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基于网络药理学、分子对接和实验验证的补骨脂效应成分及其抗骨质疏松作用机制探讨

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中国现代中药 2024年第4期26卷 653-664页

作者：王镜勋张方晴李如灿李秋月石钺中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 中国中医科学院望京医院北京100102

目的:基于网络药理学、分子对接技术探讨补骨脂效应成分抗骨质疏松的作用机制,并进行实验验证。方法:采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱飞行时间质谱法表征补骨脂水提取物的化学成分,结合SymMap、Herb、TCM-ID、GEO数据库,STRING... 详细信息

目的:基于网络药理学、分子对接技术探讨补骨脂效应成分抗骨质疏松的作用机制,并进行实验验证。方法:采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱飞行时间质谱法表征补骨脂水提取物的化学成分,结合SymMap、Herb、TCM-ID、GEO数据库,STRING平台和Cytoscape软件,筛选了补骨脂抗骨质疏松(OP)的核心药效成分与重要靶点,并进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;利用AutoDock软件对核心药效成分与重要靶点进行分子对接验证,通过体外细胞实验进行了初步验证。结果:共筛选得到补骨脂效应成分31个、重要靶点256个,其中过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)为核心靶点。GO分析和KEGG信号通路分析分别筛选出符合条件的417个生物过程和123条信号通路,其中有8条核心靶点参与的通路。采用分子对接实验和体外细胞实验对其中腺嘌呤核苷一磷酸激活的蛋白激酶(AMPK)关键信号通路进行验证。分子对接结果显示,补骨脂治疗OP的主要活性成分补骨脂甲素、甲基补骨脂黄酮与蛋白质-蛋白质相互作用网络筛选出的核心靶点蛋白PPARG结合活性较好;细胞实验表明,2个成分可以促进成骨细胞的增殖和分化,对部分AMPK通路相关基因有上调的作用。结论:应用网络药理学和生物信息学方法,结合分子对接和细胞实验,可揭示补骨脂有效成分通过AMPK信号通路治疗OP的潜在作用机制,为补骨脂的药效物质基础研究提供了新思路。

关键词：补骨脂骨质疏松症网络药理学腺嘌呤核苷一磷酸激活的蛋白激酶作用机制

脱落酸及其调控植物次生代谢产物生物合成的研究进展

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天津中医药大学学报 2024年第3期43卷 259-267页

作者：甄梦缘王丽芝孙超天津中医药大学天津301617 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193

次生代谢产物是植物长期进化过程中为了适应生态环境产生的天然有机化合物,近年来,随着生物技术的发展,植物次生代谢产物经济以及药用价值愈发引起广泛关注。但一些次生代谢产物因为其复杂的结构和合成路径以及在植物中极低的含量,使其... 详细信息

次生代谢产物是植物长期进化过程中为了适应生态环境产生的天然有机化合物,近年来,随着生物技术的发展,植物次生代谢产物经济以及药用价值愈发引起广泛关注。但一些次生代谢产物因为其复杂的结构和合成路径以及在植物中极低的含量,使其不能低成本大量生产。脱落酸(ABA)作为调控植物生长发育过程中的重要植物激素之一,可以依靠自身的合成与分解、信号传导、激素互作等作用来调控次生代谢产物的合成。文章综述了ABA在生物合成与分解代谢以及信号转导等方面的新进展,归纳了ABA对不同类型次生代谢产物的调控作用,为合理利用植物激素提高植物次生代谢产物的产量提供依据。

关键词：脱落酸次生代谢产物调控综述

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中国人参产业发展现状及趋势分析

中国中药杂志 2024年第17期49卷 4818-4828页

作者：李耿王华董政起王英平王涛姚霞陈颖贾海彬孙晓波中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 中国中医科学院中药研究所北京100700 江西中医药大学药学院江西南昌330004 吉林农业大学吉林长春130118 天津中医药大学天津301617 天地云图医药信息(广州)公司广东广州510308

人参是我国最具代表性的中药材,药用历史悠久、健康价值独特、文化底蕴深厚。人参产业的发展对我国整个中药产业具有重要的带动引领作用。新形势下,我国人参产业迎来了新的发展契机,同时也面临着严峻的内部、外部挑战,亟待深入剖析,探... 详细信息

