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N^(6)-甲基化腺苷修饰在乳腺癌中的研究进展

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生命科学 2024年第3期36卷 343-352页

作者：马唯吴宇丹张红艳李彦姝中国医科大学口腔医学院沈阳110122 中国医科大学护理学院沈阳110122 中国医科大学生命科学学院分子细胞生物学教研室教育部医学细胞生物学重点实验室暨卫健委细胞生物学重点实验室沈阳110122

表观遗传学在乳腺癌的恶性进展中起到重要作用,其中N^(6)-甲基化腺苷(m^(6)A)修饰是最丰富的RNA修饰,参与调节乳腺癌细胞恶性行为的通路及癌细胞所处的肿瘤微环境。同时,乳腺癌发病率居于我国女性恶性肿瘤首位,近年来首次发病年龄趋于... 详细信息

表观遗传学在乳腺癌的恶性进展中起到重要作用,其中N^(6)-甲基化腺苷(m^(6)A)修饰是最丰富的RNA修饰,参与调节乳腺癌细胞恶性行为的通路及癌细胞所处的肿瘤微环境。同时,乳腺癌发病率居于我国女性恶性肿瘤首位,近年来首次发病年龄趋于年轻化,是严重危及我国女性健康的疾病之一。然而,乳腺癌早期治疗预后较好。当晚期出现转移后,患者5年生存率差。m^(6)A作为一种可能用于乳腺癌早筛的生物标志物及新的药物治疗靶点,给乳腺癌的早期治疗提供了新的研究方向。本文系统地综述了m^(6)A修饰相关因子及其在乳腺癌恶性行为中发挥的调控作用,并列出现已知的一些靶向药物和潜在的早筛方法,为乳腺癌的诊断、治疗、监测提供新的思路。

关键词： N^(6)-甲基化腺苷乳腺癌信号通路药物

肝癌细胞株-乙型肝炎病毒DNA整合事件的高通量靶向捕获测序分析

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陆军军医大学学报 2024年第2期46卷 110-117页

作者：羊泽锐邓海君胡源重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400016

目的采用探针捕获和高通量测序技术研究HepG2.2.15与HepAD38 2个乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)肝癌细胞系中病毒DNA在宿主基因组中的整合位点特征。方法提取HepG2.2.15与HepAD38细胞基因组DNA,采用探针捕获和高通量测序策略对... 详细信息

目的采用探针捕获和高通量测序技术研究HepG2.2.15与HepAD38 2个乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)肝癌细胞系中病毒DNA在宿主基因组中的整合位点特征。方法提取HepG2.2.15与HepAD38细胞基因组DNA,采用探针捕获和高通量测序策略对2个肝癌细胞株中整合的HBV DNA进行捕获测序,使用Trimmomatic、BBAP、BWA(Burrows-Wheeler Aligner)等生物信息学软件进行数据分析;最后通过聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)及克隆测序对病毒DNA整合特征进行验证。结果利用探针捕获和高通量测序技术分别在HepG2.2.15与HepAD38细胞系中检测出12、7个HBV DNA整合事件,随机分布在chr1、chr2、chr7、chr9、chr16、chr17、chr19、chrX染色体上,整合位点上下游基因出现频率较高的有DPP7、TRIM56、GPC3等。结论成功建立基于探针捕获和高通量测序技术检测HBV DNA在宿主基因组上的整合片段的方法,HepG2.2.15与HepAD38细胞系中HBV整合事件在染色体上随机发生,大部分整合位点发生在HBV基因组上的X基因区域。

关键词：乙型肝炎病毒 HBV整合探针捕获高通量测序克隆测序

卵巢癌结构域蛋白酶-1基因拮抗IFN-α抗病毒效应研究

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第5期44卷 382-389页

作者：周明慧江彦君宋术义胡源重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400016

目的研究卵巢癌结构域蛋白酶-1(ovarian tumor domain-containing protease-1,OTUD1)基因对Ⅰ型干扰素信号通路的影响以及对IFN-α抗病毒效应的影响。方法双荧光素酶报告试验检测OTUD1基因对IFN-α诱导的干扰素刺激应答元件(interferon-... 详细信息

