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血必净抗炎作用药效物质基础和多靶点作用效应

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物理化学学报 2009年第10期25卷 2080-2086页

作者：马世堂刘培勋龙伟禹洁徐阳中国医学科学院北京协和医学院放射医学研究所天津300192

研究了血必净抗炎作用的药效物质基础,并在分子层面上对复方多靶点作用进行阐释.借助于计算机辅助药物设计技术,构建血必净化学成分数据库,综合应用同源模建、分子对接、药效团模型、数据库搜索等方法,探讨其与炎症靶点5-脂氧合酶(5-LOX... 详细信息

研究了血必净抗炎作用的药效物质基础,并在分子层面上对复方多靶点作用进行阐释.借助于计算机辅助药物设计技术,构建血必净化学成分数据库,综合应用同源模建、分子对接、药效团模型、数据库搜索等方法,探讨其与炎症靶点5-脂氧合酶(5-LOX)、环氧合酶-2(COX-2)、IKK-2受体的相互作用关系.血必净化学成分中与靶点5-LOX、COX-2、IKK-2结合效应较好的分别有30、36、8个分子;有16个分子与2个或3个靶点存在作用,其中15个分子对靶点5-LOX和COX-2有抑制作用,迷迭香酸对3个靶点均有作用.从分子层次上阐释了复方血必净抗炎作用的药效物质基础和多靶点作用效应,为血必净复方的临床应用提供了科学依据;同时,也为寻找新型抗炎药物提供一定的参考和借鉴.

关键词：计算机辅助药物设计血必净中药复方药效物质基础多靶点

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二氧化钛在癌症动力学治疗中的“取长补短”

科学通报 2021年第21期66卷 2691-2701页

作者：曹茜楠肖萌刘鉴峰中国医学科学院北京协和医学院放射医学研究所天津300192

癌症是严重威胁人类健康的疾病之一,是当前人类所面临的重要医学挑战.基于活性氧机制的癌症治疗手段是目前研究的热点.作为最典型的半导体材料之一,二氧化钛(TiO_(2))具有独特的催化性能、优异的化学稳定性和较低的生物毒性,使得TiO_(2... 详细信息

癌症是严重威胁人类健康的疾病之一,是当前人类所面临的重要医学挑战.基于活性氧机制的癌症治疗手段是目前研究的热点.作为最典型的半导体材料之一,二氧化钛(TiO_(2))具有独特的催化性能、优异的化学稳定性和较低的生物毒性,使得TiO_(2)在癌症动力学治疗中的应用受到广泛的关注.然而,单一TiO_(2)纳米材料具有其固有的缺点,如只能被高能射线激发、量子效率低、体内分散性较差等,使得TiO_(2)在癌症动力学治疗中的效果不佳.本文从TiO_(2)纳米材料在不同动力学癌症治疗手段中的不足出发,综述了功能基的复合对TiO_(2)纳米材料进行改善的不同策略及其在光动力治疗、声动力治疗、放射动力治疗、微波动力治疗等基于活性氧疗法的癌症治疗方面的应用,同时对TiO_(2)在癌症纳米医学领域的应用进行了展望.

关键词：二氧化钛功能复合活性氧动力学治疗纳米材料

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黑磷基纳米材料抗肿瘤研究进展

科学通报 2021年第28期66卷 3684-3694页

作者：王佃余杨丽军刘鉴峰中国医学科学院北京协和医学院放射医学研究所天津300192

黑磷(black phosphorus,BP)作为一种新兴的二维纳米材料因其优异的性质近年来被广泛应用于肿瘤治疗中.首先,BP具有较宽的光吸收范围和较高的光热转化效率,因此在肿瘤光热治疗(photothermal therapy,PTT)中展现出巨大的应用潜力;其次,由... 详细信息

黑磷(black phosphorus,BP)作为一种新兴的二维纳米材料因其优异的性质近年来被广泛应用于肿瘤治疗中.首先,BP具有较宽的光吸收范围和较高的光热转化效率,因此在肿瘤光热治疗(photothermal therapy,PTT)中展现出巨大的应用潜力;其次,由于具有独特的电子结构,BP可以作为高效的光敏剂,在光照下产生大量的活性氧,用于肿瘤的光动力治疗(photodynamic therapy,PDT);此外,BP本身具有大的比表面积,可以作为纳米载体高效负载各种药物,进行肿瘤化学治疗.最近,BP作为放疗增敏剂在肿瘤放射治疗中也取得了不错的效果;更为重要的是,BP拥有大多数无机材料所不具备的良好生物相容性和可降解性,对机体造成的毒副作用较小,为实现其临床应用打下了坚实基础.基于以上多种优良性质,BP不仅能够满足肿瘤单一模式治疗的要求,而且在肿瘤多模式治疗中也具有得天独厚的优势.本文将从BP基纳米材料在肿瘤PTT、PDT、化学治疗、放射治疗以及联合治疗方面的研究进展进行综述,并对BP基纳米材料在未来肿瘤治疗研究中的应用前景进行展望.

