详细信息

研究以厚唇裸重唇鱼(Gymnodiptychuspachycheilus)为研究对象,基于其53个野外分布位点,并结合筛选后的3组环境因子(包括第1组:气候因子与地形因素;第2组:淡水环境因子;第3组:气候因子、地形因素与淡水环境因子)分别构建MaxEnt模型Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ,分析厚唇裸重唇鱼在长江及黄河流域的当下潜在适生区分布及影响其分布的主要环境因子,并进一步探讨MaxEnt模型在内陆淡水鱼类研究中的应用前景。结果表明:(1)基于3组环境因子所构建MaxEnt模型Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ对厚唇裸重唇鱼当下在长江与黄河流域适宜分布的预测均具有较高的可靠性,在气候因子与地形因子的基础上,淡水环境因子的添加进一步增加了MaxEnt模型的可靠性与准确性;(2)MaxEnt模型对厚唇裸重唇鱼在长江和黄河流域的当下潜在地理分布预测结果与其现有分布基本吻合;(3)在长江与黄河流域,MaxEnt模型筛选出影响厚唇裸重唇鱼分布的主要环境因子包括草本植被横跨小集水区范围(Hb-rang)、上游平均高程(Up-ele)和温度季节性变异系数(Bio4)。研究结果为厚唇裸重唇鱼野生资源养护和栖息地保护提供了理论依据,并为MaxEnt模型在我国其他珍稀濒危鱼类适生区研究中的应用提供借鉴。此外,MaxEnt模型在我国内陆鱼类栖息地保护、鱼类更替及其灭绝驱动因素预测、鱼类群落生物多样性监测与评估、外来(或入侵)鱼类风险评估等方面具有广阔的应用前景。

关键词：最大熵模型适生区分布长江流域黄河流域厚唇裸重唇鱼

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淡水虾功能饲料的研发与产业应用(三)

科学养鱼 2025年第02期 1-3页

作者：刘波中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

大量的研究表明枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌、霍氏肠杆菌、粪肠球菌、戊糖片球菌、芽孢杆菌和双歧杆菌复合益生菌可提高南美白对虾、罗氏沼虾等消化酶活性，增加肠道微绒毛高度、宽度和肠壁厚度，改善肠道菌群的组成，...

大量的研究表明枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌、霍氏肠杆菌、粪肠球菌、戊糖片球菌、芽孢杆菌和双歧杆菌复合益生菌可提高南美白对虾、罗氏沼虾等消化酶活性，增加肠道微绒毛高度、宽度和肠壁厚度，改善肠道菌群的组成，减轻肠道损伤(Chai等，2016；孟霄鹏等，2017; Kewcharoen等，2019; Amoah等，2019; Zuo等，2019; Cao等，2022; Yu等，2022;Wanna等，2023)。

关键词：

西藏水生生物资源与环境本底状况调查(2017—2021)

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水产学报 2025年第03期 116-139页

作者：刘明典朱峰跃朱挺兵李雷王琳刘香江朱仁刘飞岑祥胡飞飞金星袁立来霍斌何德奎刘海平徐玮彤龚进玲王鹏丁放杨瑞斌张驰杜红春陈中祥曹坤扎西拉姆刘绍平段辛斌杨德国贾银涛李应仁李大鹏马波牟振波陈大庆中国水产科学研究院长江水产研究所国家农业科学重庆观测实验站中国水产科学研究院黑龙江水产研究所中国水产科学研究院华中农业大学中国科学院水生生物研究所西藏自治区农牧科学院水产科学研究所

【目的】全面了解西藏水生生物资源和生态环境本底状况。【方法】中国水产科学研究院(长江水产研究所，黑龙江水产研究所，资源环境研究中心)、华中农业大学、中国科学院水生生物研究所和西藏农牧科学院水产科学研究所联合对西藏雅鲁藏... 详细信息