目的研究卵巢癌结构域蛋白酶-1(ovarian tumor domain-containing protease-1,OTUD1)基因对Ⅰ型干扰素信号通路的影响以及对IFN-α抗病毒效应的影响。方法双荧光素酶报告试验检测OTUD1基因对IFN-α诱导的干扰素刺激应答元件(interferon-stimulated response elements,ISRE)启动子转录活性的影响;实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测OTUD1对IFN-α诱导的干扰素刺激基因(interferon-stimulated genes,ISGs)表达水平的影响;Western blot检测OTUD1对干扰素信号通路关键分子表达的调控作用,qPCR和ELISA检测其对IFN-α抑制乙型肝炎病毒复制的影响。结果在HEK293T和Huh7.0细胞中,OTUD1下调了干扰素信号通路下游的ISRE启动子转录活性以及ISG15和ISG56等抗病毒基因的表达。在HEK293T细胞中,OTUD1降低了磷酸化蛋白质酪氨酸激酶(phospho-Jak1,p-JAK1)的蛋白质表达水平,但是OTUD1酶活突变体C320S不能调控ISGs和p-JAK1的表达。在Huh7.0细胞中,OTUD1降低了IFN-α抑制乙型肝炎病毒复制的效应。结论OTUD1通过其泛素化酶活性下调p-JAK1的蛋白质表达水平,抑制干扰素JAK-STAT信号通路及ISGs表达。OTUD1拮抗IFN-α抑制病毒复制的效应可能与干扰素诱导的JAK-STAT信号通路有关。

关键词：卵巢癌结构域蛋白酶-1(OTUD1) IFN-α JAK-STAT信号通路抗病毒

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脉络丛及其与衰老相关疾病的关系

遗传 2024年第2期46卷 109-125页

作者：杨韵霏沈义栋重庆医科大学附属第一医院老年病科重庆400016 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所) 细胞生物学国家重点实验室细胞信号网络协同创新中心上海200031 中国科学院大学北京100049

脉络丛由位于基底层上的上皮细胞组成,相邻脉络丛上皮细胞之间的紧密连接形成了血脑脊液屏障,它与血脑屏障一起对大脑微环境的稳态至关重要。脉络丛上皮可向脑室分泌脑脊液、生长因子、神经肽和脂类物质,同时脉络丛也是免疫细胞进入大... 详细信息

脉络丛由位于基底层上的上皮细胞组成,相邻脉络丛上皮细胞之间的紧密连接形成了血脑脊液屏障,它与血脑屏障一起对大脑微环境的稳态至关重要。脉络丛上皮可向脑室分泌脑脊液、生长因子、神经肽和脂类物质,同时脉络丛也是免疫细胞进入大脑的门户。衰老和神经退行性疾病的病理生理学仍然还存在大量未知,越来越多的研究将脉络丛与这些年龄相关性疾病的病因关联起来。本文综述了目前已知的脉络丛上皮与年龄相关疾病之间的关系,以期为防治相关疾病提供新的线索。

关键词：脉络丛脑脊液衰老神经退行性疾病

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PFAS混合暴露与高尿酸血症关联的研究

中国环境科学 2024年

作者：冯雨浦少威陈祝梅朱俊亮蔡伟杰刘红波中国医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室中国医科大学环境应激与慢病防控教育部重点实验室

为评估全氟和多氟烷基物质（PFAS）及其混合物对高尿酸血症（HUA）的关联及综合效应并识别其中的关键组分，本研究基于美国国家健康和营养检查调查（NHANES）数据，使用Logistic回归、加权分位数和回归和贝叶斯核机回归对2013-2016年256... 详细信息

