检索结果-南通市图书馆

大银鱼全基因组简单重复序列标记开发及在不同生态型群体中的检验

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

浙江大学学报（农业与生命科学版） 2023年第3期49卷 413-423页

作者：唐雪梅周彦锋方弟安罗宇婷张敏莹蒋书伦张希昭彭飞尤洋南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室江苏无锡214081

利用Krait软件对2020年公布的拼接程度更高的大银鱼全基因组中完美型微卫星的分布特征进行分析,并据此开发具有多态性的微卫星DNA(又称简单重复序列)标记。结果显示:在大银鱼全基因组内共获得587 554个完美型微卫星位点,序列总长度为11 ... 详细信息

利用Krait软件对2020年公布的拼接程度更高的大银鱼全基因组中完美型微卫星的分布特征进行分析,并据此开发具有多态性的微卫星DNA(又称简单重复序列)标记。结果显示:在大银鱼全基因组内共获得587 554个完美型微卫星位点,序列总长度为11 803 017 bp,占全基因组长度的2.53%;在6种重复类型的微卫星中,二核苷酸数量最多(401 585个,占比68.35%)。针对微卫星位点设计的99对引物中,有39对具有多态性,选择其中多态性较好的14个微卫星标记分别对大银鱼洄游型群体、陆封型群体及移植型群体中选择的1个具有代表性的群体进行检验,结果表明,多态性较好的14个微卫星标记在3个具有代表性的群体中均能进行有效扩增。对3个群体的遗传多样性和遗传结构进行分析发现,洄游型群体(崇明岛群体)遗传变异丰富(平均期望杂合度为0.614、平均多态信息含量为0.576),与淡水群体[太湖群体(陆封型)和连环湖群体(移植型)]分属于2个不同的遗传群组,两者间具有较大的遗传距离和极高的遗传分化水平(遗传分化指数高于0.25,P组微卫星标记开发和遗传图谱构建等提供依据,并为后续更大范围的群体种质资源评估与管理提供参考。

关键词：大银鱼基因组简单重复序列生态型群体遗传分化

丝瓜内参基因18S rRNA的克隆及引物开发

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

丝瓜内参基因18S rRNA的克隆及引物开发

中国园艺学会2015年学术年会

作者：朱海生陈敏氡王彬张前荣温庆放福建省农业科学院作物研究所福建省农业科学院蔬菜研究中心福建省蔬菜工程技术研究中心

丝瓜(Luffa cylindrical)是中国主要的瓜类蔬菜。实时荧光定量PCR技术已被广泛应用于多个物种基因表达的绝对定量和相对定量研究中。目前关于丝瓜实时荧光定量PCR内参基因的研究还未见报道。本研究中克隆获得了一种丝瓜内参基因18S rRNA... 详细信息

丝瓜(Luffa cylindrical)是中国主要的瓜类蔬菜。实时荧光定量PCR技术已被广泛应用于多个物种基因表达的绝对定量和相对定量研究中。目前关于丝瓜实时荧光定量PCR内参基因的研究还未见报道。本研究中克隆获得了一种丝瓜内参基因18S rRNA,并利用该内参基因为基础设计一对实时荧光定量PCR引物,解决了丝瓜实时荧光定量PCR检测中没有内参基因的现状,为研究丝瓜重要功能基因的表达模式和调控机制奠定基础。以丝瓜为材料,采用改进的CTAB法提取基因组DNA,根据GenBank公布的西瓜、甜瓜及西葫芦等18S rRNA基因设计一对引物扩增丝瓜18S rRNA基因全长。以丝瓜18S rRNA基因的核苷酸序列为基础,利用PrimerPremier 5.0软件,遵循实时荧光定量PCR内参引物设计的原则设计一对荧光定量特异引物,通过荧光定量PCR扩增曲线、融解曲线及引物特异性等验证引物。以丝瓜根、茎、叶、幼瓜(花后5 d)、商品瓜(花后12 d)、成熟瓜(花后30 d)、高温处理(38℃)叶片、低温处理(8℃)叶片、强光处理(2 000μmol·m·s)叶片、弱光处理(200μmol·m·s)叶片为材料,分析丝瓜18S rRNA基因在不同组织、不同生长发育阶段及各种非生物胁迫条件下的表达稳定性。首次克隆获得丝瓜18S rRNA基因,丝瓜18S rRNA基因全长1 862 bp,GenBank登录号为:KM656452。设计1条荧光定量PCR的内参引物:正向,GTGTTCTTCGGAATGACTGG,反向,ATCGTTTACGGCATGGACTA。利用该引物进行常规PCR扩增,获得1条271 bp特异条带,符合预期大小,经测序,为丝瓜18S rRNA基因的部分序列。利用该引物进行荧光定量PCR反应,结果显示3次重复的Tm温度分别为86.25、86.06和86.25℃,均只有1个特异峰,表明无引物二聚体,扩增条带单一,特异性强,没有非特异性扩增出现,表明设计的1对引物特异性强,扩增效率高,可用作丝瓜荧光定量PCR的内参引物实验。丝瓜18S rRNA基因表达稳定性分析结果显示,18S rRNA作为内参基因在10种情况下亮度基本一致,表明在丝瓜不同组织、各生长发育阶段及各种非生物胁迫条件下均能稳定表达,适合在丝瓜基因表达研究中作为内参基因。

