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基于质谱技术的单细胞蛋白质组学

生物化学与生物物理进展 2024年第10期51卷 2705-2716页

作者：谢井盛叶子璐中国医学科学院系统医学研究院/苏州系统医学研究所重大疾病共性机制研究全国重点实验室苏州215123 苏州大学附属第二医院妇产科苏州215004

近年来,单细胞测序技术的发展极大地推动了单细胞基因组和转录组的研究。然而,直接关联单细胞生命过程的蛋白质组学研究则因技术进展缓慢而受限。随着样品前处理技术、色谱分离技术和质谱检测技术的进步,单细胞蛋白质组学(single-cell p... 详细信息

近年来,单细胞测序技术的发展极大地推动了单细胞基因组和转录组的研究。然而,直接关联单细胞生命过程的蛋白质组学研究则因技术进展缓慢而受限。随着样品前处理技术、色谱分离技术和质谱检测技术的进步,单细胞蛋白质组学(single-cell proteomics,SCP)的分析灵敏度显著提升。本综述深入回顾了SCP的发展历程及其在生命科学研究中的应用。在样品前处理方面,针对不同细胞的存在形式,研究者开发了基于声波激发、微流控芯片和激光切割等单细胞分选方法,并逐步从多步法前处理流程统一到一步法,降低了样品处理过程中的损失。在质谱技术方面,无标记定量(label-free quantification,LFQ)与基于同位素和同质素标记的方法都得到了充分的探索,各具技术优势与不足。在应用层面,SCP已在胚胎细胞早期发育、干细胞分化、肝脏组织空间异质性等方面揭示了新的生物学发现。最后,总结了当前SCP技术面临的挑战,包括检测通量、成本和数据分析的复杂性,并展望了其未来的发展方向,强调了SCP在基础研究和临床应用中的广阔前景。

关键词：单细胞蛋白质组学液相色谱质谱

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神经嵴研究手段的进展

组织工程与重建外科 2024年第4期20卷 469-474页

作者：姜乐恒尹宁北中国医学科学院北京协和医学院整形外科医院唇腭裂整形科北京市100144

神经嵴细胞是脊椎动物胚胎发育过程出现的一个广泛迁移的多能干细胞群体,谱系追踪是有关其研究的重点。150多年来,神经嵴相关研究经历了从形态学观察到单细胞水平的转变。本文对同位素标记、嵌合体、活体染料、体外克隆分析、基因条件... 详细信息

神经嵴细胞是脊椎动物胚胎发育过程出现的一个广泛迁移的多能干细胞群体,谱系追踪是有关其研究的重点。150多年来,神经嵴相关研究经历了从形态学观察到单细胞水平的转变。本文对同位素标记、嵌合体、活体染料、体外克隆分析、基因条件重组、单细胞测序等研究手段在神经嵴研究中的运用进行综述。

关键词：神经嵴谱系追踪细胞迁移嵌合体

[^(14)C]吡罗西尼在中国男性健康受试者体内的药物代谢和排泄研究

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中国临床药理学杂志 2024年第14期40卷 2118-2123页

作者：庄铨坤樊慧蓉董世奇范宾科刘鸣明许玲美王莉刘雪梅侯芳北京高博博仁医院Ⅰ期临床研究中心北京100071 中国医学科学院放射医学研究所放射性药代平台天津300110 轩竹生物科技股份有限公司北京100020

目的评估中国男性健康志愿者单次口服[^(14)C]吡罗西尼后,药物在人体内的物质平衡及药代动力学特征。方法用^(14)C标记示踪的方法评价吡罗西尼的人体物质平衡和生物转化。受试者餐后单次口服[^(14)C]吡罗西尼混悬液360 mg/50μCi后,采... 详细信息

目的评估中国男性健康志愿者单次口服[^(14)C]吡罗西尼后,药物在人体内的物质平衡及药代动力学特征。方法用^(14)C标记示踪的方法评价吡罗西尼的人体物质平衡和生物转化。受试者餐后单次口服[^(14)C]吡罗西尼混悬液360 mg/50μCi后,采集指定时间点/时间间隔内的血液、尿液和粪便样本。用液体闪烁计数的方法分析受试者全血、血浆、尿液和粪便中^(14)C标记吡罗西尼相关化合物的放射量。用高效液相色谱与在线/离线同位素检测仪联用获得血浆、尿液和粪便样本放射性同位素代谢物谱,结合高分辨质谱对主要代谢产物进行鉴定。结果共入组6例健康男性受试者。受试者服药后,血浆中放射性药物中位达峰时间为5.00 h,平均末端消除半衰期为43.70 h。在给药后288.00 h内,放射性药物基本从体内排泄清除,受试者平均放射性药物累积回收率为(94.10±8.19)%。放射性药物主要经粪便排泄,占给药量的(84.60±7.10)%,尿液为次要排泄途径,占给药量的9.41%。代谢分析表明,血浆中放射性药物的主要成分为原形药物,主要代谢产物为RM4(XZP-5286)、RM6(XZP-3584)、RM7(XZP-5736)。药物主要以原形药物和代谢物形式从体内清除,除原形药物外,血浆、尿液和粪便样本中共鉴定并分析了9个代谢产物,全部为Ⅰ相代谢产物。药物在体内的主要代谢清除途径为脱乙基、脱异丙基、氧化等。结论健康受试者单次口服[^(14)C]吡罗西尼混悬液后,主要以原形药物和代谢物形式从体内清除,粪便是主要排泄途径,尿液为次要排泄途径。药物在体内主要发生脱乙基、脱异丙基、氧化等代谢反应。受试者服药后,安全性和耐受性良好。