关键词：黑磷纳米载体肿瘤光热治疗肿瘤光动力治疗肿瘤联合治疗

MethyScan:一种甲基化特异性PCR引物设计及评估工具

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生物化学与生物物理进展 2021年第6期48卷 677-687页

作者：曹英豪中国医学科学院基础医学研究所&北京协和医学院基础学院北京100730

DNA甲基化是重要的表观遗传现象,对基因表达发挥重要调控功能.大量研究表明,基因DNA甲基化是重要的临床诊断生物标志物.在临床上,实施快速、准确的DNA甲基化状态检测是诊断应用的前提和关键.甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,M... 详细信息

DNA甲基化是重要的表观遗传现象,对基因表达发挥重要调控功能.大量研究表明,基因DNA甲基化是重要的临床诊断生物标志物.在临床上,实施快速、准确的DNA甲基化状态检测是诊断应用的前提和关键.甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)通过将两种引物与甲基化、非甲基化模板各自特异性结合和扩增,实现基因甲基化状态的区分,是切实可行、简单便捷的临床诊断实验技术.但是,不同于常规PCR,MSP主要存在如何强化引物-甲基化/非甲基化模板特异性结合、降低引物序列Tm值差异、去除假阳性扩增及提高敏感性等四大难点.尽管大多数MSP引物设计软件对上述难题都提出了各自解决办法,但在引物设计影响因素考虑、设计与评估并行处理及特异性扩增预测等方面仍然存在较大缺陷.为此,本研究通过对MethPrimer、MSPPrimer、MethBlast、BiSearch等现有MSP引物设计软件原理的深入探究,以及对Bowtie、SAMtools和BEDTools等工具的有效综合整合,基于图形库Matplotlib和第三方Python功能库BioPython与Primer3-py实现了具有系列优点的甲基化特异性PCR引物设计与评估可视化工具MethyScan.它具有引物设计、基因组索引、引物评估等三大完整功能模块,不仅可快速进行MSP引物设计,实现巢式(Nested)引物适配,还可基于4种基因组碱基转换模板分析引物结合信息,图形化展示非特异性扩增与目的片段差异,从而综合评估引物特异性-非特异性扩增.同时,对食管癌、结直肠癌等多种恶性肿瘤中6个潜在生物标志物TFPI-2、NDRG4、CDKN2A、CD44、CASP8和SDHD的甲基化引物设计对比结果表明,MethyScan不仅可获得更多CpG位点的检测引物,而且所获得MSP引物位置与其他软件结果相同或相近,且引物间Tm值差值更小.总之,作为首个图形化展示特异性-非特异性扩增差异MSP引物设计工具,MethyScan可有效提高甲基化引物设计准确性,为临床DNA甲基化检测项目开展、检测试验实施及诊断试剂盒研发提供有力支撑.MethyScan工具下载地址:https://***/bioinfo-ibms-pumc/MethyScan.

关键词：引物设计 DNA甲基化引物评估 MSP引物

电喷雾多级串联质谱法研究碱金属硝酸盐和亚硝酸盐簇合物离子的裂解行为

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分析化学 2009年第6期37卷 855-860页

作者：白进发再帕尔·阿不力孜中国医学科学院北京协和医学院药物研究所

在正常毛细管温度(200℃)下,利用电喷雾质谱(ESI-MS)研究了NaNO3、KNO3、NaNO2和KNO2形成的新型簇合物离子,采用电喷雾多级串联质谱(ESI-MSn)研究了簇合物离子裂解行为。实验结果表明:NaNO3和KNO3溶液产生的簇合物离子及这些离子的裂解... 详细信息

在正常毛细管温度(200℃)下,利用电喷雾质谱(ESI-MS)研究了NaNO3、KNO3、NaNO2和KNO2形成的新型簇合物离子,采用电喷雾多级串联质谱(ESI-MSn)研究了簇合物离子裂解行为。实验结果表明:NaNO3和KNO3溶液产生的簇合物离子及这些离子的裂解方式相似;NaNO2溶液产生的簇合物离子比NaNO3和KNO3溶液产生的复杂;KNO2溶液产生了含有Na+离子的簇合物离子,通过分析KNO2簇合物离子的裂解行为证明了Na+与NO-2的亲合势大于K+。此外,还研究了离子源金属毛细管温度和溶液浓度对簇合物离子形成的影响。

关键词：电喷雾多级串联质谱簇合物离子碱金属硝酸盐碱金属亚硝酸盐

免疫球蛋白G糖基化修饰的质谱分析方法及其应用

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质谱学报 2021年第5期42卷 878-896,I0009页

作者：赖治臻周巾煜李智立中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院北京100005

IgG是一种参与体液免疫的关键糖蛋白,其通过识别特定抗原发挥清除毒素、激活相应受体和补体、调节机体免疫等功能。IgG糖基化修饰主要为N-糖基化修饰,其恒定区的Asn297上含有1个保守的N-糖基化修饰位点,IgG糖基化修饰状态与其理化性质... 详细信息