人参是我国最具代表性的中药材,药用历史悠久、健康价值独特、文化底蕴深厚。人参产业的发展对我国整个中药产业具有重要的带动引领作用。新形势下,我国人参产业迎来了新的发展契机,同时也面临着严峻的内部、外部挑战,亟待深入剖析,探索破局之策。在全面的人参产业专题调研与分析基础之上,该文从产业链视角,系统梳理我国人参产业现状,总结分析当前我国人参产业现实问题及发展趋势,以期为人参产业高质量发展提供参考和决策依据。

关键词：人参人参产业发展现状趋势分析

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知识图谱技术在中医药研究中的应用

中国现代中药 2024年第7期26卷 1265-1273页

作者：黄佳丽王彦峰侯子雨刘海波董政起中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 北京市科学技术研究院北京100044

知识图谱技术在从关系的角度发掘实体与实体间关联方面具有独特优势,中医药知识的高度复杂性和内在强关联性的特点使知识图谱技术更适合应用于中医药学研究。中医药知识图谱研究在模式层构建、实体命名和识别等方面取得了长足发展,深度... 详细信息

知识图谱技术在从关系的角度发掘实体与实体间关联方面具有独特优势,中医药知识的高度复杂性和内在强关联性的特点使知识图谱技术更适合应用于中医药学研究。中医药知识图谱研究在模式层构建、实体命名和识别等方面取得了长足发展,深度学习、Python编程、链路预测、预训练模型等技术被引入到知识图谱中,进一步提高了知识图谱的可靠性和构建效率。回顾了中医药知识图谱技术近年来的发展历程,从概念、构建方法、在中医药领域的应用及不足几个方面进行综述,以期促进知识图谱技术在中医药领域的发展和应用。

关键词：知识图谱科学知识图谱中医药应用现状

肾宝组方及其拆方对慢性肝损伤大鼠肝脏功能及病理形态的影响

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江西中医药大学学报 2024年第3期36卷 94-99页

作者：高羽梁文雄李胜华曹旻旻周青罡邢小燕孙晓波江西汇仁药业股份有限公司南昌330052 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193

目的:考察肾宝组方及其拆方长期大剂量给药对慢性肝损伤大鼠肝脏功能及肝脏病理形态的影响,为有基础肝病或肝功能不全患者临床长期用药的安全性提供参考。方法:SD雄性大鼠共300只,随机分成正常对照组,模型组,肾宝片高、中、低剂量组,制... 详细信息

目的:考察肾宝组方及其拆方长期大剂量给药对慢性肝损伤大鼠肝脏功能及肝脏病理形态的影响,为有基础肝病或肝功能不全患者临床长期用药的安全性提供参考。方法:SD雄性大鼠共300只,随机分成正常对照组,模型组,肾宝片高、中、低剂量组,制何首乌高、低剂量组,淫羊藿高、低剂量组,补骨脂高、低剂量组,制何首乌+淫羊藿+补骨脂高、低剂量组,全方不含制何首乌+淫羊藿+补骨脂高、低剂量组,每组20只。正常对照组腹腔注射生理盐水,其余各组采用10%CCl4橄榄油灌胃,每周2次,共12周,制备慢性肝损伤模型。4周后,各组灌胃给予相应药物,正常组和模型组灌胃蒸馏水,每日1次,连续12周,停药恢复4周。给药期和恢复期观察各组大鼠一般状况,每周测定大鼠体重。在给药期结束和恢复期结束,各组分别检测肝功能生化指标、氧化应激水平和肝脏组织病理学检查。结果:与模型组相比,肾宝组方对CCl4慢性肝损伤大鼠的肝功能生化指标、肝组织氧化应激水平、组织病理形态学等均无加重现象,反而在给药12周后明显降低肝损伤大鼠的血清ALT、AST活性及肝脏MDA含量,同时明显增加SOD水平,且肝脏组织病理评分也较模型组有降低趋势。结论:肾宝处方组成中虽然含有肝毒性中药,但是全方组方合理,可以起到减轻肝毒性的作用,即使已有基础性肝病或肝功能不全患者长时间服用也不会增加肝脏毒性反应,表明其临床使用的安全可靠。

关键词：肾宝片长期毒性肝功能不全肝功能肝病理形态

基于思维导图及微信公众号的《生药学》课程教学模式的创新探索--以西洋参为例

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广东化工 2024年第12期51卷 227-228,218页