关键词： [^(14)C]吡罗西尼物质平衡代谢药代动力学同位素

基于dCasMINI蛋白的CRISPRi工具设计及其效果探究

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基础医学与临床 2024年第6期44卷 821-827页

作者：陈信文曹佳璇饶书权中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所)、血液与健康全国重点实验室国家血液系统疾病、临床医学研究中心、细胞生态海河实验室天津300020 天津医学健康研究院天津301600

目的探索基于去活化CasMINI蛋白(dCasMINI)的CRISPR干扰(CRISPRi)工具设计及其转录抑制效果评估。方法采用四环素诱导基因开启系统(tet-on),流式细胞测量术和实时荧光定量反转录聚合酶链反应从质粒基因、基因组外源性基因位点和内源性... 详细信息

目的探索基于去活化CasMINI蛋白(dCasMINI)的CRISPR干扰(CRISPRi)工具设计及其转录抑制效果评估。方法采用四环素诱导基因开启系统(tet-on),流式细胞测量术和实时荧光定量反转录聚合酶链反应从质粒基因、基因组外源性基因位点和内源性基因位点三个层次评估dCasMINI系统在哺乳动物细胞中的转录抑制效果,并进一步设计和比较6种dCasMINI-CRISPRi工具(dCasMINI、dCasMINI-ZIM3 KRAB、dCasMINI-KRAB-MeCP2、dCasMINI-ZNF324 KRAB、dCasMINI-3x KRAB和dCasMINI-Com-KRAB-MeCP2)和不同位置单链引导RNA(single guide RNA,sgRNA)的转录抑制效果。结果dCasMINI、dCasMINI-ZIM3 KRAB、dCasMINI-KRAB-MeCP2、dCasMINI-ZNF324 KRAB、dCasMINI-3x KRAB和dCasMINI-Com-KRAB-MeCP2能够不同程度地抑制质粒基因、基因组外源性基因的转录(P<0.05);dCasMINI-ZIM3 KRAB、dCasMINI-KRAB-MeCP2、dCasMINI-ZNF324 KRAB和dCasMINI-Com-KRAB-MeCP2能够不同程度地抑制内源性基因的转录(P<0.05);不同结合位点的sgRNA具有不同的转录抑制效果(P<0.05)。结论CasMINI系统能够改造成多种CRISPRi工具进行基因敲降研究,未来有望应用在多个场景,如原代细胞表观基因编辑、体内筛选和临床治疗等。

关键词： CRISPR干扰 dCasMINI 敲降四环素诱导基因开启系统(tet-on)

基于有限元方法的K-Clip手术过程再现及分析

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中国胸心血管外科临床杂志 2024年第1期31卷 44-50页

作者：施浩欧阳文斌李世国李琦张凤文刘垚鲁雯馨刘畅张少杰潘湘斌中国医学科学院、北京协和医学院、国家心血管病中心、阜外医院结构性心脏病中心、国家卫生健康委心血管疾病再生医学研究重点实验室国家心血管疾病重点实验室、中国医学科学院心血管创新器械重点实验室、国家心血管疾病临床医学研究中心、国家重点实验室北京100037 上海汇禾医疗科技股份有限公司上海201612

目的利用数值模拟研究使用K-Clip治疗三尖瓣反流时,针对不同反流形态,植入位置和器械型号对治疗效果的影响。方法利用CT影像进行三维重建,得到心脏主体模型。修改标准的参数化三尖瓣叶及腱索得到两种不同的反流瓣口。在商业显式动力学软... 详细信息

目的利用数值模拟研究使用K-Clip治疗三尖瓣反流时,针对不同反流形态,植入位置和器械型号对治疗效果的影响。方法利用CT影像进行三维重建,得到心脏主体模型。修改标准的参数化三尖瓣叶及腱索得到两种不同的反流瓣口。在商业显式动力学软件Ls-Dyna中模拟不同型号的K-Clip夹合部件在植入不同位置(后瓣中点、前后瓣交界、前瓣中点、后隔瓣交界)的效果。结论针对本文中的两种反流形态,夹合后瓣中点会造成更好的反流瓣口缩小效果(最多缩小75%的反流瓣口面积)。在前瓣中点以及后隔瓣交界植入时,所需夹紧力更大,不利于夹合部件的顺利关闭。比较18T与16T的夹合部件的植入后情况,发现并没有明显的治疗区别,且16T夹合部件所需夹紧力更小,因此推荐优先使用16T夹合部件。