为评估全氟和多氟烷基物质（PFAS）及其混合物对高尿酸血症（HUA）的关联及综合效应并识别其中的关键组分，本研究基于美国国家健康和营养检查调查（NHANES）数据，使用Logistic回归、加权分位数和回归和贝叶斯核机回归对2013-2016年2564名研究对象进行分析。当PFAS作为单一污染源暴露时，较高水平的全氟烷基壬酸（PFNA）、直链全氟烷基辛酸（n-PFOA）和单甲基支链全氟辛烷磺酸异构体（Sm-PFOS）与HUA存在正向关联（P<0.05）。将其视为混合物暴露时，PFAS混合物与HUA总体呈正相关，PFAS混合物（WQS指数）每增加一个四分位数，HUA患病风险增加39.6%（OR=1.396，95%CI：1.180～1.651，P<0.001），且这种关联仅存在于在女性人群中。n-PFOA和Sm-PFOS是其中的关键组分，直链全氟辛烷磺酸（n-PFOS）和全氟己烷磺酸（PFHxS）在混合物中可能与HUA呈负相关，多种PFAS之间可能存在潜在的交互作用。

关键词：高尿酸血症全氟和多氟烷基物质混合物贝叶斯核机回归加权分位数和回归

CRISPR筛选在衰老研究中的应用（英文）

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第9期40卷 1186-1196页

作者：徐嘉鑫荆耀彬曲静刘光慧海南医科大学(海南省医学科学院)衰老与肿瘤国际研究中心膜生物学国家重点实验室器官再生与智造重点实验室北京干细胞与再生医学研究院干细胞与生殖生物学国家重点实验室中国衰老标志物研究联合体

CRISPR基因编辑技术的发展改变了我们对人类基因组的理解，推动分子和细胞生物学研究迈向新的领域，加速了生命科学和医学的进展。基于CRISPR的基因筛选工具凭借其高效和便捷的优势，广泛应用于多个生物学领域。衰老是一个受遗传和表观... 详细信息

CRISPR基因编辑技术的发展改变了我们对人类基因组的理解，推动分子和细胞生物学研究迈向新的领域，加速了生命科学和医学的进展。基于CRISPR的基因筛选工具凭借其高效和便捷的优势，广泛应用于多个生物学领域。衰老是一个受遗传和表观遗传等多种因素调控的复杂过程，解析衰老调控基因有助于理解衰老、开发衰老评估和干预策略。本文概述了CRISPR筛选工具的进展及其在衰老研究中的应用，并展望其发展前景。CRISPR相关基因操纵工具有望成为延缓衰老和干预衰老相关疾病的重要手段。

关键词：规律间隔成簇短回文重复序列基因筛选衰老

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弓形虫肌动蛋白抗原表位抗体的制备及应用

中国动物传染病学报 2024年第4期32卷 73-78页

作者：庄宝灿朱进进余莉安徽医科大学病原生物学教研室、病原生物学安徽省重点实验室人畜共患病安徽高校省级重点实验室合肥230032

制备弓形虫肌动蛋白(TgActin)多肽表位抗体并探讨其应用价值。BepiPred 1.0 Server在线分析设计TgActin抗原表位,并与多种属Actin进行同源比对,选取并合成高特异性多肽片段序列免疫新西兰兔。末次免疫后收集兔血清并使用Protein G纯化抗... 详细信息

制备弓形虫肌动蛋白(TgActin)多肽表位抗体并探讨其应用价值。BepiPred 1.0 Server在线分析设计TgActin抗原表位,并与多种属Actin进行同源比对,选取并合成高特异性多肽片段序列免疫新西兰兔。末次免疫后收集兔血清并使用Protein G纯化抗体,SDS-PAGE检测抗体纯度,ELISA测定抗体效价,Western blot分析抗体的特异性及TgActin表位抗体作为内参抗体的可能性,免疫荧光观察胞内速殖子形态。结果显示,ELISA测定抗体效价为1∶128000,Western blot结果显示抗体特异性识别弓形虫Actin,免疫荧光染色显示TgActin表位抗体可以标记纳虫泡内速殖子。结果表明,成功制备了TgActin多肽表位抗体,可用做弓形虫蛋白检测的内参抗体及其在细胞内的免疫荧光检测,为后续弓形虫研究提供了便利条件。

关键词：弓形虫肌动蛋白表位抗体内参抗体免疫荧光

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基于网络药理学和动物体内试验验证云实感冒合剂对呼吸道合胞病毒作用

