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IL-4对肠道期旋毛形线虫感染的抵抗作用

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2024年

作者：骆泽妮吴安琪汪志锴潘晋孙希萌首都医科大学基础医学院病原生物学系首都医科大学基础医学院

目的探讨小鼠白细胞介素-4 (IL-4)对肠道期旋毛形线虫感染的抵抗作用。方法消化旋毛虫保种小鼠肌肉收集肌幼虫。超声破碎肌幼虫虫体后离心，过滤上清制备旋毛虫抗原。将10只野生型小鼠随机分成未感染组和感染组，每组5只；另随机取4只... 详细信息

目的探讨小鼠白细胞介素-4 (IL-4)对肠道期旋毛形线虫感染的抵抗作用。方法消化旋毛虫保种小鼠肌肉收集肌幼虫。超声破碎肌幼虫虫体后离心，过滤上清制备旋毛虫抗原。将10只野生型小鼠随机分成未感染组和感染组，每组5只；另随机取4只IL-4敲除（IL-4KO）鼠作为敲除感染组。感染组和敲除感染组每鼠灌胃旋毛虫肌幼虫400条，未感染组灌胃等体积PBS。感染旋毛虫后8 d，采集小鼠眼眶静脉血，取十二指肠和近端空肠2～3 cm，并分离肠系膜淋巴结。离心收集小鼠眼眶静脉血血清，ELISA检测单核细胞趋化因子（MCP-1）含量。十二指肠和近端空肠制备石蜡切片后进行苏木精-伊红（HE）染色，使用AperioImageScope12.4.3测量测量十二指肠、空肠的肠绒毛和隐窝的长度与杯状细胞的数量和大小，计算肠绒毛长度/隐窝长度的比值（V/C）和杯状细胞数/绒毛长度的比值（GC/V）。分离肠系膜淋巴结中的淋巴细胞，与旋毛虫抗原（10μg/ml）共培养72 h后收集细胞上清，高通量液相蛋白芯片（Luminex）技术检测IL-1β、IL-12p70、IL-2、IL-5、IL-6、干扰素γ (IFN-γ)、肿瘤坏死因子α (TNF-α)的含量。使用SPSS26.0统计软件对数据进行分析，两两比较采用独立样本t检验，多样本比较采用单因素方差分析。结果 ELISA结果显示，未感染组、感染组、敲除感染组小鼠血清中MCP-1含量分别为（344.90±21.80）、（350.50±38.30）、（467.94±190.01） pg/ml，敲除感染组高于感染组（t=0.681,P 0.05、 0.05)；敲除感染组十二指肠和空肠GC/V分别为9.66±0.88、7.33±0.88，均高于感染组（F=17.12、16.78，均P 0.05)；敲除感染组十二指肠和空肠杯状细胞大小分别为（12.39±1.17）、（11.05±0.60）μm，均大于感染组（F=18.47、16.22，均P <0.05）。Luminex结果显示，未感染组小鼠淋巴细胞培养上清中IL-1β、IL-12p70、IL-2、IL-5、IL-6、IFN-γ、TNF-α的含量分别为（0.39±0.03）、（1.02±0.07）、（0.72±0.36）、（0.62±0.34）、（3.01±1.01）、（0.32±0.01）、（1.53±0.85） pg/ml，感染组的含量分别为（0.45±0.03）、（1.03±0.04）、（1.00±0.38）、（0.64±0.16）、（0.62±0.24）、（0.57±0.09）、（0.94±0.31） pg/ml，敲除感染组的含量分别为（0.80±0.37）、（2.70±0.94）、（49.76±16.40）、（25.25±3.26）、（12.51±4.86）、（51.20±8.93）、（15.86±2.74） pg/ml，敲除感染组的IL-12p70、IL-2、IL-5、IL-6、IFN-γ、TNF-α均高于感染组（F=5.52、24.73、48.72、5.00、123.10、50.55,P <0.05、0.01、0.01、0.05、0.01、0.01）。结论 IL-4在旋毛虫感染肠道期能够降低小鼠血清中MCP-1含量，减缓十二指肠及空肠的炎症反应，可能会影响炎性细胞因子的分泌；在小鼠旋毛虫感染肠道期起着保护性免疫作用，是感染的保护性关键因子，对于抵抗旋毛虫早期感染有重要作用。

