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科学数据引用识别方法研究

数据分析与知识发现 2023年第6期7卷 38-49页

作者：周佳茵钱庆唐明坤吴思竹中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所北京100020

【目的】分析现有数据引用实践中的引用特征,归纳数据引用识别方法,总结数据引用识别的研究现状和未来发展方向。【方法】将现有数据引用识别方法归为基于规则识别、有监督机器学习算法和半监督机器学习算法三类,并对各方法的原理、特... 详细信息

【目的】分析现有数据引用实践中的引用特征,归纳数据引用识别方法,总结数据引用识别的研究现状和未来发展方向。【方法】将现有数据引用识别方法归为基于规则识别、有监督机器学习算法和半监督机器学习算法三类,并对各方法的原理、特点、现存问题、性能效果、适用范围等方面进行概括分析。【结果】目前相关技术集中在有监督机器学习算法,结合数据引用行为识别和数据引用元素抽取的识别方法是未来的研究方向。【局限】主要从整体上归纳数据引用特征以及现有的数据引用识别算法,未深入阐述具体算法的技术细节。【结论】目前数据引用识别研究仍存在领域局限、方法单一、未充分考虑数据引用特征等问题,有待进一步优化。

关键词：科学数据数据引用数据共享引用识别

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基于SPO语义三元组的疾病知识发现

数据分析与知识发现 2022年第1期6卷 134-144页

作者：蔡妙芝李晓瑛赵嘉玮冯凤翔任慧玲中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所北京100020

【目的】对PubMed收录的高证据疾病文献进行挖掘与知识发现,为疾病临床诊疗和日常防控提供借鉴。【方法】利用语义抽取工具SemRep,提出基于SPO语义三元组的疾病知识发现模型,选取糖尿病相关文献对模型进行验证,结合可视化及临床知识进... 详细信息

【目的】对PubMed收录的高证据疾病文献进行挖掘与知识发现,为疾病临床诊疗和日常防控提供借鉴。【方法】利用语义抽取工具SemRep,提出基于SPO语义三元组的疾病知识发现模型,选取糖尿病相关文献对模型进行验证,结合可视化及临床知识进行糖尿病知识发现。【结果】获得糖尿病SPO三元组1 258个,语义关系16个,揭示了糖尿病相关的基因、常见的并发症、检测手段及治疗方式。【局限】数据来源为公开发表的文献,未从知识库、电子病历等真实世界数据发现疾病知识。【结论】验证了基于SPO语义三元组的疾病知识发现模型用于揭示大规模文献中隐含的生物医学知识的可行性,有助于为生物医学科研人员提供潜在的研究假设和思路参考。

关键词： SPO 糖尿病知识发现知识组织

基于机器学习的环境监测数据对循环系统疾病死亡影响及预测预警模型构建

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数据分析与知识发现 2022年第10期6卷 79-92页

作者：王琰胥美美童俞嘉苟欢蔡荣单治易安新颖北京协和医学院/中国医学科学院医学信息研究所北京100020

【目的】利用机器学习对循环系统疾病死亡构建预测预警模型及评价,为疾病的预防提供参考。【方法】使用中国某地区2014-2018年循环系统疾病死亡数据进行分析,采用GAM、RF、XGBoost构建预测模型。分布滞后非线性模型计算累积滞后效应结... 详细信息

【目的】利用机器学习对循环系统疾病死亡构建预测预警模型及评价,为疾病的预防提供参考。【方法】使用中国某地区2014-2018年循环系统疾病死亡数据进行分析,采用GAM、RF、XGBoost构建预测模型。分布滞后非线性模型计算累积滞后效应结果构建预警模型,进行模型评价。【结果】累积滞后效应发现持续低温高温、高日照时数、高环境污染物浓度会增加循环系统疾病死亡风险,累计7天的相对危险度分别为1.236、1.130、1.560、1.062、1.218、1.153、1.796。RF、XGBoost模型RMSE为4.979、5.341,性能较好。年龄、性别、气温、日照时数、SO_(2)、NO_(2)、CO、O_(3)、PM_(10)、PM_(2.5)浓度为筛选出的特征变量,将累积滞后效应筛选后的数据确定预警值的预警效果较好。XGBoost预测结果的灵敏度、特异度、曲线下面积分别为0.948、0.939、0.941。【局限】缺乏伴随疾病独立数据和疾病发展进程数据。【结论】该地区死亡数增加与高年龄、男性、温度、日照时数、污染物浓度的升高有关。利用XGBoost模型构建的预测预警模型性能好,可为相关部门疾病的预防和干预提供参考价值。