关键词：丝瓜内参基因 18S rRNA

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

过量表达OsRRK1对水稻叶片发育的影响

中国农业科学 2021年第5期54卷 877-886页

作者：马银花莫凯琴刘璐李萍芳金晨钟杨芳湖南人文科技学院农业与生物技术学院/湖南省农田杂草防控技术与应用协同创新中心武汉大学生命科学学院/杂交水稻国家重点实验室

【目的】OsRRK1(rop-interacting receptor-like kinase 1)属于胞质类受体激酶RLCKⅥ家族成员,通过对OE-OsRRK1转基因水稻的叶片形态观察,明确OsRRK1在水稻叶片发育中的作用。【方法】依据水稻基因组数据库公布的目标序列设计引物并构建... 详细信息

【目的】OsRRK1(rop-interacting receptor-like kinase 1)属于胞质类受体激酶RLCKⅥ家族成员,通过对OE-OsRRK1转基因水稻的叶片形态观察,明确OsRRK1在水稻叶片发育中的作用。【方法】依据水稻基因组数据库公布的目标序列设计引物并构建OsRRK1超量表达载体,利用农杆菌介导的遗传转化转入到粳稻品种合江19,通过PCR分析鉴定阳性植株,Southern blot鉴定转基因植株插入外源基因的拷贝数,Northern blot杂交和qRT-PCR鉴定转基因植株在RNA水平的表达情况;选取T2代纯合植株抽穗期的剑叶进行叶片卷曲指数(leaf rolling index,LRI)测定;通过石蜡切片和苯胺蓝染色观察水稻横切后泡状细胞的变化情况,用Image J软件统计泡状细胞的面积;采用叶绿素测定计测量植株叶片叶绿素含量。【结果】共获得OE-Os RRK1转基因阳性植株44株,随机选取17株,经Southern blot鉴定8株为单拷贝株系,9株为多拷贝株系;随机选取2份多拷贝株系(OE-1和OE-4)和5份单拷贝株系(OE-5、OE-21、OE-22、OE-24和OE-25)用于后续试验。经分析发现OsRRK1在不同的转基因株系中具有不同程度的过表达情况,其中OE-1、OE-4和OE-25株系超量表达程度高,OE-5株系超量表达程度低,OE-21、OE-22和OE-24株系超量表达程度居中。从中选取OE-5、OE-22和OE-25共3份单拷贝转基因株系和WT对照经Northern blot鉴定后与qRT-PCR结果一致。统计选取的7个株系和WT对照的叶片卷曲指数发现:卷曲程度与OsRRK1表达量呈正相关,表达量越高卷曲程度越高。水稻叶片经切片和染色后发现OE-OsRRK1转基因植株叶片中泡状细胞发生了明显变化,转基因株系中泡状细胞数目都小于对照中泡状细胞均值4.6个。叶片卷曲得越明显,泡状细胞退化得越严重,数目更少,面积更小。经叶绿素含量测定发现,OE-22、OE-24和OE-25转基因的水稻叶片的叶绿素含量比野生型水稻叶片叶绿素含量高。【结论】过量表达OsRRK1会影响泡状细胞的数目和面积,从而使水稻叶片发生卷曲,且卷曲程度与表达量呈正相关;OsRRK1在水稻中的过量表达导致叶绿素含量增高。

