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昌黎县海域细菌群落和抗生素抗性基因分析

环境科学 2024年第1期45卷 567-575页

作者：王秋水程波刘悦邓婕徐岩孙朝徽袁立艳左嘉司飞高丽娟北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心) 北京100089 中国水产科学研究院农业农村部水产品质量安全控制重点实验室北京100141 中国水产科学研究院北戴河中心试验站秦皇岛066100

为了解秦皇岛昌黎县水产养殖海域微生物分布情况及各种抗性基因的污染状况,使用高通量测序技术,采用16S rDNA基因测序和宏基因组测序方法对春季养殖海域中的海水、底泥及土著鱼类矛尾复鰕虎鱼肠道内容物进行研究.结果表明,海水中以变形... 详细信息

为了解秦皇岛昌黎县水产养殖海域微生物分布情况及各种抗性基因的污染状况,使用高通量测序技术,采用16S rDNA基因测序和宏基因组测序方法对春季养殖海域中的海水、底泥及土著鱼类矛尾复鰕虎鱼肠道内容物进行研究.结果表明,海水中以变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidota)为主要优势菌门;底泥中以变形菌门(Proteobacteria)、泉古菌门(Crenarchaeota)、酸杆菌门(Acidobacteriota)和放线菌门(Actinobacteriota)为主;鰕虎鱼肠道内容物以变形菌门(Proteobacteria)、蓝藻细菌(Cyanobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidota)为主.底泥样本中的微生物多样性最丰富,其次是海水样本,鱼类肠道内容物的微生物多样性最低.且不同位点的同类样本之间微生物多样性较为相似,同一位点的不同类样本中的微生物多样性差别较大.对于不同位点的样本,各位点海水样本之间微生物群落结构均存在显著差异,各位点底泥样本之间差异较小,且有些底泥样本组间不存在显著的微生物组成差异.在所有样本组中,检测到的抗性基因主要为:β-内酰胺类抗生素抗性基因有5个(bla_(OXA-325)、cepS、bla_(CARB-20)、bla_(OXA-55)和bla_(TRU-1)),氨基糖苷类抗生素抗性基因有4个[aac(6′)-IIb、amrA、aac(6′)-Ie-aph(2″)-Ia和aph(3′)-Vc].抗生素抗性基因与微生物群落之间也存在一定的相关性.

关键词：昌黎县海水养殖海水底泥肠道内容物微生物多样性抗生素抗性基因(ARGs)

转食饲料对大口黑鲈幼鱼的存活率、抗氧化酶和消化酶活性及肠道菌群的影响

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中国水产科学 2024年第4期31卷 403-415页

作者：马兴宇唐忠林陈树桥周国勤徐钢春南京市水产科学研究所中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

转食配合饲料是大口黑鲈(Micropterussalmoides)幼鱼培育的一个重要环节,为了找到大口黑鲈幼鱼适宜转食的规格以及转食对幼鱼生理生化的影响,本研究探讨了摄食丰年虫(Artemia salina)幼鱼转食饲料后,其存活率、组织抗氧化酶和消化酶活... 详细信息

转食配合饲料是大口黑鲈(Micropterussalmoides)幼鱼培育的一个重要环节,为了找到大口黑鲈幼鱼适宜转食的规格以及转食对幼鱼生理生化的影响,本研究探讨了摄食丰年虫(Artemia salina)幼鱼转食饲料后,其存活率、组织抗氧化酶和消化酶活性及肠道菌群的变化。实验选取了平均体长分别为(1.06±0.02)cm、(2.04±0.03)cm、(3.02±0.04) cm、(4.05±0.04) cm、(5.01±0.04) cm共5种规格幼鱼,设为体长1 cm、2 cm、3 cm、4 cm、5 cm组进行转食实验,统计了幼鱼自然死亡率、存活率和残食率。通过酶活测定方法对比分析了转食前后幼鱼肝脏与肌肉组织的抗氧化酶活性变化及胃、肠道和幽门盲囊组织的消化酶活性变化。通过高通量测序方法对比分析了转食前后幼鱼肠道菌群的变化。结果显示:(1)体长1cm幼鱼转食死亡率、残食率最高,存活率最低,分别为60.31%、30.85%和8.84%;体长4cm、5cm幼鱼死亡率和残食率为0,存活率为100%,表明规格越大死亡率和残食率越低,存活率越高。(2)转食后肝脏与肌肉的过氧化物歧化酶(SOD)活性分别升高了86.97%和16.62%(P研究可为提高大口黑鲈幼鱼转食存活率及添加外源辅助消化物质研究提供参考。