关键词：循环系统疾病预测预警模型XGBoost DLNM 随机森林模型

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肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药机制的研究进展

中华检验医学杂志 2023年第6期46卷 628-633页

作者：武永莉鲁炳怀中日友好医院、中国医学科学院、北京协和医学院研究生院中日友好医院北京100029

近年来,碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌临床分离率不断增加,导致多黏菌素成为治疗多重耐药肺炎克雷伯菌感染的重要防线,但随着多黏菌素的使用增多,其耐药率也逐渐升高。肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药机制多种多样,以外膜修饰脂多糖为主。参与这... 详细信息

近年来,碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌临床分离率不断增加,导致多黏菌素成为治疗多重耐药肺炎克雷伯菌感染的重要防线,但随着多黏菌素的使用增多,其耐药率也逐渐升高。肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药机制多种多样,以外膜修饰脂多糖为主。参与这一过程的基因除位于染色体上的双组份系统phoPQ、pmrAB、crrAB及负性调控跨膜蛋白mgrB基因外,质粒携带的移动性多黏菌素耐药基因mcr也能介导外膜修饰。其中,mgrB基因变异对多黏菌素耐药起关键作用。本文主要阐述肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药机制,以更好遏制肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药发生。

关键词：多黏菌素类克雷伯菌,肺炎抗药性,细菌

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粪便免疫化学检测在结直肠癌筛查中的价值

中华肿瘤杂志 2023年第11期45卷 911-918页

作者：周月阳李娜陆斌骆晨雨张愉涵骆家辉卢明蔡洁代敏陈宏达中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院临床医学研究所/转化医学中心北京100730 国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院流行病学研究室北京100021 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院基本外科北京100730

筛查与早诊早治已被证实是降低结直肠癌发病率和死亡率的有效手段。结肠镜结合病理检查是结直肠癌筛查的金标准,但因结肠镜检查具有侵入性、费用高且需要专业内镜医师操作等因素,不适合直接用于大规模人群筛查。粪便免疫化学检测(FIT)... 详细信息

筛查与早诊早治已被证实是降低结直肠癌发病率和死亡率的有效手段。结肠镜结合病理检查是结直肠癌筛查的金标准,但因结肠镜检查具有侵入性、费用高且需要专业内镜医师操作等因素,不适合直接用于大规模人群筛查。粪便免疫化学检测(FIT)是国际权威结直肠癌筛查指南推荐的筛查技术之一,已在世界各国人群结直肠癌筛查项目中广泛应用。文章从技术原理、筛查效能、筛查策略、人群效果和效益等不同方面阐述了FIT在结直肠癌筛查中的价值,介绍了目前在中国人群中采用FIT进行结直肠癌筛查的现状,指出了FIT筛查所面临的挑战,以期优化基于FIT的人群结直肠癌筛查策略,为开展高效的结直肠癌筛查提供理论参考。

关键词：结直肠肿瘤筛查粪便免疫化学检测

金属-有机框架材料在细菌感染治疗中的研究进展

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科学通报 2023年第13期68卷 1677-1688页

作者：包佳伟刘鉴峰张嘉敏刘金剑中国医学科学院北京协和医学院放射医学研究所天津300192

细菌感染严重威胁着公共健康安全.近年来,随着多种多药耐药细菌的频频出现,抗生素疗效不断下降.设计开发可代替抗生素的新型抗菌材料,在提高抗菌效率的同时,降低细菌耐药发生的风险,已成为当前细菌感染治疗领域的研究热点.金属-有机框架... 详细信息

细菌感染严重威胁着公共健康安全.近年来,随着多种多药耐药细菌的频频出现,抗生素疗效不断下降.设计开发可代替抗生素的新型抗菌材料,在提高抗菌效率的同时,降低细菌耐药发生的风险,已成为当前细菌感染治疗领域的研究热点.金属-有机框架(metal-organic frameworks, MOFs)作为一类新兴的多孔杂化材料,因具有多选择性的有机配体和金属活性中心、高度可调的多孔空间结构、较大的比表面积和易于修饰等特性,在细菌感染治疗领域展现了巨大的潜力.本文总结了传统细菌耐药机制,以MOFs基抗菌材料的设计策略和抗菌机制为出发点,对近年来MOFs在细菌感染治疗方面的最新研究进展进行了综述,并对MOFs基抗菌材料在细菌感染诊疗领域的研究前景进行展望.

