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基于外周血单个核细胞转录组的冠心病RNA N^(6)-甲基腺苷相关生物标志物研究

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中国分子心脏病学杂志 2024年第2期24卷 5978-5985页

作者：吴佳妮任晓晓杨志良陈恕凤杨彬王来元中国医学科学院、北京协和医学院、阜外医院、心血管疾病国家重点实验室、中国医学科学院心血管流行病学重点实验室流行病研究部北京100037

目的通过分析冠心病病例外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)MeRIP-seq数据和RNA-seq数据,筛选潜在的诊断冠心病的N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)相关生物标志物,为冠心病防治提供新思路。方法分析冠心... 详细信息

目的通过分析冠心病病例外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)MeRIP-seq数据和RNA-seq数据,筛选潜在的诊断冠心病的N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)相关生物标志物,为冠心病防治提供新思路。方法分析冠心病病例对照PBMCs表达谱(GSE113079)中m6A功能基因的表达情况,借助LASSO和logistic回归筛选与冠心病相关的m6A功能基因。随后,分析冠心病病例对照PBMCs的MeRIP-seq和RNA-seq数据,筛选差异m6A甲基化且差异表达基因,通过多种方式筛选到潜在的冠心病诊断标志物,并在公共数据库验证其诊断冠心病的效能。结果在141例冠心病患者和健康对照的表达谱数据(GSE113079)中,两组间有22个m6A功能基因的表达水平存在显著差异,受试者操作特征(ROC)曲线分析表明,ELAVL1、IGF2BP2和METTL14的三基因组合识别冠心病的曲线下面积(AUC)为0.98。将GSE113079数据与冠心病MeRIP-seq、RNA-seq数据联合分析,得到47个m6A靶基因。经过LASSO和logistic回归筛选后,ADM和SH2D2A基因组合在冠心病表达谱数据(GSE113079)的AUC为1,经验证,在心肌梗死外周血表达谱数据(GSE66360)中的AUC为0.79。在动脉粥样硬化斑块表达谱数据(GSE43292和GSE28829)中,与对照组相比,ADM基因表达水平在斑块中显著升高(P病表达谱数据库GSE113079,得到m6A功能基因组合(ELAVL1、IGF2BP2和METTL14),进一步结合MeRIP-seq、RNA-seq数据筛选出靶基因ADM和SH2D2A,经验证集验证ADM是潜在的冠心病标志物。

关键词：冠心病 m6A修饰转录组测序 m6A功能基因生物标志物

合并室间隔缺损的大动脉转位所致肺动脉高压的可逆性程度及其分子机制

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中华胸心血管外科杂志 2010年第2期26卷 81-85页

作者：潘湘斌郑哲胡盛寿李守军张雅娟魏英杰高培显林野高歌北京协和医学院中国医学科学院心血管病研究所阜外心血管病医院心脏外科北京100037

目的探讨合并室间隔缺损（VSD）的完全性大动脉转位（TGA）所致肺动脉高压的可逆性程度及其分子机制.方法 24例平均肺动脉压力大于30 mmHg（4.0 kPa）病儿,其中大动脉转位伴室间隔缺损10例,单纯室间隔缺损14例.在体外循环开始前取其右... 详细信息

目的探讨合并室间隔缺损（VSD）的完全性大动脉转位（TGA）所致肺动脉高压的可逆性程度及其分子机制.方法 24例平均肺动脉压力大于30 mmHg（4.0 kPa）病儿,其中大动脉转位伴室间隔缺损10例,单纯室间隔缺损14例.在体外循环开始前取其右中叶肺组织,标本经HE及弹力纤维染色,评估肺血管病变程度.ELISA检测标本中eNOS、iNOS、ET-1、ET-AR、ET-BR、MMP-2、MMP-9及TIMP的表达情况.结果两组病儿年龄、身高、体重、VSD大小、术前肺动脉压力筹异均无统计学意义,而血红蛋白浓度、主动脉及肺动脉内氧饱和度及术后肺动脉压力下降值筹异明显,P〈0.05.两组肺标本Heath-Edwards分级0～Ⅱ级,ELISA检测发现TGA组的eNOS及MMP-2表达,分别为（280.13 ±101.92）ng/mg和（31.68±15.36）ng/mg,明显低于单纯VSD组的（488.41±249.6）ng/mg和（69.28±49.12）ng/mg,P〈0.05.两组iNOS、ET-1、ET-AR、ET-BR、MMP-9及TIMP表达差异无统计学意义.结论 NOS系统、ET系统及MMP/TIMP系统的失衡参与TGA合并VSD者的肺高压形成过程,相对于单纯VSD者,TGA者肺循环的高氧合状态使MMP-2和eNOS表达下调,在一定程度上影响肺动脉高压的进展及其肺血管病变的可逆性程度.