IgG是一种参与体液免疫的关键糖蛋白,其通过识别特定抗原发挥清除毒素、激活相应受体和补体、调节机体免疫等功能。IgG糖基化修饰主要为N-糖基化修饰,其恒定区的Asn297上含有1个保守的N-糖基化修饰位点,IgG糖基化修饰状态与其理化性质和生物学功能密切相关。深入研究糖基化修饰对认知免疫分子机制,以及在疾病早期诊断、预后评价和抗体药物研发方面具有重要意义。本文主要在糖链、糖肽和完整蛋白方面综述IgG Fc N-糖基化修饰的质谱分析方法及其应用。

关键词：质谱分析免疫球蛋白G 糖基化修饰

碰撞诱导解离和高能碰撞解离方式进行蛋白质组学分析的比较

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质谱学报 2016年第2期37卷 140-146页

作者：王曌孙伟中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

为了比较碰撞诱导解离(collision induced dissociation,CID)和高能碰撞解离(high energy collision dissociation,HCD)两种离子裂解模式在蛋白质组学分析方面的差异,分别应用这两种模式对牛血清白蛋白和细胞裂解物进行分析。通过比较... 详细信息

为了比较碰撞诱导解离(collision induced dissociation,CID)和高能碰撞解离(high energy collision dissociation,HCD)两种离子裂解模式在蛋白质组学分析方面的差异,分别应用这两种模式对牛血清白蛋白和细胞裂解物进行分析。通过比较所鉴定到的多肽和蛋白数目,发现在牛血清白蛋白中,HCD碎裂方法所得的谱图匹配率和多肽Mascot得分均较高,表明其质谱图质量较好。在复杂样品细胞裂解物分析中,CID碎裂方法鉴定到的谱图数、多肽数和蛋白数目均较多,表明该模式的灵敏度较高;HCD碎裂方法所得的谱图匹配率和Mascot得分均较高,表明其质谱图质量较好。因此,这两种模式均可用于大规模蛋白质组学分析,CID模式可提供更高的灵敏度,而HCD模式则可获得更高质量的质谱谱图。

关键词：质谱碰撞诱导解离(CID) 高能碰撞解离(HCD) 蛋白质组学分析

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仿生矿化纳米材料在肿瘤诊疗中的研究进展

中国生物工程杂志 2025年

作者：秦素梅刘妙登刘欢王琳华中科技大学同济医学院附属协和医院组织工程与再生医学研究中心华中科技大学同济医学院附属协和医院再生医学交叉与转化湖北省重点实验室华中科技大学同济医学院附属协和医院

全球癌症负担日益加重，现有的手术及放化疗等治疗方式在处理肿瘤多发性转移病灶及肿瘤多药耐药方面存在重大挑战。仿生矿化是通过模拟生物体内的矿化过程，利用生物矿化机制来合成矿物或有机无机复合材料的方法，已在抵御外界胁迫、疫... 详细信息

全球癌症负担日益加重，现有的手术及放化疗等治疗方式在处理肿瘤多发性转移病灶及肿瘤多药耐药方面存在重大挑战。仿生矿化是通过模拟生物体内的矿化过程，利用生物矿化机制来合成矿物或有机无机复合材料的方法，已在抵御外界胁迫、疫苗改进、骨再生、能源生产和生物传感等方面展示出巨大潜力。基于仿生矿化的纳米材料具备药物靶向递送、物理阻隔、优异的生物相容性和固有治疗特性，因而在肿瘤诊疗领域也得到了广泛应用。文章综述了常见的仿生矿化纳米材料在生物医学中的应用及肿瘤矿化与肿瘤生长、预后之间的潜在关联，重点总结了仿生矿化纳米材料介导的肿瘤诊断和治疗的最新进展，讨论了其在肿瘤治疗中面临的挑战和未来研发方向，以期进一步拓展仿生矿化在肿瘤诊疗中的应用。

关键词：仿生矿化肿瘤治疗纳米材料生物矿化辅助治疗

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“山慈菇”的本草考证

植物分类学报 2008年第5期46卷 785-792页

作者：邴其忠张本刚中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100094

以'山慈菇'之名使用的中药材,来源于多种不同植物,造成目前在命名和药材使用上的混乱。本文根据古代和现代文献中的图文,以时间为脉络,对山慈菇药用植物的形态性状、古文献的附图、地理分布等进行考证,并澄清了几种古文献里'山慈菇'的... 详细信息

以'山慈菇'之名使用的中药材,来源于多种不同植物,造成目前在命名和药材使用上的混乱。本文根据古代和现代文献中的图文,以时间为脉络,对山慈菇药用植物的形态性状、古文献的附图、地理分布等进行考证,并澄清了几种古文献里'山慈菇'的原植物,指出《本草拾遗》(唐)记载的'山慈菇'应该是来源于杜鹃兰Cremastra appendiculata(***)Makino,此后的古文献里记载的'山慈菇'则包括老鸦瓣Tulipa edulis(Miq.)Baker和杜鹃兰***两种植物。而现代文献又收录了两种独蒜兰属Pleione植物及其他多种植物,都不是山慈菇的原植物。

关键词：本草考释中国古籍文献杜鹃兰山慈菇老鸦瓣