关键词：水稻 OsRRK1 胞质类受体激酶叶片卷曲叶绿素含量

利用高密度Bin图谱定位水稻抽穗期剑叶叶绿素含量QTL

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

利用高密度Bin图谱定位水稻抽穗期剑叶叶绿素含量QTL

第十九届中国作物学会学术年会

作者：赵凌魏晓东梁文化赵春芳周丽慧姚姝王才林张亚东江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心

【研究背景】水稻是世界上最重要的三大粮食作物之一,其产量主要来自于叶片的光合作用。水稻抽穗期剑叶的叶绿素含量在光合作用中起着积极的作用,改善剑叶的叶绿素含量是提高水稻生物量和籽粒产量的有效途径。近年来报导了苗期、分蘖期... 详细信息

【研究背景】水稻是世界上最重要的三大粮食作物之一,其产量主要来自于叶片的光合作用。水稻抽穗期剑叶的叶绿素含量在光合作用中起着积极的作用,改善剑叶的叶绿素含量是提高水稻生物量和籽粒产量的有效途径。近年来报导了苗期、分蘖期、齐穗期等时期以及不同氮素供应、干旱、高温等各种条件下水稻叶绿素含量等相关性状的QTL定位结果,克隆了一些相关基因。但是现有研究结果还不能完全解释水稻叶绿素相关性状的遗传及变异,其分子机理还需要更加深入的研究。基于连续SNP标记的Bin图谱是新一代遗传图谱,通过高通量测序进行,自动化程度高、构建时间短、精确度高,可以直接进行QTL定位后续的候选筛选和分子标记开发,在复杂性状研究中有非常高的应用前景。【材料与方法】利用抽穗期剑叶叶绿素含量存在显著差异的籼稻Kasalath和特大粒粳稻TD70衍生的重组自交系(186个系)为作图群体进行全基因组重测序、SNP分析和Bin map图谱构建。使用叶绿素仪分别两年于抽穗期测量群体及亲本的剑叶叶绿素含量。每份材料随机调查3个植株,每个单株选择位置一致3张剑叶测量不同位置5个点,以3张叶片SPAD值的平均数作为株系的叶绿素含量值。利用QTL IciMapping3.4软件采用完备区间作图法在全基因组范围内进行扫描,以LOD2.5作为阈值检测叶绿素含量QTL的存在。【结果与分析】两年群体的剑叶叶绿素均呈连续性正态分布,表现出数量性状的遗传特点。通过对亲本及RIL群体简化基因组测序,构建了包含12328个Bin标记的高密度遗传图谱。两年共检测到19个控制水稻抽穗期剑叶叶绿素含量的QTL位点,其中q CHL2-1和q CHL5-1两年均检测到,表现出较强的稳定性。物理位置比对发现其中10个QTL与前人定位的水稻叶绿素含量相关位点或基因位于相同或邻近区域。第2染色体上的qCHL2-1定位在7.63Mb左右,LOD值为14.08和7.93,来自于Kasalath的等位基因可使剑叶叶绿素含量SPAD值降低1.24-1.81。qCHL5-1位于第5染色体上的23.44Mb左右,两年LOD值分别为4.31和3.76,可解释3.57-4.82%表型变异,来自于TD70的等位基因可使剑叶叶绿素含量的SPAD值升高。详细分析发现在q CHL2-1和q CHL5-1的染色体区间内找到2个与剑叶叶绿素含量相关的注释基因,这2个基因在两亲本间均存在差异,可作为水稻抽穗期剑叶叶色的候选基因进一步研究。【结论】利用Kasalath/TD70的RIL群体构建高密度Bin图谱,两年共检测到19个控制水稻抽穗期剑叶叶绿素含量的QTL,其中10个QTL与前人定位的水稻叶绿素含量相关位点/基因位置相同或邻近。两年重复鉴定到的qCHL2-1和qCHL5-1区间内找到2个与剑叶叶绿素含量相关的注释基因,可作为候选基因进一步研究。

关键词：水稻重组自交系叶绿素含量 QTL

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

农业信息资源服务质量模型及管理软件设计

中国农机化学报 2016年第6期37卷 190-195页

作者：姚坤张海辉吴华瑞西北农林科技大学机械与电子工程学院陕西杨凌712100 北京农业信息技术研究中心北京市100097 农业部农业信息技术重点开放实验室北京市100097