关键词：旋毛形线虫 IL-4 肠道期

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黑磷纳米片在帕金森病中的治疗作用

中国生物化学与分子生物学报 2024年第8期40卷 1112-1118页

作者：袁佳丽张春林雷莉基础医学院生物教研室基础医学院分子医学工程中心贵州医科大学贵阳561113

帕金森病是一种中枢神经系统变性疾病,为多基因遗传。因中脑多巴胺代谢失调而引起运动障碍等症状。目前,尽管用于治疗帕金森病的药物是针对该疾病发病机制开发的,但是由于在血脑屏障渗透性方面仍存在着一定的缺陷,导致这些药物的治疗效... 详细信息

帕金森病是一种中枢神经系统变性疾病,为多基因遗传。因中脑多巴胺代谢失调而引起运动障碍等症状。目前,尽管用于治疗帕金森病的药物是针对该疾病发病机制开发的,但是由于在血脑屏障渗透性方面仍存在着一定的缺陷,导致这些药物的治疗效果不佳。纳米材料为帕金森病的药物治疗提供了解决方案,能够将药物靶向到特定区域,解决药物缺乏特定部位的递送问题。纳米材料具有独特的物理化学特性,可以通过不同的机制穿越血脑屏障。最新研究表明,携带纳米载体和合适配体的治疗药物,有助于改善亲、疏水性药物在大脑中的分布,实现特定部位的药物递送。黑磷是近5年备受关注的新型纳米材料,因其独特结构赋予的性能,包括优越的光热/光动力特性、还原性、高载药能力以及良好的生物相容性等,被广泛应用于生物医药领域研究。在这篇综述中,我们将介绍帕金森病的病理机制以及黑磷纳米片在帕金森病治疗中的适用性。

关键词：帕金森病黑磷纳米片血脑屏障神经保护作用

miR-485-5p靶向氧连接的N-乙酰氨基葡萄糖转移酶抑制前列腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第2期40卷 258-268页

作者：胡东来赵梓岐李元杨丽雷艳丽楚元奎宁夏医科大学临床医学院检验学系银川750004 宁夏医科大学基础医学院科研平台银川750004 宁夏医科大学总医院医学实验中心银川750004

前列腺癌是男性生殖系统最常见的恶性肿瘤。尽管采用雄激素剥夺疗法等策略在一定程度上对治疗前列腺癌有效,但大多数患者最终会进展为临床尚无有效治疗手段的去势抵抗性前列腺癌。因此,寻找新的更加有效的前列腺癌治疗靶点就显得尤为关... 详细信息

前列腺癌是男性生殖系统最常见的恶性肿瘤。尽管采用雄激素剥夺疗法等策略在一定程度上对治疗前列腺癌有效,但大多数患者最终会进展为临床尚无有效治疗手段的去势抵抗性前列腺癌。因此,寻找新的更加有效的前列腺癌治疗靶点就显得尤为关键。多项研究表明,微RNA(microRNAs,miRNAs)的异常表达与肿瘤的发生相关。已有报道显示,miRNA-485-5p(miR-485-5p)在多种肿瘤中发挥抑癌作用,但其在前列腺癌中的作用在较大程度上仍未可知。本研究旨在探究miR-485-5p在前列腺癌细胞增殖、迁移与侵袭的作用与机制。生物信息学预测和qRT-PCR检测发现,miR-485-5p在前列腺癌中表达下调。平板克隆形成实验、Transwell实验和划痕愈合实验证明,转染miR-485-5p模拟物显著抑制前列腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭。生物信息学预测、双荧光素酶报告法、Western印迹和qRT-PCR检测证实,氧连接的N-乙酰氨基葡萄糖转移酶(O-linked N-acetylglucosamine transferase,OGT)是miR-485-5p的一个下游直接靶标。进一步的分析和检测显示,OGT在前列腺癌中呈高表达,转染OGT的siRNA能够显著抑制前列腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭,同时有效逆转转染miR-485-5p抑制物所发挥的促癌作用。综上所述,miR-485-5p可以通过负向调控OGT进而抑制前列腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭。本研究结果有助于进一步阐释miR-485-5p在前列腺癌中发生发展的作用和机制,可为寻找前列腺癌的治疗靶点提供实验依据。