关键词：大血管错位室间隔缺损肺动脉病理学外科

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基因检测在冠心病精准医疗中的应用进展

协和医学杂志 2021年第4期12卷 445-449页

作者：陈文周洲国家心血管病中心中国医学科学院阜外医院实验诊断中心心血管疾病国家重点实验室心血管疾病分子诊断北京市重点实验室北京100037

精准医疗是在诊疗过程中充分考虑患者个体在基因、环境、生活方式等方面差异的医学手段,基因检测是实现精准医疗的重要方式。自人类基因组数据成功解析以来,人们对遗传因素在心血管疾病发生、发展和转归中的作用有了更深刻的认识。迅速... 详细信息

精准医疗是在诊疗过程中充分考虑患者个体在基因、环境、生活方式等方面差异的医学手段,基因检测是实现精准医疗的重要方式。自人类基因组数据成功解析以来,人们对遗传因素在心血管疾病发生、发展和转归中的作用有了更深刻的认识。迅速崛起的精准医疗围绕心血管疾病的预防和治疗,将基础医学、临床医学和转化医学有机结合,不仅推动了心血管疾病遗传学研究的快速进展,且为制定个体化疾病诊疗方案奠定了基础。遗传变异和基因多态性是冠心病的重要发病因素,基因检测不仅可识别冠心病高危人群,且能够针对不同分子病理途径制定最佳预防和治疗策略,进而促进精准医学的应用。本文将着重介绍基因检测在冠心病及其相关危险因素预防、诊断和治疗中的作用。

关键词：基因检测冠心病精准医疗风险预测心血管药物基因组

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2型单纯疱疹病毒感染与血脂紊乱相关

中华医学杂志 2003年第20期83卷 1774-1777页

作者：孙余华裴卫东吴永健王国干中国医学科学院中国协和医科大学心血管病研究所阜外心血管病医院中德分子医学研究室北京100037 中国医学科学院中国协和医科大学心血管病研究所阜外心血管病医院冠心病研究室北京100037 中国医学科学院中国协和医科大学心血管病研究所阜外心血管病医院急诊研究室北京100037

目的　探讨 2型单纯疱疹病毒 (HSV 2 )感染与血脂紊乱的关系。方法　连续收集 12 4 4例住院患者 ,其中血脂紊乱患者 4 0 8例 ,无血脂紊乱个体 836例作为对照 ,采用ELISA方法检测外周血中特异性HSV 2型IgG抗体 ,进行单因素和多因素Logis... 详细信息

目的　探讨 2型单纯疱疹病毒 (HSV 2 )感染与血脂紊乱的关系。方法　连续收集 12 4 4例住院患者 ,其中血脂紊乱患者 4 0 8例 ,无血脂紊乱个体 836例作为对照 ,采用ELISA方法检测外周血中特异性HSV 2型IgG抗体 ,进行单因素和多因素Logistic回归分析。结果　血脂紊乱组 ,HSV 2IgG阳性率 (38 2 % )高于对照组 (30 6 % ,P =0 0 0 7) ,体重指数也较高 (2 4 9± 6 6 ) ,对照组 (2 3 9±7 6 ,P =0 0 0 1)。血脂紊乱组糖尿病及高血压的患病率均显著高于对照组 (分别为 15 2 % ,10 3% ,P =0 0 12 ;4 5 1% ,36 4 % ,P =0 0 0 3)。多因素Logistic回归分析显示 ,HSV 2IgG阳性与血脂紊乱显著相关 ,调整后的危险度优势比 (OR值 )和 95 %可信区间为 1 34(1 0 4～ 1 72 ,P =0 0 2 5 )。其他与血脂紊乱独立相关的危险因素还有体重指数 1 0 3(1 0 1～ 1 0 5 ) ,P =0 0 0 2 ;高血压 1 39(1 0 9～1 79) ,P =0 0 0 8;糖尿病 1 5 0 (1 0 5～ 2 15 ) ,P =0 0 2 8。结论　HSV 2感染是血脂紊乱的独立危险因素 ,增加了患者血脂紊乱的危险性。

