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基于SNP位点的吉林梅花鹿分子系谱构建及群体遗传结构分析

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畜牧兽医学报 2024年第9期55卷 3925-3935页

作者：范广轩王天骄董依萌王洪亮丁宁王莘皓邢秀梅中国农业科学院特产研究所农业农村部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室长春130112 东北林业大学野生动物与自然保护地学院哈尔滨150006 广东长隆集团有限公司珠海519000

旨在利用全基因重测序技术获得的SNP位点为吉林梅花鹿保种群构建分子系谱,并对其遗传结构进行分析。本研究在锯茸期采集保种群的吉林梅花鹿血液10 mL(n=425),其中成年公鹿132只、成年母鹿208只、仔鹿85只,提取DNA后进行全基因重测序。... 详细信息

旨在利用全基因重测序技术获得的SNP位点为吉林梅花鹿保种群构建分子系谱,并对其遗传结构进行分析。本研究在锯茸期采集保种群的吉林梅花鹿血液10 mL(n=425),其中成年公鹿132只、成年母鹿208只、仔鹿85只,提取DNA后进行全基因重测序。通过计算血源同源系数(IBD)分析吉林梅花鹿亲缘关系;基于观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、系统发育树和群体分化指数(Fst)等对吉林梅花鹿保种群遗传结构进行分析。通过全基因重测序筛选出25548601个高质量SNPs,425个样本共组成了90100对亲缘关系,平均亲缘系数为0.4351,得出195对父子关系与143对母子关系,占到采样群体原始系谱记录的92%,检出原始系谱错误率为2.2%,纠正了原始记录错误8处,具有较高的准确性和可靠性;分析群体分化指数(Fst),东丰型吉林梅花鹿与伊通型距离较远;绘制系统发育树,将吉林梅花鹿保种群划分为17个家系;采用的SNP标记平均观测杂合度为0.456,平均期望杂合度为0.277,平均多态信息含量为0.627,吉林梅花鹿保种群平均近交系数为0.078,存在较弱的近交。本研究建立了吉林梅花鹿保种群的分子系谱并对其群体遗传结构进行了分析,这对于保护吉林梅花鹿遗传多样性和规划保种群后续选育计划至关重要。

关键词：吉林梅花鹿 SNP 分子系谱

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谈如何做好科研机构绩效考核

中国医药导报 2010年第17期7卷 107-108页

作者：邸冉中国医学科学院实验动物研究所人力资源处北京100021

绩效考核是绩效管理的关键环节,绩效考核的成功与否关系到整个绩效管理的有效性。本文从如何做好绩效考核及实施绩效考核须把握的几个关键环节进行了阐述,旨在进一步帮助科研事业单位制订行之有效的绩效考核体系,为科研机构的发展提供... 详细信息

绩效考核是绩效管理的关键环节,绩效考核的成功与否关系到整个绩效管理的有效性。本文从如何做好绩效考核及实施绩效考核须把握的几个关键环节进行了阐述,旨在进一步帮助科研事业单位制订行之有效的绩效考核体系,为科研机构的发展提供充足的源动力。

关键词：科研机构绩效考核绩效工资

高校大型仪器共享平台建设及管理的思考与探索

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中国卫生标准管理 2024年第13期15卷 7-10页

作者：王芳段天林王德贵兰州大学实验室与设备管理处甘肃兰州730000 兰州大学医学实验中心甘肃兰州730000 兰州大学基础医学院甘肃兰州730000

大型仪器共享平台已成为目前高校和科研机构管理大型仪器设备的主要方式。如何建设好管理好大型仪器共享平台、实现优质资源共享,科学、规范地为教研服务,是相关人员共同思考的问题,也是高效地发挥这些大型仪器作用的关键。文章以兰州... 详细信息

大型仪器共享平台已成为目前高校和科研机构管理大型仪器设备的主要方式。如何建设好管理好大型仪器共享平台、实现优质资源共享,科学、规范地为教研服务,是相关人员共同思考的问题,也是高效地发挥这些大型仪器作用的关键。文章以兰州大学医学实验中心大型仪器共享平台为例,总结了平台运行过程中的特点及成效,包括简洁明了的操作系统、全方位开放、精细化规范化的管理模式、便捷的报账系统以及合理的绩效评价体系等。并针对创新人才培养、与相关课程相结合、规范化系统化理论培训、完善设备相关科研成果、严格论证程序等方面提出了改进的措施和方案。

关键词：大型仪器共享平台建设管理创新人才培养设备论证

恒河猴超声乳化角膜内皮失代偿动物模型的活体共聚焦显微镜观察

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中国医学科学院学报 2016年第1期38卷 42-48页

作者：吴敏胡竹林孙晓梅代解杰昆明医科大学第四附属医院眼科昆明650021 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种属资源中心昆明650118