关键词：金属-有机框架材料细菌耐药抗菌机制细菌感染治疗

Gasdermin B基因及其相关疾病的研究进展

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中华微生物学和免疫学杂志 2022年第10期42卷 831-836页

作者：万静萱张婧媛张梦圆李春晓林江涛中日友好医院呼吸与危重症医学科北京100029 南昌大学第一附属医院中日友好医院江西医院呼吸与危重症医学科南昌330000 中国医学科学院北京协和医学院中日友好临床医学研究所北京100730 北京大学临床医学院中日友好临床医学院北京100029

人Gasdermin B(GSDMB)基因作为Gasdermin(GSDM)基因家族的一员,可能与哮喘、肿瘤以及免疫系统疾病的发生发展相关。最新研究发现由其编码的GSDMB蛋白介导了细胞焦亡,GSDMB蛋白可以在细胞毒性淋巴细胞释放的颗粒酶A(granzyme A,GZMA)的... 详细信息

人Gasdermin B(GSDMB)基因作为Gasdermin(GSDM)基因家族的一员,可能与哮喘、肿瘤以及免疫系统疾病的发生发展相关。最新研究发现由其编码的GSDMB蛋白介导了细胞焦亡,GSDMB蛋白可以在细胞毒性淋巴细胞释放的颗粒酶A(granzyme A,GZMA)的作用下裂解为GSDMB-N端结构域直接诱导细胞焦亡,亦可以通过结合半胱天冬氨酸酶-4(cysteinyl aspartate specific proteinase-4,caspase-4)促进Gasdermin D的裂解,从而间接促进细胞焦亡。本文综述了GSDMB基因参与的细胞焦亡的机制以及与之相关疾病的研究进展。

关键词： GSDMB 细胞焦亡哮喘癌症

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左心衰竭相关肺动脉高压的研究进展

中华内科杂志 2024年第1期63卷 113-120页

作者：郑舒文王喆翟振国孙艺红北京中医药大学中日友好临床医学院北京100029 北京协和医学院中日友好临床医学院北京100029 中日友好医院呼吸与危重症医学科中日友好医院呼吸中心国家呼吸医学中心中国医学科学院呼吸病学研究院国家呼吸疾病临床研究中心北京100029 中日友好医院心脏科北京100029

左心衰竭相关肺动脉高压是2型肺动脉高压的重要亚类,可发生在不同类型的心力衰竭,尤其是射血分数保留的心衰。欧洲心脏病学会2022版肺动脉高压指南修订了肺动脉高压的诊断界值,强调了基于右心导管的血流动力学分型的重要性,对左心衰竭... 详细信息

左心衰竭相关肺动脉高压是2型肺动脉高压的重要亚类,可发生在不同类型的心力衰竭,尤其是射血分数保留的心衰。欧洲心脏病学会2022版肺动脉高压指南修订了肺动脉高压的诊断界值,强调了基于右心导管的血流动力学分型的重要性,对左心衰竭相关肺动脉高压的诊断和治疗提出了新的机遇和挑战。目前,临床研究尚未证明能有效改善2型肺动脉高压预后的治疗方法,研究的入选人群异质性较大且评价标准不一。临床研究提示合并混合型肺动脉高压的心力衰竭患者肺血管靶向药物可能获益。未来还需要针对左心衰竭相关肺动脉高压的病理生理特点和治疗策略进行更深入研究。本文就左心衰竭相关肺动脉高压临床诊治的进展做一综述。

关键词：心力衰竭肺动脉血流动力学

中国医学科学院北京协和医学院科技创新十年回眸

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Chinese Medical Sciences Journal 2022年第3期37卷 240-245,I0010页

作者：杨涛莲钟华王卫王健伟中国医学科学院北京协和医学院科技管理处北京100730 中国医学科学院北京协和医学院医学信息研究所北京100020 中国医学科学院北京协和医学院北京100730

本文从深化科技体制改革、优化科技创新生态方面重点梳理了中国医学科学院北京协和医学院(以下简称"院校")在医学健康科技创新发展中的改革举措,初步总结了院校近十年来通过科技创新守卫人民健康、推进健康中国战略的亮点工作,主要展示... 详细信息

本文从深化科技体制改革、优化科技创新生态方面重点梳理了中国医学科学院北京协和医学院(以下简称"院校")在医学健康科技创新发展中的改革举措,初步总结了院校近十年来通过科技创新守卫人民健康、推进健康中国战略的亮点工作,主要展示了其在基础研究、疾病防治、医药技术等领域科技创新成果。这些科技成果的取得凸显了院校为实现医学科技自立自强、全面推进健康中国建设提供重要支撑,为我国医学科技事业发展做出重要贡献。

关键词：中国医学科学院北京协和医学院医学健康科技创新十年