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第2期44卷 170-182页

作者：徐庆胜李玉迁蒋立娜魏洪迟茜文廖思睿陈维娇贵州医科大学基础医学院国家级实验教学中心微生物学教研室贵州省普通高校学校病原生物学特色重点实验室贵阳550025 贵州医科大学基础医学院微生物学教研室贵州省普通高校学校病原生物学特色重点实验室贵阳550025 贵州医科大学基础医学院国家级实验教学中心贵阳550025

目的基于网络药理学和体内试验探讨云实感冒合剂抗呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的作用机制。方法网络药理学预测:运用TCMSP、GeneCards等数据库预测云实感冒合剂干预RSV的活性成分及作用靶点。利用Cytoscape 3.2.1... 详细信息

目的基于网络药理学和体内试验探讨云实感冒合剂抗呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的作用机制。方法网络药理学预测:运用TCMSP、GeneCards等数据库预测云实感冒合剂干预RSV的活性成分及作用靶点。利用Cytoscape 3.2.1软件构建中药成分-疾病靶点网络图。通过STRING数据库分析蛋白质相互作用关系。借助Metascape数据库进行富集分析。采用分子对接技术分析验证网络药理学结果。云实感冒合剂干预RSV感染验证试验:滴鼻法建立RSV小鼠模型,灌胃合剂后检测血常规、肺指数,观察肺组织病理变化,流式细胞术检测外周血T细胞亚群,ELISA检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β含量,RT-PCR检测肺组织中TLR4、NF-κB和RSV-N基因mRNA相对水平。结果分析获得云实感冒合剂有效活性成分41个,抗RSV靶点111个,富集得到167条信号通路,主要是PI3K/AKT、MAPK、Toll-like等信号通路。分子对接结果显示,云实感冒合剂活性成分木犀草素、山奈酚、槲皮素与RSV-G、RSV-F、PI3K、AKT1、Bcl-2结合能均小于0 kcal/mol。体内试验结果显示,与RSV组相比,云实感冒合剂高剂量组白细胞、淋巴细胞计数升高、肺指数降低,差异有统计学意义(P细胞浸润,利巴韦林组和云实感冒合剂低、中、高剂量组中肺泡大小趋向均匀,肺泡壁厚度均一。与RSV组相比,云实感冒合剂低、中、高剂量组的CD3^(+)、CD4^(+)、CD8^(+)T淋巴细胞数量明显升高,CD4^(+)/CD8^(+)T细胞数量比值降低,血清中TNF-α、IL-6、IL-1β含量下降,肺组织中病毒载量和TLR4、NF-κB mRNA水平降低,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论云实感冒合剂通过多成分、多靶点、多通路发挥调控RSV感染,主要通过缓解肺组织病理损伤,减轻炎症反应,其机制可能与抑制TLR4/NF-κB通路激活有关。

关键词：云实感冒合剂网络药理学呼吸道合胞病毒体内试验分子对接

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MARK2与肿瘤相关性的研究进展

现代肿瘤医学 2024年第20期32卷 3976-3979页

作者：孙露函李婉明中国医科大学中英联合学院辽宁沈阳110122 中国医科大学生命科学学院卫生部细胞生物学重点实验室医学细胞生物学教育部重点实验室分子细胞生物学教研室辽宁沈阳110122

微管亲和性调节激酶2(microtubule affinity regulating kinase 2,MARK2)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,属于高度保守的钙调蛋白依赖性蛋白激酶家族。研究发现MARK2参与了细胞的多种生命活动调节,如细胞迁移、细胞极化、细胞增殖等。最... 详细信息

微管亲和性调节激酶2(microtubule affinity regulating kinase 2,MARK2)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,属于高度保守的钙调蛋白依赖性蛋白激酶家族。研究发现MARK2参与了细胞的多种生命活动调节,如细胞迁移、细胞极化、细胞增殖等。最近研究表明MARK2与多种肿瘤的发生发展密切相关。该文就MARK2的分子结构、分子功能及其近年来与多种恶性肿瘤相关性研究进行综述,望为恶性肿瘤的诊断和治疗提供一些参考。

关键词：微管亲和性调节激酶2 肿瘤综述