目的观察恒河猴超声乳化角膜内皮失代偿动物模型在共聚焦显微镜下的角膜特征性变化。方法健康恒河猴4只,以右眼为实验组,通过超声乳化能量破坏角膜中央直径7-9 mm处内表面制作角膜内皮失代偿模型;以左眼为空白对照组。于术前,术后1、2、... 详细信息

目的观察恒河猴超声乳化角膜内皮失代偿动物模型在共聚焦显微镜下的角膜特征性变化。方法健康恒河猴4只,以右眼为实验组,通过超声乳化能量破坏角膜中央直径7-9 mm处内表面制作角膜内皮失代偿模型;以左眼为空白对照组。于术前,术后1、2、3、4周应用裂隙灯显微镜和活体共聚焦显微镜观察角膜各层结构变化。采用SPSS 19.0统计软件进行数据分析,基底层下神经丛数量、内皮细胞密度的比较采用配对t检验,角膜厚度采用重复测量方差分析。结果在超声乳化损伤角膜内皮后,角膜改变逐渐出现在内皮层、基质层、前弹力层和基底上皮层。早期主要改变是角膜内皮细胞间隙增宽、细胞轻度水肿,基质层出现活化的基质细胞和细胞形态改变,基质厚度增加;术后2周开始出现前弹力层上皮状神经纤维减少,同时伴有基质层和内皮水肿加重;术后3周基底上皮细胞间隙增宽,少量朗汉细胞浸润,基质层和内皮水肿加重;术后4周基底上皮层大量朗汉细胞浸润,前弹力层仅见少量上皮状神经纤维,基质层大量活化的基质细胞,内皮层严重水肿。术后2周实验组基底膜下神经丛数量（t=6.9192,P=0.002）和内皮细胞密度（t=7.8936,P〈0.0001）明显低于对照组。实验组术后1（t=28.31,P〈0.0001）、2（t=63.56,P〈0.0001）、3（t=123.22,P〈0.0001）、4周（t=180.80,P〈0.0001）的角膜厚度明显高于对照组。结论活体共聚焦显微镜可清晰显示超声乳化后恒河猴角膜的变化,主要特征是逐渐加重的内皮细胞间隙增宽、基质细胞活化、朗汉细胞增多和基底上皮层下神经丛减少。

关键词：恒河猴角膜内皮失代偿活体共聚焦显微镜动物模型

中国医学科学院实验动物利用情况的回顾性分析

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中国科技资源导刊 2017年第3期49卷 8-12,25页

作者：张伟伦赵爱芳中国医学科学院基础医学研究所科技处北京100005

以中国医学科学院所承担的国家自然科学基金课题为研究对象,分析中国医学科学院在科研课题中实验动物的利用情况及其相关问题。收集2005—2007年中国医学科学院获资助的国家自然科学基金项目,对申请书及任务书内容进行检索,应用文献计... 详细信息

以中国医学科学院所承担的国家自然科学基金课题为研究对象,分析中国医学科学院在科研课题中实验动物的利用情况及其相关问题。收集2005—2007年中国医学科学院获资助的国家自然科学基金项目,对申请书及任务书内容进行检索,应用文献计量统计方法分析实验动物的种类、动物品系、使用方式及资助学科之间的相互关系。研究表明,实验动物在国家自然科学基金的研究中占有重要地位,广大科研工作者及管理工作者应高度重视实验动物科学的工作,保证实验动物科学对生命科学的支撑作用。

关键词：实验动物国家自然科学基金科学研究

应用型科研机构科研绩效考核评价体系构建研究

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中国卫生标准管理 2018年第23期9卷 15-19页

作者：徐明珏赵志梅肖剑钦车艳春中国医学科学院医学生物学研究所科研处云南昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118 中国医学科学院医学生物学研究所人力资源处云南昆明650118

应用型科研机构科研绩效考核指标评价体系的建立与应用,是其科研绩效管理的重要组成部分。合理的科研绩效考核指标评价体系能够充分调动应用型科研机构科研人员的积极性,有效提高围绕产品研发而产出的科技成果质量,有利于应用型科研机... 详细信息

应用型科研机构科研绩效考核指标评价体系的建立与应用,是其科研绩效管理的重要组成部分。合理的科研绩效考核指标评价体系能够充分调动应用型科研机构科研人员的积极性,有效提高围绕产品研发而产出的科技成果质量,有利于应用型科研机构生产经营活动的可持续发展。文章以Y研究所的科研绩效考核指标评价体系为研究对象,采用层次分析法验证现行科研绩效考核指标权重设计的合理性,结合科研绩效考核指标评价体系实施周期结束后的科技成果产出情况的分析,对现行绩效考核指标评价体系设置的合理性及绩效考核的实施效果进行综合评价,为完善应用型科研机构的科研绩效管理提出进一步优化和改进的具体措施和建议。