针对农业信息资源服务质量缺乏评价指标体系及描述方法,而难以实现大量信息资源的有效集成的问题,构建农业信息资源QoS描述模型并设计其管理软件。文章将农业信息资源的各类属性抽象为不同服务质量维度,针对QoS维度的不同变化特征及量纲... 详细信息

针对农业信息资源服务质量缺乏评价指标体系及描述方法,而难以实现大量信息资源的有效集成的问题,构建农业信息资源QoS描述模型并设计其管理软件。文章将农业信息资源的各类属性抽象为不同服务质量维度,针对QoS维度的不同变化特征及量纲,提出质量函数映射方法,规约QoS数值到统一区间,实现QoS指标实际值到指标评价值的映射,建立多维QoS描述模型;开发农业信息资源QoS管理软件,实现QoS指标设置、QoS值测量、更新管理与QoS映射,为农业信息资源高效共享提供理论基础。

关键词：多维服务质量 QoS映射 QoS描述模型 QoS管理

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

温度对猪粪厌氧发酵沼气产气特性的影响

温度对猪粪厌氧发酵沼气产气特性的影响

2008中国农村生物质能源国际研讨会暨东盟与中日韩生物质能源论坛

作者：刘荣厚郝元元梅晓岩武丽娟上海交通大学农业与生物学院生物质能工程研究中心

以猪粪为原料,中温厌氧发酵沼气发酵瓶的底物作为接种物,在自制的小型厌氧发酵装置上,研究了猪粪厌氧发酵温度条件对沼气产气特性的影响。结果表明,对于中温(37℃),高温(52℃),室温条件下各实验组,在发酵初、中期时中温试验组显现出了... 详细信息

以猪粪为原料,中温厌氧发酵沼气发酵瓶的底物作为接种物,在自制的小型厌氧发酵装置上,研究了猪粪厌氧发酵温度条件对沼气产气特性的影响。结果表明,对于中温(37℃),高温(52℃),室温条件下各实验组,在发酵初、中期时中温试验组显现出了明显的优势,日产气量和累积产气量都高于高温和室温试验组。而高温和室温试验组中微生物的活性因受到环境温度改变的影响,甲烷化反应受到明显抑制。当发酵进行到后期时,高温试验组日产气量高于室温和中温发酵试验组。对于沼气主要成分甲烷含量而言,中温、高温和室温三个试验组在发酵15天时甲烷含量分别为:59.8%、70%和62.3%。

关键词：猪粪沼气厌氧发酵

做好沿海开发的大文章——江苏沿海大开发中的金融问题

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

中国金融 2010年第1期 87-91页

作者：植凤寅《中国金融》编辑部

主持人的话:《江苏沿海地区发展规划》日前经国务院常务会议通过。这是中国加快沿海经济发展的最新举措。江苏经济长期来形成了南富北穷的发展局面,藉此沿海大开发规划,这种局面或将得到极大改观,成为江苏区域经济发展的"新引擎",也将... 详细信息

主持人的话:《江苏沿海地区发展规划》日前经国务院常务会议通过。这是中国加快沿海经济发展的最新举措。江苏经济长期来形成了南富北穷的发展局面,藉此沿海大开发规划,这种局面或将得到极大改观,成为江苏区域经济发展的"新引擎",也将成为中国东部重要的经济增长极。目前,江苏正以大手笔构建大交通,以高标准兴建港口城,掀起了新一轮沿海基础建设高潮。如何做好这篇"水文章",在更大范围内整合资源、调整结构、加快经济转型,是江苏沿海大开发必须直面的重大课题。沿海开发需要的不仅是大笔投资,更需要相关城市和相关部门的通力合作与大力支持。巨大的投资金额也对金融机构的"绿色信贷"原则提出了新的要求与挑战。近日本刊记者实地走访了江苏沿海三市,深切感受了三个城市对于发展的渴求以及城市日新月异的变化,采访了中国人民银行南通市中心支行行长姚军、盐城市中心支行行长邱跃民、连云港市中心支行行长刘保以及中国农业银行南通分行副行长汪洋、中国银行盐城分行副行长严向春,请他们谈谈对如何做好沿海开发这篇"水文章"的看法。