关键词： miR-485-5p 前列腺癌氧连接的N-乙酰氨基葡萄糖转移酶增殖迁移

NCOR2基因通过调控PI3K/AKT通路促进食管鳞状细胞癌KYSE450细胞迁移和侵袭

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中国肿瘤生物治疗杂志 2024年第4期31卷 342-350页

作者：姚佳丽石秀枝程圣旗张雨彤安哲昆王彦强山西医科大学基础医学院山西太原030001 山西医科大学转化医学研究中心山西太原030001

目的:探究核受体辅阻遏物2(NCOR2)基因对食管鳞状细胞癌(ESCC)发生发展的影响及其潜在的分子调控机制。方法:收集2017年5月至2018年7月间在山西省肿瘤医院确诊的155例ESCC患者的癌及癌旁组织标本及临床资料,利用患者的转录组和临床病理... 详细信息

目的:探究核受体辅阻遏物2(NCOR2)基因对食管鳞状细胞癌(ESCC)发生发展的影响及其潜在的分子调控机制。方法:收集2017年5月至2018年7月间在山西省肿瘤医院确诊的155例ESCC患者的癌及癌旁组织标本及临床资料,利用患者的转录组和临床病理数据进行生存预后分析及临床关联性分析。采用qPCR法检测6种ESCC细胞(TE-1、TE-5、TE-9、KYSE150、KYSE180和KYSE450)中NCOR2基因的表达水平,筛选NCOR2基因高表达的KYSE450细胞进行siRNA敲低实验,构建敲降NCOR2的细胞模型。利用CCK-8、克隆形成、细胞划痕和Transwell实验检测敲低NCOR2对KYSE450细胞增殖活性、克隆形成、迁移和侵袭能力的影响。对NCOR2敲低的KYSE450细胞进行转录组测序分析,筛选差异表达基因,进行GO和KEGG富集分析,解析NCOR2可能影响的信号调控网络。结果:NCOR2在ESCC组织中表达水平显著高于癌旁组织(P0.05)。在KYSE450细胞中敲低NCOR2基因后,转录组测序分析后发现54个基因发生了显著上调、127个基因发生了显著下调。KEGG分析发现,显著差异基因富集于PI3K/AKT分子信号通路(P<0.01),该通路中的4个基因PIK3R3、IL4R、COL1A1、EFNA1的表达水平在155例ESCC患者临床样本的转录组数据中与NCOR2呈显著正相关(均P<0.01),与转录组测序结果相吻合。结论:NCOR2可以通过影响PI3K/AKT信号通路并促进KYSE450细胞迁移与侵袭,进而影响ESCC的发生与发展。

关键词：核受体辅阻遏物2 食管鳞状细胞癌 KYSE450细胞迁移侵袭 PI3K/AKT信号通路

成果导向理念下创新融合项目式团队学习的医学分子生物学课程思政教学模式探索

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中国生物化学与分子生物学报 2024年

作者：王雅梅孔璐张静周妍卢雅彬牛静秦琼首都医科大学基础医学院生物化学与分子生物学学系

结合专业课特点全面推进课程思政建设，提升课程思政教育的实效性，是新时期高等教育改革的重点。分子生物学作为高等院校医学专业学生重要的基础课程，与基础医学各学科和临床医学之间有着密切的联系，是一门发展迅速的前沿学科，具备... 详细信息