关键词：三尖瓣反流瓣环修复 K-Clip 数值模拟

人颈动脉粥样硬化斑块组织研究的实验设计现状

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中华血管外科杂志 2024年第3期9卷 203-208页

作者：赵宁赵文心吴志远杨洋刁永鹏李拥军北京医院血管外科国家老年医学中心中国医学科学院老年医学研究院北京100730

动脉粥样硬化疾病是大部分发达国家和部分发展中国家心脑血管事件发病和死亡的主要原因, 几十年来学者们通过选取不同的标本进行体内和体外实验, 研究其危险因素、发生机制、临床表现和治疗方法。人颈动脉粥样硬化斑块标本在其发病机制... 详细信息

动脉粥样硬化疾病是大部分发达国家和部分发展中国家心脑血管事件发病和死亡的主要原因, 几十年来学者们通过选取不同的标本进行体内和体外实验, 研究其危险因素、发生机制、临床表现和治疗方法。人颈动脉粥样硬化斑块标本在其发病机制和靶向药物研究中具有重要的作用, 不能被动物标本或体外细胞实验完全替代, 常被用于不同的对照实验。这些方法主要以患者症状、斑块特点、不同位置及其他因素为依据。本文主要对上述实验设计方法进行综述并分析了各种研究的优缺点。

关键词：人颈动脉斑块实验设计动脉粥样硬化

基于领域一般网络解读脑卒中后失语症恢复假说中的可变神经替代

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中国康复医学杂志 2024年第9期39卷 1390-1393页

作者：汪洁袁英张大华宋为群吴东宇首都医科大学宣武医院康复医学科北京市100053 中国中医科学院望京医院康复二科

既往人们对失语症恢复的机制存在三个假说:(1)损伤周围(perilesional)假说,认为恢复是病变周围组织中领域特异(domain-specific)语言系统重建的结果[1—2];(2)对侧位移(laterality shift)假说,认为语言功能的恢复是由于对侧半球同位区... 详细信息

既往人们对失语症恢复的机制存在三个假说:(1)损伤周围(perilesional)假说,认为恢复是病变周围组织中领域特异(domain-specific)语言系统重建的结果[1—2];(2)对侧位移(laterality shift)假说,认为语言功能的恢复是由于对侧半球同位区功能的改变所致[3—5];(3)去抑制(disinhibition)假说,即右半球的激活是失去经胼胝体抑制的产物。并进一步提出,这对恢复几乎没有帮助,甚至可能通过抑制左半球残存的未受损组织而阻碍恢复[6—8]。

关键词：左半球受损组织失语症胼胝体语言功能假说

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118例颅内占位性病变脑扫描分析

中国医学科学院学报 1981年第1期3卷 18-22页

作者：周前蔡起蔷王维钧中国医学科学院首都医院同位素科中国医学科学院首都医院神经外科北京

本文分析118例颅内占位性病变的脑扫描,总阳性率 71.2％。按病理性质则脑膜瘤、转移瘤、颅内血肿及脑脓肿的阳性率最高,均为100％;与其它诊断方法相比,本组脑扫描除大脑半球病变外,阳性率低于脑血管、气脑、脑室造影等,但因它为无创伤性... 详细信息

本文分析118例颅内占位性病变的脑扫描,总阳性率 71.2％。按病理性质则脑膜瘤、转移瘤、颅内血肿及脑脓肿的阳性率最高,均为100％;与其它诊断方法相比,本组脑扫描除大脑半球病变外,阳性率低于脑血管、气脑、脑室造影等,但因它为无创伤性,而其它方法多在脑扫描筛选后有选择地进行,故此法仍不失为颅内病变首选的诊断方法。

关键词：占位性病变脑血管阳性率颅内脑室造影神经放射造影阳性例数大脑半球脑膜瘤蛛网膜内皮瘤神经组织肿瘤右侧位

放射性核素及“B”超声扫描对鉴别甲状腺结节良恶性的初步评价

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中国医学科学院学报 1981年第1期3卷 27-30页

作者：蔡起蔷周前石健民中国医学科学院首都医院同位素科中国医学科学院首都医院理疗科北京

本文报告52例术前同时采用放射性核索扫描及B超声检查的甲状腺结节。放射性核素扫描显示“冷”结节48例,“热”结节4例。48例“冷”结节中,恶性5例,而B超声检查假阳性、假阴性各1例。因此,对于放射性核素扫描显示“冷”结节的病例,应用... 详细信息

本文报告52例术前同时采用放射性核索扫描及B超声检查的甲状腺结节。放射性核素扫描显示“冷”结节48例,“热”结节4例。48例“冷”结节中,恶性5例,而B超声检查假阳性、假阴性各1例。因此,对于放射性核素扫描显示“冷”结节的病例,应用B超声检查有助于鉴别结节的良恶性。

关键词：结节功能超声扫描良恶性甲状腺粒子肉内分泌腺放射性核素放射性同位素