关键词：江苏沿海大开发金融问题沿海开发文章地区发展规划区域经济发展中国东部

基于ATR-THz波谱的劣变花生快速无损鉴别研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

农产品质量与安全 2018年第4期 13-17,24页

作者：王冬王纪华吴静珠刘龙海韩平张鹤冬北京农业质量标准与检测技术研究中心北京100097 农业农村部农产品质量安全风险评估实验室(北京)农业农村部(华北)都市农业重点实验室北京100097 北京工商大学食品安全大数据技术北京市重点实验室北京100048 爱德万测试(中国)管理有限公司上海201203

为了对电离辐照导致劣变的花生进行快速无损鉴别,收集白花生、红花生样本各50份,将每份样品均分为对照组和实验组;分别将对照组、实验组样品分为校正集和外部验证集,校正集分别包含对照组、实验组白花生、红花生各30份,外部验证集分别... 详细信息

为了对电离辐照导致劣变的花生进行快速无损鉴别,收集白花生、红花生样本各50份,将每份样品均分为对照组和实验组;分别将对照组、实验组样品分为校正集和外部验证集,校正集分别包含对照组、实验组白花生、红花生各30份,外部验证集分别包含对照组、实验组白花生红花生各20份。在0~2 THz范围内,分辨率0.007 6 THz下,累加2 000次,采用仪器配套衰减全反射附件采集花生太赫兹时域波谱数据;采用仪器配套软件将所采集时域谱分别转换为吸收系数谱、折射率谱,并采用偏最小二乘-判别分析结合全交互验证算法建立劣变花生鉴别模型,并采用外部盲样对模型预测性能进行验证。实验结果得出,白花生吸收系数谱数据模型的校正集、交互验证集、外部验证集正确率分别为98.3%、80.0%、87.2%;白花生折射率谱数据模型的校正集、交互验证集、外部验证集正确率分别为100.0%、100.0%、94.9%。红花生吸收系数谱数据模型的校正集、交互验证集、外部验证集正确率分别为98.3%、96.7%、100.0%;红花生折射率谱数据模型的校正集、交互验证集、外部验证集正确率分别为100%、98.3%、100.0%。两种花生吸收系数谱数据模型的校正集、交互验证集、外部验证集正确率分别为92.5%、85.0%、91.1%;两种花生折射率谱数据模型的校正集、交互验证集、外部验证集正确率分别为100%、97.5%、98.7%。研究表明,太赫兹波谱在鉴别电离辐照花生方面具有一定的应用潜力。基于折射率谱数据所建模型的正确率更高。此外,红花生鉴别模型的正确率相对于白花生鉴别模型的正确率高。

关键词：太赫兹波谱花生劣变衰减全反射偏最小二乘判别分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于大数据和人工智能的灵芝数字化育种

基于大数据和人工智能的灵芝数字化育种

中国菌物学会2023年学术年会

作者：肖世俊姜楠彭炳袁晓辉李玉付永平吉林农业大学食用菌新种质资源创制国际联合研究中心

灵芝是我国主要栽培的药用菌之一,但是目前主栽品种相似性较高,遗传背景狭窄。本项目在世界范围内采集、收集和鉴定到了136份灵芝属资源。通过第三代PacBio SMRT高通量测序技术,获得了灵芝属及其近缘种14个高质量全基因组序列。通过高... 详细信息

灵芝是我国主要栽培的药用菌之一,但是目前主栽品种相似性较高,遗传背景狭窄。本项目在世界范围内采集、收集和鉴定到了136份灵芝属资源。通过第三代PacBio SMRT高通量测序技术,获得了灵芝属及其近缘种14个高质量全基因组序列。通过高产孢菌株和无孢菌株的比较基因组分析,初步挖掘了与产孢相关的基因;基于第二代高通量测序技术完成了136份菌株的高深度全基因组重测序,明确了灵芝属菌株的遗传多样性,解析了赤芝菌株的遗传结构。然后,基于机器学习和图像识别技术开发了灵芝专用二维和三维表型采集设备及配套软件,实现了灵芝菌丝和子实体表型的快速获取,可以对菌丝生长速度、颜色、疏密程度、子实体菌盖和菌柄尺寸、颜色等二维表型、以及子实体面积、体积、菇型等三维表型进行超精准、高通量、低成本测量和分析。最后,基于高通量基因组和表型组技术的集成创新,建立了基于大数据和人工智能的灵芝数字化育种平台。

关键词：灵芝基因组遗传多样性表型组数字化育种