结合专业课特点全面推进课程思政建设，提升课程思政教育的实效性，是新时期高等教育改革的重点。分子生物学作为高等院校医学专业学生重要的基础课程，与基础医学各学科和临床医学之间有着密切的联系，是一门发展迅速的前沿学科，具备作为课程思政载体的天然优势。本研究以立德树人为成果导向（OBE），创新性融合基于项目的团队学习（PBGS）教学模式，应用于医学分子生物学课程思政教学中，二者的有机融合为提升课程思政教学的实效性和科学性做了有益的探索。以学生为中心，通过完善教学目标，创新教学设计，深入挖掘思政案例，引入多种教学方法、强化教学实践管理和优化评价模式，构建线上线下相结合的医学分子生物学课程思政教学体系。经过2年的教学实践，该教学模式有效提升了医学分子生物学课程的教学效果，实践组学生的学习成绩有明显提高，师生评价优秀。课前及课后的调查问卷结果显示，80%～90%的学生认为通过学习拓展了视野，增长了学识，50%～70%的学生认为提升了学习能力和创新意识，坚定了医学专业学习的自信。通过强化学生科研创新能力的培养，指导学生参加学科竞赛获多项国家级奖。证明该教学模式拓展了课程思政教育的广度和深度，将科学精神、创新能力、道德修养、人文素质的培育贯穿在教学过程中，为培养德才兼备和高素质的医学人才提供了经验。

关键词：成果导向理念融合基于项目的团队学习教学模式医学分子生物学课程思政

数据挖掘并验证人参总皂苷改善酒精性肝炎的机制

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中国实验方剂学杂志 2024年第21期 95-103页

作者：陈书灵刘逸韬吴骁张朵艾金慧袁桃花孙见飞贵州医科大学基础医学国家级实验教学示范中心

目的：通过数据分析和实验验证探究人参总皂苷改善酒精性肝炎（AH）的新靶点和中药，为AH的临床治疗提供新方向。方法：该研究前期从GEO数据库筛选GSE28619作为分析对象，选择GSE83148和GSE103580作为验证集。基于limma包和加权基因共... 详细信息

目的：通过数据分析和实验验证探究人参总皂苷改善酒精性肝炎（AH）的新靶点和中药，为AH的临床治疗提供新方向。方法：该研究前期从GEO数据库筛选GSE28619作为分析对象，选择GSE83148和GSE103580作为验证集。基于limma包和加权基因共表达网络分析方法（WGCNA）识别AH相关差异基因和模块基因；通过“Venny”软件取交集基因。构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，并进行富集分析，再进一步筛选核心基因评估其诊断价值。经过数据集验证后，综合分析出AH新潜在靶点并预测中药。对靶点和中药有效成分进行分子对接，并通过实验验证。将48只SD大鼠随机分出8只为空白组，剩下进行乙醇灌胃造模成功后随机均分为人参总皂苷低(10 mg·kg-1)、中(20 mg·kg-1)、高(40 mg·kg-1)剂量组、模型组和美他多辛组(117 mg·kg-1)，空白组以等量生理盐水灌胃。灌胃3周后取血清测定血清天冬氨酸氨基转移酶（AST）、丙氨酸氨基转移酶（ALT）水平；取肝组织进行苏木素-伊红（HE）染色、蛋白免疫印迹法（Western blot）和实时荧光定量聚合酶链式反应（Real-time PCR）检测肝组织潜在靶点蛋白和基因表达水平。结果：数据分析预测出潜在的原癌基因（FOS）、Ⅰ型胶原蛋白α2链基因（COL1A2），实验验证显示给药后肝脏损伤程度均较造模后减轻；血清AST、ALT水平在给药后降低；Western blot和Real-time PCR结果显示给药后FOS蛋白和基因表达水平均明显增高，COL1A2则相反。结论：人参总皂苷能通过FOS和COL1A2改善AH。