作者：田丽霞蒋文雯杨再昌季春何述钟黄林芳贵州大学药学院贵州贵阳550025 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193

《生药学》是一门理论性、实践性和应用性很强的学科。但《生药学》课程内容庞杂分散、多数生药的知识点相似、容易混淆,教学模式单一,导致学生学习兴趣低、学习效率不高,教学质量不佳等问题。因此,本文以西洋参为例,拟通过引入思政元... 详细信息

《生药学》是一门理论性、实践性和应用性很强的学科。但《生药学》课程内容庞杂分散、多数生药的知识点相似、容易混淆,教学模式单一,导致学生学习兴趣低、学习效率不高,教学质量不佳等问题。因此,本文以西洋参为例,拟通过引入思政元素、思维导图,学科前沿知识及微信公众号等,改进教学方法,提高学生的学习兴趣,提升教学质量。

关键词：生药学思政元素思维导图学科前沿微信公众号

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蛇葡萄属药用植物亲缘学研究

中国现代中药 2024年第6期26卷 978-988页

作者：曾铁鑫许利嘉宋颜君马培陈之端肖培根中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 教育部中草药物质基础与资源利用重点实验室北京100193 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室北京100193

蛇葡萄属(Ampelopsis Michaux)植物为多年生木本藤蔓植物,全世界有30余种,中国有17种,大部分为中国特有,多具有传统药用价值,可作茶饮。基于系统进化关系和形态学相似性,近期蛇葡萄属中具羽状复叶的种从该属中分出,成立牛果藤属(Nekemia... 详细信息

蛇葡萄属(Ampelopsis Michaux)植物为多年生木本藤蔓植物,全世界有30余种,中国有17种,大部分为中国特有,多具有传统药用价值,可作茶饮。基于系统进化关系和形态学相似性,近期蛇葡萄属中具羽状复叶的种从该属中分出,成立牛果藤属(Nekemias Raf),但这需要更多证据,特别是植物化学方面的证据支持。对蛇葡萄属植物亲缘关系、化学成分和药理活性进行归纳总结,并对其药用亲缘学进行探讨。蛇葡萄属中含有丰富的黄酮类化合物,但其主要种类存在差异,具羽状复叶的蛇葡萄种富含二氢杨梅素、杨梅素等类黄酮物质,而其余蛇葡萄属植物则检测到了白藜芦醇、儿茶素等酚酸类物质。这些化合物具有抗肿瘤、保肝、抗菌等活性,可与传统功效相关联。对蛇葡萄属植物的药用亲缘关系进行初步探讨,可为该属植物的资源保护和进一步开发提供参考。

关键词：蛇葡萄属化学成分传统功效药理活性药用植物亲缘学

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维药骆驼刺水溶性化学成分研究

中草药 2024年第17期55卷 5777-5784页

作者：鲍爽宋海龙热依兰木·买赛地凯撒·苏来曼马国需张晶石磊岭韩莉莉吉林农业大学中药材学院吉林长春130118 新疆维吾尔自治区人民医院妇科新疆乌鲁木齐830001 新疆维吾尔自治区中药民族药研究所新疆乌鲁木齐830002 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193

目的对维药骆驼刺Alhagi sparsifolia水溶性化学成分进行研究。方法采用多种色谱技术进行分离纯化,通过理化性质、波谱数据和X单晶衍射鉴定化合物结构,测试各化合物对人宫颈癌HeLa细胞的细胞毒性。结果从骆驼刺地上部分分离得到21个水... 详细信息

目的对维药骆驼刺Alhagi sparsifolia水溶性化学成分进行研究。方法采用多种色谱技术进行分离纯化,通过理化性质、波谱数据和X单晶衍射鉴定化合物结构,测试各化合物对人宫颈癌HeLa细胞的细胞毒性。结果从骆驼刺地上部分分离得到21个水溶性化合物,分别鉴定为毒豆甲酮(1)、毒豆乙酮(2)、callyspongidipeptideA(3)、环(脯氨酸-亮氨酸)(4)、对羟基苯甲醇(5)、D-脯氨酸-D-缬氨酸(6)、环(脯氨酸-亮氨酸)二肽(7)、布卢姆醇A(8)、(3S,4R)-3,4-二羟基-3-甲基二氢呋喃-2(3H)-酮(9)、isololiolide(10)、dehydrovomifoliol(11)、N-苯乙基甲酰胺(12)、3-hydroxy-β-damascone(13)、3,4-二羟基-3-甲基二氢呋喃-2(3H)-酮(14)、环(丙氨酸-脯氨酸)(15)、脯氨酸(16)、布卢姆醇B(17)、蚱蜢酮(18)、N-(对羟基苯乙基)甲酰胺(19)、N-乙酰基酪胺(20)、(+)-丁香脂素-O-β-D-葡萄糖苷(21);并对化合物1~21进行了抗宫颈癌活性筛选。结论化合物1~7、9~20为首次从骆驼刺属植物中分离得到,且化合物4、7、15表现出潜在的抗肿瘤活性,半数抑制浓度(median inhibition concentration,IC_(50))分别为(29.09±0.99)、(31.51±1.89)、(28.25±0.65)μmol/L。