关键词：大口黑鲈幼鱼转食存活率抗氧化酶消化酶肠道菌群

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脑室注射葡萄糖对翘嘴鳜摄食和糖代谢的影响

水产学报 2024年第4期48卷 298-309页

作者：曾妍芝李红燕王广军谢骏田晶晶龚望宝夏耘张凯李志斐郁二蒙上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部亚热带热带水产资源利用与养殖重点实验室中国水产科学研究院海南创新研究院

为探究鳜下丘脑葡萄糖感知系统的存在和对摄食的影响，实验以翘嘴鳜为研究对象，对鳜分别进行脑室注射生理盐水(对照组)、2-DG (葡萄糖代谢拮抗剂，100 mg/kg)和葡萄糖(10 mg/kg)，探究注射后3、6和12 h不同时间点鳜摄食及糖代谢的响应... 详细信息

为探究鳜下丘脑葡萄糖感知系统的存在和对摄食的影响，实验以翘嘴鳜为研究对象，对鳜分别进行脑室注射生理盐水(对照组)、2-DG (葡萄糖代谢拮抗剂，100 mg/kg)和葡萄糖(10 mg/kg)，探究注射后3、6和12 h不同时间点鳜摄食及糖代谢的响应机制。结果显示，脑室注射葡萄糖显著抑制鳜的摄食，而不同时间点鳜血浆葡萄糖含量无显著差异。脑室注射葡萄糖显著诱导下丘脑葡萄糖激酶基因gk (glucokinase, 6 h)，表明鳜下丘脑葡萄糖感知体系的存在。且脑室注射葡萄糖显著促进可卡因和苯丙胺调节转录肽基因cart(cocaine and amphetamine regulated transcript, 3 h)的表达量，这可能与鳜mTOR (mammalian target of rapamycin)在下丘脑(12 h)和肝脏(6 h)中的基因表达水平的显著上调有关。另外，脑室注射葡萄糖显著诱导鳜肝脏gk (6 h)和pk (pyruvate kinase, 3 h)的表达，促进糖酵解，表明脑室通过感知的葡萄糖水平促进分解代谢为机体供能。综上，本研究首次通过脑室注射葡萄糖探究鳜下丘脑葡萄糖感知系统的存在，同时发现鳜下丘脑对葡萄糖脑室注射存在响应。且脑室注射葡萄糖可能通过对gk的调控影响AMPK/mTOR通路，调控机体食欲相关基因表达进而抑制摄食。研究结果为翘嘴鳜对饲料碳水化合物的高效利用和摄食调控研究提供理论依据。

关键词：翘嘴鳜葡萄糖感知脑室注射摄食调控糖代谢

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膨腹海马不同生长阶段的形态特征研究

南方农业学报 2024年第4期55卷 1216-1224页

作者：赵春暖王晓梅于涛单秀娟任利群郑言鑫李波李致远王喜文陈洋中国水产科学研究院长岛增殖实验站山东烟台265800 中国水产科学研究院贝藻繁育工程技术研究中心山东烟台265800 中国水产科学研究院岛礁渔业研究中心山东烟台265800 中国水产科学研究院资源与环境研究中心北京100141 中国水产科学研究院黄海水产研究所山东青岛266071

【目的】探究膨腹海马(Hippocampus abdominalis)不同生长阶段特殊表型性状及其相关性,筛选出影响2月龄膨腹海马体质量的主要形态性状,为辅助膨腹海马形态学研究及其人工选育打下理论基础。【方法】以人工繁育的10日龄和2月龄膨腹海马... 详细信息