【目的】全面了解西藏水生生物资源和生态环境本底状况。【方法】中国水产科学研究院(长江水产研究所，黑龙江水产研究所，资源环境研究中心)、华中农业大学、中国科学院水生生物研究所和西藏农牧科学院水产科学研究所联合对西藏雅鲁藏布江、怒江、澜沧江、巴松错、哲古错、错那、错鄂(三江四湖)的鱼类种类组成、鱼类资源量、渔业生态环境等开展了系统调查。【结果】(1)2017—2021年西藏三江四湖采集到鱼类53种，隶属于2目5科24属，其中土著鱼45种，外来鱼6种，杂交种鱼2种；(2)基于数量和生物量，雅鲁藏布江上游鱼类优势种包括拉萨裸裂尻鱼、双须叶须鱼、异齿裂腹鱼和尖裸鲤，中游鱼类优势种包括异齿裂腹鱼、巨须裂腹鱼、拉萨裸裂尻鱼、拉萨裂腹鱼，加查至桑日江段国家二级保护动物尖裸鲤和黑斑原鮡的重量占比均显著下降，下游鱼类优势种包括弧唇裂腹鱼、西藏墨头鱼、黄斑熠鮡、墨脱裂腹鱼、平鳍裸吻鱼，怒江鱼类优势种包括裸腹叶须鱼、热裸裂尻鱼、怒江裂腹鱼，澜沧江鱼类优势种主要为光唇裂腹鱼和澜沧裂腹鱼，巴松错鱼类优势种包括异齿裂腹鱼和巨须裂腹鱼，哲古错鱼类优势种包括异尾高原鳅、高原裸鲤和拉萨裸裂尻鱼，错那和错鄂鱼类优势种均为热裸裂尻鱼和异尾高原鳅；(3)外来物种主要分布在雅鲁藏布江中游；(4)西藏三江四湖水质基本符合渔业水质标准，雅鲁藏布江上游水域总氮和总磷的浓度均低于中游和下游。【结论】2017—2021年西藏三江四湖调查到的土著鱼物种数(45种)占西藏历史上土著鱼类物种数(72种)的62.50%，异齿裂腹鱼和拉萨裸裂尻鱼是雅鲁藏布江上游和中游均有的优势种，雅鲁藏布江中游加查至桑日江段濒危物种尖裸鲤和黑斑原鮡的重量占比均显著下降；外来物种主要分布在雅鲁藏布江中游；三江四湖水质基本符合渔业水质标准。此次调查为西藏渔业资源与保护、特色资源可持续利用和生态环境可持续发展提供了重要的科技支撑。

关键词：鱼类资源种类组成优势种环境西藏

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淡水虾功能饲料的研发与产业应用(二)

科学养鱼 2025年第1期 3-5页

作者：刘波中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏无锡214081

二、虾基本习性。(一)切入思路。从虾与池塘养殖本身着手。目前,淡水虾主要还是以池塘养殖为主,池塘中存在非生物的物质,如水、空气和淤泥等;生产者主要是水生植物、藻类、浮游生物等,消费者主要是淡水虾,分解者主要是厌氧、需氧等微生... 详细信息

二、虾基本习性。(一)切入思路。从虾与池塘养殖本身着手。目前,淡水虾主要还是以池塘养殖为主,池塘中存在非生物的物质,如水、空气和淤泥等;生产者主要是水生植物、藻类、浮游生物等,消费者主要是淡水虾,分解者主要是厌氧、需氧等微生物。怎么保持虾、水、病原微生物之间的平衡,主要还是保持合理的虾养殖密度、水生植物、浮游植物和动物的比例,养殖系统中一些生物释放或排泄到水体中的废弃营养物质成为另一些生物的营养物质来源,实现养殖系统内物质和能量的循环利用,进而调控水质、减少病害发生,达到降本提质增效的目的。

关键词：淡水虾池塘养殖虾养殖养殖系统病原微生物营养物质分解者循环利用

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