关键词：骆驼刺水溶性成分生物碱抗肿瘤活性环(脯氨酸-亮氨酸)二肽环(丙氨酸-脯氨酸)

本草小核酸(sRNA)数据库的综合分析——揭示人类疾病的新疗法

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中国科学:生命科学 2024年

作者：曹英豪林烨暄孙娜杜芯仪董一昕梅颂邓兴宇李晓北郭劭婷汤克功刘佳齐乔翔宇赵丹丹秦宇豪张聪辛天怡史晓虎周丛照董涛果德安 Benedikt M.Kessler 许东宋经元黄凤鸣王晓月蒋澄宇 Department of Electrical Engineering and Computer Science and Christopher S. Bond Life Sciences Center University of MissouriColumbia 中国医学科学院基础医学研究所&北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室中国科学技术大学生命科学学院合肥微尺度物质科学国家研究中心中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所国家中医药管理局中药资源保护重点研究室中药资源教育部工程研究中心中国医学科学院&北京协和医学院北京协和医院中医科 MRC Human Immunology Unit MRC Weatherall Institute of Molecular MedicineRadcliffe Department of MedicineUniversity of Oxford Chinese Academy of Medical Sciences(CAMS) CAMS Oxford Institute(COI) Nuffield Department of MedicineUniversity of Oxford 中国科学院上海药物研究所上海中药现代化研究中心中药标准化技术国家工程实验室 Target Discovery Institute Centre for Medicines DiscoveryNuffield Department of MedicineUniversity of Oxford

2012年首次报道了稻米来源的miRNA的跨界调控.通过改良的草药提取方法和高通量测序技术,本研究从245种中药(traditional Chinese medicine, TCM)中获得了73677287条小核酸(small RNA, sRNA)序列,其中包含20758257条去冗余后的独特序列.... 详细信息

2012年首次报道了稻米来源的miRNA的跨界调控.通过改良的草药提取方法和高通量测序技术,本研究从245种中药(traditional Chinese medicine, TCM)中获得了73677287条小核酸(small RNA, sRNA)序列,其中包含20758257条去冗余后的独特序列.本研究构建了本草小核酸数据库(Bencao (herbal) small RNA Atlas)(http://***),同时基于序列分析,进行sRNAs注释并建立了本草小核酸命名系统.经计算分析,本草小核酸数据库中的21757条miRNAs与收录于miRBase数据库中的植物miRNAs的特征图谱高度一致.多种软件计算分析结果表明,人类所有编码基因都有可能受来自本草小核酸数据库中的sRNAs的调控,本研究通过实验验证了其中一部分的预测计算结果.这些结果显示,本草来源的sRNAs可能是中草药的新的重要药效活性成分.本研究提出了基于本草小核酸数据库的寡核苷酸药物的研发路径和中药处方的优化策略路线图.此外,中药汤剂体(decoctosome)是中药水煎液中的脂质纳米颗粒,其质量约占中药水煎液的0.5%～2.5%,却展示出显著的药效.本研究提出了新的可用于定量衡量草药药效标准的本草指数,包括小分子化合物(small-molecule compounds, SM)、蛋白多肽(protein peptides, P)、核酸(nucleic acid, N)、非核酸非蛋白大分子化合物(large-molecule compounds, LM)和门捷列夫周期表中的相关元素(E).本研究构建的本草小核酸数据库,可用于寡核苷酸药物的开发和植物药的优化,并为易(壹)医学理论提供了科学依据.

关键词：小核酸中药水煎液跨界调控中药寡核苷酸药物核酸治疗本草小核酸数据库