【目的】探究膨腹海马(Hippocampus abdominalis)不同生长阶段特殊表型性状及其相关性,筛选出影响2月龄膨腹海马体质量的主要形态性状,为辅助膨腹海马形态学研究及其人工选育打下理论基础。【方法】以人工繁育的10日龄和2月龄膨腹海马为研究对象,根据需要分别测定下颌长(X1)、上颌长(X2)、吻长(X3)、眼径(X4)、眼后头长(X_(5))、头长(X_(6))、躯干长(X_(7))、尾长(X_(8))、背鳍长(X_(9))、体长(X_(10))及体质量(Y)等表型性状,运用相关分析、主成分分析比较10日龄和2月龄膨腹海马各表型性状间的相关性及主要发育方向,并以通径分析和灰色关联度分析探究2月龄膨腹海马主要形态性状对体质量的影响。【结果】除了10日龄膨腹海马的下颌长与背鳍长间的相关性不显著(P>0.05)外,2个时期其他性状间的相关系数均达显著(P<0.05)或极显著(P<0.01,下同)水平。不同生长阶段膨腹海马主成分聚焦的方向不同,10日龄到2月龄,膨腹海马初始体长增长较快,头吻部生长发育明显,后期则聚焦于躯干部的生长。通径分析结果显示,影响2月龄膨腹海马体质量的主要形态性状是头长和体长,其中体长对体质量的直接影响最大(0.763),而头长主要通过体长间接影响体质量(0.278);构建的回归方程(Y=-1.817+0.038X_(6)+0.029X_(10))可准确预测体质量的变化(F=127.556,P<0.01)。灰色关联度分析结果显示,与2月龄膨腹海马体质量关联度较高的形态性状包括躯干长、尾长、头长和体长,对应的关联系数分别为0.787、0.754、0.745和0.724。不同分析方法得出的结果略有差异,但与体质量关联度较高的形态性状中均含有体长。【结论】10日龄到2月龄膨腹海马的生长从头吻部转移到躯干生长。在以体质量为目标性状选育2月龄膨腹海马时,应以体长为主要选择性状,并兼顾头长、躯干长和尾长的协同选择。

关键词：膨腹海马形态性状体质量通径分析灰色关联度分析

基于D-loop序列和微卫星标记的4个黄颡鱼群体的遗传变异分析

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黑龙江畜牧兽医 2024年第4期 115-127页

作者：李兵部傅建军陶易凡强俊徐跑中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 中国水产科学研究院北戴河中心实验站河北秦皇岛066100

为探究广东珠江、广西漓江、四川金沙江和云南西江4个水系黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)群体的遗传变异情况,本研究分别基于上述水系共108尾黄颡鱼的线粒体D-loop序列和12个微卫星标记对4个黄颡鱼群体进行群体内遗传多样性、群体间... 详细信息

为探究广东珠江、广西漓江、四川金沙江和云南西江4个水系黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)群体的遗传变异情况,本研究分别基于上述水系共108尾黄颡鱼的线粒体D-loop序列和12个微卫星标记对4个黄颡鱼群体进行群体内遗传多样性、群体间遗传距离和变异及群体结构分析。结果表明:共得到105个D-loop序列,其核苷酸组成中A+T含量占比为56.22%,G+C含量占比为43.78%。在105个有效序列中,多态位点数为746个(含缺和无效多态位点),单倍型数为51个。Hap2、Hap25、Hap15分别是广东珠江、广西漓江、四川金沙江群体的优势单倍型。4个黄颡鱼群体的单倍型多样性(H_(d))介于0.842~0.940,核苷酸多样性(π)介于0.002~0.083;四川金沙江群体Hd的最低,π也处于较低水平;而云南西江群体的Hd和π均最高;4个群体的Tajima′s D值均小于0。等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)均为广西漓江群体最高,广东珠江群体次之,云南西江群体较低,四川金沙江群体最低。4个黄颡鱼群体的K2P遗传距离介于0.008~0.115之间,其中广西漓江与云南西江群体间的K2P遗传距离最近;广东珠江群体与其他3个群体的K2P遗传距离较远,与四川金沙江群体的K2P遗传距离最远。4个黄颡鱼群体间均存在极显著的遗传分化(P<0.01),群体间遗传分化指数(F_(st))介于0.114~0.959之间。4个黄颡鱼群体间Nei’s遗传距离和遗传一致性分别介于0.117~1.114之间和0.328~0.890之间,其中,广西漓江群体与云南西江群体的Nei’s遗传距离最近、遗传一致性最高,广东珠江与四川金沙江群体的Nei’s遗传距离最远、遗传一致性最低。在UPGMA系统聚类树中,4个黄颡鱼群体主要分为两支,其中广西漓江群体、云南西江群体最先聚为一支,然后与四川金沙江群体聚为一支,最后与广东珠江群体聚类。在NJ聚类树中,4个群体黄颡鱼的明显分为4个分支,广西漓江群体与云南西江群体呈镶嵌式分布。4个黄颡鱼群体中共享单倍型较少,但特有单倍型较多,其中云南西江和广西漓江群体相邻较近且共有单倍型较多。在基于Nei’s遗传距离进行的主坐标分析中,广西漓江群体和云南西江群体的个体之间遗传差异较小,广东珠江和四川金沙江群体的个体之间遗传差异较大。说明四川金沙江群体遗传多样性水平较低,云南西江群体遗传多样性水平较高,广西漓江群体与云南西江群体存在一定的基因交流。