关键词：生物信息学酒精性肝炎关键基因中药预测人参总皂苷

数据挖掘干预酒精性肝炎的潜在中药与实验验证

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中国实验方剂学杂志 2024年

作者：陈书灵刘逸韬吴骁张朵艾金慧袁桃花孙见飞贵州医科大学基础医学国家级实验教学示范中心

目的：通过数据分析和实验验证探究人参总皂苷改善酒精性肝炎(AH)的新靶点和中药，为AH的临床治疗提供新方向。方法：该研究前期从GEO数据库筛选GSE28619作为分析对象，选择GSE83148和GSE103580作为验证集。基于limma包和WGCNA方法识别A... 详细信息

目的：通过数据分析和实验验证探究人参总皂苷改善酒精性肝炎(AH)的新靶点和中药，为AH的临床治疗提供新方向。方法：该研究前期从GEO数据库筛选GSE28619作为分析对象，选择GSE83148和GSE103580作为验证集。基于limma包和WGCNA方法识别AH相关差异基因和模块基因；通过“Venny”软件取交集基因。构建蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction network， PPI network)，并进行富集分析，再进一步筛选核心基因评估其诊断价值。经过数据集验证后，综合分析出AH新潜在靶点并预测中药。对靶点和中药有效成分进行分子对接，并通过实验验证。将48只SD大鼠随机分出8只为空白组，剩下进行乙醇灌胃造模成功后随机均分为人参总皂苷低(10 mg·kg-1)、中(20 mg·kg-1)、高(40 mg·kg-1)剂量组、模型组和美他多辛阳性对照组(117 mg·kg-1)，空白组以等量生理盐水灌胃。灌胃3周后取血清测定血清天冬氨酸氨基转移酶(AST)、丙氨酸氨基转移酶(ALT)水平；取肝组织进行苏木素-伊红(HE)染色、蛋白免疫印迹法(Western blot)和实时荧光定量聚合酶链式反应法(Real-time PCR)，检测肝组织潜在靶点蛋白和基因表达水平。结果：数据分析预测出潜在基因：原癌基因FOS、Ⅰ型胶原蛋白α2链基因(COL1A2)，实验验证显示给药后肝脏损伤程度均较造模后减轻；血清AST、ALT水平在给药后降低；Western Blot和Real-time PCR结果显示给药后FOS蛋白和基因表达水平均明显增高，COL1A2则相反。结论：人参总皂苷能通过FOS和COL1A2改善酒精性肝炎。

关键词：生物信息学酒精性肝炎关键基因中药预测人参总皂苷

基于人工智能技术的治疗非重症新型冠状病毒感染中药方剂研发及其作用机制研究

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中医杂志 2024年第1期65卷 103-112页

作者：黄文婷乔连生闫迪刘腾文曹宏梅郭弘妍张智程京谢兰刘清泉清华大学医学院医学系统生物学研究中心北京市100084 生物芯片北京国家工程研究中心成都中医药大学基础医学院北京博奥晶方生物科技有限公司首都医科大学附属北京中医医院

目的研发治疗非重症新型冠状病毒感染(COVID-19)的中药方剂并验证其抗炎作用机制。方法基于COVID-19患者支气管肺泡灌洗液中巨噬细胞的表达谱和新型冠状病毒(SARS-CoV-2)体外感染的肺上皮细胞表达谱分别确定了COVID-19在这两类细胞中... 详细信息