关键词：应用型科研机构科研绩效考核指标评价体系科研绩效管理层次分析法科技成果质量措施和建议

6-乙基-鹅去氧胆酸治疗对胰岛素抵抗的影响

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中国糖尿病杂志 2016年第11期24卷 1036-1039页

作者：焦蒙李乃适中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院内分泌科卫生部内分泌重点实验室 100730

非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是MS在肝脏的表现,IR在其发病中起关键作用。法尼酯X受体是调节糖类、脂类代谢和IR的关键因素,6-乙基-鹅去氧胆酸(OCA)作为其选择性激动剂,是NAFLD的潜在治疗药物。多项动物研究结果表明,OCA可改善肝脏脂肪变... 详细信息

非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是MS在肝脏的表现,IR在其发病中起关键作用。法尼酯X受体是调节糖类、脂类代谢和IR的关键因素,6-乙基-鹅去氧胆酸(OCA)作为其选择性激动剂,是NAFLD的潜在治疗药物。多项动物研究结果表明,OCA可改善肝脏脂肪变性,抑制脂质在肝脏堆积,临床试验也证实,其可逆转非酒精性脂肪性肝炎患者的肝脏组织学改变。OCA可能对IR的改善也有一定作用,但长期使用对IS的影响情况还需进一步深入研究。

关键词： 6-乙基-鹅去氧胆酸法尼酯X受体胰岛素抵抗非酒精性脂肪性肝病非酒精性脂肪性肝炎

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阜外心血管病医院科研平台的建设和运行效果

中华医学科研管理杂志 2009年第3期22卷 175-176页

作者：张雪燕朱曼璐曹婧文北京协和医学院中国医学科学院阜外心血管病医院科研处 100037 中国医学科学院科研处北京100730

中国医学科学院阜外心血管病医院于2004年整合全院资源建设了三个科研平台：中心实验室、病理生理中心、动物中心，旨在为全院的科研人员和研究生提供仪器设备的使用、技术培训、实验指导及动物实验等。在介绍三个科研平台的运行情况的... 详细信息

中国医学科学院阜外心血管病医院于2004年整合全院资源建设了三个科研平台：中心实验室、病理生理中心、动物中心，旨在为全院的科研人员和研究生提供仪器设备的使用、技术培训、实验指导及动物实验等。在介绍三个科研平台的运行情况的基础上，分析了科研平台建成后对人才培养、医院科研发展的推动作用。

关键词：科研平台运行效果医院管理

树鼩Mfsd2a基因的克隆分析和不同组织表达量的检测

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实验动物与比较医学 2019年第3期39卷 178-186页

作者：王文广匡德宣李娜陆彩霞罕园园仝品芬孙晓梅代解杰中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心云南省重大传染病疫苗研发重点实验室中国医学科学院医学生物学研究所实验树鼩标准化与应用研究省创新团队

目的对树鼩主要促进因子超家族成员2a(Mfsd2a)基因进行克隆、测序和生物信息学分析,并定量检测其组织表达量。方法从树鼩脑和脊髓中提取总RNA,RT-PCR扩增Mfsd2a基因片段,测序后利用生物信息学软件对其序列特征、系统进化、编码蛋白的结... 详细信息

目的对树鼩主要促进因子超家族成员2a(Mfsd2a)基因进行克隆、测序和生物信息学分析,并定量检测其组织表达量。方法从树鼩脑和脊髓中提取总RNA,RT-PCR扩增Mfsd2a基因片段,测序后利用生物信息学软件对其序列特征、系统进化、编码蛋白的结构和理化性质进行分析;以树鼩β-actin为内参,qPCR检测树鼩Mfsd2a基因在不同组织中的表达情况。结果克隆获得Mfsd2a基因片段全长1 796 bp,与NCBI上公布的树鼩Mfsd2a基因预测序列高度一致,比对显示其与MFS转运蛋白超家族同源。其编码区全长1 464 bp,编码488个氨基酸。预测结果显示树鼩Mfsd2a蛋白具有明显的疏水性区域,无信号肽,二级结构元件由α螺旋、β折叠、无规卷曲和延伸链组成。OCTOPUS分析发现Mfsd2a存在12个跨膜结构,修饰结构预测发现Mfsd2a蛋白存在两处N糖基化位点,亚细胞定位发现其可能主要分布于细胞膜和内质网。qPCR检测树鼩不同组织的Mfsd2a表达,结果显示各组织均有表达,在大脑、脊髓中的表达水平相对较高。结论成功克隆了树鼩Mfsd2a基因,建立了该基因表达定量检测方法,为今后利用树鼩神经系统疾病模型深入开展Mfsd2a基因功能研究提供了理论和技术支持。

关键词：树鼩主要促进因子超家族成员2a(Mfsd2a) 克隆分析表达