关键词：黄颡鱼微卫星标记 D-loop序列遗传多样性群体结构

基于耳石微化学特征的鄱阳湖刀鲚永修群体的关键栖息地识别

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湖泊科学 2024年第3期36卷 870-880页

作者：肖百义杨健姜涛刘洪波陈修报南京农业大学无锡渔业学院无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心渔业微化学实验室无锡214081

随着长江禁渔国策的持续实施,长江干流和沿线通江湖泊中刀鲚资源及其关键栖息地将有可能得到恢复。为了确证长江禁渔后的2020年在鄱阳湖永修瓢头水域所采集到21尾刀鲚的洄游履历和资源类型,本研究采用电子探针微区分析技术(EPMA)对其耳... 详细信息

随着长江禁渔国策的持续实施,长江干流和沿线通江湖泊中刀鲚资源及其关键栖息地将有可能得到恢复。为了确证长江禁渔后的2020年在鄱阳湖永修瓢头水域所采集到21尾刀鲚的洄游履历和资源类型,本研究采用电子探针微区分析技术(EPMA)对其耳石元素锶(Sr)和钙(Ca)的微化学特征进行了测定和分析。结果显示,所有个体耳石的Sr/Ca值变化较为复杂。自耳石核心至边缘Sr/Ca值分别出现了对应淡水生境的低值(3),最后边缘部分再次出现了对应洄游返回淡水生境的低Sr/Ca值(研究可为了解长江禁渔对刀鲚资源和关键栖息地的恢复效果提供最新的基础信息。

关键词：刀鲚耳石微化学鄱阳湖永修水域长江禁渔溯河洄游

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怒江源头地区那曲河热裸裂尻鱼繁殖生物学研究

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水生态学杂志 2024年

作者：朱峰跃李钊王起段辛斌陈大庆刘绍平刘明典中国水产科学研究院长江水产研究所国家农业科学重庆观测实验站上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心

了解怒江源头地区那曲河热裸裂尻鱼基础生物学概况，研究其繁殖生物学，可为评估热裸裂尻鱼生态适应性规律、进行资源管理和物种保护提供理论依据。2017年9月、2018年7月和10月在怒江源头那曲河采集309尾热裸裂尻鱼（Schizopygopsis the... 详细信息

了解怒江源头地区那曲河热裸裂尻鱼基础生物学概况，研究其繁殖生物学，可为评估热裸裂尻鱼生态适应性规律、进行资源管理和物种保护提供理论依据。2017年9月、2018年7月和10月在怒江源头那曲河采集309尾热裸裂尻鱼（Schizopygopsis thermalis Herzenstein），进行了生物学参数测定，包括年龄、体长、体重、繁殖力，计算了性比、性腺成熟系数，评估了性成熟年龄，预测了产卵类型。结果显示：热裸裂尻鱼个体绝对繁殖力（F）为2 943～16 657粒，平均（7 685±3 526.66）粒；个体体长相对繁殖力(FL)为10.15～52.71粒/mm，平均（25.00±10.57）粒/mm；个体体重相对繁殖力(FW)为10.68～48.01粒/g，平均（23.91±8.21）粒/g。个体繁殖力与各基础生物学指标的相关性分析显示F、FL与体长、体重、空壳重、卵巢重、年龄和丰满度之间达到了极显著性相关（P0.05），FW仅与卵巢重和性腺成熟系数具有相关性（0.01更多还原AbstractFilter('ChDivSummary', 'ChDivSummaryMore', 'ChDivSummaryReset');