目的研发治疗非重症新型冠状病毒感染(COVID-19)的中药方剂并验证其抗炎作用机制。方法基于COVID-19患者支气管肺泡灌洗液中巨噬细胞的表达谱和新型冠状病毒(SARS-CoV-2)体外感染的肺上皮细胞表达谱分别确定了COVID-19在这两类细胞中失调的信号通路。通过文献收集临床治疗非重症COVID-19的中药方剂102首,基于特征信号通路评价102首方剂在肺上皮细胞和巨噬细胞中的通路逆转率,并根据中医理论确定“基础方”。通过临床常用方剂总结得到治疗非重症COVID-19的常用药,结合《中华人民共和国药典》中药筛选结果得到COVID-19中药方剂研发的“药物池”。通过靶向转录组获得每味药物对信号通路的调控作用,以逆转COVID-19失调的信号通路为目标展开计算,基于中药智能组方方法采用穷举法和平行运算进行组方得到若干个候选复方,参考中医专业经验最终得出治疗非重症COVID-19的守正创新方。采用RT-qPCR法检测该组方醇提物对脂多糖(LPS)处理的RAW264.7细胞中白细胞介素1b (IL1b)、C-X-C基序趋化因子配体2 (Cxcl2)、C-X-C基序趋化因子配体10 (Cxcl10)、C-C基序趋化因子配体2 (Ccl2)、一氧化氮合成酶2 (Nos2)和前列腺素内过氧化物合成酶2 (Ptgs2) mRNA的表达,对抗炎效果进行验证。结果在巨噬细胞和肺上皮细胞中,确定了COVID-19相关的各34条失调信号通路。基于失调信号通路和中药靶向转录组,对临床治疗非重症COVID-19的102首中药复方的功效进行评估,结果显示银翘散合平胃散在巨噬细胞及肺上皮细胞上的通路逆转率分别为91.18%和100%,效果最佳;且该复方具有疏风清热、解毒化湿的功效,符合COVID-19风热夹湿的病机,故选用银翘散合平胃散作为守正创新方研发的基础方。利用中药智能组方方法结合中医专业经验对银翘散合平胃散进行加减化裁,得到守正创新方翘蒡术皮饮。该方逆转了巨噬细胞和肺上皮细胞上COVID-19相关全部失调信号通路,逆转率均为100%。翘蒡术皮饮中的君药连翘、豨莶草和牛蒡子可下调多条与病毒感染、免疫及损伤增值相关的信号通路。RT-qPCR结果表明,与模型组比较,翘蒡术皮饮组下调了LPS诱导RAW264.7细胞中的IL1b、Tnf、Cxcl2、Cxcl10、Ccl2、Nos2和Ptgs2mRNA表达(P<0.05或P<0.01)。结论基于靶向转录组、中医专业经验和人工智能研发得到治疗非重症COVID-19的翘蒡术皮饮,该方剂的乙醇提取物在细胞炎症模型上能够抑制多种促炎基因的表达。

关键词：新型冠状病毒感染中药研发靶向转录组信号通路炎症反应人工智能翘蒡术皮饮

长非编码RNA PART1抑制喉鳞癌细胞增殖和侵袭

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第7期40卷 976-986页

作者：吴昊张文桃贾峰峰刘铭朱剑军山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室太原030001 太原市技术转移促进中心太原030006

长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)PART1可作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA),在多种肿瘤的发生发展中发挥关键作用,然而PART1在喉鳞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中的研究尚属空白。我们基于前期lncRNA测序数据发现,PART1在LSCC组织中显著低表达。进一步分析TCGA等公共数据库中的测序和临床数据,共发现了LSCC癌/癌旁组织中146个差异表达的lncRNA(95个上调,51个下调)和2424个差异表达的mRNA,结果显示,PART1在LSCC中普遍低表达(P生物信息学手段构建了LSCC中PART1的ceRNA调控网络,并确定与之相互作用的miRNA与mRNA。在体外验证了PART1对LSCC细胞的重要性。通过过表达载体,显著提高了PART1在LSCC细胞中的表达量(P<0.001);5-乙炔基-20-脱氧尿苷染色实验、凋亡分析、划痕愈合实验、Transwell实验和鬼笔环肽染色等研究结果显示,体外过表达PART1可以显著影响LSCC细胞的增殖、凋亡、迁移和侵袭(P<0.001)。因此,PART1可能参与并抑制LSCC的发生和发展。本研究将为阐明PART1在LSCC中的作用提供理论依据。

关键词：喉鳞癌 PART1 TCGA数据库长非编码RNA 生物信息学分析