关键词： 2型单纯疱疹病毒感染血脂紊乱高血脂症危险因素

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DNA甲基化在高血压病中的研究进展

中国循环杂志 2018年第5期33卷 514-517页

作者：白丛霞陈敬洲北京协和医学院中国医学科学院国家心血管病中心阜外医院心血管疾病国家重点实验室北京市100037

高血压病是由多个基因和环境因素共同作用的疾病,是全球最大的公共卫生健康问题之一。DNA甲基化是最早发现的表观遗传调控机制,在高血压的发生和发展中起着重要作用。与血压调节相关的基因启动子区域发生甲基化或去甲基化会影响相关酶... 详细信息

高血压病是由多个基因和环境因素共同作用的疾病,是全球最大的公共卫生健康问题之一。DNA甲基化是最早发现的表观遗传调控机制,在高血压的发生和发展中起着重要作用。与血压调节相关的基因启动子区域发生甲基化或去甲基化会影响相关酶和受体的表达,从而引起血压升高。深入探讨DNA甲基化在高血压病中的分子机制将为高血压的发病机制寻找新的科学依据。本文主要就DNA甲基化在高血压病发展中的表观遗传学机制进行综述。

关键词： DNA甲基化高血压

基于生物信息学分析花生四烯酸代谢在缺血性心脏病中的作用

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中国分子心脏病学杂志 2023年第6期23卷 5720-5728页

作者：杨雪剑陈虹王淼中国医学科学院北京协和医学院阜外医院国家心血管病中心心血管疾病国家重点实验室北京市100037

目的基于生物信息学分析缺血性心脏病(IHD)患者花生四烯酸代谢通路(AMP)基因差异表达情况,并探讨AMP基因在IHD发生与发展中的作用。方法对IHD患者和健康对照者心脏组织转录组数据进行分析以鉴定差异表达基因,并运用机器学习算法筛选与... 详细信息

目的基于生物信息学分析缺血性心脏病(IHD)患者花生四烯酸代谢通路(AMP)基因差异表达情况,并探讨AMP基因在IHD发生与发展中的作用。方法对IHD患者和健康对照者心脏组织转录组数据进行分析以鉴定差异表达基因,并运用机器学习算法筛选与IHD相关的AMP关键基因。这些核心基因被用于IHD诊断模型的开发和验证,并结合单细胞转录组数据进一步研究这些基因在IHD中的功能。结果转录组数据分析显示,AMP基因在IHD中表达失调,并且鉴定出5个核心基因:PLA2G2A、CYP2J2、ACE、GPX3和EPHX2。基于这5个核心基因构建的模型在训练集和验证集中均表现出良好的诊断性能。这些核心基因主要在成纤维细胞和心肌细胞中表达,并与多种炎症因子及M2型巨噬细胞浸润高度相关。结论 PLA2G2A、CYP2J2、ACE、GPX3和EPHX2可作为IHD的诊断标志物,并与IHD中免疫细胞浸润密切相关。这些发现将为深入研究IHD疾病机制及开发靶向药物提供参考。

关键词：缺血性心脏病花生四烯酸生物信息学

分化拮抗非编码RNA-201对单核-巨噬细胞功能的调控研究

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中国循环杂志 2020年第7期35卷 677-684页

作者：周海清刘洋陈宇李荣霞杨淑均张伟丽安徽理工大学医学院安徽省淮南市232000 北京协和医学院中国医学科学院国家心血管病中心阜外医院心血管疾病国家重点实验室厦门大学附属心血管病医院

目的:探究分化拮抗非编码RNA-201(differentiation antagonizing non-protein coding RNA,DANCR-201)在单核-巨噬细胞炎症反应中的调控作用。方法:纳入中国医学科学院阜外医院疑为冠心病接受冠状动脉CT检查的患者25例,年龄≥45岁。根据... 详细信息

目的:探究分化拮抗非编码RNA-201(differentiation antagonizing non-protein coding RNA,DANCR-201)在单核-巨噬细胞炎症反应中的调控作用。方法:纳入中国医学科学院阜外医院疑为冠心病接受冠状动脉CT检查的患者25例,年龄≥45岁。根据冠状动脉CT血管造影图像,研究对象分为3组,包括无斑块健康对照组(n=10)、完全钙化斑块组(n=10)和易损斑块组(n=5)。采用全转录组测序技术分析外周血全血中表达差异的长链非编码RNA分子。培养人单核细胞白血病细胞系(THP)-1细胞,用于建立M1和M2型巨噬细胞极化模型,采用慢病毒感染和Smart Silencer转染技术分别过表达和敲低DANCR-201,检测炎症因子、脂质代谢与血管钙化相关基因的表达水平,采用油红O染色法检测巨噬细胞脂质吞噬能力,采用胆固醇流出实验检测巨噬细胞胆固醇逆转运能力。结果:DANCR-201在易损斑块组患者外周血的表达水平显著升高。在单核细胞系中过表达DANCR-201,可促进单核趋化蛋白-1(MCP-1)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)高表达(P研究。