关键词：热裸裂尻鱼繁殖力怒江源头那曲河

基于线粒体COⅠ和Cytb基因探讨北鲍南养对皱纹盘鲍群体遗传结构的影响

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水产学报 2024年第1期48卷 112-122页

作者：吴宙周丽青迟长凤吴彪孙秀俊刘志鸿赵丹于涛郑言鑫浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心海洋生物种质发掘与利用国家地方联合实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院长岛增殖实验站

为探讨近三十年来我国皱纹盘鲍养殖模式对群体遗传结构产生的影响，利用线粒体细胞色素C氧化酶亚基(COⅠ)基因和细胞色素b (Cytb)基因分析了定殖漳州的群体、大连培育蓬莱越冬群体、荣成培育福建越冬群体及长山列岛(砣矶岛、大钦岛、南... 详细信息

为探讨近三十年来我国皱纹盘鲍养殖模式对群体遗传结构产生的影响，利用线粒体细胞色素C氧化酶亚基(COⅠ)基因和细胞色素b (Cytb)基因分析了定殖漳州的群体、大连培育蓬莱越冬群体、荣成培育福建越冬群体及长山列岛(砣矶岛、大钦岛、南隍城岛)皱纹盘鲍群体的遗传多样性与群体遗传结构。结果显示，在259个个体730 bp的COⅠ序列片段中检测到48个变异位点和30个单倍型，6个群体的单倍型多样性为0.586～0.897，核苷酸多样性为0.005 6～0.008 1。259个个体730 bp的Cytb序列片段中检测到59个变异位点和32个单倍型，6个群体的单倍型多样性为0.605～0.909，核苷酸多样性为0.007 7～0.012 0。基于COⅠ和Cytb基因的群体间Fst值以及AMOVA结果表明，绝大部分群体之间存在显著的遗传分化，并且遗传变异主要来源于群体内。现行的皱纹盘鲍北鲍南养模式加强了不同群体之间的基因交流，使不同遗传背景的种群二次接触，导致皱纹盘鲍6个群体均具有较高的单倍型多样性和核苷酸多样性；而各养殖群体中的不同选育条件则可能是造成显著遗传分化的重要原因。本研究对分属南北沿海的6个皱纹盘鲍群体的遗传评估将为我国皱纹盘鲍资源的合理利用以及养殖模式对遗传结构的影响提供科学依据。

关键词：皱纹盘鲍细胞色素C氧化酶亚基基因细胞色素b基因遗传多样性遗传结构

5-HMF对黄条鰤生长、肠道组织结构及生理特性的影响

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中国水产科学 2024年第2期31卷 185-196页

作者：冯元周鹤庭徐永江崔爱君姜燕陈伟中国水产科学研究院黄海水产研究所深蓝渔业工程联合实验室上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心中科国生(杭州)科技有限公司

为了分析在饲料中添加5-HMF (5-羟甲基糠醛)对黄条鰤(Seriola aureovittata)幼鱼生长、肠道组织结构、血清生化特性、消化道菌群结构等方面的影响,选用360尾平均体重(82.33±2.75)g的黄条鰤,随机分为4组(M0组、M1组、M2组、M3组),每组3... 详细信息

为了分析在饲料中添加5-HMF (5-羟甲基糠醛)对黄条鰤(Seriola aureovittata)幼鱼生长、肠道组织结构、血清生化特性、消化道菌群结构等方面的影响,选用360尾平均体重(82.33±2.75)g的黄条鰤,随机分为4组(M0组、M1组、M2组、M3组),每组3个重复,每个重复30尾鱼,M0组为对照组,投喂基础饲料,M1组、M2组、M3组分别投喂添加5-HMF (添加量分别为0.25%、0.5%、1%)的基础饲料,实验持续6周。结果显示:体外Caco-2细胞(人结直肠腺癌细胞)增殖实验表明,本研究所用5-HMF浓度在安全范围内;M2和M3组实验鱼的增重率和特定生长率显著高于M0组(P实验鱼肠道肌层厚度和绒毛高度显著高于M0组(P实验鱼血清免疫球蛋白M(IgM)和碱性磷酸酶(AKP)水平显著高于M0组(P实验饲料可以提升黄条鰤幼鱼生长性能,提高血清免疫酶活水平和抗氧化能力,对肠道组织和菌群结构起到一定的优化调节作用,可为开发黄条鰤健康养殖技术和绿色饲料添加剂提供理论支撑。

关键词： 5-羟甲基糠醛(5-HMF) 黄条鰤肠道组织结构生长抗氧化菌群微生态