关键词：长链非编码RNA 分化拮抗非编码RNA-201 巨噬细胞炎症动脉粥样硬化

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棕色和米色脂肪在肥胖中的研究进展

生命科学 2021年第3期33卷 355-362页

作者：张雅晴王红蕊张宇王金娥三峡大学医学院宜昌443002 中国医学科学院北京协和医学院国家心血管病中心阜外医院心血管疾病国家重点实验室北京100037

目前随着人们生活水平的不断改善,肥胖及其相关疾病的发生率越来越高。虽然体育锻炼能够增加一定的能量消耗,但并不足以引起负能量平衡和体重下降。棕色和米色脂肪细胞的激活可使耗能增加、体重减轻以及胰岛素敏感性增加。因此,越来越... 详细信息

目前随着人们生活水平的不断改善,肥胖及其相关疾病的发生率越来越高。虽然体育锻炼能够增加一定的能量消耗,但并不足以引起负能量平衡和体重下降。棕色和米色脂肪细胞的激活可使耗能增加、体重减轻以及胰岛素敏感性增加。因此,越来越多的研究进一步聚焦这两种产热脂肪组织增加能量消耗的分子机制,希望找到治疗肥胖及其相关疾病的靶点。现系统综述两种产热脂肪组织的分类、发育谱系、产热特性和产热机制的异同点并提出现阶段存在的不足以及发展方向,以期为肥胖及相关疾病的治疗提供新思路。

关键词：棕色脂肪细胞米色脂肪细胞线粒体解耦联蛋白1 肥胖

血管内皮细胞生长因子受体基因启动子区多态与脑卒中复发的关系

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中国循环杂志 2009年第4期24卷 292-295页

作者：张伟丽祝立新孙凯王曙霞汪道文惠汝太中国医学科学院北京协和医学院心血管病研究所阜外心血管病医院心血管病相关基因与临床研究教育部重点实验室(中德分子医学研究室)北京市100037 华中科技大学同济医学院附属同济医院心血管内科

目的:探讨血管内皮细胞生长因子受体(VEGFR-2)基因启动子区多态与颈动脉粥样硬化以及脑卒中复发风险的关系。方法:对1849例脑卒中患者进行前瞻性随访4.5年(中位数,范围0.1～6.0年),Cox生存回归模型分析基因多态与脑卒中复发风险的关联... 详细信息

目的:探讨血管内皮细胞生长因子受体(VEGFR-2)基因启动子区多态与颈动脉粥样硬化以及脑卒中复发风险的关系。方法:对1849例脑卒中患者进行前瞻性随访4.5年(中位数,范围0.1～6.0年),Cox生存回归模型分析基因多态与脑卒中复发风险的关联性。并在一个横断面队列研究中随机入选1123名无心脑血管病史的参加者,检测颈动脉内膜—中膜厚度,观察基因多态与动脉粥样硬化的关系。结果:长期随访过程中,355例患者发生脑卒中复发事件。携带-604TC和CC基因型的脑卒中患者4.5年累积复发率为17.1%(159/929,复发/总例数),而-604TT基因型携带者的累积复发率为21.3%(:196/920,复发/总例数)。Cox生存回归模型校正了年龄、性别和其他心血管危险因素后,-604TC和CC基因型与降低的脑卒中复发风险相关,风险比0.71(95%可信区间,0.58～0.89;P=0.002);这种保护作用对动脉粥样硬化性血栓性脑梗塞患者更为显著,降低复发风险达35%。多元线性回归分析表明-604C等位基因与颈动脉内膜—中膜厚度呈显著负相关(标化回归系数β=0.125;P基因启动子多态-604TC和CC基因型携带者与-604TT基因型相比,脑卒中复发风险相对较低,尤其在动脉粥样硬化性血栓性脑梗塞患者中作用更显著。其机制可能与影响动脉粥样硬化的进展有关。

关键词：血管内皮细胞生长因子受体遗传变异脑卒中复发动脉粥样硬化